1GOWA

Beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNSEWSRQFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFIQNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYTAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the beta-glycosidase from the hyperthermophilic archeon Sulfolobus solfataricus: resilience as a key factor in thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLYCOSIDASE
total genus 191
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 1996-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1gowA00
1CTNA 5A6BA 1LL6A 5HPCA 3AIVA 3WQ8A 3VIJA 5EBAA 4U33A 1DWGM 3AHVA 2WZHA 3GXDA 4H8HA 4MNJA 1PZ3A 4MB4A 4JFTA 2E9MA 2OYLA 2YL6A 4CVUA 1W3JA 1VBUA 2D22A 1UQZA 2VR4A 5GPRA 4W8AA 2WSPA 4PBGA 2J7FA 4BA0A 4BQ5A 3CPUA 3SEPA 2D3LA 3WUFA 3L4XA 2W66A 2ZUWA 3THCA 4J3SA 5FKYA 4B3LA 5IFTA 2ZX9A 3AS1A 1XYFA 1ISWA 1DEDA 3F4VA 4HA3A 1JXJA 2ZWYA 3N11A 2ZXAA 3CZLA 3TA9A 3T0AA 5BXPA 4QDMA 3SCVA 3HMCA 2O9PA 3AYRA 4UFLA 4TVDA 4UFJA 3SCRA 3WUEA 1UWSA 4AEEA 3WL1A 5CLTA 1BYDA 3WF4A 1FP8A 1WZLA 1RH9A 1WCGA 2VRQA 1C7SA 5C71A 1HJSA 4J3XA 4AEFA 1W2VA 1XYZA 1JD9A 3MUAA 1KGXA 1LJYA 1MVYA 1CGVA 3CLWA 3I3BA 4PRWA 3LPOA 1GW1A 2WCAA 2JF7A 4W7VA 2WBKA 4L4OA 1DWHM 4NSBA 5HOSA 3PZTA 1E73M 2XHYA 2RGMA 1HIZA 4UCFA 4AZCA 1RPKA 2W91A 4KGLA 2CBJA 3FAWA 4E4PA 2PWGA 2G3IA 3QHOA 3ZT7A 3M07A 3W25A 3GNOA 4A3HA 1LLOA 1KWKA 1KXQA 4HZ7A 3AMGA 3IJ8A 1V3JA 1BHGA 2VZOA 3AMCA 1PZ2A 1E71M 3B9DA 4WKFA 1UA3A 5I78A 3ZMRA 1E3XA 2CKSA 2QMJA 3OIHA 3WD1A 1OT2A 4KRUA 5HDRA 3UETA 3BAWA 4HU8A 2G41A 1Y7VA 1W9PA 4PMVA 3WDHA 1G5AA 4BQ2A 7A3HA 2OYMA 2YL5A 4F8XA 2WVUA 4JHZA 5IFPA 1GOIA 1E6RA 4JZ5A 1CLVA 4AMCA 1KXHA 4HA4A 3CZJA 3VM7A 1GOKA 4JL1A 4S3KA 1GVYA 1H49A 2XYLA 3OGSA 2VQTA 5GQBA 1E1FA 2B31A 2VZTA 1B2YA 3CH9A 5FD0A 4YHEA 1QPKA 4PEEA 