1ZENA

Class ii fructose-1,6-bisphosphate aldolase
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
356
structure length
338
Chain Sequence
SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQGAAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTDHCAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMIDLSEESLQENIEICSKYLERMSKIGMTLEIELGALYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVHGVKPGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHNSLNFVFHGGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAGQTSMIARLEKAFQELNAID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CLASS II FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title The crystal structure of a class II fructose-1,6-bisphosphate aldolase shows a novel binuclear metal-binding active site embedded in a familiar fold.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 338
sequence length 356
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 1996-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1zenA00
1IXNA 3KHJA 4O17A 1KA9F 1IGSA 3UY7A 3NNTA 5C6MA 2Y88A 4LTSA 3NQ2A 2I14A 1SSGA 1DJQA 4P61A 3W7OA 1KFKA 1NF0A 3VE9A 1FQ0A 2QUVA 3R89A 2NX3A 3O06A 1BWKA 3E9AA 3BW3A 4ICNA 4DF1A 4YXGA 1OYBA 3JR2A 3SGZA 1WQ5A 2DZUA 1GVRA 3S8HA 1H7NA 2QAFA 3P8IA 3DHDA 2X1UA 3SECA 2NV1A 1DL3A 1P5BA 2FFCA 4LC6A 4AF0A 3NQGA 3U2OA 3LCFA 4PL2A 4O1DA 3TH6A 4LT9A 1F74A 3Q58A 3NQEA 3MW7A 3GDMA 4UTHA 2QCDA 3EWWA 2H3DA 1M7PA 5FEPA 3QPZA 4IJBA 4NJHA 1GTEA 1W3TA 3IIOA 1XKYA 2E09A 3HG5A 3RLUA 2GPTA 2OJPA 3HPXA 2Z1BA 2ZZ3A 3WK3A 1S5VA 3P81A 2DZXA 2CLHA 3VI2A 2DZVA 1WAUA 3IV3A 4I7UA 1XM3A 2C19A 2VFGA 1JQXA 3THQA 3FS2A 1R47A 3GX9A 4S2BA 1BTMA 3TQVA 3BLIA 2B7NA 4ZQPA 1OABA 2E6FA 2VENA 4O10A 1H7WA 2ZRUA 3BG9A 1AW2A 1HUVA 3SI9A 7TIMA 2YGYA 4NX0A 4HN4A 2NUYA 5I3IA 3G1FA 3V75A 3CB8A 5LNRA 3T7VA 3ZWSA 4XTDA 2BWGA 4FEZA 4RK8A 2A0NA 1IXPA 