2BX7A

Crystal structure of l. lactis dihydroorotate dehydrogense a in complex with 3,5-dihydroxybenzoate
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Benzoate Pyrimidine Analogues with Class 1A Dihydroorotate Dehydrogenase from Lactococcus Lactis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
total genus 116
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2005-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2bx7A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2bx7A01
5IBXC 3EX2A 3LRKA 5HNRA 5G4WA 4UTTA 1O5KA 4A2RA 1H5YA 3C2EA 4LW7A 3DFTA 3IIPA 1WBHA 4ADTA 2VEKA 5LHFA 4CLMA 5I3FA 3MHGA 3P61A 4C1KA 3S5ZA 3UPWA 4AVFA 1R46A 3O6YX 4FXRA 1X6UA 3T4CA 3PBWA 5I3HA 3E02A 1YDNA 4J9JA 3SW6A 4QM1A 3PWAA 2GQ9A 4QNWA 1DL3A 4LUJA 3T55A 5BNKA 4JIQA 1LBMA 3Q2DA 1HO4A 5AFDA 1LBFA 3LRMA 2GPTA 1TMHA 4NZJA 3CT7A 4MPQA 3PF3A 4WQ6A 5LSMA 1H63A 1OX5A 4CQ9A 1H7XA 3BO9A 3EXTA 1H7OA 1A50A 5LNSA 3QMRA 4BFAA 3GXNA 3G24A 4H3DA 2VENA 3QM3A 1JVNA 2DP3A 5FEWA 1QAPA 1SSDA 2J9XA 3M1ZA 3NO5A 3TCEA 4UR8A 4AF0A 1KFLA 2A4AA 4MVAA 1LZOA 2GUUA 1VCVA 4IMGA 1QDSA 1HO1A 1XUZA 1P0KA 4XQ6A 3W7KA 4OQVA 5CPOA 4EWND 1X8FA 5C2XA 3G3DA 2A7PA 4FNPA 4FX7A 3UWUA 1OFBA 2ZDRA 3CIXA 2QEZA 5D30A 3WK1A 5G2WA 3SZ8A 1A5CA 4UUIA 4N9EA 2KZHA 2GVJA 3A23A 5LHEA 2PRLA 4MJMA 1OFDA 3E0IA 4DO5A 4GWEA 1CX9A 2WSQA 4O0KA 3KRUA 3BPWA 3I6RA 3LM7A 3Q37A 4HHPA 3PG9A 3N9SA 1I2QA 3G1FA 1ZFJA 3MI6A 3TW6A 3W2UA 3NM3A 3DU0A 1C9DA 3HOJA 3EX1A 4CCDA 3L66A 3DFOA 2ZZ3A 3MP3A 3HO8A 1VJIA 1JRCA 5CGQA 1N7KA 1VYRA 3NG3A 1IF2A 3G1DA 3K30A 4DXVA 1VRDA 2QAPA 1XM3A 3O16A 1JUEA 4O0ZA 5D2TA 4PTNA 4UTLA 1B4EA 1XBYA 2V0TA 2RFGA 1GVFA 2GQAA 2FB3A 1SO6A 2Q3RA 4FX8A 1RQHA 1C8VA 3DFNA 3IIVA 4KWWA 3GB6A 1LDCA 4JICA 1LRQA 5DBTA 5TBOA 1YADA 4WUIA 3W1LA 4KFOA 4N4QA 4RZ5A 