4UQ9A 3CHDA 4L4PA 5A8QA 5BXSA 1G01A 1A3HA 1PJ9A 3QR3A 3GNRA 2Z1KA 3ZR6A 1JZ6A 1DWIM 2WMHA 3K8MA 4BCEA 3PZOA 1VFUA 5F7UA 3VD9A 1GNXA 1HKKA 4XV0A 3AROA 4OBRA 4AW7A 4KRTA 1EHAA 2PF0A 3A4XA 2QPUA 4W5ZA 5CGTA 1E5JA 2RGLA 3PZUA 3T09A 4CU6A 2CXGA 3NIYA 1ZBCA 1UR2A 1HJWA 2XVNA 3VDAA 2VR5A 1K6AA 3GH4A 5M03A 3VO0A 3AHYA 5DT7A 4QCFA 1QBBA 1VFMA 3GH5A 5FCZA 3WIJA 2PWDA 2DEPA 3U7BA 1EO5A 1HJQA 5KEZA 2DSWA 1E6ZA 2Y5EA 4EK7A 2V3FA 1BYCA 2TAAA 4W5UA 1KR0A 5FL0A 3VVGA 3WBAA 4J3TA 2JEPA 2VURA 5A8PA 2E40A 1JGIA 1A47A 1PPIA 3WBEA 3SUUA 3CUJA 4J7RA 3GNPA 2JF6A 2VX7A 5D9PA 4P8VA 3WQ4A 3POHA 1EHNA 1J11A 1VJSA 1J0YA 1GQLA 4P8UA 4ATDA 3CZEA 2X0YA 1EIBA 1DWFM 1UWTA 4CKQA 1I1XA 2WAGA 1WNOA 3CBWA 4ATWA 1O6IA 1B31A 1J0ZA 2WZEA 3NSNA 1XD0A 1G1YA 2BFGA 2X05A 1B0IA 1JI2A 5GNZA 1GOOA 1L0PA 1OCQA 1JFXA 3A4WA 2A3BA 1MFUA 3AXHA 2UWFA 1W9VA 2YL8A 4M81A 2C0HA 1B3VA 3MMDA 3MANA 3ALFA 1HF6A 3F5KA 1JF5A 5AYIA 1B3XA 3FN9A 3MS8A 2FHFA 1QW8A 4C7FA 1J0KA 5E09A 3TTOA 3RM8A 1K9DA 3AXXA 2XFFA 4TVUA 3UR8A 4HPHA 1IT0A 4B3KA 3TOPA 3WH8A 4WF7A 4J3UA 2QF8A 4U3AA 4P8XA 2VTFA 2WHLA 3WENA 1HJXA 3EMZA 3BAIA 1XC6A 3VMPA 1C7TA 1E6QM 3ARUA 1K9TA 3ARZA 1UR4A 4LQ1A 5A6MA 3WH7A 3ARPA 1R7OA 5A6KA 4QAWA 5ABGA 5A2AA 1QI2A 2PWEA 2J77A 2FDMA 1M04A 4AXNA 1JZ4A 2VJXA 1DP0A 3A47A 4PUEA 1HXJA 5BCAA 1UWIA 5E0FA 1EDGA 4JIEA 3O9NA 4Z2GA 5EFFA 1GZJA 1FHDA 5GNYA 1V6UA 1UD5A 5GNXA 4MPKA 2WYSA 3ARWA 4CD8A 1YHTA 2G3NA 1QVBA 1QI5A 1NARA 2VVSA 5IXEA 3EMQA 4RE2A 3N17A 1KWGA 4GZEA 2WMGA 4GPNA 4D6GA 3DYMA 1ITCA 5DO8A 2Y4SA 2JEQA 5BXRA 4V28A 4XB3A 1TZ7A 1H4PA 3ZT6A 3L4TA 4D6FA 4ZENA 4BQ4A 3NDYA 2OSXA 4EANA 4CCEA 1H41A 1V08A 2D24A 2BS9A 3HN3A 1GQKA 3NDZA 3W82A 3VIGA 3VDCA 1Q6GA 1E70M 4J27A 2NT0A 3AI0A 1XH2A 1VIWA 1UD4A 2A3CA 4N42A 3AJ7A 4CVWA 3THDA 5CPSA 1O7AA 3AIBA 1RP9A 3W29A 1MQPA 1FA2A 