1O7AA

Human beta-hexosaminidase b
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
500
structure length
483
Chain Sequence
PALWPLPLSVKMTPNLLHLAPENFYISHSPNSTAGPSCTLLEEAFRRYHGYIFGTQVQQLLVSITLQSECDAFPNISSDESYTLLVKEPVAVLKANRVWGALRGLETFSQLVYQDSYGTFTINESTIIDSPRFSHRGILIDTSRHYLPVKIILKTLDAMAFNKFNVLHWHIVDDQSFPYQSITFPELSNKGSYSLSHVYTPNDVRMVIEYARLRGIRVLPEFDTPGHTLSWGKGQKDLLTPCYSKLDSFGPINPTLNTTYSFLTTFFKEISEVFPDQFIHLGGDEVEFKCWESNPKIQDFMRQKGFGTDFKKLESFYIQKVLDIIATINKGSIVWQEVFDDKAKLAPGTIVEVWKDSAYPEELSRVTASGFPVILSAPWYLDLISYGQDWRKYYKVEPLDFGGTQKQKQLFIGGEACLWGEYVDATNLTPRLWPRASAVGERLWSSKDVRDMDDAYDRLTRHRCRMVERGIAAQPLYAGYCNH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-HEXOSAMINIDASE BETA CHAIN
publication title The X-Ray Crystal Structure of Human Beta-Hexosaminidase B Provides New Insights Into Sandhoff Disease
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 182
structure length 483
sequence length 500
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2002-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1o7aA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 1o7aA01
3RMEA 2A3HA 1RD6A 1EDQA 1GOOA 2V3EA 4UQCA 1J0KA 1UWTA 1OB0A 2E9MA 4BCEA 4OIFA 3OG2A 4XZWA 5HPOA 3TTOA 3VU2A 5CSUA 1QW8A 3A4WA 1BF2A 3VGEA 2J4GA 1UKPA 4UQBA 2WMHA 1MYRA 3WUFA 4J3UA 4PEEA 1HN1A 3OZPA 5IFTA 1UR1A 2WWCA 3RJXA 2DEPA 4U5KA 3EDFA 1PBGA 3QR3A 3TTQA 1A47A 1XGZA 3CZKA 1W3HA 1KCKA 3OLIA 2J74A 2YBTA 3WNMA 2V38A 3L4VA 1H0IA 4N42A 1G1YA 4JCLA 3WQ4A 2VX6A 2YLLA 1QI4A 2DQXA 1HVQA 3LPPA 3VD9A 2VJXA 2O9RA 2GK1A 1TA3A 1PAMA 4WIWA 1IV8A 1GOQA 1GVIA 3PZUA 2ZX6A 1UD4A 1CNVA 1E4NA 1HP5A 5BRPA 3I3EA 3OLGA 4CU6A 4NI3A 4J28A 5DO8A 3VMPA 3WF0A 4MADA 1FP8A 3ZIZA 4GIAA 3WMBA 4LPCA 3ZR5A 3WQVA 3SCQA 2CEQA 4PTMA 3FHAA 2G4FA 1GQIA 4XV0A 2WLYA 3F5KA 3AIBA 4KGJA 5E6ZA 1KGXA 3CPUA 3VNZA 5JIPA 3UG5A 1YQ2A 3CMGA 3AMCA 5CQ1A 2VO5A 2WC7A 4HP5A 4H8UA 1V6YA 4ACZA 3WNNA 