1K8ZA

Crystal structure of the tryptophan synthase beta-ser178pro mutant complexed with n-[1h-indol-3-yl-acetyl]glycine acid
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
268
structure length
257
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 98
structure length 257
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k8zA00
3E49A 2V30A 3QF0A 3TKFA 1KFJA 1DORA 4CCEA 3G1VA 4FIRA 3T4CA 2C19A 4DEFA 1GTHA 3G8EA 4LS1A 1R2RA 3PULA 1EP1A 3LX9A 4NNCA 2RDTA 1FBAA 4RXFA 4OU1A 3G1AA 3PSWA 5IBXC 2ALDA 4NJHA 2V5LA 1ZCOA 3TFCA 2TPSA 2FPYA 2FB2A 3T78A 1PL9A 2AAMA 3W1RA 2PE4A 1ICPA 1R2TA 3FJ6A 1PCKA 2H8ZA 1IGSA 5CPMA 3GAKA 2E5DA 5BOOA 4QJ1A 3C2FA 4RZ6A 4TIMA 4IXHA 2DZUA 3KVJA 4NZFA 4NVTA 5DXYA 1ZENA 3VE9A 4UTJA 3T44A 3LHWA 5KZEA 5DY2A 4FX7A 2WJZA 1M6JA 1W1ZA 3BLFA 5LNVA 2QUTA 2JKAA 4BWLA 4GJ1A 1TV5A 4IUOA 4IXXA 3GDKA 1ICQA 5BNKA 4JY8A 4CNOA 1UCWA 4FNQA 4WD0A 1JCJA 1J5TA 2QCHA 4JTLA 4A3UA 3L0KA 3W86A 4YXGA 1SW3A 1DOSA 1SZGA 3I6RA 3TQ0A 4O28A 1IXQA 5D02A 4O19A 2NXHA 4FX8A 3BK0A 4QM1A 2CLFA 4N9EA 5I3FA 1TQJA 1ZAHA 3H55A 3PVFA 4CCCA 4JYFA 1WOBA 1H5YA 5L6UA 3S5ZA 4M6QA 1EP3A 4JTIA 1EX5A 3NPUA 3GNDA 2QR6A 4GRSA 2DU2A 3NL2A 2TSYA 3TW7A 3UWQA 2CLEA 4FNSA 3LHUA 2VXNA 5G5IA 3G0UA 4NZJA 5CSRA 3CT7A 2DZPA 3UXAA 1ICSA 4PA8A 3W3OA 3DFSA 1PIIA 1EPXA 3Q94A 1D9EA 2DORA 1LTDA 4GUIA 4FHAA 1ZFJA 2V5BA 4PCFA 2JK2A 4A21A 5G2WA 1IXOA 1W0MA 2BTMA 1KFBA 5KINA 3G18A 3WJWA 4Z0SA 2VFFA 1H7RA 4TU1A 4WY0B 3GXNA 4JTSA 4HSOA 1TMHA 1W5PA 3QFEA 3SW6A 1KBIA 4HPXA 4K7YA 3QC3A 4PC8A 3MBFA 1F73A 3I68A 2FPTA 3LI1A 3LBCA 1GT8A 4XBKA 1NAL1 3O6YX 5A5WA 3MI3A 1ME9A 2A2IA 4K37A 5D2TA 3TJLA 4Q4KA 4S2CA 5F2LA 5KTLA 1JRBA 3S5OA 4GUJA 2FDSA 3DKJA 1SO5A 4IMGA 3N19B 3EXTA 1MEWA 4NJKA 1QR7A 2ZA1A 4UFIA 4IX2A 1JCYA 1N7KA 2DZSA 3EEGA 3NOEA 4UTTA 2KZHA 4JYEA 4LC8A 4RZ4A 1PCWA 2E6AA 3IEBA 1WBHA 3MO7A 2CLLA 4M6PA 3B0UX 1DHPA 4JXCA 4N6FA 4LVFA 4UFLA 1F76A 1FXPA 4RXGA 4XTIA 3W23A 