2WVTA 3GBEA 3SCUA 2BHYA 3WFZA 1UD2A 5CSUA 1DWJM 3HJEA 3RCNA 3EBVA 1PIFA 2Z1SA 4AD0A 4P7LA 3EDFA 2VMFA 1NWUA 1B9ZA 1UG6A 4UZUA 3AISA 5IHSA 3TTQA 3VGDA 2ZXBA 2OSWA 3L4ZA 4XZWA 2X2YA 1UYQA 3O6AA 3ZOAA 4OBSA 3MSDA 4ZE4A 1C92A 1BFNA 4OIFA 1GOMA 4R5EA 4WLCA 3VIKA 3WEOA 2JIWA 4H7VA 4FLQA 4W93A 8A3HA 4JAWA 4P7QA 1EA9C 4AIEA 4W7WA 4PMUA 2ZX6A 4IM4A 2GJRA 2BVTA 4QLJA 2VZUA 1D7FA 3BAYA 1M7XA 2D1ZA 2XM1A 4TOQA 8CGTA 1OINA 1CPUA 3POCA 1UKQA 4ML4A 1C8XA 2VCCA 1UR9A 1W9DM 2WXDM 3WDJA 3M46A 3TP4A 2WC3A 3FW6A 4TX6A 1RD6A 2OYKA 3FHAA 3F5JA 9CGTA 1WP6A 3WEMA 4AWEA 1JAKA 1XD1A 4UOZA 2E8ZA 4W8LA 4UQDA 1CXEA 4TTUA 5EFDA 4AZGA 1FP9A 3VGFA 2J8GA 2XGIA 1Q6FA 5I23A 3VUPA 4AZ7A 4DUWA 3QGVA 3VIIA 1V6WA 2AMGA 2D0FA 3RIKA 2Y8VA 3GTNA 3WEZA 3AHZA 1ZJAA 4P7NA 1KGUA 1IZJA 2XPKA 3N15A 4E2OA 2O9OA 2NT1A 4UFIA 1CLXA 2YDRA 1X6NA 5CXPA 2ZIDA 1CZ1A 3BLPX 3RDKA 4JKKA 3WD2A 3K4AA 1OGGA 2GSJA 3IAQA 1NQ6A 2PBOA 5AYBA 4P7RA 1R7AA 4CD7A 2YLLA 2GJXB 2WNWA 2XWEA 4OUEA 1KXVA 2NSXA 4H8UA 3W38A 4WSJA 3VD3A 3UEQA 2VVNA 3VILA 2XSAA 3WNKA 4IISA 1C90A 2XFRA 3MU7A 3ALGA 5D9NA 3T08A 1XCWA 1JL8A 1E0VA 2A3HA 2ZUVA 3LMYA 3VGBA 4Y7EA 1F4AA 2ZX5A 2CETA 4WSKA 1TCMA 4LPCA 2VUYA 4J3WA 2BY2A 2O9TA 3PTKA 1H5VA 3ZQ9A 3ZJ7A 2CHNA 3DECA 3WF3A 1KB3A 3ZM8A 1VF8A 2YDQA 3WH9A 2YA2A 4X9YA 4D6IA 2DSKA 3VDBA 3FHQA 1OGSA 3D5HA 5E70A 5DEZA 4W88A 4RE3A 2EXOA 1ZL1A 2YDSA 1V3MA 2UY5A 2FHCA 4UOJA 2AOSA 2YLAA 4JFUA 3BLKA 2J7GA 1JNEA 3VGEA 5JBEA 3FAXA 3KL3A 3U7VA 4JHOA 2BXYA 4RL3A 4CGTA 4E8DA 4M8UA 3ARSA 4GQQA 1C8YA 4AIUA 3QOMA 3VDHA 2ZXDA 1SYTA 4W89A 1C93A 2ZUUA 3BCFA 1MYRA 1DWAM 1OB0A 3T2PA 1UWQA 4GINA 1UKOA 4OZOA 4A3YA 5JBDA 1V6YA 5DT5A 3MUY1 2YBUA 5D9MA 1UZ1A 2CBVA 4LYPA 4WKHA 1TVPA 1H0IA 1V3LA 3TTSA 1US3A 2ZX8A 1W9XA 2JIEA 2FGLA 4URIA 1WZMA 3TONA 3E1F1 2XVKA 4N0RA 1AQMA 2E0PA 2E9BA 