1UWIA

Crystal structure of mutated beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus, working at moderate temperature
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDLNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHNNAQKMGLKIARLNSEWSRQFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFIQNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYTAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTGKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSSLVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Comparative Study and Mutational Analysis of Distinctive Structural Elements of Hyperthermophilic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
total genus 195
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwiA00
4J3UA 4W8LA 3BAKA 5CGMA 1J0JA 1RD6A 1US3A 2O9PA 5HXMA 1JL8A 1J10A 3VINA 1E15A 4MJ4A 5CSUA 4DWSA 3WQ8A 1KCLA 3QOKA 2X1IA 1E6NA 3WD4A 2RGMA 4N42A 4W7WA 3CZGA 4PTVA 1C8XA 1PEZA 1ISXA 4P8UA 1C8YA 3MV01 1V6VA 3LMYA 2A3EA 3BMVA 1MXGA 4CVUA 3U5YA 1MQRA 1EOMA 1TE1A 2CPUA 1M03A 2WCAA 4M82A 4QFUA 2PWGA 3AMGA 4QLLA 3CO4A 3NDYA 3AQUA 1ITCA 2J7CA 1VIWA 3WUFA 4IM4A 2DIEA 4D6EA 1JD7A 2WLZA 3GH7A 1NWTA 3NJ3A 3BAJA 2PWDA 2YLLA 4AZBA 1W1YA 4YHEA 5A6KA 2YOCA 2NT0A 1OD8A 1IZJA 3KL5A 2BY1A 4DWSB 3OLEA 1CZ1A 1QNOA 2DT2A 5CQ1A 3U5UA 3U7BA 3RO8A 5GNZA 5EB8A 1G01A 3AISA 1TVNA 2W67A 2WAGA 1W3JA 5BXSA 3N12A 4GI9A 4DUVA 3I3DA 5A3HA 3FAWA 1HVQA 3BH4A 3OGRA 4RE2A 1MVYA 4V28A 3A4WA 4AZCA 3GTNA 1V0NA 1R8LA 1Q4NX 4Q7NA 2VZTA 1W9UA 3UEQA 3VGFA 2DSZA 3AS0A 1XH2A 1FFQA 2E8YA 1E56A 4MAZA 3O2LA 3SIMA 1B3VA 4UFKA 1GOQA 2VNCA 1PX3A 5DMYA 4Z2GA 2CCRA 2YA0A 1UKQA 1OIFA 2DGAA 3T0AA 3K1DA 2GSJA 4JAWA 1V3KA 3MMUA 1J9YA 4TVDA 3ZJ7A 1HF6A 1H0IA 1CXKA 1TMQA 4MB5A 3G6MA 3IAQA 1Q6GA 5I3DA 4PSRA 4WK9A 3A4XA 1MW2A 4EE9A 3KL3A 2BS9A 3AIEA 1HT6A 4CU6A 6TAAA 4C7DA 1ESWA 1JNDA 2XM1A 3QHNA 2EPNA 3WH5A 1CDGA 3PZNA 3QHOA 2WBGA 3CIVA 2CIPA 3W0KA 2JIEA 2V38A 4MB4A 4B9ZA 4BQ3A 1JYVA 3BAWA 4AZCB 3NSMA 1OB0A 1NWSA 4JHOA 1HL8A 1UKTA 2W4XA 5AC5A 1J0KA 3MKKA 5FL0A 