1TPVA

S96p change is a second-site suppressor for h95n sluggish mutant triosephosphate isomerase
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
RKFFVGGNWKMNGDKKSLGELIHTLNGAKLSADTEVVCGAPSIYLDFARQKLDAKIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDIGAAWVILGNPERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKAIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKTHVSDAVAQSTRIIYGGSVTGGNCKELASQHDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structural basis for pseudoreversion of the H95N lesion by the secondary S96P mutation in triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
source organism Gallus gallus
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
total genus 92
structure length 245
sequence length 245
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 1994-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tpvA00
3W7OA 3I7RA 3TC6A 1EEPA 1ALDA 3AO0A 3ABSA 3UNDA 1OX4B 1PHQA 1SO5A 2QUVA 1TPEA 2C6QA 2A7RA 1UUOA 2Y63A 1XBXA 1XM3A 3MUXA 3L9CA 4OT7A 3HGOA 2A4AA 2NX9A 2ZRVA 3THQA 2J27A 4CLMA 4XBSA 1GTHA 4UNLA 2H6RA 3NNTA 3LDVA 3A5FA 3BW4A 1A5AA 1L6YA 1QOPA 2QAFA 3LXCA 4AHQA 4OWGA 2A6LA 2DZTA 2FLIA 3MJYA 1WOAA 3C8FA 1R47A 4UMCA 3UPWA 3O63A 5D2VA 4K38A 4NNCA 3QC3A 2YDAA 3OHIA 1WAUA 3E12A 2H8XA 4DELA 3P7YA 1Q45A 1XDLA 1YDVA 4DEFA 2OT1A 1DJNA 5AB3A 3DKLA 2DZXA 1C8VA 1MEHA 5A8GA 2C1HA 3NO5A 4MZYA 1W56A 2ZBTA 4IMCA 4RZ6A 4M6VA 4KWWA 5CPNA 1F5ZA 3B05A 3M16A 2QCDA 3HBLA 1SO6A 3SSJA 5F2MA 1GG1A 2VFEA 3GAKA 5AYYA 4XWUA 4NNAA 4W9TA 3SGUA 3LI0A 3PVFA 4LUIA 2DZWA 5E0KA 3W7KA 3HQ1A 1K7XA 5LNSA 4BF9A 4HNVA 3SJ3A 1F76A 1I8JA 2B0MA 3QSTA 3W71A 5K7JA 1KFJA 2PC4A 5D37A 4IUOA 5AN7A 1UB3A 4RJEA 1WBJA 1ME9A 3LCXA 4ZQPA 4ADTA 1R2TA 3C52A 4CCDA 3EWWA 1SSGA 2VEIA 3B0VC 4JY9A 1OK4A 2ZQ0A 4UTKA 3N14A 3CIWA 4MPQA 3G1DA 4ADSA 3CHVA 1KLYA 3M1ZA 1TPUA 2ZRXA 3RFAA 3PB0A 2W6RA 4LC8A 1RVGA 3G0SA 1IXNA 3NPVA 3FA5A 3NQ6A 3W1XA 3W7EA 4DBEA 3W74A 2X30A 2CU0A 3P8IA 1F05A 1H7XA 1VS1A 4AXKA 3W7CA 2J9XA 3P60A 2F7FA 4UFJA 3UWWA 3A9IA 4Z1CA 3NQVA 3UD6A 