2E5BA 1OFAA 1P0KA 3SFKA 1UUMA 5AC6A 3NPWA 5DXXA 4O50A 1UB3A 2YGYA 4N9BA 2JBMA 3BLIA 3M41A 1XDMA 3PG9A 3TK7A 4AHQA 5AC8A 1VYSX 1TTQA 5FF3A 1TTJA 4BR1A 2Y7DA 5AHLA 1TQXA 3TV8A 2QKFA 2B7QA 2Y63A 3GIYA 5AHEA 3S5NA 2CU0A 4O10A 3C6CA 3CPRA 3W1MA 4K39A 1VCFA 3M7WA 3C61A 1CI1A 1Q6QA 3B03A 3HPZA 1VQTA 2PURA 2GVJA 1UJPA 3LDVA 4RZ5A 3B04A 4MYAA 2C3ZA 4M7TA 2OCZA 3KRSA 1T99A 4CNNA 1TPDA 1EUAA 3TH6A 1RD5A 6TIMA 3RF9A 3TMLA 1HG3A 2J24A 6ALDA 3DBPA 3STGA 1A53A 1VS1A 3EXRA 2ZDRA 1AL8A 3D0CA 2ZZ1A 3KVMA 3KRZA 1YPFA 2X1UA 3L5LA 3FEMA 1OJXA 2CW6A 3NQ2A 4H3DA 4TMBA 3W7DA 3UWYA 4FNRA 3R12A 4Y96A 3TIMA 2QCFA 1VCVA 3CWOX 3TXZA 1VYPX 3B0VC 1H50A 3LTPA 4KWVA 5EPDA 3THAA 3O1NA 1XL9A 2E6FA 1B3OA 1BTMA 3G1SA 2GPTA 3STEA 1KFKA 1RV8A 4MZYA 1W5OA 5J5RA 5L9FA 4UMBA 2YX0A 3HPXA 5LNSA 2NXGA 4AWUA 3STFA 3BARA 1B4KA 3I65A 1GZGA 5I3KA 4JX4A 2NX1A 1O94A 3PBUA 3QM3A 4O8RA 3W74A 3CHVA 5F4WA 1BWKA 5D2XA 2H8XA 4LVDA 4XZ9A 3GNNA 1PE1A 4I9AA 4E2BA 5C5YA 1LBLA 3WJSA 3VI2A 3UNDA 4Q33A 3LCHA 3KRUA 1DQWA 2R94A 2AQWA 4YLWA 3WJZA 1GWJA 1Z44A 3W75A 5FF0A 4MFDA 2YCEA 3LBMA 3NQ7A 5HINA 3S6DA 3UZ5A 5CZSA 4LS2A 2DJXA 1WAUA 5FEZA 2WNZA 1IF2A 4ZQPA 5DCBA 2GQAA 4ZZ9A 3FFSA 3WFAA 1ZNNA 4DF1A 1SZNA 4FXSA 3GAYA 3PG8A 5IBXA 3DZ1A 4AWTA 1JCXA 5D37A 3C8FA 3ATZA 3DU0A 4JTEA 4ORIA 1R47A 3OEXA 1C9DA 1LLZA 1HTIA 3H54A 4H6KA 1OHLA 1YDNA 2V8ZA 4C1KA 3MJYA 3LLFA 5EBUA 4QNWA 2A7NA 2B7PA 3W7RA 1LZOA 4M6VA 3BG9A 1I2PA 4ADUA 2RHGA 3A9IA 5G2HA 2X30A 1NSJA 3G24A 4JD4A 1VCGA 2Y7EA 2E68A 3P5ZA 2A7PA 1K02A 3G3DA 4N9CA 4M5PA 4XKYA 3L0GA 5U4NA 1F6KA 4LS0A 4OV9A 3EX6A 3TSBA 3ABQA 4LVAA 3HGRA 2VEKA 3P81A 3MBDA 1ZHAA 3MHFA 1SW7A 2Y89A 2F84A 4WZHA 2P0OA 1NF0A 2HS8A 3HGJA 4EF8A 1W5MA 2IQTA 3DHDA 5LKYA 2QAFA 1TB3A 4MJZA 1BWLA 1TJRA 3DFNA 2H6RA 5CZJA 1LRNA 2J9XA 3UY7A 5GVJA 3EWUA 3W7LA 1KFCA 3LCFA 4KKXA 4J9JA 3PBVA 3L2IA 4JY9A 1WOAA 3TQKA 4JS3A 1KV5A 1PHWA 1SQ7A 2BWGA 3S8HA 1QOQA 3HGOA 1OK4A 1X6UA 2GVGA 3M5XA 