3WEOA 3GH5A 2XGIA 2J7FA 1QI4A 2XVLA 1H09A 1V3JA 3MUY1 4OUEA 2CKSA 4MTVA 3SCTA 5JIWA 3PTQA 2AMGA 7CGTA 3KWXA 5JBDA 1JZ8A 4W8AA 4DM1A 3AXHA 1U2YA 3A4AA 1E72M 3GZAA 1MW3A 3CHCA 1KR0A 2YIHA 1UR0A 1YHTA 1J12A 3VPLA 1TFVA 1R85A 3ZR5A 1JD9A 1H0GA 2G8ZA 5A8QA 3EDFA 3AS1A 4AMCA 1GOOA 1JGIA 4JFVA 3VNYA 3CMGA 4J28A 4WIWA 1YQ2A 3VVGA 2BVTA 2GUYA 2WW5A 3W6LA 3AZSA 3IANA 2D0HA 4OBSA 4B16A 4QP0A 1JDAA 2D3LA 4EKJA 1RP8A 3ARXA 3POCA 3BSHA 2B31A 3VIOA 2YKKA 3W25A 4D6GA 1UH3A 1UWQA 2WMFA 3CLWA 4HA1A 3N11A 1Q6CA 4EAMA 3VGGA 1WZKA 2O9TA 3WH9A 1J01A 1HXJA 1RPKA 3VIMA 1EIBA 4JCMA 3WMSA 3WFZA 1E71M 3MS8A 2JEQA 3WH6A 3GDBA 2XSBA 4XZBA 2Y8VA 3F5LA 2ZWZA 3OLGA 3MUIA 5I0DA 1X6LA 2WMJA 3AIVA 4W89A 1BGAA 3PZQA 3GBDA 2C0HA 1E40A 4NF7A 1KQYA 3WF3A 3PZVA 1IZKA 2VZVA 5M5DA 2XIIA 2QHAA 1V0LA 2HVMA 4AY1A 1QVBA 2J7BA 1CPUA 2VUYA 4CCCA 1XCXA 2BY2A 1VFFA 3BAYA 1KGWA 2AOSA 2ZUSA 3BSGA 1I1WA 1GQIA 1UZ1A 4UFIA 5EMYA 2VI0A 4MPKA 5D4YA 1QI2A 4P8WA 4BQ4A 2O92A 2GDUA 4CD5A 4UFJA 3NYDA 4M1RA 3AIQA 1HJVA 2J8GA 3K4DA 1HJUA 3WUEA 5A8NA 4YN5A 1UOKA 2D0GA 4PRWA 1C91A 1M04A 1XRVA 2ZWYA 3DC0A 3WUGA 3WD3A 4PMRA 3BAIA 4AD5A 4M80A 2GJXA 2VC9A 1XH1A 2ZXQA 4UOZA 1J18A 1HJXA 3ZQ9A 3HU7A 3WELA 4D1IA 3TTOA 4E8CA 2E9MA 4TVUA 1E9LA 1CGUA 4RE3A 2CEQA 4JKKA 4PN2A 2O9OA 4RE4A 3THDA 3ALFA 2ZUNA 5GNYA 4CU7A 2BFGA 5GNXA 5LA1A 3TTQA 3OA5A 3S2CA 2EPOA 3CZ8A 5AC4A 4UFHA 4OKDA 1C90A 3N13A 3TTSA 1UWUA 2VT0A 1V0MA 4W86A 3ZO9A 2D20A 2JF7A 4MNMA 4W88A 3TA9A 3G6LA 2DSVA 1VJZA 4HPHA 4PMUA 1LL6A 2E0PA 1GPFA 5A95A 3OGSA 4U3AA 4W7UA 2EPLX 1AQ0A 3AMCA 2WYSA 1WZMA 4ATWA 1UR9A 3SCQA 4Q22A 2GJXB 4UQBA 3W53A 1CWYA 4C7GA 1OGGA 1PZ3A 5I2UA 2D22A 4AIUA 4TX8A 5CZKA 3WNNA 4F9DA 1DWJM 3PZMA 1TA3A 1U33A 4B15A 5KZ6A 4CCEA 2V3GA 4W5UA 3VU2A 1GZJA 3CPUA 3VX1A 4UTFA 5ABGA 1UYQA 3OLIA 1CXHA 3NCOA 1XSIA 3WNMA 2F8QA 3PHAA 3SUVA 1M01A 1WZLA 5BRQA 2WMIA 1E1EA 1HJWA 3BLPX 4LYPA 1UWTA 1BPLB 1GJUA 2V3EA 1CLVA 5A6JA 1D2KA 4QAWA 1UKOA 2XSAA 3SCUA 3CZJA 5JBFA 3MO4A 1QI5A 1MYRA 3T2QA 1UH2A 1KGUA 5D9PA 5HNNA 1ZBCA 4NI3A 2CYGA 1QNSA 1UD3A 3RPMA 4PYSA 2UY2A 