2A7PA

Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)-mandelate dehydrogenase in complex with its substrate 3-indolelactate
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
NLFNVEDYRKLAQKRLPKMVYDYLEGGAEDEYGVKHNRDVFQQWRFKPKRLVDVSRRSLQAEVLGKRQSMPLLIGPTALNGALWPKGDLALARAATKAGIPFVLSTASNMSIEDLARQCDGDLWFQLYVIHREIAQGMVLKALHTGYTTLVLTTDVAVNGYRERDLHNRFKIPPFLTLKNFEGIDLGKMDKANLEMQAALMSRQMDASFNWEALRWLRDLWPHKLLVKGLLSAEDADRCIAEGADGVILSNHGGRQLDCAISPMEVLAQSVAKTGKPVLIDSGFRRGSDIVKALALGAEAVLLGRATLYGLAARGETGVDEVLTLLKADIDRTLAQIGCPDITSLSPDYLQNE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of the G81A mutant form of the active chimera of (S)-mandelate dehydrogenase and its complex with two of its substrates.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
molecule keywords (S)-Mandelate Dehydrogenase
total genus 127
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date 2005-07-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2a7pA00
2C1HA 4JYFA 4A2RA 3S1WA 2ZA1A 1GG0A 3EX3A 5EKYA 4O17A 1YTDA 1NAL1 4JIPA 1LRQA 1BKSA 3S1UA 1EP3A 1FCVA 2NWSA 2CWNA 4LUIA 4UMBA 1O5XA 1LROA 1S5TA 3FOKA 3NPUA 2EPHA 3LTYA 2RHGA 4PL1A 2R8WA 3DHFA 3TKFA 4RXFA 4C1LA 2ZZ6A 4LW7A 4FO4A 4O0ZA 3NVTA 3SSJA 3BPWA 4RZ6A 3R5EA 3TW7A 2ZRWA 4LWWA 2CLFA 5DBTA 3Q94A 5F4WA 2ZZ7A 2PRHA 1YLVA 4MFDA 4HNNA 3GYEA 2VEMA 3TV8A 3PSVA 1OX4A 1RPXA 4UTTC 3MI6A 3QW3A 3DI1A 1DOSA 1OABA 1TTQA 5CKSA 1TCDA 1UASA 4I7WA 1EWEA 1WA3A 4K38A 4UTHA 4FIQA 2QCMA 4XTIA 5FF4A 4AWSA 4QJ1A 4IUOA 5G4WA 2YYUA 1W5PA 3O15A 3NQCA 4O8RA 4XQ6A 4MZYA 3KHJA 1XBYA 1YXCA 3G1AA 1OX6A 1OYCA 3GX9A 5CZSA 1EX5A 4DF0A 2A21A 4J9JA 1G7VA 1KM2A 4JTHA 4O28A 4LT9A 3S8HA 3NYZA 2JKAA 4YCPA 1XI3A 1RVGA 3HB9A 3A9IA 4Z0SA 2IQTA 4NNAA 1ZENA 4AXKA 2E5CA 2NXIA 5BRBA 3TH6A 5J5DA 4WXYA 5F1UA 3K30A 1KLYA 4IMDA 4NXKA 3VE9A 3W1AA 3P62A 1K02A 5F2IA 1VYPX 3V75A 3IIXA 3EX1A 5DXXA 4RJEA 3NZ1A 3C52A 3O16A 1ONRA 3TXVA 2FPYA 4KFPA 2RKXA 4KWVA 4NX0A 5E1QA 3W1QA 4NJGA 4IXXA 1G67A 1H5YA 4JX4A 1DORA 3UPWA 3Q2DA 3NGJA 2PE4A 1A53A 4JX5A 4WXZA 3HGSA 2HMCA 1Q6RA 2DJLA 1H1YA 2A5HA 