1QFEA

The structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase from salmonella typhi
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVSRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKQASAPGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords PROTEIN (3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE)
publication title The two types of 3-dehydroquinase have distinct structures but catalyze the same overall reaction.
pubmed doi rcsb
total genus 89
structure length 252
sequence length 252
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 1999-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qfeA00
2JK2A 4E2DA 3GDKA 1MEWA 4RZ5A 1F6PA 5AYZA 3S42A 1VC4A 3W6YA 4WD0A 1QMLA 3HG3A 3M16A 1S3HA 3MI6A 3B0VC 5AHLA 3EWXA 1MZHA 4QJ1A 1OABA 4NZJA 1JCYA 2NXGA 4LUIA 2HTMA 1YDOA 3O15A 4Y96A 1VCFA 1LRNA 4WX2A 4Y8FA 1FUYA 1GVSA 1HO4A 3WK3A 3Q37A 3ABSA 2GJLA 4WZHA 3NQCA 4KWWA 2YR1A 3HPZA 5FEXA 3GKAA 1JVNA 4BI6A 3CHVA 5FESA 4HPJA 4Z1CA 1HG3A 2OJPA 1TCDA 4UTTA 3R12A 2VELA 4IPIA 1GVQA 1SO3A 4NJKA 1W5QA 4HPXA 4UMCA 5A8GA 4R34A 4UTLA 3WK0A 2X1UA 3FKRA 4Y6GA 1GPWA 5D30A 4QQ3A 3P61A 3PB0A 2TMDA 3G0SA 1TYGA 2C15A 5G2IA 3LERA 4NU7A 1S5TA 3CTLA 5I3HA 1G4PA 3SFKA 1G69A 1I45A 2GVLA 1H7OA 1VZWA 3W9ZA 3T4CA 1QNVA 1W1ZA 4ZQMA 3G24A 4U28A 1KBJA 3PG9A 3GLCA 2ATMA 1K8YA 4U4MA 3TXVA 3PBYA 2ABBA 1QR7A 2PURA 1WYIA 5LNUA 3BLIA 4NXKA 4NX0A 5CPNA 1ADOA 3CWNA 1CI1A 2V5BA 2Q8LA 1NFBA 3ANYA 5K4XA 4X3ZA 1JCLA 3RK8A 4O11A 1UUMA 2Y6ZA 3GXTA 2BTMA 3W1MA 3CEPA 2Z1BA 3N2XA 2JKEA 1GTHA 3P81A 2E6FA 3W7KA 5C54A 1WX0A 3G1YA 1F7BA 1A5CA 2WOQA 2RFGA 4CCDA 3TKFA 1SZEA 3WJSA 4W9TA 1PCKA 3MUXA 3QW3A 1T96A 4XZ9A 4LVDA 2QCEA 1KTBA 5AN7A 3TSDA 5C55A 1ME9A 1O95A 2TYSA 3UNDA 1OFQA 3PY2A 2E09A 3W1NA 3MYPA 2X1TA 3G1AA 4O18A 1GVFA 1I2PA 3W88A 3UD6A 3NZRA 2V0TA 4AVFA 2OT1A 3LBMA 4N2YA 3UQNA 4YMZA 3TMLA 4UIOA 3GNDA 4FNPA 1HUVA 4HNUA 1VPXA 1QCWA 1KM6A 2JBMA 1XM3A 4WUIA 2FFCA 3DKLA 3ZR4A 4ONVA 4KFNA 5F1VA 5HMSA 1SZNA 3LI0A 3QSRA 