1K8YA

Crystal structure of the tryptophan synthase beta-ser178pro mutant complexed with d,l-alpha-glycerol-3-phosphate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
268
structure length
255
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 95
structure length 255
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k8yA00
4KKXA 1K8YA 2DU2A 1Q6QA 2ISVA 5CSRA 1J4EA 1KTCA 3C56A 3EEGA 4H6KA 3PUOA 3B0PA 1DBTA 1HL2A 4AEOA 1DHPA 2CLMA 4LT9A 3KRUA 1OX4B 1GVOA 3EB2A 1I45A 3QSRA 5DY3A 3UY8A 1OVDA 3FYPA 3LRMA 3A5FA 5C54A 4NQ1A 1W3IA 2ZRVA 1JUEA 3O15A 4M19A 3MBFA 2JKEA 4CCCA 2VENA 1H1YA 1CI1A 3S1UA 1NVMA 3N34A 1KV5A 3QW3A 5DBUA 4LUJA 5F1UA 1TSIA 4GJ1A 4NJGA 1F73A 3PSVA 2FLIA 3SECA 2XN2A 2VFGA 7TIMA 3BW3A 5LNSA 1OYBA 3EWBX 2NX1A 3P62A 1AL8A 1C9DA 4Y90A 2C19A 3NL6A 2H8XA 1VHNA 3NVTA 3NQAA 2EHHA 3F4NA 1SO3A 1R2RA 3PBYA 2OJPA 4AHOA 4XBSA 1N8FA 1A53A 4LRTA 3O6CA 2J9XA 1EA0A 3NL2A 1TPWA 3W7JA 4FF7A 2A6NA 5AHNA 2JKAA 3LTPA 2E77A 1IGSA 3DKJA 4PFMA 2QUUA 2AGKA 5EA9A 2I1OA 3PULA 5FEXA 1W5NA 3TSMA 2R91A 3CC1A 1WX0A 2X2GA 1VPXA 3I65A 5SWUA 1ZENA 3HG2A 2YW3A 5H91A 5EY5A 1YYAA 4QIUA 5AYZA 5H2ZA 4GUFA 3QMSA 2Y7FA 1KBIA 4JTEA 1JRBA 3QJAA 1G7VA 3HOJA 1QR7A 4JYEA 5CPOA 3GVGA 3Q58A 4UUIA 1T96A 2QCFA 5LSMA 3L5MA 4ZL1A 1SFLA 3W2JA 3FIGA 3W1MA 4S2CA 2ZRZA 4JNMA 3MBDA 2CLKA 5MHBA 1AW5A 3GDLA 5AHLA 3NM1A 3MI2A 2CLOA 2ZCGA 3UPBA 4NUWA 3KXQA 4Z0JA 3CEUA 3HB9A 3GR8A 4NVTA 3LBMA 4UC5A 1QAPA 4MIMA 4O54A 1QPNA 2QCLA 4MYXA 3W1LA 2V0TA 3N9RA 1Q45A 4Z1AA 3HG3A 4O53A 2GQAA 3CPRA 1OYAA 1MEIA 5D2WA 4KFNA 1IXNA 1ICPA 1TPFA 2FB3A 1SZEA 3NG3A 1MO0A 3LDVA 1FWSA 1RQEA 3S1WA 2Y6ZA 1KBJA 1QCWA 3M7WA 4FX7A 3FJ6A 1QPQA 1M6JA 2DZSA 4ZQMA 1FCBA 3W7CA 2V5BA 1QPRA 3W84A 3G18A 3ATZA 1OJXA 5LHFA 1O94A 4IOTA 2FFCA 2ZZ2A 1XBYA 5CZTA 4KFOA 4UTJA 4IGHA 4CCDA 4UR7A 2V2CA 1H5YA 5D33A 3EWUA 3W1PA 4XTIA 4LW7A 3NNTA 2JK2A 1C8VA 1FDJA 1F76A 4RKAA 4H3DA 3BVJA 2QDGA 5L6UA 4NXKA 2RDWA 