1SFLA

1.9a crystal structure of staphylococcus aureus type i 3-dehydroquinase, apo form
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
236
structure length
230
Chain Sequence
HVEVVATITPQLETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQFENVTVDQVAEMITKLKDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVIISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title Crystal structures of Staphylococcus aureus type I dehydroquinase from enzyme turnover experiments.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 82
structure length 230
sequence length 236
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2004-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1sflA00
2GJLA 1D3GA 1OHLA 1YTKA 4WD0A 1G4EA 2NLIA 2HTMA 1P1XA 3CHVA 4JTUA 3FJLA 3EWUA 2VKZG 4O57A 5G2IA 1LRNA 1J4EA 2CLMA 2Z0IA 1JJKA 3GXPA 3C2FA 1VGAA 2GOUA 2YFOA 3FLUA 2NV2A 5FEXA 1XBZA 4JNMA 4XQ6A 3CWOX 5AFDA 3PM6A 3CC1A 3P5YA 4KWWA 2RKXA 1HFBA 4YL2A 4DBEA 3LERA 4TU1A 5LSMA 4O12A 3BLFA 3CEUA 3C2OA 5F4WA 4E38A 2OX1A 3EKZA 4CNNA 3GAYA 2WNZA 3CEPA 1JCLA 4EIVA 1YPFA 3PSVA 1RD5A 4YCPA 1KFLA 5K2ZA 1HO4A 3NL3A 1SW3A 1KFJA 4WUIA 3W7DA 5AYXA 3BGJA 4WQ6A 1VLIA 4UFMA 3SFKA 3LI1A 3ZS4A 4PH6A 3LBCA 1E51A 4IGHA 1A5AA 3SGZA 4R53A 1MO0A 1OX4B 5LKYA 1WOBA 3O1NA 4UTIA 1LP6A 1XKYA 3NM1A 4LUJA 1FCVA 3G0UA 2G96A 3M5ZA 3CT7A 1FCBA 2J6XA 3TFCA 2O7SA 3W7IA 1EUNA 1R30A 3GKAA 4R7JA 5D2TA 4PL1A 2A5HA 2BSLA 3G1YA 1OFEA 1RQHA 4WZHA 1W5OA 2CFFA 1SO4A 2VEPA 1FWNA 2VEIA 3TQ0A 5AYZA 5IBXA 1QDSA 5EBUA 4BI7A 3LRKA 2DZSA 3RLVA 4N02A 3W7RA 3PUOA 1K3UA 1KFKA 3W1AA 1G4PA 1SO6A 4AWUA 3HMJG 5G2HA 4M6QA 3O05A 3QQ1A 2X2GA 3LCHA 1WAUA 5CPMA 1YPIA 4ZVJA 5HWJA 3JR2A 3OVPA 4NQ1A 3W7HA 3CB8A 3NR0A 1PVNA 3W6YA 5D37A 3LXCA 1MEHA 3O6YX 1JCXA 1DKWA 5HR6A 1LDCA 2WSRA 4M6VA 4ZQCA 3W7KA 3DFNA 1K03A 1GEQA 1ME7A 1C29A 2WSQA 3STEA 3I65A 5A8GA 1JCNA 1KLYA 3NPWA 4XTDA 2ZA1A 5F2IA 4Q4KA 3TCEA 2C18A 4YWIA 3TV8A 2QR6A 1Q6OA 5KZDA 2JGYA 3CTLA 2QKFA 3E02A 3LHZA 5AB3A 3TNOA 1QMLA 4JTSA 2ZZ3A 