4FNQA 4GXMA 1EEPA 4CCEA 1W5OA 4FF7A 4O4VA 3CB8A 2H90A 4JYDA 4JS3A 2QDHA 1K8YA 3QQ1A 4IMDA 2BXVA 3GXTA 3LOTA 1A53A 2I1OA 2G96A 2G97A 3RK8A 3VE7A 3SECA 2FPVA 4K8HA 1G7VA 1SZEA 3W07A 3C2OA 1YTEA 3TROA 4O52A 4HNTA 2C0AA 3LLDA 1YTDA 1VYPX 5HULA 4Y8FA 1JCNA 3W74A 1ICQA 1QOPA 2LLEA 4K36A 1GJPA 4BI6A 4JYFA 2ZCGA 1DVJA 4O1DA 3VCRA 3G1VA 4PH6A 3B05A 3BG5A 1TTPA 1ZENA 4A22A 1FXPA 2ZA1A 5F2GA 2X1TA 3MHUA 3E12A 3IV3A 1XUUA 1RQEA 2E6FA 4NVTA 4M7TA 3FYOA 5DN1A 5F4WA 2W79A 4E38A 3HBLA 1EP2A 1KM2A 4LWWA 5CPNA 3BV4A 4HN4A 5I3GA 2FTPA 3GAKA 1YTKA 2YX0A 4PCFA 3O06A 2E5BA 5K9DA 3B0UX 5C55A 1OYBA 4GUGA 4JIPA 3EXRA 1SZNA 1Q6OA 2R14A 4AHQA 2FB2A 2IQTA 2WQPA 1O95A 4P2VA 3CIWA 4WY0A 1LORA 4O4WA 4UTTC 5K3VA 3LI0A 4X2RA 1R2SA 2FPTA 4TR9A 1WXJA 1KFEA 3LHTA 1FWNA 3TV8A 4JGDA 2Z2UA 3MMTA 5A5WA 2VFFA 4JX5A 5H2ZA 4HT3A 3BW4A 2DZUA 1N55A 1MEHA 1AMKA 1OFQA 3GLCA 3BW3A 4UMCA 2QCDB 3JRKA 3NM1A 5KINA 5HUOA 4TMCA 2Y88A 5HQEA 1EWEA 3LTSA 4X9SA 4JYEA 3NR0A 4IJBA 4QISA 1NFBA 1XBXA 4ZVJA 4JDYA 3PS7A 3LHWA 3P8JA 2VEMA 2QCGA 1TCDA 2TRSA 3UXAA 1JQVA 3M5ZA 3WJZA 2C6QA 5LNWA 4C1LA 2TYSA 5G4EA 3SIZA 2VXNA 4QJ1A 3S1VA 3I7RA 1M7OA 3H55A 3E9AA 3PC0A 4JTKA 3W7CA 3FOKA 4CQ8A 3GDTA 5TQLA 2ABBA 4TO8A 1JCMP 2QCEA 3LTPA 1MEIA 2BZNA 5HWMA 4TU1A 1K7XA 3OIXA 2YFNA 3W1QA 4FNTA 1MSSA 4M6PA 3TNOA 3NQGA 3P84A 3M7WA 3B03A 3EWYA 1QMLA 4IQLA 4XZ9A 4A29A 1IXNA 4QNEA 2WNZA 1VQTA 4PL1A 4KFPA 1W3TA 4EF9A 3EB2A 3CWNA 5AN7A 5AC8A 4TIMA 3W71A 5K9XA 1WOAA 4NNCA 4BK9A 4NNAA 4MFDA 1DJNA 3WJYA 4UFKA 3MW7A 2ZA2A 4GBUA 1YYAA 1W3NA 2ZTKA 1OF6A 2A6NA 4NJGA 1OK4A 3G1HA 2A7NA 3UXDA 1AW2A 1EX5A 3TFXA 3NXFA 1IGSA 3TC6A 3L68A 3GDKA 1TJRA 3LHUA 1GG1A 4MZ1A 2B7PA 3KOFA 4OV9A 3N3MA 2YW4A 4Y9AA 3MJYA 5FF0A 1HUVA 1LROA 4FO4A 3BLIA 2H8XA 4YCPA 3NQCA 4MY9A 1ICSA 2Q3OA 3L0NA 4E2BA 4X22A 1L6WA 