1XDMA

Structure of human aldolase b associated with hereditary fructose intolerance (a149p), at 291k
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
338
structure length
303
Chain Sequence
PALTQEQKKELSEIAQSIVANGKGILAADESVGTMGNRLQRIKVENTEENRRQFREILFSVDSSINQSIGGVILFHETLYQKDSQGKLFRNILKEKGIVVGIKLDGLDGLSERCAQYKKDGVDFGKWRPSSLAIQENANALARYASICQQNGLVPIVEPEVIDHDLEHCQYVTEKVLAAVYKALNDHHVYLEGTLLKPNMVTAYTPEQVAMATVTALHRTVPAAVPGICFLSGGMSEEDATLNLNAINLCPLPKPWKLSFSYGRALQASALAAWGGKAANKEATQEAFMKRAMANCQAAKGQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase B
publication title Structure of the thermolabile mutant aldolase B, A149P: molecular basis of hereditary fructose intolerance.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 303
sequence length 338
chains with identical sequence B, C, D, W, X, Y, Z
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2004-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xdmA00
2V5BA 1YYAA 4GRSA 1P5BA 3HB9A 3NQCA 1F6PA 1GVFA 2PURA 2ZZ6A 4QAIA 5GVJA 4DF0A 1KBJA 3EB2A 2QCMA 1VYPX 1EPXA 3GVGA 1XC4A 3VE7A 3HG2A 1X8FA 2QR6A 4O1CA 1P4CA 1WOBA 2Y70A 3AJXA 5BNKA 4JX6A 3N9RA 3KX6A 1KLZA 1VRDA 2QCHA 1AK5A 4LOCA 4LRTA 3W2NA 1VCVA 1FCUA 3NQEA 2Q8LA 3FIGA 2FFCA 1DL3A 4JTGA 4CNOA 4ZQMA 2B7PA 1J4EA 3NZ1A 4CNPA 4AF0B 4P2VA 1QPOA 4LY8A 3TFCA 3PBVA 1OFPA 1T0OA 3OHIA 2D73A 3F4WA 3A24A 4RLIA 2H8XA 3W1XA 3VKJA 3TQKA 4HNUA 1TTQA 3SR7A 4ML9A 3M5ZA 2C18A 5AHLA 3H53A 3I7QA 3DBPA 2ATSA 4RR4A 1DV7A 1HUVA 3P60A 3P81A 4XKYB 3W7CA 4JTJA 4WXZA 1FWWA 3FLUA 1HL2A 3BW2A 1JRBA 1MO0A 1MSSA 1N7KA 4YCPA 3RFAA 1G4SA 5CSSA 4IMCA 3PBYA 2HMCA 3W1RA 3HPSA 1H7OA 1F74A 1MEWA 3T40A 4UFJA 3OEXA 3PUEA 2YZRA 5LHEA 4JTFA 3QW3A 3LERA 3W1QA 4M6QA 5LNWA 3BV4A 4LV9A 1SW3A 4WQ6A 1UBSA 1PV8A 3L9CA 3S6DA 1LCOA 3UY8A 1GZGA 2DJLA 5U4NA 3QPYA 2QAPA 1LM1A 2I14A 1W8SA 2CZ5A 4FNRA 2NWSA 3UD6A 2VOMA 1T99A 1LOLA 3C2FA 3KVLA 4AMAA 3DH7A 5D32A 5I3IA 4JN6A 3NQAA 1SPQA 2V5LA 4J9JA 4PA8A 1TB3A 1H60A 4CCDA 1KFKA 2QCFA 2ATMA 5AHNA 4O10A 3GKFA 5TIMA 1EEPA 4WY0B 1W5MA 4ZZ9A 1LZOA 1SFLA 1ZAHA 3A23A 5AYXA 