1QOPA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with indole propanol phosphate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Wild-Type Tryptophan Synthase Complexed with the Natural Substrate Indole-3-Glycerol Phosphate
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 99
structure length 265
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qopA00
2Q8ZA 3KRZA 4IPJA 5CPOA 1QNVA 2E5DA 2JKEA 2CLFA 1TTJA 3G1YA 2NUXA 1KM1A 5IBXA 4MYXA 3ZS4A 3NQGA 3PG8A 1AMKA 3EXTA 4DBEA 4LVGA 1TPVA 2C6QA 1VCFA 4DBDA 3GR8A 2TYSA 1RVGA 2CZDA 3PBYA 1GZGA 3C61A 1LBLA 3BV4A 5CZ0A 4IXXA 4YLWA 2DORA 2FQIA 3TV8A 3N9SA 1ICQA 2ZRZA 2VOMA 2O7QA 3IGUA 1DVJA 3RLVA 2VFHA 2CLMA 1TPFA 3LLDA 3S5YA 1OG0A 1QPOA 1F6PA 3BO9A 1EP2A 1WOBA 3DBPA 4K8HA 5FEWA 4X9SA 2GUUA 4PEKA 3SI9A 3SFKA 5F1VA 1XUUA 1ZALA 2AQWA 2G5WA 2QCHA 4N9DA 1F05A 1UCWA 3G1SA 1G67A 4KFOA 1VS1A 3W2LA 1YDVA 4BWLA 3CB8A 4UTTC 4XBKA 3M7WA 1BWLA 1TCDA 1XL9A 4KWWA 3A23A 2ATSA 4LV4A 5KSWA 3LXCA 1W5MA 1PIIA 1ZJIA 1I4NA 1TSIA 1K03A 4JTFA 5LZLA 4Y6GA 3A22A 4UTIA 1WV2A 2GOUA 1C8VA 4JN6A 3CM4A 1TRIA 3NQFA 3DFPA 3QW3A 3HG3A 2QCMA 3ANYA 3FYOA 4ZQRA 5KMYA 2NUWA 3QSRA 3QYQA 1G4EA 1TJRA 4O52A 3I7QA 3BK0A 1XBYA 4UFHA 2A1YA 1FX6A 4FF7A 2QCFA 3TX9A 4IMDA 4MKNA 8TIMA 3IVUA 5FF2A 3T7VA 3E02A 4MLJA 3UNDA 2CLHA 1XKYA 2A6NA 3BLIA 4GUJA 1MO0A 3M5VA 1UASA 2A7PA 3LI1A 3NQ7A 3W7RA 2WO5A 3O6CA 5LHEA 3M1ZA 1QO5A 3NQVA 3P82A 4ADTA 3DFOA 4UFMA 2CLEA 3UWYA 4JX4A 2GJLA 3R5EA 5K7JA 4RV8A 4ZQNA 2ZZ4A 1CX9A 1MEWA 3P81A 4K37A 5D32A 3S9YA 1UUMA 5TBOA 2YGYA 4ZMGA 3IIXA 1XC4A 3LXBA 1HG3A 3H53A 1WBHA 3TCEA 1GVFA 3EWYA 2TRSA 1UB3A 5C6MA 4NJHA 3STFA 3BW3A 1J4EA 2ZTJA 3G0SA 4X22A 4TMCA 2GQAA 2EHHA 3EX4A 4TR9A 4XBSA 1OABA 1FWTA 4OQVA 5K9CA 3BARA 3PR2A 4DELA 4I7WA 2Q8LA 3S5ZA 4AAJA 4UFIA 3W1LA 4ZZ9A 5CSSA 1YDNA 2ABAA 1X1ZA 2WOQA 1EPXA 4DF1A 3RNDA 1ZHAA 3QC3A 4XKYA 4IUOA 1KA9F 4K8EA 3TA6A 3VCRA 3HO8A 3LCGA 1DBTA 1F7BA 5E1QA 2QF7A 