1RV8A

Class ii fructose-1,6-bisphosphate aldolase from thermus aquaticus in complex with cobalt
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
305
structure length
297
Chain Sequence
MLVTGLEILKKAREEGYGVGAFNVNNMEFLQAVLEAAEEQRSPVILALSEGAMKYGGRALTLMAVELAKEARVPVAVHLDHGSSYESVLRALRAGFTSVMIDKSHEDFETNVRETRRVVEAAHAVGVTVEAELGRLAGIKDALLTNPEEARIFMERTGADYLAVAIGTSHGAYKGKGRPFIDHARLERIARLVPAPLVLHGASAVPPELVERFRASGGEIGEAAGIHPEDIKKAISLGIAKINTDTDLRLAFTALIREALNKNPKEFDPRKYLGPAREAVKEVVKSRMELFGSVGRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Induced Fit Movements and Metal Cofactor Selectivity of Class II Aldolases: STRUCTURE OF THERMUS AQUATICUS FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE.
pubmed doi rcsb
source organism Thermus aquaticus
total genus 120
structure length 297
sequence length 305
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2003-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1rv8A00
4LV9A 3QPYA 1A5SA 1FWSA 1B4KA 3IVSA 4HHPA 1YDNA 4NZJA 3CEPA 2R8WA 2HS6A 4FNTA 1SFJA 2F84A 3P62A 3P8JA 4S2BA 1KA9F 1TPWA 2FPYA 3NPUA 5K2ZA 3W7KA 5LNRA 5AC7A 4NJHA 4JTLA 5BOOA 3MBDA 1OYCA 3KRUA 4UTJA 1L6YA 4CQ9A 4XWUA 1VRDA 3M6YA 5C54A 3CTLA 3VE7A 4I9AA 3R8RA 5D2TA 4JR5A 1P0KA 4OBTA 3W1MA 2E5DA 4X9SA 4AHQA 3HB9A 1ZJIA 5IBXA 3IV3A 2QCNA 4XUGA 1V5XA 3A9IA 2Y7EA 3PF3A 4TX9A 4OWGA 1TRIA 3NZRA 4FNRA 3N19B 3MWAA 3WJZA 4WY0A 5K4ZA 4PA8A 4O14A 3STGA 4LWWA 1HO1A 3S5YA 3ABQA 3W7HA 3LCLA 4LNYA 4K39A 4RLIA 2V82A 3EEGA 2H3DA 1NFBA 3HGOA 4OQVA 1W5NA 1ME7A 1TPH1 3B4UA 1N55A 2DP3A 2G96A 3BLEA 5HWNA 5D05A 2XN1A 3Q2DA 5K9DA 5T26A 3NOEA 3PR2A 5CSSA 4OT7A 1K8XA 1S5TA 1WOAA 3G0UA 5DELA 2X1SA 3MBFA 1F5ZA 3LV5A 3B06A 2OZ0A 4O52A 4W9TA 3EX4A 4U28A 3USBA 4A29A 3G1VA 4X3ZA 2ZDRA 3LCGA 4N2YA 5G2WA 1H1ZA 4Y6GA 1KM2A 1ZENA 2NWSA 2FPTA 3G3MA 4O0ZA 4S1FA 3W2UA 1ICPA 1JUBA 4CNOA 1R30A 2JKEA 