3W6LA 4NRRA 2IXVA 2BVDA 2ZOXA 4YHGA 2BY1A 3AOFA 1QNOA 3KZSA 1UH2A 1LWJA 2X0HA 2YOCA 2CNCA 2J25A 1QI4A 5TD4A 4GI6A 3VOCA 3W28A 2EEXA 4OOZA 2XG9A 5LA0A 1I1WA 1NOWA 1DTUA 1TA3B 4MNKA 2PWFA 1OD0A 3F5LA 5E0CA 4UZSA 1XSJA 3VPLA 3LPFA 3EDKA 4U2YA 3K1DA 2GK1B 5M17A 4GQRA 4PTVA 4QLKA 2EBNA 5A2BA 1TR1A 2JALA 4LX4A 4E8CA 2J62A 4U3CA 2ZICA 2ZX7A 2DPEA 3T2OA 2WMKA 3WUBA 4DM1A 4WIWA 1LG2A 2J47A 4IPNB 1S46A 1ISVA 3WF0A 2XUCA 1I75A 4RE4A 3PZGA 3BCDA 1UD6A 2D3NA 1X1NA 3SUWA 4B16A 1W32A 2VZSA 2DDXA 2IXUA 1BAGA 2F8QA 3VIPA 1ZU8A 2W92A 2VX6A 3G6MA 3WSUA 2G4FA 1GCYA 3ARYA 1W1TA 1EDQA 1QHZA 2ZUNA 4PUDA 3VNZA 5BXTA 5A69A 3U5UA 1NH6A 2PB1A 4HMCA 1B90A 1E40A 3VD4A 1W2PA 1UR0A 4Z2LA 4HOXA 5CJ5A 3MUIA 5AY7A 3T0DA 1HJVA 3LPPA 2YIHA 3RMEA 1JYVA 3AS0A 5I6SA 3I3EA 4DM2A 4Q22A 1CXKA 3OLGA 4B15A 5ABFB 1E1EA 3DHPA 5DFAA 5A6LA 1CEOA 3OLIA 1SFSA 3ZT5A 1XSKA 1XH1A 2WMIB 2XVPA 3RO8A 2WKLA 1E15A 3FNDA 1JYWA 5E6ZA 4MJ2A 3UESA 3NCOA 4BQ3A 5JIPA 1QNQA 2JFEX 1KFWA 4PMQA 1NWSA 1BYAA 1PAMA 2G3JA 4F9DA 2J7BA 3CHCA 3WNNA 1D2KA 2WZIA 2PI6A 3PTMA 1CGUA 1HKIA 3GZAA 2XJ7A 3WNMA 1V0NA 1NM9A 2VO5A 1E9LA 1J10A 1E4MM 1FH8A 4M80A 1F4HA 4LYQA 5A6SA 4Z2IA 4ZE5A 4B9YA 4H8VA 1ISYA 3GBDA 1JAEA 1BVZA 2WC7A 4PSRA 4LGXA 1BTCA 2GJXA 4CU7A 4PYSA 1WZAA 1WDRA 1JI1A 3AS3A 3SCNA 6A3HA 4ACZB 5I2UA 4QFUA 4U5IA 2VOTA 2Y2WA 2XM2A 1ECEA 3WY1A 1CGYA 1KCLA 1VAHA 1JNDA 2BXZA 5LA2A 3SCTA 4FLSA 5M3WA 1B3YA 3BH4A 4PMDA 2VL4A 3PTQA 1UWUA 4UNIA 2QPSA 1HKJA 1B1YA 5ABEA 2CBUA 1CNVA 2CERA 2OWWA 3CZGA 1HVXA 4HMEA 3OLEA 1GHSA 1FHLA 2Y24A 2VX5A 1HP5A 2DSUA 1V0KA 1BQCA 4TTGA 1CGWA 2V3EA 3RM9A 1OIMA 1R87A 1E4NA 1UR8A 2V3GA 4AISA 3SCSA 3AIEA 2WBGA 3ARRA 2FGZA 4LYRA 1GPFA 1JZ7A 1HN1A 2FHBA 3LPGA 2BV9A 3K4DA 2QV4A 4ZXLA 1V03A 3WDIA 3KEHA 3N18A 2J7HA 1V3HA 3GXFA 2OWCA 4NRSA 1VB9A 4M82A 1VFOA 1G9HA 1ESWA 