1ZAIA

Fructose-1,6-bisphosphate schiff base intermediate in fbp aldolase from rabbit muscle
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title High Resolution Reaction Intermediates of Rabbit Muscle Fructose-1,6-bisphosphate Aldolase: substrate cleavage and induced fit.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 143
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2005-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1zaiA00
2VFFA 3NQAA 4WD0A 5J5DA 5F2MA 2DP3A 2VOMA 4GXMA 4ZVJA 3WK0A 1ZHAA 1PIIA 3QQ1A 4BR1A 4EF8A 2NV1A 4M5PA 1EWDA 2ZA1A 1GJPA 4Z08A 5K4XA 1VJIA 4BK9A 2NX3A 4U28A 4XWUA 3UPBA 3OVPA 1Y0EA 1FXQA 2BX7A 4M19A 5CZSA 4ZMGA 1AL8A 5KITA 4JD4A 4GBUA 2DZWA 1ZY9A 5HNRA 1NSJA 1FWNA 4YL2A 4OBTA 5AHFA 2WSRA 4HT3A 2ABBA 3DFQA 4JTTA 1F74A 3W84A 1OABA 2WNNA 2QCFA 1Z48A 2W79A 1EA0A 1EUNA 1GYLA 4QITA 1SUXA 3SIZA 1OFBA 2ZRZA 1W5NA 3LDVA 3S5NA 3TKFA 4GUGA 3NVTA 3IGSA 3OEXA 3IIVA 1GWJA 4PFMA 2V2HA 3EX6A 4Q32A 2BWGA 3U2OA 3QEZA 1O95A 2QCEA 4DBEA 5EMUA 1R47A 3KAOA 3ZR4A 4CCDA 2V82A 5DXYA 2E5BA 3W23A 1KBJA 1RVGA 1KM3A 3M5VA 2E6DA 3PUOA 4TIMA 2NUXA 3CT7A 1S5WA 1G69A 3WK3A 4KFOA 5AC6A 5F4SA 3PB2A 4AWUA 4GWEA 4JICA 5D38A 2YW4A 1GG0A 5CPOA 4Z1BA 1WBHA 4HNNA 1KM1A 2D73A 2HS6A 3F1QA 1UCWA 3LHYA 3R12A 2DJLA 3N34A 3LXAA 4X2RA 4O19A 2H8XA 4A21A 2V2DA 3S1UA 2G5WA 3E02A 3DHDA 5HMSA 3G1DA 1UBSA 2YYTA 3I7QA 2ZQ0A 3FLUA 5DCBA 3F03K 3MHUA 3NPXA 3W07A 2PRMA 3C2VA 4JIQA 3HGRA 3GAYA 3R13A 4UTTC 2E68A 3MP3A 4DXVA 4UMAA 1V5XA 5FF2A 2CFFA 2ZRUA 2EF9A 4HNVA 4UTIA 2FFCA 3FOKA 1GVSA 2BLEA 2A5HA 2J6XA 5DLCA 3C56A 1GOXA 2QCDA 2PURA 1N55A 3ABOA 2JGQA 4FIRA 1KTNA 4JX5A 3G8RA 4IOTA 4P2VA 5HULA 3M0ZA 1GVRA 4NUWA 1M7PA 1D3HA 3LCWA 1BEUA 4BWLC 2W0UA 1TPVA 3EX2A 3T4CA 2EGZA 4RCXA 2CLEA 5DN1A 2AQWA 3CPRA 1JUBA 2YDAA 2VEPA 2AAMA 1T8XA 4RZ6A 3ZS4A 4O53A 3RNDA 2NV2A 2XN1A 5AYYA 4OQVA 5F2IA 1AW1A 1WYIA 1RZMA 1TIMA 4UFJA 3S0CA 2DJXA 4GJ1A 1YTDA 3G18A 1L6WA 5BOOA 2Y70A 4LOCA 