1WQ5A

Crystal structure of tryptophan synthase alpha-subunit from escherichia coli
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
268
structure length
258
Chain Sequence
MERYESLFAQLKERKEGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIEAGADALELGIPFSDQNATLRAFAAGVTPAQCFEMLALIRQKHPTIPIGLLMYANLVFNKGIDEFYAQCEKVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNVAPIFICPPNADDDLLRQIASYGRGYTYLLSRAGVTENRAALPLNHLVAKLKEYNAAPPLQGFGISAPDQVKAAIDAGAAGAISGSAIVKIIEQHINEPEKMLAALKVFVQPMKAATRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational Changes in the alpha-Subunit Coupled to Binding of the beta(2)-Subunit of Tryptophan Synthase from Escherichia coli: Crystal Structure of the Tryptophan Synthase alpha-Subunit Alon
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 91
structure length 258
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2004-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1wq5A00
2A7RA 1OYAA 3PB0A 3N9RA 5IBXC 4ML9A 5DN1A 1UJPA 2Y85A 3BLIA 1W54A 4MY8A 1IF2A 3HGJA 2W79A 5F4XA 3G18A 4O1BA 1XM3A 2WO5A 4ZQNA 3FLUA 3W3OA 5BMWA 4QJ1A 1FWSA 4O28A 3VE9A 2V2DA 4HHPA 1V5XA 1SO5A 3GYEA 4IQLA 1FWWA 3NOEA 1H50A 5KZEA 3IEBA 2HSAA 3OA3A 2E6DA 3CTLA 1W5MA 3SIZA 4MFEA 3LCIA 2EPHA 5D30A 1OFBA 1G7VA 2VXNA 4Z1CA 2VEPA 1WYIA 4FNPA 5KINA 1HTIA 3GR8A 3LHVA 3A5FA 3P80A 2JK2A 2G95A 1O95A 2VELA 3C2OA 1W5NA 3PUEA 3O1NA 4O19A 2NXIA 1UCWA 1SO6A 2PRHA 5U4NA 2Z2UA 2ZZ4A 4NNAA 5CPLA 3PUOA 1OJXA 3I7SA 4MFDA 1H7XA 1P4CA 3LXBA 5H2ZA 1SR9A 3SECA 3GDTA 2DZUA 4AWSA 5HR6A 1KV5A 2VEIA 2OT0A 3JS3A 3NL2A 3W1RA 5AHLA 1K3UA 5BNKA 4JTIA 1JRBA 3STCA 4DO4A 1KM3A 2X1SA 3NM1A 2QKFA 1TCDA 3LI0A 5CPMA 2QUVA 1A5CA 3HQ1A 3GDKA 3NQ2A 3C3NA 3NL5A 3N3MA 5G4WA 1LOLA 1YXDA 4FNTA 4CCEA 4O52A 3CU2A 3W1LA 1G67A 1YTKA 1SZNA 5LNUA 3PULA 4OE7A 4MZ8A 1ICQA 2NZLA 4NZFA 5EL1A 3B05A 1SZGA 2Q3OA 1GZGA 4TX9A 1VYSX 5EBUA 2GPTA 2NLIA 1EIXA 4GUJA 2Y63A 1KA9F 4FX8A 1W56A 4R7JA 4RK8A 4UTIA 4LUJA 2NUXA 1RZMA 4Y9AA 3SW6A 4UTWC 1JVNA 1BWLA 4LVDA 1LM1A 1GJPA 4LVGA 3UWYA 1M6JA 2TMDA 1O60A 1SQ7A 1J2WA 3BO9A 