1LF1 | Genus

Total Genus 109

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	109
sequence length	298
structure length	296
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGITVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKETVEAAIDLGIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWDNQIKPYAEEVIPVIRDNDPNNIVIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	A novel combination of two classic catalytic schemes. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Cel5
molecule tags	Hydrolase
source organism	Bacillus subtilis
total genus	109
structure length	296
sequence length	298
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2002-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1lf1A00

1QI0A 4U5IA 3NSNA 4TTUA 3BCFA 3BCDA 3ZMRA 1C7SA 3BMWA 5GNZA 4AIEA 1CXEA 2XWDA 5IHSA 1E6QM 1ISWA 3WDIA 2F8QA 3ARSA 2J62A 3MUZ1 2D2OA 3TOPA 2ZX9A 2ESCA 1HKKA 1CGYA 1FFRA 1PEZA 1JDAA 2D23A 2XSBA 3BSGA 1UWTA 5E9AA 3WDHA 3EDEA 4C7FA 2VRJA 4M82A 4OKDA 3TONA 3VGGA 1FA2A 5A2AA 4UQDA 2B31A 4OZOA 5C71A 1H11A 2VCCA 4DWSC 4MADA 2ZX8A 4MB3A 3II1A 1HKIA 2ZXDA 4JL2A 1XH1A 3FHAA 1UUQA 1V02A 3K4DA 5A1AA 1NP2A 1UD8A 1U33A 5HNNA 3WMBA 3PZNA 2JALA 2OWXA 4JFWA 5F7UA 2PC8A 4GO9A 1LLOA 4N0RA 4P8VA 3ARPA 1D7FA 2DSKA 1J0HA 2A3CA 4U2ZA 1E55A 1E6XM 3BAJA 2J7FA 2EPNA 4HU0A 2D1ZA 1E6SM 3N17A 2WVSA 5E6YA 4NF7A 5HPCA 4E2OA 2X09A 1HNYA 3PZ9A 1H1NA 4S3KA 3TTSA 1GORA 2XM2A 4PTXA 2WM0A 4CCEA 2G4FA 5E09A 4D6JA 1BYAA 4GI6A 1IT0A 3CHDA 2XFRA 1GJWA 3MMWA 3AIEA 1TVNA 1ISXA 4NZCA 2DH3A 3ZJ6A 5DT7A 1VBRA 1OBAA 2ZICA 4M1RA 4UFHA 3AYSA 2CEQA 1OD8A 5AC4A 4GZIA 3BXWA 3WDJA 3SUVA 2CKSA 2VVSA 2XIIA 3W4RA 1IV8A 1V0NA 2PBOA 3AROA 4XZWA 3MANA 3VGEA 1BFNA 1US3A 8A3HA 1WZLA 5BROA 3VD4A 1VFOA 3OG2A 3A47A 3CZEA 3MV11 4ACYA 1EDGA 2J78A 3KZSA 4HZ8A 2YIHA 4KRTA 1E9LA 1V3IA 