1H2JA

Endoglucanase cel5a in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-cellobioside at 1.15 a resolution
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Direct Experimental Observation of the Hydrogen-Bonding Network of a Glycosidase Along its Reaction Coordinate Revealed by Atomic Resolution Analyses of Endoglucanase Cel5A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 123
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2002-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h2jA00
1D2KA 1ODZA 1M04A 1QBAA 5C71A 5I6SA 1H4PA 5BYWA 1NWSA 1JZ5A 1VBRA 5CGMA 3CHEA 1MW2A 2EQDA 1KXVA 3OG2A 3SURA 4ZEPA 1LG1A 2UY4A 2DIEA 2WSPA 4WKHA 2ZXQA 3CUJA 2GVYA 2BY0A 5JIWA 1J0IA 1XHGA 2EPOA 3OZOA 4EAMA 5LA1A 3GZAA 1OGSA 4JAWA 3AMLA 3FHAA 1CTNA 3AZRA 5D9MA 1OBAA 1OT1A 2VRKA 2J7FA 3ARZA 3B9DA 1NWRA 4AD3A 1GZJA 3PTQA 1EDQA 3GYCA 3MKKA 3RM8A 2WCGA 3TA9A 3T2QA 3NYDA 2QLYA 2XVPA 3CHDA 1BHGA 3BXWA 2VUYA 2XTKA 1OGBA 1BAGA 4WKAA 1B3XA 1WKYA 1KR0A 2VX4A 4HOWA 1OGGA 4EANA 1KXTA 3U7VA 1JFXA 3AS3A 3SCSA 4RE4A 2PBOA 3SUTA 4YPJA 3FY1A 4TOQA 4DM1A 2GFTA 4WSKA 1U2YA 1WZLA 2DDXA 3MV01 4J3SA 2XWEA 3BAYA 5CLWA 2WZHA 5JBFA 1GOMA 5A2BA 3SCRA 3ARVA 2BVTA 7A3HA 3G6MA 4TUFA 2E40A 1K9FA 4LGXA 2J47A 2CIPA 4HPHA 5BWFA 1B9ZA 4B15A 5DEZA 1UWSA 1UG6A 1TMQA 1UQZA 1JZ6A 4EKJA 5LYRA 4Z2GA 4OIFA 4CVUA 3KL3A 3VDAA 1W9UA 1NP0A 2CBJA 3CIVA 3EDJA 5D9PA 3GH5A 2VCBA 2QPSA 3QOMA 4J3VA 2ZUNA 2EJ1A 4KRTA 2XUCA 1XCWA 3PHAA 2J25A 1VAHA 2ZXAA 1WE5A 4LXFA 4TX8A 1KQZA 4WF7A 1F4HA 2VR4A 5A8MA 1W3JA 2DSVA 5TD4A 3LPGA 4CN6A 1DWFM 4N0RA 3GH4A 1P6WA 5FD0A 3N18A 4JKKA 4Y7EA 5E6ZA 1S46A 1G5AA 3IJ8A 3PZIA 2XWDA 1UKQA 1FFQA 2J7DA 4GO9A 4JFVA 1E71M 4DWSD 1HJUA 1UH4A 1WCGA 4F9JA 1JZ4A 4PN2A 5KZ6A 1US3A 4AZ5A 4U31A 1C8QA 2Z1SA 2OWWA 1MQPA 1ESWA 2WC7A 