1GQNA

Native 3-dehydroquinase from salmonella typhi
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVSRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKQASAPGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
publication title Comparison of Different Crystal Forms of 3-Dehydroquinase from Salmonella Typhi and its Implications for Enzyme Activity
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhi
total genus 89
structure length 252
sequence length 252
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2001-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1gqnA00
3PS7A 3IV3A 3O15A 3NR0A 4MOZA 4BWLA 4FHAA 4IPJA 4JX4A 4KKXA 3EB2A 2RH9A 3LCGA 2RDTA 3ABOA 5LNRA 4MJZA 3EWBX 3TMLA 3HGRA 4JTEA 1DVJA 3GIYA 1YXYA 4ZQNA 5DXYA 3W7IA 4E0CA 1VH7A 2UV8G 3MI2A 5F2MA 1TO3A 4DBDA 4IMFA 4K7YA 1L6YA 2HTMA 3W1TA 1FDJA 3W7OA 3A22A 1FUYA 1XBXA 1LLZA 1LYXA 3TFCA 4FXRA 5DCDA 1L6WA 1D9EA 2FB3A 1F05A 4M6PA 5AHFA 3BPWA 4WXZA 4NJIA 5A5WA 3S9YA 4E38A 4AH7A 1FCUA 3Q94A 3W88A 3FKRA 1GTEA 1VYRA 1A5CA 1X1ZA 2JGYA 4LC8A 2A0NA 4NXSA 4OWGA 3TC6A 3ZWTA 1ICPA 4B5NA 3DH7A 2Y70A 3HGSA 1WBHA 1OFBA 4AVFA 1Q6LA 3PG9A 4WY0B 5KMYA 4YWIA 3C2RA 3P67A 1OX4B 2CZEA 3LRKA 1TJRA 3WJYA 5K9XA 4AXKA 1LZOA 4PH6A 3EX6A 3TIMA 2QDGA 1Z48A 3FJ6A 3A9IA 1YPFA 5IBXA 3G1FA 1XFBA 1ALDA 1WDWA 1W1ZA 2Q3OA 2ZA2A 3VE9A 4PL1A 4O52A 4LS2A 4EWND 3W7EA 3G3MA 4RZ5A 4Y9AA 2A7PA 1WYIA 1RQHA 3VE7A 3LRLA 3GYEA 3ZR4A 2R91A 4HN4A 4NXKA 5CPMA 2G96A 1H1YA 3P5YA 1UBSA 4I7WA 3LCLA 3VFLA 3W86A 5D02A 4K8EA 4K38A 2OZ0A 3W7NA 3UWVA 1OFPA 3W1QA 3W73A 4YCPA 2DJXA 4UTIA 5FEXA 1G69A 3CQ0A 2QCDA 3NAVA 4UIOA 2B7PA 2NV2A 3LTSA 3W7CA 3NQGA 3GDMA 1VLIA 2XN0A 3TSMA 2W6RA 1AG1O 3TQVA 3E12A 5CZSA 3TK7A 5C6MA 1JVNA 3LRMA 4FNRA 1H7RA 3LI0A 3W7RA 3A5FA 4O28A 4O1BA 3BLFA 4OT7A 5EMUA 1HUVA 1W3NA 2DZUA 1H1ZA 4ZQCA 1K7FA 4IJBA 4KFOA 1UJPA 1BEUA 1ZHAA 1VCGA 3LI1A 4MIMA 1TPVA 4XKYB 1YDOA 2QCNA 1EP3A 5F2LA 1OF8A 4LRTA 1AW1A 3NOEA 4IXHA 3NQ6A 1I45A 3UWWA 2QCGA 1VC4A 3TJLA 