3ATZA 4C1LA 1OYAA 4EF9A 4JTLA 4MY1A 1H5YA 4JDBA 2JK2A 3HG2A 1TPFA 3LDVA 1JR1A 1C9DA 4JX5A 3NQDA 4FNPA 5LKYA 5KINA 1UJPA 3R13A 4ZZ9A 4N9DA 2Z2UA 1ZHAA 4UTIA 4EF8A 2YXGA 5D38A 4L4LA 3GDTA 5HUOA 5EKYA 3W7LA 4E38A 3QQ1A 1LRTA 4AXKA 1YDNA 5CZSA 1OFRA 3P62A 5BMWA 3G1YA 1OX5A 5AYYA 1EP1A 2KZHA 2R8WA 3A5VA 5G4EA 3W7KA 3BW4A 5DBUA 1VCVA 1DVJA 4AAJA 1VQTA 1O4UA 1JCXA 1S5TA 5CGQA 3WJSA 5IBXA 1A5AA 4M19A 4DF0A 3W87A 8TIMA 2G96A 4JX6A 5D2XA 2W79A 4LC8A 2B0MA 4MVAA 3NEVA 4GFSA 1RQHA 2H3BA 1VH7A 4OHQA 3A21A 1ADOA 3G18A 4DELA 2W6RA 3UWVA 3UZJA 3W1AA 4CCEA 3K30A 5HNRA 3PBUA 4FNUA 3MO7A 2WJZA 1FWRA 3W71A 2B7OA 3NQ8A 4ADUA 4N4PA 3WK2A 3HG3A 4R34A 1SZEA 4EIVA 5SWUA 2EF9A 4UTMA 4RCXA 4IX2A 2IQTA 3G8RA 4MZ1A 4Z0SA 2GQ8A 2Q8ZA 1I2OA 1F73A 4JXCA 2V9DA 5E93A 4TIMA 3BG5A 1OFDA 1G4EA 3CM4A 2CLLA 4JIQA 3NQ7A 1XFBA 5D2WA 2E1DA 2E6YA 3O8AA 1TPDA 2A21A 5I3HA 5K4ZA 1ZY9A 1H60A 3LI1A 3FFSA 4GE8A 1AG1O 1KFBA 3PB2A 1MEIA 4XWUA 2QCLA 2E5BA 5AHEA 2JKEA 3RK8A 4ZQOA 4FNSA 1CI1A 4WJEA 2YZRA 1GQNA 3PG9A 6ALDA 3NQFA 4WUIA 2Q8LA 1LCOA 4O57A 4S1FA 1DQWA 3C2FA 4DXVA 2PURA 2X30A 1I2RA 1LYXA 3P80A 2V5BA 3HQ1A 2E5CA 1WV2A 3UWQA 1G4SA 3I65A 1NF7A 1ICPA 4XKYA 2QCMA 1H62A 4Y9AA 3TSBA 4BI6A 3TAOA 2ATSA 4JICA 1EWDA 3PG8A 5FF2A 1AK5A 1VRDA 3LHUA 1PHWA 2V8ZA 3UYCA 4UTJA 5E0KA 1F6KA 3W9ZA 2BLEA 3TE9A 1Z42A 4QNEA 1OF8A 1Y0EA 4PL1A 2GQAA 1FBAA 2ZYFA 4LRTA 4K36A 1J4EA 3EX4A 4FIRA 2VFHA 1G7VA 2OCZA 1SUXA 1JUBA 4UNLA 3HG4A 2VEIA 2ABBA 2BTMA 2OMAA 3G0SA 3W22A 3Q94A 1I45A 1QOPA 1QO5A 3IGUA 4JTTA 4Q33A 4FX8A 2V81A 2WNNA 3ABQA 3W2KA 1EX5A 2ZZ6A 2UV8G 1K7EA 4UTTC 5G4WA 2OZ0A 1SPQA 2A2IA 3W85A 2A7NA 3LV5A 4IGHA 3EX6A 2X1RA 3MP5A 4K8EA 3OHIA 4FNQA 1A53A 1F7BA 4GUHA 3W83A 2C0AA 2BX7A 3P82A 1KFLA 4PODA 1LLWA 3W1PA 1LORA 3W1NA 4HSNA 1HG3A 2TRSA 1TV8A 2QJHA 2QDGA 3MHGA 1UB3A 1XDLA 2FDSA 2NUXA 2OX1A 2X2GA 3EX2A 5D30A 1L6SA 5AC8A 5HR6A 4E2BA 2EHHA 1G6CA 2DORA 