4DO5A 4UCGA 2HMCA 3W7OA 3LCWA 4RK8A 1H50A 4IXHA 1VCVA 2E09A 4DEFA 3W73A 1XBVA 3UY7A 1XL9A 3W1UA 3BG9A 1SZNA 4N02A 5FF0A 2ZZ1A 4CQAA 1XI3A 3LLDA 1UASA 3CU2A 3KVJA 2DP3A 3W2NA 2H90A 1KFBA 1TPUA 4Z08A 1LCOA 1WDWA 5FF2A 1SW3A 4NJHA 4O15A 3TQVA 1FWRA 4PA8A 1L9WA 4UFLA 3G1AA 4DF2A 3L21A 1YDOA 1W5MA 5I3HA 3LHUA 4MZ1A 1GG0A 3EX4A 1GEQA 3TH6A 1JCJA 4BF9A 2ZDRA 3EX3A 1GQNA 4NX5A 3W71A 4E38A 4LOCA 2ATMA 4CNOA 2B7NA 3NQFA 1PV8A 1XXXA 1BEUA 3DH7A 3TJLA 4QM1A 1QOPA 4K37A 4UTHA 4XKYA 2FTPA 2FDSA 2DZTA 2ALDA 2NUXA 6TIMA 3ABOA 3H54A 1KV8A 1G4EA 1LYXA 3O1NA 1G67A 3SW6A 5HWJA 4N9EA 4JEQA 4FNSA 1MEWA 2DZXA 4A2SA 1LOQA 3STFA 3RU6A 1A5CA 1LLZA 1TRIA 4JTIA 4UFJA 1BWLA 4FXSA 1LM1A 5D04C 2QR6A 5G4EA 3PR2A 4WY0A 4JTSA 3CLMA 3F03K 4QITA 1HTIA 2GPTA 3PS7A 4LC6A 3LCGA 4NU7A 3STCA 4TMBA 1FCQA 4ORMA 1G6CA 5DXYA 3DFSA 2J27A 2RFGA 1OFDA 3QFEA 4M5PA 3NZ1A 5FI8A 5K9CA 2J6XA 4C1KA 5G5IA 3GR7A 1YPIA 1ONRA 4JX5A 3LLFA 1Q6LA 3QQ0A 4K6AA 1A5BA 4O28A 3W1XA 3B0VC 2X1RA 3GDTA 5AOUA 3KAOA 3P8JA 2GQ8A 1P0NA 3W22A 3LCHA 3UQNA 2YFNA 3T44A 4Z1CA 2QEZA 1L6SA 5K2ZA 5C6MA 3G24A 2ABBA 4C1LA 3PUDA 5F2IA 3C52A 2QAPA 4HPJA 3DI0A 3N2XA 4A22A 4LS0A 1EIXA 4Z1BA 4IX2A 5EYWA 3M1ZA 4XKYB 2GJLA 2TYSA 5AYXA 1A5SA 4ML9A 4AF0A 4IPIA 1EWDA 1TIMA 4M6PA 3GKFA 3LCIA 2RHGA 4QJ1A 3EWWA 3ZS4A 3W1AA 3W7PA 5FF4A 1WOBA 1UB3A 2Q8ZA 3W72A 1QNVA 4X3ZA 1OF8A 4RXGA 4WY0B 2OMAA 5KTLA 3LXCA 2V8ZA 2VKZG 3SFKA 5IM51 1KTNA 3QMRA 1R30A 3GK0A 4HSNA 5L9FA 5D30A 1O95A 3E12A 1VYSX 1PS9A 2Q3OA 3W85A 1GZGA 3M5XA 1JCXA 1GTEA 3MMTA 4LWWA 2JGQA 1OHLA 3TMQA 5CPMA 5AHMA 1QOQA 4N6FA 3ELFA 2BZNA 4G1KA 3PB2A 3N14A 2E6DA 5EL1A 1JCNA 1ICQA 2E6YA 5CZSA 3JR2A 4DBDA 2VEMA 2Z6IA 1ME9A 3RK8A 1ALDA 4UMBA 4ADSA 2QCEA 4O50A 5G2WA 3BW2A 2NUWA 3LI0A 3NM3A 2GUUA 2C14A 3R12A 5EMUA 2F84A 2DZVA 1I4NA 4WOZA 5F4SA 1OFRA 1IIHA 5FF7A 3F1QA 2JKPA 2YYTA 3RF9A 4EWND 4R53A 3JS3A 3UXAA 2WKJA 4AF0B 4UR8A 3QPZA 5FEWA 1KA9F 4WQ6A 4HIBA 1FWNA 2ZZ6A 