1XFBA

Human brain fructose 1,6-(bis)phosphate aldolase (c isozyme)
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
342
structure length
342
Chain Sequence
HSYPALSAEQKKELSDIALRIVAPGKGILAADESVGSMAKRLSQIGVENTEENRRLYRQVLFSADDRVKKCIGGVIFFHETLYQKDDNGVPFVRTIQDKGIVVGIKVDKGVVPLAGTDGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKISERTPSALAILENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIKYTPEEIAMATVTALRRTVPPAVPGVTFLSGGQSEEEASFNLNAINRCPLPRPWALTFSYGRALQASALNAWRGQRDNAGAATEEFIKRAEVNGLAAQGKYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Aldolase C
publication title Structure of human brain fructose 1,6-(bis)phosphate aldolase: linking isozyme structure with function
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 135
structure length 342
sequence length 342
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2004-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xfbA00
4BR1A 3GLCA 4FEZA 3W3OA 1QPNA 3RLVA 3N19B 3W83A 3O1NA 3GAYA 4M7TA 5I3HA 3TIMA 3L65A 3LHZA 2C14A 3CIWA 4MFEA 4NJJA 3LBMA 1EUNA 3QSTA 3C4UA 5BRBA 1K7XA 1QR7A 1SR9A 3CLMA 1VRDA 4KFPA 5C2XA 1QPRA 3A5VA 1LRNA 3W9ZA 1F2JA 2PC4A 1K02A 4X22A 4RXGA 3W71A 3EWWA 2ZYFA 3IEBA 5TBOA 3TROA 4GUGA 4UTWA 1XL9A 2HMCA 2NV2A 4JTEA 2CU0A 5G1YA 3A23A 3NAVA 4UTKA 4UCGA 3TV8A 3QPYA 5K4XA 2Z1BA 5F2IA 2GJLA 1BEUA 1Z44A 2D73A 1FBAA 5AHFA 2C0AA 3CT7A 4DF1A 2TYSA 4HIBA 3B0PA 2ABBA 3A9IA 1TYGA 1MO0A 3LHUA 1PV8A 1W5MA 2ZRZA 2I9EA 4RCXA 2VEKA 5EBUA 1XC4A 5D2VA 1EEPA 3U6WA 3HG4A 3NQAA 1UBSA 4A21A 1IXOA 5F4SA 2ZA3A 2A85A 4IMEA 3SI9A 4RLIA 1LZOA 1LLZA 4R53A 4LVBA 2V2HA 5D2TA 1Y0EA 1X1ZA 3CHVA 4HNTA 4ICNA 2ZDRA 3JR2A 4ORMA 2Y89A 2ZTKA 5D37A 3PC0A 5AHEA 4IMFA 3HGOA 4HPJA 1VYSX 1B4KA 1TMHA 4RZ6A 4I7UA 2QCNA 1EWDA 5HINA 4UMBA 5L9FA 4R34A 4XTIA 4AWUA 4UC5A 4JTIA 2PURA 2Y7DA 5HWJA 3FIGA 2ZZ3A 4MLJA 3QSRA 4ZQOA 1S3HA 1SZFA 4PTNA 1OFRA 5DCBA 3C0JA 3B03A 2A6LA 3M5XA 4RX0A 3R5EA 1OX6A 3LHYA 2H8ZA 3E96A 1XBYA 2NV1A 5D2YA 4O11A 3SGZA 4ZQPA 5DCEA 4CQ8A 1JRCA 1H7PA 3F03K 4IXXA 3IIXA 2VFIA 4JTLA 3O8AA 1E51A 1H7NA 