1XC4A

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase alpha-subunits from escherichia coli
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
268
structure length
240
Chain Sequence
MERYESLFAQLKERKEGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIEAGADALELGIPFVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNKGIDEFYARCEKVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNVAPIFICPPNADDDLLRQIASYGRGYTYLLSRAGAALPLNHLVAKLKEYNAAPPLQGFGISAPDQVKAAIDAGAAGAISGSAIVKIIEQHINEPEKMLAALKVFVQPMKAATRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of wild-type and P28L/Y173F tryptophan synthase alpha-subunits from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 78
structure length 240
sequence length 268
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2004-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xc4A00
3BLFA 5HUOA 3R5EA 4RV8A 1KW1A 1GEQA 4ZQCA 2Z0IA 5F2IA 3KVLA 1FWWA 4OT7A 3JR2A 2QF7A 4JEQA 1X1OA 1I2NA 5LNVA 4FNRA 2H90A 3G1SA 5FF4A 4GJ1A 4GUHA 4K7YA 4QNEA 2Y88A 3STFA 1OK4A 3S5ZA 4WD0A 4E38A 1TPVA 1Z48A 2WNZA 2G5WA 5CPOA 5F1UA 1THFD 4O1BA 2HS8A 3W2LA 1H7OA 3G1DA 3BGJA 3P7YA 3P5YA 4DF1A 1O94A 3INPA 5LNRA 3TROA 4O0KA 1EP1A 3I6RA 2FTPA 1JJKA 4Y90A 2NV1A 1OFEA 2VFFA 2FJKA 4CQ8A 1LBFA 4LC8A 3QMRA 1KM3A 5CG7A 4M6QA 2TRSA 1A5AA 1FX6A 1DORA 1KM4A 3C3NA 3C4UA 3FLUA 3TU9A 1TPC1 4Q4KA 1ZAHA 4MZ8A 4CLMA 1F7BA 3JRKA 4A29A 3O06A 2ATMA 3GYEA 2ZZ6A 2I9EA 3O07A 1OFQA 3WJSA 2I1OA 6ALDA 3CEUA 4OWGA 3FS2A 1SZNA 2QCCA 1JRCA 1RPXA 1H1ZA 1TMHA 3T44A 4O4WA 4UFMA 3GAYA 1QCWA 2QCFA 5D09A 1QNVA 4CCEA 1K8YA 2HMCA 4DO5A 4AHOA 3WK3A 4U28A 5HJLA 1RR2A 5CPMA 4JNMA 3LCGA 3B4UA 3EXTA 3W1UA 4JYEA 3RK8A 4FXSA 4JR5A 3LB0A 3L5LA 1LOQA 1RZMA 1HTIA 2J27A 1PV8A 3S1UA 2EGZA 4N6EA 3M7WA 2NV2A 1K8ZA 2BX7A 2FPYA 3NVTA 4QIUA 1I2RA 1ZCOA 3GDMA 2ZA1A 3M6YA 1IXPA 4MLRA 1DJQA 3QW4B 3VI2A 3BG5A 2FPVA 3L0GA 3KRUA 4D2JA 3KAOA 5DCBA 3M16A 4RKAA 4FXRA 3M5XA 4ALDA 3E0IA 1SZGA 3CTLA 1MEHA 4GXMA 4E2DA 3LTYA 2WSYA 1N55A 3SR7A 1TPH1 3P67A 1F5ZA 3CEPA 3EWUA 4ZVJA 1H60A 3HG5A 