1V6YA

Crystal structure of chimeric xylanase between streptomyces olivaceoviridis e-86 fxyn and cellulomonas fimi cex
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
STLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGSRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of a family 10 beta-xylanase chimera of Streptomyces olivaceoviridis E-86 FXYN and Cellulomonas fimi Cex
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis, cellulomonas fimi
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase and Endo-1,4-beta-xylanase B
total genus 129
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6yA00
1QW9A 2O92A 4PSRA 2JIWA 3APGA 2WAGA 3CTTA 1B31A 1FP8A 3EMCA 4W8BA 2VX5A 5JBEA 1HVQA 1QVBA 1XYFA 1MW1A 1J01A 3VIJA 3VIGA 3W29A 4P7LA 1KQZA 3VDCA 1VEPA 4TTUA 3NCOA 1ZJAA 2VQTA 3L4YA 4W89A 1LL4A 2CHOA 4JFWA 1HJWA 4CD8A 5HBFA 1IZJA 3IJ9A 1XCWA 1BTCA 4AISA 3DHPA 2XTKA 4P7NA 4AEEA 5CXPA 3K8KA 4TX8A 1R7AA 2VL4A 4PMOA 1NH6A 2QLYA 4D1IA 1V6VA 4A4AA 1Q6GA 2A3EA 3NDZA 1C91A 3WIJA 2PWHA 3AYSA 4DWSC 2WHMA 5A6BA 3W25A 5D9MA 1KXHA 4WKHA 1UHVA 1DWHM 4ACZA 1UD2A 1AQ0A 2DSWA 5FCZA 2V5CA 1XGZA 3SCUA 4WJXA 1W91A 3CHEA 4MB3A 2WHJA 3SUUA 2XVPA 2EPNA 3KL3A 1WCGA 4HZ7A 4UR9A 5D9PA 3MU7A 3CLWA 4D6EA 3T2QA 1CZ1A 4B3KA 1TVNA 3AS1A 5BCAA 5E6ZA 2E4TA 1E1FA 1CGYA 1NWRA 1CIUA 3CHFA 3I3EA 5AYBA 3W6MA 5A6BD 1C8XA 2DSVA 2UY4A 4U5KA 4V27A 4OOUA 4CD5A 1BLIA 3NSNA 3VIKA 2YL8A 2W5FA 4KRUA 1VRXA 1R87A 1TA3A 1W3LA 2C8NA 1CDGA 4LYQA 3AHZA 1FP9A 3WBEA 5I77A 4M81A 1K9TA 3T09A 1VBUA 1MVYA 1A3HA 3AHVA 1ESWA 5GNYA 2VX7A 2XVLA 4JZ5A 2WK2A 4Z2LA 5EBAA 2EPOA 3CZEA 1UWSA 1US2A 4NRRA 2DIEA 4AIOA 3AIVA 3RILA 3AOFA 3DYPA 2VRKA 5BROA 3MV01 2G3NA 1VFFA 2BXYA 2J79A 2J7HA 2VC9A 4A3HA 1AQHA 2ZXBA 1XCXA 4MB4A 3WF0A 3ZSTA 2J7BA 2VTFA 2W92A 4PMXA 4JFTA 4P8XA 3BC9A 1KXTA 