3S42A 4ICNA 4ALDA 1YTDA 1TPH1 5F1UA 3QRHA 1P4CA 1X1ZA 3GB6A 3OVQA 4MJMA 1KBJA 4JTHA 3MUXA 4JN6A 2W79A 4I7VA 1A5SA 1TTPA 3P62A 2CZFA 4MOZA 4MLJA 3TC7A 2Y61A 2OZ0A 1OFDA 4XTDA 4IPIA 3PUDA 4S2BA 3PBWA 5AYYA 1K8XA 1VHNA 2XN0A 5I3IA 1A50A 2O7SA 2EKCA 2QCGA 3W6YA 3GVGA 1DJNA 4G1KA 5CPOA 3SY5A 2OJPA 1LBMA 5K9XA 3DI1A 3IGUA 1GG1A 1OG0A 5CKSA 4ZQMA 3KX6A 4E0CA 3M43A 3Q2DA 4GE8A 4MY9A 4YCPA 5K9DA 2YFOA 3NL6A 1KFLA 1TYGA 1FWSA 3M1ZA 2WV8A 1W5QA 1Z41A 3FJLA 3N34A 3PF3A 2ISWA 1XBVA 3F4NA 1FY6A 4LOCA 2JGQA 3MHUA 1SO3A 2FIQA 8TIMA 4A29A 1GYNA 2Z0IA 3G1YA 5AHFA 1VHCA 5BRBA 2C13A 2E1DA 2VFDA 1H62A 4OT7A 4JYDA 1GEQA 3L0NA 1VLIA 1TSIA 4PL1A 2QEZA 1KFEA 5DBUA 1JUKA 3H53A 1OFRA 2I1OA 1BEUA 3W7IA 1A5AA 1FUYA 2QJGA 2YW3A 2P1FA 1ZAIA 4AB4A 3FYPA 5C55A 3M6YA 3SR7A 4KFPA 3N3MA 1YXDA 4IX0A 1VYRA 5DN1A 1JR1A 2Q3OA 5LHEA 1QCWA 1JVNA 5FF7A 3NL3A 5D33A 3P8IA 3W7QA 3UY8A 3IVTA 2YDAA 1XBXA 2CZDA 4UR8A 3ZR4A 3EB2A 2WO5A 4JDBA 3IIPA 3U2OA 3W7OA 2UV8G 4NT0A 3SGUA 2G97A 1O5XA 2CLHA 5K3VA 4AAJA 3ELFA 5K2ZA 5FF4A 5HWMA 1YLVA 3G0SA 5D09A 1FX6A 5F2IA 4RR4A 4HKPA 4IGHA 4OE7A 3DHFA 3G1FA 1EEPA 1F2JA 2WKJA 3W22A 3EKLA 4X22A 1A5CA 2ABAA 4GNJA 4U4MA 4O16A 1K7XA 1TPUA 1LP6A 1B4EA 2TRSA 3N9RA 2EPHA 3CEUA 1OX4B 4AHPA 3HOJA 4BK9A 1KTCA 4NJGA 2A21A 3CIXA 4OGZA 2QAPA 3V1PA 5HJLA 3NQFA 1PHQA 3UWZA 1VGAA 4K8EA 4NUWA 3TSDA 2ZRYA 5I3HA 2Y85A 5LGZA 5C2XA 1XUUA 2HTMA 2OT1A 3P82A 3IIXA 5EY5A 5D03A 4WXYA 4D2JA 1VRDA 5A8GA 4N4QA 4XQ6A 3Q58A 1AK5A 2DZTA 4O12A 3NQ8A 1XDLA 5CSSA 4FNPA 1YXCA 2FLIA 1XXXA 1I4NA 2ZTJA 1S5WA 1W3NA 1DL3A 1FCUA 1VJIA 5EL1A 1HO1A 4K36A 3JRKA 2I14A 3G8RA 1YDVA 3TXVA 2YXGA 3UWWA 1TPVA 1TJPA 3IGXA 3NPVA 1OFEA 1Q45A 3A5VA 1SFJA 4QNEA 4A22A 1CX9A 1GYLA 1V5XA 1HUVA 4O57A 3W84A 3BG3A 1PVNA 3C2OA 5AOUA 2ZA3A 1TPB1 4AWSA 4N2YA 2YFNA 3W73A 1Q6RA 3TDFA 3NEVA 1L9WA 2QCDB 4LWWA 3W85A 1XKYA 4YWIA 3W2UA 3HQ1A 3PWAA 3G0XA 5AHMA 5E1QA 1YTEA 4RJEA 1SR9A 3B06A 4CLMA 3NQDA 1GVOA 