2A1YA

Crystal structure of guac-gmp complex from bacillus anthracis at 2.26 a resolution.
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
321
structure length
301
Chain Sequence
MGNVFDYEDIQLIPAKCIVNSRSECDTTVTLGKHKFKLPVVPANMQTIIDERIATYLAENNYFYIMHRFQPEKRISFIRDMQSRGLIASISVGVKEDEYEFVQQLAAEHLTPEYITIDIAHGHSNAVINMIQHIKKHLPESFVIAGNVGTPEAVRELENAGADATKVGIGPGKVCITKIKTGFGTGGWQLAALRWCAKAASKPIIADGGIRTNGDVAKSIRFGATMVMIGSLFAGHEESPGETIEKLYKEYFGSFVEHKGSLEDTLIEMEQDLQSSISYAGGTKLDSIRTVDYVVVKNSIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus anthracis
publication title Crystal structure of GuaC-GMP complex from Bacillus anthracis at 2.26 A resolution.
rcsb
molecule keywords GMP reductase
total genus 93
structure length 301
sequence length 321
ec nomenclature ec 1.7.1.7: GMP reductase.
pdb deposition date 2005-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2a1yA00
3GK0A 2NXGA 2J6XA 1PVNA 3KAOA 4QIUA 3VI2A 1VR6A 1SW3A 5HUPA 2GVGA 2X16A 1IXPA 2YSWA 3DI1A 4FHAA 3TAOA 2NX1A 1XBYA 1F2JA 4X9SA 5LNWA 2V5BA 3BW3A 1LROA 4XQ6A 3GDMA 3LRLA 3DFPA 2WSQA 2C13A 5EKYA 2VFIA 3O07A 1FWWA 3MHGA 3O6DA 1OYAA 1DHPA 3TFCA 2GOUA 3BW4A 4AB4A 4U4MA 4L4MA 1T8XA 1VGAA 3N3MA 4NJHA 1SU5A 5TQLA 3CWOX 1OVDA 3R8RA 2ZZ4A 2QUUA 5LHFA 4O57A 1H51A 2WKJA 1JR1A 4DBEA 1YXYA 3ABQA 3QC3A 5DY2A 1RD5A 2V0TA 2VFFA 2ZRXA 2J9ZA 3STFA 2WPBA 4IPJA 3LHZA 4GC4A 3UXDA 4FNRA 4FNQA 3W7JA 1GYNA 2CLHA 1W5PA 3CM4A 5G1YA 3NL3A 4RKAA 1WDWA 5TBOA 1X6UA 6ALDA 3P5YA 1M7PA 1TYGA 2PRHA 4QNEA 3G18A 1P1XA 1GEQA 3NNTA 2C16A 4UTHA 4RR4A 3LCHA 2E6FA 2GUUA 2RKXA 5D37A 2J27A 3NO5A 4JD4A 4Z1DA 3LRMA 3HPXA 5ABTA 4HT3A 3DHFA 4AHQA 1LOSA 1D9EA 5AHNA 1DKWA 3S1XA 2HS8A 3A24A 3PAJA 1I45A 3S1WA 2FDSA 4ICNA 3VE9A 2F84A 3THQA 3G0SA 1NFBA 4GFSA 3E96A 1SSGA 3W7MA 1VCFA 1TPB1 2WNNA 4JTGA 4DELA 1G4EA 4O19A 1AW2A 1TJPA 1I8JA 5K4ZA 2B7NA 4MJZA 1SO4A 4RCXA 3L0KA 3EWWA 2Y7GA 1P0NA 1LBFA 1W5QA 1Q6QA 2CWNA 4MFEA 4N4QA 2YX0A 2QJHA 2YDAA 4LVDA 3LERA 4OV9A 3M47A 1HG3A 1H61A 3LB0A 3KRUA 5CGQA 2A1YA 1FXQA 1W56A 2VOMA 4N4PA 3TIMA 4P2VA 2J9XA 