4PTNA 5D2YA 5I3FA 4NZJA 2PC4A 3TC6A 1O60A 3OA3A 2G96A 3PF3A 1OK4A 3GDMA 1R2TA 4JTUA 5HUOA 2CLEA 3FKRA 3WK0A 3TE9A 2X16A 4WXZA 3W7DA 4UTKA 3BGJA 2R8WA 3CWNA 4FNQA 3PC0A 1B3OA 3ZWSA 3SI9A 4MY8A 3BO9A 5I3GA 1EEPA 1YTEA 4JTTA 5HWNA 2E6FA 1MSSA 3H53A 3W7KA 1TTJA 4BI5A 3KVLA 3DENA 1EP1A 1HG3A 4EVZA 4ZQPA 2FIQA 4AVFA 2VFFA 2OZ0A 4NNBA 4R7JA 1UCWA 3MJYA 3LRKA 2TMDA 3Q37A 3IRDA 4O10A 4GUHA 1I2PA 1C29A 4L4LA 3SIZA 2ZRUA 3TX9A 5I3IA 1JUKA 5AHIA 1M7PA 2R14A 3OVPA 3HF3A 5D09A 4X2RA 1TPH1 3MUXA 1FXPA 3I7RA 3G0SA 4PC8A 1HFBA 2TRSA 5TQLA 3LHVA 3B4UA 3PUEA 3C2VA 3FKKA 4JN6A 4Z1DA 1HO4A 1GVFA 3RLUA 1X1OA 3M0ZA 4E2BA 2DZPA 3L2IA 1WOAA 3B04A 3PB0A 1JUBA 4E2DA 3SGUA 3KOFA 3F4WA 2OCZA 4RV8A 1NFBA 1W54A 1DQXA 3C2FA 5KZDA 1VLWA 4UNKA 4UTLA 5F1VA 3S5YA 1J2WA 1ZY9A 4IWWA 5LNUA 1Q6RA 4FNRA 3MHUA 1YXYA 1LOSA 1T99A 1RD5A 1SFJA 4QAIA 4R33A 4JICA 3T7VA 1RPXA 1VS1A 1LRNA 1H61A 3NL3A 2VEKA 5F2LA 3CT7A 3IGXA 1SW7A 3A24A 3I7SA 5C2XA 3USBA 2ZRWA 2IQTA 1NSJA 4N9BA 3UYCA 3GB6A 2ZZ3A 4DQWA 4PODA 3TIMA 3VKJA 1NEYA 3G0XA 3NOEA 5K3VA 2A7NA 3AO0A 4HT3A 1Q3NA 3G3DA 1A5AA 4FNTA 1S5VA 5DCEA 1O4UA 1A50A 2UV8G 3R8RA 3W23A 1QO5A 1FQ0A 3TW7A 2WV8A 3NDOA 3ZWTA 4ONVA 3BV4A 1OX5A 4YMZA 5LGZA 2GVLA 4YL2A 1VYRA 4MJMA 1W37A 3HG5A 3GDKA 4FX6M 4RCXA 2V2HA 1IXPA 5FEPA 1K8ZA 4FEZA 3R5EA 3G1HA 3W2LA 3LCFA 4RZ5A 5HWMA 3HPSA 3KFTA 4FNPA 4RR4A 5K9XA 4DBEA 2W0UA 5F2MA 1IXOA 5HR7A 5HJLA 3B05A 1MXSA 1OX6A 1WV2A 2V5LA 3WJZA 2B7PA 2B7OA 1LZOA 2GVGA 4ZQNA 1I8JA 4FX8A 1SSDA 2QJHA 3CIWA 3EX2A 3EKLA 4ADTA 4Q4KA 2D73A 1G69A 3LX9A 4DO4A 3P61A 2RH9A 3AJXA 2VOMA 1DVJA 3OIXA 1HUVA 3O16A 5F2GA 2YSWA 1L6WA 2A5HA 4K39A 3P5YA 4QISA 1OF6A 3NQDA 4O16A 4LS1A 4Y6GA 2Y89A 4GFSA 4OV4A 4ICNA 2C15A 2VXNA 3P7YA 5DBTA 4B5NA 1Z42A 2FPVA 4O57A 4JDYA 3S9YA 2WSQA 5D02A 2ZQ0A 2ISSA 3IVTA 4K36A 3W7QA 1DV7A 5D32A 2DZUA 4MKNA 2XFWA 2Q3RA 5D37A 4LVAA 3QF0A 2ZA3A 2BX7A 5LNVA 1ICSA 2J9YA 2TPSA 4LNYA 3DHDA 2RDTA 1GYNA 4FIRA 