2BX7A

Crystal structure of l. lactis dihydroorotate dehydrogense a in complex with 3,5-dihydroxybenzoate
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Benzoate Pyrimidine Analogues with Class 1A Dihydroorotate Dehydrogenase from Lactococcus Lactis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
total genus 116
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2005-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2bx7A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2bx7A01
1K7EA 4JYFA 5KZDA 2W6RA 1DL3A 5EKYA 4UTIA 2GVJA 1L9WA 1OYCA 2ZA2A 1SO5A 3G1DA 1G4TA 1QDSA 3W75A 4OQVA 4CCEA 2R8WA 2WPBA 5HWMA 1TO3A 4N4PA 2NV2A 1IXQA 4S2BA 4GUIA 3EWZA 3R12A 1K7XA 2HS6A 2QCHA 3A5VA 4CLMA 1G69A 3MHUA 3SI9A 2ABBA 4XQ6A 3W7DA 2NXIA 3O15A 4X9SA 2YDAA 4FNUA 2Z6IA 1AMKA 2BX7A 1W0MA 2A21A 1TRDA 3CM4A 3C6CA 4GBUA 2J9YA 1OFDA 4EF9A 3W73A 1SZNA 1GTHA 2J9ZA 1PHWA 4I7VA 2H3BA 3CIWA 3NM3A 1Q6LA 3P67A 3GXNA 3BO9A 4RX0A 5CKSA 3LXBA 4DPPA 1OFBA 1CW2A 1ZALA 2GUUA 3WJWA 3OVPA 2TYSA 4HNVA 3TJLA 3K30A 1NVMA 3NR0A 2ZA3A 1YTDA 1PS9A 4IX0A 3ELFA 1RVGA 5LNVA 1KM0A 3PBWA 5LGZA 2OT1A 4DPQA 1FY6A 1X7FA 1OFEA 5FESA 5LNSA 4R33A 2ZRVA 1B3OA 2I9EA 1H63A 2VFFA 3CC1A 3STEA 5G2WA 2QR6A 3M1ZA 3SZ8A 2QCCA 3TSBA 4B5NA 1JCYA 4IMCA 4FX6M 3RNDA 3CB8A 4Z1AA 2VEMA 2ZRZA 5BRBA 4OBTA 2PURA 3EX4A 1SQ7A 3ATYA 3P60A 3T40A 4TR9A 4JY8A 3W7NA 2XN0A 4UTMA 1H5YA 5EMUA 3LCIA 3QPYA 3U8GA 3F03K 2JKPA 4LOCA 4H6KA 3DFTA 3TFCA 5E0KA 1BTMA 5AHFA 5J5DA 4PODA 1YPFA 2JBMA 2W79A 1GZGA 3INPA 3W87A 1CX9A 3CWOX 3LGEA 3NQ7A 1B57A 4EF8A 2DZVA 1P5BA 3QM3A 5LNRA 3C4UA 1R47A 2ZTJA 3TMLA 2VFGA 4JX5A 1H7PA 3W84A 3N19B 4CCCA 1AL8A 4O1DA 4N6FA 2E68A 4NX0A 1TCDA 1D9EA 3NQCA 3P61A 1JQXA 1T8XA 1W8SA 3G0UA 2XN1A 4N9EA 3NQ8A 3TE9A 3LRMA 3BW2A 1XCFA 3HGRA 4DF0A 1E51A 4QQ3A 3TNOA 5T26A 1F05A 4LU0A 5F2MA 4UTHA 1XFBA 4CQ9A 3UWUA 3W1RA 1Q3NA 2ZTKA 5CPOA 4DBEA 1WXJA 3BG9A 3U2OA 2ZZ1A 4JR5A 3THAA 5HUPA 1OFAA 1K02A 4JD4A 3V75A 3NL5A 3CWNA 