2H8ZA 1QO2A 3PBYA 2NXGA 4O50A 2J24A 2NXHA 4TO8A 3NZRA 3OVQA 3W83A 1LTDA 1M7OA 1DL3A 5BNKA 4MVAA 2NZLA 3HG3A 2ISWA 3PUDA 4JN6A 1DQXA 1HL2A 4FNPA 2GQ9A 2XFWA 4E2BA 1G7UA 5LGZA 2VENA 3STFA 2KZHA 2PC4A 1PHWA 1AW5A 5EBUA 3M5YA 3E96A 3CM4A 3S5OA 4GUHA 5BMWA 5D32A 2OT1A 3CIXA 2H3BA 2EKCA 4IXXA 4Q4KA 8TIMA 2WO5A 2NXIA 1V7YA 2QUUA 3IIZA 3HG4A 1TMHA 1LOSA 3C56A 2J27A 1IXOA 2G5WA 4MFDA 4MUZA 4CNOA 2JKPA 4UFKA 4X2RA 3C2EA 3W2KA 3LCFA 4FNQA 3DFNA 4K36A 5G5IA 3LCIA 1TPH1 5G4WA 3BLIA 1DHPA 3ATZA 3VKJA 1KV8A 2JK2A 3IIOA 3W75A 1JRCA 4JTTA 1KBJA 3BG5A 4OE7A 2PRHA 1TPB1 2DORA 1QMLA 2Q8LA 3L5MA 4YL2A 1EWEA 3C8FA 3P60A 3FJLA 3KVMA 3M16A 1EX5A 1A50A 3QFEA 3T78A 4PC8A 3SFKA 4HT3A 2R8WA 5D09A 3UQNA 4O12A 5G1YA 1ME9A 2Z6IA 2VC6A 3QM3A 2E6FA 3AO0A 2X1UA 5KZMA 3DHFA 3GNDA 3EX2A 3KRZA 4PCFA 1GEQA 1YTEA 1HFBA 1MEWA 1ICSA 1WX0A 2TRSA 3G8EA 3P82A 4N6FA 4U28A 1FCQA 2EPHA 4UTTA 5TIMA 2B4GA 2YX0A 1OYBA 3O6DA 4FO4A 2ZZ4A 3QSRA 2WSQA 2J6XA 1XUUA 4CCEA 3LM7A 3SY5A 4NT0A 4NX5A 3QW3A 4LOCA 5G2IA 1GVQA 5AB3A 4O1CA 1I2OA 3N9SA 2NLIA 5E93A 4UTJA 3KOFA 1CX9A 3N2XA 1D3HA 4Q33A 4ZZ9A 1PHQA 2A5HA 1R47A 3G24A 1WQ5A 1XDMA 3EWYA 4RLIA 5AHEA 4AHQA 4CQAA 1F76A 4H3DA 4LVBA 4QM1A 2HSAA 3GZ3A 2V8ZA 3W2JA 1DKWA 5HNRA 2ZZ1A 3ABSA 3MUXA 4L4LA 1SO4A 3DFTA 4NQ1A 2OCZA 1A5AA 2FLIA 3H54A 4GBUA 4Z1AA 3KVKA 3UY7A 2B7OA 2WNZA 2DZTA 5G4EA 4UTHA 1VHCA 3GKFA 3QH2A 2YPIA 3JRKA 2JGQA 2DZPA 5LSMA 3WJZA 3C0JA 1XL9A 3B04A 1CI1A 1K7XA 4Z1BA 2ZZ7A 2ZZ5A 4O11A 3ABQA 4R34A 3L65A 5CKSA 4WY0A 3A21A 3WK1A 1LROA 2CLHA 4UNKA 1VHNA 4O19A 6ALDA 1OX4A 2WKJA 3BVJA 3TDFA 1KLYA 3PSVA 3OA3A 1P5BA 4R7JA 4R33A 2A7RA 3L2IA 3GXTA 5AYZA 2HS6A 2EHHA 2VEMA 2ATMA 5I3JA 2ZRYA 5K4XA 2NUXA 4N9DA 4NNAA 2J9ZA 1SZFA 1Q6RA 3MW7A 4ZQRA 4ML9A 1F7BA 4KWVA 4FNTA 1K8XA 1H5YA 5FF4A 1ONRA 5HUPA 3DFOA 5K2ZA 4CCDA 3W1LA 3THAA 1H7OA 3G1YA 3MO7A 4DF1A 5I3GA 4O15A 1LBLA 4ZL1A 3VNDA 1S5WA 3LLDA 4OQVA 4S2BA 2ABAA 5FEPA 1YYAA 1O5KA 2I14A 3LERA 2AQWA 3GB6A 4AF0B 3WK3A 4Y8FA 1KBIA 3UWUA 1H63A 4LY8A 