4M6VA 4Y90A 1X8FA 2ZRYA 1K03A 2Z6JA 2QUUA 1KV8A 2IQTA 1YLVA 3LCFA 3STCA 4E38A 3P62A 3U6WA 1R2RA 2BTMA 1SO5A 5G1YA 3GNDA 3IVUA 3GKFA 5FEZA 3L0NA 3FKKA 2GVLA 4WUIA 4IMGA 4IPJA 3WJSA 5AC7A 2GQ8A 5G2HA 3MWAA 4JS3A 2ZRXA 4PA8A 2RFGA 3LERA 1TRDA 4O52A 4D2JA 3QSRA 1TPEA 3MMTA 3SI9A 1VHNA 4OGZA 4ALDA 1O94A 1X6UA 3M7WA 3IVSA 1JR1A 1SU5A 3L67A 4K8EA 4RX0A 3UXAA 4ADSA 1PL9A 1LRTA 4PL2A 3G8EA 2C16A 4CQ8A 4UTWA 2Y85A 2FPYA 5A8GA 2VENA 4RJEA 4O13A 4RKAA 3W85A 3I65A 3L21A 3LX9A 3TAOA 2VFIA 4LUJA 3Q37A 3CWNA 3NL6A 5EL1A 5FF7A 5HUPA 2QCCA 4A2RA 3B0PA 3D0CA 5F1VA 4LVGA 5AB3A 5EY5A 2QAFA 1LZOA 3FS2A 3GR7A 1DHPA 2X1RA 2WPBA 1W31A 3NA8A 3BO9A 1I8JA 5KMYA 3G1VA 4JTJA 3W1UA 4NJJA 1KFCA 3A22A 3BGGA 3TDFA 1P0KA 1H7OA 5D05A 1EIXA 5TIMA 1H63A 3TQKA 4ZQNA 2O7QA 3TA6A 3BLFA 1SFLA 3SGUA 5FESA 1W5PA 1SZNA 3QYQA 4CCEA 2A2IA 1AL7A 4I7VA 3SW6A 2B0MA 2ISSA 4FIQA 4IGHA 2NXGA 3Q94A 4HNUA 2VEIA 3BV4A 5EYWA 3LM7A 4TMBA 2CLLA 1PHQA 2FJKA 4FB7A 5K7JA 4NVTA 2QCMA 2Y7GA 4MYAA 4NXKA 1O5KA 3GKAA 3OG3A 5G4WA 4A29A 4EOUA 2EAWA 4MUZA 1F76A 2FB2A 3TX9A 3G1YA 3TMLA 2PCQA 3NQGA 1FCQA 1PV8A 1AK5A 2Y6ZA 3TSDA 3N73A 4JTEA 1VPXA 5GVJA 3UZ5A 8TIMA 3NXFA 2WQPA 5EPDA 3QW4B 4UCGA 4LS1A 2NUWA 2X30A 1OFQA 4UTHA 2ZRVA 3ATYA 1P1XA 2HS8A 3W7PA 1VC4A 5CSSA 3LRLA 1XC4A 2A6NA 5D33A 2CW6A 3PWAA 1OG0A 1LOLA 4KWVA 1QPQA 3LHUA 5HWNA 2X2GA 3FYPA 3LCHA 2H90A 3ZFHA 1YDNA 3S6DA 1SZGA 3T55A 4O0ZA 1W54A 1X7FA 2YYUA 3ABSA 4UTTA 3LHVA 5MHBA 3VI2A 3EKZA 2DZSA 1GT8A 2NXIA 3EKLA 3PUEA 4FXSA 2ATMA 1G4EA 4N6EA 3RFAA 3DU0A 1JRBA 2QJHA 1NAL1 2J24A 4KKXA 5IM51 5CPLA 3OBKA 2H3DA 2JK2A 4Y6GA 3TV8A 1SQ7A 4BWLA 3IV3A 4LU0A 3MUXA 3LI0A 4WJEA 3G0XA 4N9DA 2Y61A 4YMZA 3RLUA 2E6AA 4LS0A 3UWVA 1E51A 1C9DA 4AH7A 2A85A 3G1XA 2B7QA 5IBXC 5HR6A 1FWWA 4JIPA 2Z1BA 2HSAA 3ZWTA 3MHFA 3EWBX 1Q3NA 1H62A 3PSWA 5FF4A 1OK4A 3IVTA 4ZQMA 3I6RA 4WY0A 4MVAA 3EWXA 3DKLA 1OVDA 1WXJA 1UJPA 3LTPA 1B3OA 1F73A 1TV8A 2A6LA 3H53A 3LXBA 4XZ9A 1ONRA 3S5YA 3CEUA 3TSBA 4WOQA 