2A3HA

Cellobiose complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradherans at 2.0 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Bacillus agaradherans family 5 endoglucanase at 1.6 A and its cellobiose complex at 2.0 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE
molecule tags Endoglucanase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 117
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1998-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2a3hA00
3VNYA 1YHTA 1F4AA 5I79A 2J7DA 4WKAA 3VGHA 3WSUA 4F9JA 1PIFA 1MW0A 4J3UA 1VIWA 5BXSA 1FH8A 3BLPX 3BAXA 1E6NA 4DWSA 1KR0A 2GK1B 3NIYA 4UCFA 1KGXA 5KEZA 2WHKA 2ZUVA 2D22A 3T2OA 2FDMA 1JYVA 4MAVA 1GVYA 1HJUA 3MANA 1Y7VA 2CERA 3GXMA 1E72M 4D6CA 2W63A 3IANA 2WB5A 3LPPA 4MNLA 4U33A 3AI0A 3FAXA 1KXVA 4W7VA 2YA0A 1OWQA 3CUJA 2WBGA 2VVNA 3ZT7A 3L4ZA 2ZXBA 5A6BD 1SFSA 3PTQA 4BCEA 1E6XM 3OG2A 4GXPA 1SR0A 1UR8A 4UFJA 1BGAA 1E55A 1HL9A 1VENA 3BSHA 1TVPA 4D6HA 2YOCA 1E6ZA 4C7DA 3WIJA 2YLLA 3CPUA 3AS1A 1QW8A 1B3YA 1WZLA 4TTGA 4C7FA 4NRRA 4XUYA 2FH6A 3UERA 8CGTA 1H49A 3DYMA 1E6SM 5HXMA 1E6QM 1PBGA 3PZTA 3WMBA 4J3VA 1XHGA 1H0IA 2YLAA 2VOTA 2FH8A 4M56A 4HMEA 4W93A 3EBVA 3SCRA 4BS0A 2YDQA 4JKMA 1JDAA 3CZKA 4B9YA 4ZEPA 1QW9A 4KGLA 2NW0A 5E09A 2JFEX 1MYRA 3EDEA 3I3DA 1CEOA 5IHSA 2CPUA 1QNQA 1OD8A 2VX6A 2WMIA 1ITCA 5LYRA 4ACZA 3WD2A 5A2CA 4PUDA 2Z1SA 3GBEA 1TG7A 1V6XA 1PZ3A 1PX4A 1UKPA 2QV4A 3KWXA 4UQAA 3ZQ9A 1GORA 3VIJA 1CXHA 2PWFA 3VMNA 4KGJA 1MXDA 3ZOAA 4WIWA 4N0RA 3VM7A 1OB0A 1R87A 2V38A 3CUGA 2JF6A 3GNOA 3BAYA 4PSRA 2VZOA 5D8ZA 5CJ5A 2JEQA 1HX0A 4CD7A 1DWIM 2CEQA 3KL5A 2Y5EA 4P8WA 4PTMA 2VT0A 5I78A 2VZUA 5C70A 1D7FA 3W6MA 2DGAA 2C7FA 3WBEA 4UFHA 4WLCA 1W91A 1PJ9A 3BSGA 1M03A 1V3JA 1LJYA 2DIJA 3W38A 3T0BA 3CMGA 1AVAA 3ARUA 5JIWA 