3W7JA 3U8GA 5DXXA 3P82A 1ONRA 2RKXA 1TB3A 1LLWA 2PCQA 2ISVA 3TC7A 3EWWA 1I2RA 2VEMA 3PBWA 2DORA 3QMRA 4NJKA 3VFLA 2DZXA 1YXYA 3A23A 4QNWA 2BXVA 2W6RA 1XBYA 4DF2A 2JBMA 1BEUA 2DJXA 1B3OA 3MBDA 5FESA 2E5DA 1ZAHA 1I2PA 4Z1DA 4WXZA 2ZZ2A 1YPIA 3EKLA 3BG9A 3NQFA 3EXTA 5HWMA 4UC5A 3BG3A 1PE1A 2E6YA 4K37A 3Q58A 3FYPA 2GQ8A 4TIMA 4I7WA 4QQ3A 3KVLA 1G4SA 2GQ9A 2ZRWA 1XDLA 4JX4A 3LX9A 3TKFA 2AGKA 3TSMA 5LNSA 3VNDA 4UTLA 3KRUA 4E0CA 3MBFA 2FJKA 2RH9A 3W7KA 5L9FA 3BVJA 3UWWA 1SSGA 4JYEA 1KFJA 2NV1A 4YL2A 3CHVA 1X1ZA 3O8AA 5BOOA 3PSVA 2B7NA 5DY2A 1XC4A 1O4UA 4MY9A 4GE8A 2QF7A 4CCDA 1OK4A 5G4EA 1GWJA 3MHUA 3TIMA 4AF0A 4O50A 3OHIA 1XUUA 2WKJA 3NPWA 2H8XA 4IUOA 2CW6A 2B7QA 1A5SA 3W6YA 5TBOA 3CWNA 3GNDA 3W1TA 1PL9A 3UPWA 4LW7A 3HF3A 2ZBTA 4M6VA 3GK0A 3SR7A 1M7OA 1VJIA 3NL3A 3ZR4A 3B04A 6ALDA 4N9EA 1WOAA 1F6KA 2HMCA 4RLIA 4AXKA 4O4VA 2Z0IA 1EEPA 4UFJA 1YPFA 1OFDA 1A5BA 3DAQA 4X9SA 3L66A 3KHJA 1VS1A 4WY0A 4JIQA 3B8DA 3MP5A 2VOMA 4HSOA 1LLZA 3S1UA 4XQ6A 4TU1A 4K6AA 2X30A 3HO8A 4OT7A 4AWUA 1ME8A 3N2XA 3B4UA 3DHDA 4FHAA 3KRSA 1KBJA 3EWBX 5E0KA 1ZHAA 1FCBA 4UR7A 1K7XA 2BZNA 1ZENA 3NA8A 2QCCA 4EOUA 2QCLA 4EWND 3QW4B 4OBTA 1TPC1 1FXQA 4UMBA 4JNMA 4BR1A 3EKZA 3Q37A 4I9AA 3DZ1A 5EPDA 1AL8A 1Q3NA 2YR1A 4OWGA 5FF2A 3M0ZA 3T4CA 3LXCA 2YGYA 1YADA 2Y7GA 5HR7A 3TSBA 1PS9A 3PM6A 4K36A 3R8RA 4R34A 4EF9A 1HUVA 3WFAA 4UUIA 1OFPA 3B0VC 3NQGA 2QCFA 3TCEA 1LRNA 4M7TA 4Y6GA 3NVTA 1OX6A 4E2BA 1R2TA 3PBVA 4H6KA 4GRSA 3S0CA 3AJXA 3O05A 2A1YA 2KZHA 4FNRA 4Z08A 5G5IA 5G1TA 5KTLA 1H60A 4RZ5A 1A5AA 3PS7A 1KM6A 4KFOA 5DY3A 3PF3A 2GVGA 5FEZA 1ICPA 3NQ8A 1TTQA 3I6RA 4YMZA 4ZL1A 5HWNA 4O8RA 2GUUA 4JTLA 3CEPA 1QPNA 3RLUA 1XKYA 2J27A 2ZFAA 3IGXA 4FXSA 3W7CA 1TO3A 3TU9A 2EHHA 4ADTA 4K38A 2YZRA 3A21A 3ZWSA 1O5XA 4JTJA 3LHWA 3TQ0A 2RDTA 1TRDA 1ADOA 4TMBA 3S8HA 5C2XA 4ZMGA 1VHNA 1F74A 1QCWA 1BTMA 3HIJA 1KM0A 2XN0A 1RQEA 2V82A 5BW6A 1AL7A 3LGEA 3HGRA 5LGXA 1VLIA 4NXKA 3LV6A 1DJQA 1X7FA 3STGA 2YDAA 4R53A 5AC7A 5CSRA 4DELA 3M41A 3UXAA 1THFD 3LTYA 4G1KA 2B7PA 4HIBA 1EP3A 1K03A 3UQNA 3W7LA 3LCWA 1P5BA 5FEWA 3TH6A 1H7OA 3LRKA 4E38A 