1UUOA 2JGYA 2WNNA 2FJKA 2Y7EA 3OG3A 3NGJA 3NQ8A 3LXAA 2VKZG 4Y96A 3DKJA 2JGQA 4MUZA 1GYNA 3L67A 1TPFA 5H91A 3M0ZA 4CNPA 1M7PA 2NUYA 1YLVA 1V5XA 5U7SA 3UWYA 4LVAA 3ABRA 5K7JA 1NF7A 2EKCA 3TA6A 2A5HA 2BWGA 2YPIA 2QCCA 1K3UA 3QYQA 5U4NA 2C19A 1PHWA 2X16A 1I2RA 5G2IA 1KM4A 1SO4A 3NPVA 3W7JA 3NZRA 3PB2A 1RD5A 2VOMA 1JCXA 3LB0A 4ADSA 4NNBA 1G4SA 3FKRA 3GKAA 3G3MA 1K8XA 3W84A 1FY6A 2NLIA 1YDVA 2Y62A 3KRZA 3M5YA 2X1RA 4BI7A 3FS2A 4Z1DA 3N19B 1ADOA 4HKPA 5G2HA 5CSRA 3QJAA 5EY5A 1VCGA 1VC4A 1VS1A 4LUIA 4DO4A 3M47A 1TQXA 1ZAHA 4LRSA 1FCQA 1BTMA 4TX9A 2H3BA 2RKXA 1AW5A 3TKFA 3RLVA 3G0UA 1A5AA 1OG0A 4DF0A 3ATZA 3OBKA 4GE8A 3LCHA 2QCFA 3AJXA 4JTJA 1EUNA 1ZAJA 1QPOA 1OFPA 3CTLA 2ZRZA 4IPJA 1G67A 1K02A 3JR2A 1EPXA 3IGXA 5CPLA 5FF4A 5LGZA 3W88A 3R2GA 4LVFA 2V2CA 1WAUA 3NL5A 4UMAA 3GX9A 3LCFA 3PUDA 5HUPA 3HGRA 1F2JA 1DHPA 1ME9A 4JR5A 3C6CA 1GQNA 2A6LA 3NQ6A 4RR4A 1KTNA 1FCBA 4R34A 5FESA 2AAMA 3NQEA 4MZ8A 3W73A 3B04A 2ZQ0A 4K7VA 4UTIA 1EIXA 4IXHA 5E0KA 2P10A 4RKAA 3W6YA 1NAL1 2PRMA 5K4XA 3KHJA 1TTIA 3TJXA 1LOLA 3HMJG 4O19A 3USBA 1F5ZA 5AHLA 3LV5A 2P1FA 3DKLA 1W31A 4BI5A 4LTSA 4OGZA 1ONRA 3PBYA 4RV8A 4ZQPA 1IXOA 3E49A 1PV8A 3MYOA 2V9DA 3ELFA 1T99A 1W0MA 3P8IA 4LVGA 3NAVA 3NNTA 3IRDA 4XWUA 4YLWA 4AH7A 4MYXA 2C3ZA 1GTHA 3C2RA 5D09A 1H60A 1W5QA 3TR2A 2CW6A 4M6VA 1P5BA 5C6MA 2HTMA 3LTYA 4UCGA 1WYIA 1SPQA 3PB0A 4FX6M 3EKLA 1F74A 2V2DA 4I7VA 3W7DA 1K7FA 1W8SA 5D05A 1IIGA 2YCEA 1NEYA 1R47A 4TMBA 3KAOA 1LLZA 3G18A 3JS3A 5L6UA 3F4WA 3PM6A 3HPZA 2XN2A 3T7VA 1RVGA 2ZZ2A 3TAOA 1G69A 1NVMA 4MJZA 4R7JA 3NQFA 1I45A 1KW1A 4DELA 2ZTJA 3GR7A 5KITA 3PULA 1DORA 1W5NA 2V2HA 4JTGA 4O8RA 2A1YA 3PUEA 7TIMA 2ZA3A 3STCA 1TREA 2W0UA 1G4TA 4BF9A 3W7HA 3GR8A 1R2RA 3P67A 1R30A 2J88A 4ICNA 1J4EA 1TPH1 4MOZA 3GDLA 4YCOA 3HGOA 3GXPA 2X1SA 4FB7A 3FA5A 