3VM5A 4DUVA 4AD2A 1MQRA 4KWUA 3MO4A 3APGA 2ZUMA 1W3LA 3RJYA 3ARTA 3WH5A 1KBKA 1PIGA 3EDEA 3OA5A 3AXIA 2WK2A 2WHJA 4Q7NA 4WJXA 1Q6CA 1HT6A 2F61A 4CCDA 4AZBA 3BXWA 1JF6A 5BYWA 4PTWA 4M29A 2X09A 3PZ9A 2DH3A 3ZSSA 2CKRA 2NW0A 2JE8A 4MADA 2DT3A 1HVQA 4JCMA 4WKAA 3L2LA 3AIWA 4X0NA 1ZBVA 4DWSB 2WCGA 1WB0A 1LWHA 2C8NA 3VTRA 5KZ6A 3SUVA 1DHKA 5E6YA 3DYPA 4D6JA 4HTYA 2BHUA 1GQIA 1M03A 4OJYA 1CENA 4U5KA 2J8FA 1J0HA 3AYSA 1QBAA 1LQ0A 1TA3A 1V6VA 3DHUA 1Z32X 1ITXA 2E3ZA 1AQHA 2DSZA 1LG1A 5HXMA 3VIFA 1GVIA 4PMXA 5A8OA 5D4YA 3VINA 3W27A 2V5CA 5I0DA 3KE0A 2CEQA 2YJQA 3CUGA 2XVGA 2EJ1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CTN A;  5A6B A;  1LL6 A;  5HPC A;  3AIV A;  3WQ8 A;  3VIJ A;  5EBA A;  4U33 A;  1DWG M;  3AHV A;  2WZH A;  3GXD A;  4H8H A;  4MNJ A;  1PZ3 A;  4MB4 A;  4JFT A;  2E9M A;  2OYL A;  2YL6 A;  4CVU A;  1W3J A;  1VBU A;  2D22 A;  1UQZ A;  2VR4 A;  5GPR A;  4W8A A;  2WSP A;  4PBG A;  2J7F A;  4BA0 A;  4BQ5 A;  3CPU A;  3SEP A;  2D3L A;  3WUF A;  3L4X A;  2W66 A;  2ZUW A;  3THC A;  4J3S A;  5FKY A;  4B3L A;  5IFT A;  2ZX9 A;  3AS1 A;  1XYF A;  1ISW A;  1DED A;  3F4V A;  4HA3 A;  1JXJ A;  2ZWY A;  3N11 A;  2ZXA A;  3CZL A;  3TA9 A;  3T0A A;  5BXP A;  4QDM A;  3SCV A;  3HMC A;  2O9P A;  3AYR A;  4UFL A;  4TVD A;  4UFJ A;  3SCR A;  3WUE A;  1UWS A;  4AEE A;  3WL1 A;  5CLT A;  1BYD A;  3WF4 A;  1FP8 A;  1WZL A;  1RH9 A;  1WCG A;  2VRQ A;  1C7S A;  5C71 A;  1HJS A;  4J3X A;  4AEF A;  1W2V A;  1XYZ A;  1JD9 A;  3MUA A;  1KGX A;  1LJY A;  1MVY A;  1CGV A;  3CLW A;  3I3B A;  4PRW A;  3LPO A;  1GW1 A;  2WCA A;  2JF7 A;  4W7V A;  2WBK A;  4L4O A;  1DWH M;  4NSB A;  5HOS A;  3PZT A;  1E73 M;  2XHY A;  2RGM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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