1HF6A

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in the orthorhombic crystal form in complex with cellotriose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Direct Experimental Observation of the Hydrogen-Bonding Network of a Glycosidase Along its Reaction Coordinate Revealed by Atomic Resolution Analyses of Endoglucanase Cel5A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE B
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 119
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hf6A00
2YIHA 4NF7A 1O7AA 4U3AA 3RMEA 3RJXA 2W62A 5HOSA 1V3MA 2W63A 4QLKA 4CCEA 1LJYA 4AZGA 4XZBA 2VNCA 2WSPA 1JZ6A 2X2YA 1TE1A 1UOKA 3ZR5A 2C7FA 4BCEA 5TD4A 1BYAA 1ZBVA 3WEMA 3NDYA 2J4GA 2ESCA 3AMKA 3PN8A 2Z1SA 2WB5A 1UR0A 4CCDA 4D1JA 4ACZB 3VIMA 2WMHA 3NCOA 5DEZA 4HPGA 2XTKA 1BYBA 5E6YA 3U7BA 2VZOA 2WZHA 1DWJM 3KWXA 1SFSA 3WL0A 2V3GA 3PTKA 3T09A 5D8ZA 3L4UA 1B30A 2HVMA 5FIPA 2BHYA 1NWTA 1C91A 4CN6A 4JAWA 6A3HA 3VDHA 3VGDA 1UD6A 3N9KA 3SCQA 4B3LA 3AS2A 1UR1A 4DUVA 4U2ZA 1E1EA 1OINA 1J01A 4CN1A 1JF6A 2WCSA 4UQDA 2CIPA 1M04A 3K4DA 4KWUA 2BFGA 1RP9A 2GJXA 1J0YA 3IJ7A 4MAVA 1ISYA 3BMWA 4D6FA 3ZJKA 1M01A 2F8QA 2GJPA 1K9TA 3ARVA 4CD5A 3ALGA 4CD4A 3ARTA 1JF5A 2YLAA 3HMCA 1UUQA 1G0CA 1HP4A 3AHXA 3DHUA 3I3DA 6CGTA 1JD9A 1GQKA 4MDPA 2TAAA 2QF8A 4TX6A 5I24A 2WVTA 1UD2A 1JAKA 1JD7A 4W8BA 1ISWA 3MANA 1W3LA 3WH5A 1C8XA 4XUYA 4PMXA 3MSGA 1BG9A 3B8SA 3VGEA 1E0WA 1MW2A 3RCNA 2VZSA 1HF6A 4A3YA 2QPSA 4C7DA 3QR3A 1TR1A 2NT1A 4H8UA 4MADA 3UG4A 3WQVA 3QOKA 3TTYA 3WNOA 5A6AA 3CLWA 3I3BA 4HU8A 3AROA 5DFAA 4AD0A 4RL3A 3LPGA 5A8NA 5CPQA 1XGZA 4J3VA 1PX8A 1AQMA 3O2LA 3AMCA 4HOXA 5CJ5A 1FH7A 4YHGA 2DH2A 2X0YA 3GXFA 4E2OA 1UD4A 3VNYA 4PSRA 4AZIA 5AC4A 1YHTA 1EO7A 3KE0A 2EBNA 2QV4A 4B9ZA 4AISA 3NSMA 1JYNA 4XZWA 4MB1A 4K68A 8A3HA 1CXIA 4OOUA 3ALFA 3KL0A 4IM4A 1VFOA 5FOOA 1H2JA 1BF2A 2WBGA 2V38A 1ZBWA 2OWWA 3VMOA 4HZ7A 1U33A 2BV9A 3ARWA 1FHDA 1AQ0A 4DUXA 1NH6A 3UG5A 3U5YA 3PZIA 4S3KA 2X8RA 3W81A 3CZJA 1EDGA 4AEFA 3APGA 3ARRA 2DSKA 3NYDA 