1UQZA

Xylanase xyn10b mutant (e262s) from cellvibrio mixtus in complex with 4-o-methyl glucuronic acid
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
GLKSAYKDNFLIGAALNATIASGADERLNTLIAKEFNSITPENCMKWGVLRDAQGQWNWKDADAFVAFGTKHNLHMVGHTLVWHSQIHDEVFKNADGSYISKAALQKKMEEHITTLAGRYKGKLAAWDVVNEAVGDDLKMRDSHWYKIMGDDFIYNAFTLANEVDPKAHLMYNDYNIERTGKREATVEMIERLQKRGMPIHGLGIQGHLGIDTPPIAEIEKSIIAFAKLGLRVHFTSLDVDVLPSVWELPVAEVSTRFEYKPERDPYTKGLPQEMQDKLAKRYEDLFKLFIKHSDKIDRATFWGVSDDASWLNGFPIPGRTNYPLLFDRKLQPKDAYFRLLDLKRLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Mechanisms by which Family 10 Glycoside Hydrolases Bind Decorated Substrates
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cellvibrio mixtus
molecule keywords ENDOXYLANASE
total genus 142
structure length 348
sequence length 348
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uqzA00
2BY2A 2WHLA 3AMDA 4NRRA 4IISA 1JFHA 4GXPA 1E0VA 4OJYA 4M82A 1J11A 3BXWA 3CZEA 2YLAA 2YIHA 1W9BM 2WM0A 4H04A 4W8AA 2CBVA 4LYQA 3AHZA 1V6WA 1OIMA 1CXHA 2E4TA 4D6HA 4U5IA 5M5DA 3CTTA 5A2BA 1R85A 3WQ8A 4AZBA 3SCWA 4AXNA 1BVNP 1E4MM 2VTFA 2IUZA 3VKKA 2BXYA 4V2XA 5DEZA 1OINA 2WCSA 2E8YA 1Q4NX 3PN8A 4MTVA 4CN4A 1GHSA 4CCEA 3F5LA 1BAGA 3M6DA 4AW7A 3POHA 3WUEA 5HPCA 1V6YA 1ODZA 4F9DA 1QNOA 1JI2A 1KR0A 4TVUA 3EDJA 2ZUVA 1QI2A 3L4XA 5LA1A 1JZ7A 1UR0A 3ZO9A 4Z2LA 2VVSA 4MDOA 1UR1A 1VJZA 4UFHA 3W81A 1V3HA 1JI1A 1SFSA 1OIFA 1HVQA 1DWAM 1PX3A 3QOMA 4MNMA 2XVLA 4LPCA 3CMJA 1MQRA 5BXTA 1MW0A 3QR3A 1Q6GA 3HMCA 5HDRA 1GONA 4J3VA 4TUFA 3VIPA 4M1RA 5CSUA 1NQ6A 3DHUA 3WEOA 1EDTA 4RE4A 4UQBA 2AAAA 1OGSA 3OG2A 3N9KA 2CETA 3ZSTA 3W0KA 3IK2A 1OD0A 4UQAA 4C7DA 4ZXOA 2PC8A 4GI8A 4ACYA 4MPKA 2NSXA 4CCDA 1W3JA 3VGBA 4UQDA 1UKOA 2WHMA 2GSJA 1OB0A 2V5CA 1KWKA 2PWHA 5HOSA 4DWSB 3W6LA 2YJQA 3CZLA 1E0WA 5BWFA 3RDKA 5DO8A 1V02E 3L2LA 3MANA 1CGVA 2VVNA 1JAEA 3K8KA 