2X09A 4N42A 1HL9A 3WH9A 4D71A 3MUAA 5D8ZA 3AIQA 4P8WA 4V2XA 1V3IA 5ABEA 4KGLA 3ARQA 4D1JA 4D6EA 2WHMA 5FCZA 2O9PA 2D23A 5BXPA 1OWQA 1QNSA 1IT0A 4LYPA 4AD4A 4UQEA 1CDGA 1MWOA 3ALFA 1H5VA 3GXDA 4ACZB 2OYMA 4ZFMA 4UQ9A 3VD3A 1JZ2A 1B2YA 2CHNA 2DSKA 2BY2A 1HVXA 1EHAA 1XH0A 1BTCA 1LWJA 4OUEA 5BROA 3VGDA 3HMCA 4PMUA 1HJSA 1QW8A 1EDGA 1HX0A 1W2PA 3D5HA 4CCCA 2D0FA 3WKZA 5C8BB 3UESA 1RH9A 1W9PA 2JIWA 4GI9A 1GHRA 4CD8A 1JFHA 4JFWA 1XSIA 4HU0A 3U5UA 3THDA 1E70M 4JL1A 2PWEA 2EPMX 3WD1A 2WCSA 2WPGA 1IZKA 4BQ4A 1GHSA 1HJVA 3PZ9A 4RE2A 3WDRA 4D6HA 3GXIA 4MJ4A 3WSUA 5FL0A 2W61A 3ZT7A 3RDKA 4GPNA 5I24A 4R27A 1J0JA 1V6XA 3CGTA 1HKIA 1QHOA 2CERA 4FK9A 2JE8A 2PB1A 2Y2WA 2J7BA 4AZBA 4NZCA 4J3UA 2CYGA 1KR1A 5BXRA 1OT2A 1VJSA 5A8OA 3W38A 1TZ7A 3K46A 1MQQA 1NM9A 2WHJA 1UHVA 4ATLA 4BZYA 1IV8A 3VIOA 1W3HA 4WK9A 1CXLA 1HNYA 1J0ZA 4JZ5A 2XG9A 1N82A 3F5LA 2BFGA 2ZICA 3BAJA 1UH3A 1J0YA 3AXXA 2CETA 4TX6A 2C8NA 5A6KA 1FOBA 1G9HA 1HKKA 2TAAA 3W6MA 2BHUA 5I79A 2YBUA 1GJUA 4W5ZA 3WENA 4PMNA 1Z32X 4PMQA 1LL6A 1VBUA 3ZJ8A 1R8LA 3GTNA 1BVZA 2ZWZA 4B9YA 2PWDA 1KXQA 1OCQA 1RPKA 3L4TA 3WEOA 1HJXA 1TR1A 1E4MM 1A47A 3UG5A 4U3AA 3AZTA 2J74A 3WNMA 1I75A 5I0DA 2X2YA 4GZEA 1M7XA 3VDBA 5JUVA 1KBKA 4X9YA 3T2PA 3WUFA 3CZJA 3L4YA 3WIJA 1WNOA 2DSZA 3LPFA 1E5JA 1E5NA 2VOTA 1E9LA 1UZ1A 3W29A 2J7HA 2YJQA 4MPKA 4UFKA 4UTFA 3PTKA 2WBKA 2WMGA 2ZX6A 3VMOA 1OIMA 2XSBA 2E8ZA 3PZQA 1XSJA 1BPLB 1R7AA 1E43A 3W27A 3ZR6A 4QCFA 4GQQA 5CGTA 3ZQ9A 3VO0A 1G01A 2BXZA 1YHTA 3TONA 3ZMRA 1J0HA 1GQKA 3WF1A 4QCEA 5DFAA 2DT0A 1OB0A 3SCTA 2EBNA 2W63A 1XGZA 5EFFA 1W9VA 1H2JA 4QDMA 2D2OA 4HPGA 3SUWA 4AZHA 3RM4A 4D6FA 4AC1X 2W66A 1V03A 3BMVA 1E1EA 5DT7A 1JF6A 3WDJA 1JL8A 1AVAA 2GK1B 3CZEA 4AD5A 5CJ5A 1EOMA 1BYBA 2J8FA 2XIIA 1I1XA 4JHZA 1XH2A 1E4LA 4DUXA 3WQ4A 2E3ZA 1J0KA 1JDAA 