3WH7A 4EAMA 1H09A 2BY1A 5AY7A 1Q4NX 3CHEA 3MU7A 3CZ8A 4FLSA 5LA1A 3WSUA 4GKLA 4B3KA 3KWXA 4GINA 2J47A 1ZBWA 4AZ5A 5KEZA 1UHVA 3SCPA 4C7GA 3MUAA 3I3EA 4JKMA 2DGAA 1V6WA 3AHYA 4HOXA 3PZIA 3GZAA 3RO8A 1B3YA 2RGLA 2O9RA 2IXVA 2OYMA 2V3DA 5ABHA 3BAYA 2QLYA 3PZMA 2CBVA 4J3UA 5IHRA 1JZ3A 2WMFA 1ZL1A 3WNPA 1OCQA 2VT0A 1V3HA 2CBJA 3M7SA 2ZUTA 3FXYA 1NOWA 2JIWA 1WE5A 3LPPA 1UD6A 3ALFA 1LWHA 1EHNA 2W63A 2WC4A 4HMCA 5AYBA 1FH9A 5BWFA 1NOUA 3A6OA 4DUXA 3M07A 2CBUA 4H2CA 3UG3A 4AD2A 3B9EA 3VNYA 2VQUA 1MVYA 2GJRA 4UQEA 1BGAA 4PN2A 1X6NA 1LL6A 1DP0A 2EPKX 4D6EA 2PF0A 2E8YA 5I6SA 2YBTA 3A4WA 4D1IA 5A8NA 1W9XA 2VVNA 3VINA 5A95A 5HBFA 3WEMA 2XSAA 2ZUWA 1GOWA 4W85A 1HKMA 4X0VA 3BLPX 3N12A 2XTKA 4D6GA 3VGFA 1ZBVA 4AZ7A 3VDBA 1QVBA 2JIEA 2XIBA 1GQLA 1WP6A 3AS2A 3AIBA 2QV4A 3AIQA 1CXLA 1QW9A 1PZ3A 1E5NA 2EQDA 4JHZA 2JEQA 2YL5A 4MJ4A 3WD0A 4MNMA 5HXMA 1W9VA 1UOKA 5JUVA 4PMNA 4W7WA 1LL4A 1WDPA 2FGZA 3N9KA 1PAMA 2WXDM 5JBDA 3AIVA 2GJPA 3UERA 4TOQA 4WSKA 5DO8A 1B2YA 3DYOA 2AOSA 2BVTA 4X9YA 4UZSA 4K68A 3ZR6A 4CVUA 4D71A 4CU8A 1ZS2A 4MDPA 5BRQA 3ZT6A 3GNPA 1E6PA 2XUCA 3AHXA 5DFAA 2ZWYA 1KXVA 2QPSA 3W82A 2VX7A 1NH6A 4IPNB 1W9DM 3EBVA 5I79A 1W9PA 4YHEA 1D2KA 6A3HA 3IJ8A 1EIBA 2WVVB 2YA2A 4PCSA 3ZM8A 1OIFA 2OSWA 4NRRA 3OA5A 5A6JA 1Q6EA 1E1EA 3ARWA 4AZHA 2BY0A 4PRWA 1R7OA 4ML4A 4W93A 4FMVA 3GBEA 3UG4A 1F4AA 2RGMA 1XCWA 5CQ1A 4ATWA 1KQZA 1RH9A 4WIWA 1KWKA 3F4VA 1XRVA 1LF1A 3NSXA 3EDKA 3GXFA 2AMGA 2CPUA 4HMEA 3CTTA 2XVLA 4PUEA 2V3FA 4CVWA 4D6HA 1V3MA 3TTQA 3S6TA 2DIJA 2BHZA 2WVTA 3VD5A 1CXHA 3MMUA 1MQQA 3F5LA 3T0BA 3A4AA 1ZB5A 3FNDA 3QGVA 3RILA 4AY1A 1FH7A 3W26A 3WD4A 2DPEA 5C70A 5DEZA 1ZJBA 3ARVA 5LA2A 1E4NA 3EYPA 3VILA 1GVIA 4HOWA 1GNXA 4GIAA 1CGUA 1ISZA 1CWYA 1V0MA 3AXIA 4WK9A 3O6AA 1C3FA 4WSJA 4WF7A 3F5KA 1BHGA 3MUIA 3AHZA 5ABEA 2OWCA 1QNPA 4AYSA 3SIMA 4C7DA 5HOSA 