2P0OA 1H50A 4R53A 5HJLA 1VCVA 3VKJA 3HIJA 2DORA 2A2IA 3M16A 4O0KA 1VLWA 3PSVA 2ZFAA 1EB3A 4Y8FA 1EPXA 2C0AA 3ATYA 1C8VA 1PHQA 1OF8A 1GTHA 3NQAA 4AWTA 3OIXA 5CPOA 2VC6A 1LP6A 1G4TA 1KLYA 2ZRYA 3W7EA 1I8JA 4IOTA 1TIMA 1EIXA 1Z42A 3L0NA 4QJ1A 1OFPA 3MMTA 3CU2A 2ISVA 3Q94A 3A24A 4J9JA 3KFTA 4TIMA 1X8FA 2CZFA 1XL9A 3A23A 3G24A 4WY0F 3W72A 3B05A 4WY0B 2X16A 3WJYA 1OYAA 1TTJA 3N2MA 5AHFA 3KRZA 1TV8A 3RK8A 1W5PA 3A22A 3IVUA 1VYRA 4PFMA 3QJAA 5HR6A 3MHGA 2X1UA 4IMEA 4JX6A 3C56A 4Z0SA 3W6YA 4FXSA 1LRQA 3I7RA 3LRLA 4GJ1A 4HSNA 4YXGA 5DBTA 2YZRA 5SWUA 1WOBA 4LVDA 4PC8A 1MZHA 2CZ5A 2QKFA 1SZGA 5HMSA 1ML1A 3QPZA 1EUAA 4P2VA 5CSRA 5DXXA 2BLEA 5I3IA 5FEPA 2QJIA 5FF0A 3W2NA 1CW2A 1D3GA 1DVJA 2RDTA 5DCBA 1QPRA 1QO2A 2RDUA 4JTHA 2WPBA 4GUHA 1G6CA 3UPBA 1LRTA 2NX1A 4HNTA 1P5BA 2YXGA 3CC1A 1KM4A 3AO0A 3C2FA 1XXXA 2ZYFA 5FEZA 2TSYA 2J24A 1M7PA 3H54A 1F6PA 3TJLA 4NZFA 2FQIA 3T55A 1LOQA 3UNDA 2G95A 4UFJA 1ICSA 2X30A 3W75A 1PIIA 2VENA 1MXSA 5EY5A 2PRMA 4BI6A 1VH7A 4EVZA 3G1HA 3LI0A 2ATMA 1H7PA 2HS8A 1IXOA 1DQWA 1KFCA 3L0GA 2CLKA 1QWGA 4ZQPA 2FLIA 4ORMA 3BG3A 1TPB1 1OFOA 3QMRA 1GYLA 3B04A 5L6UA 3M5YA 4HNUA 1OFDA 3P84A 4AEOA 2E77A 3LV6A 4AWSA 2CLHA 1UCWA 1F76A 1RV8A 5HQEA 1Z41A 4LRSA 3ZWTA 4YCOA 2C15A 3TCEA 3GK0A 3HGRA 4MJMA 4Z1CA 4BR1A 2C13A 3R5EA 4BWLC 4UNLA 3WK2A 3TA6A 3TXZA 3EX1A 3M5VA 3MYOA 5D2YA 4U4MA 4O1AA 3TK7A 4K8HA 4ADUA 4DEFA 2ZZ5A 3L65A 3B8DA 1TTIA 3GDTA 4QNEA 3E02A 3LLFA 1ZY9A 1KFBA 3I68A 1GEQA 3MP5A 1GYNA 2H8XA 3QFEA 4AXKA 4LS1A 5AHMA 3LXCA 3WK0A 3FYOA 3GDKA 3NEVA 1B57A 1P4CA 2A7NA 4LOCA 4NJJA 1QDSA 3KHJA 4YMZA 3SJ3A 3MHUA 1JCNA 3GB6A 5GVJA 5I3KA 2Z2UA 3BW3A 3UWZA 3DU0A 4KKXA 2ABAA 4CLMA 3E96A 1DOSA 3DFOA 1EEPA 3VCRA 3R13A 4CQAA 5H2ZA 3SZ8A 3UY8A 1SO5A 1THFD 1Q45A 5K4XA 5HNRA 2QCDA 4UTTC 2Q3OA 4FO4A 4CNNA 4JYDA 2JGQA 4EIVA 1W5QA 4NJGA 1B3OA 1B9BA 1OVDA 2FB2A 2H6RA 1YLVA 3TAKA 1H7NA 1HFBA 