3T0AA 4CVWA 3MO4A 3CZKA 1EO7A 3POCA 5CSYA 5A95A 1GORA 2YKKA 3WDIA 2GK1A 4WK9A 2XGBA 4JFVA 4QLKA 2VQUA 3M7SA 2VCBA 3AIWA 3AIUA 3PZOA 4URIA 3K1DA 4W88A 1EH9A 1B2YA 5A6MA 3AZRA 5A6KA 3VGFA 4UFLA 2D0GA 1UD3A 3K8MA 2J4GA 1LLOA 3DECA 3I3DA 2A3BA 2D0HA 1KCKA 2FGLA 1EDGA 3WNMA 4GINA 4CKQA 1JXJA 2O92A 2WB5A 5DMYA 4EE9A 4GI9A 4AD1A 3WF2A 1B90A 3WUGA 2CYGA 1PAMA 4MNLA 3PTKA 1GQKA 3NSMA 2F61A 3U5UA 1M03A 1KGUA 4UTFA 4HOWA 1B30A 5M03A 3AS3A 1FP8A 3RM8A 2UY3A 1SYTA 2J7CA 4WIWA 5LA0A 1R7OA 4LQ1A 3NCOA 4OZOA 2CESA 3VPLA 4PCTA 2G41A 4QFUA 3BMWA 1LG1A 4LYRA 4PMQA 3WNNA 2WZIA 2E9MA 5JIWA 2CEQA 2GUYA 3WNOA 3BCDA 1VIWA 3CLWA 2X1IA 5D9OA 2ZXBA 1UD6A 3SEPA 1WCGA 2F8QA 1D2KA 3L4ZA 3AQUA 1ZJAA 1GUVA 3FHAA 4CUCA 1BQCA 2E3ZA 3FNDA 3PZUA 3ZQ9A 2CBIA 3VIIA 3WIJA 1PX4A 5JUVA 3OA5A 1LJYA 3AYRA 1JYXA 3GDBA 3W26A 4QDMA 4QCEA 2UWFA 4F9JA 3SCRA 4AD2A 4CD6A 1OT2A 4W5UA 3WN6A 5I77A 1CGWA 1VENA 1W9UA 2YDSA 5E70A 1DWIM 2C8NA 3L4TA 2WWCA 4MB1A 1EO5A 3FY1A 2D24A 2Y24A 4PMXA 4DWSD 1O7AA 4ACZA 1UWQA 2W67A 1UR9A 3SCTA 2G3JA 1XHGA 2BHUA 4AZ6A 2WLZA 4MJ4A 2CCRA 3UG3A 3LPPA 1UR4A 4W87A 1NWSA 3TTOA 2YA0A 3GXIA 3SCNA 4H8VA 3VM7A 3UETA 1J9YA 1KQYA 2DT3A 4J27A 1BG4A 3WMSA 3AMKA 2O9TA 4HU0A 3KZSA 1NOWA 7CGTA 4HU8A 3WDPP 1EGZA 3N12A 4UFJA 5CXPA 3CUFA 4JKLA 2YLLA 3CHDA 3ZT7A 2VC9A 2JEQA 1US3A 4PTVA 1WDRA 1JDCA 4TVDA 3D3AA 1CGYA 4GQQA 4OUEA 4OKDA 2CHOA 2J7EA 4MB5A 3AICA 1ZU8A 5JBEA 1SR0A 4JKKA 1W2PA 1VEOA 2CKRA 5E0CA 2ZXDA 3LPGA 3IJ9A 3HN3A 3THDA 3SCOA 3TOPA 2J79A 1HN1A 1HJUA 3UR8A 2EO7A 2J25A 1UWIA 2OYLA 4D72A 4H7VA 3HU7A 2DSVA 4K68A 3UESA 1FA2A 4GZIA 4ZE5A 4AZ5A 2WMHA 1MFVA 1BG9A 1QI4A 3GXDA 1C91A 1WZKA 2WXDM 5LA2A 1E4IA 4AZIA 4IM4A 2JEPA 2EPLX 4TX8A 3LMYA 3WELA 1V0LA 4J7RA 1CXEA 1QVBA 3A6OA 4YPJA 4JCMA 2WAGA 1DTUA 2J62A 1QI0A 3SUSA 1TMQA 3ZIZA 3WKZA 3AMGA 3RO8A 2XIIA 1LQ0A 2QLYA 5E9AA 1NOFA 4AZCB 5E6ZA 4J3TA 4GKLA 3CUHA 