4UTWC 3C4UA 5AHIA 1NEYA 4WZHA 5G1YA 1R2RA 2QJHA 3M7WA 3L66A 1JQXA 4AWTA 3CWNA 4FO4A 1GG0A 4JNMA 5D33A 3L0KA 2OZ0A 1QO2A 3MYPA 4CCEA 5KITA 2TRSA 2P10A 3M41A 5EPDA 5FEPA 1Z48A 2J6XA 2CZ5A 1RQHA 3L67A 3PUEA 4AWSA 3GAYA 1DJQA 2WPBA 3G1YA 3VFLA 1TPFA 5ABTA 1AL8A 2WSQA 3DFOA 3PUDA 3TAKA 3MWAA 4UR8A 1G4SA 3W2JA 4AEOA 1H7WA 3P5ZA 4O50A 5LHEA 2WNQA 1QMLA 1GEQA 1W3IA 5TBOA 5F1VA 2GQAA 4QM1A 3W7GA 5D09A 1G7UA 3LBMA 3NQCA 5LNRA 3EKZA 3EXRA 1VJIA 4N2YA 1RQEA 2GJLA 3NZRA 2I1OA 4MLJA 1W1ZA 1HUVA 4HNNA 1YDNA 4Z1AA 4MVAA 3N3MA 2Y6ZA 3DAQA 1EIXA 3PBUA 3A24A 2ZA2A 3PWAA 3W7IA 5G4EA 2ZCGA 4GUGA 5HJLA 1Z44A 1VR6A 1KM5A 4QQ3A 1M5WA 3DFTA 3ATZA 2ZRWA 4KFPA 5G1TA 1BWLA 5DBTA 4LVBA 1GZGA 3UXDA 2JBMA 4WQ6A 1LOLA 1DKWA 3W3OA 1KA9F 4K6AA 3H54A 1LCOA 3LM7A 1VYSX 1FCQA 3O15A 1KTBA 1Y0EA 1OJXA 4M6PA 5FEZA 3H53A 5EYWA 4Z0SA 4U28A 1EB3A 4IQLA 1ICSA 3MP3A 3LXAA 5LGXA 1YXCA 1TTPA 3VE7A 4E2BA 1RV8A 4NJKA 3CQ0A 1JULA 2VFGA 3CWOX 2YGYA 3UZ5A 2YZRA 3G8RA 4A3UA 3INPA 4AMAA 1FCUA 3DFNA 3KAOA 4TIMA 4K7YA 5EBUA 1OYCA 1W3TA 1M7OA 2E68A 1JCXA 4IMGA 4RXGA 2PRHA 4AF0B 2E5CA 3F4NA 3A22A 5E1QA 4UMAA 3EWYA 4UR7A 3G3DA 3U8GA 3UQNA 1FDZA 1G67A 3MP4A 4FNRA 1JCNA 3MBFA 1VZWA 3T7VA 4JTIA 4M5PA 3SW6A 3P62A 1P4CA 1ZCOA 2GPTA 2NXIA 1YTKA 2CLKA 1K02A 1WYIA 2TPSA 5I3JA 3QPZA 1BWKA 3L0GA 4O14A 2YYTA 2ZRYA 1N7KA 3S8HA 3BW3A 4PH6A 4UTIA 4EOUA 4ML9A 4UTUA 2Z6JA 3QQ0A 3GR7A 2QCEA 4K36A 2XN1A 3QPYA 4CNPA 3W2KA 1VC4A 4MUZA 4JX6A 1DHPA 1RQBA 1OK6A 2G96A 2QUTA 3O06A 3R5EA 1YADA 2GVGA 3TJXA 1G7VA 2ZYFA 2Y88A 1MXSA 2A7PA 3DFSA 3E96A 1H7OA 3DH7A 4ORMA 5LKYA 3PG8A 3LBCA 2E6AA 4FF7A 3M44A 3LCHA 2CLIA 5C54A 4LS2A 4MKNA 3BG9A 3HJZA 3HG5A 1Q6LA 3G0XA 1G4TA 2OCZA 1SW7A 3PUOA 4O0ZA 2P1FA 4NVTA 4O1AA 4Y9AA 1KFBA 1YDOA 4YCOA 4MLRA 2XFWA 3UWZA 4IMEA 4OU1A 3WJSA 2PRLA 4DF0A 2QCFA 3IIXA 3DZ1A 5D05A 4IJBA 2CWNA 3IVUA 4PL2A 1GTEA 4HN4A 3N9RA 5BNKA 1JCJA 1NF0A 3C0JA 3M9YA 4UFIA 3W85A 3W7NA 1EX5A 4WY0F 1PS9A 3ABOA 5AHLA 1TV8A 3NYZA 2VXNA 2VEKA 5I3KA 4XBKA 3HB9A 5IBXA 4XTDA 1SUXA 3KRZA 4LV9A 4FHAA 1TMHA 1WOBA 4K7VA 1BKSA 5FF3A 4WXZA 2CFFA 3B8DA 