4GNJA 1HO1A 3G3DA 4K39A 4JIPA 1V5XA 4N6EA 5G1YA 2AGKA 1V7YA 2H6RA 2ZZ5A 1GVOA 3GXPA 4NNCA 4I7UA 2V2HA 1XDMA 3LDVA 3TW6A 3UWQA 2B7QA 3L5LA 5G4EA 3FYPA 4OE7A 3T78A 1TV5A 1F73A 5TBOA 3ABQA 2WNQA 4K8HA 3NAVA 2B4GA 3PB2A 5D2VA 1OYBA 1JUBA 3LRMA 1LM1A 2PC4A 3BLFA 1SO4A 4TU1A 2WSQA 4BI7A 5AHFA 3DI1A 1XXXA 4LUJA 4JTLA 2ZZ1A 1W3NA 4LWWA 4G1KA 3LI1A 3C4UA 3LHYA 3FYOA 4ML9A 5KITA 1P0NA 3CEUA 3LV5A 1I2QA 3U8GA 4XBKA 3A21A 5AC7A 1WV2A 2VFDA 4Z1BA 4LRTA 3GB6A 5A5WA 4EVZA 5IBXC 3QYQA 5CZSA 3S0CA 3BW4A 1TJPA 1KFEA 3B03A 5SWUA 3EX1A 4LRSA 3QC3A 4GC4A 1KTCA 2LLEA 4DF1A 4UC5A 3STEA 3C56A 4O50A 1MSSA 4JTUA 4JDBA 5TQLA 3S1UA 3EB2A 3M43A 3Q2DA 1YADA 3F4NA 3I7SA 1H7PA 4RXFA 1A5SA 3AJXA 4NNBA 1K7FA 4BFAA 4UFLA 1GEQA 4JY9A 4S2CA 5DCBA 1QO5A 3W7LA 2JKPA 1AL7A 3DFOA 1FX6A 1Q3NA 4N9BA 4YLWA 3IGSA 3C2OA 1KV5A 5KINA 4AHQA 2HSAA 3SZ8A 1M6JA 1EEPA 3NXFA 4BF9A 5CZ0A 1F6KA 5KTLA 4E2BA 1TTQA 2VFIA 3N34A 4AB4A 3ATYA 1EWDA 3QW4B 3NO5A 4DO5A 4C1KA 5D09A 4LC8A 1TQXA 1K8ZA 2C1HA 5EY5A 1G4EA 1QPQA 3HQ1A 1VR6A 1OX4B 1SO5A 1W5NA 4OV9A 4GUFA 2F84A 4NJHA 1H7NA 1OFBA 4K38A 4CQ9A 3G8EA 5EBUA 3TAOA 1BKSA 4WXYA 4HNNA 1C9DA 4HSOA 2ZFAA 1W3IA 5CG7A 3EX6A 1UBSA 2BZNA 1PIIA 3NEVA 1TMHA 3MYOA 4UTHA 1KM4A 2X2GA 4FX6M 2WSRA 4DEFA 4XQ6A 3QMTA 5K9CA 3VNDA 1ALDA 4DO4A 1Z48A 1KFKA 1RD5A 3MWAA 1YXYA 3W73A 1VS1A 4RX0A 1CX9A 1EB3A 4JTTA 4RR4A 3LCIA 3W86A 2FB2A 3KHJA 4DPQA 4BI5A 3HG2A 1T99A 2CLFA 5BW6A 3GKFA 4AF0A 2J88A 1ICPA 3QF0A 3W1XA 1XBXA 5E1QA 3V75A 1JQXA 1KA9F 1JR1A 1TRIA 3BARA 1I2OA 1IXPA 2YW3A 4ZQCA 3P84A 4JX6A 1TPUA 1N7KA 1QAPA 3W23A 3KVMA 4ICNA 2QCDB 1NSJA 4UFKA 5DBTA 3WJWA 2QCFA 3GK0A 3IIOA 1SO6A 2XN0A 4JTEA 1TQJA 4M6QA 4HIBA 1F5ZA 5F2GA 4Y9AA 1H5YA 3M5XA 4R53A 5HJLA 1LOSA 4MYAA 1QPNA 1R46A 1KTNA 1GG1A 3TUUA 1ME8A 5IBXA 1DJQA 3OG3A 2VEMA 3LXBA 3W2UA 4DO6A 1ICSA 4FNTA 3QQ1A 5I3JA 3DZ1A 4H3DA 1TTJA 3W76A 3THQA 5HUOA 4HSNA 2OT0A 1R2RA 5D2TA 4BK9A 2ZRVA 4AAJA 4RZ6A 4YCOA 4UR8A 1VHNA 3S5YA 1VRDA 3RLVA 1OJXA 3MP3A 2WV8A 1G4TA 4QNEA 2VXNA 3B05A 4FB7A 3UZJA 