1J4E | Genus

Total Genus 142

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	142
sequence length	341
structure length	341
Chain Sequence	HPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPAIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHAATQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKAPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLAAQGKYTP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Snapshots of catalysis: the structure of fructose-1,6-(bis)phosphate aldolase covalently bound to the substrate dihydroxyacetone phosphate. pubmed doi rcsb
molecule tags	Lyase
source organism	Oryctolagus cuniculus
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE A
total genus	142
structure length	341
sequence length	341
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2001-09-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1j4eA00

1W0MA 1KW1A 5EL1A 3MHGA 1GVRA 3SGZA 4IPIA 1QPOA 5LZLA 2J9XA 3LHTA 4IMEA 4MZ8A 3LHYA 4HPXA 2ZRUA 1G4EA 4CNPA 3OA3A 1EPXA 2VFIA 3ANYA 2CFFA 3P82A 3SY5A 2E5DA 4Z1BA 1AW2A 4JTFA 4DF0A 2WQPA 3GR8A 4JXCA 3MWAA 3QW4B 3LCFA 2C15A 3G0UA 3N2XA 4NZFA 4RZ5A 1OYCA 3W70A 1Q6OA 5U7SA 1SU5A 1X7FA 1C8VA 5D03A 1FWRA 3P60A 3BLFA 1TJPA 3L2IA 4LUJA 4UIOA 3Q37A 4PL1A 2QEZA 3N2MA 3KXQA 4MY1A 1M7OA 4YCPA 3W1NA 1ICPA 3T40A 3Q94A 1A53A 5FF7A 4PEKA 1ZALA 4UTLA 2CLFA 3EWZA 1TJRA 4NX0A 3GIYA 2RDUA 3MP3A 5G2HA 1HL2A 3ZWSA 4MFDA 2C3ZA 5HWJA 2G96A 5AOUA 3TR2A 1TTPA 3WK0A 2D73A 4JICA 5F2MA 4FNRA 1TV8A 2X2GA 3CTLA 1F7BA 3M5ZA 4O52A 3Q2DA 5CZTA 2CLEA 5FEZA 3TQKA 3UPWA 1NEYA 1G4TA 2OZ0A 2V5LA 3DZ1A 3QSTA 4O1AA 1ZNNA 1YTKA 1Q3NA 4JTTA 1GTEA 4FNQA 2RFGA 3TC6A 4N9DA 4UUIA 4O14A 3IV3A 3V75A 2XN1A 4JYDA 1OX4A 4O16A 3IRDA 4WX2A 4KFOA 1ZAHA 1O5XA 1MZHA 5G2WA 8TIMA 1SSDA 2FB3A 4QNWA 3QFEA 1FXQA 4JTUA 5HWNA 2HS8A 5G5IA 3TSMA 2B0MA 3W1TA 3W1XA 3L21A 3B0UX 4RXGA 3TSBA 2YCEA 1F05A 2ZDRA 1KFBA 4ALDA 1JQXA 3EWYA 3QJAA 4GUFA 4O1DA 4WY0F 3W7NA 4UFHA 5BW6A 4QISA 5IBXC 2VEMA 3EEGA 4C1LA 4FEZA 3MYPA 3W23A 4UR8A 3STFA 1K8YA 3OHIA 2CWNA 3A24A 5C5YA 