2A7NA

Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)-mandelate dehydrogenase
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
NLFNVEDYRKLAQKRLPKMVYDYLEGGAEDEYGVKHNRDVFQQWRFKPKRLVDVSRRSLQAEVLGKRQSMPLLIGPTALNGALWPKGDLALARAATKAGIPFVLSTASNMSIEDLARQCDGDLWFQLYVIHREIAQGMVLKALHTGYTTLVLTTDVAVNGYRERDLHNRFKIPPFLTLKNFEGIDLGKMDKANLEMQAALMSRQMDASFNWEALRWLRDLWPHKLLVKGLLSAEDADRCIAEGADGVILSNHGGRQLDCAISPMEVLAQSVAKTGKPVLIDSGFRRGSDIVKALALGAEAVLLGRATLYGLAARGETGVDEVLTLLKADIDRTLAQIGCPDITSLSPDYLQNE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of the G81A mutant form of the active chimera of (S)-mandelate dehydrogenase and its complex with two of its substrates
pubmed doi rcsb
molecule keywords L(+)-mandelate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
total genus 125
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date 2005-07-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2a7nA00
2QCCA 3NQ8A 2ZDRA 3GAYA 4FNTA 4WX2A 4UTMA 2E5BA 4MY8A 4NXKA 2AQWA 3V1PA 4NNAA 5GVJA 5K9DA 5FF3A 1H61A 5DBTA 3W7PA 2DORA 1EEPA 3LHUA 2W79A 4RV8A 2XFWA 4LU0A 3OEXA 1UUOA 3MI6A 1QMLA 2ISWA 3LCWA 5F4SA 4BWLA 3Q37A 1ICSA 4LW7A 1YXDA 3TW7A 1QR7A 2C3ZA 2J6XA 3A9IA 4XTDA 3M0ZA 2Y70A 3THQA 1TPEA 3W2KA 2GVJA 3LV5A 5CPNA 2ZZ5A 3ANYA 1IXOA 1H1ZA 2E68A 2FDSA 5HNRA 3Q94A 1W3TA 5HUPA 3W7HA 2QR6A 4JTSA 5IBXA 1I2RA 3P81A 3P7YA 1VLIA 3NG3A 5H91A 1LOQA 1FCQA 1C8VA 4OQVA 1B4EA 3M41A 3QPZA 4O10A 4MY1A 1T0OA 5LHEA 2WO5A 1ZHAA 3N34A 1OHLA 4UUIA 3E02A 4M6QA 4YLWA 3LBCA 2QCGA 4CNNA 4K7YA 1TJRA 1DKWA 1YXYA 1BWLA 4NJKA 3PUEA 3RLVA 1EB3A 5KZEA 1W5OA 4HNNA 2VFFA 1KW1A 3SGUA 3LHWA 3TE9A 1FCUA 1OF6A 4LVGA 1GT8A 4RZ4A 4YWIA 1PHWA 1XKYA 4WOZA 1OFRA 3PUOA 5CKSA 2QCFA 5C6MA 2YPIA 1GPWA 1I2NA 1C29A 4PFMA 2QAPA 5D09A 4CNPA 1U83A 3WJWA 5AN7A 3FFSA 2YW4A 2ZZ7A 1FDYA 3LCXA 3PM6A 3HOJA 3KOFA 4AHOA 2FB2A 1WQ5A 1J4EA 4YCPA 1KLZA 4EWND 1OFBA 1SQ7A 4AF0A 1F76A 3OVPA 4E0CA 3G18A 3C4UA 4EF8A 4YXGA 1XDMA 4Y96A 4CQAA 5D2XA 4H3DA 3TROA 4Z0JA 2EAWA 2PE4A 4MY9A 2DZSA 3W7IA 3SGZA 1OJXA 1A50A 1PS9A 1YLVA 5LKYA 3CTLA 2VXNA 