1UWTA

Structure of beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with d-galactohydroximo-1,5-lactam
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
489
structure length
485
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITREKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural studies of the beta-glycosidase from Sulfolobus solfataricus in complex with covalently and noncovalently bound inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
total genus 200
structure length 485
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwtA00
1H5VA 1Q4NX 5CZKA 2XGBA 4AIEA 4P8WA 1DP0A 3CZLA 1G94A 3VIPA 4JKLA 1D3CA 1J0YA 3DYOA 4N0RA 3ZT7A 3AS0A 4FLRA 3ZSSA 1BTCA 4ZXLA 4UR9A 3WNNA 4M1RA 4JIEA 3L2MA 3ZMRA 1ITXA 5DEZA 4PMQA 3NUKA 1GOOA 4CU7A 3OIHA 2NSXA 4W84A 1JZ6A 2GSJA 5I23A 3AI0A 5D9MA 4TTUA 2BV9A 3WFZA 3UG4A 1H3GA 3NSNA 3PHAA 2FGZA 1CWYA 4S3JA 3WD4A 3OGVA 4ATDA 2ZXQA 1E6ZA 1IV8A 2E8ZA 4P7NA 3GNOA 2BFGA 3RM9A 2FGLA 2W5FA 5ABHA 2YDRA 4JHOA 1VBRA 2XM1A 3L4ZA 2Y8KA 3MUY1 4U2ZA 4PMNA 1NWTA 3B9EA 1BLIA 1E6NA 3FY1A 3BC9A 1CXHA 4M8UA 1KGXA 4J3UA 3FNDA 1XSJA 1JNDA 1S46A 4P8UA 2RGMA 3ALFA 3VU2A 1C93A 2JEPA 4B9ZA 1UWUA 5ABFB 1NQ6A 3GH5A 1UWRA 4PUEA 3CZ8A 2J25A 2CHNA 3ARPA 2EPKX 3BAIA 4F9DA 3N9KA 4UNIA 1EQCA 4PTXA 3EDKA 3WBAA 1XSIA 4H8UA 3AJ7A 1UWIA 2CBIA 1UR2A 3ZQ9A 4AD5A 2O9TA 3ARUA 3GNPA 1XV8A 3NYDA 1BYBA 1E6XM 3ARZA 3CUGA 1UD4A 4PYSA 4AYSA 1JZ3A 3QHMA 3WD0A 5ABFA 2J74A 4IM4A 3SCUA 1NWUA 5DMYA 2J7DA 3AMDA 3MV11 2XTKA 1LL4A 3W81A 3PZQA 1JXJA 1B3XA 5BCAA 2G3MA 4GI9A 4UFKA 5M17A 2ZOXA 1EHNA 3SUUA 2VR4A 1WDSA 1KGWA 3WUEA 3ECQA 3U5YA 1WZKA 1UR1A 4WJXA 3RDKA 4Z2IA 3UERA 2G41A 1VEMA 5D9NA 4CD8A 4D6JA 5C71A 4EAMA 3WKZA 5A8MA 3N15A 3THDA 2W61A 1V3IA 4QLLA 1D7FA 1RPKA 3PTMA 4HU0A 1TVNA 4H8HA 1DWHM 2XVPA 1XHGA 