1LOSA

Crystal structure of orotidine monophosphate decarboxylase mutant deltar203a complexed with 6-azaump
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
SRRVDVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGDPGETLRFADAIIVGASIYLADNPAAAAAGIIESI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of inhibitor complexes reveal an alternate binding mode in orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
molecule keywords orotidine monophosphate decarboxylase
total genus 80
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2002-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1losA00
3G1YA 1QR7A 3DAQA 1W3TA 1YDNA 4L4MA 2ABBA 2HTMA 5I3KA 3QEZA 4UTHA 3T40A 1IXQA 1G4TA 2V30A 5DN1A 3PF3A 4IMFA 2TMDA 3QYQA 4O19A 4IPIA 3NQGA 1BWKA 3W7MA 7TIMA 5KINA 1UBSA 1G4SA 4RXFA 2OZ0A 3GK0A 5D02A 4A3UA 2E6FA 3TSBA 4O1CA 1ME8A 2YYTA 3GAKA 5G1YA 1QPQA 3W1LA 3OHIA 3NL6A 1RV8A 3CWOX 1K03A 3JR2A 3KRUA 1GVRA 3MHGA 2PE4A 2EF9A 3TAKA 3RMJA 4XBKA 4RV8A 5AHNA 2ZRZA 1ZY9A 3PAJA 2A7RA 4LC8A 4HSNA 2BLEA 3W83A 3P5ZA 3O07A 1HTIA 5DXYA 3C2VA 3M16A 4NJIA 5I3HA 4LRSA 4AXKA 3L2IA 3LHWA 1XL9A 2V81A 3MWAA 3EX6A 1JUEA 1P0NA 1KM6A 5FEXA 3G0XA 3TW6A 3DENA 5LGZA 3EWYA 2PRMA 1GQNA 1XDLA 2E68A 4O53A 2ZFAA 3W7GA 2J27A 1HFBA 1K7EA 3VI2A 1JUKA 3MMTA 3L65A 4FX7A 4JN6A 4Z1CA 3BG5A 3S1UA 3O06A 1QCWA 2B7QA 3W2JA 4PFMA 4AVFA 1DL3A 4NJGA 4FNUA 3MBFA 4XWUA 1ME9A 4P2VA 2LLEA 3WK0A 5K4XA 5F4XA 3W7RA 3W1PA 3WJSA 2YGYA 4NUWA 3SR7A 1XKYA 4N6EA 4TO8A 3P8JA 4U28A 2GQ9A 2Y7FA 4Z08A 3E96A 3R5EA 3NR0A 1H7WA 3SIZA 2QKFA 4NX5A 2V82A 3E12A 3S1XA 1TYGA 3ABQA 3M5VA 1YPIA 1EIXA 3ANYA 1CI1A 3KRSA 1EX5A 3FFSA 1W31A 2A7PA 1SO5A 4AHQA 2V9DA 3W7CA 2CLHA 1L9WA 1SZEA 1IF2A 1FXQA 4AH7A 4CCEA 1TQJA 3G3DA 3HMJG 2JBMA 1QO2A 2CLKA 3G1FA 1PHQA 3N9SA 4IGHA 3SSJA 3M43A 