5CZTA 1DV7A 4OHQA 4JIPA 8TIMA 2QCHA 2TYSA 4ADUA 1ZJIA 3W7QA 1WDWA 4UNLA 2QUUA 4AB4A 3W88A 1GVRA 4FF7A 3T78A 4UFMA 3TDFA 2VFDA 4M6PA 1RD5A 3GAYA 3BG5A 4C1LA 3GXTA 1TPWA 3TC6A 3S5OA 4UTWA 3MUXA 2QR6A 4N4QA 1B4KA 1GQNA 2Z6IA 3WK3A 1IXPA 5AN7A 3N2MA 3MW7A 2WSQA 3P5YA 4ORIA 1SUXA 2Q8LA 4Y8FA 5G2IA 3TA6A 3B0UX 1LRTA 4IMEA 2CZEA 2DZTA 4DEFA 4JTFA 3KVJA 2WQPA 3W70A 2CLHA 1PCWA 3L0KA 1OYCA 4JX5A 5AC6A 1SO3A 1G7UA 1D3HA 1VR6A 3PG9A 2JKEA 1K02A 4FNQA 2TSYA 4NXSA 2R14A 5E93A 1H63A 1YDOA 3H53A 3QJAA 4IJBA 3UXDA 5AYZA 4LWWA 1W3NA 1WXJA 1LBMA 3HJZA 3DKLA 3TW7A 4BI6A 1FUYA 3L0NA 1JQXA 4I7VA 1BWKA 4IMFA 3KRZA 3G1AA 1AW5A 3GX9A 5AHIA 3INPA 5K2ZA 2FPVA 1KV8A 3F03K 1X8FA 3DBPA 2PRMA 5HNRA 3MMTA 1M7PA 4AF0B 3PG8A 2NV2A 4MJZA 4NZJA 5K9DA 1YTDA 4HPXA 3NYZA 4LC8A 3QH2A 4UTMA 3LTPA 5K3VA 4Q4KA 2ZTJA 4U28A 3M16A 4IXXA 1F7BA 4LOCA 3R13A 2QEZA 1YLVA 3P84A 2V2HA 2CFFA 2DZVA 2ABBA 4UMCA 4UIOA 4MJMA 1P1XA 1JUKA 2NUWA 3NO5A 4UTHA 5K7JA 3DXIA 3IVSA 2GJNA 2NWSA 3V1PA 3EX4A 2V30A 3ABOA 4WY0B 4MKNA 1GT8A 3P67A 1LBFA 2ZYFA 3BGJA 5C54A 4RV8A 2CZ5A 1QDSA 2ZZ1A 2Y7FA 3LTSA 1QOQA 4ORMA 3PUDA 1AW1A 2B0MA 1LROA 3S1XA 4UMAA 3GKAA 5A5WA 5LKYA 4DPQA 4PTNA 1IXQA 3RLVA 5FEXA 4Z1BA 3ATZA 5CG7A 1ZCOA 3OIXA 2I14A 2DU2A 1X1OA 3NQCA 2ABAA 1QAPA 2FTPA 1B4EA 4FB7A 2NUYA 5D04C 4NX5A 1ZY9A 2G96A 3HGSA 1SZFA 3W7HA 2H8ZA 2QCGA 3C56A 3ELFA 2H90A 1T96A 4IMDA 3TQVA 3LCXA 3PSWA 2ZQ0A 3UZJA 3NPUA 3IVUA 3G1HA 1QPOA 2A6NA 4MIMA 4IWWA 1JQVA 4S2BA 2CZFA 1XDMA 3LOTA 3DU0A 1J5TA 2A5HA 3W7MA 3THQA 3GNNA 3FOKA 4HKPA 4QISA 1H1YA 1ZFJA 3A5VA 3SY5A 3DFPA 1H5YA 2CWNA 2CLOA 1IIHA 1KTCA 2G5WA 1H7PA 4AHPA 3E49A 1FWNA 3QFEA 4NX0A 4S2CA 3TJLA 3G1FA 1SW3A 5G2HA 2BX7A 1JCYA 3P7YA 1TV5A 5KZDA 4L4MA 3TQKA 4YCPA 3NGJA 4E2DA 4M5PA 3QRHA 3W2KA 1BKSA 4UXDA 2X16A 1VCGA 4IMGA 3KX6A 3C2FA 3W2MA 1TPFA 4O1CA 3C52A 3UYCA 3NPVA 1U5JA 2JGQA 4ZVJA 1FBAA 4RXGA 2ZCGA 3W1NA 1F76A 3W71A 1TQXA 1L6WA 1RQBA 3HPZA 2F84A 2A7PA 3QW3A 2ZRZA 2PC4A 2ZRYA 3GVGA 2V5BA 4XTIA 1R2RA 2ZA3A 5D32A 3L68A 2FFCA 3G22A 3F1QA 2YX0A 3STEA 5LNWA 3VCRA 1RPXA 3G0SA 2Z6JA 3PC0A 3M7WA 2VFHA 1G4TA 