3PZMA 2DGAA 5ECUA 1LLOA 4IUGA 1V6WA 4UFKA 2WC3A 1KR1A 2WHMA 1D2KA 1HT6A 1US3A 1VFFA 1WZAA 5FKYA 1HJSA 1ZJBA 3WDRA 1E6NA 4MAZA 1EGZA 5A69A 4E8CA 2VRQA 3SCTA 2WMKA 4QAWA 3ZJ8A 3PZVA 2DEPA 2DPEA 4BA0A 1Q6FA 4FLOA 2YOCA 2CXGA 2ZUVA 4CU7A 2WWDA 4BZYA 4TVCA 1E73M 1GHRA 3ZT6A 2VVNA 5HBFA 1V0KA 5D9NA 5DO8A 2VCCA 3WMSA 1JNEA 1HNYA 2YLLA 3WH7A 2WZIA 2ZX9A 4BS0A 3WUEA 5JBFA 2WBKA 2A3BA 2BHUA 4MB5A 1XH2A 3WELA 3O6AA 1PIFA 2VVSA 2E4TA 5A2CA 5HPOA 5BYWA 1BQCA 1NWRA 4GO8A 4HOWA 4AD1A 4W8AA 3UESA 2CETA 1JL8A 1DEDA 4UFLA 4UFJA 4Z2GA 2YL5A 2WC4A 1EO5A 3OLIA 2FHBA 1NOUA 2E3ZA 4UQBA 5M5DA 4AZCB 1VF8A 1BTCA 4B15A 4D6CA 1ZS2A 5GNZA 1VFMA 3SEPA 3MUAA 1VEPA 2G3NA 1KCLA 4IPNB 2YA1A 4PMVA 3BLPX 1KBBA 3WF3A 1UHVA 3MO4A 3B9DA 1S46A 4WSJA 2XG9A 1E4MM 1KB3A 2WVVB 3M7SA 1H0IA 2WZEA 3FHQA 5E09A 1CZ1A 1DP0A 4NSBA 2ZUSA 2JF6A 3AHYA 1E70M 1H4PA 1RH9A 3SUVA 3TOPA 4HA3A 3ZSTA 3OLDA 4X0NA 1OWQA 1XSIA 3T0AA 3AFBA 1L8NA 1OCQA 3EDFA 4DWSD 1B3ZA 3J7HA 1A47A 5EB8A 2C0HA 3ZOAA 2W66A 5CPSA 4JFTA 5A6KA 1J12A 4J27A 2XFRA 4GO9A 2EPKX 4AD5A 4UR9A 1J18A 1E6XM 3A4AA 4PTMA 4PMZA 1W9DM 2XVPA 4CN4A 3AIUA 2E9MA 3VD3A 4PMRA 1E72M 1ZBCA 1UWRA 1KGUA 1WZMA 1XCXA 2V5CA 4V27A 3AHZA 3N04A 2PWDA 1NQ6A 1E43A 3AS0A 5C70A 3VMNA 1QNRA 2GJXB 4ZFMA 1FH9A 1JYWA 3FNDA 4PTXA 4WK9A 3VD7A 3AIBA 2OWCA 3PZOA 2VC9A 4PMDA 4NRSA 4LYRA 5AC5A 3L4XA 4X9YA 3WQ6A 2VL4A 4LGXA 2PBGA 3CUIA 1HXJA 4UNIA 1C7TA 3WN6A 1EQPA 1PX3A 1UH3A 3K8LA 4HTYA 4QCEA 1V0NA 1Z32X 1W9BM 1QHPA 4ZEPA 4WKHA 4N42A 1C8QA 1JDAA 2XFYA 1M53A 5JIPA 1VENA 3AHTA 3WUGA 2D1ZA 4FLRA 1W1YA 1MQQA 2XIBA 2NW0A 1JFHA 3SCPA 1JZ3A 3SCNA 3ZMRA 4DM1A 3VDCA 4JHOA 3CZEA 1XYFA 2EPMX 1HN1A 4A3HA 4EANA 2UY3A 4JKLA 2XHYA 2F2HA 2QMKA 1UR4A 1J9YA 4GQRA 1EXPA 5ABFB 3DECA 3OA5A 1GW1A 1V02A 2ZUNA 4ATDA 2CPUA 2IXVA 3T2PA 4P8WA 4C7FA 2A3AA 1SR0A 1GONA 4W5ZA 6TAAA 3VDBA 5ABHA 1UWTA 3BSHA 1M03A 1HJXA 1OD0A 2W4XA 2AMGA 1EHAA 3M6DA 1JG9A 1Y7VA 1TZ7A 1DWFM 3EDKA 4UFHA 1BVNP 1XSKA 1E15A 1VEMA 4JHZA 3W37A 2OYLA 1FFQA 3T0DA 4GZJA 3SUUA 2J7EA 1OB0A 2WPGA 4OBSA 