1N82A

The high-resolution crystal structure of ixt6, a thermophilic, intracellular xylanase from g. stearothermophilus
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
NSSLPSLRDVFANDFRIGAAVNPVTIEMQKQLLIDHVNSITAENHMKFEHLQPEEGKFTFQEADRIVDFACSHRMAVRGHTLVWHNQTPDWVFQDGQGHFVSRDVLLERMKCHISTVVRRYKGKIYCWDVINEAVADEGDELLRPSKWRQIIGDDFMEQAFLYAYEADPDALLFYNDYNECFPEKREKIFALVKSLRDKGIPIHGIGMQAHWSLTRPSLDEIRAAIERYASLGVVLHITELDVSMFEFHDRRTDLAAPTSEMIERQAERYGQIFALFKEYRDVIQSVTFWGIADDHTWLDNFPVHGRKNWPLLFDEQHKPKPAFWRAVSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The high-resolution crystal structure of IXT6, a thermophilic, intracellular xylanase from G. stearothermophilus
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule keywords intra-cellular xylanase
total genus 135
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2002-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1n82A00
3BAIA 1LQ0A 4YN5A 3IJ9A 3OLEA 4HPHA 3SCRA 2EPLX 3L2LA 3OZOA 3AYRA 4YPJA 3NUKA 1W9VA 1C8XA 1W32A 1CLVA 3UESA 1CGXA 3ARPA 1B3VA 3ZT6A 4IPNB 3A6OA 4A4AA 1U2YA 4JL2A 2IXUA 4FLOA 3L4ZA 1UHVA 1QBBA 1C8YA 2E9LA 2OSYA 2C0HA 4MPKA 3EMCA 4JFSA 1WB0A 3WQ5A 2D0FA 3ARTA 1KXHA 3GNOA 4WF7A 2VVSA 3VUPA 3MUY1 4CD5A 5GNZA 3BGAA 1KGWA 3RMEA 4ZE5A 2W66A 5FL1A 2AMGA 1J0KA 2W61A 2W4XA 2J8FA 3WNPA 2JF7A 1UKPA 4P7LA 1JF6A 1HJQA 1N82A 1WZAA 2A3BA 5M5DA 2GUYA 3AIRA 3GH5A 2GJXB 3F5KA 4CVWA 1GZJA 2J74A 3RILA 1B3WA 1U30A 4GIAA 2CKSA 4PYSA 3NJ3A 4L4PA 5A6JA 3KZSA 3DYMA 4FLRA 1ODZA 3AIBA 4P7NA 4W86A 3VD9A 5JIPA 2V3EA 2XUCA 1JYXA 4QLLA 3AMCA 4GZEA 2V38A 4LGXA 2ZWYA 2QV4A 3WMSA 3CH9A 3DHUA 1UUQA 4UFIA 3B9EA 2QMKA 4OOUA 1W1TA 3VIPA 1DWGM 1SR0A 2WPGA 2BNJA 4B3KA 4HZ7A 3T0AA 1JZ8A 4J7RA 3WH9A 5A6LA 3A3HA 2F8QA 4D6HA 5GPRA 1W3JA 3AS2A 2CYGA 2W62A 4W7UA 1J11A 1GVYA 3UR8A 3WNKA 2DGAA 5E6YA 1Q6GA 4R5EA 2Y4SA 2G8ZA 3J7HA 4BQ3A 3K4DA 1NP2A 