3VKJA 3BG5A 2YW3A 1ME8A 2O7QA 2VFEA 3S1VA 1W5PA 2C13A 2V0TA 3GNNA 1OX5A 3HO8A 1TV5A 4IMDA 1AW1A 4AMAA 1QPOA 3EWUA 4O57A 3P61A 1HG3A 3G0SA 3TSMA 4XTDA 4DO4A 1BTMA 1VHNA 2A0NA 2A1YA 4HPXA 1VZWA 5A8GA 1ZHAA 1KFCA 1HTIA 1NF0A 3T7VA 4LOCA 4R7JA 5HUOA 2FB2A 1PVNA 1ZAHA 3CEUA 4RJEA 5LNUA 4MVAA 3KVMA 4WZHA 3USBA 3UQNA 1CI1A 4FNRA 5F1VA 2X1RA 3JS3A 3WK1A 1J5TA 3GDMA 4PEKA 5EL1A 3LX9A 3LCFA 4HT3A 1RR2A 1EP2A 4KKXA 3SIZA 3LI1A 5I3GA 3NQFA 1A50A 1WBHA 5G1TA 1DHPA 1DQXA 3C2VA 4JXCA 4QISA 3UWUA 2OMAA 2ABAA 2H3BA 4K7VA 1WV2A 2QUUA 4YL2A 1H7XA 3G3DA 2ZTJA 3OVQA 4TMCA 4LS2A 3S9YA 2QAFA 4X9SA 3S1WA 2VFDA 2QCEA 1IF2A 3HPSA 3W7DA 4QQ3A 4ZQNA 5I3KA 5H2ZA 1ZENA 3CU2A 3W2UA 4EF9A 4LV9A 3A21A 3PAJA 3S5OA 3NPUA 3WFAA 1DV7A 3O05A 4HN4A 1LP6A 2VOMA 1O5KA 1R30A 4LTSA 3W73A 4MYAA 4H3DA 1K03A 1JR1A 4JDYA 3SSJA 3SECA 3MHFA 2UV8G 4LVGA 5D03A 3W22A 3BLIA 3H54A 4MZ1A 4DBDA 3BK0A 1VLIA 4MKNA 3CIXA 3HMJG 5F4WA 3EEGA 4UR8A 3W87A 2Q8ZA 3ABSA 3R2GA 2X16A 4FNPA 3O07A 1WX0A 3W7PA 3LV6A 3G1VA 1YADA 2QCHA 4DBEA 4JY8A 1OVDA 4A2SA 1SW7A 1ZY9A 1TB3A 1TPDA 5EPDA 2BX7A 1LTDA 1TRIA 2ALDA 3G18A 4LC6A 4TMBA 1VCFA 2HS6A 2FIQA 3GDLA 3M5VA 3W7EA 3ABQA 2E1DA 4JNMA 1R2RA 2RHGA 3DFOA 3I7SA 5L6UA 3TNOA 4GE8A 3ZWTA 2J88A 2NXIA 3A24A 4CCEA 1KFBA 4FNSA 1TTJA 3LHVA 1YXCA 3GIYA 2CLKA 3AJXA 3LOTA 4UUIA 5G2IA 2PRMA 3VFLA 5FF3A 2A7NA 3NOEA 1GVQA 3SZ8A 4K38A 4X3ZA 1GVOA 2FB3A 3EWZA 2CFFA 3SFKA 2A2IA 5K3VA 4JTGA 2HSAA 5LNVA 5K9XA 3M47A 1FWRA 5J5RA 1FDYA 1RD5A 4NXSA 5I3FA 2CZ5A 1N55A 4PCFA 4O19A 3W85A 4FB7A 2FQIA 4O0ZA 3W74A 2ZZ4A 4I7VA 3KVKA 4JTUA 4AWTA 1SFLA 5F2MA 2WOQA 1GYNA 1OABA 2GOUA 3MP5A 4AEOA 2BZNA 1OF8A 2E09A 4WOQA 3K30A 1DORA 2RDTA 3W76A 1EIXA 3UWZA 4N9DA 1LROA 3YPIA 4KWWA 1VH7A 4DXVA 3UWYA 5LNWA 1FDJA 2C19A 3NQ2A 2Y70A 5HJLA 1QDSA 4P61A 3C2RA 3W7HA 3G8EA 4LU0A 1G4TA 2GVJA 3GXPA 2ISSA 5G4WA 4CCCA 1C29A 4AVFA 3MBFA 4BI7A 1VGAA 2V81A 1GJPA 3I65A 2H3DA 2VFHA 3LCHA 2A6NA 4O10A 1R47A 5KTLA 3KRSA 1B9BA 1JQXA 4AHOA 2H90A 5F1UA 3BW3A 4LUIA 4GFSA 3MI2A 1LCOA 5HR7A 4IQLA 2Z6JA 3L2IA 3T40A 3WK3A 3MYOA 2XN0A 5SWUA 4BK9A 