3DFTA 4EF9A 1TJRA 4M7TA 1NF7A 3W1XA 1GJPA 5BOOA 3S8HA 3TIMA 4CNNA 1G7UA 2EKCA 4DBDA 1VC4A 5G1TA 4FXSA 1SZNA 1KW1A 1JCLA 2ZA3A 4JNMA 1EP3A 1YLVA 1OFRA 3W7LA 1R30A 1LCOA 2I1OA 3MUXA 4GNJA 2CLOA 2OJPA 5CPNA 1U83A 1X1ZA 2A85A 2WSQA 1SPQA 3CIWA 5CPLA 3TSMA 2VC6A 1OK6A 3ZR4A 3WJXA 3EWZA 3IGXA 4PEKA 5L6UA 2V5LA 4TX9A 3LHVA 1XXXA 2NZLA 3N2MA 1H51A 1KTBA 1QNVA 1WV2A 1XM3A 2GVLA 5DCBA 4FNRA 1LP6A 1IIHA 3NPXA 4M6VA 3NM1A 1VCGA 3L67A 4DELA 3NO5A 3CLMA 1G69A 4UTWA 4DO6A 2WJZA 1DV7A 3E9AA 3LHUA 3UWVA 1ADOA 3W7NA 1FQ0A 4AHPA 4E2BA 5D05A 3DHDA 3PWAA 5K4ZA 3L9CA 3TW7A 3LBMA 3F4WA 3TROA 3T44A 4UFHA 4IJBA 1MEWA 4FNTA 1X6UA 3RU6A 3PM6A 3PUOA 1D3HA 3FLUA 3EWBX 2VEKA 3DFNA 1GVOA 3GAYA 3OVRA 3THAA 3NQCA 2CWNA 4LWWA 5K2ZA 2H3DA 1FDZA 1LOLA 2TSYA 1FWTA 3GNDA 2XN2A 5FF0A 3MI3A 4YL2A 5BW6A 2DZXA 3DKJA 2DJLA 4LTSA 2QCNA 3W87A 5G4WA 1GZGA 1Q6RA 2X16A 5LNRA 3G1XA 4ZVJA 2Z6IA 2A6NA 3W75A 3LCIA 2NV1A 3S42A 5D2VA 2G95A 2DORA 2YX0A 1LOSA 5F2MA 1L6YA 4XTIA 2UV8G 4O15A 3W86A 3NL3A 1S3HA 3KVJA 4DO5A 2CLEA 4BK9A 5C5YA 3BLEA 3KXQA 3HGJA 1K8XA 4OV4A 2HMCA 1PS9A 2J24A 3BGJA 4MFDA 3W84A 1GPWA 2DZWA 4I7VA 1Q6QA 3W2MA 3TQVA 4JTLA 3NEVA 3GXTA 4M7SA 5TQLA 2YW3A 4ZQPA 5FF7A 4UNKA 2YSWA 3TH6A 3S6DA 1YPFA 5T26A 4BI7A 4ADUA 1O4UA 1ICSA 4GRSA 2ZZ2A 2DZTA 5LHFA 4Z1AA 3HG3A 3H54A 3QFEA 3W74A 4D2JA 3OG3A 2X1SA 2Y7GA 3GLCA 1VPXA 3GB6A 2E6YA 5GVJA 4PC8A 3NVTA 3GDTA 1Q6LA 3PSVA 1ONRA 3LI0A 1YADA 2D73A 2YDAA 4K6AA 2WOQA 4AAJA 1RVGA 2R91A 4K38A 4Z0SA 4MYAA 1SSDA 2HS6A 2Y7DA 4A29A 3IIXA 2A7NA 4I7UA 3UYCA 3LHYA 3WJYA 4LT9A 4JYEA 5AN7A 4MVAA 2B0MA 5AOUA 1JRCA 5DBUA 3WK2A 1I2RA 3NQVA 2E5CA 1Z41A 4IWWA 2J9ZA 3Q58A 3LRKA 4UMAA 3RLVA 3A21A 4J9JA 3UWQA 1WA3A 4LRTA 3W2NA 1FWRA 4XKYA 1GTEA 2JK2A 4R53A 1DJQA 4GUJA 3Q94A 5HWMA 1IGSA 2EHHA 3G8EA 2ATSA 5K3VA 2C0AA 2RDTA 3PBYA 5D04C 