1OK4A

Archaeal fructose 1,6-bisphosphate aldolase covalently bound to the substrate dihydroxyacetone phosphate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
NLTEKFLRIFARRGKSIILAYDHGIEHGPADFMDNPDSADPEYILRLARDAGFDGVVFQRGIAEKYYDGSVPLILKLNGKTTLYNGEPVSVANCSVEEAVSLGASAVGYTIYPGSGFEWKMFEELARIKRDAVKFDLPLVVWSYPRGGKVVNETAPEIVAYAARIALELGADAMKIKYTGDPKTFSWAVKVAGKVPVLMSGGPKTKTEEDFLKQVEGVLEAGALGIAVGRNVWQRRDALKFARALAELVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE CLASS I
publication title Crystal structure of an archaeal class I aldolase and the evolution of (betaalpha)8 barrel proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Thermoproteus tenax
total genus 90
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2003-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ok4A00
3B4UA 3O1NA 1VH7A 3P61A 4UTWA 4ZVJA 4A29A 1NFBA 3DKJA 3MP5A 3TROA 3NQMA 2GQ9A 1EWDA 2OT1A 2QJIA 5K9XA 2ATMA 2E5BA 2B0MA 2Q8LA 5HUPA 3QMTA 4NJHA 1MZHA 3LX9A 2A2IA 3WJZA 3PUEA 3M5XA 5LNUA 1KV5A 3I7RA 4MYAA 3GNNA 1XC4A 4JTTA 2J88A 5HWJA 1DVJA 1XCFA 4OQVA 5CZJA 5DBUA 3STCA 2ZRUA 1BWLA 4BK9A 5KTLA 1ZCOA 1EP3A 3W2UA 5C6MA 1LOQA 5AHEA 3UWQA 1VCGA 2TYSA 3G0SA 3LOTA 3PSVA 1FWTA 4RK8A 5LNWA 1SO3A 4Z08A 4O15A 1R47A 4H6KA 3HPZA 3RMJA 3G1VA 5EL1A 1W8SA 3NO5A 3UWUA 3WJXA 4K38A 5FF0A 3O16A 3M16A 4Z0SA 4UTJA 2QCNA 4IX0A 2JGYA 3LHTA 1NF7A 3UPWA 4L4MA 4UMAA 3FYPA 4AB4A 3LI1A 4NX0A 1SSGA 1GQNA 2YX0A 3GK0A 3GAYA 3QSTA 1OYAA 4WJEA 1RQEA 2WNNA 4CCEA 4ZZ9A 2I1OA 1JQVA 2CLEA 1GYLA 1QPNA 4JDBA 3W7JA 5G2IA 1B3OA 3PUOA 2Y7FA 3EB2A 5DBTA 3P67A 1LBFA 3VE7A 4PA8A 2VFFA 3TKFA 4ADTA 4CNPA 1FQ0A 2QF7A 3BGJA 3MMTA 2OZ0A 4TMCA 2YW4A 3NNTA 3UWZA 3P84A 3W22A 2ZFAA 3DFTA 4Z1AA 1YLVA 3Q58A 1TRIA 1ICPA 1AW2A 2X1RA 3NL2A 1FDYA 3PB2A 1TPVA 3ATZA 1F7BA 3FJLA 1FBAA 2YSWA 3NQ6A 3P81A 2JGQA 5F1UA 3W7GA 1ICSA 1F74A 4FXSA 5DLCA 1XBXA 4XZ9A 1FDZA 2H8XA 2WSQA 2G97A 4POCA 4RZ4A 3HG3A 4R34A 1VYPX 3EX6A 2V8ZA 4NVTA 2Y62A 1X8FA 3G3DA 1A5BA 1H1ZA 1Z44A 4LY8A 3UY7A 1GG0A 3S9YA 3W1UA 2X1SA 3CC1A 1FWRA 1BEUA 