4B15A 4AZHA 2Y4SA 1EA9C 1PPIA 3LPOA 1JNEA 5IFPA 1VRXA 3AIBA 1TR1A 2YDSA 4URIA 1V3IA 1PX8A 1ISXA 2PWHA 4MB4A 5GPRA 1Q6CA 2XIBA 1KXTA 5EB8A 4KRUA 4LPCA 3BAIA 1GNXA 5JBEA 1EGZA 4M80A 1KXHA 1W9UA 1OT2A 1W3LA 2WAGA 4JHZA 4P8XA 1MVYA 3WQWA 2B31A 2WC3A 1KB3A 2WKLA 2WHJA 2O9OA 5FCZA 3VDBA 3WDQA 3WDPP 4S3JA 1ZBKA 4ZENA 3B9EA 4GI8A 3NSXA 3WQ8A 3A4XA 2DSUA 1XSIA 3DYOA 3L4XA 1V02A 4U31A 5HDRA 2Q8XA 2O9RA 1XSKA 4RL3A 3MU7A 1GCYA 3TTQA 5A94A 5E0CA 4D71A 1UUQA 3THDA 1UWSA 5DFAA 4AIUA 1XRVA 2GK1A 1CBGA 2VMFA 5DT5A 3VINA 4GO9A 2VL4A 4BF7A 5HOSA 1EDGA 1GZJA 3L4TA 1E6RA 3WEOA 3NDYA 1V3MA 5F7UA 4V28A 3WN6A 4CCCA 2J47A 3N15A 4FMVA 3IAPA 1C7SA 1FHDA 2YIHA 3EMCA 2E9LA 5FIPA 1HVQA 5BRQA 2WKGA 4B16A 4AZBA 3W53A 4AC1X 1Q4NX 3KZSA 4GO8A 3SUTA 3QOMA 3LPFA 1V03A 1UZ1A 2CBIA 4D6GA 1JF5A 2XGIA 1E70M 4W84A 1V3HA 3CHDA 4JHOA 4LYRA 1P6WA 1N82A 4JAWA 4ZFMA 4KRTA 1EH9A 3GH5A 4UZSA 1KGWA 1YQ2A 4DWSD 1E1FA 1GQLA 4PTVA 3DC0A 2A3HA 3DHPA 3OLGA 5M3WA 2BFGA 4AEFA 3NSMA 1BLIA 9CGTA 4AD4A 1V0MA 1GVIA 1FH9A 4R5EA 1ZBWA 2WMGA 4ATWA 3PTMA 3N11A 4MNJA 2V5CA 1JG9A 5A6MA 3KL0A 4M29A 1HJSA 1MW3A 4MAZA 1J0JA 3BCDA 2WVUA 4CCEA 4W5ZA 1EOKA 1OGBA 1JAKA 3WQVA 1IZJA 4AYSA 1H4PA 2D0GA 1WE5A 2J78A 4LGXA 2WPGA 1UD3A 3DHUA 4U3AA 1NQ6A 2WCAA 5FOOA 3D3AA 7TAAA 1W1VA 4U5IA 1U30A 3W0KA 1HVXA 1XYZA 1NOWA 3BH4A 3IJ7A 2XVNA 2BVYA 2E4TA 1B1YA 3VU2A 2PC8A 3GXDA 2EO7A 4W88A 2DH3A 1LL4A 3MMDA 2IUZA 1J10A 1BFNA 2D0FA 3SURA 2W66A 4MB3A 1W9XA 3VIOA 3N17A 2O9TA 1V0NA 1B9ZA 3T0DA 5JIPA 3WF4A 4B3LA 4MNKA 2XUCA 1E0VA 1NARA 3PTKA 5I0DA 1GHRA 1BSIA 1CLXA 1OBAA 2MANA 4V27A 1M7XA 5E6YA 4KWUA 2QMJA 4H41A 2ZXDA 1K9FA 4D6IA 2J4GA 5C8BB 1XCXA 4D72A 3CHCA 4EK7A 4U2ZA 5CXPA 1SMDA 2NT0A 1R8LA 2QMKA 1E5JA 2OWWA 1JZ5A 5C71A 2G41A 3MMWA 3S2CA 4M8UA 3VOCA 4JFVA 1E0XA 4LXFA 3L4VA 1JXKA 3CLWA 