3CHVA 3STEA 3NQ6A 4YXGA 3LBCA 3WJYA 2NX3A 2C18A 1EP2A 2X1UA 3NXFA 1W0MA 1ZJIA 2DJXA 3QYQA 1PE1A 1AMKA 4IMEA 4EF8A 4WJEA 2Y63A 2ZZ7A 3GXTA 1PHQA 4RJEA 3G3MA 4MYAA 1GVSA 1W8SA 3DFQA 3M43A 4XTDA 1LTDA 3LXBA 5DN1A 2CZEA 3V75A 3C2EA 5ABTA 2A1YA 1KFKA 3VE9A 1X8FA 2FJKA 4O4VA 3NQCA 4O18A 5I3JA 1KTBA 2C1HA 1GVQA 1YDNA 2CLLA 3C4UA 1KM2A 3W7EA 3WK3A 4O13A 4HSOA 4UIOA 3C6CA 1K7XA 1TCDA 3LGEA 1VCGA 3LHTA 4WZHA 1FX6A 3G8RA 4GWEA 3QQ1A 3W1TA 1K8XA 3LTSA 1XM3A 2R94A 1XUZA 3KHJA 3L9CA 2A7PA 3IIZA 3DXIA 1SR9A 3W7GA 4WXYA 5D38A 1AW1A 3TCEA 1RR2A 3IIVA 1OABA 3U6WA 5BW6A 1F6KA 2ZYFA 3EXRA 3T4CA 4UFIA 1OFQA 1P4CA 4O1AA 5DLCA 5DXXA 5AHEA 3L65A 2BXVA 1RV8A 1XUUA 4NX0A 3P84A 5GVJA 3JRKA 4JX6A 5AC7A 1ZHAA 3UWQA 4IJBA 3O6YX 4QNWA 1KFJA 1RZMA 3FLUA 4A3UA 1LBMA 2F7FA 1X1ZA 2E6AA 4X22A 1GWJA 3P80A 1NAL1 2YCEA 1B9BA 3DFOA 5J5DA 3GXNA 4GUJA 1FY6A 4U28A 4O52A 1NF7A 4N6EA 3QZEA 1P5BA 4NJIA 3TROA 3L5LA 3P5ZA 1R2SA 4XWUA 3G1DA 2YW4A 4FO4A 1P0KA 3NPXA 4JTHA 4AHQA 3LERA 1UBSA 5EPDA 1PCKA 2A21A 3P82A 4NXSA 3SR7A 4YWIA 2QUVA 1H60A 4NJJA 5AN7A 1LBFA 1VZWA 2VFHA 5CSSA 5CGQA 1XDMA 4KFPA 3CTLA 1PIIA 1M7OA 3TV8A 3DBPA 3S5OA 3TUUA 4FIQA 1LRQA 3DI1A 4U4MA 4AH7A 3O07A 2Y70A 2PRMA 4JD4A 3PWAA 4D2JA 4MVAA 3QC3A 1CW2A 1KM4A 3T78A 3TJXA 1AK5A 4LV4A 3O05A 3PY2A 2CU0A 3HG4A 2Y62A 1KM1A 5KZMA 3NGJA 3A23A 3IIPA 1YTDA 3TXVA 3DFPA 3HQ1A 3Q94A 1U83A 3UZ5A 1TRDA 4LTSA 2X1SA 3B03A 1F2JA 1EWEA 1WQ5A 3LOTA 3N73A 3INPA 3MO7A 3HPZA 2OT1A 1IXQA 1W56A 3BLFA 3E49A 1TQXA 1D3HA 3VNDA 1J5TA 1W5PA 1WBHA 4LC8A 5BMWA 1K02A 3FEMA 2NZLA 1FUYA 3SY5A 4TMCA 4YCOA 3KVKA 4O19A 5AB3A 3TQ0A 1YDVA 2C13A 2QAFA 2WSRA 1JULA 1RQBA 2X30A 1W3TA 4JYFA 1D3GA 4OT7A 3LHYA 5AC6A 2C3ZA 3R89A 3L67A 5CZJA 4NJKA 2QCDA 4O11A 5DCDA 2WNQA 3OG3A 3PG8A 3OHIA 1DL3A 3S1VA 5LGXA 2ABAA 3R2GA 2FPYA 2JGYA 3D0CA 1OFBA 5DELA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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