1U5JA 4FNTA 4DBDA 3WJYA 5EMUA 1KM6A 2QCHA 4LC6A 3LHWA 4NJIA 4C1KA 3LHTA 4HN4A 4NJJA 4ALDA 2CZEA 3N73A 1GYLA 1JCXA 1KFCA 2V5BA 3W23A 3ANYA 2RDWA 3KVKA 1M7PA 3BW2A 2ABAA 3LBMA 5DXYA 4XTDA 2YCEA 3UWZA 3ZWSA 5ABTA 4E2BA 5K7JA 3W87A 4LV9A 5HQEA 4CLMA 3IIVA 2QJIA 2B7QA 3W72A 3GNNA 3DENA 3NQFA 3TSDA 3CQ0A 1KM3A 2WO5A 3EKZA 4PTNA 3GKAA 5CG7A 1GVFA 3LCWA 3TU9A 2V2HA 2YX0A 3PB0A 4I7VA 3WK1A 3M5XA 1TTJA 3MP4A 3VI2A 4WX2A 2CFFA 4O1BA 2C18A 1BEUA 3OA3A 1VCFA 2Y6ZA 3WFAA 3FJ6A 4DF2A 2Z2UA 2XN1A 1VQTA 3G1XA 1QR7A 1VCGA 1H7NA 3WJWA 5U4NA 2PC4A 4PCFA 4K7VA 3S1VA 5DLCA 4ORIA 4GFSA 1JCJA 1K8ZA 3W2UA 4BR1A 3NQDA 1QPNA 3NQ6A 1VYSX 2R91A 1PCWA 2CLIA 3FLUA 1LBFA 3LB0A 4FEZA 1XXXA 3NDOA 5HUPA 3DFNA 3EX4A 1OFOA 2ZYFA 3LDVA 1J2WA 1XBZA 4H4IA 4OE7A 1OFRA 1SO6A 2ISVA 4Q33A 2VEKA 1X1ZA 3GVGA 3UWUA 1JUEA 1J5TA 4KWWA 4O16A 3NR0A 3WJSA 3DFSA 2YW4A 3P8JA 1ADOA 3PF3A 1I2OA 2VENA 3DGRA 4TMBA 3CT7A 3DFQA 3W7HA 1YTKA 1M7OA 3W2LA 1QOQA 3NOEA 1GYNA 2G95A 2Y70A 1JCYA 1SO5A 4Z0JA 4CQ8A 1L6SA 2FPVA 4KKXA 4OGZA 3UZ5A 1DQXA 4A2SA 5EBUA 2OZ0A 1SSDA 1FX6A 2HSAA 2J6XA 3O6YX 4UMCA 1K7FA 3TX9A 2DZPA 1HL2A 4ZQCA 3NO5A 4M7TA 4POCA 3GR7A 3W84A 4IQLA 5C2XA 1IGSA 2QUTA 4N02A 4RLIA 2WSQA 1QCWA 3BLEA 2BTMA 2NX9A 3MMTA 3YPIA 3ZFHA 4XZ9A 5FEZA 3FYPA 3OIXA 3LLFA 2YXGA 3W70A 4RCXA 3NQ7A 4N9BA 5D03A 1DJNA 4O14A 2TPSA 1Q6QA 4FNSA 4UFHA 4DQWA 3N19B 5F2GA 2B4GA 3BW4A 4FF7A 1MSSA 1OYBA 5HNRA 4DEFA 2BLEA 3UZJA 1F05A 2CLLA 3C0JA 2Q3OA 5HMSA 3IGUA 3QQ0A 4KFNA 1EPXA 4JICA 1YDVA 3SGZA 3FA5A 4ZQRA 2X16A 1QOPA 1H60A 1A5AA 3QH2A 4LS2A 2QR6A 3LHVA 2A1YA 1AW5A 1YPIA 4ADUA 1ZY9A 3GDLA 2WSYA 3PBUA 3LXAA 1TV8A 1H61A 3B8DA 3BV4A 5DBUA 1W56A 3HG4A 2Y62A 2BXVA 3FKKA 4YL2A 3NQ8A 4FXRA 3TA6A 3PBVA 1LRNA 1S3HA 2B7PA 4IOTA 3A24A 3EEGA 4HSNA 3NQMA 1XDLA 3E9AA 3LXBA 2VFIA 4JTTA 1CI1A 4EWND 4NJKA 3LRMA 5G2WA 4JEQA 3MHUA 5AHMA 4ORMA 4LUJA 4N6EA 3PSWA 2FB3A 5D37A 4ONVA 4GNJA 3G1YA 3M1ZA 3PM6A 4Q32A 1N7KA 1IIHA 1YXYA 4IJBA 5LSMA 5CPMA 3NM3A 3DI0A 2GVGA 1OVDA 2VFEA 2ZZ5A 4HNVA 1SPQA 3CWNA 3WJXA 4UCGA 4E2DA 3KVJA 2ZA2A 3MW7A 4NXSA 1I45A 1RQEA 1K7XA 1OK6A 5I3JA 3PBWA 