3VIOA 4GZJA 1EQCA 2PWEA 1GQKA 3UR8A 3GDBA 4XUYA 4W88A 4D6DA 1J01A 3CHCA 3LPGA 3WH5A 1OGSA 4CKQA 3CGTA 4W8BA 3FHQA 5EMYA 1JNEA 1XYZA 2ZXBA 1VB9A 4M24A 3WQWA 5C8BB 4U3AA 3GH7A 5CGTA 4PTVA 4TVUA 4U3CA 4QAWA 7TAAA 4HA4A 1R85A 4H8VA 4UOQA 2WLZA 1BLIA 3W6MA 3MSGA 1C90A 1X6LA 1H2JA 4JCMA 4B9YA 5CZKA 2DT0A 2VNCA 2VJXA 1PIGA 1DWGM 3DHUA 1VEMA 3LPFA 2J7DA 2EPLX 1ZJAA 4MB4A 1KXHA 1U30A 1WDRA 3KL0A 3AIUA 4V2XA 3WEOA 4LGXA 1QHPA 4GPNA 3DHPA 4QCFA 1C8YA 1VEOA 3VDAA 1LJYA 3L4UA 2WKLA 3PZTA 4DWSA 1VFFA 2CBIA 2J25A 2QMKA 1E71M 3PZUA 2D22A 2J7EA 1AQHA 1VJZA 2J7BA 3W24A 3GH5A 1GZJA 4IM4A 4Y7EA 4CN4A 1XSKA 2J75A 4PSPA 4GQRA 1JI2A 3FAXA 3UG5A 4J3VA 2Z1SA 3TP4A 3MSDA 5BRPA 1PZ2A 4FK9A 2VX5A 1UKSA 2W4XA 2W92A 3OZPA 4LQ1A 3W27A 2YJQA 3CUHA 2YOCA 2Q8XA 3VNZA 2VUYA 1E0WA 2FHFA 3OLDA 1G01A 4A3HA 3SUSA 3SCQA 1CIUA 3I3BA 1KXQA 1ZU8A 1W2PA 2J8FA 3OIHA 3VVGA 5CPTA 2PWDA 2X0YA 1EA9C 1E43A 3BH4A 4FF5A 2D3LA 5A6LA 2YDQA 5A6BD 1KGXA 1NWTA 1CZ1A 4M29A 2BY3A 1KFWA 1E6NA 1V6VA 3SCRA 4PBGA 1UR2A 5D9MA 4ZXOA 3WF0A 1MW3A 3SUUA 1UWUA 1RPKA 4A4AA 2ZUSA 4MB1A 3CHFA 4UQAA 1XV8A 1Y7VA 4OOUA 2X2YA 1HJQA 4AZBA 1C7TA 2DT2A 2G3MA 4D6CA 3VMNA 2J79A 3HMCA 5I23A 4AEEA 5M03A 1QNQA 1OT1A 1UR1A 3S2CA 4UFMA 2GVYA 4HZ6A 4FLOA 3VM7A 2XFFA 5I77A 3ZJ8A 3RJXA 3W0KA 3GYCA 1OM0A 2VOTA 1JD7A 1TZ7A 3CH9A 3JUGA 5CJ5A 1HF6A 4MNJA 4AD5A 3PBGA 4TTGA 2ZX5A 5IDIA 1KGWA 1M03A 3VMOA 3N1AA 3CIVA 3RCNA 3AOFA 1M04A 1C92A 2WWDA 3ZR5A 3LMYA 3W37A 2VRQA 3MUY1 5FD0A 3WD2A 4D6IA 1Q6CA 4CCCA 3CUFA 3SUWA 4U5KA 1V6UA 4AD3A 3WELA 2WB5A 3ARTA 2Y8VA 3BGAA 2PWFA 1IZJA 1CLXA 2CESA 2MANA 1EO7A 1C8QA 3U7VA 3WIJA 1WPCA 4MNKA 5KZ6A 1V08A 1CYGA 1EH9A 3LPOA 1JYVA 4QLJA 3FW6A 4UFKA 1MFUA 3L2LA 3ZT5A 1KR0A 2VX4A 4CN1A 7A3HA 2BNJA 1UZ1A 1WKYA 2Z1KA 1B31A 3IK2A 3AZTA 1W3JA 2OYLA 5GNYA 5CXPA 1WCGA 2WBKA 3AISA 2VZUA 1E4MM 4YN5A 2BFGA 