2TRSA 3TMLA 1K8YA 1ML1A 1FDZA 4QIUA 1P0NA 3DFPA 4MUZA 1FWNA 1HO1A 4NJGA 1S5WA 3DHDA 3CTLA 4POCA 5CZ0A 3FLUA 2ISWA 1ZCOA 3WJXA 3O6DA 4MLRA 3W7MA 4EOUA 1D3HA 4HNVA 4IOTA 4K36A 1G4EA 4K37A 3S5NA 1F6KA 1OFQA 3N9SA 1FXQA 5IBXC 5K9CA 2QJHA 4I9AA 4O14A 1Q6OA 3M1ZA 4O1DA 5CZJA 3UXAA 3PBVA 4E38A 3NXFA 4JR5A 4BF9A 5AB3A 2JK2A 1G6CA 3SW6A 3P8IA 3M16A 2J9XA 1AG1O 3FYOA 7TIMA 4O52A 1W0MA 4ZQCA 3HIJA 4TO8A 3W86A 2WO5A 4JDBA 5I3JA 3DGRA 2FTPA 3U2OA 1GVRA 2X30A 5AHNA 2ATMA 4CLMA 4N4PA 3PUOA 4J9JA 4YXGA 1YPIA 4Y8FA 4GBUA 2NUXA 2NLIA 3TXZA 4BWLC 3B0UX 1QCWA 2YXGA 4CQAA 2GQ9A 3Q94A 1XXXA 5LSMA 5FF2A 3UY8A 2ATSA 2E5BA 1FWTA 1G4PA 4H4IA 3BLEA 4A2RA 3TFCA 1RZMA 2R94A 5CKSA 1VYPX 3EWXA 3MI3A 4GUJA 4GWEA 4QSHA 3TAOA 3UZJA 5EMUA 1Z41A 4C1KA 3S42A 2VFGA 4RZ5A 3DI0A 5ABTA 3P8JA 3RK8A 1QFEA 3MP4A 1GOXA 3LV5A 3MHGA 4IPJA 2W6RA 1G4SA 2QCDB 4HKPA 1YXDA 3TCEA 1F74A 1TJRA 4FNQA 2FLIA 3P82A 3FFSA 5CPOA 4UTJA 4LT9A 2ZRYA 2ZZ6A 2V8ZA 1TPC1 1NF7A 1TTQA 3QFEA 5C54A 4O15A 4N02A 3LM7A 4YMZA 1EA0A 4HHPA 2VKZG 2Q3OA 1W3NA 3LBCA 1OX4B 1XM3A 3NL6A 5D2XA 4AF0B 4MJMA 4UTLA 1SO4A 2FJKA 4JTHA 5IBXA 3UPBA 2Q8LA 3TSDA 2QDGA 4Y6GA 4O54A 1FCVA 2WPBA 3VNDA 1FX6A 4WOZA 5KINA 2QCCA 3CWOX 2YYTA 4A22A 1JCNA 3TC6A 3TXVA 1WA3A 6TIMA 3OA3A 2AGKA 2WNZA 3QMRA 2WSQA 3U8GA 4L4LA 3KXQA 1TREA 2Y6ZA 2CLMA 1QMLA 3OIXA 1T99A 1LBLA 2YZRA 3H55A 3LB0A 4IGHA 1QPQA 3ZS4A 4DF0A 3QRHA 1QOQA 3N9RA 4BWLA 5FEWA 1A5SA 3M44A 3M5YA 4JYEA 1H1ZA 2QEZA 2NWRA 3EX2A 1SPQA 3G24A 1PCKA 4MZ8A 3LCXA 1KM0A 2YYUA 4MYXA 3MI6A 2J24A 4EF8A 3AO0A 4LVFA 2DP3A 3GR8A 2BSLA 3PG9A 2HS8A 4MY1A 3P60A 3L0KA 4IJBA 3P5YA 5MHBA 4JIQA 3HG3A 1TV8A 2A7PA 3NPWA 4JTTA 4XBSA 4L4MA 3EXRA 3TJLA 1SW3A 3MUXA 3NQDA 2TPSA 4U4MA 4ZQMA 1IXPA 4O17A 1FCBA 1G69A 1FXPA 3EX1A 1JJKA 3SY5A 1VYRA 3HF3A 1KV8A 2PRHA 2WQPA 4MY9A 3S1UA 1V7YA 3W1PA 4AHPA 5E1QA 2EAWA 3E0IA 1BWKA 4DF2A 1WXJA 2NXGA 5G2HA 1J2WA 5LGXA 3LCIA 4HNUA 2WNNA 5AC8A 1OK4A 1VPXA 3KOFA 1ONRA 1XBXA 3W2NA 3EX3A 4ORIA 1XBZA 4UFHA 3B0VC 4XKYB 4R33A 4FIQA 5BMWA 1SO3A 1OFEA 1OHLA 1XUUA 1VC4A 2X1SA 3GZ3A 1SSDA 3G8RA 5TQLA 