4WY0B 3W1NA 2FIQA 4AHQA 1QPQA 4AF0A 4L4LA 1KFBA 2VFDA 2G5WA 5HUOA 2XFWA 1ZALA 1W3IA 3D0CA 4O16A 2LLEA 3F4NA 1TO3A 2Z6JA 2Y70A 1IF2A 4O4WA 4IJBA 4P2VA 3W84A 3OHIA 3S5OA 1RQEA 3W9ZA 2P10A 2Y63A 2HS6A 4O1BA 3RLUA 2A21A 2DP3A 3TMLA 4O4VA 3W2LA 1SZGA 1J2WA 1UCWA 3C61A 1OFAA 1JQVA 1Q45A 3G8EA 3MP4A 5CPNA 1TPFA 1H51A 1SFLA 2YFNA 4AB4A 1GG1A 2C16A 2E5DA 3CU2A 1YLVA 2E1DA 1JULA 3OA3A 1GT8A 1I2QA 3C52A 2Y7DA 5F4SA 4MZ1A 2CZFA 3QFEA 3IV3A 3MMTA 2YW4A 3P60A 4JD4A 3TW6A 4ADUA 3W76A 3V75A 5I3HA 4QSHA 3C4UA 1ZCOA 1ZAHA 3G1XA 3TROA 1U5JA 3P81A 1GVQA 1Q6RA 1L9WA 1TTQA 4LRTA 3W1UA 2QUVA 1EWEA 3GDKA 4O54A 3TC6A 3W87A 3MO7A 2X16A 3R5EA 4HNTA 2CLIA 1TQJA 4HHPA 3DFTA 1DBTA 2DJXA 4OT7A 4TX9A 3R13A 3S5ZA 3UWUA 3TDFA 5AHEA 2E6DA 1LZOA 3BG3A 1S5TA 3KOFA 3LHYA 4ZQNA 1GG0A 3G3DA 1H7WA 1W5PA 1X7FA 1UASA 3L0GA 1S5VA 3ABOA 3TK7A 5SWUA 3QW4B 2GUUA 2TMDA 3G3MA 3GDTA 2VC6A 2NV1A 3JRKA 1TPWA 3W75A 4WXZA 3UWVA 2JKEA 3HQ1A 2RHGA 4FX6M 5CKSA 1LTDA 2IQTA 4IMGA 4IMCA 3FKRA 5GVJA 3HPXA 3C2RA 2CWNA 3C2VA 3MJYA 3A22A 3UWQA 1LROA 2V30A 4P61A 3SR7A 3NEVA 3NNTA 1FCQA 2W79A 4DF2A 4O11A 2Y89A 1TPUA 1IXPA 5D2YA 1FX6A 1VCFA 3USBA 4K7VA 1KM0A 3W23A 2CLHA 1K8YA 2X1TA 4JTFA 1R2TA 3LTSA 3JS3A 2QEZA 2XN0A 2PE4A 1ICPA 2A4AA 5FF2A 3DXIA 2B7NA 3GYEA 3N14A 5CSSA 3UD6A 4IXXA 4JY8A 2YYTA 3CQ0A 2A0NA 3IIZA 3WJXA 3HPZA 1UUOA 1N8FA 3YPIA 1R46A 1TPVA 4RXFA 4AWTA 2Y62A 4UFLA 1A53A 4PODA 1H7NA 4IXHA 5AC7A 1NF7A 3LM7A 2ABAA 5C5YA 3E0IA 3OVQA 1I8JA 2X1RA 3B8DA 3LDVA 3EX2A 2GQ8A 1VZWA 4QISA 1O60A 3HF3A 4AAJA 4FXRA 3LCGA 3PC0A 1XBYA 4O28A 2VELA 5AYYA 4N6FA 1C9DA 3QYQA 3AO0A 5D03A 1SR9A 4E0CA 2V0TA 3KVLA 2FQIA 3HJZA 5D33A 3P74A 4NXKA 1K8ZA 4FXSA 5K7JA 4ORIA 2V82A 1XC4A 1T8XA 4O1DA 5DY2A 3QMSA 3S0CA 4K37A 4OWGA 3WFAA 3S1VA 4NNAA 2NX1A 1PV8A 2RDTA 4PCFA 1H7PA 2C3ZA 4BFAA 1MEIA 3UWWA 4QAIA 1WA3A 2C15A 2GQAA 1TYGA 3TJLA 1G4TA 4CCCA 4QM1A 5AN7A 4YCOA 3N2MA 2DZXA 3PY2A 5I3JA 1LBFA 2CLOA 3L9CA 3O07A 1GPWA 3DI0A 1OG0A 1RVGA 1OF6A 5LNRA 2FTPA 2F84A 3LV6A 4UTMA 3B0VC 1B57A 1ALDA 3O15A 3TSMA 