3L9CA 1K7XA 4O4VA 2QJIA 2V9DA 4CNNA 3OHIA 3KVLA 4MZ8A 3IVSA 2EKCA 4LVFA 3YPIA 2CZ5A 5EMUA 3NPUA 2Z1BA 4WX2A 3DI0A 1Q6LA 4ZQPA 4JTEA 1JRBA 2C19A 1KTBA 2QUTA 3G0XA 4GWEA 4H6KA 1FUYA 3SR7A 3QF0A 5F4WA 3W72A 2R91A 4KFNA 5C2XA 5HNRA 1MEHA 5EYWA 4IOTA 4HSOA 2NV2A 1OYBA 4UFJA 3UY8A 3E12A 3FKKA 4LT9A 5LSMA 4JTKA 1R47A 5K9DA 4O57A 3V75A 3MO7A 3S1UA 1ML1A 4GXMA 1VJIA 4FX7A 3NL3A 3W76A 3G22A 3UYCA 1C9DA 2QAPA 1PE1A 4ZL1A 3N34A 4LS0A 4M6PA 1TTIA 1KFCA 1X1OA 3WJWA 5I3JA 3LCXA 2DP3A 3BG3A 1LRTA 2OCZA 3GYEA 3GZ3A 2BTMA 4N02A 3DFTA 4FNQA 1Y0EA 3VKJA 2VEMA 1N55A 1UBSA 5DXXA 4C1LA 4QM1A 4HNTA 5J5DA 5AN7A 2X2GA 3M43A 2C15A 2RHGA 4EF8A 4M5PA 3BG5A 1F6KA 3U8GA 3FJ6A 1M7OA 4FNTA 1K8ZA 2QDHA 3RMJA 1AL8A 3LHUA 4WUIA 2OMAA 1T99A 3ABQA 2J88A 3USBA 2ZZ1A 1XXXA 5KITA 4LUIA 2FFCA 5KINA 1DJQA 1HL2A 1IGSA 1IXQA 3C4UA 2FB3A 5AOUA 3I7SA 4QQ3A 2FDSA 3DHDA 2ZCGA 1LYXA 3VE9A 4JXCA 3W7KA 1QO2A 2PE4A 1Q45A 4YCPA 1XM3A 3W86A 1DOSA 1LOLA 1Z48A 4ORIA 1SFLA 2OT0A 3C56A 3E96A 4JTJA 3B0VC 3G1DA 3O16A 1LP6A 1P5BA 3GIYA 5DCBA 1YXCA 5I3GA 1I2QA 1Q6OA 4K36A 4NZFA 4UFKA 1H7XA 3L0NA 1LLWA 2ZFAA 3E0IA 2RDTA 4ZQCA 1H63A 1G7VA 1LLZA 3WJYA 1XCFA 3W1QA 4O17A 1KV8A 2A5HA 1G4PA 3NL2A 2AGKA 4DF2A 4QIUA 4XTIA 2V5BA 4CCEA 3O06A 3DFQA 4WY0F 3PBWA 3TH6A 1SZFA 3LCIA 4R33A 3TAOA 3CT7A 3ATZA 3UY7A 4R34A 4N6EA 1WBJA 2YR1A 2BSLA 3LTPA 2P10A 4MZYA 3KVMA 3R89A 3BGGA 3DHFA 3N2MA 2YSWA 3DKJA 4ZQMA 2WQPA 3EB2A 1SW3A 2H8XA 3EKLA 1K7FA 3MP5A 3PWAA 1W56A 1PCWA 4O4WA 2YDAA 3L67A 3THAA 2B0MA 4MLRA 2WV8A 2NUYA 4UR7A 5HUPA 3QPYA 3W2KA 3TXZA 3GAYA 5I3HA 1I2NA 1LORA 3LB0A 1TPEA 2VFGA 3ATYA 1ME7A 1TTQA 4JTIA 3L66A 3NPWA 2V81A 3NR0A 2DZTA 4AF0A 3HPZA 3MHFA 4UTWA 4JTGA 1QOQA 1PCKA 4P2VA 1BWKA 1FXQA 4NVTA 3W1MA 2QJHA 3GNDA 1F2JA 4NUWA 3KXQA 4CQ9A 4UNKA 1VR6A 5GVJA 1GEQA 1FXPA 1OFBA 4LS1A 3QQ1A 3HG5A 3NOEA 3W1NA 2ZA2A 3S1XA 1JCNA 4LNYA 2Z6IA 4FXRA 1OFRA 1MXSA 5G2HA 3RLUA 2RFGA 3G3DA 5KZDA 3TDFA 1ZAIA 5AHFA 3LRLA 