1J2WA 1N7KA 1H7OA 5CKSA 3TR2A 3CEUA 1H1ZA 1ZNNA 3DFTA 3LHTA 1K8YA 3TQKA 5KMYA 3C6CA 3W7CA 2CZFA 1OYCA 1QPOA 3OG3A 2F7FA 3GYEA 3W70A 4A22A 4I9AA 3W7GA 1H7PA 3NL5A 2PRHA 1FY6A 4JS3A 1TQJA 4E2DA 5DY2A 2VFIA 4M7SA 3PULA 4RXFA 1K3UA 3CU2A 1ME8A 2CLFA 1CW2A 4JTUA 4O53A 5AYZA 3KOFA 3F4NA 2Z6JA 3G1HA 1UBSA 5F2IA 3C56A 3QSRA 3QH2A 2EAWA 5LNVA 4R33A 2A6NA 2VFFA 4DQWA 3NDOA 4CCDA 2BXVA 2GVLA 1U83A 5DXXA 3O07A 2R14A 5I3JA 1OG0A 3KAOA 3HB9A 1VLIA 2RH9A 4R7JA 4WOZA 1DQXA 4G1KA 1H63A 3W7IA 1KBJA 1Z48A 3G24A 5H91A 4B5NA 4NVTA 1SW0A 4PFMA 4X22A 3L5LA 1TTJA 3NGJA 2V0TA 1OFQA 1QDSA 1ZAIA 3C2RA 2HMCA 4A3UA 4DF2A 3M1ZA 5T26A 3ATYA 3N9RA 3RLVA 1ZCOA 1VC4A 1LOSA 3IGSA 3LM7A 4IX0A 2W0UA 4TU1A 3DAQA 3LHWA 2ALDA 1KM5A 3W3OA 2GUUA 3DFQA 2RKXA 4JYFA 3T4CA 3TKFA 3IIZA 2DZTA 2P0OA 1WA3A 5A5WA 2G97A 3W88A 3QFEA 4O4WA 1EP3A 2PE4A 3S1VA 5LZLA 3SY5A 4OBTA 1TJPA 1VCFA 3FLUA 4PEKA 3TU9A 3YPIA 3O1NA 5AHIA 3BLEA 1YDOA 3S0CA 1F5ZA 3UWUA 1KM1A 3G8EA 1JJKA 3U8GA 1QNVA 1JRCA 3HIJA 4KWWA 2CZ5A 3GKFA 2ZRWA 3ANYA 2VOMA 4WY0B 1LOQA 4NNCA 1P1XA 4C1KA 5EYWA 3INPA 3DFPA 3T40A 2P1FA 5K7JA 4OV4A 3FEMA 4NZFA 3PF3A 5TIMA 5AYXA 3SW6A 5D33A 2WSRA 3W7EA 5CSRA 4QITA 4KWVA 3TJXA 3RU6A 4YLWA 2XN0A 3W7PA 5CPMA 4IWWA 3NM1A 3OVPA 1PCKA 4A2RA 3DBPA 2GVGA 1A5BA 1CX9A 3FJ6A 1H7XA 2RDUA 2Q3OA 3E49A 4DPPA 4IMDA 2X1SA 1MSSA 3TAKA 2AAMA 3TQ0A 2OT0A 4QSHA 1FWTA 1AW1A 3KFTA 5FF3A 1LROA 2CFFA 3NVTA 4UTWA 4O18A 3WFAA 3M5ZA 2NX9A 4NJGA 3DKLA 5AC6A 1OFEA 1QOQA 3OEXA 4I7VA 4UFLA 1YTDA 1WBJA 3LOTA 2I1OA 2VEKA 4Z1BA 1FCBA 2QCGA 3A9IA 2DJXA 4OU1A 4LOCA 1THFD 1PV8A 1ALDA 5F2GA 2ZZ4A 1XI3A 3P60A 3ZS4A 3QC3A 3BGJA 1ICSA 2HS8A 3L0GA 4O14A 2ZZ1A 3W73A 4UFHA 3S1XA 3KVJA 1AMKA 4AWSA 4MJMA 5K3VA 3G1VA 2OT1A 1X1OA 1TV5A 4LV9A 2GVJA 3CIWA 4ML9A 4UNKA 4N02A 3GNNA 4OT7A 3H55A 2FQIA 3QYQA 2QEZA 1HTIA 1OX4A 1U5JA 2GOUA 2A4AA 1UCWA 6TIMA 1QCWA 3GXNA 3IEBA 1T96A 1TQXA 1QPQA 1RQEA 