1DWJM 2BY0A 2IXVA 2J8GA 2CBVA 1NARA 4UNIA 3VMNA 2BHYA 4J3WA 2E8YA 1WO2A 2ZUWA 5LA0A 2DT1A 4CD5A 2F61A 3PZTA 3IK2A 4YHGA 1KQZA 1UR2A 1XSJA 2X0YA 4CN4A 4UZSA 4W84A 4AZ7A 1O7AA 2XTKA 3W4RA 2FGLA 3II1A 3SCOA 3WBAA 2QF8A 4QCFA 3FAWA 4W85A 2QMKA 4W5ZA 4QCEA 4OBRA 2YL9A 5CPQA 7A3HA 5A6BA 3LMYA 1I1XA 2EJ1A 2J75A 4R27A 3MANA 2VRJA 4AMCA 3UG4A 4S3KA 3WNOA 1ECEA 3WIJA 1ZBVA 4V2XA 5E70A 3T2PA 2BVDA 2Q8XA 3A4AA 3VIOA 3T08A 1NP2A 1V3IA 3WNLA 4AZHA 5BROA 4CCDA 4RE3A 1V3MA 2WZEA 5ABHA 4P8WA 3WF2A 1W32A 1QVBA 2Y2WA 1NWRA 4HOXA 4PMXA 1HKIA 2VCBA 3U7BA 1EHAA 3OGVA 2VX5A 3NJ3A 4DM2A 2CHOA 4X9YA 4C7DA 4F8XA 1W1PA 3EMZA 4UFHA 2OYKA 1GHRA 1Q6EA 4PMRA 1ISWA 2VMFA 1US3A 3CO4A 3NSNA 1QI3A 2WMIB 1KR0A 4PN2A 3L4ZA 4QLJA 3VDAA 3U7VA 4QDMA 3VO0A 1QI2A 2QLYA 3EDDA 1B1YA 5HOSA 1E5JA 5EB8A 3WD1A 1KGUA 4JKLA 1EDTA 3NSMA 1Q6CA 1CXFA 3QHOA 3EDEA 4IUGA 3UESA 4H04A 1N82A 1QHOA 4OKDA 3ZOAA 1HJWA 4D1JA 1BGAA 1AQMA 1EH9A 3ARPA 1E4MM 1J12A 5D9PA 2GJXA 2WC4A 2CNCA 2DSWA 3SCUA 1ZB5A 2CKRA 3MV01 3OLDA 1OWQA 3AXHA 1UD8A 1OIFA 4TX6A 2G41A 3VIJA 4QLLA 4B16A 2VZSA 4D6EA 4KGLA 4PSRA 3BXWA 2XVKA 4AISA 2VZTA 1E70M 1KGWA 3SCTA 1VFFA 4J7RA 5A2AA 2VZVA 4WKAA 1CGXA 1QNPA 3N13A 3KWXA 2FHFA 1VBUA 3T0DA 3ZQ9A 3FN9A 3ZT6A 2A3BA 1E6ZA 5ABEA 1J18A 2GK1B 1D3CA 1V6UA 3SCSA 2YDQA 2OWWA 3DECA 3M46A 3VM5A 4C7GA 3TONA 3AIEA 3AMGA 2YL5A 3SCPA 2QPUA 1TVPA 2VL4A 4HPGA 4FLRA 3LPOA 4XZBA 1HVXA 1CXEA 1JDAA 3ALFA 1CLXA 1VENA 1Q4NX 4M8UA 1V6XA 1UKOA 3EDJA 3HJEA 1V3JA 3QOKA 4E8DA 5BYWA 2VI0A 4FMVA 1E40A 1CLVA 3G6MA 3VDCA 1NOWA 3WBEA 3W37A 4DWSC 2YJQA 3AMKA 2BY1A 4AIUA 1CXHA 4HZ6A 4YPJA 1K9FA 2DH2A 4L4OA 3T09A 3OB8A 2VQUA 1C3FA 3MKKA 4P8VA 3BSHA 3CBWA 1SFSA 2CHNA 5I24A 3SCVA 2W66A 4DUVA 1B3WA 2OWCA 3W53A 5BWFA 3EMQA 3AS0A 3AISA 2Y8KA 1WNOA 4GI8A 4HU0A 3M6DA 4JKMA 4LQ1A 3PHAA 4BF7A 3WFLA 3CUIA 2XVPA 2BXZA 4TTGA 1LJYA 4E4PA 2QMJA 4MNMA 4ZE5A 4XUYA 2VZUA 2WVUA 4OOUA 4FLOA 1XD1A 1M04A 1ZJAA 