2ZUTA 1V6UA 1VEPA 2FGZA 1E9LA 4UZUA 4FLQA 4H8HA 3T09A 1UOKA 4W86A 2CKRA 2PWGA 3VD3A 2C8NA 2BY2A 3K4DA 1E4MM 4EAMA 1I1WA 3UETA 4GIAA 4P7QA 4RE3A 3WDJA 3OZPA 3WELA 2BHYA 5TD4A 1RP8A 1VFFA 1DEDA 3AIVA 4NI3A 3I3BA 3WL0A 2GFTA 3ALFA 3AZRA 4J3XA 1XYFA 3M07A 1CGWA 4ZXLA 1US2A 1JYXA 2WNWA 4YN5A 1ZL1A 3OLIA 1NH6A 4OKDA 4E4PA 4AD2A 5D8WA 5CGTA 1VFOA 3MSDA 1FH7A 1CGTA 5CPTA 1CYGA 4D6EA 1I75A 4U5KA 2VURA 4J3WA 3VTRA 3WH9A 4ATLA 5A8PA 2X09A 1V08A 3G6LA 2BV9A 4OOUA 4JFTA 5IXEA 5I2UA 1BGGA 4TOQA 3J7HA 1CGXA 1MQQA 5EMYA 4TVUA 4F9DA 2ZX8A 2BVTA 1HP5A 4WSJA 3WFLA 5AC5A 1VJZA 2VX5A 3WD4A 1VFMA 2GSJA 1JXJA 4AW7A 1W1YA 3W37A 2BS9A 4D1IA 1TA3B 4CD6A 4M82A 1CTNA 4QP0A 2WCSA 3AMKA 1V0LA 5AYBA 1W2PA 2DT1A 1E4IA 3BC9A 3VIKA 1H09A 4J3SA 3GNPA 1HKIA 3O9NA 1XH0A 3WDIA 3AIEA 4CGTA 1MWOA 3BAKA 1WB0A 2X0YA 2ZWZA 4IISA 3W6LA 1H41A 2WHLA 2CHNA 2XGBA 2WZIA 2G3IA 3MV01 3TOPA 2Y8KA 4XV0A 3PZIA 4GKLA 3N04A 1WPCA 4CN4A 1C8QA 1K9DA 1J18A 2J7GA 5D9OA 1GOQA 1EIBA 3VDAA 2RGMA 1E43A 4MDOA 5CPSA 1QVBA 1KXQA 1GONA 3SIMA 2WWCA 3F5JA 1UR1A 3GXFA 3PZUA 2PB1A 2J7EA 3RCNA 2YBUA 1B3WA 3T0AA 4HOXA 1EHAA 2GJRA 1VJSA 2O9PA 2BY3A 1E1EA 4GZIA 4KH2A 4AXNA 3VGGA 4WK9A 3BAJA 3WMCA 2VCCA 3AS0A 3AHXA 2WHMA 1JAEA 5A6KA 1MFUA 5FKYA 2BVDA 1CGUA 3AHVA 3CUFA 4OOZA 5BWFA 4XZBA 4L4PA 3BMVA 4MADA 3T08A 1W3JA 2VQUA 3OZOA 3ZSSA 4GQRA 1UH3A 4ML4A 1E56A 1NOFA 3NCOA 2A3AA 1MQPA 2WC7A 1OD0A 2EBNA 2V5DA 2AAAA 4MJ2A 5FL0A 1GOIA 1ZJBA 2J75A 4PN2A 2WVTA 4TX6A 3VD4A 2DPEA 2E40A 1H5VA 4JCLA 3SUWA 3CTTA 4EANA 4AZGA 3GH4A 1CXKA 3W82A 2YL8A 1QBBA 4TVDA 2CCRA 4S3KA 3VIHA 1B0IA 3WQ6A 4XZWA 5FD0A 1PX3A 2EPNA 2WC4A 4UQBA 4JFWA 1V6WA 4A3HA 1Q6EA 3K4AA 3WL1A 1G5AA 3WF1A 2J77A 5DMYA 4W8BA 2XJ7A 3L2MA 4C7GA 3SCUA 4P7RA 1E3ZA 5ABHA 4X9YA 1B2YA 3U7VA 1KBBA 2G8ZA 2FHFA 4BQ5A 4E2OA 4P7NA 