1UQYA

Xylanase xyn10b mutant (e262s) from cellvibrio mixtus in complex with xylopentaose
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
GLKSAYKDNFLIGAALNATIASGADERLNTLIAKEFNSITPENCMKWGVLRDAQGQWNWKDADAFVAFGTKHNLHMVGHTLVWHSQIHDEVFKNADGSYISKAALQKKMEEHITTLAGRYKGKLAAWDVVNEAVGDDLKMRDSHWYKIMGDDFIYNAFTLANEVDPKAHLMYNDYNIERTGKREATVEMIERLQKRGMPIHGLGIQGHLGIDTPPIAEIEKSIIAFAKLGLRVHFTSLDVDVLPSVWELPVAEVSTRFEYKPERDPYTKGLPQEMQDKLAKRYEDLFKLFIKHSDKIDRATFWGVSDDASWLNGFPIPGRTNYPLLFDRKLQPKDAYFRLLDLKRLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Mechanisms by which Family 10 Glycoside Hydrolases Bind Decorated Substrates
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio mixtus
molecule keywords ENDOXYLANASE
total genus 142
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uqyA00
1JDDA 4MDOA 4C7DA 2PI6A 3B9AA 5LA2A 7CGTA 4CKQA 1W1PA 3ARRA 1CENA 2OLHA 1WDRA 2XGBA 4BZYA 4UFIA 2WZHA 5CGMA 1D3CA 4A3YA 4LXFA 1LG2A 3AHTA 2BY2A 1CZ1A 1OWQA 2XFFA 3FHAA 2NW0A 1E4NA 4TVDA 3QOMA 5M03A 2XVNA 2E0PA 4HMEA 1OM0A 1V0LA 2WMKA 1WPCA 2CBJA 2OWWA 2FGLA 5HDRA 1FH9A 3A47A 1QNPA 3T2OA 4PMRA 1EDQA 4YHGA 2WLYA 1J12A 2XM2A 3ZJKA 4H8UA 5EMYA 2WMHA 3B9DA 4U33A 3THCA 3PZQA 1QBAA 1V0KA 3QHMA 1C91A 3TONA 5A8OA 3L4XA 5GPRA 3VO0A 3WEOA 3I3DA 3WQ6A 4GINA 4M81A 3GH4A 1GQKA 2J74A 3CUFA 2ZOXA 1UG6A 2WKLA 1I1XA 1CECA 4AZGA 1NP2A 3SCNA 5DO8A 4AIUA 3SCTA 1E1FA 1HKJA 5A8MA 1GORA 2J78A 5M17A 1BLIA 1M01A 4FK9A 2J77A 4L4PA 3K8MA 1XH1A 1Y7VA 3CZJA 3N04A 1LWJA 3WUGA 2HVMA 4QP0A 2CCRA 1UH3A 1NWTA 4AD4A 5LYRA 4JHOA 3VGBA 2J7HA 4CN1A 2EXOA 3L4VA 1CGTA 3W6LA 5I79A 4MNKA 1QI2A 5JIWA 1EOMA 2WSPA 4U31A 4WKFA 2CHNA 3AICA 5GQBA 5AC4A 2ZUUA 1ESWA 3W24A 2VVNA 4B9YA 4MNLA 1G5AA 3CUGA 3A3HA 4B16A 5CSUA 2D23A 3ARPA 4HU8A 3AYSA 3GXDA 4W88A 5I2UA 3EMQA 3LMYA 3VD9A 1E6QM 2JF6A 1EO5A 1GONA 1GZJA 4XZWA 3SCRA 3DC0A 2FHCA 1MQRA 2ZX5A 4UR9A 5CG0A 4D6GA 1WE5A 1UKTA 3VDCA 2D2OA 4IISA 3MUIA 4XV0A 4URIA 3QR3A 3OZPA 1ZL1A 3GH5A 3VIJA 2X2YA 3TTYA 4LGXA 4PMOA 3RCNA 2XIIA 4HA1A 2GVYA 1GVYA 1BHGA 3VM5A 2VCAA 4GQRA 3CH9A 1E3ZA 