1TPUA

S96p change is a second-site suppressor for h95n sluggish mutant triosephosphate isomerase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
RKFFVGGNWKMNGDKKSLGELIHTLNGAKLSADTEVVCGAPSIYLDFARQKLDAKIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDIGAAWVILGNSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKAIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKTHVSDAVAQSTRIIYGGSVTGGNCKELASQHDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structural basis for pseudoreversion of the H95N lesion by the secondary S96P mutation in triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
source organism Gallus gallus
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
total genus 94
structure length 245
sequence length 245
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 1994-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tpuA00
3FJLA 4NVTA 1L6SA 3O15A 2QCGA 1LBMA 1O5KA 4OV9A 3T4CA 3B0VC 3DU0A 1Z44A 3MI6A 4AHOA 1IXPA 1RQHA 4MZ8A 1N8FA 5EBUA 3GNNA 3L5AA 1QPOA 3PVFA 1J4EA 1TTQA 1W5PA 1OFEA 2NX1A 3RLVA 5F1UA 3TUUA 1BWLA 1JQXA 1LTDA 2H8XA 1SZFA 3HMJG 2FQIA 1LCOA 3DFTA 3UD6A 3LOTA 3GDKA 1SZGA 3F4NA 3CQ0A 4UTLA 3PB2A 5LZLA 1RZMA 3W72A 2NV1A 3DKJA 1FX6A 1IXNA 1ICSA 2JGQA 3W84A 5LNUA 1HO4A 5K7JA 1DQXA 4YCPA 3TQVA 5DY2A 5AHNA 3A22A 3LHTA 3SW6A 3W1NA 1UJPA 1B4KA 4AF0A 1D3GA 2CLOA 3RF9A 4KFNA 1YDOA 1D3HA 3NOEA 4JTEA 3M5ZA 2OCZA 2YSWA 4TX9A 3I7SA 1JCXA 1H1ZA 3O6YX 2H6RA 1UCWA 3CM4A 2C16A 4JXCA 4Y6GA 2WKJA 5DY3A 4R34A 4FHAA 1KFBA 1K8ZA 1J2WA 3W75A 1XUZA 3EXSA 3GNDA 4N6EA 1QFEA 1OFOA 1UUMA 1TIMA 1LROA 1TPDA 4MZ1A 4I7VA 2FTPA 2QJIA 5AYZA 4MIMA 1VC4A 4NZFA 4UTKA 2YCEA 2WNQA 3G1DA 4ICNA 1FQ0A 2BWGA 3C2RA 4C1KA 1YTDA 1GTHA 1EP2A 4QNWA 4MY1A 4QSHA 1LP6A 4UNLA 2JGYA 5AFDA 1Y0EA 2AGKA 4TMBA 3TW6A 3EX2A 3GAKA 1FWWA 4IXXA 3LDVA 1IGSA 4GUIA 5G1YA 4LUJA 3LRLA 4HPXA 4X22A 4A22A 2DP3A 4O4VA 3VFLA 2TPSA 3NVTA 1TJPA 3CB8A 1SW7A 2QEZA 1Z41A 3M5YA 3EEGA 2UV8G 3VKJA 1XBZA 1OK6A 1YXDA 3BW2A 3BW4A 4LS0A 3PBWA 5D2TA 4MY8A 1FUYA 3DGRA 2J24A 2VEMA 3IVTA 5HNRA 