1CENA 2A3EA 1JXJA 2WC4A 4IM4A 4CU7A 8A3HA 5I3DA 1PAMA 4U2ZA 4GQRA 4HA3A 4PMYA 3M7SA 3GH7A 3SCOA 4H8HA 3MMWA 1IZJA 4PMDA 1C91A 3AMGA 3CO4A 3EYPA 3SUSA 1PPIA 3RJXA 1EO7A 1XV8A 3WMCA 1MW0A 2W62A 2W91A 4KMQA 5ABGA 2JALA 1DTUA 4UFMA 1JDDA 1EXPA 5CSYA 4AD1A 3BLKA 1G1YA 4AMCA 2V3EA 4W7UA 1QHZA 1VFUA 4GINA 4MAZA 5AC4A 4OOZA 5M3WA 4UFJA 1UR2A 1LLOA 2WMFA 2YL8A 4HZ7A 3APGA 2VRJA 2WW5A 3UEQA 3WF4A 1ZU8A 2JEQA 2YLAA 4QP0A 1LL4A 4AD0A 2G8ZA 4ZENA 1PX3A 4TVDA 1FP8A 1GQIA 1YQ2A 4YHGA 1QI3A 2PF0A 2CKRA 4R5EA 5CSUA 8CGTA 1JGIA 3GNPA 2QHAA 4D72A 4UNIA 1VFOA 3FAXA 3M07A 5ABFB 1GPFA 1B1YA 4C7FA 4C7GA 4UFLA 4UCFA 3OLEA 2PC8A 4PTXA 4CN4A 2VCCA 3WFLA 1FH9A 3RCNA 2X8RA 1V6VA 4ACZA 3M46A 3MUIA 2CXGA 4OZOA 1BYAA 1WDPA 4P7NA 4PMXA 4PTMA 2OYKA 1XSKA 3MMUA 1J01A 1EO5A 2WZEA 1GOQA 2BV9A 2YL5A 5CG0A 1DHKA 1JIBA 2FGLA 5A8PA 2J7CA 2VZSA 3WUEA 1EA9C 1M03A 1BFNA 3RIKA 1E0XA 3OA5A 4IUGA 1CXHA 4GI6A 3ZM8A 3A4XA 9CGTA 4U5IA 1VEMA 3UG3A 2ZOXA 4LPCA 3WY1A 1E0WA 1CXIA 1MW3A 1VRXA 1BGAA 1E0VA 1ZBVA 5E70A 1Q6EA 1KXHA 4JKLA 1L8NA 3TP4A 4ML4A 2ZX8A 5A6AA 1JZ3A 4J7RA 1UA3A 2XFFA 3AS1A 3L4ZA 3WQWA 1VFMA 1JZ8A 4XZBA 3PZMA 1RD6A 2IXVA 2WMKA 3NDYA 2D0GA 4EK7A 2BS9A 2GDVA 3CHFA 3VOCA 2WSKA 3OLGA 3SUUA 3BGAA 2E0PA 2J4GA 3VKKA 1KGWA 3N1AA 1UH2A 1ITXA 3B9EA 4OJYA 1C7SA 5AY7A 4AZGA 2FDMA 1UD4A 3AXHA 5M5DA 1UR4A 2QF8A 3B9AA 3CUGA 1W9DM 1WZKA 4HZ8A 3MSGA 1V3KA 4D6IA 3L4WA 1UD6A 3AS0A 3VGBA 1KGUA 1D3CA 4RE3A 4AXNA 3NSXA 1KGXA 3NDZA 3CUHA 3POCA 5D9OA 2D3NA 1OD8A 3QR3A 2G3NA 5IDIA 3WUBA 3RPMA 1Q4NX 2OSWA 2W92A 3AHXA 4V28A 5BRPA 3MU7A 2YDSA 3OLDA 2ZUUA 2J7GA 2XM2A 2Y4SA 3AISA 5IFTA 4Z2KA 3EMCA 1H49A 4J3TA 4MDOA 4BA0A 1LJYA 4QLKA 4HU8A 2GJXB 2W5FA 3UCQA 2BHZA 3CLWA 1CZ1A 5HNNA 1QPKA 4PMZA 2XGIA 2PWGA 4P7OA 5GQBA 3GXMA 2XPKA 1DWGM 2YL9A 2ZXDA 3WBAA 4ATWA 5BRQA 1NARA 