1RD5A

Crystal structure of tryptophan synthase alpha chain homolog bx1: a member of the chemical plant defense system
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
SRPVSDTMAALMAKGKTAFIPYITAGDPDLATTAEALRLLDGCGADVIELGVPCSDPYIDGPIIQASVARALASGTTMDAVLEMLREVTPELSCPVVLLSYYKPIMFRSLAKMKEAGVHGLIVPDLPYVAAHSLWSEAKNNNLELVLLTTPAIPEDRMKEITKASEGFVYLVSVNGVTGPRANVNPRVESLIQEVKKVTNKPVAVGFGISKPEHVKQIAQWGADGVIIGSAMVRQLGEAASPKQGLRRLEEYARGMKNALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the structural basis of the catalytic mechanism and the regulation of the alpha subunit of tryptophan synthase from Salmonella typhimurium and BX1 from maize, two evolutionarily related enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Zea mays
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain, chloroplast
total genus 94
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.8: Indole-3-glycerol-phosphate lyase.
pdb deposition date 2003-11-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1rd5A00
1TV7A 3OA3A 3DGRA 1XBVA 1XFBA 3GAYA 5FEXA 4JTSA 3TU9A 3MBDA 4UCGA 1TCDA 3GYEA 3O6DA 1EP2A 1IGSA 1G4EA 4FNQA 4MFDA 4UTTC 1B4EA 4GC4A 4JYFA 5F1UA 4HT3A 2NX3A 4NJHA 2A7NA 5D05A 2NV1A 4U4MA 4UFIA 5DBUA 1DORA 3P8JA 2X16A 4EF8A 3GR8A 2A6LA 1Z41A 3IVSA 3IEBA 3BV4A 4I7VA 1SPQA 4LC8A 3PM6A 3WJSA 4PFMA 3M44A 2JGYA 5U4NA 3S5NA 1TYGA 4FNSA 1R2RA 1AW5A 2G95A 3LHVA 2VELA 3NZ1A 2GVLA 2BWGA 3CWOX 5AFDA 1YTEA 1QWGA 3M5ZA 5D32A 1TV8A 3SR7A 4JY8A 1QFEA 3N2XA 4UIOA 5LNRA 4MIMA 2V2HA 3LCLA 1LTDA 2R94A 4S1FA 2E5CA 4O18A 3VFLA 3W2NA 2PRHA 1XBXA 3LCHA 5LGXA 3TE9A 3SI9A 4MUZA 4Z0JA 3HOJA 4JTGA 3B4UA 3EXRA 1KFKA 1K8XA 1RQBA 1KM6A 1SQ7A 4DXVA 5U7SA 5LGZA 3NGJA 1O5XA 1LBLA 2CLEA 1UCWA 1GYNA 3MHUA 4AVFA 3G22A 3SECA 2QDHA 4I7UA 3TJLA 1KM4A 3EXTA 3A22A 1A53A 4FNTA 5CPLA 3SIZA 4JTJA 4R34A 1W1ZA 2NUWA 3MP4A 4LUIA 4JEQA 3UWWA 1QO5A 1A50A 3N73A 1VGAA 2CLHA 1A5CA 3W72A 3W2MA 1QPNA 2DZTA 5FEPA 1W5MA 1SO6A 5D04C 4OT7A 3PB2A 4BI6A 3UPBA 3M5XA 3C2RA 3B03A 1YPFA 2ZCGA 3W1XA 1JJKA 3QW4B 2JKAA 4ZMGA 1JQVA 3GDKA 2A21A 3GIYA 1Q6RA 3HPZA 1W3NA 3WK0A 