2J78A 1OM0A 2JF6A 1WDQA 1E55A 3A4WA 3U7VA 4CCCA 3T2OA 3WF0A 2ZX5A 4AXNA 4M81A 2E8ZA 4QCFA 2CESA 5CPSA 4AEEA 2WBGA 5LA0A 2VRKA 3CHFA 1VEMA 3VD4A 1EHNA 1DWJM 1K9DA 2CBJA 5BYWA 3AHVA 1EQPA 1BAGA 1F4HA 1UH2A 1H4PA 4Y7EA 4MNKA 4PTMA 2WHLA 2WMIA 3SCOA 5ABHA 3M07A 4IUGA 4CU7A 4PTWA 1E6XM 2WSKA 1TUXA 4KGJA 3U7BA 1PIGA 1OBAA 1GJUA 2DQXA 2FGZA 5AYBA 5BXTA 1F4AA 4V2XA 1MW2A 1W1VA 1J12A 1H5VA 2O9OA 1TA3B 1GCYA 3B8SA 1KXVA 3W82A 1KCLA 2DDXA 4BS0A 2YLAA 3I3DA 3A4AA 4E2OA 2VCAA 3VIOA 2WYSA 3PZQA 4OIFA 2WBKA 2X0YA 1J01A 2X05A 4HOWA 2WVSA 4UTFA 3CZ8A 5BXPA 4CVUA 1UD6A 1S46A 1JI1A 4DWSA 1ZBCA 3OGSA 3WD3A 4W93A 4AZGA 5E09A 2OYLA 1SMDA 3FAXA 2YOCA 4PTXA 2DSWA 3POCA 3T2QA 3L4XA 4CN1A 1OGBA 1M7XA 1XH2A 4J28A 4NSBA 5ABFA 2NT1A 5D4YA 3PZNA 1E6RA 2VO5A 2YL8A 1LL4A 1QI3A 3ARRA 1RH9A 2EEXA 3FN9A 4MB1A 4W8LA 3WQ4A 2QLYA 4JFWA 4D72A 4JHOA 2OSXA 3CZLA 4Z2HA 2EQDA 2CBIA 3AIQA 1VFOA 3WL1A 1HT6A 4WKFA 3NDZA 4UZUA 1JAKA 1MWOA 4M24A 2WZHA 2Y2WA 2HVMA 3QHOA 2VI0A 4PSRA 3LPOA 3WH7A 1C93A 3RCNA 1CGUA 2WSPA 3GBEA 1OINA 4BQ5A 4MB4A 3E1F1 3GZAA 2DH2A 1QHPA 2GVYA 3A4XA 4W8AA 1H1NA 2C7FA 1B3XA 1WZLA 2E0PA 2J7HA 1XSKA 4JCMA 3IJ8A 1UR9A 1BFNA 4X9YA 4B15A 4OBRA 4B9ZA 4HZ8A 5A94A 1HJSA 4JAWA 1WDSA 2WANA 5IHRA 1G9HA 2A3EA 2W63A 1CDGA 1XC6A 2GJRA 1LF1A 1JYWA 4UQAA 1JGIA 3CBWA 2QPSA 1ISZA 4TVDA 2PBGA 5BXRA 1V08A 4UOZA 3VILA 3DYOA 3CUHA 3WDQA 1PJ9A 5M17A 5FCZA 3VIKA 2A3AA 5GNYA 2DPEA 1I1WA 4C7FA 4J27A 3UERA 2VR5A 3O6AA 1CGWA 2FHCA 3QOMA 1J0ZA 2ZUNA 5FOOA 1ZBWA 3S6TA 4FK9A 3K46A 3N17A 7CGTA 1EHAA 4LPCA 2ZUVA 1XD1A 3K4AA 1D7FA 4GPNA 2GDVA 2ZOXA 4J3VA 3EDKA 2GJPA 3VKKA 2V3FA 3NSNA 3GNPA 1Q6CA 4DUWA 5E9AA 3UETA 1C92A 2D0GA 2GK1A 1JZ6A 2EBNA 3SCWA 3WNLA 2BY3A 1WZKA 2XFRA 5DF0A 2NSXA 4A3HA 1R7OA 3WENA 1X6NA 3L4WA 1AMYA 1Z32X 3OG2A 1NM9A 1ZS2A 2YDSA 2ZUWA 2Y24A 5IXEA 4RE4A 4H2CA 2VJXA 4U3CA 3HMCA 2A3CA 4JFTA 2X8RA 4F9DA 4ACZB 1OWQA 