3FY1A 5I23A 1HNYA 1TA3B 3CGTA 1W9PA 2PWEA 2WLYA 3AZTA 5D8WA 2WC3A 2E3ZA 2YDQA 2BY3A 1MWOA 1UZ4A 4ML4A 4AZIA 1ZL1A 3N1AA 3NUKA 1UD6A 1K9DA 4E2OA 4MJ2A 3VD9A 2Y8KA 3ARWA 1OD0A 2VX5A 3WBEA 3VNZA 3ARRA 3WEZA 1QHPA 2WNWA 2WMIB 1QOXA 1VJSA 1W1PA 2WB5A 2Y4SA 3AIWA 2OWWA 2CHNA 2XPKA 3HJEA 2QMKA 5A94A 3EMZA 4P7LA 2GK1A 2VCCA 4U31A 1HKKA 3UR8A 5A6BA 4F79A 2VZUA 3EDEA 4D6DA 1EH9A 1W32A 2Z1KA 5E0FA 4U2YA 1V3HA 3N17A 1QBAA 2ESCA 3PZ9A 4PEEA 2V3DA 4AD3A 2FHCA 4W93A 2CESA 3CUJA 2JE8A 3AICA 4AW7A 1R7OA 3VDBA 2WSPA 1AQHA 4XUYA 2EPMX 4OIFA 2XTKA 3WF1A 4IUGA 1LL7A 1NWUA 4UZUA 1MXDA 1FH8A 3UCQA 3SUWA 2BXZA 3ZM8A 5C8BB 1PZ2A 4ZXLA 1ODUA 2CERA 3WD1A 4BZYA 5BXTA 2C7FA 1NWRA 1I75A 4ATLA 5LA0A 4OZOA 3VD4A 2CBJA 2ZOXA 4HP5A 5IFPA 2WK2A 4L4OA 2X09A 1W3KA 1E0XA 3M7SA 1W3HA 1H5VA 2OSYA 4AEFA 1KWGA 3CZEA 3SCVA 1LQ0A 4HOZA 4DM2A 2J7EA 1K9EA 4HA4A 3IK2A 4W84A 1E3ZA 1H11A 1E55A 3ZJ6A 3CMJA 1FHDA 2VJXA 1ISZA 3J7HA 5IXEA 1KR1A 2CBIA 1H49A 1KB3A 1LF1A 3CHFA 4PCTA 4W5ZA 1OIMA 4GXPA 4V27A 2XVGA 3CZLA 4XZWA 4WKAA 1CNVA 5E6ZA 1FOBA 1NOWA 4J3VA 1XCWA 1SMDA 2W92A 2DT0A 5A6MA 2XHYA 5TD4A 1A47A 1E4LA 3W38A 1JZ4A 2J79A 4IISA 4NSBA 2WWCA 1UKPA 1C8QA 1JZ6A 2YBUA 4BQ5A 2WSKA 1B0IA 3VMNA 4NZCA 4QLJA 4AZGA 2JALA 2VRJA 1KXVA 4ATDA 4P7NA 3ARYA 4BQ2A 3GXMA 4LPCA 2VR4A 3FHAA 3DHPA 1GORA 3VOCA 1UG6A 1GOWA 2VCAA 2NW0A 4HOXA 1BF2A 2PBGA 5ECUA 3K46A 4JL2A 2A3HA 1EO5A 2DH3A 1PJ9A 2ZUVA 3D3AA 1XSKA 3TP4A 4AIOA 3SCRA 1BVNP 1J0HA 4TVCA 1G5AA 1HKJA 3CUGA 1B9ZA 2OYKA 1MW1A 2YJQA 1DWGM 3ARQA 4BF7A 3B9EA 3MUZ1 2Z1SA 2WANA 2EQDA 5CPTA 3VGBA 1E6RA 2XVKA 2ZXDA 1E73M 4CN6A 4GZEA 3RILA 2WHLA 4X0NA 4CUCA 1WDPA 5I77A 3NDZA 4UFMA 3GNOA 1GJWA 5AY7A 3EMCA 3ZR6A 8CGTA 2QPUA 2WVVA 1HL9A 1C92A 5M17A 4D1JA 1C7SA 1UH4A 2EXOA 1JDCA 1NOFA 2YA1A 4JFTA 4GQQA 2C8NA 1VENA 2ZXBA 2J75A 1MQQA 2ZUWA 1HVXA 1B3ZA 1OGBA 3WQ6A 6CGTA 2JF6A 1GCYA 4M8UA 5BWFA 1CLXA 2XYLA 1VFUA 3OLDA 2ZICA 4JL1A 4AXNA 2FHFA 4D71A 4M24A 1PPIA 1L8NA 2ZX7A 3BLKA 1UWIA 2J8FA 1IT0A 1XD0A 3W81A 5KEZA 3GH4A 3GYCA 5M03A 1SR0A 4KRTA 1GOIA 1V02A 2DQXA 1BYBA 4LYRA 1JIBA 