4NJKA 3M5VA 3GDRA 4O1CA 3GYEA 3MI3A 4I7UA 1VLWA 3U2OA 1K02A 1FXPA 1EUAA 4WOZA 5E0KA 2IQTA 1B4EA 2TPSA 1KA9F 1SQ7A 3W88A 3W1XA 3KFTA 2ZRVA 1H1ZA 3UD6A 3C2EA 4RJEA 3NQ7A 1HTIA 2Y61A 3VE7A 3W76A 2VXNA 4JGDA 1S5TA 1WV2A 3EWXA 4DBDA 1EWEA 4UTWA 1QWGA 3TH6A 4YMZA 2TSYA 4K39A 4MZ1A 1OFPA 3SR7A 4UFIA 4PODA 3DENA 3FS2A 3N14A 3SGZA 4TU1A 4YL2A 3FA5A 3FJ6A 4QITA 3QFEA 1KBIA 3W1TA 2E1DA 5FF7A 3R12A 2B7OA 5AFDA 3I6RA 4MIMA 4ZZ9A 1JUBA 1QOQA 1TTJA 1OX6A 2X1RA 3WK1A 1ME7A 3W72A 4NJGA 4JICA 4IWWA 3EX4A 4UFJA 3A22A 3MI6A 2H6RA 3HB9A 3TSMA 3H54A 3IVTA 1Q45A 3W7GA 3STEA 3ABSA 3DKLA 3KX6A 1IXOA 4UTIA 2X1UA 5EYWA 4W9TA 4JX5A 3GLCA 2A2IA 1FCBA 4UNLA 3PBWA 5AHLA 1W3NA 3PF3A 4GUIA 1YLVA 3GXPA 2ZRZA 5DBUA 3UWVA 1A5BA 5FF4A 5G1TA 5CPLA 1H5YA 2C0AA 2W6RA 3MP4A 1G4SA 4YCOA 2X2GA 1V7YA 4C1KA 4XWUA 3QRHA 4LRTA 1TCDA 1FX6A 2ATSA 1Z42A 4QQ3A 2OMAA 1TPC1 3W2KA 4CCDA 3U8GA 1TPUA 1BEUA 2E6DA 3CIWA 3I7SA 3W7QA 4BF9A 3LXAA 5BW6A 3UY7A 2ZTKA 4MUZA 3HBLA 1XM3A 1RQHA 1MEHA 3HF3A 3NQFA 1G6CA 1OK6A 4N9DA 2V82A 3PS7A 4A2RA 1CW2A 2QJIA 5K2ZA 4XBKA 3TXZA 1OFOA 4K36A 2NLIA 4QJ1A 3R89A 1LLWA 3AO0A 1H7WA 3QW4B 4Y8FA 4TMCA 2UV8G 1NSJA 1OABA 6TIMA 4EWND 4PEKA 2YFNA 1M6JA 3P67A 2I9EA 3G3DA 1J2WA 3C2RA 1F76A 5D2TA 3HIJA 1SW7A 1EX5A 2C1HA 1EWDA 1YDVA 2DU2A 4LU0A 5F4WA 3NOEA 2J9YA 4OBTA 3BLEA 4NVTA 2AGKA 5G2IA 3G24A 3IGSA 3P82A 1WX0A 2B0MA 4G1KA 5L6UA 1HO4A 5I3IA 5F4SA 1U5JA 2GJLA 1X1OA 3M0ZA 2QCEA 4IMFA 1R47A 3NQMA 3W7HA 5H2ZA 4CCEA 4LTSA 3DFQA 3LXBA 3OEXA 3V1PA 3F4NA 1TB3A 1G4PA 2ATMA 1C29A 1SZFA 3LRKA 2CLEA 3M41A 2QDGA 4IMEA 4WOQA 1F6PA 5U4NA 4A2SA 1MO0A 3PG8A 2ZA2A 4JN6A 3CWNA 2NV1A 4QISA 3CU2A 4AWTA 4JYEA 5K4XA 1DOSA 1L2UA 3IIVA 1A5CA 4A21A 4Z0JA 2CZEA 1Q6RA 1EP1A 2P1FA 3F03K 1M7OA 2Y85A 3DBPA 3BG9A 2EGZA 5FESA 3GDKA 3B0UX 5J5DA 3GX9A 1W1ZA 3QJAA 5T26A 4UTMA 2H3BA 3P81A 1ME9A 5D2WA 1ZHAA 1QPQA 3UWUA 3MWAA 4S2CA 3NPXA 4IX2A 2QDHA 2YFOA 4FX8A 5E1QA 1TPFA 5TIMA 3EX3A 2XN1A 2QJGA 3UWZA 4O0KA 1GQNA 5E93A 3SSJA 3WK0A 3B8DA 4RZ6A 1DQWA 3IIZA 5FF3A 2VEIA 2QCDB 1F74A 3BV4A 3PUDA 1TSIA 2DZTA 1IF2A 3GKAA 