1H1NA 1AQMA 1EDQA 4D1IA 4BQ2A 2ZOXA 1J10A 1KCLA 4CGTA 3WBEA 4CD4A 2GK1B 4UZUA 4GI6A 3MV11 5CG0A 3RPMA 1CGUA 2X09A 3VOCA 1LWHA 1HIZA 1YHTA 4LX4A 7TAAA 2W61A 2BVYA 2XFFA 4LXFA 1JD9A 3GBDA 3T2QA 5ABHA 2UY2A 3SIMA 2ZICA 1E4LA 3AHYA 4HZ6A 3AHVA 1ZL1A 3ARQA 1C7SA 2DSZA 2VJXA 4PBGA 4AC1X 1QBBA 3W4RA 4KH2A 1JG9A 1GVIA 5A6JA 1DWJM 1W91A 2JF7A 3WSUA 5BCAA 3MMUA 2BVTA 3U57A 2BY3A 3L2MA 2VT0A 5D9MA 3AXIA 1E9LA 4TTGA 2FHCA 2J78A 3VVGA 2EQDA 3ZMRA 2HISA 1MW3A 3SCVA 1NP0A 4J3SA 3MUIA 5I23A 4BQ4A 2YDQA 3WQWA 1UWUA 5A69A 5HXMA 3VGHA 2V3FA 4KGLA 4W89A 1J0IA 2GVYA 4AIEA 1JZ3A 3BAKA 4B9YA 2XFRA 1WO2A 4W5ZA 1XV8A 1H09A 3ALGA 2JFEX 1CIUA 3AIQA 1QW9A 1BGAA 1W3LA 1JYVA 3UERA 4NZCA 3II1A 3CUGA 4AYSA 3B9DA 3MMDA 4UQEA 2O9PA 3WD4A 1DWHM 1HKKA 1F4HA 1FHDA 2PWFA 3CUIA 5BXPA 1B31A 4F79A 1XD1A 3BAJA 3U7VA 3A3HA 4V27A 2XGIA 1YQ2A 3VO0A 3B9EA 2ZUTA 1GPFA 3WY1A 1JFXA 1EQCA 3A4WA 1MFUA 4HPHA 2Y5EA 1UWTA 2EPKX 1WPCA 4B15A 3EDDA 5C71A 1V3IA 5BYWA 3CH9A 3VDBA 1C8QA 2WCAA 5DT7A 2PI6A 2ZUMA 3G6LA 3T2PA 3CZ8A 3CZGA 3W27A 2WHJA 3AXHA 1JZ6A 3AMLA 4ACZB 4XZWA 1UHVA 2W91A 2PBGA 2YOCA 3SUWA 3WDQA 1ODUA 3GBEA 3DHPA 1HJVA 1FHLA 2QPUA 1K9EA 1JF5A 1BSIA 1PIFA 4OIFA 3PZGA 2YBTA 4FMVA 4FLSA 2VR4A 4HMEA 4J28A 2J7BA 4AD3A 1GOIA 2WNWA 1NWTA 2D0FA 4UNIA 1VJSA 1J0YA 1N82A 2Y8VA 1MYRA 3EDEA 1V3LA 3WMCA 1EOMA 1OCQA 1I1XA 3A4XA 3VIFA 2WMIA 3AHTA 2XG9A 8A3HA 1MXGA 1W3KA 3O9NA 3BSGA 3PTQA 1ZB5A 3MUZ1 1IZKA 3A47A 4QCFA 3VUPA 1ZJBA 1Q6CA 1V0KA 4RE2A 1UR8A 2YA1A 1JL8A 3OLGA 1CTNA 1BYBA 2BHYA 2VZUA 3F5JA 4NI3A 5E0FA 1G5AA 1UUQA 4W7VA 4TXEA 2ZE0A 2C7FA 3KWXA 4ATLA 3IANA 1ISVA 1SMDA 2A3EA 1PJ9A 5IFPA 4UQ9A 4WKFA 1J0HA 3QHOA 4GPNA 4ML4A 1O6IA 2G3NA 3ZJ7A 1H2JA 2EEXA 3WDRA 4HP5A 4Z2KA 3B8SA 3WEMA 2VR5A 3PZNA 2GJRA 2WKLA 2FH6A 3W37A 1WP6A 4JCLA 3GM8A 1KFWA 1E1FA 3GNRA 5TD4A 2VZSA 3M46A 1E5JA 1WAWA 3UEQA 3W25A 3WNLA 4D6JA 4PMNA 3S6TA 