1VEOA 1CGWA 5A1AA 1K9TA 3T0BA 4B3KA 3VO0A 5JBEA 1MFVA 3JUGA 1LLOA 1HP4A 3AIUA 3F5KA 1H41A 4U2ZA 3VDAA 3SCWA 2ZIDA 1P6WA 1Q6FA 4JCLA 3UG3A 1FA2A 1CXEA 1QW9A 3MV11 4HMEA 1BTCA 1JFHA 2X2YA 3WSUA 4PMDA 2RGLA 3TONA 3UETA 2FDMA 1XC6A 4CN4A 4P7RA 3QR3A 2ZUMA 2DDXA 3KEHA 1KWKA 1VFMA 2NT1A 5ABEA 2BHZA 2VOTA 4CD8A 2A3BA 1C7TA 1E0VA 1TCMA 3WQVA 3PZIA 4HMDA 2VZOA 4OJYA 3SCNA 1X6NA 1FH9A 3RMEA 1O7AA 4PSPA 3BGAA 3W24A 3ARTA 5I78A 4M29A 3M07A 1GOMA 1FFRA 3TTYA 5JIPA 4KH2A 5CPQA 4AZ6A 3VIKA 1WAWA 1HIZA 4FLOA 5ABFA 2D24A 2PF0A 2QV4A 4FMVA 4CGTA 4DWSC 3W28A 4D6CA 4QLKA 3MMDA 1EQCA 1C3FA 1OWQA 4U5IA 2VX6A 2OSWA 2DPEA 5IFTA 3N18A 1UQZA 2WMGA 4DWSD 3WQ5A 3FW6A 3SEPA 3QHMA 3VDHA 1HP5A 1HN1A 2JIWA 4AD4A 2J4GA 5FL1A 1QNRA 1LWHA 5DT7A 3N15A 1EOKA 1LJYA 4OBRA 3AHXA 3SCPA 2WVTA 3GXDA 3I3EA 3RM8A 2WC7A 1B3YA 2DH2A 2CBUA 2J77A 3PZUA 5CGTA 4H04A 4AWEA 2XVNA 4PTMA 1OCQA 1FH7A 1ISVA 4GKLA 4Z2JA 2ZE0A 2AAAA 3RM4A 5ABFB 5DEZA 2D1ZA 2X05A 2G3JA 3PZGA 1HX0A 1WDRA 4FLRA 4PMQA 2VL4A 4E4PA 5CXPA 3SUUA 5FOOA 1V6YA 1V02E 4P8XA 2VO5A 1W1VA 1GOKA 4GI6A 3W29A 3KZSA 4JFUA 1ISWA 2ZX6A 1ZJBA 2ZX8A 2UWFA 2DT1A 1B3XA 2X0HA 3AI0A 2FGZA 3W26A 1CXFA 1HKMA 3VKKA 1QNPA 1DHKA 1A3HA 1V03A 4XV0A 3GXIA 3DYMA 1UD5A 2GFTA 4J7RA 3WH7A 3OB8A 2WCSA 1W9BM 2VTFA 1RH9A 1NQ6A 2V5DA 2D2OA 2F2HA 2XIBA 2VX7A 5BXPA 4ACYA 5I24A 5A8MA 1G9HA 1W9VA 5AYBA 7TAAA 1CBGA 1Q6DA 1J0YA 4HA3A 4UCFA 1DWAM 3WDRA 1E1FA 2W66A 4GZIA 3MMWA 5M3WA 2YDRA 4AD0A 4UQ9A 4JFWA 3AMDA 4MNLA 3HN3A 4X0VA 3K8KA 4GO9A 2J25A 4ZEPA 3VMOA 3ZOAA 2FHBA 4WSKA 2XFFA 3T0DA 3L4ZA 4PMYA 4HOWA 5A6SA 3F4VA 3W6MA 3UR7A 3AXXA 1BYCA 4UOQA 3WNKA 4KWUA 1UKSA 1ZB5A 4JKLA 4U3CA 3VGDA 3RM9A 1EXPA 3ZMRA 1UR2A 2J78A 5DO8A 1LWJA 2YL5A 1D7FA 1KXTA 3FHQA 3W82A 3K8MA 1ZJAA 1EGZA 1KBKA 2WM0A 5BCAA 4GI8A 3WEMA 3NIYA 1JFXA 5LA2A 5BROA 4PUDA 2PBOA 1ITXA 1VEPA 5I6SA 1J0ZA 1Z32X 5DF0A 3AHVA 2FGLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4J3U A;  4W8L A;  3BAK A;  5CGM A;  1J0J A;  1RD6 A;  1US3 A;  2O9P A;  5HXM A;  1JL8 A;  1J10 A;  3VIN A;  1E15 A;  4MJ4 A;  5CSU A;  