4UFMA 5D9NA 3WBAA 2VQTA 3WBEA 4GI9A 2XVPA 1GOKA 2BHUA 1EIBA 4RL3A 4WJXA 1MQRA 1W9DM 4CKQA 1MVYA 1JD7A 3VDCA 3L4UA 1OGGA 3WD2A 3VDBA 1TVNA 3ZSSA 5I2UA 1GHRA 3WELA 4HOXA 5I3DA 4PTVA 1V02A 3WKZA 2OWWA 2CERA 2YLLA 4QLKA 4E8CA 2WWCA 4GXPA 3MS8A 1E5JA 1UKSA 4MNJA 2WB5A 2VUYA 2WCAA 1K9TA 3SCTA 3MSDA 3QOKA 2D0HA 5I6SA 1E43A 2DIJA 1DEDA 1SYTA 3EBVA 4OZOA 3TOPA 4D6CA 3AHXA 2WLYA 3VU2A 3OLDA 1UA7A 3ARZA 1I1XA 4B9YA 4AMCA 1XCWA 3K8KA 3BAWA 2EXOA 3AHZA 2EO7A 4LYQA 1UWSA 2ZUSA 4LXFA 1JNDA 1QVBA 4R27A 5AYIA 2UY4A 4GO9A 3N12A 1QNQA 1J0HA 4UQBA 3VNZA 5DO8A 3CTTA 4W89A 2F61A 5A6SA 2VRQA 4PMZA 1B3ZA 2YKKA 2GJXA 3PHAA 5TD4A 3CMJA 1UYQA 2WHMA 1V3LA 2OLHA 2WMFA 5A69A 3WN6A 3GTNA 1AQMA 3MMWA 3EMZA 3NCOA 3WIJA 3NSXA 4DUXA 5FIPA 3L4TA 4M56A 3W38A 1HKKA 1JYVA 2J7EA 5A95A 3W27A 1PBGA 2CBVA 4BQ2A 1DWAM 3TTSA 4HPGA 2PB1A 3WNMA 3WH8A 2DT3A 4UQCA 1XSIA 2WZIA 2AAAA 4AZBA 3FHQA 1OT1A 4MJ2A 4F66A 2Y8KA 5CSUA 5IHSA 1GJWA 6CGTA 4CCEA 3N13A 3WF1A 4QCEA 1E6NA 5C71A 4W84A 1NWSA 3SUWA 3ZT5A 2WMJA 3PZ9A 3SEPA 4W85A 3PZIA 1ZBVA 4CU6A 5A6KA 5M03A 3DC0A 5F7UA 2B31A 4P8UA 4IISA 3WNOA 5E0FA 1OIFA 1KWGA 1D2KA 3BH4A 1V02E 2D23A 1CYGA 3EMQA 3LPPA 1W9PA 1KQYA 4D1IA 1C91A 1PZ2A 4UFKA 3HU7A 3BAYA 4JIEA 4LYPA 2WK2A 1M04A 3VX1A 4AZ6A 2BXYA 1XSJA 3OA5A 4AD1A 1XD0A 1BVNP 4E8DA 4J3WA 3IJ7A 4PBGA 3IANA 1C7SA 3F5LA 5I24A 1O6IA 1J18A 1VJZA 3ARXA 1D3CA 4UFLA 5BCAA 4AIUA 1EDTA 1FHLA 3N04A 4GI6A 3UG4A 3RJXA 3RJYA 3WDIA 1US3A 2WCGA 1QI0A 1VENA 3ARYA 2D2OA 4AD5A 1BYAA 3LPGA 1BG4A 2D22A 3LPFA 1CENA 1WP6A 3VO0A 3N15A 4KMQA 1W2VA 1TA3A 1H41A 1ZU8A 4GKLA 1Q6DA 3IAPA 1ZB5A 3ZO9A 3T0BA 2XWEA 1ITCA 1GORA 1JI2A 4HU0A 2ZX7A 4AYSA 3OGVA 4KH2A 4MDOA 2DSZA 2F2HA 2QHAA 1U33A 1QW9A 1M53A 3GBDA 3K1DA 3AIUA 4U31A 2GDUA 3VIFA 3NIYA 4UCFA 5CPTA 5BXSA 2YL9A 1JDCA 1LWHA 3EDJA 4D71A 1ISWA 4DWSC 1WE5A 2D24A 3VM5A 1WAWA 4PRWA 1B9ZA 5A2AA 1EO5A 4B3LA 1EDQA 1E1FA 