1K7FA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with n-[1h-indol-3-yl-acetyl]valine acid
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
267
structure length
253
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of a new class of allosteric effectors complexed to tryptophan synthase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 97
structure length 253
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k7fA00
4EVZA 2J9ZA 3O8AA 1JR1A 4J9JA 1OABA 3N3MA 3OG3A 3LHWA 1JRCA 4WD0A 1MZHA 5EYWA 3L0KA 4DF1A 1LTDA 3PB0A 1FXQA 5LNUA 3GK0A 1L6WA 3E49A 4JY9A 3LTSA 4M19A 5LKYA 3C0JA 3NZRA 4DPPA 4NZJA 5SWUA 3LRMA 2ZRZA 5HINA 1LM1A 2E5DA 1H1ZA 5H2ZA 5AYZA 1N55A 4AF0B 1DKWA 3T55A 3UY8A 1W56A 3JR2A 2YDAA 1VJIA 3RFAA 1CW2A 2A85A 2Q8ZA 3HPZA 1LBLA 1FWRA 3PB2A 3S1WA 4ORIA 3NEVA 2PCQA 5BNKA 3ABRA 2C18A 1WBHA 5U4NA 3C61A 2OT1A 1AMKA 1LLWA 4JDBA 2V81A 1XBYA 4RV8A 4HT3A 3BGGA 1L9WA 2PC4A 1O60A 1SO3A 2B7NA 4O10A 5HWJA 5HQEA 5FF0A 1OX4B 4LTSA 1QR7A 3CEUA 3PBWA 3TQKA 2E09A 1OVDA 1W3TA 3A22A 3QYQA 1PV8A 3DH7A 3W84A 3BK0A 4S2CA 5F2IA 2GQ8A 2QCCA 2J24A 4YWIA 1DJNA 4IMFA 1HUVA 4LW7A 1LRTA 3CLMA 3MP5A 1BWLA 4Q4KA 3AJXA 1S5TA 2V2CA 1NSJA 2I1OA 3HQ1A 3L65A 3TXZA 4N4QA 4W9TA 5F2MA 3ZWTA 2RH9A 4MIMA 3C2EA 2X16A 3UWUA 4JDYA 2QCEA 3O07A 4CCCA 3GX9A 3M5YA 1XKYA 4NJKA 1WX0A 1TTQA 1FQ0A 3RK8A 4ZQCA 3G24A 1KTCA 3E0IA 4MYXA 3EKLA 3EXTA 5LZLA 3LV5A 2QCLA 1RZMA 3CEPA 1FCQA 4OV4A 4MLRA 5DY3A 1TV7A 2CZDA 3WJXA 4ZVJA 1KFEA 3H55A 4QISA 3EWWA 3DHDA 3W1PA 4K8EA 3PBVA 2R8WA 3CB8A 3GXNA 1AW1A 3W70A 2FIQA 5BMXA 1TB3A 1ZFJA 5D09A 4X3ZA 2A7NA 2QAFA 4LOCA 4NXKA 1G7VA 5U7SA 3W1RA 3CHVA 4N6FA 4S2BA 5AC6A 1EP2A 1XM3A 3ZWSA 3ZR4A 1FCVA 1W37A 4UFKA 3O6DA 4JX4A 2Q8LA 5I3GA 3NQMA 1LLZA 1XC4A 2CLKA 4A2RA 1TPDA 2QDGA 3B04A 3HJZA 3P8JA 3KRSA 3NPUA 1EA0A 4JYDA 2QCMA 2VOMA 2YFNA 1TPEA 4JX5A 3G1HA 2H3BA 5G4WA 4K8HA 5E93A 4HSNA 5KZDA 2V5LA 1LBFA 4I9AA 8TIMA 1TV8A 2ZTJA 3PBYA 3A24A 1JUKA 4AH7A 