1PV8A 3N19B 3M47A 3P67A 2A1YA 1NF7A 2AAMA 3CT7A 3HG2A 4DBEA 3DFOA 1RV8A 4LS1A 4AWSA 3W2LA 4KFPA 2ZZ6A 1AK5A 5TQLA 2J24A 3EWUA 1KFCA 3W72A 3O16A 3W84A 2CLKA 2A85A 4O15A 2WNZA 5BMXA 1XUZA 2YDAA 1ML1A 1H50A 4O57A 3L0KA 1GWJA 3TUUA 3F4WA 3B05A 3G3DA 3S5OA 5L9FA 4NU7A 3P80A 2ZZ1A 4I7UA 3W7OA 1Q6QA 2WO5A 3NL3A 5K9CA 3TXVA 4MLJA 3GDLA 2V81A 4D2JA 3GX9A 1S5VA 3UWYA 3EXTA 4GC4A 1F5ZA 1KLYA 4OU1A 3P84A 5F2GA 3TW7A 4OV9A 2ZRVA 2ZA2A 2HTMA 1SPQA 3N9RA 3S42A 3NPWA 5CZ0A 5HULA 3TMLA 4OGZA 4IWWA 3LOTA 5DBTA 4QNEA 1EP3A 5AFDA 1J2WA 2VFFA 4I9AA 4RR4A 3W3OA 3DHFA 3AO0A 4HKPA 3NQMA 3LXCA 5A8GA 2FTPA 2WOQA 1KM2A 3HPXA 1AMKA 3NQGA 1VCFA 4O0KA 1GPWA 4K8HA 3IIPA 3NXFA 1R2SA 4S2CA 3W2NA 1WA3A 1ZJIA 3TKFA 1IXQA 3JRKA 4IUOA 3A22A 4PCFA 5AHIA 3PWAA 1OF6A 2NZLA 1XI3A 3F4NA 4UTIA 2F7FA 3M9YA 3QH2A 5J5DA 4NUWA 1UUOA 3W86A 2E6DA 2Z6IA 4RZ6A 5F1UA 3LLFA 5DY2A 1AL7A 3C61A 1VC4A 4RJEA 1QOPA 4UC5A 1KM3A 1Z42A 3B04A 4GNJA 4GUJA 1S3HA 4JTHA 3PF3A 1H5YA 3W1AA 4XWUA 1XBXA 2H3DA 3GKFA 1YADA 4O28A 4S1FA 1ICQA 1KBIA 1YYAA 1I2NA 3N73A 4GUIA 2RHGA 4NZJA 4O11A 3NGJA 2Q3OA 4BI7A 1QAPA 3QPYA 2J27A 4RV8A 4ZQPA 3GB6A 1DVJA 2ZFAA 1IIGA 3PUOA 3OVQA 3R12A 3LCGA 2WPBA 3PVFA 1P1XA 1F73A 2ZRWA 5HUPA 2BLEA 2VFHA 2YSWA 3CLMA 3C4UA 3PBUA 3L66A 2V8ZA 1TV5A 2TRSA 1KM6A 1R2RA 3HQ1A 4N9EA 1XDMA 1SO5A 4GXMA 1JRBA 1ZAIA 4BWLA 5KZEA 4LVBA 4OE7A 4CQ8A 3NG3A 3DFNA 3S8HA 4IJBA 4WY0B 4ZMGA 1FCVA 1BEUA 5IM51 1OFBA 5AHEA 3GNDA 3MI6A 3R13A 3W22A 3KAOA 2AQWA 3HPSA 5AHFA 4WOQA 3R8RA 1SO3A 1YDVA 2ISVA 1E51A 2RDWA 2C0AA 3LM7A 2W6RA 2OCZA 2GVGA 2Y7GA 2RH9A 4QJ1A 3DBPA 1H61A 1O60A 1W8SA 4IMCA 1KFKA 4PFMA 4UNKA 2GVLA 1LP6A 2O7QA 3NQVA 1QCWA 5K2ZA 4X3ZA 3W1QA 2QUUA 3BLEA 3PB0A 1KV8A 3V1PA 3B0PA 4FNUA 2E1DA 1NSJA 3M5XA 2PCQA 4ORMA 1DORA 3BGJA 3O1NA 4X9SA 3GDRA 1MO0A 4UTKA 1FWSA 4CCDA 4A3UA 5SWUA 5D05A 5FEWA 4LRTA 1K3UA 1SSGA 1GVSA 1Q6LA 3CEUA 5EYWA 3LCWA 3O07A 2Z6JA 4Z1CA 4AHPA 5LHFA 2V5BA 1KM5A 1GJPA 1MEWA 4UFLA 1W56A 4OWGA 2QKFA 2J6XA 6ALDA 3E02A 1I2RA 1VLWA 1C9DA 2HMCA 1P5BA 4ZQRA 2GVJA 3S0CA 3WJZA 3M0ZA 3BVJA 2CLHA 4AF0B 1VHNA 1QWGA 