3UERA 4GQQA 1WB0A 2G8ZA 2RGLA 1W1TA 1LL4A 3ARSA 3VUPA 3VM5A 3LPPA 5A8OA 3O9NA 4U33A 5A95A 1CGVA 4GI6A 1V0MA 2J7BA 2E9LA 2JF7A 3KEHA 4TTUA 2J47A 5E6ZA 2V3EA 3POHA 4AXNA 4QCFA 2WYSA 1MQRA 2GSJA 3QHNA 2OSWA 1HKJA 3UCQA 1FH8A 3CHEA 2WNWA 1JAEA 2WMFA 3AMDA 1XC6A 2PBOA 5FCZA 1BLIA 1JDCA 2D22A 1K9EA 2CERA 4MB4A 1EDQA 4GINA 1FP8A 3VILA 5A6JA 1YQ2A 3HN3A 5CGMA 2ZUWA 5JBEA 3WMCA 2FH8A 3A47A 2WHJA 3WDJA 2EPLX 1ECEA 4OJYA 4A4AA 2BHZA 4J3WA 4JL2A 3WKZA 4TTGA 1W1PA 4PMNA 1K9DA 3DYOA 2D3NA 1SMAA 2CCRA 1QI3A 2D20A 4AZ7A 5I2UA 3GTNA 3CH9A 5ABGA 4H8VA 4UZUA 4W88A 3VIKA 3PZUA 4YN5A 3I3EA 3WIJA 3D5HA 2FHFA 3LPOA 3GXIA 1J11A 3LPFA 1F4HA 1B2YA 3GH7A 4U5IA 3VD9A 3UG3A 4D6JA 3BAXA 3QGVA 2EO7A 1UR9A 1QOXA 2WVVA 4GKLA 1OIFA 1O6IA 2VO5A 4C7GA 1GORA 1E5JA 5I78A 4W89A 5BXPA 4CU6A 4WKAA 1WKYA 2X0HA 2ZWYA 3RIKA 4Z2HA 3AIWA 3T08A 5A1AA 1RD6A 1G1YA 4U2YA 3WEZA 1KXVA 1V02E 1HL9A 4AD2A 1B3WA 1NARA 2YJQA 4JIEA 3WD2A 3AS1A 3L4ZA 3LMYA 4ZE5A 1JI1A 1W32A 2MANA 1ZB5A 3RM4A 1NOWA 2ZXDA 5GQBA 1WDRA 4W7WA 2NT0A 2XGBA 3OLGA 4P7OA 5I0DA 3CZLA 3CMJA 4JCMA 3NDZA 3UR7A 3VO0A 3W29A 3MMWA 2PWFA 1W2VA 3VX1A 2ZX7A 3CHDA 1V6UA 3U7VA 4KGLA 2BS9A 5HPCA 2G41A 4M24A 4ZXLA 4MB3A 1E3ZA 1TCMA 3EBVA 1MFUA 4D6HA 4DWSB 3RPMA 1CXFA 2YA2A 1UG6A 1R85A 4W7VA 1V6YA 2FGLA 2DT0A 1LF1A 1FOBA 3PZGA 3WNKA 2ZE0A 4S3JA 4UFIA 2D0FA 5A6BA 5A6BD 4AIOA 3WQWA 5E70A 2DQXA 2DIJA 1E6RA 2W67A 2YBTA 1QNPA 4RE4A 5LA1A 1HJVA 2PC8A 2O9OA 1ESWA 2XSAA 1ZBKA 3QHMA 3EDEA 4IPLA 3L4TA 4Z2LA 1QNSA 1C8YA 2XVGA 2VI0A 2V5DA 4HMDA 2G3JA 2HISA 1CLXA 4Z2KA 1E4LA 1E6PA 5CQ1A 1VBRA 4DWSC 2ZUMA 3BXWA 4W7UA 2XSBA 4M56A 8CGTA 1OGSA 5ABFA 1RP8A 5C8BB 1UWUA 3IK2A 2VOTA 4D72A 2BXYA 1QW9A 2VMFA 3WBAA 5DF0A 1F4AA 2WM0A 3AZTA 1J10A 2OSYA 2IXUA 4E4PA 1DWGM 1K9FA 3AHVA 3OZOA 1HKKA 3CPUA 2WWCA 3JUGA 4LXFA 3WF4A 4GZEA 3WH6A 5I77A 1HKMA 3TTSA 1LWHA 2CBJA 2PWGA 2WC7A 4JFVA 3SURA 3K8KA 1J0HA 4Q7NA 1BYCA 1GHSA 5EFDA 1BSIA 1GQLA 2DSWA 2WW5A 1GJWA 1OM0A 4FK9A 3VM7A 1G9HA 2WLYA 3VX0A 1CGUA 2GDVA 4RE3A 1PEZA 3NSNA 2CKRA 1EQCA 1H0GA 