3VNDA 4ICNA 4AWSA 3BVJA 3MMTA 1SZEA 1EB3A 3DI1A 4GJ1A 3G1AA 2VEMA 3EX4A 3O63A 4K7YA 4N9CA 2ZA3A 1SSDA 3S5NA 1QPQA 4O14A 3LCXA 4H3DA 5BMWA 3W7IA 3RF9A 4IJBA 1R2RA 2ALDA 3NPVA 2C15A 3QM3A 3FJ6A 1FCBA 2R14A 1UJPA 4X22A 4HIBA 2DORA 5D2YA 3W7HA 4C1LA 4Y90A 3GIYA 3P67A 3LERA 1SUXA 2PE4A 1PVNA 3LXAA 3C2OA 4RK8A 4OV9A 3QPYA 3TJXA 5FF7A 2Y7GA 5F2GA 1TPWA 3HBLA 1K7FA 4L4LA 4N2YA 1IGSA 5CZJA 3OBKA 3HB9A 3PUOA 4HSOA 3KX6A 1VHNA 4RKAA 4HHPA 4DPQA 1KA9F 1V5XA 3GKFA 5MHBA 4JN6A 2E6AA 1GJPA 5HUPA 3LXBA 1EPXA 3B06A 3O1NA 4ZZ9A 3HG5A 3R89A 1H7OA 1UUMA 2C19A 2DZPA 4XZ9A 1JUEA 1GEQA 1MSSA 2JKPA 1VC4A 2Q3RA 5T26A 3W85A 1P0KA 2NX1A 1XDMA 4GUGA 4FO4A 3FKRA 4IXXA 4RX0A 3SSJA 5LHFA 5CSSA 3CU2A 2QEZA 3M6YA 4HKPA 4JTUA 1FDJA 4BWLA 1VR6A 1FBAA 2H8XA 6TIMA 3CQ0A 2TSYA 4GFSA 3C4UA 5C2XA 4K39A 1G69A 2AAMA 3RU6A 3QFEA 4OGZA 1TIMA 4CLMA 4O53A 1KM0A 4XBKA 3L5LA 2JGYA 1G4TA 1DHPA 4UFJA 3LGEA 5CPNA 1OYAA 1OJXA 3STCA 2ZRYA 4O8RA 4Y9AA 3NO5A 5K3VA 1OFBA 3S5YA 4BWLC 2YZRA 4AHPA 2ZDRA 3QMRA 4GUFA 2FQIA 1TPUA 1XDLA 1OF8A 2GVJA 3EB2A 3A21A 2EHHA 2DZUA 1JCLA 1FXPA 2G97A 1C9DA 3GDKA 3IVUA 4RLIA 1O5XA 4EF8A 1HG3A 3EXRA 4HNTA 3DENA 2VEPA 3NPXA 4EOUA 3HGOA 3R12A 3MI3A 5BW6A 3TMLA 2VELA 2WNNA 1A50A 4CCEA 4MY9A 1K8ZA 2X2GA 4Z0SA 3UWYA 1GVOA 2G95A 2VC6A 2H6RA 5EKYA 5KZMA 1G7UA 3DAQA 1N8FA 2VXNA 4NNBA 3TIMA 2B7QA 1OG0A 1A53A 1VRDA 3LHUA 1K03A 2NX3A 1FWSA 1WAUA 3NQDA 1J5TA 3MP3A 2GVGA 4NQ1A 3WJSA 3TU9A 1P5BA 3TXVA 3W2KA 1RR2A 3L67A 2C0AA 4QM1A 2E6DA 3NL6A 3G22A 2Y62A 3W6YA 5CKSA 4E0CA 4UXDA 3P5YA 1G4EA 3FJLA 4WY0F 1D3GA 4LVDA 3W73A 3IVSA 1RPXA 2VKZG 3SR7A 5G1TA 1QFEA 1PHQA 3GR8A 2QCDA 1KV8A 3G3DA 3HO8A 3M7WA 4AVFA 5D2XA 4NJJA 4XBSA 5LSMA 3TSMA 1A5AA 1W1ZA 2AQWA 3LI0A 3L2IA 1I45A 1RV8A 5F4XA 2ZZ6A 3M5ZA 5I3JA 2ISVA 3M0ZA 3F1QA 1WDWA 1M7OA 3DKLA 4NJGA 4WXZA 4ZQNA 2J27A 1W8SA 3UWVA 4Z08A 5E1QA 1Z48A 3FLUA 3GZ3A 3NL3A 3O05A 3HMJG 1C8VA 4LV4A 1PCWA 2YYUA 1SFLA 4RJEA 3W7QA 1M5WA 2CLFA 3HPSA 3A5VA 4FXRA 