1KWKA 2NT1A 1PBGA 5JBDA 2ZX5A 1EGZA 1V0NA 3DHPA 5F7UA 4JHOA 4WIWA 4M8UA 3WFZA 3K4AA 4JFSA 4Q7NA 4CVWA 5A3HA 4C7DA 2GJRA 1GORA 4A3HA 3ZO9A 2E9LA 1E6NA 1TVPA 4JFTA 1D7FA 4UOJA 3BLPX 1FFRA 5DT5A 4X0VA 3SEPA 2WMIB 1ZS2A 5GNYA 2GK1A 1QVBA 1CECA 2DH2A 5HPCA 1E3XA 4MJ2A 4CCDA 4GKLA 1ECEA 1SMDA 1B31A 2XFYA 4XUYA 3AROA 5JIPA 2WLZA 3UR7A 4AEEA 1FH7A 4B3LA 2C7FA 4EE9A 2ZWYA 2WVVB 4F79A 1TUXA 5CPQA 4AIEA 4NRRA 2ESCA 1VFFA 3T08A 3ZIZA 1L0PA 2FHCA 4D6JA 3ZJKA 1J11A 1VF8A 3N15A 1HP5A 5D8WA 1W1TA 1OD0A 3AICA 4FMVA 5A6LA 1W3KA 3WNLA 3OB8A 4PMRA 4UR9A 5A95A 3VMPA 4TTGA 4LYRA 4CU8A 1DWAM 6CGTA 3TTOA 3VIFA 1E56A 3B8SA 4LX4A 3WUGA 3EDKA 4W7VA 2D3LA 1UWIA 2XVKA 1NP2A 2IUZA 4HOZA 1HJWA 1WZAA 3WL1A 3ZJ6A 3VNZA 4J3XA 1UQYA 3N11A 2GSJA 3VX1A 1UD5A 1QBBA 3VD4A 3EMQA 1XRVA 2G4FA 3A4WA 3AOFA 1V08A 3CHCA 3HN3A 4OOUA 3EMZA 4E2OA 3KWXA 1GCYA 1WDSA 5E0FA 4HZ6A 4BQ2A 1W1PA 2VI0A 2F2HA 5HBFA 4PTWA 1SYTA 3WQ5A 1E6PA 5D9NA 1PX8A 2AOSA 1B0IA 2WK2A 4TVCA 4MDPA 1R87A 1UOKA 3PN8A 3MUY1 1H11A 5E6YA 4KRUA 4Q22A 1ISWA 3BC9A 4Z2LA 2CITA 4AW7A 1V3LA 2WWDA 1ISZA 1UD2A 5A6JA 3VNYA 3MO4A 1CGWA 1O7AA 3I3BA 4E8DA 4B16A 3CZ8A 3N9KA 2WXDM 2VURA 3VX0A 1UA7A 2VZOA 1CNVA 2CPUA 2WWCA 1BG4A 2JF7A 4MNKA 3SCWA 3A47A 3WH8A 2XSAA 1XC6A 1E6RA 1JG9A 3T0DA 1AQHA 2JF6A 3AHVA 1FP9A 1EIBA 1WPCA 2NT0A 4U33A 3ECQA 4M81A 3PZGA 4PMOA 1PIFA 1MXGA 4D6CA 4W8BA 5A2AA 1OSEA 3BAWA 3OGSA 3RILA 4CN1A 1TA3A 4FLQA 1W1YA 1B3ZA 3UR8A 3CH9A 4F9DA 2PI6A 1I1WA 1C90A 1PEZA 3AIEA 4TXEA 1Y7VA 3WF3A 5AYIA 4TVUA 3K8MA 4DUVA 3II1A 1GOWA 4MB4A 5KEZA 3ZT6A 1CGYA 2VX6A 2HVMA 1XD0A 3BCDA 1E4IA 1WZMA 1G0CA 1HVQA 3PBGA 1UR8A 1U30A 1V6YA 3AIUA 1NH6A 1ODUA 2PBGA 1E15A 4J3WA 1V6WA 1M01A 1GQJA 3PZOA 3ZJ7A 3L4VA 1UZ4A 3EDEA 2V3FA 3A6OA 3T09A 3VDHA 5I5RA 1JNDA 1CBGA 3D3AA 1HXJA 3K8KA 3AXIA 1RP8A 5HDRA 