1KGUA 3AHYA 5DT7A 4PMDA 1LWJA 2D23A 3ARQA 2BY1A 2GJPA 2PBGA 2VI0A 2CETA 1LLOA 4QDMA 1HJQA 3ARWA 3II1A 2DH2A 4PCSA 4B9ZA 1KWKA 1BYAA 5A1AA 4PMYA 1VEOA 4AD1A 3AS3A 4PMZA 1LWHA 1UD2A 5A3HA 2YA1A 2UWFA 3DECA 1VBRA 2WW5A 2OWCA 3T2QA 3CZGA 1OM0A 2X0HA 2ZUSA 3VILA 3VX1A 2OYLA 4GZEA 4PMOA 4X0VA 4CUCA 4LYQA 1W32A 3WH6A 4AZ6A 3JUGA 2EPKX 3WNLA 4AISA 1ISVA 3W81A 1JFHA 1QI0A 1J0HA 2G3MA 3WQ5A 1CXEA 3WDRA 4CU6A 4UOQA 4WSKA 1TA3A 3IJ8A 1M01A 1JZ7A 2A3EA 1JD9A 5A8NA 3N9KA 4E8CA 4TX8A 1ODUA 2C0HA 1HIZA 1O6IA 1HF6A 2PWDA 1VF8A 3VX0A 3K8KA 4WKFA 5BXTA 5E6ZA 2WZEA 1J0ZA 1GQKA 4V2XA 5M03A 5HPCA 4PMQA 1VEMA 1BVZA 1UKQA 5CLWA 5A6SA 4MJ4A 2YL5A 1LG1A 1IT0A 1F4HA 1VFUA 1ECEA 1UH4A 3AROA 4JKLA 5JBFA 2OYKA 1LF1A 1DP0A 2Y8VA 3UG4A 1QI3A 1R85A 4PTXA 1XV8A 4M24A 1V3LA 4JFUA 2OSXA 1UHVA 2BHZA 3AISA 1TE1A 1L8NA 3OGSA 4QCFA 2VRKA 4HPHA 4BA0A 3WH5A 1VAHA 5LA1A 1TVNA 1GJUA 2J79A 2JE8A 1FP9A 4Z2KA 4J28A 3VKKA 1EO5A 2WZHA 3CZJA 2BXYA 4TTUA 1HNYA 5D9PA 1W9PA 2WSPA 3PZQA 3VIIA 2E3ZA 5A6AA 3M46A 1W3KA 1ZBCA 2VO5A 3NYDA 5BXRA 1CZ1A 3VMPA 1H1NA 2TAAA 1GJWA 3ARVA 3L2LA 1XSJA 3A4WA 4UOJA 1HKKA 1WP6A 1HJXA 2ZE0A 5A6LA 4OBRA 1BQCA 3CGTA 2VC9A 3PHAA 4Z2HA 3TP4A 3VGEA 2WANA 2J62A 3EDKA 5ABGA 1UR4A 4XX6A 3AJ7A 2JIWA 3ZJ8A 2XVPA 1V02E 1KCKA 2WBKA 2EEXA 4CN6A 4NRSA 1BAGA 1GPFA 1UD6A 3RPMA 1H3GA 3VD7A 1ISYA 2PI6A 5HBFA 3U7BA 1B30A 4MNMA 3WD1A 2AOSA 1LL7A 1Z32X 4TUFA 3SUSA 2VZTA 1GOMA 4CD8A 2EPOA 4AZ5A 2WLZA 4B3KA 1ISZA 3DYPA 3WMSA 4P7OA 1BTCA 1XD0A 2DSWA 1B3ZA 2VR5A 4JKKA 1RPKA 2XWDA 1RP9A 2FHBA 3AMGA 3AMCA 4OIFA 3RDKA 3BAWA 3PN8A 4HOWA 3VUPA 2J7CA 3OBAA 3SCOA 5I5RA 3HJEA 2CESA 2IXVA 3W25A 1FHLA 3KE0A 1Q6FA 3PZVA 4ZXOA 2RGLA 1JZ6A 1QNOA 3FNDA 4AIEA 4FLOA 4RE4A 3SUUA 1JGIA 1WZMA 1E5NA 1G9HA 3GTNA 1MW2A 2YDRA 1TZ7A 5EFDA 2XM2A 4JIEA 5LA0A 3QGVA 1EQCA 