1RQEA 3UY7A 3W7JA 3DU0A 3W7MA 4JYDA 1H5YA 3G1XA 4RXGA 3LXAA 5IBXC 4NX5A 1KM3A 2WSRA 5DBUA 1M5WA 3G22A 4KWWA 4LWWA 4MFEA 2X30A 1H1ZA 4JD4A 2CU0A 4O52A 3MHUA 2NX9A 1XUUA 1L6SA 1H7WA 5AC7A 1UASA 3ATYA 4XBKA 3KVKA 4POCA 1F73A 3C2OA 3M44A 2ISSA 3IEBA 1OX5A 3PULA 1K03A 3G1HA 5CPOA 1W37A 3P84A 3FKRA 3MO7A 2A7RA 1DJNA 4NJKA 1OF8A 4AF0A 3STEA 4LW7A 4XWUA 4Q32A 1W5QA 1X6UA 3NGJA 1NVMA 2R14A 5FF4A 4UMAA 4N9DA 4N2YA 3W84A 4AWTA 5CZTA 5AN7A 1L9WA 4A2RA 3S42A 3TJLA 3MI3A 3HG5A 1AG1O 3S5YA 4JIQA 3L5AA 3G1VA 4O14A 2ZQ0A 4Z1CA 1VR6A 2RDUA 4H3DA 1JRCA 3W76A 3UZ5A 4XKYA 4JTHA 1K8ZA 3QFEA 3TW7A 4OBTA 3TQ0A 2LLEA 4LVDA 3ZWTA 3QQ0A 1VQTA 3GR7A 1OG0A 3FA5A 2E6AA 1FCVA 2B7NA 3VE9A 1GEQA 2TSYA 4R53A 3W85A 4MZ1A 3OVPA 4PODA 3F4NA 3RU6A 5EA9A 3DI0A 3T4CA 2A21A 1E51A 5FEPA 3NEVA 3PUOA 3C6CA 1GVRA 1B57A 2E6FA 2Y88A 3P74A 5KZMA 4OE7A 3S1VA 2NV2A 1KFBA 1EWEA 3DAQA 1P0KA 1TPWA 3L0KA 4TU1A 1H1YA 4W9TA 3I68A 2DZTA 3FS2A 3ABQA 3W7LA 1JQXA 3GNNA 3THQA 3M41A 4FX7A 4JYFA 1I2NA 4R34A 1YDVA 4S1FA 3GDTA 2YSWA 1JCYA 2YDAA 1IF2A 1DVJA 3IIVA 3L2IA 1KFLA 3QSTA 4TR9A 5AYYA 5G4WA 1FQ0A 1I45A 4QQ3A 4LS2A 3LLDA 3QW4B 4O28A 4R33A 4IMEA 3B8DA 3G0SA 4UR7A 4UIOA 2DZPA 2FPYA 3W83A 1RR2A 3W87A 2YW3A 4WY0A 2QKFA 4EOUA 3CPRA 3BG9A 3NVTA 1YTDA 1CI1A 4QITA 3MJYA 3O06A 2V0TA 3P7YA 1BWLA 1OF6A 1J2WA 1GTHA 3LV6A 8TIMA 3CLMA 3KAOA 2JKAA 3EWZA 3QEZA 4BF9A 1SW0A 3KRZA 1VYSX 2WKJA 1S3HA 1FCBA 2YGYA 5LNSA 4BWLA 3I65A 3CHVA 1GYNA 3PBWA 4KFOA 1GVOA 4UTTC 3GDRA 3TUUA 5D37A 3KRUA 1OK4A 3CQ0A 5HR6A 6TIMA 3CTLA 5F2MA 3TXVA 2VKZG 2DU2A 3WK1A 1KBIA 2J9XA 1EWDA 1Y0EA 1B9BA 2GVLA 2F7FA 3MYOA 3GX9A 2QUUA 4DPPA 3STCA 2XN0A 2R94A 1IXPA 3VNDA 1TRDA 1PHQA 1SSDA 4JICA 4MY1A 1L2UA 3QJAA 4AXKA 3TC6A 3W88A 4Q4KA 3G3DA 1AW1A 4BK9A 2VFIA 4EIVA 1OABA 1W5NA 3ABOA 3M9YA 1FXQA 1FY6A 3Q94A 3MHGA 4QSHA 3HOJA 1AL7A 1SZGA 4G1KA 2J24A 4U4MA 2GOUA 2VFGA 5I3JA 4JTKA 3TMLA 5AHIA 1S5TA 3NPUA 1K7EA 4ZQOA 3B0UX 1ML1A 3W1PA 2BTMA 3EEGA 1HO1A 4A29A 3M47A 1P0NA 2C3ZA 3UPWA 3M43A 4AVFA 1EIXA 5AFDA 4ZVJA 1JUKA 2A2IA 3T55A 3M16A 3NR0A 1JR1A 5BMXA 3OA3A 5LGZA 4DF1A 1ICPA 