4Q7NA 3AZSA 1G0CA 1XRVA 1KCKA 3SUVA 1ECEA 2WHKA 3WD1A 2XSBA 3ZJ7A 2V3DA 5I5RA 4L4OA 1W3HA 1UWUA 5A2BA 9CGTA 1XGZA 1JL8A 3WH5A 4XZWA 1EH9A 4P7RA 3OB8A 4AZCB 1GW1A 4AD3A 5BWFA 1FHDA 3GXFA 2IXVA 4ACYA 1V3HA 3B9AA 3FXYA 3ZIZA 1XH0A 1OCQA 3WEMA 1IZKA 3MSGA 2PBOA 4WSJA 4U2YA 4HA4A 1C8QA 2WVUA 3PN8A 4MJ4A 4CD6A 4UFJA 1CECA 1JFHA 2AOSA 3CUGA 2EPMX 5HNNA 2V5CA 1FFQA 4XX6A 4ATWA 1YQ2A 4HMCA 1W1YA 5LA1A 3OLIA 1O7AA 2JIEA 1HP5A 1VB9A 3OZPA 3ARQA 5DT5A 1EA9C 4U5KA 4CD7A 3AYSA 3VOCA 2A3HA 1UR8A 3AMLA 4PCSA 3VNYA 3ZR6A 1MXGA 4Z2KA 2J7GA 1KGUA 2XVLA 1UZ4A 1VEOA 1TMQA 4D6GA 4QAWA 3WDJA 3MMDA 5GQBA 1GQKA 5JBFA 4HOZA 2YJQA 3PZTA 1Y7VA 3AXXA 2CIPA 2XJ7A 3MV11 1UOKA 1LG1A 2XVGA 1ZJAA 3VGFA 1XYZA 1CIUA 1J10A 2OWXA 3GNRA 3VM7A 5GNXA 4HZ6A 1BYCA 1E15A 4JCLA 4EK7A 1CXHA 4UQEA 2WC3A 4U5IA 2WKLA 2XM2A 3VDAA 1QHZA 1Q4NX 4M80A 1OGSA 1UWQA 2EPKX 5CG0A 1GPFA 4PMNA 4J3SA 3ZQ9A 1ZBKA 1OT2A 3O9NA 3ARSA 4UZSA 1NWTA 1UD2A 3CGTA 1NARA 1PIFA 4YHGA 4MDPA 4FLQA 5DFAA 3MUIA 1EOKA 2E9MA 1OSEA 3KEHA 2BV9A 4C7GA 1UR1A 2NT0A 1WKYA 3BLPX 2VC9A 1BYBA 2J7FA 1IZJA 1V6UA 3VGEA 2JEQA 4H8VA 5HPCA 1HVQA 1QBAA 1UKQA 5A8QA 1VEPA 2YDQA 3W24A 1E72M 3KL5A 4J3XA 1Q6EA 3N9KA 4QDMA 3RM8A 3JUGA 2XPKA 3SCNA 4XV0A 1UKTA 2DT1A 3WF4A 1LWJA 1E0WA 2VX6A 4ZE4A 3BAKA 1V03A 1MQPA 1V6YA 4E4PA 3AZRA 3M46A 1E6QM 1DWHM 5E0CA 2FHBA 1KBKA 1ISYA 2W91A 4B16A 5C70A 4ACZA 3GDBA 1CXIA 2X2YA 1E0VA 1B2YA 3ZJ6A 2UY5A 2PI6A 3VTRA 4CN4A 5JUVA 4QFUA 2J47A 5ECUA 1KR1A 1MW1A 2WZEA 4ZXLA 1CEOA 4BA0A 4N42A 2WMHA 4MAZA 1GUVA 1UD8A 1E3ZA 1UR4A 4J3TA 2EPNA 3PZOA 4ZFMA 1WZMA 3AIWA 1E70M 1VRXA 3SUUA 5CGMA 1QPKA 3WDPP 1QNRA 1FFRA 3THCA 2G41A 4BQ4A 2QMJA 1QHOA 2E4TA 3PZUA 1B3YA 1SMAA 1W3KA 4DWSD 3CUIA 5M3WA 4PMUA 1UWTA 1H3GA 3GXMA 4LX4A 1R8LA 4GQQA 2BFGA 2XTKA 4H04A 1R7AA 8A3HA 1VFUA 2VX4A 1FH9A 4AZ5A 4D1JA 2E3ZA 5D8ZA 1BHGA 2D20A 4GI8A 3WMBA 2J75A 2ZXQA 3TTQA 3CUJA 