1FWNA 3W7JA 1A5CA 1X1ZA 4UTWC 3JS3A 4HT3A 1RQBA 4UMCA 4FF7A 4UR8A 4YCOA 1KM0A 4IUOA 3EXTA 3G22A 3STFA 5ABTA 3CC1A 5CZTA 4N9EA 4O4VA 5G2HA 3TCEA 1VR6A 4UC5A 4MZ8A 1TYGA 4JTSA 4JIPA 2C6QA 3ZWTA 3U6WA 3DFSA 3TDFA 3KRZA 2ZA2A 4MYXA 3GIYA 3NPWA 3SGUA 3LLFA 3L66A 1K7FA 5K4XA 3PVFA 3WK0A 3M47A 4Y90A 3T44A 1OK4A 4WQ6A 4LS1A 4AHQA 4UFKA 3L0NA 1DV7A 2ZRXA 1F6PA 3PM6A 5TBOA 1LBFA 3TC6A 4K38A 3O6DA 1PE1A 5D2TA 4IMFA 4Q4KA 2WV8A 2H90A 2H8ZA 2J9ZA 4FXRA 4LVDA 4MFEA 4HNNA 1L6WA 3IGXA 4LS0A 3CIXA 4K7YA 3MBFA 1KW1A 3NAVA 4JYEA 4IXXA 1XCFA 2B7PA 2C13A 2F84A 1SFLA 3W2NA 2YDAA 3FOKA 3QQ0A 4MOZA 1M5WA 1T99A 1QMLA 4NXKA 1LRNA 2V2HA 1D9EA 1TSIA 3MP3A 4XTIA 5CSSA 4RKAA 1MEHA 3VKJA 3OVQA 3L67A 2ZCGA 3L5AA 3N9SA 5FEWA 1JUKA 5D2YA 2ISVA 4O28A 3LXBA 5CPOA 1FDYA 3DHFA 4XBKA 2O7SA 2RHGA 4XZ9A 3N14A 1W0MA 1RV8A 3KVMA 1SR9A 5J5RA 3DGRA 1K8XA 1KFEA 5F4WA 3O16A 3I7RA 2YPIA 4GUGA 4IMGA 3W07A 4PH6A 4JY8A 2C18A 3LERA 1XBXA 4FX6M 3CWOX 1TO3A 2JBMA 2V2DA 2TYSA 1W31A 3W74A 4QISA 5EBUA 2ZBTA 3S5YA 1SZGA 3LCXA 4L4MA 5BNKA 2DZSA 3FYPA 1SFJA 4NJKA 4O0ZA 5DCBA 1T0OA 2WNZA 3CEPA 4K37A 4AVFA 1W5NA 1S5WA 3W7NA 3NA8A 1ZAHA 3S5NA 4FX7A 4P2VA 3LRLA 2ZDRA 1QFEA 4X3ZA 1TJRA 4XBSA 3E12A 1EIXA 1RR2A 2C1HA 2YYTA 1TPUA 3TX9A 1T8XA 4UFIA 3TK7A 1VHNA 4ZL1A 3O63A 1I2PA 4AB4A 3NQAA 5C2XA 3F4WA 1P0NA 5C55A 1R30A 2RDWA 4ZQMA 3USBA 5IBXC 1AL8A 3QSTA 3C52A 4N9BA 3G3DA 4MIMA 4AH7A 4WXZA 4Z1AA 3N3MA 4CQAA 2YW4A 4DBDA 1TPB1 5FEZA 1EUNA 1SW3A 2X1TA 2ABAA 4NNBA 4JD4A 2ATMA 3LB0A 3TFCA 2R94A 1B4KA 1KLZA 2EGZA 4LVBA 1A5SA 4H4IA 4NXSA 4O8RA 5EPDA 2PCQA 2ZRVA 4MUZA 4Y6GA 5FF7A 4A2SA 1XUZA 5J5DA 4PA8A 1W5QA 1OFAA 4PCFA 3S5OA 2G5WA 4JYDA 2YFNA 5G2WA 4HNVA 4O52A 1NEYA 4GUFA 4U28A 3DU0A 2WOQA 3EXRA 3WJYA 4Z1DA 4WOQA 4ZQNA 5KTLA 4CNPA 3C0JA 1O94A 2Y7DA 1LTDA 5CG7A 3N2XA 3LXCA 1F76A 4DBEA 2FIQA 1EA0A 4BWLA 1JCNA 2I9EA 4PTNA 3EKLA 3KXQA 4FIQA 3W2UA 1W56A 3UNDA 4S2CA 3TSDA 