2TAAA 4J3UA 1X6NA 1CEOA 1OWQA 1E43A 3CGTA 1LL7A 3EYPA 2OWCA 1E71M 2VX7A 3IJ8A 3GH4A 1CXKA 3WL0A 4PYSA 2QMJA 2QHAA 4KRTA 1JGIA 3CMGA 3M07A 4HMCA 3CIVA 3OZOA 1UD4A 4CU7A 2OYMA 3CHCA 1Y7VA 1QNRA 1JIBA 3RIKA 3WH8A 4D6EA 2OSWA 4MAZA 1KXTA 5IFTA 4E8CA 3BAYA 3I3BA 4KGJA 1TUXA 1E56A 1QPKA 3ZR6A 1H0GA 1VBRA 3N04A 5DT5A 2DIEA 5A2CA 3RMEA 3EMCA 1E3ZA 5EMYA 3WNPA 2NT0A 4S3KA 2V3DA 3EMQA 3WFLA 2AMGA 2CBJA 3WDHA 2VX6A 4D6IA 1GW1A 1B3ZA 5BXRA 1PEZA 3CO4A 4BQ3A 2VL4A 4FK9A 1Q6FA 1UKPA 4AD0A 1B0IA 1HJXA 3VGDA 1JDAA 3SUTA 3U7BA 5FL0A 5IHRA 2X0YA 4P7RA 4DWSC 3OLDA 4D1JA 2RGMA 4QAWA 4CN1A 2CXGA 3BC9A 4PMVA 3AIVA 1V03A 2EBNA 4WKHA 1VEPA 4Y7EA 2VZTA 3ARWA 1ISWA 4HA4A 5D9NA 1E1EA 1ZBCA 3PZ9A 1HX0A 1KGWA 2W63A 3BH4A 1QNSA 1H5VA 1V3KA 3W29A 4UQCA 5D9PA 3VMOA 1HKMA 4P7QA 3NJ3A 1Z32X 1WDQA 2W4XA 1GQJA 5BRQA 3AYSA 3VDAA 3MUY1 1LF1A 5CJ5A 4OBSA 3O6AA 4UOQA 5A8OA 3QHNA 1C8YA 4FLRA 2VOTA 4WKAA 5A8PA 1VF8A 3MU7A 3ZJ6A 2BFGA 3ARXA 2YL8A 3PZMA 3OBAA 4B3KA 1B9ZA 5CLTA 5AC5A 1M53A 4KMQA 1W9DM 1XH1A 2J74A 2DH3A 2VCAA 4N0RA 1UZ4A 3MS8A 3HJEA 1TA3A 1CENA 1QI3A 1EHAA 1EA9C 5FCZA 2WK2A 5AC4A 1WKYA 2Z1KA 1PBGA 5I6SA 4N42A 2YA2A 4MB3A 2D22A 3VD7A 2CIPA 2EXOA 3SCSA 3TP4A 1UD5A 2ZXQA 5E09A 3NUKA 3GYCA 4P8UA 4P7NA 2WWDA 2VI0A 1RP8A 1B3VA 1W1YA 4P7OA 4XZBA 3BGAA 5ABGA 1M01A 3VNYA 1CGTA 4ATWA 2Y8KA 1UR2A 3NSNA 1QI5A 5C70A 3O2LA 1BYCA 1VBUA 2DSUA 1E72M 2IXVA 2NT1A 2XWDA 4CD7A 4LGXA 4ZXLA 1RD6A 5M17A 1R87A 1DEDA 3WF0A 2BS9A 4WJXA 5I79A 1K9TA 2PWGA 3K4DA 1ITCA 1KGXA 2MANA 3ECQA 1ISYA 3BAIA 3W38A 4AZGA 3ZOAA 2CKSA 2UY5A 3WD3A 2E9LA 3FHQA 1GOMA 4PMOA 2WC4A 1GCYA 2J7FA 4Z2JA 3VIOA 2B31A 4HMDA 2WMIB 1BGGA 3F5KA 1JF6A 1RP9A 1OGBA 3THCA 3WH5A 3GTNA 2ZUUA 1AQ0A 5I0DA 4D6CA 5A6BD 3K46A 3NIYA 4WF7A 5A8QA 3CUJA 1OD8A 2J7GA 3EDKA 2XVKA 1JNDA 3VM5A 1HP4A 1CXLA 1D7FA 1DWGM 1R86A 5DFAA 1UD2A 1W9VA 3VDCA 1EOKA 1MVYA 1QHZA 3AMCA 3KL0A 