1EWEA 3B04A 2V5LA 3W74A 2X16A 3PG8A 1G6CA 2E09A 1R2TA 3HPXA 4E2BA 3HPZA 1W5OA 2GVLA 1JRBA 3TFXA 2HSAA 5EYWA 5F2GA 1TPUA 3W86A 3ZS4A 4GJ1A 3O05A 4O0ZA 5CPLA 4DO6A 1TTIA 3PAJA 2Y89A 3S0CA 1G4EA 2R14A 1FCBA 1T8XA 2E6DA 3PSWA 1FBAA 3T44A 3DI1A 3THQA 3HO8A 2Q3RA 3NYZA 1TMHA 3NL2A 1DV7A 1PE1A 1TPFA 1H7NA 1W3IA 3W2MA 4ZL1A 3CIWA 3IIOA 3EWWA 1ZJIA 3DHFA 1Q6RA 2X1TA 4O12A 5F2MA 2TSYA 1W5QA 3G8RA 3SZ8A 3MYPA 2ISVA 4EIVA 3SGUA 2QJHA 2RKXA 3QQ0A 1ZALA 1SO5A 3G1SA 2PC4A 3H53A 3M1ZA 1ZAIA 5GVJA 5I3JA 3LI0A 2OT1A 4XWUA 5AHMA 3C56A 2E5CA 3MW7A 3QZEA 4RX0A 3GIYA 4OQVA 3SJ3A 1O94A 3FFSA 2D73A 3G1AA 3HBLA 3NQ6A 4PL2A 5BMXA 4WY0A 4TMCA 1O5XA 4NQ1A 1KM1A 3NQVA 1PL9A 1WAUA 3GK0A 3W7KA 1Q6LA 1THFD 3B4UA 4O4WA 4XKYB 3I7RA 2E6AA 3QM3A 3CLMA 1K7FA 2CU0A 5AYXA 1TB3A 2ZRUA 1K8YA 1DHPA 3H55A 3W3OA 2B7NA 2CLIA 5HQEA 5BNKA 3PC0A 4GXMA 1TRIA 1XDLA 1Q3NA 1W8SA 1VCGA 5D33A 4IMCA 5D37A 2A6NA 2X30A 3LB0A 4GBUA 3Q58A 2QF7A 3W7HA 1VCVA 3W7MA 2VFDA 3NO5A 4WXYA 4OU1A 1OF6A 1FXQA 4UTTC 4GUJA 4QITA 2B0MA 3TFCA 5KTLA 3G0UA 4Q4KA 2C1HA 2ZQ0A 1DJNA 2J88A 2FDSA 3LXBA 1VHCA 4O54A 4I9AA 3MP4A 3UZJA 1XKYA 3STCA 3TAOA 1OFQA 2Y62A 2EHHA 1TRDA 3BPWA 2B4GA 2NLIA 3DH7A 2EAWA 4C1LA 3TAKA 4L4LA 5G1TA 4LT9A 1OX5A 3LCGA 3P67A 2Z2UA 3FYPA 1QPRA 4UFIA 4UFJA 3CEPA 1JJKA 4PEKA 2DZVA 2A0NA 1LBFA 1SW0A 3GKFA 2QUUA 5KZMA 1ZNNA 2CLMA 3QRHA 3S6DA 3TXVA 3EXRA 4Z1AA 1F6PA 3ZR4A 1KFEA 1FWTA 1EWDA 1ZAJA 1SUXA 1G4SA 4LRSA 2FB3A 5BRBA 2QCMA 1R30A 3OVRA 4PCFA 4Y9AA 4ZVJA 1ME7A 3G24A 4A3UA 2YXGA 4I7WA 3GB6A 3ELFA 4O10A 5D05A 2J6XA 4AMAA 1BTMA 3W7LA 4WQ6A 1KFLA 1NF7A 4DBDA 4EF8A 1GVOA 3UWVA 3ATZA 1JUEA 4CNNA 3C3NA 2WSRA 5FEXA 2YFOA 4FXSA 4K6AA 1KM6A 1IIHA 1SZEA 3KVJA 4O28A 1H7PA 5HJLA 1JQVA 5K4ZA 3UWYA 2ZYFA 2WOQA 3DFQA 2V2CA 3SGZA 4UTIA 3TMQA 3DFOA 3D0CA 2ZRYA 3NQEA 1QAPA 5EPDA 2V8ZA 4S2BA 3E49A 1TCDA 4RZ6A 1ICQA 1XBXA 1QPQA 3CHVA 1SO3A 3GXPA 4TO8A 2RDUA 2CLLA 3QW4B 5D2WA 3S42A 2P1FA 3ABRA 2BXVA 3C8FA 5AHEA 1KM5A 1XCFA 4X9SA 1V5XA 1H62A 3PBYA 1I2QA 3MI2A 1PHQA 3SECA 3GR8A 4IMGA 4LW7A 2GUUA 3MYOA 3NPVA 5D02A 4JYFA 5CZ0A 4JD4A 