5KTLA 2VENA 4IGHA 3C2EA 1X6UA 2V82A 1FWRA 4K37A 3W76A 2VKZG 4H4IA 1L6SA 1GYNA 2FJKA 2X16A 1OF8A 2ISWA 1EPXA 1TQJA 3JR2A 3LERA 1B57A 1KTCA 5FEWA 2WQPA 2YFNA 3TMQA 4O53A 3PSVA 3Q94A 2BSLA 5HUPA 2ZZ2A 5LSMA 1KTNA 2DZSA 4ZQMA 1A5CA 4WOZA 2Y85A 2RKXA 3NL3A 3QM3A 4HNUA 5AHEA 5D2WA 4LTSA 4RZ4A 4HHPA 3NL2A 2ABAA 3VNDA 1L6WA 2CLHA 1H7RA 2NX3A 1SZGA 4MJMA 3G1HA 3FKRA 2JKEA 3T4CA 3S5ZA 1YTDA 4FX6M 3BPWA 5HR7A 3S1WA 3S1VA 2CLEA 3RLUA 1JUKA 4FNTA 3LHVA 4UFMA 3MMTA 4FXRA 4JN6A 3CC1A 5D32A 5DLCA 1VLIA 2NV2A 3E49A 5CZSA 1V7YA 1WBHA 4GBUA 4O16A 2Y89A 1ADOA 4O1CA 3Q2DA 3FJLA 3G1AA 2NUYA 2Y61A 4S2BA 4I9AA 3D0CA 5KINA 1LDCA 3DFQA 1H63A 5AHNA 3MI3A 1I2QA 3EX3A 4R34A 3DGRA 1C9DA 2VFDA 4JTSA 1JRCA 1OFPA 1SFLA 3W6YA 4IWWA 3NM1A 1P0KA 4BK9A 5TQLA 3W70A 1JQVA 2YFOA 4HKPA 1M6JA 2X1SA 5C6MA 2NV1A 1FCVA 5G4WA 3SR7A 3MI2A 4JTJA 2FFCA 3PG9A 4S1FA 1YTEA 4HSOA 3SZ8A 2X2GA 1KFEA 3W9ZA 4O15A 1VGAA 4UNKA 1LTDA 2GVLA 4WD0A 2Q3RA 4CNNA 3P84A 4LS0A 5F4XA 3C61A 5DY3A 5LNWA 4XQ6A 3TSBA 3LB0A 1FWNA 1JCYA 2A2IA 3CLMA 4J9JA 4R33A 4HNTA 2P0OA 2VC6A 3IIPA 5D38A 2QKFA 4O4VA 5T26A 5K9CA 3L21A 2Y70A 2WJZA 3KRUA 4EWND 4E2DA 1SR9A 4OHQA 3HPZA 1O95A 3UY7A 3W7LA 1SSDA 2YR1A 2ATMA 3W1TA 3W2LA 2JGQA 1XI3A 4TO8A 3UWVA 4LY8A 3C6CA 4EVZA 4AB4A 3S1UA 2Z1BA 2ZTJA 2HS8A 3USBA 5H2ZA 2E77A 3B0UX 3IGUA 3ZWSA 2V2CA 5FF0A 2OMAA 1I2RA 3NQ8A 2JKAA 7TIMA 3TJLA 2CLFA 1ICQA 3P61A 4RZ5A 4UFHA 4GC4A 3I6RA 4KFNA 1O60A 5AC6A 2V5BA 3O1NA 5I3IA 1KW1A 2LLEA 1DQWA 3CB8A 3UZJA 2E6DA 3O16A 4H6KA 1H61A 2DP3A 3B04A 4DO4A 4K8EA 1K7FA 1JVNA 2QEZA 1SPQA 1E51A 4ZQNA 3BARA 1QCWA 3WFAA 4KFOA 1H1ZA 5DCBA 1A50A 4OE7A 3DBPA 1F73A 1WQ5A 2R14A 5F2LA 3RMJA 1BEUA 4AHPA 1LRTA 2CZDA 1FWTA 4TMCA 1Q6OA 3F03K 1FX6A 2YW3A 2VOMA 1W0MA 2OT0A 3B06A 4I7UA 2FPTA 1IIGA 1H62A 1ZJIA 4OBTA 1KFLA 2A7NA 3H55A 3LCGA 5J5DA 4JX5A 3PY2A 3TV8A 4DBDA 1VPXA 3N2XA 4XKYB 3RLVA 5C5YA 3GDKA 1NFBA 1X1ZA 3W1LA 2ZDRA 3MYOA 1FY6A 1EUNA 4QIUA 1AW2A 1IGSA 4ZQCA 4JTEA 4LVGA 1VRDA 4UTWA 1S5VA 3L5AA 5LZLA 4U4MA 2WKJA 3W7MA 2A5HA 4JIQA 4ZQOA 1EP2A 3C56A 3W1UA 1K3UA 1L9WA 3GB6A 1HG3A 