1R2RA 1F76A 4K7YA 4MIMA 1V7YA 1AL7A 4UTLA 4DXVA 3BGJA 3W73A 4OQVA 2JK2A 3MWAA 2AQWA 2I1OA 1PE1A 3P74A 1LRTA 1W5OA 2E68A 1G6CA 4H3DA 2R94A 5AC8A 2R14A 3LERA 5FEWA 4TR9A 1ICPA 4NQ1A 3C2OA 3P5ZA 3PB2A 4LNYA 4HPXA 1SW3A 1FQ0A 2DZXA 1F73A 3TCEA 3FJLA 2FPTA 5E0KA 4HHPA 5AYYA 1O5KA 3QPZA 5DN1A 3C4UA 2V2CA 4O57A 4QITA 4NUWA 4NJHA 1EB3A 1VRDA 1OJXA 1Q45A 1VPXA 4WQ6A 1W8SA 3TXZA 3W2KA 1TYGA 2WPBA 4UNKA 1SO4A 4IX2A 3UWYA 4X3ZA 5HINA 1RD5A 4ZZ9A 5FF0A 1LLWA 2WV8A 5KZEA 5CZJA 1MEIA 4N2YA 4XUGA 1QFEA 1I2PA 1MO0A 4JDBA 2C16A 4MUZA 2C13A 4YCOA 3DKLA 3CIWA 1S5VA 1VH7A 1S5WA 1TPC1 3QSTA 2G96A 4R53A 5FI8A 5C6MA 4O19A 1TQJA 2Y61A 1N55A 1VR6A 4MLRA 5KTLA 3DFPA 3T78A 2B7NA 4KFOA 1WV2A 3HPSA 3NQEA 1M5WA 3MBDA 4NU7A 4CCEA 5G4EA 1TSIA 1TO3A 1A5BA 5F4XA 3THAA 1KV8A 3DH7A 3L9CA 5LZLA 3P7YA 3GDTA 4TO8A 2YFOA 2A2IA 3NG3A 1JCLA 3ATZA 1DV7A 5AHLA 2ZZ1A 3F1QA 3N9SA 3N9RA 1H7PA 3QM3A 2X1UA 3BG5A 3UXDA 1P5BA 3MP5A 5A8GA 4YXGA 1L9WA 4JX6A 2X1TA 3B0VC 5K9CA 3E12A 5LNRA 4LVDA 3A5VA 3F03K 2PRMA 4TX9A 3KFTA 3GKFA 4W9TA 1IXPA 3IEBA 3FS2A 2QCEA 1R2SA 1TPB1 3DAQA 1ME7A 1KTBA 1WBJA 3S5NA 1GOXA 3DXIA 4UFJA 3PG9A 2Y63A 5LNVA 4WY0A 4LVBA 4WJEA 1NF0A 1FCBA 4GC4A 4GWEA 4JNMA 4EVZA 4O10A 4YLWA 3QMTA 3AJXA 2Y7GA 1LOLA 1KBIA 1DJQA 2V5LA 4DPQA 3W9ZA 3MYOA 2DZTA 2VOMA 4NZFA 3UYCA 3LCXA 5G1TA 1NEYA 2X2GA 3QW4B 1QPQA 4AAJA 2E5BA 2CLMA 1LP6A 4AB4A 1GVRA 3W7DA 1OFQA 2YFNA 4DO5A 1JQXA 1FCUA 3BG3A 4PC8A 3LX9A 4GUHA 1KTCA 3OHIA 5AHFA 1QNVA 1ZFJA 1RZMA 1G4SA 2QCDB 2Y7EA 1VC4A 4JS3A 3EX6A 1PHQA 4O15A 1SZEA 4OV4A 3G24A 2VEPA 3L0NA 4OWGA 3W74A 2G97A 1X7FA 1H1ZA 3GXPA 3B06A 3ZWTA 1SU5A 2YW3A 3M6YA 3TROA 4BFAA 1BWKA 3HMJG 5D32A 2D73A 4O13A 3JR2A 4K8HA 3MO7A 5IM51 4FIRA 3CEPA 4LS1A 4EOUA 3NL6A 3I7SA 4QNEA 5CSRA 4TMCA 1SW0A 4JY8A 1DL3A 2UV8G 5AHNA 4JR5A 3TQVA 1WXJA 4FNUA 4U28A 4CCDA 2V0TA 3PUDA 3EWWA 1Q6LA 4ICNA 3RLUA 4D2JA 2W6RA 2YSWA 3G8EA 5K9XA 3B05A 3KVLA 3HG5A 1TIMA 1PL9A 2GUUA 1ZNNA 1F6KA 5TIMA 3T40A 1FWWA 3PUEA 3ZR4A 3S0CA 4M5PA 1XM3A 1KLZA 2QCCA 4AMAA 4HKPA 1H50A 1W5NA 3QQ1A 2LLEA 4IMEA 4BK9A 3BW3A 1FWRA 1TMHA 3NXFA 4MY9A 1P4CA 1H7WA 