4HIBA 3HPSA 2P1FA 4FNTA 5DBTA 2JBMA 3W2NA 2NX1A 3W70A 3W1NA 2ZRWA 3NM1A 1OX6A 3GX9A 5LNRA 5LNVA 4LS2A 3CWOX 1QPRA 3THQA 2FPVA 1RQEA 1FWTA 4K36A 2UV8G 1ZAJA 3TJXA 2ZFAA 4HHPA 1GVOA 3NQCA 4Z0SA 1KBIA 2C14A 2E09A 4LVFA 2RH9A 1ZFJA 4Q33A 3LLDA 1SSDA 1H1ZA 1W37A 3W7HA 4O4VA 3W7EA 2NXHA 5AYZA 4DPPA 3G24A 2F7FA 4IXXA 4QSHA 1K8YA 2ABAA 4FNUA 5BMWA 1VCGA 3QQ0A 1F05A 2VFDA 3GDTA 3SZ8A 1S5VA 1CW2A 3MO7A 5HR7A 1KFKA 1QOPA 4JN6A 1VQTA 2B7NA 3NAVA 1DBTA 3BLIA 1H7XA 4XKYA 3G1HA 1FUYA 3NQMA 4KWWA 1YDOA 1LP6A 5D2WA 4YLWA 3G1FA 4NJGA 4ZZ9A 3W1TA 2Q8ZA 5K9CA 2QKFA 4FHAA 3MW7A 2DZXA 3O6YX 3NR0A 2Y7EA 3BW2A 2QCDB 3KXQA 3LBMA 5U7SA 1I2RA 1OYBA 2X16A 3GXPA 5AHIA 1XL9A 4K8HA 2Q3RA 4QJ1A 2Z0IA 3STEA 3B03A 4NZJA 3NPVA 3A23A 3W7KA 1QPNA 3HF3A 4GUHA 2YZRA 3NL5A 2YXGA 1YPIA 2ZZ1A 4LT9A 1QMLA 3JS3A 4LC6A 1JVNA 3PM6A 1CX9A 1XUZA 3S5OA 2RDTA 5K4ZA 3A5FA 4FXRA 4RR4A 1IIHA 1T0OA 1AG1O 3PUDA 2TPSA 3QH2A 3W72A 1TTQA 1YXYA 4JYDA 2A7NA 3TC7A 3HG4A 2YFNA 1VZWA 1SFJA 3B4UA 4NNCA 3FIGA 1SR9A 2FTPA 2XN0A 2ZTJA 3O63A 3QMRA 5BNKA 1DJQA 3R8RA 3M5ZA 4NQ1A 3B8DA 1LYXA 3C2FA 1SZFA 4WZHA 3TXZA 4ZQPA 4IWWA 5DCDA 3P61A 3GVGA 4GFSA 2WNZA 4YXGA 4LRSA 1TTIA 2QJGA 3UWWA 5D03A 3W75A 3NL2A 1B4KA 3P8JA 5CKSA 3NQFA 4RLIA 2GQ9A 1X1OA 2Y7DA 4ML9A 3TAKA 4PCFA 3DENA 5KSWA 5KINA 1Q6RA 1G6CA 1XM3A 4TU1A 4K39A 3P5ZA 4NNBA 4Q4KA 5BRBA 5I3HA 1C8VA 4EWND 1ZJIA 4M7TA 3UWZA 1NF7A 4M6QA 3FFSA 1H51A 2A1YA 5EKYA 3L68A 1FWRA 5D2XA 3GIYA 3AO0A 1DQXA 1KW1A 1I2PA 1ZALA 4Z1DA 3RF9A 3HPZA 3UPWA 3BLEA 5IBXA 4IPIA 1A53A 5AC8A 2YFOA 3LCIA 5DELA 4AWTA 2A0NA 1DL3A 1VCFA 1S3HA 1K3UA 3RLVA 5G2WA 4Z1AA 2E1DA 2R94A 4UFKA 4I7UA 4HPJA 3YPIA 5D30A 4Z0JA 1RR2A 3W7IA 1MEHA 3W7DA 3EXTA 1LOQA 2YPIA 4OHQA 3PF3A 3TR2A 3TQVA 1TCDA 1JCXA 1OFRA 2VFEA 1QNVA 4ORIA 4DF2A 1EWEA 4IQLA 4QNEA 2YCEA 5AHLA 4O1AA 5AHMA 1TJPA 2PC4A 2YGYA 4O28A 3W88A 2VEKA 1JQVA 2WKJA 3NYZA 3G3DA 5SWUA 1K7XA 4CQ9A 1PCWA 4WY0F 1YADA 1K7EA 3W1LA 3VE7A 5LGXA 1W5QA 3O15A 3TW7A 