1W91A 5AYBA 3VPLA 1ZBKA 4AZCB 1Q6GA 4UQDA 3PZNA 2WNWA 1EQCA 5I23A 1B3YA 2A3CA 1ZJBA 2WC3A 1FH8A 1V3MA 1EDTA 4E4PA 5DMYA 4W89A 4MNMA 3F5JA 3IANA 3GBEA 2WAGA 3QHMA 2DPEA 1ZJAA 1JI2A 5I78A 3A4AA 1CIUA 1HIZA 3VMNA 1W3LA 4MTVA 2XGBA 1B3WA 2A3AA 2WYSA 4A3YA 4PUDA 3T0AA 4PSRA 3WMSA 1W9XA 2F8QA 3VD9A 1CYGA 1GW1A 2QMKA 3MS8A 4W7WA 3WNKA 3CPUA 2OSYA 4AYSA 5GPRA 5E09A 1J12A 2O92A 1WAWA 3W4RA 4UOQA 4F8XA 4J28A 4MADA 4S3KA 4UQBA 4AZ6A 1KQYA 4JCLA 2WB5A 4CUCA 1H0IA 3OGVA 4M82A 1MYRA 4MB5A 2OLHA 2G3IA 1B30A 1V0LA 2XVNA 1VB9A 2FHFA 1B3VA 1HJQA 2WMIA 3GDBA 3AHZA 5HXMA 2EPNA 1K9DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1D2K A;  1ODZ A;  1M04 A;  1QBA A;  5C71 A;  5I6S A;  1H4P A;  5BYW A;  1NWS A;  1JZ5 A;  1VBR A;  5CGM A;  3CHE A;  1MW2 A;  2EQD A;  1KXV A;  3OG2 A;  3SUR A;  4ZEP A;  1LG1 A;  2UY4 A;  2DIE A;  2WSP A;  4WKH A;  2ZXQ A;  3CUJ A;  2GVY A;  2BY0 A;  5JIW A;  1J0I A;  1XHG A;  2EPO A;  3OZO A;  4EAM A;  5LA1 A;  3GZA A;  1OGS A;  4JAW A;  3AML A;  3FHA A;  1CTN A;  3AZR A;  5D9M A;  1OBA A;  1OT1 A;  2VRK A;  2J7F A;  3ARZ A;  3B9D A;  1NWR A;  4AD3 A;  1GZJ A;  3PTQ A;  1EDQ A;  3GYC A;  3MKK A;  3RM8 A;  2WCG A;  3TA9 A;  3T2Q A;  3NYD A;  2QLY A;  2XVP A;  3CHD A;  1BHG A;  3BXW A;  2VUY A;  2XTK A;  1OGB A;  1BAG A;  4WKA A;  1B3X A;  1WKY A;  1KR0 A;  2VX4 A;  4HOW A;  1OGG A;  4EAN A;  1KXT A;  3U7V A;  1JFX A;  3AS3 A;  3SCS A;  4RE4 A;  2PBO A;  3SUT A;  4YPJ A;  3FY1 A;  4TOQ A;  4DM1 A;  2GFT A;  4WSK A;  1U2Y A;  1WZL A;  2DDX A;  3MV0 1;  4J3S A;  2XWE A;  3BAY A;  5CLW A;  2WZH A;  5JBF A;  1GOM A;  5A2B A;  3SCR A;  3ARV A;  2BVT A;  7A3H A;  3G6M A;  4TUF A;  2E40 A;  1K9F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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