4W87A 4EAMA 4TVCA 3PTMA 4HMEA 1HJWA 1E73M 3BSHA 3T09A 5A6BD 1CXFA 3VD3A 3ZOAA 4TUFA 1V6VA 1V0KA 1OIMA 1NWRA 3I3BA 1TVPA 2D3LA 1W3LA 1FOBA 3BCFA 2ZE0A 4BZYA 1A47A 2IUZA 2YA0A 1KXTA 3AMKA 4AISA 5CLTA 3AXIA 4WKHA 5EB8A 1KQZA 1JXJA 4CD4A 5HPOA 2WNWA 5CXPA 3AMDA 5ABFB 3WD0A 1GQIA 4UQ9A 4EANA 2ZXAA 5A2CA 4D6IA 1B0IA 1PEZA 3SUSA 1KFWA 3NYDA 3ARUA 5JIWA 1CGTA 3WL0A 4MAVA 3VGBA 4GZIA 1GHSA 3APGA 2MANA 4JKMA 4AZHA 5A3HA 3WMCA 3AOFA 1EXPA 2WMGA 2E40A 4KRUA 1HIZA 1K9EA 5A8NA 3QR3A 1TCMA 4TTUA 4KWUA 3VDHA 1VFFA 3QGVA 1UWIA 3CO4A 5CSYA 3WEOA 3G6MA 4M29A 3UEQA 4V28A 1OD8A 4ML4A 4HP5A 4M82A 1C7TA 5I23A 5ABEA 2GFTA 3TP4A 2XFYA 4JFVA 2XYLA 3I3EA 3L4VA 4CGTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3BAI A;  1LQ0 A;  4YN5 A;  3IJ9 A;  3OLE A;  4HPH A;  3SCR A;  2EPL X;  3L2L A;  3OZO A;  3AYR A;  4YPJ A;  3NUK A;  1W9V A;  1C8X A;  1W32 A;  1CLV A;  3UES A;  1CGX A;  3ARP A;  1B3V A;  3ZT6 A;  4IPN B;  3A6O A;  4A4A A;  1U2Y A;  4JL2 A;  2IXU A;  4FLO A;  3L4Z A;  1UHV A;  1QBB A;  1C8Y A;  2E9L A;  2OSY A;  2C0H A;  4MPK A;  3EMC A;  4JFS A;  1WB0 A;  3WQ5 A;  2D0F A;  3ART A;  1KXH A;  3GNO A;  4WF7 A;  2VVS A;  3VUP A;  3MUY 1;  4CD5 A;  5GNZ A;  3BGA A;  1KGW A;  3RME A;  4ZE5 A;  2W66 A;  5FL1 A;  2AMG A;  1J0K A;  2W61 A;  2W4X A;  2J8F A;  3WNP A;  2JF7 A;  1UKP A;  4P7L A;  1JF6 A;  1HJQ A;  1N82 A;  1WZA A;  2A3B A;  5M5D A;  2GUY A;  3AIR A;  3GH5 A;  2GJX B;  3F5K A;  4CVW A;  1GZJ A;  2J74 A;  3RIL A;  1B3W A;  1U30 A;  4GIA A;  2CKS A;  4PYS A;  3NJ3 A;  4L4P A;  5A6J A;  3KZS A;  3DYM A;  4FLR A;  1ODZ A;  3AIB A;  4P7N A;  4W86 A;  3VD9 A;  5JIP A;  2V3E A;  2XUC A;  1JYX A;  4QLL A;  3AMC A;  4GZE A;  2V38 A;  4LGX A;  2ZWY A;  2QV4 A;  3WMS A;  3CH9 A;  3DHU A;  1UUQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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