4GE8A 3W72A 3QSTA 5J5DA 2I9EA 3M43A 3NXFA 3SIZA 3UXDA 3LI1A 4Y6GA 4FEZA 1NF7A 1K7XA 3W74A 3LCGA 1RQHA 4LT9A 1SSGA 4PL1A 1G4SA 3TAOA 4IMCA 3TNOA 4ADUA 3VKJA 1GYNA 3TJLA 3HF3A 3O06A 4JTKA 4NNCA 1VPXA 2DZSA 1A5SA 1ME9A 1H7NA 3L21A 1G6CA 3ATYA 3LM7A 3N9RA 1Q45A 3B05A 3W88A 2YX0A 4ADTA 2GJNA 1ICQA 3NOEA 2X1SA 3NQ2A 3BLIA 5AHIA 4O1AA 4QAIA 2YR1A 2YGYA 4KFPA 4IX2A 2A21A 2ABAA 2A6LA 3HG2A 4RZ4A 3NAVA 3B8DA 4ML9A 2ZRXA 1H50A 4FNRA 3GAYA 1DJQA 2H90A 2Z6JA 3G0UA 3PWAA 4Q32A 5FEPA 4N02A 2JK2A 5C6MA 4CNPA 4WJEA 1QO5A 3IGUA 1A5BA 3EWXA 3W2LA 4UTMA 4QJ1A 4Z1AA 1PCKA 4GUHA 1IXPA 3N2MA 1SZNA 2E5CA 4JY8A 4KFNA 2A5HA 1OHLA 5D05A 1SO6A 4IPJA 4IOTA 5LNVA 3LCHA 4B5NA 3EX6A 4EIVA 1PE1A 1KW1A 4NT0A 1DBTA 2TYSA 1O95A 5FESA 1V7YA 2NXHA 2RDTA 3LBCA 2J9XA 3G18A 1R2TA 2C6QA 1T8XA 5G1YA 3EX2A 3LV6A 1XCFA 2QDHA 3PULA 1P1XA 1W31A 1OFOA 1VLWA 1DOSA 1Z41A 1T99A 3BW4A 4ADSA 5BRBA 2YW3A 1TRDA 2BTMA 2Y63A 1BKSA 1K7EA 2WOQA 4AB4A 3E9AA 3ELFA 3TE9A 4MZYA 4P2VA 1EWDA 3S6DA 4XKYA 1FX6A 4FX6M 4FNQA 4E2BA 2V8ZA 5F4SA 2HTMA 3QQ1A 1Q6QA 4IMDA 3P7YA 3NA8A 5EL1A 3F4WA 5TQLA 3UQNA 2NX9A 2CLOA 5LGXA 3TDFA 3TQVA 3O16A 1SZGA 5FEWA 4WX2A 5LGZA 4FIQA 3GDMA 3FA5A 3T78A 3UPWA 3EEGA 1AW5A 1OK6A 1F7BA 2A4AA 2O7QA 1UCWA 1TTJA 3ATZA 1W54A 4M6PA 4D2JA 5F4WA 3HPXA 1JCNA 3QZEA 4R53A 4JTIA 1XUZA 2QCDB 1LDCA 5AB3A 4UC5A 3CTLA 3W83A 3KVLA 2GJLA 2J88A 4FNUA 3UZJA 3FYOA 2ZYFA 1C29A 3GXTA 3Q94A 3WJYA 2QJHA 2B7PA 2WSYA 5D03A 4A22A 1TQJA 2Z1BA 5DXYA 3C2FA 1I8JA 4MJMA 4UFHA 5I3FA 1IIHA 1SW0A 3SGZA 2ZA1A 5K9XA 1X7FA 4JTTA 4MOZA 4K38A 2HS6A 1IF2A 4EF9A 2TRSA 1AW2A 3O6YX 4WZHA 3HGRA 4UTUA 3I7QA 2QCGA 2Z2UA 4RZ6A 2EPHA 2WNQA 3G1VA 2C13A 3W7NA 4DBEA 3QMSA 3A9IA 3GDRA 3OEXA 3TFCA 5G2IA 2C16A 1MEWA 3BLEA 2W6RA 4LY8A 3W1TA 1GWJA 5D38A 3DFQA 3IV3A 2PURA 5F2LA 4IQLA 1L2UA 2B0MA 3M5VA 2VFFA 5KSWA 3MI6A 3Q37A 4QITA 4U28A 4R34A 3GDTA 3THQA 2DP3A 3GDLA 2NXIA 1JQXA 2VFIA 1Q3NA 1TV5A 3NM1A 2QR6A 1X1OA 1ICSA 1YTEA 3RMJA 5DY2A 3S0CA 