2XFWA 3P5ZA 4FB7A 3G1SA 3IVSA 3OVPA 3S5ZA 1Z44A 1VCGA 4JYEA 1RZMA 1SZGA 3CEPA 3O06A 2Z2UA 4MZYA 4AVFA 3TU9A 5AC7A 1EWEA 1ONRA 1IIHA 4N6EA 4IMGA 4UTWC 3LRLA 4MOZA 4IOTA 3CHVA 2E5BA 3G3MA 3E12A 1W3NA 1DKWA 4LOCA 4DEFA 3TDFA 3U6WA 2VKZG 2XN2A 4LWWA 1TPFA 3LHUA 1XDLA 4UCGA 5E1QA 5EMUA 1KTBA 1KFEA 1M5WA 3LHZA 4EIVA 2CLOA 3QSRA 1XXXA 2CU0A 1OYAA 1W5NA 3S1UA 4EWND 4U4MA 4TU1A 1HO1A 1OFOA 1SFJA 3HMJG 3ELFA 4I7VA 2TYSA 4JTIA 4KWVA 1VYRA 5LNRA 2FPYA 3GAYA 5C55A 5CZSA 3S1WA 4GUGA 2V9DA 4FIQA 5CGQA 1TQJA 3W7EA 1YXYA 3A21A 3BW4A 3DKJA 1DJQA 1U83A 2YX0A 5LHEA 2QJGA 4JYFA 1YTDA 4X2RA 3I7QA 4UTJA 1G4SA 2WV8A 1LM1A 2DZPA 1CW2A 3NO5A 4K7YA 3GXNA 1N55A 2EPHA 5KTLA 1I2OA 5HWMA 4Z0JA 3MUXA 3IIVA 5AHMA 2ISWA 2X1SA 4O13A 4IQLA 4JX4A 3TH6A 5C2XA 4K39A 4FXSA 5HR7A 3BV4A 2JKPA 5HNRA 3DFQA 2PRLA 4BI6A 1OFEA 1L2UA 3G1VA 3NL6A 4BK9A 1FWNA 3DH7A 3R89A 1DHPA 3M6YA 3CC1A 4AXKA 4ZVJA 3CWNA 4JTKA 5HUOA 1MSSA 3W7GA 4MJMA 4N9BA 4IXXA 5CSRA 3HO8A 4POCA 3MP4A 5DCEA 3IGXA 4AWTA 4M6VA 2C1HA 4NJKA 3STCA 3STEA 4BFAA 1GEQA 3W2UA 4N4PA 1TB3A 4R53A 4NXKA 3BPWA 3OVRA 4LVGA 4FX7A 1QDSA 2YGYA 3FS2A 3K30A 1QR7A 2DZSA 4MJZA 3P74A 3G0SA 4DF2A 1LLWA 2R8WA 5EBUA 3MO7A 4DELA 2BTMA 3LCXA 1HG3A 3DFSA 5AB3A 1KM0A 3UXAA 3SIZA 3FOKA 3T44A 2VEPA 4GJ1A 1A5BA 1FXPA 4UTMA 2ZBTA 2NV1A 1FX6A 3I6RA 4N9CA 3FEMA 4O1CA 4MFEA 4Y8FA 2NV2A 3F03K 2ZRYA 4JR5A 4LC6A 2R14A 2NXHA 3W7LA 3O15A 1KTCA 2ZRZA 1FWWA 3KFTA 2ZCGA 3FJ6A 4JX5A 3M44A 4YWIA 1H1YA 3LLDA 3VI2A 3EWXA 4QAIA 1EA0A 3ABQA 4HSNA 2A7NA 4UFIA 3W7KA 2H3BA 3S5YA 4CQAA 4FF7A 3DI0A 3DI1A 3UQNA 1OABA 4LC8A 2C6QA 1UBSA 2QCHA 1WBHA 2C18A 1K03A 2C14A 2I9EA 4LVDA 1X6UA 2JGYA 3W74A 1VGAA 3GR7A 3FKKA 3SFKA 5K4XA 1GVOA 1B57A 4GWEA 3BW2A 3P7YA 1NFBA 1YLVA 2Y88A 3LTPA 4AWUA 2V2HA 3LV6A 1VJIA 3ZFHA 1YDOA 1TRDA 4XKYB 3NOEA 4GBUA 1GVFA 4RLIA 3ABRA 1PHWA 4LY8A 1VLIA 1XL9A 3P8JA 3TMQA 2UV8G 4CCEA 2I14A 2ZRXA 1QNVA 2Y7DA 3C2EA 3CM4A 1VYSX 4HNVA 3O6CA 4MYAA 3M43A 3TC7A 2VEKA 3UZ5A 3B8DA 4TO8A 3C56A 3VFLA 1PL9A 2G95A 3CIWA 1ADOA 4HNNA 4PH6A 2QCDA 3O6YX 4UXDA 3I65A 3KHJA 3PM6A 4M7TA 1OK4A 3WFAA 