4R5EA 1QHPA 4EK7A 1JXJA 1Z32X 4CVWA 1KBKA 3CZGA 1JGIA 5A8QA 1BYAA 1UG6A 4PSPA 3ARUA 3AS3A 2EXOA 4TUFA 5A8NA 2WKLA 4UR9A 1F4AA 1R87A 1UYQA 3WQ5A 1HNYA 1H0GA 2J25A 2D20A 4AZBA 5DF0A 3VGFA 4U2YA 3BAKA 1E4LA 4UQ9A 3NYDA 3S2CA 3LPFA 3K8LA 3B9AA 5EBAA 1M03A 3AOFA 4PMYA 4U3AA 4HMCA 3KL0A 1LF1A 1V3KA 3GXDA 5A8MA 3O6AA 2CXGA 1CXLA 3WDHA 1J0IA 3AYRA 1XRVA 1WZLA 3POCA 5DMYA 4AD5A 3ARQA 3WH8A 4ATWA 3I3BA 1HP4A 4M81A 1U33A 2WHLA 2WSKA 4PUEA 3CUJA 2Y8VA 1XH1A 2A3AA 1WDRA 4HA1A 1V0MA 2X8RA 3BAWA 4WF7A 2OYLA 3ZM8A 2E0PA 3B9DA 3BAYA 3W81A 1JF6A 1QI5A 4P8XA 3WQWA 1GOWA 2VQTA 1VJZA 2XM1A 4AYSA 5FL0A 6CGTA 1KXHA 1MFVA 2ZUSA 5CLTA 3RIKA 3GYCA 1QNRA 2GJRA 5E6YA 3VX0A 4UFJA 3MV11 4JFVA 3GZAA 1A3HA 1ZS2A 2ZX5A 3OZOA 4CUCA 1SMDA 3NCOA 2JF6A 1DTUA 2VOTA 1OT2A 1EO5A 5ABGA 3ZJ7A 3FAXA 2VVNA 1B3VA 1CTNA 1E73M 1H41A 4F9JA 3WH6A 3VGDA 2E9BA 1CGTA 1HT6A 2J47A 1VBRA 3RO8A 4Q22A 5IXEA 5CPTA 4CU8A 1B0IA 2ZUMA 2BVYA 1V02A 3ZSTA 4V28A 5I6SA 2J62A 4HOWA 3WL0A 5HNNA 3VD5A 3W38A 1EOKA 2ESCA 2WMJA 4JFTA 1MW3A 2W67A 1WKYA 2RGMA 3W26A 1IZKA 3MS8A 3L4WA 3VDBA 3O2LA 2BHUA 3BLKA 1KFWA 4PTVA 2UWFA 4D6DA 1U2YA 4AWEA 1GQJA 4PRWA 5GPRA 3SUSA 1DWFM 3RM4A 1JYWA 1GUVA 1QI0A 1S46A 4BQ3A 2FGZA 1MQPA 2ZX9A 2V5CA 1E6QM 1E6SM 3AIQA 3U57A 2NSXA 4AEEA 1LWJA 4X0NA 1OM0A 1WP6A 5ECUA 4JZ5A 2W61A 5D9NA 2VURA 1W1VA 1J0ZA 1CZ1A 3MUY1 2MANA 4AZGA 1QHZA 4MJ2A 2DSUA 2BNJA 2WMIA 4PYSA 3A3HA 2YOCA 3F5JA 4ZEPA 4EANA 3ARXA 4F9DA 3AHTA 5M17A 3HN3A 4AD2A 2G8ZA 3VGHA 1E0WA 2WB5A 3D3AA 2X05A 1I75A 5CJ5A 1B3YA 1OBAA 1H5VA 2ZX7A 1PPIA 4IM4A 2WWDA 4MB4A 1WDQA 1C93A 3VKKA 1JZ5A 1VRXA 2DPEA 2D2OA 3CUGA 2XGIA 1QBBA 1EO7A 1R7AA 1HF6A 3TP4A 6TAAA 3SUWA 2AAAA 4EE9A 4MDPA 3G6LA 2WAGA 5D4YA 3AZSA 1E3ZA 4CN6A 3VD7A 3AMDA 1E4IA 1VEOA 1H3GA 2YDRA 3VILA 3CHFA 4UCFA 2WHKA 3MO4A 1E56A 2J78A 2X2YA 3VX1A 1W3JA 4FLQA 3MUZ1 4NF7A 4B3LA 5AC5A 3ZJ6A 5A2CA 3WD3A 2EPNA 4H7VA 1NWUA 4W8BA 1C91A 1E6PA 4D72A 3RCNA 1HJXA 