4IMDA 1LBFA 1TCDA 3G1SA 1YXDA 2HS8A 2NXHA 4ADSA 1UUMA 1WA3A 2VC6A 1YDNA 5EKYA 5TQLA 2CLOA 5DCEA 5BOOA 4WOZA 5LGXA 1DORA 2GQ9A 1YXYA 4GC4A 1S5WA 2ZA2A 4IMGA 3M5XA 3LBCA 5DCDA 1KM6A 4UTUA 4HN4A 3S5ZA 3UWVA 3NPWA 2ZRXA 2G97A 3LHVA 1NSJA 3ATZA 5D2WA 2QCEA 2RDTA 1P1XA 3NQ8A 3I7SA 2H90A 4CQ8A 2Z0IA 3E9AA 1H7PA 1UUOA 3UWYA 2A0NA 3DFSA 2CZDA 4DQWA 1QCWA 3IIPA 1UB3A 2PRMA 4K8EA 1XBZA 1U83A 1ZY9A 3S9YA 3OIXA 5U7SA 5CKSA 1C9DA 1X7FA 3PM6A 1FWRA 1W5OA 4RK8A 3G8EA 1VC4A 2V2DA 3C2EA 3WFAA 4IPIA 1YPFA 3TX9A 4I7WA 1W56A 2A6LA 3W86A 1W3NA 4LC6A 4MZYA 4N6FA 1GOXA 2BZNA 5AC8A 1ZENA 3WK2A 4OV9A 3W1MA 3GXPA 3LLFA 4MPQA 4FEZA 3KFTA 1LLZA 3LCFA 5AHEA 1TJRA 2GJNA 2JKPA 3TXZA 1Q6RA 4IJBA 3R5EA 1Q45A 3M1ZA 3M5VA 2FJKA 2NUWA 3F1QA 2X16A 4WX2A 2X2GA 3TAOA 1KM1A 2Y85A 1OFEA 5FESA 4JXCA 4LNYA 1AW5A 4QISA 5G1YA 3RK8A 1ADOA 2CLLA 4JTTA 4RX0A 1KM4A 4UMBA 2B4GA 2QDHA 1LRNA 5F1VA 3O16A 5K4XA 4XQ6A 2G5WA 3LCGA 1TTJA 4IX2A 3KVMA 1RD5A 3V75A 1T8XA 4ORIA 3FJ6A 4OT7A 3MWAA 3P5ZA 4Z0JA 1LP6A 4K7VA 2WO5A 1FBAA 1K02A 5I3HA 5D04C 2Y7GA 4UTWC 5I3GA 4N4QA 2VEMA 3NA8A 4QNEA 1Q6QA 5D30A 1G4PA 2EHHA 3TK7A 1FXPA 3LCWA 3YPIA 3R8RA 2RKXA 3W7QA 1K3UA 1VHCA 2W79A 1FX6A 3QSRA 1I2OA 2QCGA 3FFSA 4K38A 2ZRWA 4GUFA 5SWUA 4LS0A 4UNLA 4WZHA 4M6VA 4XTDA 1RV8A 3N19B 3LHUA 5AB3A 1ZHAA 4FX6M 3HF3A 4OHQA 1QR7A 4N9CA 5AYZA 2RFGA 3CEPA 2Y7DA 5T26A 1XFBA 4RZ5A 3UNDA 1G4TA 1H7NA 1XBVA 1KM2A 2BX7A 4MYXA 3UQNA 4TIMA 2C16A 3TCEA 1FDZA 1TIMA 3CEUA 3MI6A 3L21A 1Z44A 4XTIA 3SZ8A 1NF7A 5IBXA 3W1LA 1N55A 1NAL1 3MHFA 5LKYA 5HR7A 2P10A 5L9FA 4I7UA 1RVGA 2RHGA 3ZR4A 4FXSA 2A7NA 3G1FA 4IWWA 1F2JA 1DQXA 3GXNA 1H7XA 1OYAA 4NJJA 2QCDB 3E12A 1SO3A 2NZLA 4D2JA 3OBKA 1GPWA 2ZZ5A 4WY0F 4FF7A 3OVRA 4L4LA 1GWJA 2FB2A 4JS3A 3S5NA 3THAA 2VELA 3QMRA 3O6YX 1BKSA 1NF0A 3DKLA 5FF0A 3PSWA 1YTKA 4TMBA 3WJZA 1RQBA 3W23A 2E1DA 1PCKA 3JS3A 3QYQA 3PB2A 3TDFA 2QAFA 3ANYA 1WOAA 1R2TA 2PRLA 2E5DA 1F05A 3NAVA 3HGRA 4RJEA 2NV1A 1WYIA 4NJIA 4CLMA 3BLIA 4K6AA 1R2RA 5G1TA 3ZS4A 4FNQA 1RPXA 3PBUA 3NQFA 3NXFA 3LTPA 5FF3A 1NFBA 3C4UA 1L6YA 1M7PA 1JCXA 3DHFA 3W2JA 1LORA 1TPEA 3FJLA 