1SFJA 2QKFA 4O53A 5BNKA 3BG9A 3M7WA 3VE7A 1ZFJA 2DJLA 3A22A 4M19A 2LLEA 4ADSA 1A5BA 1RVGA 1K3UA 2RDWA 1G7VA 4LNYA 3GR7A 2ZZ1A 2FPYA 3G1AA 4U28A 1TIMA 2QUTA 4NX0A 1W8SA 2YCEA 2G95A 6ALDA 4JYFA 4QM1A 1T0OA 1YTKA 3NM3A 3VCRA 1SQ7A 3Q58A 4IWWA 1YXYA 3UYCA 2E5CA 3LCLA 4IX2A 3QQ1A 4JD4A 1F7BA 2WSRA 1Z42A 5LHEA 1H7OA 5AC7A 2NX3A 4ADTA 1R2SA 5IM51 2V5BA 1SU5A 1T96A 2QR6A 5EYWA 5F2GA 1H60A 3LHTA 4AHQA 4DEFA 1A53A 4UR7A 4JICA 3N14A 1W1ZA 1F5ZA 3EWYA 4XWUA 5G5IA 1AMKA 1GZGA 3MP3A 1OFPA 1P5BA 3NL2A 1WBJA 3W70A 4FF7A 3QM3A 5LZLA 1KTCA 3LTPA 3M0ZA 3EX6A 3OVPA 4ZMGA 3M9YA 3M6YA 2YX0A 3HJZA 2ZRWA 3I6RA 3W88A 1MSSA 3QZEA 3GAKA 4PA8A 5K4ZA 3DFTA 2B7PA 1B3OA 1M7OA 1QAPA 1MEWA 4TX9A 3W07A 1AW2A 2A5HA 3IGXA 5AYYA 4MPQA 2ZRXA 1M6JA 5EKYA 2A4AA 2CLIA 5AC6A 2I1OA 2DU2A 3HOJA 4IMGA 2XN1A 4K8HA 3UPWA 1EWEA 4MJZA 3W1MA 3QMTA 2DZPA 3TFXA 3BW4A 3F1QA 1JCXA 4O18A 1SO5A 1O94A 1OX4A 4LY8A 1GT8A 2YPIA 3STGA 3L5LA 3PULA 3TQVA 4OHQA 1PHWA 4RK8A 3R12A 2FPTA 3W84A 4RV8A 4WXZA 1VHCA 2ZZ2A 4N9BA 3DFNA 3FKKA 2YDAA 4FNTA 2TMDA 5H91A 4PFMA 5D38A 3GX9A 1JCJA 1YDNA 4UXDA 3WJWA 1QO2A 4O8RA 4Y96A 3B04A 1NAL1 2ZZ5A 4NVTA 3F4NA 5D33A 4DPQA 2H6RA 5FEXA 1P0KA 1H7RA 3W7JA 1I45A 3O06A 2ZRVA 4E0CA 2EGZA 4JTFA 4UMCA 1W5QA 5G4EA 3W1UA 3W7OA 1KM2A 5A5WA 3ZR4A 1WQ5A 1GG0A 1Q45A 3SR7A 3M5ZA 4JY9A 3W2MA 3O6YX 1VLWA 1VJIA 1THFD 1H63A 3HBLA 3L21A 5KZEA 1H7WA 4JIPA 5DBUA 4UFJA 2KZHA 2A21A 3IIZA 3T78A 1EP1A 4JX6A 2Z0IA 3O16A 3EXSA 1DOSA 3W1XA 5K9DA 2DZUA 3E49A 3LTYA 3NZRA 3B05A 3CPRA 3TMQA 1FY6A 5D05A 1KM3A 2WJZA 3PWAA 1Q6RA 1OJXA 4JS3A 4WY0B 2YFNA 1W56A 4AWSA 1Q6QA 1LRQA 4N4QA 1X6UA 1YTEA 2HTMA 2I14A 1TCDA 2YFOA 3UWWA 4QAIA 3QW4B 5CSRA 4NNAA 1PHQA 3P81A 3W1TA 4LC8A 3OEXA 5FEZA 2Y7EA 4Z1AA 4UTMA 1FWSA 3RNDA 3Q2DA 3P74A 3HGSA 2OJPA 1L6YA 4M6QA 3MYPA 2F7FA 2ZFAA 2XN2A 3NQ7A 4Z1BA 2C18A 2J27A 4MFDA 1OK6A 3FYPA 3NQ6A 2Y62A 4UNKA 5TIMA 2C1HA 1ZNNA 1PIIA 3C6CA 3C52A 3TC7A 1L9WA 2DJXA 4O28A 3TJXA 2WV8A 3HB9A 3LTSA 1KM4A 4X2RA 5G2WA 1AW5A 4Z0JA 8TIMA 3LRMA 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 4Y90 A;  3HPX