1L0PA 4M29A 3ZJ8A 4F8XA 1GPFA 2GK1A 3MUIA 2WMGA 1OBAA 1GHRA 3CHCA 3ARPA 4JKMA 1XHGA 2J8FA 1E72M 3W6LA 1E40A 2WVUA 3GNOA 3SUSA 3NJ3A 4R27A 3BLPX 4ZE4A 4AIUA 1EOMA 2E9MA 3L4ZA 4W7WA 2WVVB 2YBUA 4QFUA 1NOFA 2E8ZA 3DECA 4DUWA 5D8WA 4KGLA 2WBGA 3OIHA 1GQIA 5A1AA 2W63A 1JNEA 2VUYA 1ZS2A 3ARRA 4Q7NA 2G8ZA 1UR9A 3ARVA 3MV11 4BF7A 1UD8A 2JE8A 4ATDA 2VR4A 1XSIA 1HKJA 1MYRA 4J3TA 3VDAA 4KRTA 4FLRA 3KE0A 3GH7A 3F5JA 4B3LA 4CKQA 3VIPA 1FH8A 2OYMA 1CGTA 1CXFA 3GH4A 1JNDA 1HN1A 5EFDA 4PBGA 1MFVA 4FLQA 2DPEA 4WKFA 5EFFA 2XSAA 2BHZA 3GNRA 1E15A 3TTQA 2VVSA 2HISA 3RJXA 6TAAA 2D3LA 3AISA 2CCRA 5GQBA 4TVUA 1U2YA 4OUEA 3VILA 1V6XA 3MMDA 2XJ7A 1H2JA 1JZ2A 3ZJ6A 1G01A 2CETA 3VGBA 1K9EA 2VZUA 2W4XA 1KBKA 1VFUA 3DC0A 1EA9C 4YPJA 2XVKA 3AICA 3SEPA 1G5AA 2QF8A 2W62A 3CUJA 1J18A 2CKRA 1JAEA 4H8VA 1M7XA 1SMDA 4M56A 2VR5A 1C93A 3CZJA 4JL2A 4DWSB 4DUXA 3SUWA 2MANA 3U7BA 3LPPA 3W0KA 2DEPA 3IK2A 3MANA 3A4AA 1E9LA 1NQ6A 1QI2A 2YL5A 3BCFA 3VIMA 4F79A 2WKGA 4MB5A 3O2LA 1I1WA 2X8RA 5A8QA 3THDA 4NRSA 1Q6FA 3WQ8A 1B90A 1GOMA 4V2XA 5IXEA 3SCQA 4J3SA 1BVNP 4W93A 3VOCA 2BY2A 2WVTA 1OWQA 4AD4A 1W3KA 2WW5A 4PMRA 2J47A 5A95A 4E8CA 2J74A 1WO2A 4XZBA 3VIOA 3M46A 2V38A 4HA1A 3T0BA 4IPLA 3OBAA 1JF6A 3RM9A 2DH2A 2X09A 3BGAA 4WLCA 1SFSA 2WWCA 1UKSA 4CCCA 1B2YA 3PZMA 2BHUA 3W4RA 3EMZA 5C8BB 1YHTA 5EMYA 3PZVA 1E43A 3VVGA 1G9HA 2EJ1A 2C0HA 5E09A 1CECA 1IZKA 3KWXA 4TVCA 1ZBWA 5CPSA 1E56A 1KXQA 4AWEA 3U57A 5ABFA 1OD0A 3L4TA 1W3HA 3KEHA 1JF5A 2XFRA 2QHAA 4UQCA 1K9DA 1XSJA 3U5YA 4PYSA 1BYAA 1B3ZA 4C7FA 1GUVA 2Y8VA 3IAQA 1E4NA 3MMUA 2ZWZA 5IDIA 3NIYA 5CQ1A 1KGUA 3WKZA 1HL8A 4OOZA 1VEOA 1OSEA 3DHUA 4L4PA 3GM8A 3N17A 1GVYA 3T08A 3ZJ7A 1PPIA 3WL1A 4F9DA 3RCNA 1JYXA 4U3CA 3AMCA 3AIUA 1UR8A 1WE5A 4C7GA 3WDQA 3AXXA 3ZT7A 4XZWA 1J0ZA 2XIIA 2BY3A 3PTKA 3PN8A 3UG3A 1HP4A 3OGVA 5HNNA 