1SFJA 3CWOX 5D37A 4GBUA 1H5YA 2NWRA 3IIXA 5EPDA 2E6FA 2Y89A 4O57A 4M7SA 1WOAA 3IGSA 1JULA 4N9EA 3TW6A 3M5XA 1KFCA 3LRKA 2ZBTA 3JRKA 4QNEA 3GNDA 1K3UA 1VHCA 1VYRA 1MO0A 3NQGA 3LOTA 1YXCA 1ALDA 5DCDA 5DLCA 2OCZA 3UXAA 3W3OA 4UTIA 1OFRA 4AAJA 5AOUA 4XQ6A 3KAOA 4NX0A 2Y7FA 1R2SA 1JQVA 3P74A 3S5ZA 2G5WA 3G0XA 5TBOA 2V82A 4CQ9A 1AK5A 3K30A 2R91A 3MW7A 3MBFA 4LVFA 4CNOA 3W86A 3W7DA 2OX1A 2FTPA 1GVFA 1H62A 4KWWA 4UR8A 5DBUA 4Q33A 3PR2A 4MFDA 2ZZ5A 5I3IA 2CLEA 2KZHA 5A8GA 1OFPA 2JBMA 3ABSA 1KFLA 5G4EA 1LCOA 4IXHA 1EX5A 3DU0A 4JNMA 1ONRA 2V2DA 3OHIA 3UPBA 1PS9A 4UTWA 1TTIA 3FIGA 1DV7A 3T44A 4R7JA 1RD5A 3GVGA 4XKYB 5FEZA 5GVJA 3W7PA 3ZS4A 3S1UA 5LNWA 5CZTA 4YCOA 3WK1A 2V9DA 1VCGA 4P61A 5D02A 5ABTA 2YSWA 3NVTA 3HGJA 1A5CA 4N4PA 4MZ1A 1KM6A 1L6YA 3UNDA 4UTWC 1BTMA 1HFBA 5LNSA 2DZVA 4RXGA 3SI9A 4YMZA 3UWQA 4IGHA 3N9SA 1G4PA 3NM3A 3P60A 3HGSA 5F1VA 3W7RA 1O4UA 3DI0A 3FOKA 3UZ5A 3KFTA 4UTKA 2VEKA 3B4UA 4K7VA 1M7PA 2UV8G 5HR7A 5CGQA 2PRMA 3PAJA 3NNTA 4FX7A 1YXYA 3CWNA 1W5QA 3H53A 3S1VA 3TQ0A 3NQ7A 2DZWA 3KXQA 2EKCA 5K7JA 1GQNA 3N73A 1I2RA 2V2HA 1GVRA 2ATMA 5G5IA 3C2RA 1F2JA 4N6EA 3ZFHA 2WJZA 1QMLA 1IXQA 1TJRA 2B4GA 3IGXA 1FUYA 4KWVA 4BI6A 2OJPA 3QQ0A 3HIJA 4HPXA 4O17A 1CX9A 2VEIA 2QF7A 3QF0A 4WQ6A 5BOOA 4ORMA 4TO8A 3GAKA 3BW3A 4QNWA 4JGDA 3FYPA 2B7OA 2X1UA 2E68A 1QPNA 4GRSA 3MI2A 3OIXA 4DELA 3C3NA 2Y70A 2FB3A 5J5RA 1DVJA 1ZENA 4MUZA 3LHVA 1U83A 3PUEA 4LRTA 5K9CA 3C52A 1SW3A 2W0UA 2R94A 3RLUA 4JXCA 1B9BA 2ZTKA 1NVMA 3Q2DA 1TPVA 3B0VC 4UTTC 2FFCA 3F4NA 4O1CA 3STGA 4NU7A 4Y96A 1UBSA 1OFQA 1Q6LA 1YTKA 2RKXA 3M44A 3USBA 3QPZA 2CLLA 3DXIA 3KHJA 4LWWA 3TX9A 3NGJA 4GXMA 4ONVA 4JYEA 3IRDA 4O4WA 4PFMA 2Y6ZA 4M6VA 1TPC1 4UMAA 2X1RA 4PC8A 4UCGA 1XL9A 1JVNA 1QPRA 4FF7A 3NL2A 1OFEA 2WQPA 4ZQOA 5K4ZA 3TC6A 2YYTA 3QEZA 4MKNA 1GOXA 4H6KA 4FNSA 4O0ZA 4PH6A 2WNZA 4DXVA 1D3HA 3M9YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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