3THAA 4O54A 5BOOA 5CKSA 1OYAA 1Z41A 2B4GA 1VCFA 1LOSA 2R94A 3N19B 3FIGA 2BX7A 1OYBA 3VKJA 2UV8G 2VFFA 4E38A 1GVOA 1IXQA 5BRBA 5HMSA 3W1MA 1I2NA 2V2HA 4ALDA 3B4UA 1FUYA 3QZEA 3NZ1A 3W1NA 4JXCA 1AW5A 4MZ1A 5DBUA 3P8JA 3G8EA 2Q3OA 4MYXA 1RZMA 2B7PA 4ADUA 1TV5A 3FEMA 3TFXA 5HNRA 5CPLA 4MFDA 3M5ZA 1G6CA 3LV5A 4NXKA 3TW7A 2EF9A 5AFDA 1GQNA 1DOSA 4NU7A 4A29A 3UY8A 3G1FA 3L5MA 3S42A 4PEKA 1YPIA 3UPBA 2QDGA 1QPNA 4NJHA 2YW4A 4GUJA 3LHWA 4Q4KA 4AHOA 2Y62A 1W5NA 5F1UA 3TR2A 1YLVA 2JK2A 3BGGA 3KVJA 1CI1A 4FXSA 4ZVJA 1OFRA 4JTLA 4O8RA 5H91A 4MFEA 2EPHA 3VI2A 1B4EA 2ZZ1A 4UMBA 3S5YA 1THFD 3GR8A 1J2WA 2H8ZA 2QUUA 2ZZ3A 5FESA 4CQAA 2QCDB 3QW4B 3STCA 1B3OA 1ZAHA 4JTUA 2PCQA 3FS2A 2AGKA 1XBYA 1UCWA 1SZEA 4OV9A 4RR4A 4IMDA 4O4WA 4JDBA 1PHWA 1QPOA 1KV5A 3W75A 2B7QA 3HMJG 3TQVA 4LUJA 4X9SA 2YXGA 5AC8A 3EXTA 3RNDA 3S1XA 3TK7A 2C16A 3KX6A 3ZWTA 4N9DA 3O8AA 1YYAA 5EKYA 1IXPA 1Q6RA 3GDMA 2O7SA 1HTIA 8TIMA 3NPWA 1RR2A 1WDWA 1LLZA 2G5WA 1T0OA 4HIBA 5K2ZA 3L68A 1HO1A 3EB2A 3IIZA 3MHFA 2EHHA 1JUEA 5F4WA 1TO3A 5CSRA 3W87A 5BMWA 1FCBA 3O6CA 5LNUA 1KM2A 2Z0IA 1IXOA 3GXTA 3IIOA 1XUZA 3ABQA 3C2OA 3LHUA 4OV4A 4M6QA 4MJZA 3NQ7A 3G1VA 1K03A 3CEPA 3WK1A 3NOEA 4IXXA 1O4UA 5DY2A 4DPQA 4GJ1A 3HO8A 2DJXA 2X1UA 3HG2A 5E93A 3G18A 1Q6QA 4JTGA 4RCXA 3W88A 4AAJA 4Z1BA 3P67A 1QR7A 1TRIA 1I2OA 1EWEA 5LHFA 2E6YA 2E6FA 4JICA 3A5VA 2QCGA 1IF2A 4N6EA 2V5LA 1QO5A 3Q58A 2RHGA 2Z2UA 2Q8LA 1TRDA 1XL9A 4A2RA 3LCLA 1LYXA 4QSHA 3W7RA 4LVFA 2A85A 5K3VA 4FX7A 3GZ3A 2WSYA 2NZLA 1PCKA 4GWEA 4PTNA 1QPRA 2KZHA 5FEXA 3NQ2A 2E5BA 3DHFA 2B7NA 5CZTA 1KM3A 4Z1DA 3I68A 3NVTA 3GIYA 1KLZA 1EP1A 4ORIA 1F7BA 4TX9A 3NGJA 1MO0A 1K8ZA 5D04C 3IEBA 3F4WA 5KMYA 4LV4A 1OABA 4I7VA 5F2IA 1OFOA 2H3DA 4KWVA 3STFA 4BI7A 1SO3A 1K8XA 3IGSA 4M19A 3UWQA 1KFKA 1I2PA 3F1QA 4N02A 2GOUA 4O10A 2V9DA 1HFBA 2QR6A 3TMLA 4UTTA 5L9FA 1Z42A 3G1XA 4UTLA 5TIMA 1T8XA 6ALDA 1O5XA 3JRKA 5L6UA 4JTTA 4HPXA 4D2JA 3K30A 5D02A 4JTKA 2QCLA 3GK0A 3NG3A 2X1TA 4OQVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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