5CZKA 1G5AA 3BAJA 4W8LA 1H49A 4MB3A 1RP9A 3W25A 3PZ9A 3U5UA 5CSYA 3FXYA 2BVTA 3T2QA 4RE2A 2D0HA 1GORA 2D23A 3AIUA 1PEZA 2WHJA 1BYDA 1H2JA 3SEPA 2EQDA 1DWHM 1LQ0A 1EXPA 4FLSA 2E9LA 1FH8A 1KCLA 1JI2A 1IT0A 3VM7A 3GNOA 1H4PA 5AC4A 4GKLA 3MSGA 2DT2A 1W91A 1ZBWA 2G3IA 4WSJA 4TTUA 4UFLA 2G3JA 3BH4A 1FFRA 2ZXQA 4WKFA 3WL1A 5IFPA 2WKGA 1KWGA 1VIWA 1UD3A 3LPGA 2A3CA 3ZMRA 4ML4A 3CZEA 1GONA 1HJSA 1BG4A 2OLHA 1MXGA 2ZX8A 1GJUA 2GDVA 5E0FA 1UUQA 3CGTA 1UD6A 5A8OA 1B9ZA 1VFMA 3K4DA 3W0KA 1EOMA 1KXQA 2ZXDA 2DT3A 4JL2A 2XIIA 3ARRA 2D0GA 3VNYA 4GZJA 1WDPA 3UEQA 3A4XA 2E8ZA 6A3HA 2GSJA 3WSUA 2J7HA 1KWKA 2W5FA 1ISVA 5M3WA 2AOSA 1UA3A 3PZIA 4M1RA 4GINA 3CHEA 3KEHA 1GOMA 3SUTA 4PBGA 3OGRA 4PMUA 3WDJA 3VTRA 2VT0A 4HTYA 3RM9A 1B2YA 5CGTA 1C7TA 3MU7A 7CGTA 2YL6A 4AD4A 2DSVA 1ODUA 1L8NA 2WVSA 3WN6A 3T2OA 1LL4A 4AD3A 3CUFA 4PCSA 1J9YA 4H8HA 4ZXOA 1D2KA 1US2A 4X0VA 4AZ5A 1B3ZA 2WW5A 1AQHA 4H2CA 3W82A 2E3ZA 5A69A 5FOOA 2XG9A 5BXTA 1B31A 3GBDA 4AW7A 3N18A 1XH0A 2ZUNA 3NUKA 4AIOA 3WUEA 1FHDA 3DYPA 4UQAA 4BA0A 2XYLA 4AD0A 3IANA 2VNCA 2BXYA 2CETA 3PZOA 3VD3A 3SCNA 4J3TA 3AZTA 2O9OA 4YN5A 1E5NA 4OUEA 1Q6GA 1TFVA 3MMUA 4RL3A 3N17A 1H11A 4XX6A 1GZJA 5C70A 5D9OA 2WZIA 3EYPA 4MB5A 5DEZA 1TCMA 1UH4A 1DEDA 2G3NA 1NQ6A 2V3FA 4UFMA 3I3DA 5CG0A 3VGGA 1K9DA 3AFBA 3AI0A 2D24A 5DT7A 2D22A 3BCDA 2PC8A 3VIMA 1LWHA 3QHNA 1UH2A 3WMCA 1TZ7A 3GH5A 2NT1A 1UR0A 4MTVA 3MMDA 4AZIA 1BLIA 5D8ZA 3W6LA 3CLWA 1JDCA 1JAKA 1FOBA 3DHUA 3OGSA 4AZCB 3PZQA 5BCAA 3GXIA 1WZMA 2XJ7A 5CPSA 3IJ7A 1AVAA 4JFUA 4W93A 3B9EA 3WENA 4ACYA 3CZJA 3K1DA 1M7XA 4RE4A 1HX0A 2JF7A 3DYOA 1YHTA 5A95A 4Z2KA 3AIWA 1OGBA 4HZ8A 2WBGA 3BAXA 3AJ7A 2CKSA 3AROA 1CECA 2XSAA 4ZE4A 3WEZA 1ISZA 3THCA 3WUBA 2ZXAA 2GJPA 4JFWA 4OBSA 3GXFA 4E8CA 4W88A 5A6MA 3CHDA 1V08A 2A3EA 2EEXA 1UR9A 3ARTA 4KH2A 2NW0A 5JIWA 1TR1A 4TXEA 1FFQA 1PZ3A 3DC0A 4AXNA 1E43A 1GPFA 1WZKA 1B3XA 1R86A 2XFRA 4D6CA 4XB3A 4PUDA 1TUXA 4W86A 