2ISWA 1D3GA 1H51A 2WQPA 1XFBA 3C61A 2VXNA 4WY0F 4X22A 1GT8A 3TR2A 3INPA 1TTPA 3M41A 1ICSA 4PEKA 3UWQA 1LBLA 1VLWA 3GIYA 4CQAA 2J9XA 1OFBA 4O1AA 1SZNA 3KX6A 2G5WA 3CHVA 1OYAA 5I3GA 3PG8A 1KFEA 4Y8FA 1GZGA 3HPZA 2Z6IA 4AVFA 2A7PA 3LV6A 4NZJA 2H8ZA 2NX1A 4UTTA 3P80A 5D2WA 1I2QA 1T8XA 1A5SA 3DU0A 3SY5A 3W86A 3PAJA 3W2JA 3PWAA 3B04A 2C3ZA 5BNKA 4NNBA 1GWJA 4IMCA 4AWUA 3IGXA 3H54A 4ZQOA 4PL2A 3QJAA 4N4QA 4AEOA 3M5YA 4AF0B 3W7LA 4UTWC 2FQIA 4DELA 1LLZA 4UIOA 5K4ZA 3CM4A 3LHYA 3O05A 4DO6A 2VFFA 1VHNA 3DFTA 4JTIA 3C2FA 3P84A 5EY5A 1K8YA 5G5IA 3W1UA 3TQ0A 4O12A 2OCZA 2Q8ZA 3M43A 3DKJA 3TNOA 3SR7A 5DCEA 3G1VA 4RK8A 1VZWA 5HWMA 1IF2A 4HT3A 1ZCOA 3UWVA 3W7CA 4MY1A 1AW1A 1NFBA 4QAIA 3HGRA 1G4EA 6ALDA 5LGXA 1F2JA 4EF9A 4PFMA 4GUJA 4XKYA 2QUUA 3ABSA 1OFAA 1LZOA 2W79A 3SJ3A 3U2OA 2WKJA 4K6AA 1NF7A 2H3BA 3C2EA 2QJHA 1HFBA 4AHOA 4FNRA 4K37A 5AYZA 3B4UA 4UFMA 1UJPA 4MJMA 3LRKA 4O1DA 5FEXA 3W7JA 4IWWA 3SW6A 4PODA 1Z44A 2V82A 3TW6A 1RQBA 3KAOA 1A50A 3BVJA 4MVAA 4UTJA 4UR8A 5GVJA 3W7PA 3L5LA 3QPYA 1ME8A 3TMLA 2GJLA 1F74A 2A6NA 2H3DA 3P8IA 2TYSA 1O4UA 2VFDA 5D05A 2VEIA 1FDJA 4JD4A 3W2NA 3H55A 4PA8A 4O18A 2Y89A 2Y88A 4UFIA 4E0CA 4AWTA 4ADSA 2AGKA 3I7RA 3AO0A 3W7KA 1B3OA 1OX4B 4O4VA 2KZHA 3GZ3A 4FNPA 3C6CA 4HPJA 2BWGA 2RDUA 5L6UA 4UR7A 3IVSA 3N2MA 4BI7A 4RXGA 1AW2A 1AG1O 3S5ZA 1W1ZA 2YR1A 3KXQA 3LGEA 4K39A 5DCBA 3NZRA 1P0KA 3UNDA 5LHEA 4RV8A 3LLDA 2ZRYA 3GNDA 4BWLC 3FIGA 3QZEA 2DZVA 3GAKA 1H63A 2E6YA 5D2VA 4Y90A 2W0UA 3PY2A 1TRDA 2CLOA 3MJYA 1ZAIA 1FWSA 4Z1CA 2TRSA 3GDRA 5FESA 1JVNA 2WSRA 3GDKA 3HPXA 1F7BA 2DZWA 5HJLA 5C55A 1WOBA 3I68A 4LTSA 4TIMA 1D9EA 4WUIA 5FEPA 4WOQA 1G7UA 2TSYA 1O95A 1TB3A 1GVQA 8TIMA 2YYTA 3R2GA 3QFEA 6TIMA 1XL9A 3CC1A 3DHDA 5HR6A 3BO9A 5F2LA 1JCNA 3PVFA 3SGUA 5K3VA 2DZUA 4JGDA 2Q8LA 3O07A 1MEWA 1I2RA 5C5YA 1EUAA 3LM7A 3CLMA 3D0CA 3SFKA 3CPRA 4MY8A 3MUXA 4JYEA 5K2ZA 5D2YA 5C54A 3M5VA 3ZS4A 1R47A 1T0OA 3WK2A 3BK0A 1X8FA 2ISSA 5EL1A 3DFOA 1JRBA 3W7RA 1SZFA 3TQKA 5AC7A 4M7SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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