4MYXA 3DH7A 2V30A 3STFA 3KRSA 1M6JA 3L0NA 3UZ5A 1SZNA 5HMSA 3UWVA 5G1YA 3THAA 1XUZA 3PY2A 1IIGA 3W1NA 2B7PA 2DZWA 2VC6A 2X1TA 2WPBA 3W86A 1WBHA 2FFCA 3GLCA 4IJBA 3BGGA 2YDAA 4IWWA 5EA9A 4UXDA 1P1XA 2EAWA 3W7EA 1KTCA 3OIXA 4ICNA 1SO5A 4CQ8A 4XBSA 1TPUA 3W75A 2Q3RA 4QQ3A 2ZA3A 1SUXA 4JR5A 2E09A 4QITA 3IEBA 3UD6A 2HS8A 2NWRA 1NAL1 3CWOX 3G1FA 4N6FA 5CPMA 4UTLA 2QKFA 1H7RA 3MP3A 3NVTA 3QW4B 1OHLA 3W3OA 5FF4A 5F4XA 1QCWA 3N3MA 2BTMA 1IXNA 4H4IA 1DBTA 2GJLA 4WUIA 1RQHA 3LHVA 4UUIA 1VCVA 1O95A 1OX4B 3WFAA 3LV5A 3IIXA 1S5VA 1EIXA 4OT7A 1LM1A 2JK2A 3W2JA 1F76A 3CB8A 3NQFA 4XUGA 2A6NA 3O6CA 3G1SA 3W7NA 5J5DA 3E0IA 2V0TA 4O14A 3L65A 3T7VA 3PSWA 3LTPA 5AHMA 3W7HA 2ZBTA 4JYFA 4ONVA 1Q45A 2B7QA 2VEMA 2G95A 2ALDA 5DXXA 3PWAA 1P0NA 1UUOA 2QCLA 1I2PA 4NZFA 1B57A 1RZMA 2I14A 3R13A 3WK3A 3KOFA 1E51A 3PBYA 3IIOA 1XL9A 1TPB1 3P82A 4CQ9A 1H61A 5K7JA 5K9CA 4AHQA 3TW7A 3NL6A 3BG5A 1MEWA 2VFEA 2YCEA 4Z1DA 4Y96A 1OF6A 3KVJA 4JY8A 2VFDA 2YGYA 2YPIA 3M1ZA 5D2XA 3OVPA 3ABOA 5A8GA 1KBIA 3HJZA 1W37A 3FIGA 1FCUA 1D3GA 2QDHA 4UFLA 1LRQA 4WXZA 3O05A 1SQ7A 3I68A 3MBDA 3WJWA 2GVJA 3BLIA 3NOEA 4JTHA 2E6YA 2BLEA 4LTSA 4GUJA 2X1UA 1U5JA 2Y61A 1UUMA 2QDGA 1DJNA 3NGJA 3DHFA 3NPWA 1TQXA 2NXHA 3TW6A 4XTIA 1GTEA 2E6FA 5K2ZA 1SSDA 2XN1A 3F4NA 5EMUA 4HPXA 2UV8G 2FPYA 4K8HA 1MEHA 5DY3A 1JVNA 3C2FA 1EP1A 2A5HA 3O15A 1TYGA 2C0AA 4HSOA 3W6YA 3NQ7A 4JYEA 3MHUA 1F6PA 3LBCA 3MP4A 1TCDA 2ZA1A 1LCOA 3GR8A 2Y7DA 1ZAJA 4FNQA 4PL1A 4XWUA 1W5PA 1AG1O 2NX9A 1KM4A 4JX4A 1FDJA 3HG4A 3JRKA 4GBUA 2QCDA 3FJ6A 2W6RA 4MY9A 1Q6QA 1RR2A 2H3DA 1ZAIA 3Q37A 2GQ8A 3AJXA 2ISSA 4GXMA 3M7WA 4E2BA 2ZTKA 3GR7A 1J2WA 4AWTA 4RZ6A 5E0KA 3G3MA 4UTIA 3C2RA 1IXPA 3EKLA 4WY0A 2FTPA 1KTNA 5J5RA 5FF3A 1WQ5A 4X22A 4N6EA 1ZENA 3LERA 2V5LA 1XDLA 4JTIA 3W2KA 2X2GA 4N9DA 4XQ6A 4FHAA 1QFEA 2V9DA 2GQAA 5K9DA 1L6WA 3W1MA 1RQBA 1T8XA 1DL3A 1GG1A 2G5WA 3MJYA 1ZALA 4DBEA 2FLIA 2CLKA 4OE7A 4QIUA 1D9EA 2YFOA 4FIQA 3UWYA 4O1BA 4UCGA 4FF7A 1BKSA 1DORA 4AHOA 1A5AA 3TC7A 4AH7A 1H63A 1ME8A 4QNWA 4IPJA 2E5DA 3QJAA 2ZZ4A 4BWLC 4JTKA 4LRSA 