4BZYA 4PTXA 4Z2IA 3GH5A 2GJXA 4W7WA 2G8ZA 3VIMA 1IT0A 1CGXA 1C93A 3DYOA 1G1YA 3UCQA 1E55A 3N1AA 4M56A 2V5DA 3ARRA 1GHRA 4Q22A 3T09A 1E6QM 2EPOA 3RM4A 2VRQA 3N17A 4MADA 2IXUA 3WUFA 3OZPA 4B3LA 1V0NA 2XTKA 3GNPA 1RPKA 1UKQA 4AMCA 1XYZA 2XVNA 3JUGA 1CBGA 4HTYA 1XC6A 1DHKA 3RILA 2WMFA 4TVCA 2BHZA 4DUVA 5HBFA 4M24A 4U3CA 5CGMA 2WYSA 1F4AA 2VZOA 4HA3A 1E15A 3AIBA 1V6UA 3T0BA 4R27A 4CCCA 2J8FA 2W92A 2VZVA 4BA0A 1FP9A 1TFVA 3N13A 4AD5A 5KZ6A 3RCNA 2PBOA 1UQZA 5FL1A 3VIHA 4ZFMA 2CBUA 4PTWA 3RJXA 3PHAA 1M7XA 1QHPA 2FGZA 4NSBA 2PWEA 3DYPA 1VFFA 3FW6A 4M8UA 1KWGA 3AZSA 4W7UA 8CGTA 3VMPA 3L4UA 4W93A 4BF7A 1CYGA 2D1ZA 3PZQA 4M80A 2X05A 5A94A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BY2 A;  2WHL A;  3AMD A;  4NRR A;  4IIS A;  1JFH A;  4GXP A;  1E0V A;  4OJY A;  4M82 A;  1J11 A;  3BXW A;  3CZE A;  2YLA A;  2YIH A;  1W9B M;  2WM0 A;  4H04 A;  4W8A A;  2CBV A;  4LYQ A;  3AHZ A;  1V6W A;  1OIM A;  1CXH A;  2E4T A;  4D6H A;  4U5I A;  5M5D A;  3CTT A;  5A2B A;  1R85 A;  3WQ8 A;  4AZB A;  3SCW A;  4AXN A;  1BVN P;  1E4M M;  2VTF A;  2IUZ A;  3VKK A;  2BXY A;  4V2X A;  5DEZ A;  1OIN A;  2WCS A;  2E8Y A;  1Q4N X;  3PN8 A;  4MTV A;  4CN4 A;  1GHS A;  4CCE A;  3F5L A;  1BAG A;  3M6D A;  4AW7 A;  3POH A;  3WUE A;  5HPC A;  1V6Y A;  1ODZ A;  4F9D A;  1QNO A;  1JI2 A;  1KR0 A;  4TVU A;  3EDJ A;  2ZUV A;  1QI2 A;  3L4X A;  5LA1 A;  1JZ7 A;  1UR0 A;  3ZO9 A;  4Z2L A;  2VVS A;  4MDO A;  1UR1 A;  1VJZ A;  4UFH A;  3W81 A;  1V3H A;  1JI1 A;  1SFS A;  1OIF A;  1HVQ A;  1DWA M;  1PX3 A;  3QOM A;  4MNM A;  2XVL A;  4LPC A;  3CMJ A;  1MQR A;  5BXT A;  1MW0 A;  3QR3 A;  1Q6G A;  3HMC A;  5HDR A;  1GON A;  4J3V A;  4TUF A;  3VIP A;  4M1R A;  5CSU A;  1NQ6 A;  3DHU A;  3WEO A;  1EDT A;  4RE4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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