3RMJA 1JCYA 3HIJA 3T40A 2ZZ5A 4JTLA 1SFJA 4WY0F 3HF3A 1O95A 2NXHA 4LTSA 3P5YA 1K02A 3LHWA 1L9WA 1WOBA 3U2OA 1I2PA 5FEWA 3FIGA 4AWUA 3NEVA 3VE7A 3G3MA 3VI2A 5D38A 1K8XA 4LNYA 1XDMA 2FPVA 4R7JA 1TYGA 1TPWA 1JR1A 3LHUA 3PUOA 1SO4A 4NX5A 2A7NA 1LOLA 5FF0A 3MWAA 1F74A 3NDOA 3IGSA 1XI3A 3BK0A 3F4WA 1WDWA 1GYNA 4FF7A 4LU0A 3MO7A 2EPHA 1Q45A 3B0UX 2W0UA 3G1HA 1Q6QA 2C3ZA 3C61A 3I65A 3W87A 3M9YA 1GWJA 1H1YA 1WV2A 2PURA 1I8JA 3MHFA 4LOCA 2BTMA 3WFAA 2WO5A 2E6FA 2CZ5A 3QEZA 1WA3A 3LBMA 2WJZA 4ORIA 4IMDA 3SIZA 4M5PA 3N2MA 4Y8FA 3PUEA 3QMRA 1CX9A 2ZA2A 3EX3A 2V2DA 4A29A 1X6UA 1TREA 3L66A 4AHQA 3TQ0A 3PG9A 4JIQA 1P0KA 1WOAA 3NA8A 4N9DA 3QMSA 4XUGA 1B9BA 1KTCA 1JRCA 5FF4A 4CQAA 4UCGA 3SFKA 1D9EA 3NQ7A 2WPBA 3DHDA 4AB4A 1P4CA 5CZJA 1W3TA 4O19A 2ZRXA 2DORA 2QCFA 3W83A 1MEIA 2FJKA 3LBCA 3G3DA 3LV5A 2A2IA 5AHLA 1AW5A 1OX4B 3O63A 4GC4A 1DBTA 3P82A 1MEHA 4IX0A 2VFGA 3NM1A 2Y88A 5L6UA 5DELA 4M19A 3AJXA 1PCKA 1R46A 3E0IA 2Z6IA 4Y96A 1RR2A 3TJLA 5F1VA 3K30A 1P1XA 1OYCA 2Z1BA 5C5YA 3CEUA 2NX3A 3N34A 2H90A 2NWSA 4FNPA 2A1YA 2B7QA 4O11A 3EWUA 3DFNA 3W1LA 4RLIA 4UMCA 4LVBA 1W5MA 1S5VA 3NL3A 2YYUA 2CLHA 1TPH1 4UXDA 4AXKA 1R47A 1F5ZA 8TIMA 4JGDA 3LXCA 3C52A 4CNPA 3GX9A 4ORMA 2HTMA 3KRUA 4Q33A 2V9DA 1C29A 1DOSA 2VFIA 1RQBA 3GZ3A 2GJNA 3NAVA 5K9XA 2A5HA 1LZOA 1ALDA 1H5YA 3NL5A 2NUXA 2WNZA 4IUOA 3EX1A 5ABTA 3KXQA 2NZLA 2J9ZA 2F84A 4CNOA 1YDVA 3P61A 4JN6A 4M7SA 3R8RA 1GEQA 4JY8A 1MSSA 4UIOA 5C6MA 5DBTA 3UNDA 3QFEA 4UTTA 1VQTA 4MLRA 3S5ZA 1KTNA 1N55A 4Z08A 4U28A 4ALDA 3GR7A 3L65A 2ZA3A 1J5TA 3PULA 3OEXA 2ZZ4A 3JS3A 1K7XA 4Z1DA 4JTFA 4K8HA 1ZENA 3NQFA 4ADTA 1EP3A 3N3MA 4N4PA 3T78A 2NUWA 4QM1A 3QPYA 3M5VA 4RR4A 1H7RA 1OABA 3TMLA 3R5EA 3W1MA 4ZQPA 4JNMA 1AL8A 1FWSA 3WJWA 3INPA 2ZTJA 1KBJA 1VPXA 4AWSA 1VYRA 4LY8A 2J9YA 2CZFA 1UASA 2X1RA 2PRLA 3GDMA 4O13A 1DQWA 4EF9A 2Q8LA 1JCMP 4JTUA 3N9SA 5CZSA 4UMBA 3G1YA 1KFJA 3ZWSA 5AC7A 3NG3A 5G4EA 2F7FA 3LCWA 1TSIA 5K3VA 1EB3A 4JTGA 5KZDA 5FI8A 4OGZA 3TCEA 5T26A 5BW6A 5HR6A 3QQ1A 4XKYA 3KAOA 4FX8A 1GG0A 1DORA 5IBXA 1I45A 4NJIA 1WYIA 3IRDA 3IEBA 3DENA 