1VQTA 2ABBA 1K02A 4RZ6A 1KTBA 1OX6A 5C55A 5A8GA 1LYXA 3G22A 1ME9A 1VC4A 3M44A 2E6DA 1BWLA 3EXSA 3BK0A 5G1YA 3RFAA 2A4AA 3OVPA 3LOTA 2ZRUA 2I14A 2JBMA 2OCZA 3DKLA 3ANYA 2TYSA 1FDYA 1JVNA 2RKXA 1XC4A 3FS2A 3M5ZA 4FNSA 3HGSA 3TMLA 3LX9A 3SR7A 2WOQA 3TC7A 2X2GA 2A0NA 3W7MA 4JS3A 3M1ZA 3W7IA 3W7OA 1KTNA 3LTSA 4AHPA 2NXHA 2NV1A 2O7QA 4QQ3A 1R2SA 5ABTA 4DPPA 4MZYA 2DZUA 2YW4A 1F05A 1KM6A 4NQ1A 4UTIA 3LBCA 1YPFA 2Y61A 3HPXA 1PL9A 4P61A 3TXVA 3JR2A 4RXFA 3UD6A 2YYUA 1SPQA 1AMKA 5DCDA 2YPIA 4UUIA 3NDOA 5K3VA 2QCDB 3LCFA 1FQ0A 2P10A 1D9EA 1W1ZA 1XDLA 3IIZA 4IMDA 5EA9A 4LVAA 5LSMA 2AGKA 3GKFA 4ZVJA 1WV2A 3O05A 5C2XA 3QRHA 4UMAA 2YR1A 3ABRA 4GE8A 2ZTJA 3GDMA 3W7GA 2Y88A 3PUOA 4TO8A 4GUIA 4JY8A 3PBVA 1LOLA 3WK1A 2JK2A 1GG1A 4K36A 5FF2A 3W73A 4RXGA 3IVTA 4AH7A 3TC6A 3W76A 3IIXA 1HL2A 2CWNA 4JDYA 3NQ8A 3ZFHA 5IBXC 1IXQA 1G69A 2DZVA 2GQ8A 1DORA 3RLUA 1N8FA 4JD4A 4MZ1A 1T8XA 5D04C 1GOXA 1LOSA 5CPNA 4IJBA 1WBHA 3PM6A 1X1OA 4GXMA 1UBSA 3QSRA 4UFHA 3B0UX 1W54A 5FF7A 1UASA 4RJEA 4JEQA 3HG4A 2FPVA 1FCQA 3W7QA 3M41A 4MFEA 1TRDA 3NQVA 3PS7A 1W0MA 4LVBA 1OFQA 3TMQA 4JTIA 1U83A 2DJLA 1XM3A 3TSDA 1JQXA 2ZZ4A 1RQBA 1QPOA 3NQ7A 1I2NA 1FXPA 1GQNA 1PCWA 4N9CA 5AHNA 4I7VA 1RQEA 3BLIA 4JNMA 2QCCA 4Z1BA 3NG3A 4A2RA 3S9YA 5HULA 3DFNA 3NPVA 4Z0JA 3M7WA 1LCOA 3NQDA 1O94A 3PB0A 3QH2A 3S5OA 4JXCA 1SSDA 5LKYA 5LGXA 2C6QA 1VHNA 3S42A 1DHPA 3MI2A 3N34A 3GXPA 3EXRA 4N6FA 1KFKA 4RR4A 3CHVA 1H7RA 4YWIA 2B7OA 1FXQA 1HTIA 1GVFA 1JUEA 1Z48A 4GRSA 4O11A 4WUIA 4XKYA 1IXPA 2QCLA 1K7EA 3T4CA 5DLCA 3EWZA 5FEXA 1PCKA 5F2GA 3FOKA 2B4GA 2ISWA 4UCGA 5LNVA 3GLCA 1BWKA 1SZEA 3NAVA 4JDBA 4M6QA 3DHFA 2BX7A 4MPQA 4FX6M 3EWUA 3OG3A 3BW2A 3KXQA 4ZQRA 3QMTA 4ML9A 1RD5A 2J9YA 2VFGA 4MVAA 2DZXA 5AYYA 2Z0IA 3M43A 1DQXA 1QOPA 1WBJA 4O57A 3STEA 1ZAIA 3HPZA 3B0VC 3G1FA 5LZLA 2Y70A 5LGZA 2ALDA 1JUKA 4DF2A 1YTKA 4UR8A 5KZEA 3OBKA 1OFRA 1FBAA 