3WDQA 7TAAA 1ZL1A 1KR0A 1GQJA 1I1XA 1QNOA 1JDDA 4KRTA 2J62A 1HKIA 2VZUA 1NOFA 3IJ9A 4D6IA 1H09A 5KZ6A 2XUCA 1XSJA 3VIIA 1WCGA 4GPNA 3WFLA 3RDKA 1X6NA 4UTFA 3CZKA 2ZWZA 1KQZA 1QI5A 5BROA 4JKKA 2Y4SA 4Y7EA 1R8LA 4FLQA 1GVIA 2G4FA 2ZUTA 1UYQA 1NP0A 1V08A 1TUXA 2O92A 2DT3A 3OLEA 3GM8A 3W6MA 4HZ6A 1ISVA 1PJ9A 1QI4A 3CUFA 2VQTA 5EFFA 1I1WA 3BCFA 3CBWA 3CZ8A 4H04A 2DSUA 3OZPA 3AYRA 3RM8A 3FY1A 4TUFA 2BVTA 1VRXA 3ZT7A 3WFZA 5LA2A 2YDQA 1LQ0A 2J7HA 2ZX8A 5GPRA 4DUWA 2YKKA 1HJQA 2GFTA 4OZOA 2QPUA 1CPUA 4UOZA 5IXEA 4WKFA 3WF2A 1JXJA 4P7NA 1HVQA 3FAWA 3II1A 3MMDA 2OYKA 5E0FA 3SUWA 3VGHA 1OBAA 5I3DA 3BLKA 4W93A 4WIWA 2GJRA 1FA2A 1X6LA 4F9JA 3L4WA 1E40A 3PBGA 2XWDA 2ZX6A 4GZIA 4W84A 4GI9A 1BGAA 3BH4A 3GNPA 1PIGA 3AIEA 2V3FA 2XM1A 2E0PA 5A2BA 1V3JA 1E6SM 3DHPA 2YL9A 2PWEA 9CGTA 5HXMA 1JI2A 1R7AA 2UWFA 3U57A 3POCA 1TVNA 1TA3B 1UA7A 3FN9A 4JCLA 1UWQA 1CIUA 2O9TA 4JFWA 1ZU8A 3VDAA 1V03A 4KMQA 2WK2A 1JIBA 4BQ2A 1CDGA 5JUVA 1D3CA 1W9VA 4AZ5A 2UY4A 3VD5A 2J25A 3A3HA 3KL5A 2NSXA 1ISXA 3ARPA 3T0BA 3UR8A 4DM2A 1DWHM 4DWSA 1CWYA 1OGBA 2BXZA 1E0VA 1ODZA 4EAMA 1QBBA 4WSKA 2RGMA 3AXIA 2W92A 3FXYA 1UZ1A 5M3WA 2PI6A 2W5FA 4D71A 4AEEA 1G01A 2J7GA 1KQYA 2DH3A 3OIHA 3ARXA 2JFEX 2WANA 4EKJA 2D2OA 5LYRA 4CUCA 1CGXA 4MNKA 4CCCA 1V0LA 4HU0A 1XV8A 5FD0A 1J0IA 1TFVA 4JFUA 2O9RA 1MW1A 5A6SA 3D3AA 3NSXA 1E4IA 3W38A 2G3MA 1UWIA 4Z2JA 3WD4A 2J74A 4ML4A 1CTNA 3CTTA 3W4RA 1B31A 4PN2A 2BY3A 4AZBA 4JFSA 3RJYA 1K6AA 2XFFA 3WF1A 1E0XA 3PTQA 2J7CA 4BQ5A 4XV0A 4QLJA 2DSZA 1RPKA 3ZM8A 5BXTA 1V6XA 3DYMA 5D9MA 2ZIDA 5D8WA 3THDA 3WQ8A 3WBEA 1AMYA 2ZUUA 3CHFA 3SUSA 1W91A 5BXRA 1NM9A 2D3LA 1HL8A 3ZR6A 2J7FA 1UZ4A 1HVXA 2WAGA 1E4NA 2V3DA 3TP4A 3VPLA 2FH6A 4CD8A 1UH2A 3CUGA 5CSUA 4YPJA 4XX6A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YIH A;  4NF7 A;  1O7A A;  4U3A A;  3RME A;  3RJX A;  2W62 A;  5HOS A;  1V3M A;  2W63 A;  4QLK A;  4CCE A;  1LJY A;  4AZG A;  4XZB A;  2VNC A;  2WSP A;  1JZ6 A;  2X2Y A;  1TE1 A;  1UOK A;  3ZR5 A;  2C7F A;  4BCE A;  5TD4 A;  