1UYQA 1GOOA 4GQQA 1BG9A 3CHFA 2WMHA 3ECQA 2WWDA 4QCEA 3ARTA 3NUKA 4QLJA 5CZKA 2YL9A 3AYSA 2XYLA 1JYNA 3UCQA 3WQ4A 1WDPA 1CNVA 3PZGA 1TMQA 2BY0A 4OBSA 5A2AA 3OGVA 3ZJ6A 4AZCA 1XC6A 4TXEA 1GOKA 2DEPA 3FW6A 4HPGA 3CUHA 4AIOA 3RM9A 3W26A 2QHAA 3VO0A 3WEZA 5GNXA 5I3DA 2XWEA 1R7AA 3VIMA 1WDQA 3VPLA 1JZ4A 1JF6A 4IPLA 5AC4A 2YJQA 3UR7A 1UD5A 1BF2A 1NM9A 4JCMA 1CXLA 1EO7A 4AZIA 3N13A 2EJ1A 1FFQA 4UFIA 1E0WA 3RJXA 1EDTA 4CD4A 3LMYA 1ZU8A 3T2PA 1AQ0A 1X1NA 3AQUA 4JZ5A 3PZNA 4IPNB 5AY7A 4HU8A 1JIBA 3EDFA 4ACYA 1R86A 2PBOA 3AXHA 4UQEA 4W5UA 1UKSA 3APGA 1PZ2A 2CBJA 2W92A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VNY A;  1YHT A;  1F4A A;  5I79 A;  2J7D A;  4WKA A;  3VGH A;  3WSU A;  4F9J A;  1PIF A;  1MW0 A;  4J3U A;  1VIW A;  5BXS A;  1FH8 A;  3BLP X;  3BAX A;  1E6N A;  4DWS A;  1KR0 A;  2GK1 B;  3NIY A;  4UCF A;  1KGX A;  5KEZ A;  2WHK A;  2ZUV A;  2D22 A;  3T2O A;  2FDM A;  1JYV A;  4MAV A;  1GVY A;  1HJU A;  3MAN A;  1Y7V A;  2CER A;  3GXM A;  1E72 M;  4D6C A;  2W63 A;  3IAN A;  2WB5 A;  3LPP A;  4MNL A;  4U33 A;  3AI0 A;  3FAX A;  1KXV A;  4W7V A;  2YA0 A;  1OWQ A;  3CUJ A;  2WBG A;  2VVN A;  3ZT7 A;  3L4Z A;  2ZXB A;  5A6B D;  1SFS A;  3PTQ A;  4BCE A;  1E6X M;  3OG2 A;  4GXP A;  1SR0 A;  1UR8 A;  4UFJ A;  1BGA A;  1E55 A;  1HL9 A;  1VEN A;  3BSH A;  1TVP A;  4D6H A;  2YOC A;  1E6Z A;  4C7D A;  3WIJ A;  2YLL A;  3CPU A;  3AS1 A;  1QW8 A;  1B3Y A;  1WZL A;  4TTG A;  4C7F A;  4NRR A;  4XUY A;  2FH6 A;  3UER A;  8CGT A;  1H49 A;  3DYM A;  1E6S M;  5HXM A;  1E6Q M;  1PBG A;  3PZT A;  3WMB A;  4J3V A;  1XHG A;  1H0I A;  2YLA A;  2VOT A;  2FH8 A;  4M56 A;  4HME A;  4W93 A;  3EBV A;  3SCR A;  4BS0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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