3INPA 4UXDA 3TQVA 4JTKA 1DJQA 2V5LA 1KM0A 3UY7A 3IGXA 4FXRA 2YSWA 1LDCA 2ZA3A 1SSGA 3LERA 5EPDA 3P82A 3W2LA 1JCYA 4MZ8A 5FF3A 3C3NA 4JTJA 2Q8ZA 1OX4A 4G1KA 2CLEA 4PODA 3UWYA 3BARA 1R2TA 1SZFA 1XUUA 1JULA 1RVGA 4Z08A 4NVTA 3W1AA 4ZQMA 2A7RA 4JX4A 2YFNA 4IPIA 1UJPA 4XKYB 4OHQA 1EA0A 4LUJA 5K7JA 5IM51 5EKYA 3EX2A 2VEMA 2G5WA 3DBPA 1DV7A 2OJPA 4D2JA 3P60A 2Y85A 3TFXA 1HUVA 3E9AA 2CW6A 4EF9A 3TDFA 4M7SA 1Z44A 1YTEA 3HG2A 1OJXA 5C5YA 5I3FA 4UTHA 4UFLA 3PWAA 3E49A 2QUVA 4E2BA 3W71A 2EKCA 1SW7A 3W1NA 3L2IA 1KM3A 3C2VA 1P0NA 1GVRA 1XBZA 1RR2A 5F1VA 3W9ZA 1G67A 1OK6A 5CG7A 3LCIA 1LROA 3PBWA 1LRNA 2RFGA 3DKJA 1ONRA 2NV2A 5L9FA 4M7TA 4MIMA 2GVGA 4MLJA 3PULA 3UQNA 2ZA2A 4K7VA 1AW5A 2YGYA 2C19A 3T7VA 1CX9A 1R46A 1TYGA 3HG3A 1Q6RA 2FIQA 2QCFA 4O4WA 5AC6A 3OEXA 4A22A 2ZQ0A 1EP2A 4WZHA 2Z6JA 1ZAJA 1X6UA 4TR9A 1A5AA 2QR6A 2QCMA 3LHTA 1KM1A 4WJEA 4HNVA 2DZSA 1K8YA 1OX4B 3S1XA 2CZEA 1Q6QA 3P5ZA 2A6LA 5FESA 4HT3A 4GWEA 5D02A 3E0IA 1ZFJA 3G0XA 1K7XA 2ZBTA 1GVQA 1I4NA 1SO4A 2X1RA 2WSYA 3W7JA 1X7FA 3O8AA 4XBKA 5F2MA 4L4LA 1YPIA 3QEZA 1OF6A 3L67A 3GR7A 4IX0A 3MP3A 2C1HA 5E0KA 2FB3A 1TPC1 1O5XA 4GUJA 1K3UA 2I1OA 4JN6A 4GUFA 2Z1BA 3DI0A 2QAPA 2VEIA 3N3MA 2CLFA 4JYEA 1KV8A 2GPTA 1O4UA 1JJKA 1OHLA 3LB0A 5D30A 4ADTA 2J6XA 1O5KA 5G5IA 4M6PA 5D33A 1H1YA 1KBIA 4O1DA 2CFFA 4GUGA 3NL6A 3LCHA 3PUDA 3C2OA 2BTMA 1JR1A 1C9DA 4E38A 4NJKA 4AB4A 1ZCOA 1M6JA 2EHHA 1GZGA 3W2JA 1TQXA 1XBVA 1L6SA 3L5MA 2ZA1A 3TJXA 2GQAA 3LM7A 5LNUA 1AK5A 2RH9A 1JRCA 4O18A 3O16A 3BO9A 5LNSA 2EAWA 3FIGA 1SW3A 4GC4A 2YCEA 4LUIA 3C2RA 1VCFA 3HOJA 4FNPA 3QW3A 4OGZA 2GOUA 5H91A 4ZQOA 1M5WA 1MEHA 2ZZ2A 4PEKA 3W7DA 3FYPA 1HO4A 4HN4A 4JTFA 3MW7A 1FX6A 4FNUA 4JIQA 3W3OA 3NPWA 1LZOA 3EX3A 4FHAA 3UWWA 5K9CA 2OT0A 3W70A 2IQTA 5D38A 4Z1DA 5K9XA 4YCPA 3P80A 1DBTA 3STCA 1VPXA 1H62A 5F1UA 1SUXA 3L66A 3G0SA 4NXKA 3THAA 1TSIA 3EKLA 4ADSA 1VHCA 3CWNA 3MYPA 