4DWS A;  3WQ8 A;  1KCL A;  3QOK A;  2X1I A;  1E6N A;  3WD4 A;  2RGM A;  4N42 A;  4W7W A;  3CZG A;  4PTV A;  1C8X A;  1PEZ A;  1ISX A;  4P8U A;  1C8Y A;  3MV0 1;  1V6V A;  3LMY A;  2A3E A;  3BMV A;  1MXG A;  4CVU A;  3U5Y A;  1MQR A;  1EOM A;  1TE1 A;  2CPU A;  1M03 A;  2WCA A;  4M82 A;  4QFU A;  2PWG A;  3AMG A;  4QLL A;  3CO4 A;  3NDY A;  3AQU A;  1ITC A;  2J7C A;  1VIW A;  3WUF A;  4IM4 A;  2DIE A;  4D6E A;  1JD7 A;  2WLZ A;  3GH7 A;  1NWT A;  3NJ3 A;  3BAJ A;  2PWD A;  2YLL A;  4AZB A;  1W1Y A;  4YHE A;  5A6K A;  2YOC A;  2NT0 A;  1OD8 A;  1IZJ A;  3KL5 A;  2BY1 A;  4DWS B;  3OLE A;  1CZ1 A;  1QNO A;  2DT2 A;  5CQ1 A;  3U5U A;  3U7B A;  3RO8 A;  5GNZ A;  5EB8 A;  1G01 A;  3AIS A;  1TVN A;  2W67 A;  2WAG A;  1W3J A;  5BXS A;  3N12 A;  4GI9 A;  4DUV A;  3I3D A;  5A3H A;  3FAW A;  1HVQ A;  3BH4 A;  3OGR A;  4RE2 A;  1MVY A;  4V28 A;  3A4W A;  4AZC A;  3GTN A;  1V0N A;  1R8L A;  1Q4N X;  4Q7N A;  2VZT A;  1W9U A;  3UEQ A;  3VGF A;  2DSZ A;  3AS0 A;  1XH2 A;  1FFQ A;  2E8Y A;  1E56 A;  4MAZ A;  3O2L A;  3SIM A;  1B3V A;  4UFK A;  1GOQ A;  2VNC A;  1PX3 A;  5DMY A;  4Z2G A;  2CCR A;  2YA0 A;  1UKQ A;  1OIF A;  2DGA A;  3T0A A;  3K1D A;  2GSJ A;  4JAW A;  1V3K A;  3MMU A;  1J9Y A;  4TVD A;  3ZJ7 A;  1HF6 A;  1H0I A;  1CXK A;  1TMQ A;  4MB5 A;  3G6M A;  3IAQ A;  1Q6G A;  5I3D A;  4PSR A;  4WK9 A;  3A4X A;  1MW2 A;  4EE9 A;  3KL3 A;  2BS9 A;  3AIE A;  1HT6 A;  4CU6 A;  6TAA A;  4C7D A;  1ESW A;  1JND A;  2XM1 A;  3QHN A;  2EPN A;  3WH5 A;  1CDG A;  3PZN A;  3QHO A;  2WBG A;  3CIV A;  2CIP A;  3W0K A;  2JIE A;  2V38 A;  4MB4 A;  4B9Z A;  4BQ3 A;  1JYV A;  3BAW A;  4AZC B;  3NSM A;  1OB0 A;  1NWS A;  4JHO A;  1HL8 A;  1UKT A;  2W4X A;  5AC5 A;  1J0K A;  3MKK A;  5FL0 A;  3WEO A;  3GH5 A;  2XGI A;  2J7F A;  1QI4 A;  2XVL A;  1H09 A;  1V3J A;  3MUY 1;  4OUE A;  2CKS A;  4MTV A;  3SCT A;  5JIW A;  3PTQ A;  2AMG A;  7CGT A;  3KWX A;  5JBD A;  1JZ8 A;  4W8A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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