3VOCA 5D8ZA 2WMHA 3L4XA 3VUPA 5BXSA 1I75A 4PTMA 3ARQA 1GHRA 3AMKA 3IJ9A 4PMDA 4P7RA 4GQQA 1J9YA 1AMYA 1UD4A 2AAAA 2BHYA 3AIWA 3IANA 1TA3A 4BCEA 2A3HA 4UQBA 1EO5A 3RDKA 4B16A 5LYRA 1EXPA 4P7OA 2XJ7A 3OLIA 5CG0A 3WL0A 4W5UA 4CU6A 3DYPA 3VTRA 1HT6A 3NDYA 2OSXA 1HVQA 4J3WA 2OYKA 1MW1A 1UH2A 1HX0A 3BAIA 1WDSA 5JBEA 1ECEA 5ECUA 1H0GA 1BYCA 3TA9A 3F5JA 4QLKA 1Q6FA 2J4GA 3VGBA 2C7FA 1R7AA 3VIMA 3T0AA 1VIWA 2BS9A 3B9AA 2A3AA 4L4PA 5D8WA 4XX6A 1FOBA 3WUBA 3NUKA 1CTNA 4J28A 5FCZA 2A3BA 3AMGA 2GJXA 1CXIA 1NM9A 3SCSA 1JYXA 1GW1A 1OWQA 3L4VA 1FHLA 3PZVA 1UR8A 4TVDA 3QOKA 3GXDA 4F9JA 2VTFA 1OINA 1R86A 1UR0A 3WDRA 3CO4A 3N11A 3N15A 3BAXA 3UETA 1UD2A 2WMIB 2WANA 1E3XA 1WNOA 1CEOA 3WQ4A 1PX3A 3CLWA 4J3XA 3AZSA 4P7NA 1KCKA 1UG6A 1XD0A 4P8XA 1ISYA 1QHOA 4B9ZA 3IAPA 5D4YA 3GTNA 3UEQA 5D9NA 4UOJA 2NT1A 5E0FA 2VO5A 4CN6A 1U2YA 4DWSB 4KWUA 4W89A 1L8NA 1UKTA 1JFXA 1NWRA 2F2HA 3CZJA 1GOMA 3K1DA 1JDCA 2IUZA 5E0CA 2DSUA 1JD9A 2YBUA 3EDJA 1B30A 1P6WA 4WJXA 4ZFMA 2DSZA 3GH4A 3EMCA 3NJ3A 3WF4A 1WB0A 1B0IA 3RM4A 5I3DA 2BXZA 2J74A 1UKPA 3ZQ9A 4JAWA 1FH8A 2ZUMA 1K9TA 4LYQA 4Z2HA 5FKYA 5ABFA 4BQ2A 4L4OA 4X0NA 2WHMA 4UFJA 2ZWZA 5I78A 4W86A 2WZIA 4CUCA 4AW7A 2EBNA 2JEPA 4MAZA 1QW8A 3AS3A 1QI3A 3MO4A 1KBBA 1B3XA 4AISA 3D5HA 3U57A 2WZEA 3EDFA 3GNRA 3FN9A 1MYRA 2DDXA 2CYGA 2WC7A 1DWJM 1TMQA 1JGIA 2XGIA 2WHJA 3ARXA 3WF1A 1UWRA 4FLRA 1H4PA 1BGGA 1KWGA 3WL1A 1CGWA 1VBUA 4KRUA 1G1YA 3ARRA 1JXKA 4YPJA 5IFPA 1DEDA 1W9BM 3ARZA 1E6ZA 1JF6A 1DWIM 3WNNA 1QI2A 1J11A 3KEHA 1DHKA 4W7UA 1XD1A 4AD4A 3QHOA 3WNKA 2VQTA 3AS0A 2Y24A 1OIMA 4U31A 1K6AA 1AQ0A 4UZUA 3IJ7A 2NT0A 4PSRA 3VIKA 2QF8A 1G9HA 4UTFA 4HPHA 1SYTA 1V03A 1J0KA 1WAWA 2E0PA 1JAKA 4OUEA 4D6FA 1B1YA 3L4ZA 3CMGA 5CPQA 4W8LA 1O6IA 4MJ2A 4E8DA 1PBGA 1UQZA 2OSYA 3ZSTA 4UQ9A 2WMJA 4DUWA 3N04A 4N42A 1UQYA 3K46A 3CUJA 4BQ3A 3N18A 