1M7PA 4ZQNA 1HFBA 1XBVA 2GQ9A 4H6KA 2ISSA 4FNRA 1NEYA 2XFWA 1VGAA 3HJZA 1FDYA 1B3OA 4FNUA 1GOXA 4IMEA 3P74A 2TRSA 4JYDA 5C54A 3ATYA 2V2HA 1DL3A 2JBMA 1H7XA 1RD5A 3UXDA 4WX2A 2YDAA 3L21A 4L4MA 1VYPX 1KV5A 2Y7FA 3I68A 4QQ3A 4YWIA 4DO5A 4S1FA 2YZRA 3M0ZA 1OJXA 2Q8ZA 2CLKA 1KA9F 5HWJA 3TK7A 5SWUA 4O17A 1ADOA 4LC6A 4O57A 1VS1A 1YDNA 4NT0A 4WOZA 6TIMA 3USBA 1GJPA 4ZMGA 4ZZ9A 2BZNA 1QO2A 1ICPA 3NQ2A 3ABQA 4I7UA 1GVFA 3O07A 2V30A 2WQPA 4DELA 5FF7A 3NZ1A 5I3GA 5HULA 3CWOX 2TMDA 1QDSA 4LVGA 4PH6A 3LCHA 5FESA 4Q32A 3G1FA 1M5WA 2Y85A 4JTIA 4XTDA 1K3UA 5CG7A 1H60A 3LXAA 1YLVA 5F4WA 4AAJA 3CWNA 5EKYA 4AH7A 1QWGA 1YXYA 3LCIA 3LTSA 4N6FA 2CW6A 4HNNA 3P7YA 3M5XA 4O1DA 2A4AA 2VFHA 3MHGA 3L9CA 2ZDRA 1AW1A 2IQTA 1H51A 3P84A 1XBYA 3TE9A 2I9EA 3WJZA 4BK9A 4GRSA 4JYEA 2RHGA 2TYSA 3KX6A 3TSDA 4MYXA 4NJJA 3EKLA 4FX6M 5G4WA 1SQ7A 1VLWA 4HSNA 6ALDA 3GXNA 2ZTKA 2QKFA 3EWBX 4DF1A 1OYAA 1FWNA 4EVZA 3TW7A 1OYBA 4LS1A 5H2ZA 3W70A 2FB2A 3UWQA 5AN7A 1M6JA 1OFBA 3N19B 4YXGA 5G2HA 3E96A 1JVNA 2H8ZA 4B5NA 4O1BA 3H54A 1TPB1 3T55A 3RLUA 3QSTA 4JTTA 2HMCA 3W6YA 5A8GA 3GYEA 4N9BA 1HTIA 3BO9A 3EWXA 1ZCOA 2J27A 1TTPA 1RPXA 1VR6A 3GDTA 5AOUA 3W1QA 4DQWA 4YMZA 5L9FA 4KWWA 1GZGA 3LLDA 1FDJA 3CC1A 3M7WA 3B8DA 4CCCA 3BLEA 4WXZA 1E51A 1W31A 2QDHA 3M6YA 1W5NA 4HNVA 1TPC1 1CW2A 1W1ZA 4A21A 1YYAA 1NFBA 4N2YA 3UPBA 3MBDA 4O50A 3LCLA 4QAIA 1P5BA 4Z1CA 4JEQA 5HUPA 4ML9A 1KBIA 5K4XA 3MUXA 3W7NA 3C4UA 3E9AA 5DCEA 4OWGA 1WXJA 3GDLA 3DI0A 2NX9A 5F2LA 3V1PA 3WK3A 2YX0A 1W56A 3W7GA 1S5TA 1KV8A 4UTHA 2Z0IA 3LHYA 4QIUA 4ZQCA 1GTEA 3TQKA 2QCDB 5D2XA 1RQEA 4Z0SA 1JUBA 3S5OA 4M6PA 1I2RA 3P62A 4AHPA 4A2RA 4XBSA 5AC6A 1EPXA 1X1ZA 3FLUA 5CGQA 1QPNA 3LX9A 1UUOA 1TPVA 2XN1A 5IBXC 5DBUA 3NQGA 1H7WA 5DLCA 1VZWA 4GUGA 1EUNA 4JDBA 1PCWA 3G0SA 3RU6A 3NGJA 3W07A 2QCCA 2JKAA 4JTKA 3WJXA 2DZTA 3A24A 2QAPA 3HOJA 3LV6A 3OG3A 3O6DA 3TC6A 7TIMA 3KVKA 4IPIA 1JCJA 3BG9A 2QJGA 5LGZA 4LVFA 2QDGA 4YCOA 4JDYA 4K8EA 1PV8A 1G67A 4E0CA 4R53A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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