5A8NA 2EPLX 3CUFA 4ZE5A 4GZIA 3A4XA 2E9MA 3L2LA 5FKYA 3RM4A 4HTYA 3KL5A 4BCEA 2WZIA 4PMXA 2X0YA 1W2VA 2Y4SA 3L4XA 7TAAA 2BVYA 1UR9A 1UKSA 1QI0A 2EQDA 2DSKA 4B16A 1WAWA 3ZJ8A 1ZBCA 2CNCA 3I3EA 1W9VA 4DUWA 4M81A 4MTVA 3OB8A 4D6IA 4EKJA 8CGTA 3A47A 2CETA 1I1XA 3BSGA 3GBDA 1TG7A 1U33A 3VM7A 4AW7A 4UTFA 3BAKA 3APGA 3GXDA 3CHEA 3M7SA 1FH7A 3B9DA 3VOCA 5CQ1A 1E15A 1UKQA 4DWSA 4BQ4A 4M29A 5A1AA 5A8QA 2QF8A 2J77A 5A94A 4PSRA 4YPJA 5CGMA 3GH7A 1LLOA 4EE9A 2VJXA 3BAWA 3PZVA 1ESWA 1H2JA 3LMYA 5FD0A 2WVSA 3ZJKA 2ZXBA 2FH8A 4MNLA 2F61A 4GPNA 2WWCA 3AIBA 1HP4A 1AQ0A 2OWCA 1JIBA 2WHJA 1QW8A 2XIIA 2Y24A 1Z32X 3VDCA 1WCGA 2Y8VA 2VRKA 3NIYA 4CCCA 3GYCA 3TTSA 5A69A 2X8RA 4N42A 1EO5A 4WIWA 3WF1A 1W2PA 4PMYA 1ISVA 3OBAA 2OWWA 1E6PA 4JFWA 2OSYA 1W1VA 4J7RA 3WDJA 4ZEPA 5JBDA 4IISA 2OWXA 3ARXA 4UZUA 1TCMA 3WUFA 1L0PA 2OSXA 4JFVA 1NOWA 4ACZB 1W32A 3T2QA 3ZSTA 3BSHA 3QHNA 1BFNA 1EIBA 4MB4A 2WMFA 3VIGA 3FW6A 1R7AA 2VTFA 1KWKA 3BMWA 2XG9A 3L4VA 2VVNA 1J12A 1KCLA 1H41A 3CZGA 2YJQA 2OYLA 5FOOA 4QDMA 4TUFA 1ODZA 1J0HA 3GXIA 3DHPA 4S3KA 3MMWA 2V3GA 4CCDA 3ARVA 3LPOA 3FN9A 5E9AA 3F5JA 1V6YA 3CHCA 3NCOA 1PIGA 2BVTA 3AYSA 1E1FA 1ODUA 2D3NA 3CIVA 4AZBA 3EMCA 1GZJA 1B3VA 3AIQA 4HMDA 1QVBA 2BY1A 1DTUA 4M80A 1OT1A 1F4HA 4X0VA 4ACYA 4MJ2A 5BRQA 1G9HA 4JKMA 5A6BD 4RE4A 2YL9A 1JFHA 5IHSA 1OWQA 4KGLA 4LX4A 1FH9A 1PJ9A 1W1YA 4LYPA 4PMZA 2CESA 5JIWA 1E43A 1XH0A 2QMKA 1CIUA 4WSKA 5JBFA 1MW0A 3BLKA 1JYWA 1VFOA 2G4FA 2WXDM 4WSJA 4XZWA 3VMOA 4AY1A 3OZPA 4FF5A 3SURA 5LYRA 1E73M 2A3BA 1VAHA 3WD1A 3WMBA 1JZ7A 3WELA 2J8FA 1KR1A 1MVYA 1MFUA 1GJWA 4JHZA 4MNKA 2JALA 2W66A 1M53A 4MNJA 4W86A 1FOBA 2CKSA 2XHYA 1HF6A 1C3FA 3ZJ7A 1GQLA 3AZTA 4W8LA 3J7HA 1OM0A 1BGGA 1CECA 2GJXB 3QOKA 2YA0A 4DM2A 3ZM8A 4GXPA 1BYDA 1GOWA 4Q7NA 4U5KA 1JDCA 3RIKA 4OKDA 2CEQA 2O9RA 2WMGA 4D6EA 