1CW2A 5DCBA 1YDOA 3S42A 1PE1A 3GZ3A 2X2GA 5EA9A 3LRMA 3UWZA 2RDWA 3D0CA 3PY2A 4N9CA 1LZOA 2CZ5A 3C6CA 2C3ZA 5F2LA 3W7MA 3ATZA 4OWGA 1GTEA 3ZFHA 4PL2A 4GNJA 4Z0SA 1XM3A 2XN2A 3LXBA 3TFXA 3W7DA 3KRUA 3QPZA 3HJZA 5BNKA 5HJLA 2HTMA 2ZTJA 3NM3A 4MZ1A 4IMCA 4YL2A 5CZTA 1VHCA 2WNZA 1ZAJA 4RZ4A 3M9YA 3W7OA 3LCGA 1IF2A 3W23A 3W86A 4KWVA 3TJXA 1A5AA 4CCEA 5DN1A 2DU2A 2JGQA 4UMCA 5FF4A 3WJZA 4AF0A 4NZJA 4MPQA 2Q8LA 4WY0F 3LHYA 5DXXA 2A85A 3RU6A 5AYYA 5EMUA 3THQA 3W73A 1OK4A 4ZQMA 4IMGA 1DV7A 1R2SA 1FUYA 4O52A 2YX0A 3B05A 3BK0A 4GJ1A 3FIGA 3G1DA 1X1OA 3G1HA 3HQ1A 4JIPA 1W5OA 4UTKA 1KA9F 2C14A 4FNUA 5DCDA 2Y6ZA 1H1YA 3LV6A 3VKJA 1KM1A 3BVJA 2C13A 2ZRYA 3G3MA 1JCJA 5D30A 4OHQA 5KZDA 4U28A 4JTHA 1QO2A 2W6RA 1WV2A 2QCCA 1LDCA 1FQ0A 3G1YA 5DBTA 3F1QA 1UJPA 3DH7A 4RZ6A 1ADOA 3G1FA 4ICNA 1T0OA 2ZA3A 5G1TA 3IGSA 1SUXA 2YPIA 3O6YX 1FWRA 4O8RA 2EPHA 3W7CA 3W7JA 3VE9A 4BWLC 2CLLA 3GDMA 5L9FA 2OCZA 1OYCA 4K6AA 4TU1A 3NQDA 1TSIA 2E77A 4NJGA 3S1WA 2I14A 1TIMA 2NWRA 3A5FA 3QEZA 4JYEA 4NT0A 3C2VA 4HSNA 3NQ6A 3P67A 5C55A 2CWNA 1PHQA 3NZRA 2ATSA 1W54A 5AYXA 1G4SA 2QCGA 3NR0A 2J24A 4N9DA 1MZHA 4TO8A 4M6QA 2D73A 2ZTKA 2FB3A 4JTUA 5F4WA 4O4VA 5SWUA 1G6CA 3U2OA 1DQWA 2B4GA 2FPYA 2OZ0A 2V30A 2WNQA 2OT0A 3NDOA 3W7HA 1K7FA 1LORA 5LSMA 4ZQCA 4OGZA 4LC6A 3GR7A 5AHMA 1I2PA 4OV4A 3O6CA 1QNVA 3KVKA 5KITA 5I3JA 5D38A 2ZZ2A 4LVGA 5LZLA 5BOOA 5HINA 1LLZA 4GUGA 1ZY9A 3PBWA 3NM1A 1M7PA 2CLOA 2E68A 2FQIA 3O63A 2X1RA 2VXNA 4Q4KA 1FDZA 2XN0A 3NO5A 5KTLA 3W7PA 2NUYA 3R2GA 2NX9A 5CPNA 4ONVA 4N2YA 4NZFA 1TTJA 4JTIA 4WXYA 1XL9A 3DHDA 2EGZA 3C2FA 5C5YA 3NQCA 1P0KA 3W7IA 4BK9A 2CLIA 3P74A 2C0AA 4ZVJA 3C0JA 4RXGA 4AHQA 2YCEA 4QITA 4A21A 2OX1A 1KFBA 1VPXA 2C15A 1KLZA 3LOTA 4NX0A 4FNRA 1H61A 2RDTA 4WOQA 3CTLA 4O57A 2J27A 3GXPA 4OQVA 4S2CA 2Y7FA 3DZ1A 2V5BA 4UR7A 2HS8A 1RQHA 3W71A 3LI0A 3IGUA 4RR4A 2JBMA 1YDVA 3QQ1A 2TPSA 2ZZ1A 4Y90A 3FFSA 1FXPA 2Z1BA 3SW6A 3NQ8A 3G3DA 4ZZ9A 3PVFA 1V7YA 1M7OA 2AGKA 4IMEA 4M7TA 3UD6A 4Z1AA 3GLCA 4O54A 4MKNA 4UFJA 3M41A 1K7XA 3NPVA 1LCOA 1L6WA 1LOQA 3LLFA 4O0KA 1H60A 4C1LA 1KM3A 3T4CA 4E2BA 5ABTA 3QH2A 2ZZ5A 