3UPWA 4DBEA 5AYYA 4RXFA 3B8DA 3MW7A 3BW3A 5D2TA 1YTKA 2F7FA 2WOQA 4P2VA 4E0CA 1ICQA 1KA9F 2QCGA 2WNQA 3STCA 3UZ5A 1H7XA 2XN1A 1DKWA 1NF7A 4BK9A 4O10A 3B06A 3EX4A 3LHWA 5A5WA 1W5QA 2VXNA 3W73A 3LI1A 4K37A 4OV4A 1QR7A 4XTIA 1DOSA 1D3GA 1O5XA 2KZHA 1VCGA 5D02A 1IIHA 4NUWA 2TPSA 5FEPA 1YDNA 3TC6A 2Y70A 5GVJA 1QPQA 1OF6A 2ZTJA 1T0OA 3DFNA 2XN2A 3W84A 4HN4A 2GJLA 4HSNA 5CGQA 2CZDA 4GUJA 4CNNA 1VH7A 1DV7A 3LXBA 3DKLA 3BARA 3FKKA 1SZFA 4BWLA 5AYZA 2YFOA 3PUEA 4LV9A 1KFLA 3W86A 3DKJA 4UNLA 2ZDRA 3M9YA 3NL3A 3DHFA 4O15A 3T78A 4M6VA 1VYPX 1P0NA 3NDOA 1VPXA 5HULA 4UFLA 3OA3A 1KTCA 2VEIA 1LDCA 4JTLA 2A0NA 3KXQA 2FQIA 5LNSA 3A5VA 5DLCA 1I2QA 2ZRXA 2DJXA 1GVQA 4R33A 3HJZA 1ICSA 3UXDA 5TIMA 2J9ZA 4B5NA 3PUDA 4I7VA 4XWUA 2Z1BA 3UWQA 1GTEA 1GVFA 3C2EA 4IX2A 1JUKA 1ZAJA 3GDRA 2RFGA 1OFAA 1F74A 1LYXA 3G3MA 4QNWA 5CSRA 3EKZA 1Y0EA 4FNPA 5E1QA 3BVJA 4XUGA 1UBSA 5K9CA 3C52A 3BV4A 4OQVA 3QMSA 2YZRA 4GNJA 4TIMA 4M19A 3TE9A 3NPWA 1H63A 3FEMA 1K7EA 5BW6A 1V7YA 3UWUA 1XL9A 3W7HA 5LGXA 2NXHA 4MKNA 4MY9A 3C2RA 3H55A 2V5LA 4O11A 1VRDA 3EB2A 3LLDA 1JRBA 3A9IA 3WK2A 4R34A 2H3DA 4K36A 4QITA 3W9ZA 2GVLA 2F84A 1ZHAA 3E9AA 4N6FA 4MJMA 1SU5A 4ADSA 3H53A 4RX0A 4UTWC 3BG3A 3W75A 3CPRA 3MHFA 3L0KA 5BOOA 2CWNA 3GIYA 3SJ3A 5I3HA 3UZJA 3CWOX 4A2RA 1S5WA 3MP5A 5DBTA 2P1FA 1MSSA 2D73A 3BG9A 3GB6A 1GG0A 1XI3A 4NX0A 4O1AA 4UTTC 2CLIA 2Z6JA 3O05A 1CW2A 1YPFA 4OE7A 1ME7A 1GPWA 1H51A 2X1TA 3HGSA 3DZ1A 3HOJA 4DBDA 5G2HA 2Y61A 1F2JA 4JYFA 2JGQA 3NL6A 1GZGA 4AF0B 4FIQA 5I3KA 5CSSA 3TFCA 3S5YA 2V2DA 4IQLA 3TFXA 2R91A 1FCQA 1WBHA 5KINA 3HG3A 3OBKA 1R46A 1RQEA 3JS3A 5D2YA 3HF3A 2RHGA 3P82A 4KKXA 1FY6A 1TV8A 1H61A 3B03A 1S5VA 3G0XA 5D38A 3L0NA 4S2CA 3KHJA 2QJIA 3W72A 3HPZA 2NXGA 1GOXA 4AB4A 1TQJA 4HHPA 1P5BA 4UR8A 3HG4A 3RU6A 3ABOA 4HNTA 3G8EA 1IGSA 4M6PA 3ZR4A 1HUVA 1OFPA 4ORMA 3W7NA 3CWNA 1YYAA 4DEFA 3P61A 5TBOA 4GUFA 5IM51 1D9EA 1OYCA 1HL2A 4JGDA 4O1CA 3LBMA 2AGKA 5DXXA 1K8XA 3FYPA 1DHPA 1DQXA 3EEGA 3G1YA 1ADOA 3L66A 3W7QA 2DORA 3N34A 5G1TA 3KVJA 3EX1A 4ONVA 1ME8A 2PCQA 1EA0A 1CX9A 4LS0A 1SFLA 3TR2A 