1LP6A 4Z1CA 2VKZG 4RV8A 2VOMA 2CZEA 2WO5A 3W70A 3KRUA 3HQ1A 3DAQA 2ZQ0A 1TREA 1KW1A 3S5YA 1EP2A 3R2GA 1KFJA 5I3KA 3O6YX 1RPXA 2C3ZA 2GJNA 3N2XA 4KWWA 3HBLA 2ZZ1A 4YL2A 3W7OA 4BFAA 4PEKA 3TIMA 1VQTA 3BW4A 3NEVA 5BMWA 2B4GA 3FLUA 3GXNA 3UWWA 1WV2A 1TSIA 2A21A 1OJXA 5HQEA 2AQWA 3KAOA 2EKCA 3NZRA 3QPYA 3SIZA 3RU6A 3B8DA 4IUOA 4KFPA 5L6UA 4I7VA 4O1DA 5I3FA 3W1QA 1EA0A 3O6DA 3LM7A 4A2RA 2WV8A 3T40A 4UNKA 4N9CA 3A24A 4LU0A 3T78A 4GUIA 1MEIA 3U8GA 4IMDA 2VEPA 1O5KA 2Y6ZA 5AHFA 4E0CA 1LLZA 3N9RA 4ORMA 2FPTA 2EHHA 3I65A 4UTKA 2PRLA 2OCZA 1JJKA 3H53A 5LKYA 4O1CA 3MI3A 2PE4A 3CU2A 4UIOA 1L6SA 3BG9A 3GB6A 3VI2A 2FJKA 3UZJA 3DENA 1W3IA 1LTDA 1ZJIA 1KA9F 4O8RA 4Y6GA 5CZ0A 4TR9A 5F2LA 5HINA 4Y9AA 3PAJA 2ZZ2A 3HB9A 3DFNA 2RKXA 5KZEA 3USBA 2DZPA 1U83A 5F2IA 5HR7A 3BK0A 1W1ZA 3GDLA 4DF1A 1I2OA 4JEQA 1KFEA 3LCHA 2JKAA 4XBKA 5AFDA 4Z1BA 2HMCA 3RK8A 3TK7A 2DZXA 3FEMA 3QEZA 5IM51 1WAUA 3DU0A 4ZQPA 2QCDB 3G1DA 1Q6RA 2XN0A 1SZGA 2RDUA 3G0UA 3TSMA 4K37A 3S5ZA 3W71A 3W76A 3HGOA 1ADOA 4DXVA 3DFQA 5I3JA 1X1ZA 3NQCA 4JTJA 4QISA 4UTHA 4ADUA 5LSMA 4N02A 3EX1A 4FXRA 3P60A 4WY0B 1XDMA 2QCFA 4LS0A 5D04C 4UFMA 1CW2A 4AHPA 3MI6A 1K7FA 2ABBA 3GXPA 1KBJA 3G1HA 3STEA 2ZZ3A 3DHDA 4JY9A 3OEXA 3BW3A 1GVQA 1QWGA 1RVGA 2P1FA 1DQXA 1L2UA 1FWNA 1OFBA 2Z6IA 5AHLA 4DQWA 2Y7EA 4MZ8A 3TQKA 4LS2A 1DJQA 3G8EA 3UXDA 4GNJA 1YDOA 1GYNA 3R8RA 3M5ZA 5LGXA 1GOXA 2RDWA 4AMAA 1HG3A 3F03K 1TTIA 1ME7A 3NQ2A 2ZZ6A 3TC6A 2C14A 1K3UA 4QNEA 5DCBA 3TJXA 1EPXA 1KFLA 1OG0A 4IMEA 1AK5A 4QAIA 4WD0A 3TUUA 1JUBA 4I7UA 4P61A 1HTIA 3H55A 3QM3A 4WX2A 3MYPA 4RKAA 3ZWSA 3EWXA 4JTLA 1R46A 4QM1A 2CLLA 1O60A 4H3DA 4Q33A 3MUXA 3KRZA 1W3TA 4FNSA 3NPVA 1OYCA 3Q2DA 5D02A 1LOSA 3LLFA 3L2IA 4UTTC 3P5ZA 4GWEA 3P8IA 1JCXA 5HR6A 2BWGA 4OV9A 3NQGA 1FX6A 5I3HA 3EXTA 5L9FA 3EEGA 2ZRVA 3L67A 3B0VC 3TV8A 3HO8A 5CSRA 3NQEA 1T0OA 5CZTA 2DU2A 1H7OA 5AC7A 2DZSA 5ABTA 4LC6A 3W88A 5FEWA 1Y0EA 3LTYA 2X30A 3ZWTA 7TIMA 3W72A 4JX6A 3KFTA 1JULA 2C1HA 1W5NA 3TQVA 1G4PA 2NV2A 3WK0A 2CZ5A 1ONRA 1R2SA 2NXIA 3QQ1A 4YLWA 4OGZA 1FXPA 4GRSA 4IMFA 