5A6AA 4DM2A 1IT0A 2PB1A 2EPKX 3VDHA 4XX6A 3WY1A 1BF2A 2CXGA 5A6KA 2CBJA 4D6HA 1GCYA 1KGXA 4BA0A 2DT0A 1UKTA 5DT7A 3WNNA 5A2BA 3AQUA 1UD5A 3IJ8A 2V3EA 4PTXA 3CMJA 3WQ5A 2J4GA 3ALGA 5EB8A 2FH6A 1W3JA 1BPLB 4CD6A 3N13A 2BFGA 3VMOA 2J77A 4ZXLA 4F9JA 3WH6A 2OWCA 4MAZA 2YDQA 1LWJA 1VFMA 3K46A 1XD1A 1JI2A 1CYGA 3BXWA 4H8HA 3ARWA 2RGLA 3PZOA 4PCTA 4AZHA 3GTNA 4GZJA 1C7TA 4M8UA 5A94A 1DP0A 1CLXA 2ZUSA 3AROA 2AOSA 4Z2GA 2WANA 3AMDA 3BSGA 3IAPA 5BRQA 4HA4A 1QHZA 3POCA 1YQ2A 1QI0A 2C7FA 1B1YA 1K6AA 3VNZA 1WNOA 1XH2A 1FHLA 3WF3A 2WCSA 4UZUA 2Z1SA 4Z2HA 1J11A 2GJXB 4EKJA 1W9BM 1HJUA 1C90A 1ZJBA 2CERA 4HU0A 3N1AA 4OKDA 1SR0A 1CEOA 3VD3A 5D9OA 2NW0A 4K68A 4OBRA 2CEQA 4YHGA 2Y8KA 5E0CA 1JAKA 2WCAA 1PX4A 4CN1A 3VTRA 2WXDM 1QHPA 3CUIA 3NSXA 1N82A 2DT3A 1TZ7A 3RPMA 5LA0A 1OGGA 3WD1A 1V0NA 4PMDA 3AS3A 1UKQA 3OB8A 1LJYA 2FHBA 1BG4A 2QPUA 4AIEA 1UG6A 3AXHA 1LF1A 2A3AA 3QHNA 2WVSA 3BAIA 3KZSA 4UTFA 2VO5A 1HKMA 1M53A 5CZKA 3WFLA 1ISYA 3LMYA 1C7SA 1CGXA 4CVUA 4H41A 3UG4A 5F7UA 4M24A 2JEPA 1UZ4A 1QHOA 2J78A 3VGFA 1NOWA 4QCEA 4CGTA 3FHAA 3GH5A 1OIFA 1SYTA 1CGWA 3GXIA 2BVTA 4W5UA 4LXFA 3ARYA 4HU8A 4XUYA 4W5ZA 2PWEA 1OT1A 4X9YA 2YIHA 1DTUA 3EDJA 5A3HA 1GQKA 3SCPA 2BVDA 1UKPA 2GJRA 4Z2JA 1W2PA 3L2MA 2VCAA 4ACYA 2DSUA 4D6CA 1DWFM 4OBSA 2FHCA 1KR1A 1UWQA 3ARQA 4H7VA 4AD0A 3MO4A 5IHSA 2V3FA 1LL7A 1CXEA 3AJ7A 3BSHA 2JEQA 2JF6A 2W66A 4QAWA 1PX8A 3VINA 3HU7A 5I6SA 5BYWA 1WDQA 2WNWA 1E4IA 1V3JA 2UY2A 2XG9A 3ARSA 3AIWA 5KEZA 3BAYA 3GDBA 3OA5A 2ZUUA 2J7GA 8A3HA 3HN3A 2WSKA 2WMJA 2QV4A 1H41A 3WEZA 1M03A 4D6FA 2WMKA 3CZKA 4UZSA 1WDRA 1KFWA 4JFUA 3EMQA 2OSXA 2G3MA 5ABHA 2Z1KA 3ARXA 4J28A 2ZIDA 2VQUA 1EIBA 1GOIA 3F5KA 3W27A 1PIGA 1HVXA 1BFNA 2FGZA 5HPCA 4UFJA 1TCMA 1FOBA 4W87A 4PMVA 2JFEX 3L4UA 5JBFA 3GZAA 1NP2A 2WLYA 4A3YA 4E4PA 1LLOA 1EHNA 1OGBA 3WD3A 3GYCA 1J10A 