3PBWA 1SUXA 4BWLC 1EA0A 5F4SA 1LM1A 1L2UA 3IVSA 4NNCA 3B0UX 4UFIA 2ZTKA 1I4NA 3BARA 4GUJA 4YCOA 1JCXA 4JTLA 2Q8ZA 3UWZA 2V2CA 3SI9A 3W7QA 3S1XA 1LRNA 2BZNA 2YYTA 1SQ7A 4N6EA 1K7EA 3NQAA 2G97A 3TUUA 1E51A 1SW0A 2AAMA 3B06A 2TMDA 3BGGA 3M5XA 3UXDA 4NJHA 3Q58A 2C1HA 1B9BA 4DXVA 2VEKA 4UMAA 4JIPA 2CWNA 1TV8A 4XKYA 4UTMA 1OF6A 3TV8A 3IVTA 3EKZA 2VFDA 4BF9A 1SZEA 3M5VA 1TTPA 2B7QA 4C1LA 1RD5A 2FDSA 4IOTA 2Y88A 5EPDA 4NNBA 4GNJA 5F4WA 4NZJA 3MJYA 3BG3A 4K37A 3HGJA 3G1HA 1GJPA 2PRMA 2E68A 3W70A 3PUOA 4LS1A 3TE9A 3KRSA 2Z0IA 5IBXC 3P62A 2C0AA 3I65A 4TMBA 4MY9A 4RZ6A 4UTLA 2QAPA 1G7VA 3N73A 3I6RA 5C2XA 4WJEA 5AHMA 4PEKA 1K02A 3S6DA 3DKJA 4ZQPA 3EWUA 5TBOA 4QNEA 5H91A 4PFMA 3MBDA 3IIPA 2VKZG 1VGAA 4UCGA 3STCA 2FPVA 3MP4A 2VELA 4IMCA 4BFAA 2E5CA 2BX7A 5LKYA 2Z2UA 3DI1A 1G4SA 3N3MA 2CZ5A 3W7GA 4XBKA 1VCVA 4JTFA 2QUVA 3AJXA 3N9RA 4RJEA 3CLMA 1LRQA 1B4EA 1ZCOA 3EWWA 2FPYA 5C54A 3O06A 1A53A 4WD0A 4P61A 2Y6ZA 1S3HA 2NWSA 2ZRZA 3NPUA 3SR7A 1Q45A 3MI6A 5HMSA 1TPEA 1NEYA 3EEGA 5BRBA 2CLOA 5CSSA 4JYFA 1KFEA 5K9CA 4GUIA 1TPDA 2RDWA 4MZYA 1TTIA 3PBVA 3KFTA 2V0TA 3INPA 1ME8A 1P4CA 3CIWA 3QMRA 3C2FA 2X16A 1OABA 3I7QA 4FX7A 3A24A 3NXFA 3HQ1A 2Y61A 4ORMA 2VFGA 1AMKA 3MI3A 3B03A 4KWWA 3UWQA 4MFEA 3M41A 1PE1A 3TQKA 2ATSA 3W7LA 1X8FA 3MYPA 1VR6A 1J2WA 3NQ7A 4HIBA 2Z6JA 3W84A 4HNTA 1KTBA 1O95A 5DCEA 4WUIA 3CHVA 1TPUA 4G1KA 3M6YA 1WBJA 1W0MA 2ISVA 4DPQA 1KLZA 1OFRA 3BK0A 4UFHA 5LNSA 2P1FA 1ADOA 3T40A 3QMTA 2NX3A 5GVJA 4RCXA 1VLWA 4LW7A 3FS2A 5DN1A 5EKYA 1SW7A 3E49A 2V5BA 1KFJA 4L4MA 4M5PA 2VFFA 3M43A 5AN7A 1SPQA 5EA9A 1IIGA 1DJQA 3MHUA 1C8VA 3NL3A 1LP6A 4K8HA 3OVRA 4Z0SA 2QCCA 3W1AA 3PVFA 2IQTA 1YXDA 4MYAA 3UY8A 3L66A 2RKXA 5BW6A 3HB9A 1QWGA 3W22A 1QPNA 4GRSA 4Y90A 2FQIA 2Y7FA 3GDTA 4IX0A 5U7SA 4KFPA 4XWUA 1DV7A 2ZZ6A 4XUGA 3W1PA 3MBFA 3W7PA 3LTPA 3MP3A 1QFEA 3W9ZA 3QMSA 4QITA 4CQ9A 1P0KA 5MHBA 3PSWA 3B05A 3S1UA 1TRIA 2WSYA 3R2GA 4QSHA 5BOOA 2I9EA 3GAYA 2H90A 5I3IA 1Z42A 3GKAA 3F4NA 2LLEA 4KFNA 1GOXA 4LNYA 3TAOA 1UB3A 