3B05A 1GVOA 2ZRVA 2QCEA 1GG1A 3U2OA 3LLFA 4GE8A 3NZ1A 1U83A 2ZA2A 5EBUA 6TIMA 3MWAA 1KM2A 3NGJA 4TO8A 3MJYA 2FB3A 1Q6LA 1XXXA 4R53A 4K6AA 3L2IA 3W1RA 2NXIA 4YXGA 3CQ0A 5CZJA 1OF8A 3NM1A 2E6DA 1M6JA 4NNCA 3W6YA 4UFJA 2BWGA 3LHZA 1KLYA 4DELA 2E6YA 1OX6A 3B0PA 3N2XA 4OV9A 3PBUA 5AHEA 3TKFA 3TXVA 5H2ZA 1EWDA 3EWXA 3AJXA 3PULA 3E12A 3KFTA 2NZLA 4O57A 4JTIA 2NLIA 4JX5A 3M1ZA 2A4AA 3B0VC 4PTNA 3NQAA 4JX6A 3ABRA 4BF9A 3S0CA 3YPIA 2TMDA 3O1NA 4N9EA 1LM1A 1A5SA 2QUVA 1ZY9A 2GJNA 3L67A 4FB7A 4EIVA 1GVSA 2FPTA 1XBYA 3IGXA 4XBSA 3C8FA 3W7RA 3NO5A 4M7TA 3LCFA 1BTMA 3W2NA 3OVRA 1BWKA 4ZQRA 2ZRUA 3TNOA 4YCPA 1FXQA 3KVMA 3NQ6A 4KFPA 3MO7A 3W7JA 2E5DA 1YDOA 4JTEA 2Y62A 1FBAA 1FCBA 5LGZA 3VE9A 2C16A 2VFGA 1OX4B 2ZZ5A 1UASA 3NQDA 3W07A 5FESA 1OHLA 4JTTA 3TW6A 4Z1DA 4PEKA 5DCEA 4WY0A 1W0MA 1CI1A 4NNAA 3MBDA 2A7NA 1W56A 4MIMA 2GPTA 2Q8LA 1K02A 2E09A 4UMAA 2I14A 2ZRZA 4WOQA 1QOQA 1P1XA 4MFEA 4FEZA 2VFDA 4YCOA 2P0OA 1EEPA 3UWYA 4XZ9A 4JN6A 4C1LA 5L6UA 1MZHA 1W5NA 4UCGA 4BI6A 2CZEA 2E5BA 2FB2A 3PBWA 2CZ5A 4RXGA 1PCWA 1GQNA 1QDSA 1H5YA 4TU1A 4AVFA 4O1DA 3GKAA 4EF8A 1B3OA 3W7DA 3F03K 4O12A 5EL1A 3FIGA 1VLIA 4MJZA 3A23A 1PVNA 5EYWA 1W3NA 2FFCA 4H3DA 4OHQA 4M7SA 4WJEA 2JKAA 3QM3A 4TR9A 4JXCA 3IIVA 3W1NA 5AHNA 2E6AA 3M5VA 5BMXA 3QMTA 3VNDA 1O60A 5SWUA 3NL5A 4EOUA 1TB3A 2E68A 3PB0A 1OFRA 1SQ7A 3S5OA 4Y96A 1OYBA 1QPOA 4BFAA 3UQNA 3I7QA 4X22A 4O53A 3G3DA 1XDMA 3P74A 1H7WA 2YGYA 4NQ1A 2Y89A 2HS6A 3IIZA 4O14A 1TTJA 3L21A 3PUOA 3PSVA 1D3HA 2WKJA 3TQVA 3MHUA 3TSBA 1BWLA 4R7JA 3QH2A 4IMGA 4BI7A 3W70A 1LROA 2GVJA 3TQ0A 3DH7A 3N2MA 1TPEA 3BLIA 1EWEA 1K03A 3GKFA 2QJHA 4LVAA 4JTUA 1WOBA 3RMJA 2DZVA 3NR0A 1NFBA 2V8ZA 3NPUA 1OFBA 1W3TA 4K7VA 4N9BA 2Y7DA 3BW2A 1VYRA 4O19A 3RLVA 3S6DA 4N2YA 1F05A 1JULA 1WDWA 1FDJA 1GJPA 3DFTA 4UFHA 1Z41A 1EUNA 1T96A 3TJLA 4N4PA 4JTSA 2VEMA 2GVGA 4HNUA 3G0UA 3W3OA 2V2CA 2ZTKA 1AW5A 4FNUA 4GBUA 3IV3A 3HIJA 1W3IA 3LCLA 5C55A 4UTUA 3EXRA 1K7XA 1ZAIA 3CB8A 3Q37A 1L9WA 3PG8A 4LT9A 4P61A 5D2WA 1W1ZA 1VJIA 2VKZG 3E49A 5HR7A 4CQ9A 1G7UA 4JTKA 1YLVA 1W8SA 3ZFHA 3L5MA 