4BR1A 4UMBA 4WX2A 5DY3A 3PWAA 1R2RA 4HSOA 4S2BA 1PIIA 3KRZA 3NEVA 3NZRA 3LHTA 4ZQNA 1LYXA 4JX6A 3IVSA 1ZFJA 3ZR4A 3L5LA 4FF7A 2VFDA 2FIQA 4UFLA 2FFCA 4ZQOA 2QCNA 1K3UA 4MVAA 3TV8A 3C56A 3GXNA 2B7QA 2FB2A 1ZNNA 3USBA 1DJQA 1OFDA 4GUJA 4O28A 1H60A 2A6NA 3W22A 4NQ1A 1A5SA 4K7VA 2QF7A 3G8RA 2P10A 3LM7A 1L6SA 3JS3A 2PRMA 5AC8A 3H53A 2G97A 3TK7A 4UIOA 1GTEA 5AHEA 2DJLA 3I7QA 1SR9A 3QSRA 1L6YA 3T7VA 3NQCA 3BLIA 4E0CA 1WAUA 4O18A 4LS1A 3W1PA 3TDFA 3UXAA 1TTQA 3PBUA 4K6AA 1W37A 3W7IA 3LLDA 4E38A 1TJRA 3P5ZA 4IXXA 2DZUA 1RV8A 1R30A 1XBXA 2X1SA 3GXTA 4R53A 4AHPA 3GZ3A 2WOQA 3BLFA 2QCCA 3IVUA 5D03A 3LTYA 2Z0IA 3O05A 5LNSA 1GT8A 1FCQA 3MHFA 2C6QA 4M5PA 4QSHA 2VFGA 4OV4A 4H6KA 3I7RA 1KM2A 1YDOA 4PA8A 2JKEA 2VEPA 3SY5A 3TXVA 7TIMA 5I3JA 3UPWA 4MLJA 1IXQA 1QNVA 2C3ZA 3SFKA 4PL2A 2E6AA 3DI0A 5I3GA 1UUMA 1CI1A 2OJPA 4DEFA 1K8ZA 3B0VC 1OFEA 3PM6A 4UTUA 5BOOA 1VLIA 5AHIA 3M5XA 3RLUA 4DF2A 3H55A 2V30A 4NUWA 3NQDA 4CNPA 1ZAIA 4O4WA 4Y6GA 4AHOA 2FJKA 3T40A 4O0ZA 4FNPA 3L65A 3TQVA 4Q4KA 3HOJA 4UC5A 3KVKA 3LLFA 5HWMA 1TPVA 2Z1BA 4P61A 1DQXA 1OFRA 2V2DA 1H1YA 3DGRA 3KVMA 3TNOA 1XBVA 3TU9A 3NL5A 3O6YX 2XN0A 4K7YA 3SECA 3QMTA 3LX9A 1UASA 4UR8A 1O4UA 4LRSA 4O17A 4JY9A 3S0CA 3N9RA 1W5MA 2I14A 1I2QA 4Y90A 4YCPA 3FLUA 3P62A 4UMAA 3W7KA 5F4XA 4K38A 3VKJA 4LS2A 5DLCA 1TO3A 1W8SA 3C2FA 3L9CA 5AHMA 4JS3A 1A53A 1L9WA 1I2RA 5LHEA 1NF7A 3SI9A 3OG3A 3HGOA 2WQPA 3A5VA 4RXGA 1TV8A 4BK9A 3BG5A 2J88A 1SO5A 1QO5A 3NL6A 4POCA 5D38A 2DZWA 4ORMA 1QFEA 3HQ1A 1TV5A 4PL1A 4S1FA 3DKJA 2PCQA 1FQ0A 4N9CA 2CLKA 1WBHA 1FY6A 1FBAA 2E5CA 1DVJA 4U28A 4WXYA 1ZENA 1XXXA 3G8EA 4ZQCA 3NQ8A 5EPDA 1WQ5A 4MZ8A 4ADSA 1QDSA 1K03A 1KM1A 4HHPA 2A7NA 3WJYA 3MJYA 5IBXC 1KTNA 2H8ZA 4IXHA 3YPIA 2DJXA 4B5NA 4PFMA 3RMJA 3PB0A 3C3NA 3MBFA 2ZCGA 2OZ0A 2V81A 5D05A 2YXGA 4R34A 3W85A 4MZYA 3UWWA 3V75A 3A5FA 1OFBA 3NL2A 4UTLA 3ABOA 1G4TA 2PE4A 4LOCA 3LI0A 4ONVA 4ZVJA 1G69A 2NX3A 1KFBA 4GUFA 4AVFA 4LC8A 3LDVA 4YLWA 1XKYA 2NUXA 1JJKA 3UZJA 2Z6JA 4JTEA 4BI6A 3L67A 4LVAA 4O15A 5BNKA 2ZZ7A 3NPUA 3QSTA 4I9AA 3EKZA 2NWRA 3W3OA 3C61A 