1JNDA 1W3LA 1WDQA 3K8KA 2VQTA 4MB4A 5ECUA 3GBDA 3OBAA 4BQ3A 4D6EA 2PWDA 4TVUA 1N82A 1BYBA 1X6LA 3RIKA 3BCDA 3AMLA 3PZMA 1XCXA 2J7BA 2J8GA 1UWQA 4P7NA 5A8PA 3U7VA 1CWYA 4U2ZA 1OINA 1AMYA 2UWFA 1ODUA 3WNPA 4J3VA 4GZEA 2WB5A 3VD7A 2A3AA 3RMEA 1JAKA 2XSAA 1PJ9A 5BYWA 1EA9C 4RE2A 3T09A 2ZIDA 3SUUA 4TTGA 3AXXA 3BAYA 1WZAA 1WZKA 1O7AA 2WVVB 2DT3A 2DEPA 4BQ2A 8CGTA 3EDEA 1QBBA 3ZIZA 4V28A 1QNQA 5FL1A 4AMCA 1VAHA 1HNYA 3WDRA 4V2XA 3CO4A 4M56A 3AZTA 3AMGA 3N18A 3ZSTA 1WZMA 3O6AA 4AZIA 2WHMA 2WMJA 1AQHA 2BHUA 4B15A 1FOBA 1H09A 3GH7A 2CBUA 1E15A 3AZSA 3L4TA 1UWUA 1B30A 5GNYA 1CGYA 3WN6A 1UYQA 2J79A 3U5UA 3BMWA 2YL9A 3HU7A 4W87A 1SR0A 2VJXA 4WSKA 3K8LA 2J62A 3ZJ6A 3UR8A 7TAAA 1EQPA 3WMBA 2W63A 2D0HA 3FXYA 1CNVA 3SCVA 2CITA 3HJEA 4TVCA 4OBSA 1C92A 1CXEA 4ZXOA 3AJ7A 2G8ZA 2YDQA 4NF7A 1E5JA 3CUIA 1C90A 1JD7A 2BHZA 3PTQA 3SCWA 1UKPA 3L4YA 4DM1A 3NUKA 1QI0A 3G6MA 5AC5A 4JHZA 3WBEA 3ZM8A 3WFLA 3AHZA 4PUEA 1Q6GA 2IXUA 4Z2JA 5A6BD 1CGVA 3ZJ8A 1C8YA 5KZ6A 4UNIA 2D3NA 5ABEA 3DECA 1U2YA 3PTKA 1UWSA 2CXGA 4AISA 1LWHA 1W1YA 4EKJA 2B31A 3RDKA 1E6SM 1VFFA 1BSIA 1GOWA 3A4AA 1GHRA 3KL0A 4PTVA 2X05A 1FHDA 2WM0A 1WB0A 3ALGA 1GQJA 3NSXA 4FLRA 3SUTA 1B3XA 4DWSD 2YA0A 2WNWA 2NSXA 2TAAA 5JIPA 2J7FA 5ABFA 1B3YA 2WWCA 3WDIA 1OB0A 3I3BA 4J3TA 1HL9A 1UD8A 4EAMA 1V0MA 2GJXB 2XWEA 3CTTA 5CXPA 2PWGA 4ACYA 1E0XA 3TP4A 3WUFA 5A6JA 1CXIA 3II1A 4M1RA 2CYGA 1BYAA 4PUDA 2YLAA 1Q4NX 4HOXA 3F4VA 3ZJ7A 3MSGA 2BXYA 3FN9A 3UERA 5IHSA 1EHAA 1ISZA 1G0CA 2WC7A 1W9XA 4HMCA 3VIMA 2A3HA 4D6JA 5A1AA 1E73M 2J7CA 4E4PA 2J47A 3RM4A 1W9BM 5AYIA 4IPNB 1V3MA 4W84A 4WK9A 2WHLA 2CBVA 1E4LA 1GOMA 3RM9A 1HVXA 3ARXA 1YQ2A 4PMYA 3WDPP 2OSWA 4D6HA 1V0NA 1JGIA 3F5LA 5IFPA 2YDRA 1H41A 5DEZA 1R7AA 4OOUA 5FCZA 1FP8A 4NI3A 3D3AA 2EPOA 3WQ5A 1B3WA 4UZUA 2EQDA 2JALA 1WP6A 2YL8A 5A8NA 4TX6A 4XB3A 2ZUMA 2VRQA 4W5ZA 4MNJA 4D71A 4CGTA 3NIYA 2FGZA 4JAWA 4PN2A 4CVWA 1W2VA 3EMZA 1I1WA 1HVQA 4UQBA 1TVNA 1CGWA 2VVSA 5BXPA 3SUWA 4JKKA 1XSKA 2VOTA 4PRWA 3WENA 4JL1A 3GNRA 4E8CA 1EO7A 3WMCA 1GOIA 2PB1A 1ITCA 4QFUA 5A2AA 1JDAA 3M6DA 2YA2A 5C70A 