1A5AA 4WY0F 4CCCA 4IQLA 2FPYA 2V2DA 3G0SA 1LZOA 2WNNA 3GR8A 3R2GA 3GXPA 3GKAA 4Y9AA 4JTSA 5HMSA 1WQ5A 1LM1A 3B05A 3F03K 3QPYA 3STEA 4TR9A 5D2TA 3NZRA 2NUYA 3I68A 1XBZA 3TC7A 1FY6A 2Y61A 3BLFA 1N8FA 1PL9A 1BEUA 3BPWA 4QQ3A 3W7QA 1FX6A 3MO7A 4K39A 1SW0A 1HG3A 1OJXA 5G2WA 3P74A 3LLFA 5D32A 3NQ6A 1H7PA 3LDVA 4K7VA 5D2XA 4MY8A 1KM1A 1KTCA 4JTJA 3EXRA 1K7XA 4RJEA 1M6JA 3F4NA 3KHJA 3HQ1A 1JR1A 4OWGA 1KTNA 3TX9A 4FEZA 3PG8A 3IRDA 3L21A 8TIMA 2IQTA 3BARA 1OF8A 3W7HA 4LS2A 3G8RA 4K8HA 4BI5A 4UFLA 2PCQA 2YFNA 3B4UA 4OU1A 3SY5A 3RF9A 4S2BA 3SGUA 4GJ1A 1VLIA 2QAFA 4IUOA 4A2SA 3LX9A 3PB2A 4P61A 4MFEA 4ZQMA 1A53A 4IMDA 3MP5A 4UIOA 4AWUA 5HQEA 4LNYA 3G3MA 3MI6A 2YCEA 2CU0A 2O7SA 3BV4A 4QIUA 2GJLA 2JGYA 5HNRA 1RQHA 3GKFA 5HR7A 4O12A 5KZEA 2VKZG 4WY0B 4O8RA 3GYEA 3SI9A 5HINA 3FKRA 1AW2A 2OT1A 1G7VA 1H61A 3LB0A 3IIVA 2Y63A 3W9ZA 4BWLA 3DFQA 2QUTA 4MY9A 3SECA 5CG7A 1EPXA 4LS0A 3MI2A 4GFSA 4LUJA 2G5WA 3WK1A 2ZZ3A 3NPWA 4JDYA 1AMKA 5C54A 4ADSA 3T7VA 4XUGA 5DCEA 3EB2A 5BRBA 3V75A 2ZRUA 4WUIA 4AMAA 4OHQA 2HSAA 3DBPA 4O54A 4H3DA 5LKYA 3HGRA 4O4WA 1H7NA 2BXVA 3ZWTA 4IMGA 5AC6A 1LROA 3MP4A 4AF0A 2C16A 2AGKA 2AQWA 1G4EA 4NNCA 5U7SA 4QISA 2JGQA 1S5TA 5G4EA 3VE7A 1F76A 5C6MA 4UNLA 3DFPA 1TRDA 5AHLA 1D9EA 1QOQA 2DZPA 3STCA 3STGA 1VHCA 3NL5A 3W23A 4FNQA 5HWNA 4JY8A 3M1ZA 1GOXA 3S0CA 2WV8A 3EX2A 2PRHA 2ZBTA 5HR6A 1JJKA 4KFPA 1O5XA 3W2KA 3W1QA 3N2XA 1C29A 1VYRA 4X9SA 4Z1DA 4LVBA 3DHFA 2KZHA 4IMCA 2PC4A 3SGZA 1LBMA 2WSRA 3L0KA 5K9CA 1UASA 3TXZA 3GDRA 3G1VA 2RHGA 4NJJA 3FA5A 3GX9A 4JIPA 3KVLA 3I6RA 4XZ9A 3SZ8A 6ALDA 3HGSA 4JTIA 4HPXA 4EIVA 3P61A 2CZEA 1KA9F 1ML1A 1IXNA 2JKAA 3KAOA 5LZLA 3IEBA 3LCWA 1N7KA 4MJMA 3O6DA 4Q32A 4XQ6A 4B5NA 3P81A 1OX5A 5D30A 1TPFA 1OYAA 2QCCA 3L68A 3C3NA 3TFCA 5H91A 4YCPA 1TPH1 2NXIA 4TMCA 4UTIA 1P1XA 2O7QA 3CM4A 3P80A 