1MO0A 1KBJA 2EKCA 3TXVA 3QF0A 3HG2A 4LVGA 1X1ZA 1FWSA 2A1YA 2Q3OA 2QJHA 1G7UA 2AAMA 3LHUA 6TIMA 1PE1A 3FA5A 1ZAHA 3SY5A 4Z0SA 1OX4B 1H7RA 2VENA 3B8DA 3TKFA 2E6AA 2CFFA 3DFNA 1ZY9A 1WYIA 1OG0A 3W1XA 3MBFA 1Z41A 4UMBA 2ZCGA 4MJMA 1DKWA 1ZNNA 4JIQA 4PL2A 4G1KA 3UQNA 4LVBA 5HWJA 1Z44A 2QJIA 3W88A 2BTMA 3P8JA 3B0UX 2FPTA 1FQ0A 4IPJA 1XBYA 3S1UA 4LNYA 4QISA 3EWBX 4UXDA 3PM6A 4N6EA 1EP1A 3I7SA 1WV2A 3BW3A 1O5XA 3DKLA 2A0NA 2F7FA 4KFPA 4PEKA 1SFJA 4OWGA 1ZAIA 1M6JA 1TPEA 4MJZA 1FBAA 1LLWA 3GIYA 4AWTA 4X22A 4YCOA 2Y63A 3EWXA 5DY2A 3BLFA 3I7RA 5IBXA 3DH7A 1NEYA 1UBSA 3W1MA 1OHLA 2CZFA 1W3NA 2ZZ3A 1FDJA 2E6DA 1W1ZA 3M41A 2H8ZA 3W22A 3DU0A 3GXPA 3KVKA 1AW2A 1AW1A 3TX9A 4LRTA 1T0OA 3BGJA 3NG3A 2R94A 3NA8A 3M5VA 4AWSA 1GPWA 1VCGA 2B0MA 3U6WA 3TC6A 2JK2A 3MJYA 1H60A 1HL2A 3NL2A 5E1QA 5LNWA 4O11A 1FWNA 4O4WA 4FO4A 1OF8A 4M7TA 2O7QA 1RQBA 2IQTA 1VGAA 2YW4A 3E9AA 3RK8A 4KKXA 1Q6QA 2V82A 3ATZA 2H6RA 3G1YA 1GYNA 4O13A 7TIMA 2V30A 1AG1O 2CWNA 2NV1A 4KWWA 5F4SA 2YFNA 1FCBA 5DCBA 3NNTA 1ME8A 1W3IA 1H7WA 3NZ1A 2VXNA 3TR2A 1YDOA 1I45A 2A4AA 3USBA 4N2YA 3I65A 4LTSA 1J5TA 1VCVA 4U4MA 3W7MA 3TXZA 5H2ZA 4TU1A 1SW7A 5HR7A 4PCFA 2YPIA 5F4WA 1EP3A 5C55A 4JIPA 1HFBA 1JCLA 1OK6A 4QSHA 4UCGA 2ZZ7A 2JGQA 4QIUA 1LOLA 4RCXA 4IOTA 4RV8A 5K7JA 3DI0A 4R7JA 1SO4A 5KMYA 1YDNA 3OBKA 1JRBA 4RKAA 4MUZA 2Y7GA 4DF2A 3TV8A 2A6NA 3BV4A 3FKRA 4MOZA 5AHNA 1GJPA 1KFKA 2R14A 4NUWA 1ICQA 5K3VA 5HULA 4FIQA 2FIQA 4GJ1A 5BNKA 4GFSA 1A5CA 1XDMA 4FNTA 3EX3A 3DBPA 4HPJA 5AC7A 3ZR4A 3DXIA 4YCPA 4BWLA 4PTNA 5EBUA 3W1UA 2BXVA 3O16A 3UWYA 5IBXC 2TPSA 3O1NA 2TMDA 3M6YA 3GNNA 4ADUA 3GZ3A 2ALDA 4Q32A 1WBHA 4NNCA 2CLHA 4RXGA 2NWRA 1IGSA 3G1AA 1L6YA 3RMJA 4FNQA 2B7NA 3P62A 1YXYA 2DJLA 2YYTA 2H3DA 3TSMA 1KW1A 3C61A 2HMCA 4JS3A 2G95A 3LB0A 3AJXA 3UWQA 4MLRA 1JCXA 4WX2A 3B4UA 4C1KA 1QFEA 2C14A 3TDFA 4M6PA 4PA8A 3RFAA 1PV8A 3M44A 1THFD 2Q8LA 2P0OA 3S1VA 4NJKA 1JQVA 2V5BA 3TROA 4JTKA 3MWAA 3N9SA 3C2VA 4I7UA 5HMSA 1FXPA 2DZUA 3PF3A 4WQ6A 