1X1OA 3M6YA 1Q6OA 1DHPA 5I3KA 3GDKA 3H55A 3PC0A 4OQVA 3L68A 2ZZ2A 3HGOA 1Z41A 3A9IA 3HG3A 1QWGA 5CGQA 4RCXA 3TQVA 3TSBA 1QPNA 3B06A 3CM4A 2E68A 4Y90A 5EL1A 4XUGA 4DO4A 4I9AA 2AQWA 2GPTA 1SU5A 1KM5A 2FLIA 1ZALA 3UPBA 3WJXA 1CW2A 3NQ7A 4JEQA 4QIUA 5CPMA 3EXRA 3IIZA 1QOPA 4JNMA 4K36A 5LNVA 5L6UA 1SR9A 3AO0A 3G0UA 2DJXA 3L5LA 4MUZA 1GVSA 1TPVA 5HULA 1TV5A 2QJHA 1M7OA 4GUIA 3FYOA 2Z2UA 1Q3NA 3EWXA 2G95A 1ZNNA 3S1WA 4RXFA 4IUOA 3GAKA 1O94A 5AOUA 1FUYA 3HPXA 4MYAA 1YTEA 5A8GA 2PRHA 3IRDA 1EX5A 2YXGA 3GB6A 3E49A 4NXKA 3KHJA 4DO5A 3LX9A 4MY8A 4NX0A 4UTTA 3PG9A 2QCDA 1J5TA 2E6DA 3NL3A 3INPA 1LBMA 2DZXA 4OWGA 3QM3A 4NZJA 3DXIA 1I4NA 1I2PA 3C56A 1W0MA 4FNPA 4Y6GA 3FKKA 5C55A 3M7WA 4M6PA 4QNWA 2EAWA 2IQTA 4JDBA 2QJIA 2ZTJA 4YMZA 3S8HA 3R13A 3KXQA 2QCNA 3EKZA 2VXNA 4UTKA 3SY5A 3QMSA 2CZFA 2RH9A 2WSYA 4O0KA 4FNSA 2H6RA 2QF7A 4I7VA 3V1PA 1O5XA 1SO6A 3L66A 2CFFA 2A5HA 3NPXA 3TW6A 5LHFA 1I8JA 3G1DA 1FDJA 2V81A 2ZZ1A 4U28A 3NL5A 1QOQA 1PHWA 2CLKA 3CWOX 3GLCA 4LVAA 2NX3A 2DZSA 4JIPA 1HTIA 4MJMA 3N2XA 1DQWA 4Y8FA 3W2UA 3EX2A 1FWTA 2J9ZA 3G1AA 1W5PA 3EX4A 2NXIA 2ALDA 2W0UA 3QC3A 3QF0A 5CZJA 3W7KA 1F76A 3L5MA 1KFEA 1HO4A 1EP2A 2XFWA 3B03A 5TBOA 4FO4A 4PEKA 1H50A 3EX3A 3ZFHA 1F7BA 2QDGA 3LXCA 3GKAA 3N3MA 5K4ZA 1I2QA 2E6YA 3GDLA 2Y62A 1I2RA 3KVJA 2Q3RA 3PS7A 2X1UA 4GUHA 3W2MA 2Q8ZA 3GK0A 2OJPA 3LGEA 2Y63A 4XZ9A 2NLIA 5K9CA 1EUNA 3TR2A 3HJZA 1C8VA 1ICQA 1TTIA 4K8HA 5G4EA 4AHOA 3EX1A 2NX1A 1KLYA 3S0CA 1PVNA 5KMYA 3EWYA 2GVGA 4NU7A 3UXAA 5KITA 2WQPA 4C1LA 3UWWA 1OX6A 3DFNA 3RLUA 3LRLA 3K30A 3NM1A 4JX4A 1MXSA 4HKPA 1FWSA 2GQ8A 3BG3A 3NDOA 3LCIA 1XUZA 3TNOA 3UWQA 1GJPA 1BTMA 1LTDA 1N8FA 1TJPA 2GQAA 3MBFA 2ZZ7A 4QM1A 3G8RA 2CWNA 4O0ZA 2CLFA 2Z1BA 1XL9A 3QPZA 2ZA1A 5H91A 4BR1A 2VFDA 4N9BA 2PE4A 1OHLA 5LZLA 1LYXA 1RQHA 3HGSA 5D03A 1KW1A 5FEXA 2CW6A 3WK0A 2C13A 4DO6A 3KOFA 4NUWA 1LRTA 3I7RA 3VCRA 4PL2A 1ME9A 1K8XA 1BEUA 1OFBA 5K2ZA 3QH2A 5EY5A 1ONRA 2HTMA 3QMTA 2YR1A 2V8ZA 3W7IA 4O1BA 4ONVA 3BLEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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