2OYKA 4ATLA 1KBKA 5A2BA 2J7DA 1TMQA 2WYSA 4W5UA 1BG4A 1JF5A 1V6WA 4X0NA 1JD9A 1XC6A 4F79A 1EHNA 1JFXA 4HTYA 7A3HA 2WBKA 4YPJA 4CVUA 2VX7A 2WHJA 5A6SA 3B8SA 1E43A 2WPGA 3S6TA 5A6BA 4AD2A 1DEDA 1UQYA 4QCFA 1G9HA 1LLOA 3NDYA 2WAGA 4J7RA 2WXDM 4U3AA 2BNJA 4Q22A 4NSBA 4WIWA 4AZBA 3EDFA 4MDPA 1FH8A 2V3EA 1BFNA 1V6YA 1VFMA 5ABHA 4DWSA 3UG3A 3LPOA 1U30A 2WWDA 4B3KA 2VMFA 4EE9A 1BPLB 4KGLA 1UUQA 3SUSA 1MW2A 3VIGA 1SFSA 3QHOA 3T0AA 2Y24A 4AIEA 4ACZA 3CZGA 2C0HA 1TA3A 4JIEA 1V6XA 2ZX6A 1KFWA 1MXGA 5HPOA 2OWXA 4J3SA 1HXJA 1BF2A 3CZEA 2XG9A 1E72M 1D2KA 3VMOA 1MQQA 4PEEA 3WF2A 4Q7NA 4W93A 4PCTA 3WBAA 5CJ5A 4XZBA 3OIHA 2GJPA 4TUFA 2E9MA 1CLVA 1MWOA 3M46A 1R86A 4PMXA 4R27A 1HJSA 2XWDA 1CTNA 3VKKA 3THDA 4BCEA 4C7FA 3UESA 1ODZA 3DHPA 1GNXA 2WKGA 3VUPA 3BLKA 1QHZA 2CPUA 1VEPA 4Z2GA 5M5DA 6TAAA 3VMPA 3FAXA 3CGTA 3ZT5A 3N13A 4A3HA 3ECQA 5CZKA 4AIOA 5A6MA 1DWJM 5A6AA 1MW3A 2V3GA 1H2JA 4CN4A 3M7SA 1BVNP 4W89A 2E40A 4CU8A 1PX3A 4HZ6A 1G01A 3RILA 4D6DA 4YN5A 4B3LA 1O6IA 1K9EA 1QOXA 2VZSA 3OLEA 4UFLA 4ZE4A 4AD0A 1JF6A 4PYSA 2D1ZA 3MUAA 1K9TA 2BV9A 5CPQA 2D24A 4UOJA 1MFVA 1MVYA 1KQZA 1JXKA 2XVKA 3ARZA 1QHPA 1JZ3A 5DF0A 5BCAA 3OLIA 3BH4A 2G3JA 2YLLA 4AEEA 2EBNA 3JUGA 5FD0A 1J9YA 3WMSA 3OLGA 1XV8A 4D6CA 4BQ5A 2XIBA 4NZCA 1WDSA 1ZBWA 1UKOA 1X6NA 3BSGA 2ZXQA 4P8WA 3VDAA 1OIMA 1CXFA 2FDMA 1ZBCA 2VT0A 1E0VA 1MW1A 1GQLA 1JZ8A 4UQAA 3WF0A 2XHYA 3DYPA 2A3EA 1BTCA 3WF4A 1LL7A 5ABGA 2OYMA 2WVTA 3VNYA 3WH7A 1HJXA 3MMUA 4UQDA 1HT6A 2OSXA 3S2CA 1PX4A 4HZ7A 3BLPX 1V3JA 4KH2A 4QCEA 3GXMA 1OGBA 3WDJA 4OKDA 3CIVA 1GJUA 1H1NA 2VI0A 1NP0A 3OA5A 3TTOA 4CD4A 4CD5A 5CQ1A 2V3DA 3MMWA 3ARUA 4WSJA 1G1YA 1M04A 1B31A 5CPTA 3PZ9A 4IUGA 1OD0A 1B9ZA 4P8UA 3ZQ9A 2CERA 4LPCA 5D9NA 2VX6A 1LL6A 1NWSA 1Z32X 3VMNA 4QLKA 1H0IA 2ZXBA 3AIQA 4GQQA 2G3IA 5GNXA 1C93A 1VB9A 4PSPA 4HPGA 1BGGA 1DWAM 2QMKA 1J0HA 1EGZA 2MANA 1GW1A 3APGA 1C8QA 1B0IA 2WMGA 1BAGA 2X1IA 3FNDA 3WSUA 1UR9A 4LYRA 4CUCA 3E1F1 3O2LA 3WNOA 4M8UA 1UZ1A 2BY3A 1UZ4A 2V38A 4TX8A 2D22A 3WEMA 3VDHA 1R7OA 4WLCA 2ZX8A 1JZ7A 4XUYA 1E6PA 5A95A 1CIUA 3VU2A 3RPMA 