4UR8A 2B7QA 4WY0F 3L0NA 4MVAA 1PE1A 4UTUA 2O7SA 4HNUA 1O95A 5D38A 1EP1A 3TSMA 1VYRA 3STFA 3MHGA 5A5WA 1QPRA 3G1AA 4KWWA 3W2NA 3BO9A 1XBXA 1E51A 3G3DA 3M44A 5LNVA 3SI9A 2A1YA 1TCDA 2NUXA 3G1FA 1X8FA 2IQTA 2Q3OA 1YXCA 2P1FA 4M7TA 4NX0A 3C2RA 4QNEA 1YTDA 1ZAIA 3JR2A 3FS2A 4K6AA 3W71A 4A2SA 3W75A 2J27A 3GLCA 2WNZA 3W1LA 2O7QA 3PAJA 3C61A 1JCYA 2P10A 4N4QA 4A21A 4RZ6A 3H53A 3W7RA 1Y0EA 4EOUA 1P1XA 2AGKA 1LLZA 3LXAA 2OMAA 3IIOA 2NX9A 2V2DA 5F1VA 3B0UX 1A5AA 3FLUA 2ALDA 5KSWA 1KV8A 4JDYA 4ORIA 4FNPA 4MYAA 4K39A 4N02A 2AAMA 2GQAA 3SW6A 1OYBA 2FLIA 4NJHA 2X1SA 4GBUA 5DXYA 3DZ1A 3R5EA 4LY8A 2QJGA 5DCDA 4Y8FA 1HUVA 2V2HA 3PG9A 3TMQA 3HO8A 4AWTA 4AHQA 3W9ZA 1X6UA 5F4WA 3IIXA 1A5SA 4JIQA 3UY8A 2Y62A 1OG0A 1RZMA 4JX4A 5FF7A 3O6YX 1XL9A 5I3FA 3M5YA 3GAKA 1OFQA 3RMJA 3QW4B 2PRHA 2OJPA 2WNNA 3T78A 4LC8A 1NF7A 3NQAA 4GE8A 4YCOA 3NL6A 1QOQA 3LDVA 3O63A 5HR7A 3HGOA 4GC4A 1LTDA 1OK6A 2YR1A 3NEVA 5F4XA 3GB6A 2CZEA 4QIUA 2GOUA 1F05A 1BTMA 4UTWC 2A4AA 4O13A 1RQHA 1OFOA 4NZFA 3W7CA 1PCKA 5LGXA 1OFDA 2DZXA 4FX8A 5AC8A 2Z6IA 1LORA 3LCIA 2VEMA 2YCEA 3PVFA 4UTIA 4JYFA 1W5NA 4TO8A 1KBIA 1F73A 2G5WA 3OG3A 3G1SA 3THAA 4OV4A 5I3JA 3OVRA 1M7PA 1SW0A 2NXIA 1W37A 3PSVA 2C14A 1WAUA 3IGSA 3QMRA 4GFSA 3LCFA 2GVLA 3KFTA 2ZZ1A 5AHLA 3S5OA 1VGAA 4UFLA 4B5NA 4O19A 4I7WA 1T96A 3W23A 2ZZ4A 3E9AA 1T99A 3W2LA 2DU2A 4OV9A 4UMBA 4JIPA 5AC6A 1OF8A 1OFPA 1ZAJA 3PBWA 1TV5A 2QCNA 2I14A 4CLMA 1I8JA 2VFDA 2C18A 2E6AA 3W22A 3ATZA 4UTHA 2FPYA 2JKAA 3S1VA 1TPWA 3S9YA 2H8XA 2QCMA 5AYXA 5DCEA 4A22A 1BWKA 1OVDA 4WY0A 4AXKA 1H60A 4NT0A 3G0XA 2OT0A 3MHFA 1Q6RA 4HKPA 1DJNA 2CLKA 4FNQA 1MEWA 2TYSA 3DHFA 1LRNA 4Y90A 1G7VA 2WJZA 4E38A 5AHEA 2BX7A 3G8RA 2X1RA 4NJIA 4O54A 1LROA 3NQ7A 3CB8A 3R8RA 2HS6A 3DFPA 1VH7A 3SFKA 3O1NA 3LCGA 2B0MA 2WQPA 1R46A 4WXYA 2WV8A 2OX1A 1K7XA 4PODA 2VEIA 3LX9A 5HMSA 1H63A 1UUMA 3EWUA 4WUIA 4LVBA 2NWRA 3GZ3A 2A21A 1GVFA 1CW2A 1D3GA 2JGYA 1SSGA 1WBJA 5I3KA 3C2VA 3BGJA 1W0MA 3CEUA 5D2YA 2CZFA 2X1TA 1FWRA 4O11A 2VEPA 3BARA 5C54A 1BKSA 4IX2A 3TCEA 5CPMA 4IX0A 2HS8A 3E12A 5FESA 4LS0A 4LVFA 1W3NA 5DLCA 5BNKA 