3EYPA 3SCVA 1HL9A 4KMQA 1CXKA 4IM4A 1XSKA 5E0FA 5E6YA 4QLKA 2DT2A 5DEZA 1JD7A 5DF0A 1ODZA 2ESCA 4OIFA 1QNQA 4GO9A 1ZU8A 2G3IA 1TFVA 3GNPA 1HIZA 4PMQA 3WENA 1J0KA 1EQCA 4W8AA 5BXRA 2D0FA 2B31A 4MNLA 1H4PA 2O9OA 2PWFA 1GHSA 4MAVA 4HPHA 1B30A 3PHAA 1V02E 3GXDA 4ZE5A 3JUGA 4QP0A 3TOPA 1UWTA 3AI0A 1B3YA 3W82A 2DH3A 2FH8A 3VM7A 2Y4SA 7TAAA 1EHAA 2YJQA 1PBGA 4LYPA 3BMVA 1W32A 5KZ6A 4NSBA 3NDYA 1MXDA 1Q6EA 2VOTA 3AHYA 5FL0A 3OZOA 1UWIA 3OLGA 3VGHA 5I24A 4UFLA 1GQLA 1FH9A 2JF7A 2ZX8A 3T0AA 4E2OA 5AC4A 3TTOA 7CGTA 1E3XA 1FFRA 3BMWA 1E0XA 3VIFA 3WUGA 5CLWA 5CJ5A 4HOWA 3G6LA 4ATWA 1J0JA 5A8PA 3BAKA 4AEFA 3GXMA 4PMNA 3AXIA 3D3AA 4H2CA 3WDHA 1UOKA 5LA2A 3WUEA 2VVNA 1XD0A 4EAMA 3UERA 4V28A 2ZUMA 3PZIA 3W38A 2D1ZA 4Z2IA 2Y5EA 2ZX9A 4J3UA 2O9PA 2D3NA 1LQ0A 1CGUA 1UD3A 1NARA 3CIVA 4MNJA 2E0PA 5GNXA 3RDKA 5BRPA 4KGJA 4DUVA 2FGLA 4IUGA 1UD4A 2CHNA 5BXSA 4MTVA 3VNYA 1ISWA 4TOQA 1C3FA 1QNOA 5BXTA 2J62A 4HMDA 4PCSA 2XSBA 4B9ZA 1FFQA 2CIPA 4PUDA 5CSYA 3ZSSA 1WZKA 3PBGA 1J0YA 4AD1A 1UA7A 2VCCA 5A8OA 2JALA 3CGTA 3RMEA 4CU6A 4D72A 5BWFA 1F4AA 1VBRA 1E6QM 4EK7A 3A6OA 3AMKA 5M03A 2QMKA 4F66A 1MQQA 3N18A 2CNCA 1BAGA 3POHA 2EPLX 2YA0A 3VPLA 1VENA 2O9TA 1MXGA 5JUVA 2PI6A 1AVAA 4RE4A 3UCQA 3AMLA 1HJSA 2YL9A 1E6RA 4BS0A 2X0YA 1MW0A 1GORA 3UR8A 1BHGA 5GNZA 1E3ZA 3SUTA 4AY1A 4JAWA 3AZTA 2NT1A 2WHLA 2PC8A 2CBIA 4OZOA 4PUEA 2YDSA 5AY7A 1B3VA 3AYRA 1V3LA 1DWAM 5A2AA 1XH1A 4ZXOA 1QNPA 1JXJA 1R86A 4TXEA 2BY1A 3W37A 2E3ZA 3WMBA 4UNIA 1J0HA 1JZ4A 5CLTA 4KWUA 2XWEA 2IXVA 4JKLA 1F4HA 2VX6A 3SCNA 3AS2A 3MSGA 1UH2A 2DSKA 4EE9A 3FY1A 4HMEA 4J7RA 3VO0A 4LX4A 7A3HA 1V6YA 3VGGA 1XV8A 2YA1A 4AZ5A 1QNRA 2V5DA 1UH3A 2XM1A 3WDJA 4P8WA 3PZ9A 2J7EA 3L4XA 2OWWA 2D24A 5DT5A 3PTMA 1QI3A 2RGMA 2WCGA 2ZE0A 4PSPA 1RP9A 3UEQA 4PMZA 1JZ8A 3WELA 3B9AA 3O6AA 2DQXA 3MUAA 1NWUA 2FDMA 4GXPA 