5AYXA 2FDSA 5CZSA 5TIMA 4AF0B 3IGSA 3C61A 1ZNNA 3WFAA 4N6FA 1W5PA 3VE9A 5D38A 1TQJA 4KKXA 3NA8A 4E2DA 4HSOA 3UD6A 5DY3A 3FIGA 3W83A 3W22A 1D3GA 3CLMA 1I2PA 3A5FA 3O05A 1ICPA 4YL2A 4O53A 3M5XA 3O6DA 1EWDA 1QR7A 4NJKA 3CU2A 2ZZ1A 3F4NA 3W1RA 5D04C 3TUUA 1H7WA 1N8FA 3MP4A 1IIHA 2E5DA 3G22A 4DPPA 5MHBA 1KTCA 3STEA 1D3HA 5ABTA 3IVSA 1O94A 2QF7A 3HJZA 3L9CA 1CW2A 1SW3A 1VLWA 1PVNA 3PSWA 4MLRA 2QCMA 1GPWA 4S2BA 1BWKA 3LHVA 4S2CA 1F7BA 3ABQA 4O57A 1LP6A 1G4PA 3W1NA 1B4KA 3EEGA 4RXFA 1JR1A 4WXZA 3QFEA 3N14A 3HGJA 2WSRA 3L0GA 2ZRXA 5EA9A 1H61A 3LDVA 2JBMA 3O8AA 4GNJA 1TPUA 2J6XA 4Y6GA 2H6RA 1GVOA 3MYPA 3H53A 4QSHA 3YPIA 1W1ZA 3UWWA 1FUYA 4O1CA 3N34A 5AC6A 1QO2A 1VHNA 3B0VC 1FWTA 3N2MA 3ANYA 1DV7A 3G1YA 4WOQA 1H7RA 2VEPA 4NJHA 1FDJA 3W2NA 3P82A 1QNVA 3HQ1A 1GVRA 5HINA 4LU0A 3W87A 3N2XA 1U83A 8TIMA 2QUTA 3BG9A 3S5OA 3TK7A 1W54A 4O1AA 1EUAA 2NV1A 2NWRA 2A85A 2TSYA 2H3DA 1PHQA 4JTIA 3DXIA 1WBJA 4BWLC 3TMQA 1KA9F 3TQKA 3PUOA 5AC7A 4G1KA 2E1DA 2QJIA 3GZ3A 3RLUA 3EWWA 3U6WA 5AOUA 3S42A 3FJ6A 4Y90A 1A5SA 2BLEA 5F2LA 1L9WA 1Z41A 3EWXA 1OFAA 4FHAA 3PBUA 3L5AA 3NQAA 5E1QA 1W3IA 3KVKA 1TPWA 4AXKA 4N9DA 1T0OA 1MXSA 4O13A 4RZ6A 3KFTA 1ZJIA 2Z6IA 1ALDA 4O12A 2WPBA 4EIVA 1VCFA 2D73A 4PEKA 3UZ5A 3G0SA 2X1UA 2ZRWA 3NPUA 5KSWA 2V5BA 5AHEA 3BGGA 3EXSA 4Z08A 3HB9A 3LV6A 2HSAA 5DLCA 2ZRVA 1LOQA 3HG3A 5AYZA 5IM51 4D2JA 1GTEA 2O7QA 3M41A 1QWGA 4RCXA 3LI1A 1TPVA 5I3JA 3W2JA 4CNOA 1Y0EA 3BVJA 2DJLA 4M19A 2E6DA 2NUXA 4JD4A 4OWGA 3W2KA 1OABA 2R8WA 2EGZA 2Y7DA 3GNNA 2A0NA 2NUWA 3SGUA 1B9BA 1W37A 3LLFA 1KV8A 4RLIA 4WY0B 2R94A 3IIZA 2CWNA 3IGUA 1PS9A 3M16A 3LBMA 3HPXA 2O7SA 1BEUA 4ZL1A 4YWIA 3G1SA 5FEXA 3R5EA 2WSYA 1DBTA 3OHIA 3FJLA 2YZRA 3W7LA 1TO3A 1XFBA 2ISSA 4MY1A 4ORMA 3W2MA 2ISVA 5DCDA 4XTDA 1YXDA 3G1XA 4PL2A 1TB3A 3C3NA 1H50A 3R12A 1SU5A 1GWJA 1O5XA 1X1ZA 2F84A 3ZFHA 3UWVA 3TSMA 1SR9A 4UFHA 4XTIA 2QJHA 3GK0A 3P7YA 2FIQA 1WA3A 4JTFA 2CLHA 1AK5A 1U5JA 2CLKA 3FLUA 3QPYA 2RH9A 3HG2A 2P0OA 1PCWA 4L4LA 4GFSA 2C18A 3P60A 3LX9A 1DOSA 2OMAA 3O07A 5I3IA 2E6AA 1SZGA 1RV8A 3KXQA 3M44A 1OX4A 2UV8G 4ZQCA 4Z0JA 5AB3A 4O10A 3ZR4A 1AW1A 5G1YA 1VLIA 4O50A 3NQMA 5EKYA 3WJSA 2ISWA 2GJNA 3P5ZA 3QSTA 2NXGA 5D2VA 4WY0F 3OVRA 1KM0A 3TMLA 2YR1A 1QFEA 2Y6ZA 4DF1A 4K6AA 1VYSX 4UR7A 1KM3A 2Y7GA 3OVPA 1ZHAA 4ONVA 1FQ0A 2PC4A 5CSSA 2QR6A 3WK3A 1JUBA 3DH7A 2EF9A 3ZWSA 4LS0A 2Q8ZA 4RK8A 4NU7A 4LS1A 3GDRA 5LGXA 3C2VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3LRK A;  5B7Y A;  1Q6F A;  4UTT A;  3C8N A;  4ACZ A;  3CUH A;  4HB7 A;  1IE7 C;  3HM7 A;  5LHF A;  3P61 A;  3SN1 A;  2ZIC A;  5LXE A;  3AHZ A;  4U10 A;  4GIE A;  4J9J A;  5A2C A;  3SW6 A;  4D6J A;  3PWA A;  1DL3 A;  3AU2 A;  3TJI A;  4UNI A;  1J79 A;  3PZV A;  1H3G A;  5AFD A;  3JUG A;  4F0L A;  1LBF A;  3R0U A;  3LRM A;  1XGZ A;  4C7D A;  1DWI M;  2W66 A;  2DIE A;  3W53 A;  5IRP A;  2FKP A;  1E4N A;  1H7X A;  3L2L A;  3UG3 A;  2WLY A;  5HK4 A;  3QMR A;  3WQE A;  4AD4 A;  4BFA A;  4H3D A;  2VEN A;  4TV6 A;  1H11 A;  4B16 A;  5FEW A;  1QAP A;  4F48 A;  2J9X A;  4YWS A;  3NO5 A;  1GOO A;  4HU8 A;  2RUS A;  4MVA A;  2XM1 A;  4H8N A;  1HKV A;  4I5U A;  1RY0 A;  1X96 A;  1VCV A;  4IMG A;  1QDS A;  3U4F A;  4QDP A;  2Z4G A;  1PTA A;  2IPW A;  1P0K A;  3W7K A;  3POC A;  3CHD A;  3A4A A;  2W67 A;  4Z1Y A;  3NO1 A;  5D30 A;  3SZ8 A;  4NIL A;  1CXI A;  2KZH A;  1BG9 A;  1OFD A;  3F4C A;  3QLD A;  5JH2 A;  3KP0 A;  3GDB A;  1V03 A;  1JGI A;  3BPW A;  3I6R A;  2E8Y A;  3LM7 A;  3Q37 A;  1TE1 A;  1OGS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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