1TMHA 3NQEA 4LY8A 4O10A 1KW1A 3A21A 4I7WA 4KFOA 4O1CA 1W5OA 4LS0A 4NNAA 1TPUA 4WOQA 3SFKA 2C3ZA 3SGZA 1XFBA 5I3HA 1ADOA 1VJIA 3M0ZA 3HGJA 4JIPA 4DF1A 1BTMA 1SR9A 3NGJA 2PRLA 4O12A 3V1PA 1EWEA 4IWWA 2GVLA 3TFCA 2W6RA 5KTLA 1TREA 6TIMA 3MHFA 2B0MA 2HMCA 2O7SA 3RLVA 1SFLA 4HKPA 1I2OA 5KZDA 3NPXA 3FKRA 3QZEA 1W31A 3P7YA 2QJHA 3DENA 1G4EA 2YX0A 3M9YA 5EL1A 1VLIA 2WNQA 3NVTA 3PG9A 3TX9A 4M6VA 4NX0A 1LLZA 3KVMA 2VFEA 4NU7A 1FWWA 1WQ5A 4O1BA 4CQ8A 1R2RA 4UIOA 4XZ9A 3M47A 2LLEA 3CB8A 3M5XA 2WO5A 3VE9A 1FCVA 2VXNA 8TIMA 1S5VA 5G2IA 3LRKA 4DBDA 5KINA 4FIQA 3TR2A 2ZRXA 3RNDA 1GTEA 5I3GA 3SGUA 1H60A 3UXAA 3IIOA 3TKFA 5CZ0A 3HMJG 1A5CA 2OT1A 1QR7A 3W85A 3W1RA 3TQKA 1JQVA 1MO0A 3EKZA 4QITA 1LM1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2RDX A;  1A5S A;  3PK7 A;  1YDN A;  4GY1 A;  3ZJ7 A;  2HDJ A;  4PUM A;  1UHV A;  3P62 A;  3P8J A;  4S2B A;  2FPY A;  1B2Y A;  2Z1W A;  5AC7 A;  4HK5 A;  3CBW A;  1E1C A;  3PJX A;  3GIP A;  2YL8 A;  1OYC A;  4E8D A;  4ZXO A;  3FYY A;  2GK1 B;  3I4K A;  2IKG A;  3BAK A;  2WCS A;  3D3A A;  1VRD A;  4ZOB A;  5D4Y A;  3DG6 A;  2DUX A;  3SN1 A;  3CLW A;  5D2T A;  5AZ0 A;  1CGU A;  3GHT A;  4X9S A;  3WF1 A;  1UML A;  1TCM A;  1DTN A;  5JVL A;  1E6Z A;  5IBX A;  2NQH A;  3QR0 A;  3A9I A;  2Y7E A;  4F0M A;  4OWG A;  4JL2 A;  3NZR A;  2WZM A;  1MDR A;  3MWA A;  4PA8 A;  5HNT A;  2BVW A;  1MYR A;  3UES A;  4PMV A;  3S5Y A;  2X41 A;  4HME A;  1CT5 A;  3F4V A;  2V82 A;  3W02 A;  2H3D A;  1NFB A;  3HGO A;  2X2Y A;  1IEQ A;  4PCP A;  2XVP A;  3B4U A;  4AD4 A;  2DP3 A;  5FIP A;  3TOY A;  5D05 A;  4DWS B;  3NOE A;  3PR2 A;  5ABG A;  4OT7 A;  3COT A;  4FMV A;  3G0U A;  3P3B A;  4O52 A;  3DG7 A;  3USB A;  3GTF A;  3LCG A;  2FFI A;  5G2W A;  4OIF A;  4Y6G A;  3UXI A;  2YDS A;  4NZ1 A;  5CC3 A;  3W2U A;  3WQF A; 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