2B4GA 3UWYA 2A4AA 1DQWA 4BFAA 4FX6M 2VOMA 3TFXA 1KLYA 2E6AA 2J88A 2QUUA 4JX5A 3LERA 2JKEA 2JKPA 1VYPX 3PULA 3N34A 3G1HA 2DZUA 1E51A 2H8XA 1OFBA 1MO0A 1FCVA 4K8EA 1SZFA 1QOPA 4CCDA 3M44A 4AWTA 4RZ5A 4FXRA 4AB4A 3W1UA 4HPJA 1RR2A 2GVJA 4HSOA 1SO3A 1ZAJA 2WNQA 4LVFA 1F6KA 1THFD 1JRBA 3H53A 1TJPA 1O94A 4YMZA 2NUWA 3LCLA 4UFIA 3TE9A 1PE1A 3S5OA 1KV8A 1TTQA 3ELFA 2ISSA 2Y62A 1KV5A 1M5WA 1OK4A 1WXJA 3CTLA 1YXYA 3EKZA 1I2PA 4CQAA 3P8IA 3CEPA 4Y90A 2C14A 3QW4B 3W2LA 1LLWA 4LY8A 2GPTA 4M6QA 4U4MA 3DI1A 3EXSA 3O05A 4O57A 5AHFA 1YTDA 2BWGA 3UXAA 5HUOA 4HNTA 3NQDA 4G1KA 2RFGA 2XFWA 1SFLA 4Y96A 4DF0A 1NSJA 4M5PA 3W70A 2V2HA 1FCBA 1YXCA 1PHWA 4JTGA 3EX3A 3LM7A 2XN0A 1H50A 2NXHA 4N9CA 1OFDA 5AHMA 1PIIA 1OHLA 2CW6A 4JIQA 4KKXA 1XCFA 3RFAA 3C2EA 4L4LA 4ONVA 3D0CA 2QCDA 1R2SA 1F5ZA 1D3GA 4RZ6A 4O1DA 5MHBA 2H8ZA 5CSSA 4FNPA 2GVGA 4UTKA 3S9YA 3W2UA 1RZMA 2YZRA 5FEZA 3ABOA 1M7OA 2PURA 4JTFA 3UD6A 3M47A 2I14A 1GVQA 2VFHA 1S5VA 4Y6GA 2BZNA 1AL8A 4HNUA 3E02A 1SU5A 4MOZA 1K3UA 3LHTA 5AHEA 1GYNA 1B4KA 3L5AA 5F1UA 3S5YA 1KLZA 1VQTA 2A0NA 5DCDA 4DPPA 3B0VC 1OG0A 5EBUA 4S2CA 3PR2A 4MIMA 3NNTA 1XC4A 3W7PA 3MYOA 3NDOA 3P60A 4KWVA 4X2RA 2W0UA 1AW5A 1EA0A 1LRTA 4DQWA 1KFJA 2Z6JA 4FIQA 2FQIA 1DJNA 2F84A 2CLIA 5KITA 1ALDA 4OT7A 3A23A 2DZSA 3OEXA 4JTKA 2EAWA 2FPVA 1K02A 2ZZ4A 4WOZA 3OBKA 3SJ3A 1VCVA 4LV9A 5DY3A 2VEPA 3B03A 5LGXA 5E93A 2ABAA 2GUUA 5I3IA 1MEHA 5LNUA 6TIMA 5D38A 4OBTA 4N9DA 3I7SA 4GUHA 1WDWA 1OX4A 1K8YA 2W79A 5CZTA 3R8RA 3G18A 3E0IA 3QW3A 1L2UA 1BTMA 3DZ1A 1SO4A 3HG5A 2J9XA 1AG1O 1JUBA 3OVPA 1DVJA 1LDCA 3STFA 3W1MA 4Y8FA 4JS3A 4UTJA 3UQNA 1P4CA 4FIRA 2Z0IA 2H3BA 2E77A 5F2LA 2R94A 1NFBA 4O4VA 1EWDA 1VLWA 3NQFA 1H1YA 3BG9A 3B8DA 3PS7A 4GXMA 3L0NA 3EWXA 1QFEA 4UXDA 2E1DA 5KZMA 1LORA 4DO4A 1W56A 3GVGA 3W3OA 5AYYA 4OGZA 1SQ7A 3A24A 4Q33A 