4EWND 3KVLA 4M6VA 2CZEA 3L21A 3IV3A 4NXSA 4X9SA 3W1TA 3C56A 2I1OA 3HF3A 4AF0B 1DHPA 4X2RA 4K8EA 3KAOA 3W1MA 1BWKA 3QFEA 4O14A 5DY2A 2X1TA 3CEUA 3LHUA 2V9DA 3PUEA 2QCNA 5A5WA 1NVMA 5FF0A 1S5TA 1JUBA 2VOMA 1TQJA 1TPVA 1LOSA 1JCXA 4E38A 3T40A 3H54A 4D2JA 3P84A 3I7RA 3S1VA 4UC5A 3ABOA 4GUJA 4ZQOA 5CSSA 4UR8A 1LLWA 3C52A 5D37A 1XI3A 3BG5A 3T44A 5CPMA 2GJNA 1P4CA 2NV2A 3QM3A 2G97A 5F4XA 1SFLA 5CKSA 3TMQA 1G7VA 1ZHAA 2AAMA 3BARA 4GXMA 3W7RA 4K37A 2E6YA 3CEPA 1TPEA 3MHFA 3OVPA 1OFBA 5E1QA 3DXIA 4X3ZA 1N55A 3RK8A 2WSYA 1O95A 3CIWA 3QSRA 1K02A 3DBPA 1J4EA 1ZNNA 4A3UA 1J2WA 1TREA 2H6RA 2ZZ4A 3DHFA 4CCDA 1H7OA 2WKJA 4LU0A 2Y61A 2C6QA 3FYOA 3W88A 5K3VA 2GQ8A 1TTQA 4AHPA 5HWNA 3N34A 5FF3A 4ZQRA 4XKYA 3TR2A 1NF0A 2VFHA 5DLCA 1RD5A 4JTLA 1D3HA 1S5VA 3S5OA 1THFD 3RLVA 4RKAA 3MWAA 1AK5A 2DZWA 2O7SA 4CLMA 3U6WA 3NQEA 1T99A 3G0UA 4O4WA 2YDAA 3NPWA 5AHFA 3H53A 4FNPA 4NQ1A 3QSTA 3FYPA 2A2IA 2BZNA 3PAJA 4ZQNA 1KM0A 2ZZ7A 1KLYA 1R30A 1SSGA 3I65A 3TMLA 2TYSA 1S5WA 1AL7A 4RJEA 3I7QA 2B7PA 3QZEA 1GZGA 5LNVA 4QNEA 5C2XA 4JIQA 3E12A 1H50A 4MFEA 3HGRA 1FY6A 4JDBA 5K4XA 3Q58A 2JKPA 2WV8A 4OBTA 2H90A 4AB4A 3I7SA 2Z6JA 3HPXA 4K7YA 4Y9AA 1C29A 5CGQA 2Q3RA 4ADSA 4JX6A 1HL2A 3TH6A 3C8FA 2A5HA 5G1YA 3P8IA 1IIHA 1ZENA 3S8HA 1EUNA 1W37A 1TPWA 3A23A 3NAVA 4JTFA 1SW3A 2JK2A 3G1XA 3PSVA 1LBFA 5IBXA 4EVZA 4YCPA 2C16A 3BLFA 1I2OA 3KXQA 1OHLA 4DF0A 1FWWA 3EKZA 5HWMA 1EIXA 1YDNA 1OYBA 1DL3A 1E51A 1LBMA 2VEKA 3DAQA 3W85A 4BI7A 3FOKA 3PBYA 2V2CA 4MOZA 1QPOA 3G8EA 4N6EA 3MO7A 1KM5A 3E96A 1KV5A 2B7NA 4WD0A 4UTTA 4R7JA 4LUJA 1GG1A 1JRCA 1H7PA 2G5WA 2PE4A 3PWAA 3IIZA 4UXDA 1PCWA 1OFDA 3UZJA 3SZ8A 3QW3A 5CG7A 3NL3A 2CLFA 4JNMA 4MY9A 5FEWA 4FHAA 4NUWA 3LXAA 3S1XA 3UWQA 4NNAA 2TMDA 3TDFA 4HPJA 3EX2A 2Y63A 2YFNA 4M7SA 4AMAA 2CW6A 3S5ZA 1XKYA 1PCKA 3ABRA 3L5AA 3P81A 1U5JA 3WK3A 3MI2A 4GFSA 1ME7A 2P0OA 3A21A 3CB8A 4KWWA 4ORMA 1R46A 3FJ6A 4M5PA 1YLVA 4O1DA 4OV9A 2DJLA 1GJPA 4H3DA 4A2RA 1W5NA 2XN1A 2PC4A 4O1AA 1NFBA 2A7RA 4X22A 3NVTA 3SSJA 2J9ZA 5G5IA 3KX6A 3M7WA 4HSOA 4MY8A 2DJXA 4FXRA 4TR9A 3LTYA 2GUUA 3FJLA 1V5XA 3KVJA 4XBKA 1JULA 1SZNA 1QPRA 