2H3DA 4LVBA 2PURA 5TQLA 2E5CA 4S2CA 5LNUA 4FNTA 1FDYA 2I14A 3HGOA 1F74A 2V9DA 3B04A 5DBUA 5FEZA 4JICA 2G97A 2R14A 2A6LA 3QMTA 1W5QA 3S42A 3QMRA 4A2RA 5CSRA 2GVGA 3L67A 4UMAA 5EL1A 5AC6A 1KM1A 2ZBTA 4RZ6A 1TB3A 5G1YA 2GVLA 1KTNA 1ME9A 1UUMA 1TV5A 1ZY9A 4GUHA 3W2NA 3O63A 1OJXA 2WV8A 3O06A 4IQLA 1KA9F 1DVJA 5KITA 2CZDA 3E96A 4WXYA 4ADSA 5KMYA 1QFEA 4DPQA 5J5DA 2Z1BA 5F1UA 4HSNA 1QAPA 3NYZA 3QPZA 3NL2A 3M5YA 1VYSX 3DENA 1K7EA 5AC8A 1LRTA 2W0UA 3PWAA 2QAPA 1O94A 1IGSA 1YXDA 1TRIA 3W7LA 5E1QA 4EF9A 5CPLA 3GZ3A 4UTWA 2QDGA 3S1UA 3W7OA 1FBAA 2Q8ZA 5I3IA 3C8FA 3P82A 5LNSA 4HT3A 3PSWA 3BW3A 1F7BA 2E6AA 3O16A 2JGQA 2VENA 4RXGA 5LGXA 3K30A 3LHTA 3SIZA 2NWSA 3W83A 1KV5A 4GC4A 2GVJA 4WX2A 4LS2A 3W3OA 2J27A 1KLZA 2YYUA 3W1QA 4I7VA 3TAOA 3NZRA 1VPXA 2EPHA 3SW6A 5I3GA 4AXKA 2CLEA 3HO8A 3KVMA 5D2VA 2WNNA 8TIMA 5FF4A 1Z48A 1TIMA 3NQMA 3ELFA 4RZ5A 4OU1A 2JKAA 2QCCA 4LC6A 6TIMA 2ZZ4A 2QAFA 3EX6A 5I3KA 3B03A 4GJ1A 1H60A 3R2GA 2C13A 2VEMA 3FFSA 4MY9A 1F6PA 4BWLA 4H6KA 3RNDA 4UTTA 1NVMA 4M6PA 4B5NA 1VQTA 1EIXA 1VHCA 4EWND 1A5BA 2X1SA 3MBDA 4W9TA 4JTLA 1ML1A 5ABTA 3A5FA 5KINA 2E77A 2NUWA 3WK1A 3M44A 4A2SA 4O17A 5J5RA 4N9EA 1X1OA 4LS0A 2Z6IA 1SPQA 1KM5A 1VS1A 1FXQA 1O95A 5EMUA 4CQ8A 1H62A 4JX5A 3GLCA 3KVJA 1IXOA 2RDWA 3PB0A 3W1XA 3FA5A 3OG3A 1XDMA 4JDYA 1WYIA 5G1TA 2Q8LA 4K6AA 1YTEA 2EKCA 3H53A 2E09A 3LOTA 3W85A 3BV4A 3W1MA 4POCA 5MHBA 1X6UA 4AMAA 4UFHA 3M16A 2DU2A 1W5NA 2B7QA 1FWTA 2J9XA 1RPXA 2GQ9A 3LI0A 1AK5A 1JUBA 2RFGA 1EPXA 3BVJA 3PAJA 4N2YA 4LOCA 5C2XA 1JUEA 1ZAIA 2DZPA 3A23A 4X2RA 4A29A 3S1WA 1OX6A 1TV8A 3ZWTA 3HG3A 4OHQA 1VYPX 3H54A 4JTGA 4AWSA 4GFSA 4OV9A 3G8RA 1AL8A 1GZGA 2H6RA 4ZQRA 2RDUA 4UFJA 2E6FA 4LNYA 3INPA 1W5MA 3NQAA 5IBXC 4LWWA 3GR8A 3LGEA 3HGSA 1SQ7A 3UYCA 2BX7A 1SSGA 3UXDA 2AGKA 4K39A 2FFCA 1RZMA 3G1AA 4MKNA 4TO8A 3N9RA 4IOTA 1GWJA 1O4UA 4E2BA 2EHHA 3SECA 3TJXA 4Z08A 2H8ZA 1XUZA 3S5NA 1W54A 3P67A 1W1ZA 3L0KA 1PHWA 1AL7A 3GDMA 4FNRA 4AEOA 4DBDA 1B4KA 3R8RA 4UR8A 1L2UA 1GVOA 1PS9A 4MYXA 1Q3NA 5FESA 4GUJA 4NT0A 4O1AA 