3WJSA 4LV4A 4N6FA 4AWSA 1YYAA 2R14A 3M1ZA 2Q3OA 2QAPA 4LNYA 2FLIA 4CCCA 3S8HA 3Q2DA 5D2VA 5BRBA 4Z1AA 1GTHA 2BWGA 1HL2A 3RFAA 2JKAA 3CPRA 2E77A 3K30A 4LVBA 3CEPA 3TJLA 1GVOA 5CSSA 3CT7A 5F2IA 1OG0A 3RK8A 1M5WA 4WY0A 5D30A 5DXYA 1JCYA 4K37A 4MY1A 5F2LA 4JTIA 1H7XA 1KFJA 1RR2A 2CLOA 5CSRA 2D73A 3LBCA 3EXRA 1LTDA 1A5AA 1AMKA 1LORA 1VCVA 4JY8A 2PRLA 1DL3A 1I2PA 5AN7A 1XI3A 3BGJA 2GJNA 5K9XA 3WJXA 1VS1A 1TTIA 4CNOA 3L5MA 1ONRA 1Z41A 1PCWA 3DFNA 3GDLA 4M6QA 2FPTA 4HNNA 4KWWA 3P61A 4RK8A 2H8XA 2Y63A 1JCLA 1SUXA 1ML1A 2HS6A 2YYUA 1KTBA 2HTMA 3C2OA 2GQ9A 5F2GA 1EUNA 2VELA 3HG4A 4JR5A 4XBSA 3EX2A 3N9SA 3EWZA 3D0CA 1S3HA 5D32A 3L0NA 3THAA 4NJJA 5BMWA 2WNQA 1B3OA 4JXCA 5U7SA 4JIQA 2WO5A 2WSYA 5EMUA 2BXVA 5D2XA 3F4WA 2H90A 3QPZA 3PY2A 3O6CA 4LY8A 1T96A 3PBYA 3PBVA 4JDBA 1EP3A 1LP6A 2EPHA 4NXKA 5EBUA 1U83A 1RPXA 3W2JA 3G22A 3N19B 3T55A 3W70A 4UTTC 4A29A 3TQKA 3S5OA 4BI7A 3EWUA 2WSRA 2XN2A 3NM1A 1JQVA 1W31A 4TR9A 4GE8A 1IGSA 3NPWA 2FQIA 3AJXA 3M7WA 5CZJA 2VC6A 4E2BA 2QCFA 1R2TA 3FYPA 3ATZA 2ZRYA 1VH7A 1K7EA 3WJZA 1K8XA 4CLMA 3W7DA 3KOFA 1TRIA 5FI8A 2QUVA 4KKXA 4LWWA 2FTPA 4AF0A 3CIXA 3TX9A 1NVMA 2CZDA 4HPXA 3W7NA 4DO4A 5CZTA 2HMCA 2JBMA 4PC8A 2A85A 2DZXA 2GVJA 3MP3A 1H7NA 4NZFA 1EEPA 3OVQA 1KV5A 4OWGA 1C8VA 3RNDA 2QUTA 3TC6A 1ME8A 3S5YA 1LOLA 1GVSA 3TSDA 3TMQA 3L5AA 2CLIA 3HGJA 2F7FA 1W3IA 3M16A 3PUEA 3HPSA 1W54A 1YTEA 3NQVA 1KM4A 1TPH1 2Y88A 3G0XA 3PSVA 2CLMA 4OU1A 4ORIA 1C9DA 4JTFA 3OHIA 4JYDA 3C6CA 4IMGA 1W5OA 4D2JA 4DF1A 4IPIA 1H50A 3STGA 4JTSA 5G4WA 4WJEA 3W87A 4UR7A 3PR2A 1O5XA 1TTPA 3PG9A 2NUYA 1H62A 3VFLA 2C18A 3DH7A 3FYOA 2RDUA 3M5ZA 5HWNA 4XTIA 1X8FA 2ZRUA 1I4NA 3FJLA 3TUUA 1MEIA 3LCGA 2CZFA 4NZJA 3QW3A 2ZBTA 5LKYA 3M43A 1TPEA 1JRCA 4UFKA 3MYPA 4H3DA 5FEPA 4Y96A 2X1TA 3W74A 2E5DA 4IX0A 1VC4A 1OFAA 2TMDA 5EY5A 3W1AA 1VPXA 1ICSA 3NR0A 5DBTA 4ZQMA 1O94A 5K3VA 3LV5A 4Z08A 4CQAA 4O16A 3T44A 3O15A 4ADTA 3EKLA 5FEZA 1OX4A 3FKKA 2OT0A 2BSLA 3NQ2A 3B04A 1WA3A 1YPIA 3EXTA 4LT9A 2QAFA 3TJXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3W1M A;  1OX4 B;  