3RMEA 4CD8A 4AIUA 1F4HA 1VAHA 2E8ZA 1W32A 1JFHA 1LL7A 1WZAA 4U2YA 2WYSA 2O92A 3WUGA 2VC9A 5CSYA 2YL9A 2JF7A 3W28A 1XH2A 1B9ZA 3VDHA 3VGDA 3MS8A 1OGBA 5D9PA 4R27A 3THCA 3DECA 4M56A 4J27A 3AQUA 1DWAM 3GXIA 5AC5A 3BMVA 1K9EA 4W87A 1SR0A 1HL9A 1FP8A 1GUVA 1TUXA 3HJEA 1V6YA 2FHCA 5A8PA 3AFBA 1W1PA 4LXFA 1KB3A 4IUGA 3WQ6A 2XPKA 3RIKA 4Z2JA 3QR3A 4EK7A 5CSUA 2ZUNA 4AD1A 4JCLA 4JFVA 1VFUA 2WK2A 4DM1A 5A94A 1K9DA 1TA3B 1E1FA 2Y4SA 2VCAA 2DT3A 4NI3A 2EPOA 3ZJ7A 1EOKA 1BVNP 1IZKA 2UY5A 3FAWA 4PEEA 1J0YA 1QNRA 2VX6A 2G3NA 2QHAA 2WSPA 3CBWA 1H0IA 1OT2A 2E9MA 1CGXA 4A3YA 1JDDA 3SCWA 1BVZA 2ZIDA 3HU7A 1VFMA 4OOZA 3RPMA 1MXGA 1ISVA 4LX4A 2PI6A 4UFIA 4PMOA 4LPCA 1N82A 4MNLA 5JIPA 2W91A 2PB1A 1K9FA 1UKOA 1CDGA 2WHLA 2WCAA 2GJXB 1EDTA 1NOFA 3L4TA 4AMCA 5BCAA 2YA1A 4YHGA 1E73M 1TVPA 2ZX7A 1HJUA 1CPUA 5M5DA 4CGTA 4TUFA 2WC3A 2EJ1A 5D9OA 1WDQA 1DTUA 1FP9A 2E40A 3CUGA 5GNXA 2D0GA 4M81A 4HU8A 3W25A 4E4PA 3AJ7A 1E4LA 1HIZA 1KBKA 3HN3A 1GONA 2QMJA 1JZ4A 7CGTA 2XVNA 1QBAA 3TTYA 4F79A 1JYNA 1GOQA 2EXOA 1BAGA 4ZENA 5A69A 3WF2A 2JF6A 4UOZA 4W5ZA 3ZOAA 3SUTA 3WN6A 1A47A 3NYDA 2J7HA 1LG1A 3T2QA 3WMCA 4Z2GA 4OBRA 3ALGA 1BF2A 1JI1A 4ZE5A 1JZ5A 3K8KA 1VRXA 3WUFA 1EDQA 1W1TA 4PMXA 2VR4A 2O9OA 1O7AA 8CGTA 1J12A 2YKKA 5M17A 5ABFB 1UZ4A 1NWUA 4PUDA 1JL8A 4AZCA 1M7XA 4P8UA 2VZSA 3THDA 1QBBA 1E40A 4WKAA 1E4IA 1V02E 2V5CA 1XH0A 1EGZA 2W67A 3O2LA 4J3TA 3OB8A 2XGBA 2YL8A 9CGTA 4AEFA 3MKKA 3L4YA 2BY2A 2D20A 3WUEA 2X1IA 5A6AA 3T0DA 3N13A 1BPLB 3M46A 2XHYA 2JFEX 2E9BA 1PJ9A 4U33A 1V0LA 1XCXA 1J0IA 3VGHA 3AYRA 3I3DA 1S46A 1D3CA 1R87A 3SEPA 4ATLA 1B3WA 1B3ZA 4CD6A 3AXHA 3J7HA 1J10A 1XSJA 3WNOA 3BAWA 1QOXA 3WNMA 3UESA 4UR9A 2WSKA 3KL3A 1BQCA 1BG4A 3EMQA 3CZLA 4W84A 5HDRA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1LF1A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations