2BSLA

Crystal structure of l. lactis dihydroorotate dehydrogense a in complex with 3,4-dihydroxybenzoate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Benzoate Pyrimidine Analogues with Class 1A Dihydroorotate Dehydrogenase from Lactococcus Lactis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE A
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
total genus 114
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2005-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2bslA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2bslA01
3MP5A 3S5NA 5HJLA 3E9AA 3G1SA 1JUBA 3CB8A 1XDLA 3HPSA 2Y7FA 3BLFA 3M9YA 1F6KA 1Q6OA 3P67A 4WY0F 1W56A 3W2KA 1K7FA 1SQ7A 4PA8A 5F2LA 5LKYA 1MEHA 1VGAA 4RXGA 1TQXA 3TQKA 1K02A 1M6JA 5C55A 3QSRA 5SWUA 1EIXA 2C15A 1G67A 4CNOA 1C8VA 4JTTA 2E6AA 1GG1A 3IV3A 5IBXC 3NR0A 3HB9A 4DO6A 4UIOA 3DU0A 5KZMA 3DKLA 2I9EA 3S1VA 5DXXA 1XCFA 3N19B 3LRMA 3W7HA 2ABBA 2YSWA 5CGQA 1FWSA 2VFGA 2O7QA 4FF7A 4QSHA 1P0KA 3G1VA 3M47A 3ZFHA 3GDTA 4JTEA 4IOTA 3IIOA 1FCBA 2C1HA 3PSWA 4KFNA 2E6YA 4NUWA 4WY0A 1GVQA 3PVFA 5AHMA 1GYLA 5IM51 1KTNA 1I2OA 1XKYA 1O5KA 4M5PA 1Z44A 1C29A 3O8AA 3W7JA 2FJKA 2B7QA 1L6YA 2NXGA 2H8ZA 4UC5A 3MHUA 1H7RA 1NSJA 2Y6ZA 4LU0A 4C1KA 3TUUA 2WJZA 4FNUA 3TJXA 4X2RA 3DAQA 1W5QA 1XFBA 2Y63A 6TIMA 4UR8A 1JQVA 4NQ1A 2I14A 4MOZA 1KTCA 3LV5A 4O8RA 3JR2A 4AMAA 2OJPA 4E0CA 2VEPA 1ZFJA 2J24A 1W54A 5EKYA 3QH2A 3W72A 4PFMA 5LZLA 3LI0A 1YLVA 4XKYB 1QO5A 4R34A 1EP1A 1O5XA 4MY9A 4LT9A 4N9DA 3VI2A 3CM4A 4JNMA 3RLUA 1FXQA 3P5ZA 1FUYA 2E5CA 3SW6A 3BGGA 3TW7A 1DV7A 3DHDA 3NQEA 2V30A 3QEZA 1BTMA 1XBYA 1VHNA 2QDGA 2ZFAA 2VFEA 3OBKA 3FA5A 2FLIA 3G1HA 5BOOA 4MLRA 1KFLA 4ORIA 1OFOA 1KM4A 1QOQA 1TPEA 2QUUA 2NWRA 3LLDA 4EWND 1DORA 1TTQA 4IXHA 4JTJA 5HWNA 3QPZA 2GQ9A 1FDZA 2OZ0A 3PWAA 4O14A 3W2NA 4U28A 5D2WA 3GKAA 2IQTA 4JR5A 4HIBA 3YPIA 3M6YA 4XBSA 1LOSA 3HBLA 3TCEA 4HPJA 4PCFA 2F7FA 4OHQA 1F7BA 1F73A 3LM7A 1GQNA 1OX4A 4Y9AA 3DGRA 1QR7A 3SI9A 3UY8A 2C13A 2QCNA 4M7TA 5FEWA 3EX3A 2ISSA 5DELA 2FB3A 5C6MA 4JD4A 3MBDA 3CIWA 2ZRXA 1ME7A 5G1YA 1XBVA 3TW6A 3M5VA 5BMWA 5KTLA 3RU6A 3ABSA 1ICQA 1VH7A 2X16A 1JR1A 3NG3A 2Y7GA 2Z6JA 3P82A 4ORMA 4QITA 2DJXA 4K8EA 4QAIA 2ZZ1A 2I1OA 4O57A 1I2RA 4JTKA 3CC1A 4GXMA 3ABOA 1T8XA 3QMTA 5HUPA 4Y8FA 3OVRA 3FFSA 1Q6LA 2Y7EA 3P61A 1T99A 3C6CA 3LXBA 3W7DA 4A29A 1ONRA 4QM1A 5G1TA 4S2BA 1LOQA 2GQ8A 1JVNA 1LLWA 4JICA 2HS6A 3MO7A 1WQ5A 4K7VA 3W1MA 3LRLA 3NXFA 3W07A 3PB0A 1HO4A 3THAA 4UTTC 4IMGA 1H62A 1VPXA 1YDOA 1D9EA 4JDYA 5EYWA 4NT0A 4LVDA 3GKFA 1JCMP 3OHIA 3MW7A 1S3HA 1K3UA 4JYEA 3GNNA 5GVJA 1MO0A 2VFHA 3RLVA 4UFHA 1JUEA 3GX9A 3O1NA 1PCWA 5HQEA 2A21A 1LYXA 1AW2A 2ZDRA 2HSAA 3PBWA 1LDCA 3LRKA 3W73A 2R94A 3W1TA 3S1XA 4ZQMA 1L6SA 1QOPA 5D33A 3M1ZA 4LRTA 5K9XA 3S6DA 1RD5A 5EL1A 2FB2A 4BK9A 3NO5A 1SO3A 3PB2A 3LDVA 1RPXA 1H51A 4LS0A 1EEPA 2ZRYA 2ZA3A 1YTKA 3STEA 3W86A 2QAFA 5F4WA 3N3MA 1VYPX 4GRSA 3RMJA 1KW1A 1W1ZA 3L21A 1TV8A 2DP3A 1ZJIA 3SFKA 2GVLA 2D73A 1T0OA 2WO5A 3EWXA 2W0UA 5J5DA 3LCIA 3GAYA 2E5BA 3BW3A 4FX8A 3RNDA 5I3HA 1CX9A 3W9ZA 3PM6A 4LC6A 5AHNA 1IIGA 4AVFA 1P4CA 3HG5A 4O19A 4TMCA 3V1PA 1M5WA 4I7VA 4MIMA 2OX1A 4RLIA 3HIJA 4O1BA 2QAPA 3EXTA 3I7SA 3UYCA 3G1FA 3W84A 3NGJA 5A8GA 3WJYA 3GDMA 1XBZA 1XUUA 4L4LA 4NJIA 3QF0A 3C8FA 3HOJA 2W79A 3KRSA 3C2RA 3GVGA 5AYZA 6ALDA 3TE9A 2C6QA 1AMKA 4UMBA 3G0XA 3W3OA 1V5XA 3LBCA 3N9SA 1ZENA 1VJIA 3JRKA 4A21A 2ZRWA 3QZEA 1R2RA 4FNRA 4H3DA 2V9DA 1Q45A 4FB7A 1KA9F 4JX4A 2JKAA 3GXNA 2TYSA 1KM1A 4UXDA 3UZ5A 1AG1O 4M6VA 4OGZA 1SR9A 3NM3A 5DCEA 5AYYA 3UPBA 4LUJA 4XTDA 3R13A 3MI2A 3PSVA 1W5MA 2EF9A 4PODA 3UWZA 2ZTJA 3W1LA 1GT8A 3LI1A 3W76A 1SW0A 2HTMA 3QQ0A 3F03K 3S5ZA 4R53A 3FKKA 3STCA 3MBFA 2DZUA 1PS9A 4WQ6A 3LTSA 4Y6GA 2YGYA 5CPOA 3HMJG 1A5CA 3KVKA 4R33A 4HNTA 4LOCA 2J6XA 4DELA 1R2TA 1W8SA 2P0OA 4LW7A 1FWRA 3KVMA 4O15A 3B4UA 5AHLA 4I9AA 1GJPA 2GJLA 5D02A 2YDAA 3M41A 5DBTA 1UASA 5D30A 2QUVA 4UTWC 1ME9A 1UUMA 2X1RA 3C61A 2NXHA 2JBMA 4NU7A 3HJZA 4HSOA 2Z6IA 3FS2A 4MKNA 2QCMA 1OFPA 5FEXA 4LVGA 1TPUA 1X8FA 3M44A 4FNQA 2JGYA 3NQ7A 2FFCA 2XN1A 5D38A 1X7FA 1WDWA 3T40A 2B4GA 5FEZA 3OEXA 2VFIA 1LCOA 2QJIA 3PULA 1W5NA 1KFKA 2O7SA 4FNSA 1GVRA 1MSSA 3B0VC 3H53A 5CKSA 4EF8A 2CLHA 4ZVJA 1JUKA 1SO5A 1YDNA 1NEYA 3TKFA 3BW4A 5LGXA 3LERA 2CLMA 1SZNA 1QCWA 3ZR4A 4EOUA 1N7KA 2WPBA 3DI0A 3TROA 4HNVA 3G3DA 4UMAA 3IIPA 2TSYA 2FPTA 2Y89A 3M43A 2BZNA 3EXSA 5TBOA 3PG8A 1TRDA 1WXJA 3TXZA 3TX9A 2RDTA 3KXQA 4DO5A 3G1AA 2QCDB 5FF7A 3KHJA 3W22A 3BK0A 4WJEA 1KM6A 3P74A 1LBLA 2EHHA 3W1XA 5KITA 4DF1A 3NDOA 1OYBA 3W2UA 1Q6QA 3GIYA 1OF6A 3VKJA 1W5OA 3PS7A 2RFGA 4LTSA 3R2GA 5HWJA 3C2EA 4O54A 3GAKA 3QFEA 3M5YA 3A9IA 3P81A 2ZZ2A 3S1UA 1OJXA 5MHBA 1J5TA 2HS8A 1IXOA 1L9WA 4WOQA 4ADUA 1PE1A 1QPRA 4X22A 3TIMA 1F76A 1ML1A 2C18A 2Y70A 3MJYA 1S5VA 3O06A 5D32A 3O15A 4CCDA 1RQEA 1GTEA 1TJPA 4NVTA 4RK8A 1DOSA 3CIXA 3LB0A 1U5JA 3U6WA 3I65A 3L9CA 2EKCA 4PTNA 3IGUA 5LNUA 1H50A 2NV2A 4AWUA 1KFBA 1ZHAA 2WSRA 2ZZ7A 1RZMA 4N9BA 3TC7A 4A3UA 3G8RA 2Q8ZA 3LGEA 3GXPA 3MI3A 4IX0A 1DJQA 2CFFA 4UTUA 1ME8A 4ICNA 1IGSA 1OYAA 3QYQA 3W7EA 1DBTA 2DZPA 2A6NA 2H90A 3S9YA 4FIRA 4BWLA 3EWZA 1O4UA 3W6YA 5G2IA 5AOUA 4O10A 2JGQA 3WJSA 3EX6A 2RH9A 4K38A 4DF0A 4IPIA 3S1WA 4O1AA 4RR4A 1TV7A 4UUIA 4IXXA 1R30A 4NX5A 3P80A 3P5YA 2J9YA 1H5YA 3S5YA 1KFJA 2DZSA 3HGRA 3TNOA 2QCCA 3FJ6A 1EWDA 1ICSA 4GUHA 3W7PA 3W2LA 3U2OA 3TA6A 1M7PA 5F2IA 3TXVA 3W7OA 2PE4A 1BWKA 1TPB1 5TIMA 1VR6A 1QPOA 1OX5A 3LXCA 3UNDA 1LP6A 4JTGA 4O16A 1D3HA 4HKPA 4I7WA 2A85A 4IJBA 1LRQA 3C56A 2Y62A 3PY2A 3VE7A 2C3ZA 3NPXA 1LRTA 3TFCA 3LHTA 1B9BA 5DBUA 4KWVA 3N73A 4OV9A 3NYZA 1LTDA 3MWAA 5EY5A 4BI7A 5F4XA 4K6AA 4UTLA 4DBDA 4YXGA 1I4NA 1W31A 1ALDA 1TSIA 1G4SA 4TU1A 1S5TA 1AL7A 3G0SA 7TIMA 3E49A 3F1QA 2GJNA 5H2ZA 4DEFA 1Q6RA 3QW4B 1IXPA 1UCWA 5L6UA 1JCJA 1G4PA 3NOEA 3C2VA 2NX3A 4OV4A 1RR2A 1SZEA 4MZ1A 4TR9A 3W7GA 4MJZA 5G4WA 2DU2A 4LNYA 5LGZA 1P5BA 1L6WA 3OVQA 4N9CA 3EX1A 3NQFA 3O63A 4CQ9A 3SIZA 1I2NA 1RQBA 3QM3A 1ZAHA 3LCFA 1Z42A 3UQNA 1B3OA 2RDUA 3WJZA 4X9SA 1UUOA 2PCQA 4CLMA 5BW6A 3A24A 5AHEA 3V75A 5G4EA 3LX9A 4XTIA 3FJLA 1JRCA 4RZ4A 2ALDA 4DPPA 3T4CA 2Q3OA 4P61A 3E0IA 1UB3A 3HPXA 5BRBA 3M16A 1ZAIA 3BPWA 4AHOA 5C5YA 1LLZA 3NL5A 4Q33A 3MYOA 3F4NA 4TIMA 3B06A 4Q4KA 2WQPA 3P84A 3W1UA 4PL2A 3DBPA 1VRDA 3M5ZA 3A21A 4G1KA 3S5OA 4ADTA 4KFPA 3LTPA 3GR7A 1GZGA 4JEQA 3W71A 3BLEA 1SW3A 2NUXA 5DY3A 3LBMA 4Z1BA 4WXZA 2VEMA 3CEPA 1SO4A 1CW2A 3MMTA 5CZSA 2QCGA 2X2GA 2HMCA 4EIVA 3EB2A 1KLYA 4GUFA 2YPIA 1ICPA 4H4IA 3MI6A 4XKYA 4K39A 1LBMA 3C0JA 4M7SA 4AF0B 1FDYA 2A7RA 1B4EA 4MUZA 3SR7A 5U7SA 4IWWA 4Y96A 2P1FA 1JCLA 1NF7A 1SZFA 3L5AA 1Z41A 2A5HA 3EKLA 3PBVA 1X1ZA 3KOFA 3IVUA 3LHWA 1QWGA 2C14A 2VELA 1FCVA 4RV8A 2QCLA 3QC3A 4FXSA 1V7YA 1X1OA 3M7WA 1XM3A 1JJKA 3LCGA 4PL1A 1BKSA 1K8ZA 1FCUA 3MYPA 4AXKA 1G7UA 5DLCA 1QAPA 3NL2A 3SGUA 3W7QA 4RZ5A 4DPQA 3CEUA 3W85A 3W23A 4O17A 2VFDA 5I3KA 3P8JA 1IXQA 3O6YX 2ZZ3A 2OMAA 1QFEA 2PURA 4O1CA 3IVSA 3L0GA 1XDMA 3G18A 3NZ1A 1N8FA 4BWLC 3L5MA 4GUJA 3QQ1A 4AWTA 1J4EA 3C2FA 4GC4A 5HUOA 3UWYA 4ZQOA 5K9CA 1FWTA 1O60A 1YPFA 1ZCOA 2NLIA 4IGHA 1QPNA 4FNTA 1NF0A 3SY5A 3U8GA 2RKXA 2TMDA 2X30A 3C4UA 3D0CA 5FF3A 3O6CA 4L4MA 5I3IA 5DN1A 2J88A 5G5IA 4HSNA 1W3NA 1THFD 5HMSA 2TRSA 3CHVA 4NZJA 2V82A 2PRLA 1H7XA 3WFAA 2Y61A 2A7NA 4POCA 1ZY9A 4FIQA 3PBYA 3DHFA 3N14A 3LCXA 5LNRA 1VCGA 4QJ1A 4N2YA 2NUWA 2QEZA 2GPTA 4XQ6A 1AK5A 2YW4A 3FIGA 4RKAA 3CU2A 2Q3RA 3ZS4A 3IIZA 4ONVA 4HT3A 3LLFA 3UY7A 1GOXA 4WX2A 5T26A 1PL9A 4RCXA 3PUOA 2A0NA 3O16A 4RZ6A 2ATSA 3TV8A 1NVMA 3RFAA 4JY9A 3UWUA 1MZHA 1FX6A 2OT0A 4JTSA 3S42A 1OHLA 2CZDA 4GE8A 4LV9A 4Z1CA 2Y88A 4JXCA 3WK1A 3LHUA 3GDRA 1H63A 2CU0A 4KFOA 2YXGA 1IXNA 5HINA 2NZLA 1TYGA 4MFDA 5CZTA 4BR1A 1FQ0A 3R89A 1H61A 1EPXA 1SZGA 4UTMA 1TCDA 4NJJA 4C1LA 1OG0A 1DL3A 1T96A 4UFKA 1H1YA 1SO6A 4Z0SA 2YYTA 3TQ0A 5CSRA 4O0KA 4FHAA 1DQXA 4K7YA 2E77A 4UMCA 3B05A 1JULA 4DF2A 2R8WA 1R47A 3NQ8A 4S1FA 4DXVA 2EPHA 4JIPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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