2ALDA 5D37A 1LZOA 5AHNA 3I7QA 1LORA 1NF7A 1VGAA 1KM5A 3N19B 5D2XA 4PL1A 3B06A 1VC4A 3RF9A 2J24A 3W7GA 4AH7A 3G8EA 1FQ0A 1GVSA 2DZWA 2Y7EA 1H51A 4Q33A 1XBVA 3CIXA 3NQMA 4X3ZA 2ZA1A 4JN6A 4O12A 3TX9A 1IXNA 2ISSA 2CLFA 2FIQA 5TQLA 3IIZA 4K39A 1W5OA 1GTEA 2C3ZA 4O15A 1PHWA 3LRLA 1R46A 3VI2A 3LXAA 3P81A 2A6LA 4DBEA 2P0OA 4PA8A 1D9EA 5BRBA 1I4NA 2I1OA 2OZ0A 2QDHA 2YSWA 3DFNA 3LI1A 1W0MA 3PY2A 4L4LA 1T8XA 3NZRA 4DXVA 4N02A 4A3UA 2V9DA 2G97A 5AYYA 3N9SA 3N73A 1EWDA 2QCNA 4ALDA 1OFOA 3I65A 5FF4A 2WV8A 2ZZ3A 2C0AA 3W87A 4A2RA 1GPWA 2QCMA 2ZRUA 4GBUA 4AMAA 3WK1A 4ADSA 2V2CA 4JTUA 3HB9A 4FEZA 2D73A 2Y88A 2E6FA 4N4PA 1J4EA 3DGRA 5F1UA 1TSIA 3P60A 2P1FA 1SFJA 3HG5A 2OJPA 2C18A 3IRDA 2JKAA 4K7YA 4AAJA 1K8YA 4YLWA 5I3HA 1W37A 2C6QA 4BWLA 1DL3A 4NQ1A 3DFSA 3HG2A 4GFSA 3CIWA 2ZRVA 3DHFA 1XCFA 4A22A 4GUHA 3NQ7A 4MZ1A 5E1QA 3DKJA 4O54A 1DQXA 3KOFA 3TAOA 1ZNNA 4O17A 3DFTA 3OVRA 5D2WA 4OQVA 3TNOA 1WBJA 5MHBA 4M6QA 3G0UA 4BF9A 1Y0EA 1DKWA 2ZZ6A 1XFBA 5D33A 1Z42A 4CCCA 2V8ZA 4Y96A 4ZQCA 3L5AA 5LSMA 3M43A 2R94A 3IGSA 4QNEA 3G1XA 3USBA 5BMXA 3LCLA 3KFTA 1SW7A 1F5ZA 1N8FA 2GQAA 3CQ0A 4JS3A 4TO8A 5HUPA 3RFAA 1S5VA 2NX1A 4RJEA 2JKPA 1D3GA 1GOXA 3SJ3A 2C16A 3KAOA 1SW0A 2O7SA 4LS0A 4RZ4A 2WPBA 3VE7A 4WY0F 3NZ1A 1R47A 3MP4A 3GDMA 1JCLA 3BW3A 3U6WA 4WXYA 1RQHA 3P8IA 1P0KA 3BW4A 4HSNA 3W07A 1OF8A 4M19A 3CC1A 2E09A 2C14A 1MEIA 1TTPA 4NNBA 4O57A 1GEQA 3MHFA 3Q2DA 2ZA2A 4UNKA 1K8XA 1W5QA 3M9YA 3LHYA 1VCVA 4FNUA 4NJGA 4DF1A 1F6PA 2ISWA 4TR9A 1AMKA 4ZQMA 1XI3A 3QEZA 2YPIA 3HBLA 3EWYA 3C0JA 5CSSA 2YCEA 1VYPX 1ZAJA 5DCDA 1UUOA 4W9TA 2RDWA 3UY7A 2CU0A 2HS6A 1CX9A 1ML1A 3CWOX 1WX0A 2I9EA 2QJHA 1GVQA 4PFMA 4RKAA 5I3FA 3QC3A 4I7UA 1DHPA 1MEHA 3QYQA 4CLMA 3H54A 4O1DA 4XZ9A 4PH6A 5D2TA 1C8VA 5EYWA 3W1MA 1NAL1 1PVNA 5DELA 5D2YA 1TPDA 3FKRA 5EKYA 1HO1A 2E68A 5HINA 4HNTA 4LS1A 4JTHA 4N2YA 2AAMA 5IM51 2EAWA 3CT7A 1N55A 3ABRA 1V7YA 3UWVA 3W86A 4K7VA 4OV9A 1K8ZA 5F4WA 1KW1A 3NQEA 2A4AA 4LTSA 5DLCA 2Q3RA 4LVFA 5FF7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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