2DIEA 4AEFA 1WO2A 2BVDA 5FL0A 5A6LA 1UR0A 4AZCB 4AC1X 1C8XA 4LPCA 4YHGA 4Z2LA 2DT1A 4J27A 3DECA 3F5KA 5KZ6A 4TOQA 4V2XA 4A4AA 4NRRA 5BYWA 3WL0A 4X0NA 2WKGA 3II1A 2E9LA 1EXPA 3MUIA 5BROA 2VURA 3AFBA 2WSKA 4AD2A 5D9OA 1AMYA 3MSGA 3S2CA 2CIPA 1E56A 3JUGA 3N13A 2WLZA 3B9AA 4AIOA 3SCOA 2J7BA 2PWEA 3THCA 1KCKA 1KR0A 5IXEA 2VZUA 3W6MA 1MXGA 1QPKA 3VPLA 4LGXA 1GOIA 3WNKA 4E2OA 4ZFMA 1UKOA 3W37A 3WN6A 3IK2A 4QP0A 4AZ7A 3KE0A 2GDVA 2YLAA 3M46A 2G3NA 1MW2A 1UWQA 1CDGA 1Y7VA 4UQBA 4W7WA 3KWXA 2J75A 1E6RA 3AS1A 1PZ2A 2VNCA 3AISA 3QOMA 1WZAA 4QLKA 1R7OA 3SCQA 3N04A 2WM0A 4RE3A 2WZEA 4XZBA 6TAAA 3NSMA 2JEQA 1UA7A 2J7CA 3OZOA 3VGFA 3O6AA 4B9YA 4F79A 1B3YA 1E4IA 3EMQA 4GINA 1WZLA 2E8YA 1QNQA 3ZT5A 2D22A 2VO5A 4AIUA 3DYMA 3VMPA 1DWFM 1UD8A 1OGGA 5AC5A 1W9PA 3AIRA 3T2PA 3RMEA 1R86A 4W88A 1WP6A 1UZ1A 1EQPA 1ZBVA 4AZHA 2DSVA 3A4AA 4UQEA 1UQZA 2PBOA 3W6LA 1TE1A 3T08A 1HKKA 3CHDA 1CGXA 3VNYA 1JI2A 2X05A 1OGSA 2PWFA 4TVCA 3WFLA 9CGTA 1E3ZA 3VIKA 3VNZA 3CLWA 3WMSA 1LG2A 4AISA 1XYZA 5A8OA 3MUAA 2ZWZA 1TFVA 4KWUA 4CD6A 2ZUUA 4C7FA 1GVYA 2ZUVA 1QHZA 1UWTA 5DT5A 1CGTA 2VQTA 1NOFA 3TONA 3WH9A 1HL9A 1E6QM 2VCAA 1KXTA 3KEHA 2JE8A 1GNXA 1JD9A 1MWOA 1MFVA 5CGTA 1C8YA 1OT2A 5EFDA 5BXPA 3PBGA 3VIMA 4RL3A 4TXEA 4Z2JA 1Q6CA 2VQUA 4UQ9A 4CD5A 4W89A 3RPMA 3FHQA 5I79A 4JZ5A 3MV01 4EANA 4PMRA 1MQRA 1BPLB 1EOMA 2V5CA 1GQIA 2ZWYA 4HP5A 4PN2A 3VIOA 4HZ8A 2JIEA 4NSBA 3F4VA 1J18A 1E4MM 4IUGA 4F9JA 4GO8A 4XX6A 2OSWA 7A3HA 4C7GA 3PZOA 5GNYA 1LWHA 4MB1A 2J47A 1J0ZA 5E0FA 1OBAA 3AHXA 1EDGA 1KB3A 5A6SA 3PZ9A 1QOXA 1C90A 1KFWA 2WMKA 2IUZA 3WQWA 2HISA 3TA9A 3U5UA 4NZCA 4MADA 1JYNA 2YL8A 3UR8A 5D4YA 4AMCA 4BQ5A 1MW3A 3VD9A 1FHDA 3ARRA 1Q6FA 1I75A 1SR0A 4CN6A 1CXKA 3WH8A 2W91A 5BWFA 1HL8A 2D1ZA 2YIHA 4CVWA 1FP8A 5EBAA 2NW0A 1GHRA 4M82A 5A6JA 1H0IA 2FHBA 3BXWA 2VC9A 