3NG3A 3OA3A 3B05A 4MLRA 2AGKA 5KMYA 2WQPA 4O0KA 1O5XA 1F5ZA 1VRDA 3TU9A 1KM3A 3M47A 2CZDA 3TH6A 3LRKA 1P4CA 5I3IA 1YTKA 2TSYA 3TXVA 4GE8A 2BXVA 3NQAA 4AWSA 4JNMA 1RD5A 1TV7A 5EYWA 4CCCA 2GOUA 4GUGA 5CKSA 3FFSA 2E5CA 2HTMA 4MY8A 2VEKA 1HFBA 1DQWA 1GWJA 1V7YA 3GDKA 2PURA 1PCWA 1IGSA 2J6XA 5H2ZA 2CLMA 4X9SA 2Z6JA 3LCXA 2HS6A 2HSAA 3L5LA 4BI5A 4UR8A 3TFCA 3A9IA 1FCBA 2A85A 2WNZA 3KVKA 3T4CA 1C29A 3EKZA 1TPC1 3LXAA 3EX3A 1XUUA 1Z41A 3ELFA 1G4EA 3OG3A 1YTDA 4MJZA 4MUZA 5D32A 2A7RA 2ZRZA 4ADSA 1QNVA 2J9YA 4OBTA 1M5WA 2V81A 1YTEA 3I6RA 3A5VA 3QC3A 2WSRA 1YPFA 3PR2A 2QUTA 4WZHA 2C18A 2ZRXA 1I2RA 4RLIA 3M43A 1EUAA 4CNNA 4HNUA 5DCDA 2XFWA 3JS3A 2YYUA 4LNYA 3N14A 4AWUA 1JCLA 4K7YA 3WJSA 3L5AA 2QCGA 3CIWA 4JN6A 4EF8A 2ISWA 4MPQA 4UC5A 4UMBA 3LXBA 1JCJA 3S6DA 1L9WA 2E6DA 2YW3A 3S5OA 2NX1A 4DO6A 3NA8A 2DP3A 4TMBA 1L6YA 2Q3OA 2O7QA 3T44A 3UY8A 2QUVA 2Y88A 3T55A 1K7XA 4LWWA 3MBFA 1N7KA 4LUJA 2NUXA 4NJIA 5H91A 3NPUA 4YWIA 2FQIA 3TQ0A 1A53A 3LCWA 5D2WA 3S42A 3HMJG 1PHQA 3L0KA 2JKPA 3PG8A 1LZOA 5KITA 5FEZA 2E77A 1W5MA 2EPHA 3PG9A 2ZTJA 3C2OA 5K4XA 4O0ZA 2R14A 3MHFA 1QPRA 4NNCA 3LCFA 3W7KA 3RLVA 4FX7A 2BX7A 3BV4A 5CPLA 3U6WA 2RH9A 4NQ1A 4RX0A 3STGA 4O11A 1HO4A 1HL2A 3THQA 1A5SA 5LGZA 1JCNA 2GVGA 1OF8A 5MHBA 4IGHA 1A50A 3B06A 5LNVA 2A0NA 3KHJA 3PB0A 3GIYA 2B7OA 4FNTA 5G4EA 3OBKA 4N4PA 4QJ1A 1EX5A 5FI8A 5CPOA 1VYRA 3LDVA 1LOLA 1VYSX 3V1PA 5D09A 4ZMGA 3A5FA 3F4WA 2YFNA 3C2VA 3KVLA 4ZQMA 1CI1A 3TE9A 3CQ0A 3M5YA 1AMKA 5C54A 5IBXC 1G6CA 1KM5A 3SECA 1NSJA 3QMSA 2VFHA 4BI6A 5U4NA 4NJJA 4N9EA 4JIPA 4U28A 4EWND 3IGXA 4A3UA 3E9AA 3HF3A 5HWMA 4FNPA 3N2MA 4HSNA 3W7LA 3UQNA 1B4KA 4BWLA 1WA3A 4NU7A 2RHGA 1QAPA 4GJ1A 4RXFA 4MZ1A 1EWEA 1YDNA 3L0GA 3E96A 3W7PA 3NXFA 5FESA 1DHPA 1FWSA 1TPWA 1XKYA 1H60A 4GUHA 3S0CA 1UJPA 2VXNA 4ORIA 3W2LA 4HNNA 2FIQA 1PL9A 2VEIA 2VELA 3N19B 1G4TA 1TO3A 1SR9A 1N55A 1K8YA 3O63A 4JYDA 3IIZA 4RZ5A 5FEPA 4XTDA 1H7NA 1VS1A 2YYTA 5TBOA 1ZY9A 1F2JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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