3W81A 3UG5A 2ZUTA 1OGSA 3QGVA 4P7OA 1KGWA 1UWIA 3PZOA 4MJ4A 3UR7A 3OGVA 4WF7A 2VTFA 4PCSA 1JXJA 1KR0A 4UQCA 5C8BB 1MQPA 4MTVA 1CGUA 1B3VA 4MB1A 1C7TA 3UG4A 6CGTA 3CMJA 1GUVA 4M82A 5D9MA 1ZBVA 3BXWA 5ABFB 2W5FA 1FFRA 2QHAA 2UY5A 4H8VA 1ECEA 1W91A 4UOQA 1XH0A 1XD0A 1LJYA 2UY2A 4UZSA 4AC1X 4JKMA 3UETA 1CPUA 1H3GA 3AIUA 4OOZA 1UKQA 5D8ZA 4JFUA 2CEQA 1HKKA 2E9BA 3IJ8A 4HOWA 4XX6A 1U33A 2CETA 3NCOA 2EPNA 1Q6EA 2XVGA 2JEQA 2XYLA 1NOFA 3GXFA 1FHLA 1TCMA 3MANA 3BAWA 2DPEA 2VUYA 5AY7A 3M07A 1LF1A 3VIFA 3O9NA 4KMQA 1E6ZA 4HU0A 1UD5A 5EFFA 4U2YA 1PBGA 1CXKA 2DT0A 4CU7A 4BQ4A 1UWRA 4FF5A 3MUZ1 1CBGA 5EFDA 1D7FA 4IPLA 2W67A 3MUY1 3K1DA 3T2QA 1JDCA 1PEZA 1KR1A 3ALFA 3QHNA 3WD0A 4FLQA 3NSNA 1ISYA 4PMZA 4TTUA 2BY0A 4F9JA 5A69A 1R87A 4X9YA 1KB3A 4ML4A 1JL8A 3A6OA 3T2PA 2YBTA 3MS8A 3SEPA 2WZIA 2XPKA 3NYDA 1G94A 2NT0A 4FLSA 1GCYA 2VX4A 1XHGA 5DMYA 1UH2A 1K9FA 4CCDA 1HJVA 3FY1A 2DIJA 1QVBA 2OYLA 3PTMA 1XYZA 1LG1A 4NRSA 2GK1B 4UFJA 1VFOA 1DP0A 1KXVA 2WVVA 1DHKA 2D0FA 5BXSA 4AXNA 1UA3A 2Z1SA 4LYQA 1QW8A 2Y2WA 5LA0A 3SCOA 3BSHA 3POHA 3BGAA 2VCCA 4UQEA 2YJQA 1VENA 5BROA 3SCUA 4N0RA 2CBIA 3IJ7A 3PHAA 3WKZA 4KWUA 2YOCA 3AIWA 1CEOA 2XJ7A 1UA7A 5E0CA 4JKLA 1W1TA 3AS3A 5AYBA 1UH4A 3SIMA 1ZJAA 3WL0A 4AYSA 4DUWA 1OGGA 1B2YA 2WCSA 1V02A 3AXIA 1XYFA 3VNZA 2ZWYA 1X1NA 4X0VA 4GKLA 2ZX7A 1W3KA 2QV4A 3CPUA 1GOQA 3AZRA 3BMVA 3OGRA 3DYMA 4PTWA 2EPLX 3AMDA 1DWGM 3W4RA 4BS0A 4D1IA 4OIFA 4PMDA 2O9TA 6A3HA 1VJZA 4JFSA 2EJ1A 4ZEPA 1OIFA 3EDDA 3AIBA 1VIWA 2WMIB 3CZKA 2W4XA 2VCBA 1TA3B 1KCLA 4GI8A 1E6NA 4P7QA 2WLZA 3POCA 3AHXA 1VEOA 3F5KA 1H49A 2PWFA 2YKKA 3K4AA 2Y5EA 4JFWA 4N42A 4AD1A 1C8XA 4DM2A 4AZCA 1H11A 3KL3A 2EPKX 1BG9A 4W8AA 1K6AA 3ARWA 4S3KA 4R5EA 1NARA 4FLOA 4PTMA 5FKYA 1LQ0A 4GO9A 2ZICA 1MXDA 5F7UA 1B3ZA 4AZHA 4HZ8A 3AMKA 1WNOA 3RM8A 4W86A 1Q6FA 1QI5A 3WUBA 4AZ5A 3DHUA 1VEMA 1W1VA 1RH9A 2GJRA 1KXTA 2D0GA 3AMCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JDD A;  4MDO A;  4C7D A;  2PI6 A;  3B9A A;  5LA2 A;  7CGT A;  4CKQ A;  1W1P A;  3ARR A;  1CEN A;  2OLH A;  1WDR A;  2XGB A;  4BZY