1VAHA 4BQ3A 3WUFA 3WH5A 1D2KA 4OJYA 3CZ8A 4QLJA 5FD0A 1IV8A 3T2OA 2DT1A 1JDAA 3OGRA 4WF7A 5BXPA 2XIBA 5A6JA 4YN5A 4BZYA 3K4DA 4FLSA 3FW6A 3CH9A 3M6DA 1E6PA 4BQ4A 4RE3A 4MJ4A 1FHDA 1UD6A 1VF8A 5IHRA 3MMWA 1JYVA 3SIMA 1ZBVA 5CPQA 3AIBA 2YL6A 2W91A 4BQ5A 1M04A 3S6TA 1QNSA 1RP8A 4L4OA 1E70M 1QOXA 1GW1A 1WZLA 5LYRA 3VGEA 3WUBA 3A47A 4GPNA 2A3CA 3G6MA 1JYNA 1TVPA 4ML4A 2WWDA 4JFVA 2HVMA 2YDRA 3M7SA 3ZOAA 3J7HA 4MDPA 1EDQA 2WVVA 2PWGA 2ZXAA 1RH9A 1PIFA 2DSZA 4R5EA 6CGTA 2G3JA 1XC6A 5FIPA 2GVYA 1UUQA 1JZ7A 2GSJA 4PTMA 1EO5A 4W7UA 4H8UA 3VKKA 2IXUA 4E8DA 1OCQA 4PMYA 3SCWA 5HXMA 1V3MA 4AZ7A 1UQZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QW9 A;  2O92 A;  4PSR A;  2JIW A;  3APG A;  2WAG A;  3CTT A;  1B31 A;  1FP8 A;  3EMC A;  4W8B A;  2VX5 A;  5JBE A;  1HVQ A;  1QVB A;  1XYF A;  1MW1 A;  1J01 A;  3VIJ A;  3VIG A;  3W29 A;  4P7L A;  1KQZ A;  3VDC A;  1VEP A;  4TTU A;  3NCO A;  1ZJA A;  2VQT A;  3L4Y A;  4W89 A;  1LL4 A;  2CHO A;  4JFW A;  1HJW A;  4CD8 A;  5HBF A;  1IZJ A;  3IJ9 A;  1XCW A;  1BTC A;  4AIS A;  3DHP A;  2XTK A;  4P7N A;  4AEE A;  5CXP A;  3K8K A;  4TX8 A;  1R7A A;  2VL4 A;  4PMO A;  1NH6 A;  2QLY A;  4D1I A;  1V6V A;  4A4A A;  1Q6G A;  2A3E A;  3NDZ A;  1C91 A;  3WIJ A;  2PWH A;  3AYS A;  4DWS C;  2WHM A;  5A6B A;  3W25 A;  5D9M A;  1KXH A;  4WKH A;  1UHV A;  1DWH M;  4ACZ A;  1UD2 A;  1AQ0 A;  2DSW A;  5FCZ A;  2V5C A;  1XGZ A;  3SCU A;  4WJX A;  1W91 A;  3CHE A;  4MB3 A;  2WHJ A;  3SUU A;  2XVP A;  2EPN A;  3KL3 A;  1WCG A;  4HZ7 A;  4UR9 A;  5D9P A;  3MU7 A;  3CLW A;  4D6E A;  3T2Q A;  1CZ1 A;  4B3K A;  1TVN A;  3AS1 A;  5BCA A;  5E6Z A;  2E4T A;  1E1F A;  1CGY A;  1NWR A;  1CIU A;  3CHF A;  3I3E A;  5AYB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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