4QIUA 3I68A 3C2EA 3B04A 4BF9A 5HQEA 4LY8A 3UYCA 5I3KA 4L4MA 2VXNA 5H2ZA 4DF1A 1QFEA 3IGUA 1KV5A 2C13A 1KFLA 2VFGA 1XBZA 1R2SA 3EWZA 4ZL1A 3L0KA 2Y88A 4DEFA 4RXFA 4K38A 5C6MA 1TV7A 2CZFA 5G4EA 2Y7FA 1NFBA 3EB2A 4RXGA 1Q45A 2Y89A 5E93A 3W7RA 4LTSA 1H7PA 5LNUA 1FBAA 3NOEA 1MEWA 1OFAA 3E9AA 3NPUA 3PBWA 4NU7A 5LNWA 3QSTA 1B4EA 2FPTA 1BKSA 3L5AA 1LRQA 4DBDA 5CZJA 4O50A 1R46A 3W87A 2JKPA 5CSRA 1WX0A 5F4WA 3W86A 5K9DA 2G95A 3A5VA 3IEBA 4FNQA 2CZEA 4LRTA 1UB3A 1R30A 4O1DA 1TV5A 4WOZA 1TPWA 3NZRA 3WJXA 2NUYA 1HO1A 2E77A 2V2CA 2R91A 3DKJA 2ISVA 3PR2A 3CEPA 1FCVA 1JRCA 2WJZA 1OFDA 1SW7A 4IUOA 3HGSA 3L65A 4HN4A 1W8SA 2FDSA 3FJLA 2V81A 1WBJA 3TK7A 1GYNA 3P84A 3G1AA 5H91A 3OA3A 4LC8A 1L6SA 4O57A 1M7OA 3C2OA 3LLFA 3TMQA 4WY0B 5FF0A 1TRIA 3TJLA 3JRKA 2YSWA 1Q6QA 1D9EA 3DHFA 3S9YA 4BI5A 5HWMA 3RU6A 3EX3A 4JDBA 3C52A 1VRDA 4UMBA 4S2CA 3HPXA 4UIOA 1MZHA 4J9JA 1G4TA 3EWWA 2A7RA 3NGJA 4I9AA 2Q8LA 3MBDA 4CQAA 3E12A 4JX4A 3PULA 1O5XA 4CCCA 3N19B 1ML1A 3P81A 5CZ0A 5F2GA 2V8ZA 4QNWA 1JCJA 5DY2A 1WAUA 3G22A 2G97A 1XBVA 3N14A 1K7FA 4JYEA 1TPUA 1EUAA 3TW6A 3M16A 4YCOA 1NF0A 3PVFA 3IIOA 1A5BA 1FXPA 4MPQA 2TRSA 4MFDA 1SW0A 4MLJA 3W7OA 1KFJA 3LOTA 3T40A 1RD5A 4OE7A 1L9WA 3EXSA 3EX1A 1P0NA 3W7GA 3E96A 1HTIA 4GUIA 2ZTKA 5D2YA 3N2XA 1FWSA 1VH7A 3UY7A 3KHJA 4FNPA 1H7NA 3QRHA 2QUVA 3VE9A 3HO8A 4AB4A 1LBFA 5D32A 1LORA 2WOQA 3LCLA 3WK1A 4XBSA 4XKYB 2X1UA 3M9YA 2ZYFA 1SO6A 2ZDRA 3DAQA 4AMAA 3KOFA 1B9BA 1LM1A 1VYPX 1O60A 3O6CA 3NM3A 1EX5A 2F84A 4AXKA 4O16A 1GTEA 1F6KA 3O06A 1SO3A 4RV8A 3TU9A 2VKZG 1WV2A 1OF6A 1FDZA 3K30A 4Z1CA 1KTBA 1HUVA 3B0UX 1LBLA 1IXQA 1ALDA 3G3MA 4H3DA 4K7YA 3W7JA 3L66A 4UC5A 1H60A 4IMFA 4UFMA 2ZZ4A 3GXTA 1N7KA 3GYEA 1AW5A 3NNTA 1QO2A 4HSOA 3LRKA 4FX6M 1GEQA 1JUKA 3INPA 4QQ3A 3W1XA 4JYFA 2R14A 2DZTA 3GDRA 1KM6A 1KLYA 1TJRA 4H4IA 3BW3A 2OX1A 3TH6A 1LLWA 3B05A 3KVJA 2QCNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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