1BYA A;  1ZBV A;  3WEM A;  3NDY A;  2J4G A;  2ESC A;  3AMK A;  3PN8 A;  2Z1S A;  2WB5 A;  1UR0 A;  4CCD A;  4D1J A;  4ACZ B;  3VIM A;  2WMH A;  3NCO A;  5DEZ A;  4HPG A;  2XTK A;  1BYB A;  5E6Y A;  3U7B A;  2VZO A;  2WZH A;  1DWJ M;  3KWX A;  1SFS A;  3WL0 A;  2V3G A;  3PTK A;  3T09 A;  5D8Z A;  3L4U A;  1B30 A;  2HVM A;  5FIP A;  2BHY A;  1NWT A;  1C91 A;  4CN6 A;  4JAW A;  6A3H A;  3VDH A;  3VGD A;  1UD6 A;  3N9K A;  3SCQ A;  4B3L A;  3AS2 A;  1UR1 A;  4DUV A;  4U2Z A;  1E1E A;  1OIN A;  1J01 A;  4CN1 A;  1JF6 A;  2WCS A;  4UQD A;  2CIP A;  1M04 A;  3K4D A;  4KWU A;  2BFG A;  1RP9 A;  2GJX A;  1J0Y A;  3IJ7 A;  4MAV A;  1ISY A;  3BMW A;  4D6F A;  3ZJK A;  1M01 A;  2F8Q A;  2GJP A;  1K9T A;  3ARV A;  4CD5 A;  3ALG A;  4CD4 A;  3ART A;  1JF5 A;  2YLA A;  3HMC A;  1UUQ A; 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 3UG5 A;  3U5Y A;  3PZI A;  4S3K A;  2X8R A;  3W81 A;  3CZJ A;  1EDG A;  4AEF A;  3APG A;  3ARR A;  2DSK A;  3NYD A;  3PZM A;  2DGA A;  5ECU A;  1LLO A;  4IUG A;  1V6W A;  4UFK A;  2WC3 A;  1KR1 A;  2WHM A;  1D2K A;  1HT6 A;  1US3 A;  1VFF A;  1WZA A;  5FKY A;  1HJS A;  1ZJB A;  3WDR A;  1E6N A;  4MAZ A;  1EGZ A;  5A69 A;  4E8C A;  2VRQ A;  3SCT A;  2WMK A;  4QAW A;  3ZJ8 A;  3PZV A;  2DEP A;  2DPE A;  4BA0 A;  1Q6F A;  4FLO A;  2YOC A;  2CXG A;  2ZUV A;  4CU7 A;  2WWD A;  4BZY A;  4TVC A;  1E73 M;  1GHR A;  3ZT6 A;  2VVN A;  5HBF A;  1V0K A;  5D9N A;  5DO8 A;  2VCC A;  3WMS A;  1JNE A;  1HNY A;  2YLL A;  3WH7 A;  2WZI A;  2ZX9 A;  4BS0 A;  3WUE A;  5JBF A;  2WBK A;  2A3B A;  2BHU A;  4MB5 A;  1XH2 A;  3WEL A;  3O6A A;  1PIF A;  2VVS A;  2E4T A;  5A2C A;  5HPO A;  5BYW A;  1BQC A;  1NWR A;  4GO8 A;  4HOW A;  4AD1 A;  4W8A A;  3UES A;  2CET A;  1JL8 A;  1DED A;  4UFL A;  4UFJ A;  4Z2G A;  2YL5 A;  2WC4 A;  1EO5 A;  3OLI A;  2FHB A;  1NOU A;  2E3Z A;  4UQB A;  5M5D A;  4AZC B;  1VF8 A;  1BTC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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