A;  4UFI A;  2WZH A;  5CGM A;  1D3C A;  4A3Y A;  4LXF A;  1LG2 A;  3AHT A;  2BY2 A;  1CZ1 A;  1OWQ A;  2XFF A;  3FHA A;  2NW0 A;  1E4N A;  4TVD A;  3QOM A;  5M03 A;  2XVN A;  2E0P A;  4HME A;  1OM0 A;  1V0L A;  2WMK A;  1WPC A;  2CBJ A;  2OWW A;  2FGL A;  5HDR A;  1FH9 A;  3A47 A;  1QNP A;  3T2O A;  4PMR A;  1EDQ A;  4YHG A;  2WLY A;  1J12 A;  2XM2 A;  3ZJK A;  4H8U A;  5EMY A;  2WMH A;  3B9D A;  4U33 A;  3THC A;  3PZQ A;  1QBA A;  1V0K A;  3QHM A;  1C91 A;  3TON A;  5A8O A;  3L4X A;  5GPR A;  3VO0 A;  3WEO A;  3I3D A;  3WQ6 A;  4GIN A;  4M81 A;  3GH4 A;  1GQK A;  2J74 A;  3CUF A;  2ZOX A;  1UG6 A;  2WKL A;  1I1X A;  1CEC A;  4AZG A;  1NP2 A;  3SCN A;  5DO8 A;  4AIU A;  3SCT A;  1E1F A;  1HKJ A;  5A8M A;  1GOR A;  2J78 A;  5M17 A;  1BLI A;  1M01 A;  4FK9 A;  2J77 A;  4L4P A;  3K8M A;  1XH1 A;  1Y7V A;  3CZJ A;  3N04 A;  1LWJ A;  3WUG A;  2HVM A;  4QP0 A;  2CCR A;  1UH3 A;  1NWT A;  4AD4 A;  5LYR A;  4JHO A;  3VGB A;  2J7H A;  4CN1 A;  2EXO A;  3L4V A;  1CGT A;  3W6L A;  5I79 A;  4MNK A;  1QI2 A;  5JIW A;  1EOM A;  2WSP A;  4U31 A;  4WKF A;  2CHN A;  3AIC A;  5GQB A;  5AC4 A;  2ZUU A;  1ESW A;  3W24 A;  2VVN A;  4B9Y A;  4MNL A;  1G5A A;  3CUG A;  3A3H A;  4B16 A;  5CSU A;  2D23 A;  3ARP A;  4HU8 A;  3AYS A;  3GXD A;  4W88 A;  5I2U A;  3EMQ A;  3LMY A;  3VD9 A;  1E6Q M;  2JF6 A;  1EO5 A;  1GON A;  1GZJ A;  4XZW A;  3SCR A;  3DC0 A;  2FHC A;  1MQR A;  2ZX5 A;  4UR9 A;  5CG0 A;  4D6G A;  1WE5 A;  1UKT A;  3VDC A;  2D2O A;  4IIS A;  3MUI A;  4XV0 A;  4URI A;  3QR3 A;  3OZP A;  1ZL1 A;  3GH5 A;  3VIJ A;  2X2Y A;  3TTY A;  4LGX A;  4PMO A;  3RCN A;  2XII A;  4HA1 A;  2GVY A;  1GVY A;  1BHG A;  3VM5 A;  2VCA A;  4GQR A;  3CH9 A;  1E3Z A;  1JND A;  1W3L A;  1WDQ A;  3K8K A;  2VQT A;  4MB4 A;  5ECU A;  3GBD A;  3OBA A;  4BQ3 A;  4D6E A;  2PWD A;  4TVU A;  1N82 A;  1BYB A;  1X6L A;  3RIK A;  3BCD A;  3AML A;  3PZM A;  1XCX A;  2J7B A;  2J8G A;  1UWQ A;  4P7N A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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