1O60A 3E0IA 2XFWA 2UV8G 3GKFA 2V5LA 4L4MA 4UFHA 3G0SA 4Y6GA 2Q3OA 1HO1A 4P2VA 2VC6A 3KFTA 3NPXA 3N9RA 3TQ0A 3W3OA 1Q6QA 5F2IA 1FDYA 2NWSA 3NOEA 1W3IA 3CLMA 1SZEA 2FPVA 5A8GA 2KZHA 3IVTA 3Q37A 4UTWA 4CQAA 5LNUA 3C3NA 3ZS4A 1KFEA 3ZR4A 4LS1A 3HG3A 5D2XA 2ZYFA 1EPXA 2LLEA 4LVBA 1UUOA 3MJYA 1JUKA 4R33A 3NPUA 1I8JA 2ZFAA 3UWVA 3T55A 2WNNA 4IMDA 3CQ0A 3TW6A 4PEKA 5AHEA 3W2LA 4AXKA 1Z42A 5F4SA 1W0MA 4AH7A 1KFCA 1SU5A 1OVDA 1TJRA 2GOUA 1PV8A 2R14A 1H51A 3HGJA 3KRZA 3TIMA 1JCMP 1H7XA 2FTPA 1Q6OA 2ZRVA 4K36A 2Y62A 3DKLA 5HNRA 5KZMA 3CU2A 3L9CA 2ZRUA 3FKRA 1MEIA 4POCA 3M6YA 1CI1A 2ZZ6A 1HG3A 5D02A 3R12A 2ZRZA 2YR1A 3L2IA 3W76A 5D09A 4LRSA 5HMSA 4JD4A 4XKYB 4FX7A 1ME9A 3N19B 3EX6A 2E6DA 2VEMA 1GWJA 2Z0IA 4LOCA 4E0CA 4I7WA 4K38A 3F4WA 2QUVA 4WOZA 3NA8A 4FXSA 5G4EA 3QF0A 1TPC1 2F84A 3QMRA 3DENA 2X1UA 3VNDA 3C2OA 3E9AA 5BMXA 2QDGA 4NNBA 1FWNA 3P80A 4QISA 1WDWA 4JS3A 2NXIA 3L5MA 3UPWA 3W7GA 1TPH1 4MLRA 4QNWA 1SSDA 1SR9A 1F6KA 3M47A 3EX4A 5KSWA 1KBIA 3P62A 1O4UA 3YPIA 4LWWA 5HULA 1F73A 5CZJA 3OEXA 4UFMA 4LNYA 3NYZA 3N14A 4RZ5A 3M16A 3PULA 1H7NA 4XBSA 3G24A 4IX0A 3TX9A 1QPQA 1EWEA 2G96A 3TCEA 3BW2A 2F7FA 3LI1A 4OU1A 1L2UA 1VJIA 1XUZA 1JUEA 4DPPA 2NUXA 4JR5A 1LRNA 3E49A 5EL1A 4XTDA 3S1UA 3HO8A 3Q94A 4NU7A 5AC8A 3QJAA 1OFOA 3IVUA 3C2EA 2DP3A 1VCFA 1FCUA 1LROA 1I2NA 1DQXA 3P82A 2QUUA 1EB3A 3FEMA 3L0KA 2E6AA 3TA6A 5J5DA 1DKWA 1Z48A 2CLMA 2P1FA 4BF9A 4WXZA 2EAWA 3P61A 1WAUA 3GX9A 1DOSA 1W8SA 2BSLA 3LRLA 2FLIA 5I3HA 2FIQA 3STEA 4XZ9A 4BWLA 3HGOA 1HTIA 3INPA 8TIMA 2J9YA 3P5ZA 1Q3NA 1F76A 3UWUA 5DY3A 5L6UA 3PBVA 3NQGA 2FDSA 4WJEA 4CQ8A 1ZAHA 3PC0A 2HS6A 4JX5A 4CNPA 1VQTA 1WQ5A 4O10A 4MZ8A 3GDLA 2C18A 4NXKA 3NQ2A 2GQ9A 4EF9A 3STFA 5I3FA 4A2SA 2WO5A 3A24A 1QDSA 3RNDA 7TIMA 4DO5A 4DELA 3W70A 1O5KA 4AWUA 2EF9A 4UUIA 1IIGA 2NXHA 2R8WA 3W2JA 4QAIA 2J88A 3G18A 4DO6A 1WOBA 5IM51 1AMKA 3BO9A 1GEQA 2EHHA 4LVDA 1PVNA 1KTCA 3QPYA 3LERA 4MJZA 4FF7A 5K9XA 4HPXA 5AHLA 3QMTA 1KFJA 1SW0A 1BTMA 5HR6A 3T7VA 4TMCA 1JCLA 4J9JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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