1A5CA 3N14A 3NQGA 1IGSA 3P5ZA 4MKNA 5I3HA 2FQIA 5D04C 3A5VA 4JS3A 1KFCA 3DU0A 4O4VA 2TMDA 1RD5A 1VRDA 2QDHA 1DBTA 3PY2A 4EIVA 3OA3A 4ADUA 3FYOA 3DFSA 1XUZA 2PCQA 1VJIA 1ICQA 3I7RA 5D2WA 3G1YA 4ZQPA 3W07A 1ZNNA 4AHPA 4TR9A 3NM1A 3B04A 3W7QA 2QCLA 4S2CA 2CZ5A 3HPSA 1YPIA 3EB2A 4O16A 2V81A 3ABSA 4HNTA 1D3HA 4A29A 2QCEA 1H7NA 5CZJA 3W3OA 3DGRA 1IF2A 5FEPA 4JEQA 2QUVA 3HG5A 1X1OA 3U8GA 3AO0A 3GDLA 5D03A 2V30A 1TRDA 1JUKA 1JVNA 3I7QA 1LP6A 1EX5A 1H7RA 3F4WA 4CNOA 1RQBA 1TB3A 5EPDA 1THFD 4UXDA 3NQVA 3NQDA 4DBEA 1GVSA 4M6PA 2V9DA 4I9AA 3DFTA 1OX6A 4HSNA 4JYEA 3G24A 1Z48A 1UB3A 3F4NA 1JULA 4O4WA 2FB3A 3QRHA 3S1UA 3ABQA 2QCDB 2ZRUA 2FIQA 4WJEA 1ZAHA 1FWNA 1LZOA 4FEZA 3EX1A 4PC8A 3L2IA 3QSTA 3W88A 1F7BA 3PUDA 5BMXA 3P74A 2YW3A 1PIIA 3I7SA 1WOBA 2EPHA 4IUOA 4OGZA 3ABRA 3CQ0A 1TIMA 1ADOA 1QPNA 4RLIA 3BG5A 3N3MA 4AEOA 5G1TA 3VKJA 1ZCOA 5AHIA 4FF7A 3W7NA 4N9BA 1FQ0A 1FY6A 1V5XA 3NVTA 1KFJA 2H3BA 5D30A 2Q8ZA 2KZHA 4Z1AA 4R7JA 3VFLA 2V2CA 2YGYA 4NJGA 4LVAA 4JTEA 2ZZ2A 1S5VA 2B7OA 1VHCA 4NNBA 2A6NA 3SECA 1TPDA 2QAFA 3NPUA 4N6FA 2WKJA 4Y9AA 5BRBA 3NR0A 5DELA 3L66A 3WK3A 3L67A 3U6WA 5LGZA 1VC4A 1LBMA 4O52A 3QW3A 4JY8A 1G69A 2I1OA 4O8RA 3TXZA 3NPXA 4HT3A 3L9CA 3NQMA 4DBDA 4O0ZA 3S5NA 5EA9A 2XN2A 4GUFA 2R8WA 1TSIA 3NQ2A 2DZPA 1LLWA 4MFDA 3U2OA 4FNSA 4FHAA 2A7NA 2Z2UA 2WPBA 2GJLA 1DORA 3EWYA 1Z41A 3O16A 2DZTA 3NGJA 3IIPA 1ONRA 1R30A 3BW3A 1K02A 2FFCA 1TV7A 1OFEA 1P0NA 1XC4A 2A7PA 1K8XA 3I65A 5E93A 1RV8A 1L6SA 3T55A 2Z6JA 4ZL1A 3NYZA 5HWMA 3CEPA 5LNUA 1JRCA 1RPXA 4ICNA 4J9JA 3PB2A 5CPOA 2EGZA 4LC6A 3CWNA 1KFEA 2NV1A 3L65A 3DKJA 4UC5A 2GJNA 1TQJA 3PR2A 2GVGA 2PURA 1F5ZA 3W1MA 1XUUA 3JRKA 3IVUA 4DO4A 3BLIA 2R94A 3LTYA 2H8ZA 3B0PA 4NXSA 2C16A 4HPXA 1DV7A 2F84A 3NOEA 4X3ZA 3TSDA 3LHZA 3WJZA 5HWJA 3P5YA 6ALDA 4JXCA 4ZQNA 3IIZA 5HQEA 2ZA1A 4U28A 5G1YA 3FKKA 5K9XA 1GTEA 1WBHA 2A85A 3WK2A 3GXNA 3QSRA 3MWAA 2Z1BA 1HL2A 4WZHA 3RNDA 1GZGA 3LXCA 3NQEA 4MJMA 5T26A 3I68A 2H6RA 3G0SA 2UV8G 1TMHA 3O6CA 4JTUA 1GG0A 1L6WA 4IPIA 1FX6A 3SY5A 3B05A 1F2JA 2A7RA 2QF7A 2YFOA 3SJ3A 2NUWA 3FOKA 4UTTA 3ZWTA 5AOUA 