2Y70A 1LRQA 3IIVA 2WSRA 3W7OA 1KFLA 3W7PA 1P0NA 2NWSA 1NFBA 1ZCOA 3W75A 3CEPA 4XUGA 1AG1O 2W6RA 5G2WA 3LCFA 5K4ZA 3GDTA 2HS8A 1HO1A 4YXGA 1FCQA 4Y8FA 3HBLA 3NQEA 4NZJA 4TX9A 3UXAA 1O95A 1OJXA 3M9YA 1A5CA 3C52A 3W73A 4N4QA 3V1PA 4O1CA 1OK6A 2WNZA 1LTDA 1RQBA 5EPDA 5K4XA 1ZAHA 4IMGA 1ALDA 4MFDA 3DKLA 5IM51 1GYNA 3T40A 3BLFA 1K7EA 1H1YA 1TV7A 5LNRA 4KFPA 4K7VA 3SW6A 1HO4A 3N3MA 1OX6A 1VQTA 4CQ8A 4DQWA 1C29A 1H61A 3P84A 3WFAA 5G4EA 4FO4A 1OFAA 3TUUA 2VENA 2QDGA 3TSBA 3M5XA 2FPVA 1VYPX 3PB2A 3CHVA 1FBAA 1RZMA 4JDBA 3OG3A 4NNBA 2WNNA 3CU2A 4MPQA 3W1AA 1X7FA 1N8FA 1IIGA 1X8FA 5AYYA 1H1ZA 4CLMA 3TK7A 3W7HA 3NQMA 4O14A 5CG7A 3MW7A 3UWVA 4HNUA 3T44A 1EB3A 2W0UA 2ZZ7A 3EX2A 4E0CA 1G4TA 2WSYA 2BLEA 1PV8A 3INPA 1KLYA 5CGQA 2QEZA 3FFSA 2XN0A 2ISWA 1OVDA 4MY8A 3LXAA 2QCNA 4X2RA 5D2VA 3NA8A 3NL5A 1ICSA 2Y7EA 4K38A 2ABBA 5AC8A 3M16A 4W9TA 1FWWA 1KTNA 1S5VA 3PAJA 2NWRA 1FY6A 5IBXC 4FX8A 4IX0A 2UV8G 4UCGA 2ZYFA 1NSJA 1OX4A 1H51A 1JR1A 3P74A 5CZSA 3CWOX 3W7MA 2OT1A 2E5BA 1O4UA 2GVJA 3G0UA 3NG3A 1W54A 4TIMA 3GK0A 3UD6A 2WPBA 1FCVA 4O15A 2FPYA 4Z1BA 1W5PA 3W2UA 5D09A 4UNLA 1H62A 5HMSA 3PUDA 5U7SA 5DELA 4BR1A 4OE7A 5AHLA 1CI1A 1ME9A 2PURA 3CTLA 2CW6A 1XFBA 1VGAA 2ZA3A 4A2SA 4O12A 1I2RA 4A21A 4AWUA 3NM1A 4GJ1A 3FYPA 2E77A 3I6RA 4ML9A 4JD4A 3S6DA 4AHPA 2V5LA 4WOQA 1M6JA 2J9ZA 4UMAA 1H50A 7TIMA 1F73A 1FDJA 4N9CA 1KFEA 1O94A 3H55A 5AHEA 3FKRA 2W79A 1N7KA 3NQCA 2YFNA 3TQKA 4UTUA 1DL3A 3FS2A 3IGSA 2X1RA 3TIMA 4BWLC 1NF0A 3TJLA 4IMFA 1RR2A 3W88A 1W5QA 2X1TA 3ELFA 3F03K 1K8YA 3C2OA 2BXVA 3DU0A 1D3GA 4LC8A 3EWZA 1ICPA 4RZ5A 4RKAA 1YLVA 2XN1A 4O13A 3GXNA 5KZEA 1LROA 5G5IA 4UIOA 3N14A 1G4SA 2ZRWA 4BI6A 3I7RA 4M7SA 2DJLA 1GG1A 2C1HA 3IIOA 1VHNA 2ISSA 1YADA 3PY2A 3C2FA 4UC5A 4O0ZA 1YPIA 2GQ8A 2E6DA 4O10A 1TPH1 1W5OA 1SZNA 5DLCA 3M41A 3A21A 4JIQA 1UUOA 1WDWA 2HSAA 3L68A 3O07A 4OHQA 1F74A 2YYUA 1E51A 1TREA 4M7TA 2QUUA 4JDYA 4S2CA 1OF6A 2I1OA 1WQ5A 4PL1A 3NL6A 5HUOA 3TSMA 