3LXCA 3W74A 3WJSA 1W8SA 4O57A 1RZMA 4ADTA 2FTPA 4HHPA 1NSJA 2CLKA 4O1AA 3GLCA 3W1NA 4Z1DA 4K39A 2Q3RA 4J9JA 4QNWA 1H61A 4HSNA 3LHVA 4AWUA 1JUKA 4ICNA 5FESA 1RQBA 3GR8A 3P80A 5G2WA 1IXNA 1UASA 5HULA 2GJLA 3LCHA 5AC7A 3OG3A 1FDZA 3NGJA 4HPJA 4TMCA 2YFNA 3LHTA 2HS8A 2VFHA 1SR9A 1ZAHA 2RFGA 4JYDA 4UTTC 4RZ4A 3K30A 2QAFA 4IMEA 3L5AA 3CWNA 5LZLA 3M7WA 1CW2A 2FFCA 2ZRUA 4AF0A 4N9BA 3W2UA 2I1OA 1UUMA 3KHJA 3LXAA 3W2NA 3W76A 2WNQA 2OT0A 5DBUA 1F6KA 1JUEA 4A21A 1HO4A 1TQXA 5KITA 1IF2A 5C5YA 1FDYA 3G1SA 1FWWA 1X7FA 4LVFA 5FF7A 2EAWA 4O4VA 2CLMA 2C6QA 3ZFHA 2FPTA 4UR7A 3OVPA 3YPIA 1AK5A 3W85A 1W5QA 3A5VA 5CPOA 3CEUA 4D2JA 2PRLA 5FEZA 1TTQA 2QKFA 4XQ6A 4M6QA 1F2JA 2YR1A 5E0KA 3NQEA 5D2XA 2FJKA 3O1NA 3W1XA 5HWNA 3V1PA 2H8XA 1AL8A 2V82A 2CU0A 5HUOA 2E5DA 2B0MA 3MMTA 1GG1A 4S1FA 4ONVA 5HJLA 3PB2A 2QDHA 2YGYA 5E1QA 4MPQA 5CGQA 1UCWA 1PVNA 2ZDRA 4PA8A 4JTUA 3E02A 1YDNA 1LBFA 4GUFA 2V2DA 1OFOA 1T8XA 4ORIA 4FX8A 1EB3A 4LU0A 1RVGA 4M6VA 4Q32A 5F1UA 1F6PA 3TC7A 1KM0A 4QAIA 2GVLA 4LV9A 3CWOX 3G1VA 3GDLA 1LORA 1YTKA 3E0IA 3NPWA 3BO9A 3LHUA 3L0KA 2Y7EA 1WOAA 1KM1A 4JTKA 1IIHA 1KTNA 3BLEA 3VCRA 1K8ZA 1THFD 5KSWA 1VS1A 1IGSA 5HWJA 1WA3A 1XBVA 4XZ9A 2QJIA 1C29A 3BW4A 1XXXA 3C2VA 3O8AA 4FX6M 3EX4A 4UMBA 2ZRXA 2WJZA 1MEHA 1M7PA 1TIMA 1DJNA 5DELA 3CB8A 3R12A 1K03A 5KZEA 1K3UA 2BTMA 3O05A 2D73A 2P0OA 1OFQA 1W5PA 1DOSA 2YW3A 3RLVA 3TW7A 1NAL1 2VFIA 5FEWA 3PAJA 4A2RA 3WK0A 2ZFAA 2NV1A 4DO5A 3ABRA 2C18A 2JKEA 1NF7A 1PS9A 4MYXA 4TIMA 1TPFA 5D04C 3RMJA 3N2MA 1G4EA 5K7JA 4MY1A 5KZDA 1U5JA 3S5YA 4MZ8A 3JS3A 1YADA 3H55A 4O1DA 6TIMA 3NEVA 2A6LA 3DHDA 4M7TA 1ML1A 4LV4A 3GX9A 4CLMA 1SO5A 1XCFA 3TMQA 1FCBA 2A7NA 3N34A 2W0UA 2ZCGA 3OHIA 2C19A 3EWZA 3RK8A 3GVGA 4I9AA 5F2GA 3DFSA 1ZFJA 3GXPA 5LNVA 4YMZA 3TQ0A 1ME7A 5F2IA 1J5TA 4I7UA 3NM3A 4O0ZA 1KV5A 3QPYA 1PCKA 3ANYA 1DORA 3STEA 3KAOA 1OJXA 2JKAA 3Q2DA 1XUZA 3E9AA 1SZGA 4JX6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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