1CBGA 1QHOA 2J7FA 1V3JA 5I3DA 3K1DA 2VT0A 3GBEA 3TTOA 1X1NA 4AXNA 3T09A 2VL4A 1GUVA 1V0KA 1WNOA 4ZXOA 2DEPA 3VILA 4J3XA 2AMGA 2Y5EA 4GIAA 3IANA 3UESA 3OLEA 1NWSA 5EFFA 2DT2A 5AC4A 4MNMA 2B31A 1NP2A 5FCZA 1AQMA 3L4WA 1US2A 2XWDA 4LYRA 3WQ6A 3W27A 5HDRA 2G3IA 2PF0A 1E71M 4WKHA 5DFAA 1JYXA 5CXPA 5A95A 3BCDA 1GOMA 1PEZA 1CGWA 2BHZA 5JUVA 5D9PA 1UD5A 2X09A 4GKLA 4MDPA 3ZOAA 2D24A 1CXEA 3SCWA 1FFQA 1V0NA 3ARYA 3VDAA 4CU8A 3I3BA 1JI1A 4UZSA 2XWEA 1IT0A 3SCTA 3MMUA 5IHRA 1H0GA 2WAGA 5I2UA 3HU7A 3VIFA 1FH8A 3FAWA 4HZ6A 4DWSB 4Q22A 1JDDA 1JXKA 3EMZA 1UD3A 2GK1A 4MB5A 5JIPA 2WC4A 4PUDA 5HXMA 1R8LA 5D8ZA 1G0CA 1W1PA 3AMCA 1CLXA 1CPUA 3W0KA 3AMLA 1ZBKA 1F4AA 2WSPA 3N11A 4E8CA 2D0HA 2V3DA 4EK7A 4UOJA 5ECUA 2ZICA 4FMVA 2EXOA 1PX3A 1US3A 1E0VA 3KL3A 1WDRA 1SFSA 3CMGA 1ZJBA 3QR3A 1HKJA 1SMDA 3WDIA 1CZ1A 4OBSA 2DSWA 1B90A 1QBAA 1YQ2A 2OLHA 1LJYA 6A3HA 2ZUSA 3WNMA 1BYCA 1VEOA 3M07A 4P7QA 1TA3A 3VMNA 5C70A 3TOPA 1HP5A 1UWSA 4IPLA 2EPMX 3UG3A 3OLIA 3T0AA 2WNWA 4TVDA 3UEQA 1H49A 2Q8XA 2ZE0A 3GM8A 1CTNA 5C8BB 2W92A 1UHVA 1HKIA 3AHVA 2BXYA 2YDSA 3VTRA 1ZL1A 5I5RA 2WVUA 4BA0A 2F2HA 4A3HA 5CG0A 1DWGM 3SCSA 2D0FA 4ZENA 1VJSA 3SCRA 2VI0A 1UH2A 1IZKA 3W82A 1VFMA 4W5ZA 2EPOA 5CSYA 1TZ7A 1JYVA 1HJVA 2GJPA 2FHFA 2XYLA 3WY1A 1VIWA 2W63A 3EDDA 2V5DA 5IFTA 1NWRA 1ZBWA 2J78A 2F8QA 3VIJA 5DO8A 4MJ4A 4U5IA 4WKFA 3WDQA 4DWSC 1XCXA 3BGAA 1UR8A 2PI6A 1GQJA 3WQ8A 3PZIA 1E4LA 2WBGA 3QHOA 1KBBA 2J7GA 4CUCA 1V3LA 2HVMA 4BZYA 3UCQA 2VZTA 3VD4A 2EEXA 3RCNA 1UQYA 1V6XA 2WVVB 2V38A 2VZVA 4TVUA 3W4RA 3ZT6A 1GOKA 1W91A 1EDTA 2GUYA 2XPKA 3B8SA 1FP9A 1B2YA 4LXFA 1DWIM 2V3EA 4AZ5A 1VJZA 3HJEA 3LPGA 4CD4A 4JAWA 4UFJA 2UY4A 3NJ3A 1VFUA 3GH4A 4HZ7A 2WLYA 1EA9C 2JF7A 1PX4A 3VGEA 1CYGA 1N82A 2ZUWA 1XCWA 3U7VA 3AXHA 1XC6A 2WVVA 3AQUA 5I6SA 2ZX9A 1P6WA 1J0KA 1JL8A 1DWAM 