1L6YA 1W31A 3LBMA 4CNPA 4IWWA 2J27A 3LX9A 4NXSA 4AXKA 3W7CA 3THQA 4ADSA 3ZFHA 2Y6ZA 4RXGA 2AAMA 1OYCA 3P60A 1TPC1 4K6AA 2ZA1A 1SW0A 1A5AA 1LOQA 3CIWA 2JK2A 3LHTA 3W6YA 2OX1A 5FF0A 3TQ0A 5G4WA 2ZRXA 4L4MA 3W7GA 2YCEA 3R12A 4QNEA 2QAFA 5LNUA 3DGRA 1LBFA 4E2DA 3GR7A 3K30A 3L0GA 3TW7A 3O6DA 2ISVA 3PULA 4M19A 1I45A 3NAVA 2Y7GA 3W7IA 1PS9A 4N2YA 2G96A 1G6CA 3TKFA 2A4AA 4FNPA 1PHQA 4KKXA 5LKYA 3HG2A 4FEZA 1SO3A 4S1FA 4HT3A 5CPLA 4NNCA 2NV1A 4N9BA 5BNKA 1GWJA 3PC0A 4E38A 2I14A 5BOOA 4JR5A 5KTLA 1NAL1 1EEPA 3CEUA 3IVTA 1GOXA 2EF9A 3N2XA 3PBVA 3UZJA 2IQTA 5F2IA 4JTHA 3PB0A 4LRSA 4JTSA 4PH6A 5BMWA 1GT8A 2ZDRA 1G69A 3F1QA 3EWWA 1J2WA 3HGOA 3N73A 4BFAA 3PG9A 3WK3A 5CZTA 2ZRYA 1GVSA 2KZHA 1OX5A 3IIZA 4Y90A 1PL9A 1K02A 4LTSA 1IF2A 4RZ4A 5SWUA 3UWQA 3EXSA 4QJ1A 4O1DA 5D2TA 3SIZA 3OEXA 2GVLA 3M0ZA 4YCOA 1JVNA 2CFFA 1YTEA 1W37A 2Y63A 3M44A 4N9EA 2FTPA 4EIVA 1SW7A 4OV4A 1KFKA 3LI0A 4AH7A 2H6RA 2DZVA 4MJMA 4PTNA 2RDUA 2CLLA 3L21A 5FEZA 5I3KA 4RCXA 2PRMA 2QCDA 5KZMA 4XKYB 3WJSA 3P61A 4MJZA 3SJ3A 3TROA 1JQXA 5LNWA 1XBXA 4NX5A 3W7JA 4TO8A 3HG4A 3M5ZA 2ZZ3A 1JJKA 2TMDA 1KFJA 3W7DA 2TPSA 5D30A 4KWVA 4Q32A 1JUBA 4ZQOA 3N19B 3H54A 3TFCA 3B0PA 4JX6A 2C0AA 1AK5A 5F2GA 3TNOA 3GLCA 1VHCA 4WXYA 1Q6QA 3S0CA 3DXIA 4MYAA 5FEXA 3B05A 1FWNA 2WKJA 3LOTA 2DZXA 2YXGA 2J6XA 3PUOA 2E6FA 3JR2A 4FNUA 1QDSA 3C2VA 3B06A 3PF3A 3HJZA 2OZ0A 3B03A 3W7QA 1XDMA 5AB3A 2VEPA 4FB7A 1GG0A 3W1PA 1P0KA 1D9EA 1X6UA 3TMQA 3L65A 1DORA 4BI7A 5HULA 1B9BA 2VEIA 3TSDA 2Y88A 4IQLA 5DXYA 3GXPA 4NJIA 4IGHA 3AJXA 1A50A 1OFQA 3MBDA 4FXSA 4XQ6A 3P80A 2R94A 3KVJA 3O05A 4HN4A 5CPNA 2H8ZA 2VFFA 2CU0A 5I3FA 3STGA 3EWBX 3A5FA 4DPPA 5D33A 3F4NA 5HQEA 3W84A 3PM6A 4MUZA 3W70A 2YW4A 1LRNA 3O1NA 1XDLA 4E2BA 2X1UA 3STCA 3NM3A 3JRKA 2BX7A 2ZZ6A 3TR2A 1FDYA 3W71A 3LRKA 4GFSA 1RV8A 4JTTA 4LWWA 3QW4B 1VYRA 1VLIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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