5F2GA 3IGSA 3W2JA 1B57A 1P0NA 5G4EA 2NWSA 3EWZA 3TU9A 2TMDA 5KZDA 1HO4A 3NO5A 3NQMA 1Z42A 1GOXA 4N6EA 1M7PA 4UTIA 1OYAA 3NQVA 1XFBA 4Y9AA 1TIMA 4KFNA 1RVGA 5D2YA 4X9SA 3QQ0A 2A6LA 3OBKA 3QW4B 1MEHA 2Z1BA 1S5VA 4Z1CA 4UR7A 3GDRA 2ZA2A 3U8GA 3QMSA 4LV4A 2H3BA 3LOTA 1DJQA 3PSVA 3EX1A 1GVSA 4O11A 4AXKA 5KZMA 3IV3A 4POCA 3P7YA 5HWNA 5I3GA 4O4VA 1DVJA 1LOSA 3DXIA 1KM1A 3W2KA 1QO5A 3GLCA 3UPBA 5BMWA 3LCWA 5HWJA 2OT0A 4C1LA 1CW2A 4IQLA 1KLZA 3LM7A 1UASA 2XN1A 3LGEA 4XUGA 4IMEA 3CLMA 4DPQA 5I3JA 1TPC1 2I9EA 3L5MA 4RV8A 4LVBA 3R13A 2QDGA 2ZTKA 1TO3A 1VPXA 2EF9A 5LGXA 1MEIA 4JX5A 3W72A 1HL2A 2YW4A 3LTYA 3RLUA 4NQ1A 5K7JA 3CIWA 4UTMA 3QJAA 3W1QA 3M0ZA 2ZZ7A 1H63A 1EUNA 1GVFA 5AC7A 1GVQA 3E0IA 1UBSA 5TBOA 4NX5A 4N9DA 4UUIA 1GG0A 1SPQA 4K7VA 2CLOA 2A7RA 2NZLA 2B7NA 4MUZA 1O5KA 4OBTA 3DFOA 3M5ZA 3RMJA 3S0CA 1W54A 4PODA 1E51A 5KSWA 2GJNA 4JEQA 4LW7A 4MZ1A 3HB9A 3NGJA 1A5BA 2JKEA 3T55A 3G1XA 3SZ8A 3DFQA 1S3HA 5IM51 1OFQA 3QMTA 2X1RA 2CWNA 1YYAA 3TUUA 4JGDA 3NG3A 3GX9A 4UFJA 3O16A 1FCVA 3KOFA 2V81A 3PC0A 4K38A 2GOUA 3F1QA 2Z2UA 2BXVA 5MHBA 4K8HA 1GQNA 2QCCA 4Y8FA 1F7BA 4BI5A 2NUXA 1OX4A 1LBFA 5DLCA 1WX0A 3DFTA 5EKYA 5H2ZA 4QITA 3TA6A 1GJPA 1NVMA 3W7GA 2NXIA 3DH7A 1MSSA 1NF7A 4P2VA 4DBEA 3VFLA 1F05A 1ML1A 5EMUA 3WK0A 4BWLC 1KM5A 3MWAA 4EVZA 2VEMA 2A1YA 4WX2A 1OFBA 3LTSA 4AF0B 3WK3A 3DENA 4DO5A 5D32A 2C1HA 3NM1A 2CLMA 2Q8LA 3S5YA 1QWGA 3VCRA 1ALDA 4M19A 3STCA 2G5WA 2WPBA 4HSNA 3NA8A 4MVAA 5HMSA 3NL5A 2OMAA 3FYOA 2NX3A 5C6MA 3P74A 1OYBA 5FEPA 5T26A 4WJEA 3JR2A 2ISVA 3IIZA 3SJ3A 1KTNA 1EA0A 1J2WA 4TR9A 3W7CA 3NYZA 3WJYA 1LM1A 4O1DA 5CPNA 2J27A 1SO6A 1R2SA 3BW3A 2NUWA 4NNAA 3VE7A 4LNYA 2QCDA 4MY1A 5HR7A 3DI0A 3A24A 2A4AA 3HG3A 3UWUA 2PRLA 1C8VA 1T8XA 1H51A 1QNVA 2JKPA 1H7PA 4MZ8A 4LTSA 1JUBA 3TCEA 1LOQA 2R8WA 5F1VA 2CZ5A 4XBSA 3L66A 2DZWA 4TO8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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