2YCEA 4U4MA 3GAYA 2CZDA 1TRDA 1HFBA 4WY0F 5F4SA 3NL6A 4O1CA 3VFLA 3TIMA 3PB0A 3W2JA 2QCEA 2FPTA 3PWAA 1JCMP 2RFGA 1YXCA 3B03A 4ALDA 4HIBA 3E02A 2VEPA 1X8FA 1B57A 4O16A 3CTLA 4GC4A 2ZRYA 4JTEA 2E6DA 1EP2A 1TPEA 3A5FA 3P5YA 1C8VA 2PC4A 3DFNA 3BW2A 1HO1A 3GR8A 3M16A 3M41A 1LOLA 3UXDA 1GWJA 3OBKA 3V1PA 2GJNA 2WO5A 1R2TA 1W5MA 4D2JA 1TPWA 3NXFA 4OV9A 5HQEA 1GYLA 3L21A 1JUEA 4UXDA 3UWZA 3WJXA 2CLIA 3LX9A 5LHFA 1G4PA 3L65A 5HINA 2J6XA 1XBVA 4JR5A 3BGGA 3QW4B 4UIOA 2VFDA 1KV8A 3TV8A 4ORIA 1YTKA 5HWJA 2E6AA 3G1AA 1TB3A 4MY9A 2XFWA 1WOAA 4MYAA 1D3HA 3R5EA 2CLOA 3P74A 1B3OA 3QMTA 4UFJA 1GPWA 4GBUA 1OF6A 2NWSA 5K2ZA 2NXHA 4AHPA 5BRBA 4YCPA 3IIXA 2NWRA 5K9XA 5FEXA 2C14A 3HGSA 4NX5A 3LV6A 3ZFHA 2RDTA 4O12A 4A29A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5M1T A;  4LJ3 A;  2J7C A;  5C6M A;  3U7V A;  4LTS A;  1JZ6 A;  3BH4 A;  1IR2 A;  3NQ2 A;  4JEJ A;  4P61 A;  1KFK A;  1NF0 A;  2NX3 A;  2Q01 A;  1RAL A;  3W27 A;  1VKF A;  4DF1 A;  1WQ5 A;  1GVR A;  3L7R A;  1I0D A;  1W9D M;  1H7N A;  1FHL A;  2X1U A;  1ISZ A;  2DIK A;  1P5B A;  2FFC A;  5ECV A;  2BBF A;  3WLM A;  3AS0 A;  4W7W A;  1HQT A;  2BHZ A;  4QX4 A;  3ISI X;  4GJI A;  4ZO6 A;  3AIE A;  2QCD A;  3EWW A;  2H3D A;  4D8A A;  2YA1 A;  3NJ3 A;  1V6T A;  1XKY A;  1OEP A;  3BOL A;  5FL1 A;  2Z1B A;  3WK3 A;  3VM5 A;  1JZ2 A;  3P81 A;  2DZX A;  1BYC A;  3VI2 A;  2DZV A;  4KCV A;  4MAZ A;  4GXP A;  3FS2 A;  3TQV A;  3BLI A;  1XCX A;  4GQB A;  2G3I A;  2VEN A;  3VGB A;  3LK6 A;  4PUK A;  4Q4M A;  3VDB A;  1QJW A;  7TIM A;  1V3I A;  3APG A;  3W38 A;  3W02 A;  4HN4 A;  4Q6X A;  3OZP A;  3V75 A;  5LNR A;  4XTD A;  2XYL A;  3CV6 A;  4P8U A;  4RK8 A;  1E6N A;  2PWH A;  1N8W A;  3T0C A;  4EF9 A;  1QAS A;  2VJX A;  4JTL A;  4G7E B;  4JDB A;  3GTI A;  3HG2 A;  1TPF A;  3NQD A;  1R87 A;  2HBV A;  4ZZ9 A; 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