4UMCA 2JKEA 3VCRA 2XN1A 3NPWA 3UY7A 1S5TA 2C6QA 4IGHA 4TMBA 3TAOA 3TW6A 2VFHA 4JTFA 4Z08A 3UXAA 1R2RA 5G4EA 4LT9A 1FCVA 4BI7A 4JX5A 2P0OA 4UFJA 2PRMA 4DEFA 4O50A 3A5FA 3FA5A 5E0KA 1QOPA 3BG3A 3HGJA 3FEMA 1SO4A 3DH7A 3KHJA 3S0CA 4N4PA 4ADSA 3GXTA 4NQ1A 2CZDA 2G97A 2VEKA 4O12A 3UXDA 3G0UA 3YPIA 3W83A 3USBA 4BWLC 5TQLA 2RFGA 3W70A 4A2RA 1SU5A 1MEIA 3MP4A 1A53A 5AHNA 1HO4A 3LV6A 5LNWA 3SSJA 1W5MA 1ICPA 4IMEA 1H7XA 4P2VA 4Z1BA 3STEA 3N73A 2DZVA 4HN4A 4JTTA 2R91A 3RU6A 4QJ1A 1SUXA 5HUOA 3TAKA 3W73A 5TIMA 3C0JA 1PL9A 3EWXA 3R2GA 1I2QA 1KFKA 2WNQA 5G2HA 1MZHA 4JTIA 4CCDA 5BOOA 4MZ1A 3MO7A 4LTSA 3W1AA 3TC7A 3EKZA 4RR4A 3EXRA 2OZ0A 4UFKA 4IMFA 3CWOX 3UYCA 3GNDA 3PC0A 5HJLA 3HPZA 3A21A 3LGEA 4OHQA 3FKRA 3UWUA 3MYPA 2VFIA 1L6YA 4AH7A 1GYNA 1ME8A 1SO5A 4H6KA 3W7DA 3CLMA 1Q45A 1ZJIA 1SZGA 3WJYA 5EL1A 5HULA 4LV4A 1B4KA 1NFBA 3BG9A 2RHGA 1FBAA 1K7EA 1G4SA 2NWSA 4Y6GA 5E1QA 3TFCA 5LSMA 2PC4A 3LLFA 3STGA 1SZFA 2CLFA 3BLFA 3GR8A 5TBOA 2RDWA 1JCXA 3PBVA 3H54A 1AL8A 2VKZG 1N7KA 3W74A 4JDBA 3G3MA 1F6PA 1C9DA 2Y7GA 4N9DA 5DBUA 1FDJA 2ZCGA 4E2BA 1AW1A 5F2MA 3TX9A 1H62A 4RK8A 5KINA 1YADA 3W7MA 4M7SA 3NL3A 1VQTA 4BR1A 2ABBA 5G4WA 4IXXA 4FB7A 1SPQA 4IWWA 4Z0SA 4WOQA 2ISSA 2HTMA 3TQ0A 4U4MA 3MP5A 4GWEA 4EVZA 4JTJA 3KRSA 5EMUA 3C3NA 1TV8A 5FF4A 4MPQA 5FEZA 1GQNA 1MSSA 3A24A 1A5BA 4OU1A 1VCFA 3STCA 3BW2A 1W54A 3LXBA 2C1HA 4JYDA 2ZYFA 3EKLA 1TQXA 2DJXA 3CIWA 2JGQA 1JRBA 2ATMA 4XKYB 4A3UA 4PA8A 2CW6A 4LUJA 2GPTA 2NLIA 3EWZA 1WYIA 4BF9A 3LB0A 3S6DA 3W7EA 4P61A 3W76A 1R2SA 1L2UA 3TQVA 4NNCA 4O0KA 4CCCA 1G6CA 4X2RA 3E49A 4L4MA 1JJKA 3F1QA 5IM51 2H3DA 3P62A 2NX3A 4K8HA 3TDFA 3HG2A 3KRUA 3M47A 4UTLA 1X1ZA 3G1DA 3KRZA 3EWBX 4XWUA 3M7WA 1WXJA 2RKXA 1FDZA 3PG8A 4AVFA 1WA3A 1XDLA 2NV2A 3ZWSA 4FNRA 2LLEA 4JTHA 3EXTA 2ZA2A 5AYZA 3L0GA 3GDRA 1H5YA 1K7FA 5LNRA 1W56A 1F74A 4DQWA 1I2PA 2BLEA 1D9EA 4UTKA 4HHPA 1H50A 3W72A 3MP3A 3TJLA 1VR6A 1WOAA 2EKCA 1O4UA 3L68A 4UFHA 4WXZA 4ZQOA 1BEUA 3W1UA 3TUUA 3RFAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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