4BQ2A 3PTMA 1V0LA 3L4XA 3WNPA 4Z2JA 5I5RA 5A1AA 2VVSA 4TVUA 1JD7A 1J0YA 1NOUA 2CBJA 2J7DA 4TVDA 2O9PA 1OINA 3F5LA 1JNDA 3UETA 3OLEA 3PN8A 1V3LA 1ISYA 2WMGA 2VZOA 5CXPA 3ZJ8A 2JFEX 4GQRA 5HDRA 1HXJA 3TA9A 1TVNA 2JALA 2FHCA 1XHGA 3WD4A 4EKJA 3NIYA 3AS1A 1DWGM 1UWQA 1VB9A 4NRSA 1UD5A 2XVGA 3U5YA 1FH7A 4JHZA 3JUGA 3N11A 1SMAA 4BQ5A 1HJVA 1RP8A 2EPOA 3VDHA 4W7UA 1ISXA 3HU7A 2ZICA 3SCWA 1V02E 3GH4A 1QBAA 2YL8A 4WKHA 2CIPA 3BCFA 5EMYA 1EHNA 1MWOA 1VEPA 1L0PA 4JIEA 2C8NA 4P7NA 4M82A 4UTFA 1MW2A 4QAWA 1NP0A 2VR5A 3CZLA 5I2UA 1NM9A 3S6TA 5M03A 1CEOA 1JDDA 3L4UA 1WB0A 2PWHA 4P7RA 3T0BA 2D3NA 5E0CA 1JZ4A 3L4YA 2BV9A 1CENA 3N9KA 2WVTA 3N15A 3ZSSA 4W7VA 3AYSA 1TMQA 2WVVB 2ZUUA 4QFUA 1J0JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3RME A;  2A3H A;  1RD6 A;  1EDQ A;  1GOO A;  2V3E A;  4UQC A;  1J0K A;  1UWT A;  1OB0 A;  2E9M A;  4BCE A;  4OIF A;  3OG2 A;  4XZW A;  5HPO A;  3TTO A;  3VU2 A;  5CSU A;  1QW8 A;  3A4W A;  1BF2 A;  3VGE A;  2J4G A;  1UKP A;  4UQB A;  2WMH A;  1MYR A;  3WUF A;  4J3U A;  4PEE A;  1HN1 A;  3OZP A;  5IFT A;  1UR1 A;  2WWC A;  3RJX A;  2DEP A;  4U5K A;  3EDF A;  1PBG A;  3QR3 A;  3TTQ A;  1A47 A;  1XGZ A;  3CZK A;  1W3H A;  1KCK A;  3OLI A;  2J74 A;  2YBT A;  3WNM A;  2V38 A;  3L4V A;  1H0I A;  4N42 A;  1G1Y A;  4JCL A;  3WQ4 A;  2VX6 A;  2YLL A;  1QI4 A;  2DQX A;  1HVQ A;  3LPP A;  3VD9 A;  2VJX A;  2O9R A;  2GK1 A;  1TA3 A;  1PAM A;  4WIW A;  1IV8 A;  1GOQ A;  1GVI A;  3PZU A;  2ZX6 A;  1UD4 A;  1CNV A;  1E4N A;  1HP5 A;  5BRP A;  3I3E A;  3OLG A;  4CU6 A;  4NI3 A;  4J28 A;  5DO8 A;  3VMP A;  3WF0 A;  4MAD A;  1FP8 A;  3ZIZ A;  4GIA A;  3WMB A;  4LPC A;  3ZR5 A;  3WQV A;  3SCQ A;  2CEQ A;  4PTM A;  3FHA A;  2G4F A;  1GQI A;  4XV0 A;  2WLY A;  3F5K A;  3AIB A;  4KGJ A;  5E6Z A;  1KGX A;  3CPU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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