1H1NA 3WUGA 3MSDA 4V28A 4MAZA 2OYMA 1UG6A 1IZJA 3MUZ1 4PTMA 2YA1A 1QI5A 1HT6A 4UFHA 3VGHA 2WZHA 4OIFA 5CLTA 1B1YA 3DHUA 1K9TA 3GTNA 1E4NA 1E6SM 1V0MA 3NSXA 2ZIDA 1CNVA 1RD6A 1G5AA 1KQYA 4UFIA 2YLLA 2QPSA 1WDPA 3NDYA 4YHEA 2GJRA 5HPCA 4PCTA 1M01A 3E1F1 1W1TA 2CBUA 1HVXA 2VVSA 2XSBA 1C7SA 4JL1A 4QCFA 3F5LA 2DPEA 3CHFA 5IFPA 1HVQA 4GQQA 2DT3A 3RO8A 3PZGA 1WKYA 3CZEA 4HMEA 2D3LA 4FLQA 4PMUA 1XGZA 2EPNA 2CITA 1FA2A 3AS3A 2A3CA 3IAQA 3L4UA 1QI4A 1D2KA 1E1EA 3D3AA 1XD0A 4B3LA 4PSPA 1E3XA 1W9XA 4HA1A 1UH3A 4GZJA 1JG9A 5D8WA 3MANA 2GFTA 1Q6DA 4KH2A 4PMVA 1R85A 5HPOA 1U30A 3RM8A 4FLSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1H5V A;  1Q4N X;  5CZK A;  2XGB A;  4AIE A;  4P8W A;  1DP0 A;  3CZL A;  1G94 A;  3VIP A;  4JKL A;  1D3C A;  1J0Y A;  3DYO A;  4N0R A;  3ZT7 A;  3AS0 A;  4FLR A;  3ZSS A;  1BTC A;  4ZXL A;  4UR9 A;  3WNN A;  4M1R A;  4JIE A;  3L2M A;  3ZMR A;  1ITX A;  5DEZ A;  4PMQ A;  3NUK A;  1GOO A;  4CU7 A;  3OIH A;  2NSX A;  4W84 A;  1JZ6 A;  2GSJ A;  5I23 A;  3AI0 A;  5D9M A;  4TTU A;  2BV9 A;  3WFZ A;  3UG4 A;  1H3G A;  3NSN A;  3PHA A;  2FGZ A;  1CWY A;  4S3J A;  3WD4 A;  3OGV A;  4ATD A;  2ZXQ A;  1E6Z A;  1IV8 A;  2E8Z A;  4P7N A;  3GNO A;  2BFG A;  3RM9 A;  2FGL A;  2W5F A;  5ABH A;  2YDR A;  4JHO A;  1VBR A;  2XM1 A;  3L4Z A;  2Y8K A;  3MUY 1;  4U2Z A;  4PMN A;  1NWT A;  3B9E A;  1BLI A;  1E6N A;  3FY1 A;  3BC9 A;  1CXH A;  4M8U A;  1KGX A;  4J3U A;  3FND A;  1XSJ A;  1JND A;  1S46 A;  4P8U A;  2RGM A;  3ALF A;  3VU2 A;  1C93 A;  2JEP A;  4B9Z A;  1UWU A;  5ABF B;  1NQ6 A;  3GH5 A;  1UWR A;  4PUE A;  3CZ8 A;  2J25 A;  2CHN A;  3ARP A;  2EPK X;  3BAI A;  4F9D A;  3N9K A;  4UNI A;  1EQC A;  4PTX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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