5DELA 2WOQA 5FEPA 5LNVA 3NQCA 4N9BA 3P8IA 4MY1A 3GXTA 5K9DA 2C0AA 5TBOA 1EP2A 1G7UA 1M7OA 3N34A 1H7OA 4O1CA 1EX5A 2A1YA 3EWZA 1ICQA 3BGGA 1Q6LA 1TQXA 1TPDA 5FEWA 1QPNA 3KHJA 1ADOA 1VC4A 1AG1O 3E12A 2F7FA 1VYRA 4NVTA 2YW3A 4OQVA 1VHNA 4O50A 3GB6A 4YXGA 4XBSA 2ZCGA 3TKFA 4XKYB 3IGXA 2B7PA 4X3ZA 3DFOA 2GJNA 1QO5A 1QOPA 3PUDA 4FX8A 3HGJA 3M9YA 2BZNA 3L5AA 4MYAA 2WQPA 5LGZA 2ZTJA 1SZEA 3L65A 4UMCA 2R94A 3M5XA 2JBMA 1FCUA 2FLIA 4LW7A 3MUXA 4N9CA 3CWNA 5LHFA 1OX4A 2ZRUA 1DQXA 1SW7A 2QCLA 1DQWA 4A22A 2ISWA 3BG5A 3LX9A 3EX1A 4M7TA 6ALDA 4RZ4A 3I7SA 3LRLA 2E6YA 1JCJA 4X22A 1TJPA 3AJXA 1VRDA 1OFQA 4UFKA 3MI6A 4JY9A 1M7PA 1M5WA 2FB2A 3VFLA 1F6KA 1JR1A 3IGSA 2Q3RA 2B4GA 4NJGA 3FIGA 3W86A 4M7SA 3VCRA 2A85A 3FKKA 1IXNA 3DFSA 4GUFA 3UNDA 1TREA 1MSSA 1P0KA 5DCDA 1AW5A 3W22A 2TRSA 3V1PA 3L2IA 1IXQA 1T99A 3MI3A 4LVAA 5K4ZA 2RH9A 1UBSA 3ATYA 1D3HA 2C14A 3STGA 3W7EA 4UNKA 2V5LA 3U8GA 3S6DA 3U6WA 3KXQA 3KRZA 2VXNA 3O6CA 4H4IA 4JN6A 5U4NA 4UCGA 4MZYA 1I45A 2HSAA 1A5SA 3NA8A 4MLJA 4MFEA 5C54A 3LCXA 5BW6A 3T78A 4WY0A 5LNWA 1FDZA 4MFDA 1M6JA 2QCMA 1OYAA 3BG9A 3M47A 1P0NA 1ICSA 4ALDA 3IVTA 3BLEA 2J24A 3NQ2A 2ATSA 3WK2A 1FWRA 3MP3A 1LRQA 4XUGA 4FIQA 3H55A 1NFBA 4O14A 2NUXA 4JX6A 1VH7A 3GNNA 3QSRA 3IIXA 2Y7GA 4UXDA 2QCDB 3EXTA 4S2BA 4LC8A 3P84A 1LBLA 3UY8A 4YMZA 4O15A 3RFAA 4DO4A 1VCGA 3LV5A 3B0UX 2YGYA 1I4NA 3EXRA 4NJHA 1AW2A 4FEZA 3NAVA 4NNBA 1P5BA 2QCNA 1XL9A 5G2WA 1LORA 2QUUA 3LCLA 3QH2A 5I3FA 2JKPA 3DI1A 1AW1A 3M0ZA 3QSTA 4JYEA 2NXHA 3P8JA 3T4CA 3RMJA 2DZUA 4BI6A 4PEKA 1K8XA 3HIJA 4MLRA 1QNVA 3S9YA 2QCGA 4DXVA 2EGZA 3IVSA 3W7NA 3W7GA 4FB7A 2A7PA 1W31A 3BARA 3Q2DA 3PBWA 4XWUA 4E2DA 1YXYA 3OIXA 3PBVA 1PIIA 5F2LA 3IGUA 3TR2A 4NZFA 2B7OA 4Y8FA 4K7YA 3TMQA 3TFXA 5DXYA 1H1YA 1LOLA 1N7KA 2JK2A 1KV8A 4Z1CA 3THAA 4HIBA 1HTIA 2OJPA 5KZEA 1WOAA 3NQVA 3PVFA 2ABBA 1YYAA 4LVGA 1LLWA 1ZHAA 1Y0EA 4LRSA 3EWBX 4Y90A 5F4XA 1SW0A 3TE9A 3P5ZA 1OVDA 3NOEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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