3MP4A 4LTSA 1XI3A 3P62A 1FCVA 1EUNA 2R91A 3PUDA 2YXGA 2JGQA 3N73A 3SJ3A 1PV8A 2O7QA 4IJBA 1JRBA 3S1WA 4XTDA 4JTGA 3NVTA 3E12A 1ME7A 2A6LA 1XUZA 4QSHA 3S1VA 1ZJIA 3MW7A 4MY8A 2TPSA 2Y85A 4H6KA 4O1DA 5K3VA 2VFFA 2ZZ3A 5CZTA 3WFAA 3SW6A 2C18A 4X22A 1MXSA 4AF0B 1SR9A 1KBIA 5DCDA 4LS2A 4LV4A 4AWSA 3W3OA 2E1DA 4O1BA 1GYLA 3L0GA 3WJXA 3WJZA 2V81A 4LVAA 2C16A 3W7QA 1D3HA 1TPFA 4TMCA 2Z6IA 5BMWA 1SW7A 4O13A 1F74A 3CB8A 3IVSA 5I3GA 4Q33A 3DGRA 3WJYA 1XC4A 4XWUA 3RF9A 4UTIA 5HINA 4JEQA 3MHGA 1U5JA 3CT7A 5C5YA 3TR2A 1VHCA 3UY8A 4O54A 3W1QA 1SFLA 3NOEA 2DZUA 3P8JA 1K03A 2XN1A 5BNKA 3NYZA 3MHUA 4FIQA 4ORIA 3C52A 2CZFA 4IQLA 4O0KA 2CWNA 2R14A 2I14A 1WOAA 5DXYA 5CKSA 3BG9A 3RLUA 5K4ZA 4O4WA 1H1YA 3RNDA 5F4SA 2Y7FA 3VKJA 3VE7A 1YPIA 1J5TA 1UJPA 1OX5A 3MI2A 3P80A 1GOXA 3NQMA 5BOOA 1VLIA 2R8WA 3KFTA 3G1DA 5G5IA 3TX9A 4NJGA 3P74A 2H90A 4BWLC 2NWRA 1JUKA 3LCLA 3ATZA 3G1VA 4JX4A 1L6SA 3W7PA 1VJIA 2G97A 5LHEA 4EF8A 3OVQA 3BGGA 4ZMGA 2DZSA 1VCVA 2Y7GA 3W7EA 3GDLA 4UTKA 5FF3A 3TQVA 2CLOA 2FPVA 3IIXA 3LCFA 1H60A 1PVNA 2WSYA 4JTJA 3HGSA 2GQ8A 4JTKA 3EWZA 3KRSA 3O6CA 4DF2A 5D37A 1R30A 3NM1A 4AHPA 3I65A 1TPB1 1KLZA 4LV9A 1ZNNA 3RMJA 1EPXA 1LCOA 2J27A 1XCFA 2DZWA 2Q3RA 3C6CA 5D02A 4UTWA 1TRDA 3E02A 2VEPA 2ZZ2A 3OVRA 1Q6QA 4JTSA 3B0PA 5LNVA 4CQAA 3TE9A 2BXVA 1HL2A 5FF0A 3L67A 4L4MA 2YCEA 3BW2A 3N3MA 3GZ3A 3I7QA 3W2KA 1TIMA 2PRLA 5L6UA 4K8EA 3HGJA 3L68A 2B0MA 1W37A 3IVUA 3NQ8A 4GE8A 3SR7A 2A4AA 1OK4A 4MKNA 2NZLA 1PL9A 3TFCA 1H7WA 1KFJA 2GVJA 3IIVA 3LGEA 2HMCA 3P5YA 4L4LA 2A7NA 3R8RA 3HB9A 1VYSX 2V2CA 3W87A 2WKJA 1XL9A 3LBCA 3DHFA 3VFLA 5DLCA 4XBSA 1N8FA 3UWVA 4FNSA 2A5HA 3O6YX 4ADTA 2X30A 2NV2A 2RH9A 4LVFA 3E49A 1KM3A 1H51A 1KM1A 5HUPA 2Y89A 1RQBA 3W85A 4AWTA 3P60A 3DH7A 3S6DA 5LGXA 1RPXA 3TSBA 1W3TA 5FI8A 4C1LA 3PULA 3TJLA 4ZL1A 3M7WA 2G5WA 1TO3A 1IXQA 3O1NA 2E5CA 1DHPA 1IXNA 1TPC1 2EGZA 1RZMA 2YW4A 4IMCA 5F2LA 3W2JA 3LRKA 2CZ5A 3TNOA 1QDSA 5DBUA 3GDTA 2F7FA 2A7PA 1U83A 4QNWA 4DBEA 2DU2A 2B7PA 2NLIA 5AOUA 3LV6A 4FO4A 2V82A 3A9IA 