4IMDA 2A7NA 2J24A 4R34A 3DKJA 3L0KA 5D2TA 3KAOA 4RR4A 3PG8A 3PY2A 1YDVA 1QWGA 2WQPA 4AEOA 4CNNA 3PVFA 2CZ5A 3UWVA 5KITA 3STFA 4LW7A 3QW4B 5DN1A 2ISSA 4NJJA 1JULA 3CLMA 5CZTA 5AYXA 4JEQA 2QUVA 3DZ1A 2E6FA 3W9ZA 3H55A 4XUGA 1VZWA 2FQIA 3EKZA 1YLVA 2QAPA 3MHFA 3LX9A 1N8FA 2J9XA 1XI3A 4FXSA 2ISVA 4L4MA 3BARA 4JDBA 2LLEA 1ZCOA 3OEXA 3PBUA 3C2EA 3B0PA 3KOFA 3CTLA 2CLKA 4GE8A 1TMHA 5L6UA 5DBTA 3B04A 1X6UA 3GVGA 3VE7A 5LKYA 3IVUA 3L5AA 3EX6A 2CLMA 3KX6A 1HUVA 1LRNA 1RD5A 3W07A 3H53A 3KHJA 3DAQA 2X30A 2DJXA 4UUIA 3G18A 4HHPA 4K36A 5FEPA 4QM1A 3LTPA 1VS1A 4POCA 3QSRA 2OZ0A 4HIBA 1MEIA 2QAFA 4MZYA 3SGUA 4XTIA 5D33A 1LM1A 4L4LA 5KZEA 1GWJA 4AAJA 1ME9A 3JRKA 3EEGA 4R53A 2FTPA 3W2MA 4DF1A 1L2UA 4FX7A 5D2XA 3A24A 5C54A 1GVRA 1FCVA 4H3DA 3A23A 1WDWA 5U4NA 1R2RA 1K8YA 4CQAA 1GVSA 5F1UA 1IXPA 2ISWA 3TFXA 3A9IA 4ORIA 3KVMA 3MP5A 5TBOA 5A5WA 4E38A 5MHBA 2VEPA 2AGKA 4RXFA 3NQMA 4HN4A 3WK1A 4EOUA 3MUXA 4O0KA 3EX2A 3FEMA 1KLYA 1F6PA 3GKAA 3C3NA 3LRLA 2NXGA 3NQFA 4UMAA 3C2FA 4WOZA 1OX4A 1TREA 4NNBA 5K2ZA 5AYZA 3M5YA 5D37A 4IJBA 4WZHA 4A29A 3B05A 1LBLA 3GR8A 5CGQA 3P80A 3HQ1A 2CLEA 4TMBA 1MSSA 3DFPA 3MI2A 4JYEA 4MPQA 5LZLA 5AHIA 4E2BA 3MYOA 4LUJA 3M16A 1Q45A 3G8EA 3O6CA 1WOBA 5AC8A 1O4UA 3NL3A 4QJ1A 1TPH1 1K03A 1H61A 2C18A 2HSAA 1WBJA 4EVZA 3L2IA 1SFLA 3HO8A 3S5ZA 3LERA 3T55A 3NO5A 4W9TA 1YADA 4MZ1A 4QAIA 4MIMA 1I2RA 3W2NA 3W2UA 4M19A 4JTIA 8TIMA 5TQLA 4CNPA 3NEVA 1O95A 1LP6A 1K8XA 3LHWA 5K9XA 4DBDA 1SW3A 1KV8A 1TTIA 3L68A 4JGDA 1I2PA 4O10A 4I9AA 3RLVA 5G4WA 5HQEA 4XBSA 1AW5A 3Q37A 1CI1A 4YLWA 3C8FA 1KLZA 5C6MA 2Y61A 1LOQA 1TV7A 3KXQA 1A5BA 2NZLA 2I1OA 4JTFA 5I3FA 4FIRA 4IXXA 2WSYA 4O53A 3TIMA 4IWWA 3LLFA 1HO4A 4O54A 3IEBA 2P10A 1LORA 4WY0A 5FF3A 2VFIA 1U5JA 3IIOA 4Y9AA 1H7NA 1UJPA 3BG5A 4P61A 4OU1A 1EA0A 1RR2A 5K9CA 4N9CA 1JCNA 1ZAJA 1A5AA 4M6VA 4TO8A 2X2GA 2Y85A 3W7IA 2ZZ5A 3EWUA 3Q94A 3P5ZA 1EB3A 4UTLA 4N4QA 2O7SA 3L0GA 2C15A 2V8ZA 3O07A 2VEIA 3GDMA 1T96A 1DJQA 1VH7A 1XBVA 4MLJA 1GEQA 