3T55A 1F7BA 1RD5A 3NL2A 3U2OA 2C3ZA 2G97A 2YFOA 1Q3NA 2QF7A 3C56A 4IMEA 1KBIA 3W6YA 3W07A 3V1PA 4GC4A 2VEIA 1GWJA 4O18A 1O60A 2RKXA 1EB3A 5F4WA 4MYXA 3FOKA 2J9YA 2H90A 1SZGA 3LTSA 2YXGA 2VENA 4WZHA 1PVNA 1W3NA 3IIZA 1K7FA 4ICNA 2Z2UA 3TXVA 3M41A 4UMCA 1TSIA 3QZEA 2E5DA 3EX4A 3PC0A 3CU2A 4WOQA 3ABSA 4C1LA 3KX6A 3KFTA 1FDJA 1OYBA 1ZCOA 2V2CA 1DKWA 2Q8LA 1OYCA 3TAOA 1VCFA 2Q3RA 2BSLA 4JX4A 3W1RA 4GE8A 4QAIA 4R7JA 3T78A 1H62A 5I3JA 4N4QA 1MSSA 4TU1A 1QO5A 2C19A 3NZ1A 4MUZA 1GYLA 5IBXC 2QCLA 2ZZ5A 3MW7A 2ISVA 2VEMA 1LRNA 4UTTC 2OCZA 2ZRVA 4LVDA 1MZHA 3TR2A 2ZZ1A 1JCNA 3LTPA 3TC6A 4AHOA 2Z1BA 3QQ1A 3RK8A 1TCDA 3M9YA 5FF2A 1EP1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3G1Y A;  1QR7 A;  3S6O A;  4PCN A;  5BOF A;  4D6E A;  5I3K A;  4UTH A;  4TX8 A;  2WQD A;  3NZG A;  2V30 A;  5DN1 A;  3PF3 A;  4IMF A;  2TMD A;  3VIP A;  3NQG A;  3W7M A;  2BOG X;  4YHE A;  1G4S A;  4RXF A;  3EZ4 A;  4KEM A;  4H19 A;  1W91 A;  2O55 A;  2OR2 A;  4DUW A;  5CCZ A;  4C90 A;  3RO6 A;  3IUH A;  1KRA C;  2E9L A;  1F4H A;  3UPM A;  5FL0 A;  4G1N A;  2YA0 A;  2EF9 A;  3TAK A;  3B8V A;  1RCO B;  4XBK A;  5CSY A;  4HTY A;  5AHN A;  3PAJ A;  1E0W A;  3M46 A;  3W83 A;  2PWV A;  2GDV A;  3P5Z A;  4G9P A;  3O07 A;  1P6B A;  1MFU A;  4GI6 A;  1E1C B;  5DXY A;  3M16 A;  4NJI A;  5I3H A;  3QLL A;  4AXK A;  1L8P A;  3LHW A;  1PUD A;  4FZI A;  3MWA A;  3EDJ A;  1DTU A;  4IHC A;  3P14 A;  3EMZ A;  3DEN A;  3EMQ A;  1EXB A;  4KRT A;  2X8R A;  1XDL A;  3AU2 A;  1BVN P;  3A3H A;  3FXY A;  1TZ7 A;  4O53 A;  1K7E A;  1O5R A;  4D1I A;  2WMG A;  1JUK A;  4FX7 A;  4JN6 A;  5M17 A;  4Z1C A;  1NU5 A;  2D23 A;  3VXG A;  4IFK A;  1UWT A;  1UWI A;  3PTD A;  3LQG A;  3W2J A;  2GFT A;  4RV3 A;  3AMK A;  1SJC A; 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