3MYOA 1TJRA 1G4SA 4YLWA 5AYXA 3DXIA 1MXSA 5AHIA 4Q33A 2C13A 3KRSA 4Z08A 1FDYA 4HNVA 3I7RA 1G67A 3C2OA 5FEZA 5G5IA 5CPNA 3PC0A 1L2UA 3SZ8A 2DZSA 1U5JA 3M47A 3UD6A 4MZYA 3UNDA 4UTJA 1AL7A 4A21A 4RLIA 3LBCA 2FIQA 4UFIA 3V75A 1M7PA 2A21A 2JKPA 1P4CA 3OVQA 4XKYB 5DCDA 3NA8A 1R2RA 5L9FA 3WK1A 2QDHA 3DFQA 5KSWA 2R94A 3A24A 5U7SA 4ZL1A 2CW6A 1QOPA 3NL2A 5I3IA 1TYGA 4YL2A 4AF0A 1W37A 5FF0A 1EP3A 5LSMA 3W1LA 4PL2A 3W7OA 1VYSX 4KWWA 1GVRA 1I45A 3LV5A 3QJAA 1VQTA 3OG3A 2ZRWA 1FWRA 1G69A 1B4KA 2ZZ7A 3NYZA 4LVFA 2PRLA 4GC4A 4YMZA 1PE1A 2E6FA 2H6RA 5TQLA 3UYCA 2G97A 3QC3A 5DBUA 1PIIA 3FYOA 3GDKA 1XUUA 1XM3A 1VZWA 3TK7A 5AC8A 2O7SA 1I2PA 4NZFA 1KM1A 3TW7A 1KBIA 2DZUA 4IOTA 1DBTA 4JS3A 4J9JA 5U4NA 3PSWA 5HQEA 2OT1A 2YCEA 3PR2A 1UB3A 1JUEA 3HO8A 4HKPA 3QZEA 2VEPA 5G2IA 4CQAA 1O4UA 4Z1AA 4IMDA 3TH6A 5D04C 1QPRA 3HG2A 3U6WA 1KFBA 2B7OA 3M0ZA 3QRHA 5AC7A 2VOMA 1ZFJA 4JTGA 5D30A 4IWWA 4OGZA 3TDFA 3PM6A 2A6NA 4LUIA 4NJJA 1SO4A 2WQPA 4I9AA 5E93A 1N7KA 1TJPA 2X1RA 3R12A 5AB3A 3GDLA 4IX0A 4A22A 1PS9A 3C2FA 3EWBX 3LHTA 4IPJA 4DO4A 4MVAA 1RQBA 1ZNNA 2Z2UA 3P80A 4NJIA 5EY5A 2QUUA 1TRDA 2C6QA 4FF7A 4O8RA 2NWRA 2NX9A 2Z6IA 2YW4A 3VKJA 4AMAA 1DL3A 1WQ5A 1F76A 4HNNA 4HIBA 2B7QA 2ZCGA 5G2WA 1H62A 2JKEA 5K3VA 2ABAA 3SFKA 1O5KA 4X9SA 5CZSA 2NWSA 3HMJG 3O8AA 3QEZA 4JD4A 2Y7FA 3TIMA 1VHNA 3G1VA 2RDUA 1G4TA 1AL8A 4IMEA 1A53A 4UTTA 1LBLA 2ATSA 3IVSA 3E02A 3ZS4A 1ALDA 4LVBA 1I4NA 1GT8A 4AWTA 3S1WA 1TREA 1YADA 4O52A 3STGA 4RZ4A 4HPJA 2QAPA 4WQ6A 4LVGA 3QSTA 4EF9A 2Y7GA 4DPPA 1VCFA 5LKYA 3DAQA 4YWIA 3HB9A 1Z44A 1S3HA 1SSDA 2QCHA 4QAIA 2E77A 4N02A 1WAUA 2YR1A 4WXYA 4ZQPA 1KTNA 3NQ8A 4MLJA 1AW2A 3W83A 4AEOA 1FWNA 1YPIA 4Y8FA 4DQWA 3B04A 2GUUA 3N73A 4QQ3A 4RR4A 5EMUA 3NQCA 2JBMA 5ABTA 1HG3A 3G1FA 5C5YA 4O28A 1Q6OA 1OX4A 3IRDA 2QR6A 4BR1A 4JY8A 5IBXC 5DN1A 1NSJA 2FLIA 5I3JA 4NT0A 3P60A 2B7PA 3UWVA 1E51A 5C6MA 4JX4A 1JCNA 1VC4A 2W79A 3GXTA 2GQ8A 2Y6ZA 3CLMA 1V5XA 3S5NA 2QCLA 2X16A 2CLEA 1TTPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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