3DFOA 5KSWA 1I2OA 1OABA 5HUOA 1KM6A 3LI1A 4MFEA 1DORA 1OX6A 3G22A 3MO7A 3L21A 1KTBA 2CZEA 4IMEA 2QDHA 3Q58A 1P4CA 4X2RA 5LHEA 3RLUA 3UPBA 1R2SA 2WNNA 3PBVA 5I3GA 4LV4A 3FS2A 3HJZA 4UTUA 1DQXA 4J9JA 4RLIA 5CZJA 2BZNA 3UXDA 4RZ5A 2B4GA 1KFJA 3G1FA 2ZZ6A 1QMLA 4PH6A 1B4KA 4AHPA 3GDRA 3FYOA 4LVFA 3M47A 1B4EA 1XM3A 1YPIA 3TK7A 3GDKA 1C8VA 2RDTA 4JTTA 1JUKA 2PC4A 4JTEA 3WFAA 1FDYA 3FKKA 4ZMGA 1VJIA 2ZRXA 1FWRA 1KM2A 3R2GA 1WOAA 3O06A 3O05A 1KV5A 3CHVA 3NL6A 3HMJG 1JJKA 3TW6A 2GQ9A 5DXXA 4NJHA 3W72A 3IGUA 4RZ6A 3D0CA 3LI0A 3I6RA 5D30A 3E96A 3Q2DA 2Z0IA 4M5PA 3A21A 4O12A 5AFDA 1SUXA 5I3HA 1JRCA 4FB7A 4UFIA 3W1NA 2CLFA 3NQGA 3OVRA 1IIGA 2QDGA 3F4WA 3EXSA 1BEUA 1VHNA 2Z1BA 3KFTA 3W83A 3IRDA 2WJZA 1VYRA 4GUHA 4WJEA 1OFQA 4E2DA 2C0AA 1VHCA 3QYQA 1O60A 3GKFA 3FOKA 3TSDA 3TQKA 1GT8A 1TJPA 3CEUA 3TA6A 4GUFA 1G6CA 4MY8A 3W7EA 4XBKA 2EPHA 4KFNA 3W1QA 2QUUA 3G24A 5G4EA 2CLLA 1V5XA 1ADOA 3ABQA 1VYSX 3W7PA 1H1YA 3W85A 1J2WA 1EWEA 5AC6A 2Y88A 5CPNA 1XUZA 4LVAA 3HF3A 4EWND 1VLWA 5A8GA 3P84A 1R30A 4AF0A 5HINA 2RFGA 3HB9A 1F76A 5EPDA 3RU6A 4UNKA 1I8JA 4K39A 4UR7A 3LBCA 4JTJA 2C13A 3F4NA 2CLIA 2QKFA 2VKZG 5DBUA 5D04C 1KFCA 1PCWA 3NAVA 5AHLA 3C52A 1RPXA 2DU2A 1OFPA 2E6YA 3QQ0A 4O1CA 2V2DA 4MY1A 4LT9A 3FIGA 1TPB1 2V0TA 3TAOA 1LOSA 1SR9A 1KTCA 1LRTA 3MP4A 5D05A 1G4SA 3TUUA 3B03A 2ATMA 3LXCA 4WY0B 3W74A 4DO5A 1W37A 3GR7A 4O15A 3P74A 4NQ1A 3W70A 3QEZA 2HS8A 1HO1A 3MYPA 3HG5A 4FNPA 3M0ZA 3MW7A 3PSVA 2B7OA 1M5WA 4NNAA 2C3ZA 4IPIA 3T78A 2WSRA 2WNQA 2QCLA 4NJGA 2Y7EA 2PRLA 4ALDA 1XUUA 1A5SA 1PCKA 4AMAA 1IIHA 3L67A 3NPUA 4LV9A 3VNDA 4IXHA 1KFEA 3EWYA 1FXQA 3AO0A 3LV5A 5J5RA 5DCEA 2DZXA 1WA3A 2B7QA 2ZRYA 4TMCA 2ZRUA 3W7JA 1W56A 4ZQRA 1KM4A 1GYLA 2RDWA 2Z6JA 4AHQA 3IV3A 1EUAA 2X1SA 3O63A 3W23A 1TPVA 3QSTA 4WOQA 3VI2A 1TYGA 4IX2A 4K37A 4UTTA 4XTDA 2Y62A 4FEZA 1DJNA 1JCJA 3DGRA 3LOTA 1NAL1 5G1TA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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