A;  1OFD A;  1UB3 A;  3W1R A;  3P80 A;  5C6M A;  4QJ1 A;  4UMA A;  1MEI A;  2JKP A;  4FXR A;  2VEL A;  5AN7 A;  3RU6 A;  2QF7 A;  3LRK A;  4UTW C;  4M5P A;  1YYA A;  3HQ1 A;  4JTS A;  2OT1 A;  4A3U A;  4D2J A;  1QNV A;  4AB4 A;  4O4V A;  4GRS A;  2EF9 A;  2XFW A;  3IVU A;  5DXX A;  1I4N A;  4BI5 A;  1JUK A;  2Z6I A;  4BI6 A;  2B7O A;  1OF6 A;  1TSI A;  2Y85 A;  5GVJ A;  3L66 A;  4LUJ A;  1VCG A;  1TPW A;  3SGU A;  3PUE A;  2R91 A;  1I2O A;  1BWL A;  3CQ0 A;  3HG5 A;  3RLU A;  4FO4 A;  3L5M A;  1HL2 A;  3EXT A;  3QJA A;  4CQ9 A;  2X2G A;  4O0K A;  4UTH A;  1T8X A;  1B57 A;  1OYC A;  3LCW A;  3WK2 A;  1R2T A;  1LYX A;  4A29 A;  1AL7 A;  1L2U A;  3N34 A;  4P2V A;  2QJG A;  4S1F A;  3MO7 A;  3LXB A;  2B4G A;  4UIO A;  4NJK A;  4YCP A;  1DKW A;  3HPZ A;  3DU0 A;  1JCL A;  2NXH A;  5CPL A;  5LGZ A;  1OYA A;  5HMS A;  3PBW A;  2YW4 A;  3PS7 A;  2V9D A;  1LDC A;  1ME9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3L4V A;  4H41 A;  2VP8 A;  3W3O A;  4P8U A;  3N19 B;  4LPC A;  1ZGD A;  3GAY A;  5I3H A;  4B5U A;  4HPG A;  3DG6 A;  1F3T A;  1W1T A;  4MB4 A;  1SJA A;  2C14 A;  4MFE A;  4BF5 A;  2PDP A;  3HQO A;  2DIK A;  3UG3 A;  4HCD A;  3TYD A;  1AQM A;  2OEJ A;  1DWA M;  3QST A;  4Z2J A;  3LA4 A;  5IDZ A;  1QR7 A;  3MUI A;  1SR9 A;  5DAN A;  4TUF A;  5C2X A;  4RE3 A;  3CZ8 A;  3RXZ A;  1VFU A;  3ISI X;  3QV8 A;  3QV6 A;  3W9Z A;  1F2J A;  2PC4 A;  4LAZ A;  4RXG A;  3W71 A;  3TRO A;  3IEB A;  4JAW A;  2BAS A;  2PP1 A;  2UY5 A;  4GUG A;  1XL9 A;  4OBR A;  2HMC A;  5EB8 A;  1JGM A;  3A23 A;  5F2I A;  1Z44 A;  1XQK A;  2YBV A;  1FBA A;  4M81 A;  5AHF A;  4FLR A;  5HK4 A;  3R43 A;  4HQV A;  5HAN A;  3B0P A;  2ABB A;  2YLA A;  1S2A A;  2QV4 A;  1VFF A;  1W5M A;  3W53 A;  2DH3 A;  3WF0 A;  2QJM A;  1MYR A;  5D2V A;  1EEP A;  1DYS A;  3ZLH A;  1IXO A;  3GTN A;  4QRO A;  1AJ0 A;  5F4S A;  3HA1 A;  2ZA3 A;  4QJ3 B;  3SI9 A;  4NAS A;  5DO8 A;  1LZO A;  4R53 A;  2PDY A;  1JZ2 A;  1TMQ A;  1X1Z A;  1ZLP A;  2V68 A; 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