5HMS A;  4UMC A;  4AEO A;  5HR7 A;  2Q8Z A;  5F1U A;  1K7F A;  5IM5 1;  1TMH A;  3LCX A;  4ZQR A;  1XBZ A;  4LVF A;  2OT1 A;  4ADU A;  1E51 A;  1BTM A;  1LRT A;  3QEZ A;  3TSB A;  1PL9 A;  4FO4 A;  5G2W A;  2R91 A;  3B4U A;  3UYC A;  1NAL 1;  1KM3 A;  4GXM A;  1W5N A;  5J5R A;  1TRD A;  3Q37 A;  4IJB A;  3GVG A;  2ZTJ A;  2Z6I A;  1LOQ A;  2YZR A;  5KZD A;  5BMX A;  4XUG A;  3GR8 A;  3LTS A;  2CZ5 A;  4FIQ A;  4NU7 A;  3P60 A;  4RV8 A;  1CX9 A;  3CHV A;  3ZWT A;  3WK2 A;  4BWL A;  2ABA A;  1H7P A;  5D09 A;  3W2L A;  3TE9 A;  3NA8 A;  3A23 A;  1PHW A;  1QO2 A;  3LHV A;  4FX6 M;  4CNN A;  2Y62 A;  2C15 A;  3PUL A;  4JIP A;  3W7R A;  5K7J A;  5H91 A;  2A0N A;  4JNM A;  4O8R A;  4UUI A;  4N9B A;  5HIN A;  2NX9 A;  3TFX A;  4IGH A;  3W7E A;  1JCJ A;  2ISS A;  2ZFA A;  4DO6 A;  3DZ1 A;  1FWS A;  4DXV A;  3G0U A;  4EVZ A;  1FCU A;  4IQL A;  2NXH A;  1PS9 A;  4O4V A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VD9 A;  3KWX A;  5EGR A;  3WH6 A;  2P3E A;  4PUM A;  3MVI A;  4R9X A;  2PTW A;  5LXX A;  1VR6 A;  1SW3 A;  5HUP A;  3DI1 A;  4GVG A;  1IEX A;  3KHD A;  4GIR A;  2J8G A;  3ZIZ A;  1V7A A;  1R9X A;  2PC8 A;  4YTT A;  3BAX A;  1BSL A;  1JL8 A;  1H1N A;  4IZG A;  1MXD A;  3GDM A;  3DFP A;  2FZ9 A;  2GSJ A;  4JHM A;  5EKY A;  5CAH A;  2YIH A;  4E2V A;  3VOH A;  3TFC A;  2HVN A;  4L4M A;  1T8X A;  1VGA A;  4KS0 A;  4Q4M A;  4DRS A;  4W85 A;  3UWE A;  3CWO X;  1PTA A;  2Z28 A;  5LHF A;  4DBE A;  3GC4 A;  1YXY A;  4QLJ A;  4BF5 A;  3STF A;  2J9Z A;  3WQO A;  3VNY A;  1GYN A;  1W5P A;  1QK0 A;  2WCA A;  3NL3 A;  3E3H A;  1I0B A;  1WDW A;  4LBR A;  3P5Y A;  4PCT A;  1RLC L;  2OZT A;  2E8Z A;  4DWS A;  3WQ4 A;  4DB7 A;  1Q6D A;  2C16 A;  2ZX7 A;  3UR8 A;  4TX6 A;  1R0M A;  2ODO A;  3OTR A;  5BWF A;  4MKS A;  3KE0 A;  3FY1 A;  4JPG A;  5BXP A;  4D8A A;  4CU7 A;  1XH1 A;  2CZV A;  3S1X A;  1BQG A;  5D9M A;  2HS8 A;  4PRW A;  3PAJ A;  4NAE A;  4L9Y A;  4QBX A;  3G0S A;  3KCJ A;  3CL7 A;  3ALG A;  3CLW A; 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