3PBVA 1B9BA 5FEWA 3PWAA 2QJIA 4YWIA 1TSIA 1TREA 2QAPA 4BR1A 1UB3A 5LKYA 3OBKA 4DBDA 4P61A 2C0AA 3DAQA 2YGYA 1KFBA 2FLIA 4N4PA 3M41A 3TC6A 1FCBA 2OZ0A 2VOMA 1OFAA 5FEZA 3FJLA 1EUAA 1CW2A 3C2RA 1FXQA 5GVJA 4WY0F 4DF0A 4FXSA 1XBYA 3LTYA 1F76A 1ZCOA 3M9YA 2UV8G 5DY2A 4BWLA 2D73A 3A23A 4O17A 4WJEA 1E51A 4EWND 3R5EA 1QOQA 4HT3A 4OGZA 1OFOA 3I68A 3A5FA 3P67A 4Y90A 1SZFA 1VCGA 4AWUA 1TTIA 2H3BA 4NQ1A 1YTKA 3R13A 4M7TA 4HNVA 1RVGA 5AFDA 2VEKA 3EWWA 3UXAA 1XBVA 1WBJA 2Z2UA 2DJLA 4KFPA 3NPXA 1Q6OA 2FB3A 1R2SA 2Y7EA 3LXCA 5H91A 3QMRA 1LZOA 2CLMA 4QIUA 4AEOA 4IOTA 1XFBA 4OV4A 1MO0A 1FBAA 1X6UA 1WOBA 2HS6A 1OX4A 4GJ1A 3BK0A 3O05A 1ZAHA 2P10A 2J24A 2YDAA 1SQ7A 3THAA 4EF9A 2QCHA 4OWGA 1D9EA 2GVGA 2ZTJA 3D0CA 3W1LA 2RHGA 3JR2A 4B5NA 1FWSA 5AB3A 3E0IA 2AQWA 3H53A 1H61A 3L5AA 1THFD 3QMSA 3KAOA 2DZXA 5D32A 2I9EA 3DFTA 4ADUA 3W1RA 1IIGA 1W54A 1FDZA 4RLIA 3BV4A 4Z1AA 1A53A 1F05A 8TIMA 1TPDA 4PFMA 2RKXA 1C8VA 3L65A 4Z1DA 4N02A 3PBWA 1X7FA 3W7GA 3FLUA 3K30A 3R89A 2G96A 3A5VA 4UMBA 1VLWA 2ZZ6A 2H3DA 4P2VA 3TCEA 2NV1A 1SZGA 5F4XA 1DV7A 1X1ZA 2C6QA 2ISSA 4FF7A 4XKYA 4UUIA 1KFCA 2ZRXA 1TJRA 4HKPA 5D05A 2CW6A 3B06A 3DI0A 3FOKA 1MEIA 4JNMA 1K3UA 2W6RA 4LC6A 3M44A 4YXGA 3LHZA 2QCCA 3EX3A 3TQ0A 4IX0A 1DOSA 5H2ZA 5EL1A 3EKZA 2QCDA 2A85A 4FX7A 2A0NA 3C0JA 1JCJA 2QCGA 3L0KA 4R7JA 3M5ZA 4OU1A 2QR6A 3P5ZA 3FS2A 4CLMA 3C2FA 3IGUA 4LOCA 3OEXA 4O8RA 3QM3A 1B57A 4PEKA 2KZHA 3IV3A 5AHEA 1VQTA 3FKKA 3UYCA 3EXTA 4JTHA 3EWYA 3QPZA 5C2XA 2NUYA 3JS3A 3W1UA 1IIHA 4NX5A 4PH6A 4JDYA 1P5BA 4GUGA 2CLLA 4FEZA 1EP2A 2NX3A 1DJNA 4R33A 1AL8A 5U4NA 1JCNA 1FCUA 4A3UA 4AHOA 4PODA 1SSGA 5HQEA 1JULA 2Y61A 5I3FA 1QPOA 1J2WA 2PE4A 3UWWA 4XUGA 1ZENA 4WOQA 4O12A 3T40A 1P4CA 3MMTA 3STCA 3LRLA 1Z41A 3GAYA 1B3OA 2A7RA 3KRZA 1XKYA 1H62A 3SI9A 3KRUA 3W7IA 2WNZA 4GRSA 1YPFA 2FTPA 4UCGA 1TB3A 4UNLA 5CPOA 1YXDA 3LOTA 4GUIA 4M5PA 4WY0A 3NL3A 3LCHA 3ELFA 1NEYA 4XKYB 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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