4I7WA 3C2OA 4NVTA 3KVLA 1XBYA 1RVGA 1G4PA 1AL8A 2YR1A 3L65A 2QF7A 5AHNA 3H53A 3NQ2A 1G7UA 2PRMA 2ZZ5A 3LHVA 5E0KA 3M1ZA 4AEOA 4LNYA 3W1LA 1H7NA 1LYXA 1N8FA 1I2QA 3MI3A 3P81A 1G7VA 1JUBA 3I7RA 1K8ZA 3MHUA 2VFEA 3W83A 3C52A 3TV8A 1QO5A 3W7CA 3G1FA 4Q4KA 4AB4A 3SW6A 4ADTA 2Z1BA 2DZVA 4LW7A 2GUUA 1JVNA 3B03A 3GDTA 4DO4A 3S9YA 5IBXA 3EX3A 5K9XA 4PA8A 4HNUA 1YTEA 2VXNA 4G1KA 4TX9A 2GQ9A 5L6UA 1R47A 1MXSA 2VFGA 2OT0A 3IGUA 4PL2A 2EKCA 2ZZ3A 2CZFA 3C2RA 5D30A 1JULA 1O94A 2QCFA 3TCEA 2DZWA 3W7QA 5G1TA 3DFTA 3DAQA 3W7PA 3A5FA 4TIMA 4JEQA 1TV7A 2ZA1A 3PC0A 1VYPX 3RLUA 2DZTA 3W6YA 5F4XA 1TQXA 2QUVA 4A22A 4UTUA 4JTJA 3PULA 3IIOA 2WNNA 1NF0A 4O53A 3EXRA 4P2VA 5DCDA 3DHDA 3LTSA 1WX0A 2HSAA 5I3KA 4HPJA 1KBJA 3W71A 3NR0A 4GE8A 1BKSA 1RQHA 1F6KA 1SW3A 4QIUA 1JCNA 2Y6ZA 3PAJA 2GOUA 3W75A 1TYGA 3TJLA 1WV2A 1B9BA 1HFBA 2A21A 1SO6A 2QCEA 3W7DA 1TTIA 3I68A 3R5EA 5HINA 5BNKA 3W2JA 1DV7A 1LTDA 3L0GA 1L6SA 1H7RA 1YDNA 4QITA 1H7PA 1A5SA 4DPPA 3FYOA 5D09A 1GG1A 1JCJA 3PS7A 1L6WA 2CLLA 3NNTA 3UWWA 3M7WA 5FI8A 3DU0A 3W73A 4JNMA 4ZL1A 1SZEA 3N3MA 3QQ1A 3TK7A 3UNDA 2FFCA 1LOSA 1H60A 1UUMA 4UNLA 4OHQA 2DZUA 3UXDA 3H55A 4WJEA 1TMHA 1XBZA 3BG9A 2EAWA 3TJXA 4L4LA 5D04C 4DBDA 4HHPA 3S6DA 2ZZ7A 3UYCA 3TFXA 4O8RA 4AHOA 3MP5A 3BLIA 5D38A 3PBWA 1VR6A 4KWWA 2ZZ2A 5LSMA 4FNSA 2WNQA 3UWQA 3TA6A 4H6KA 2H90A 2ISSA 4WQ6A 1SZFA 2EGZA 3LGEA 1OF8A 1XFBA 4EOUA 4FHAA 4UTTC 4DQWA 2P10A 3S1XA 4R33A 1AG1O 3W7JA 2DP3A 3W88A 3QF0A 1IGSA 1SZNA 4MZ1A 1FCUA 4CCCA 2QJIA 1FDYA 4A2RA 2VOMA 4XBSA 2TPSA 3LI1A 2X16A 4NQ1A 5I3HA 1RR2A 5G2IA 3GNNA 1QMLA 3PSVA 3JS3A 1T96A 2YYTA 4AAJA 4PODA 4OV4A 1EP2A 2NX9A 2NXGA 3IIZA 3M41A 4O4WA 1P4CA 1LROA 2CLIA 4NNCA 1TCDA 4BI5A 3U8GA 3QW3A 1SQ7A 2RKXA 5DLCA 4WZHA 4RZ4A 1FWTA 5AYZA 1JRCA 4OT7A 1OVDA 1TREA 3G1AA 5K7JA 1TSIA 4NJIA 3TQVA 2A5HA 3SZ8A 5CKSA 3H54A 1FY6A 5FF3A 1Z48A 1DQXA 1H7XA 2BSLA 5AYYA 2YZRA 2FB2A 1B4KA 4HNTA 4JTEA 5LNVA 1JJKA 1V7YA 2E68A 5K4ZA 3NPUA 3S5NA 3L9CA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1J4EA

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