2C0HA

X-ray structure of beta-mannanase from blue mussel mytilus edulis
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
AAVRLSVSGTNLNYNGHHIFLSGANQAWVNYARDFGHNQYSKGKSTFESTLSDMQSHGGNSVRVWLHIEGESTPEFDNNGYVTGIDNTLISDMRAYLHAAQRHNILIFFTLWNGAVKQSTHYRLNGLMVDTRKLQSYIDHALKPMANALKNEKALGGWDIMNEPEGEIKPGESSSEPCFDTRHLSGSGAGWAGHLYSAQEIGRFVNWQAAAIKEVDPGAMVTVGSWNMKADTDAMGFHNLYSDHCLVKAGGKQSGTLSFYQVHTYDWQNHFGNESPFKHSFSNFRLKKPMVIGEFNQEHGAGMSSESMFEWAYTKGYSGAWTWSRTDVSWNNQLRGMQHLKSRTDHGQVQFGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-Dimensional Crystal Structure and Enzymic Characterization of Beta-Mannanase Man5A from Blue Mussel Mytilus Edulis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MANNAN ENDO-1,4-BETA-MANNOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Mytilus edulis
total genus 141
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2c0hA00
1QI4A 1GJWA 3ZOAA 1MW3A 2JIWA 1E5JA 7A3HA 3BMVA 2D20A 5C8BB 3UG3A 4QAWA 4HOZA 2BHYA 2J7DA 2XM1A 1WZLA 1TG7A 1JFHA 4CKQA 1YHTA 4D6IA 4WKHA 1XSKA 1QOXA 3VPLA 4D6GA 1PX4A 2VO5A 4HTYA 3WQ8A 1E56A 3NDYA 3MS8A 3ARZA 3K4AA 2BY3A 1BF2A 2W66A 1CLVA 1ISXA 4XV0A 2WMIB 3VIMA 1E6PA 4Q7NA 1GONA 4OZOA 1HKIA 3WNOA 4MB1A 1DWAM 5CXPA 5A6MA 5DMYA 4MADA 3SEPA 4D1JA 2WSKA 1GQIA 3FNDA 2XJ7A 4NI3A 3W37A 3WH5A 2C8NA 4CD4A 1KB3A 2W91A 1V6UA 1TA3A 2Z1KA 4QLKA 4BCEA 2A3AA 2ZX7A 4U2YA 1WKYA 2WMFA 1Q6FA 2NSXA 4BZYA 1WDSA 2CBVA 4H8UA 1HKJA 1QNSA 1W3HA 2BNJA 1CXKA 5I23A 3A4AA 3I3EA 3OGVA 3L2LA 1V08A 1EQCA 3NSNA 4PMNA 4UZUA 4S3KA 1LL6A 1CLXA 3CHFA 3CUHA 3UETA 4AEEA 3MANA 2WBGA 1EH9A 3WF4A 5EFDA 1KCLA 3WMSA 1J0ZA 3MMUA 2GJPA 3SIMA 1FP9A 1QBBA 4HZ7A 2ESCA 1JAKA 3AOFA 2G41A 4M82A 4UFLA 5DEZA 2G3JA 2VR5A 1RP8A 3TTYA 1KXTA 4GKLA 1BHGA 1H0IA 5JUVA 1D2KA 1B90A 2WMGA 2XFRA 1RH9A 1U30A 3AQUA 1UD3A 1C90A 2XPKA 3TTQA 1SMAA 3L4ZA 5CPSA 3VIJA 2J7FA 2WB5A 1D3CA 1E72M 2DT1A 3KE0A 2Y8VA 3PZMA 4LGXA 1QW9A 1MXDA 3BXWA 3SCUA 3CZJA 1JFXA 4V28A 1UQZA 1OT2A 1F4HA 1VEPA 3WH6A 2CITA 2D2OA 1OM0A 2X1IA 5M3WA 2WYSA 4JFVA 3SCSA 2C7FA 2EPNA 3SCQA 1GOWA 3AS1A 3ARTA 4UTFA 3K46A 3WQ6A 1MWOA 3OZOA 3WEZA 1JZ4A 3VILA 2OSXA 3AJ7A 1J0YA 5ABFB 1HJUA 3UR7A 4UOQA 2GSJA 3EBVA 4TTGA 4W8BA 3CZKA 4B9ZA 3VD3A 4OUEA 4UOZA 4PMRA 1UWQA 4UFJA 2CETA 3ZM8A 5FIPA 1LJYA 1Q6EA 3VIIA 2YL6A 1HVQA 3WQWA 1BG4A 4U3CA 3VVGA 1PX3A 3MUAA 4AW7A 1BVNP 1EOKA 3MSDA 4N0RA 2ZWYA 3VIFA 2J7CA 1UOKA 3WF3A 4RE3A 4E8DA 4LYPA 2J8FA 2J62A 2EPKX 1E43A 3FN9A 4U2ZA 1SMDA 3DYPA 4WKAA 2OYMA 2B31A 2V38A 5E6YA 1WZMA 4W93A 2V3FA 2V3DA 2JALA 3AHZA 3N15A 4CU8A 3TA9A 1VFFA 2RGLA 1PIGA 2J77A 1GVIA 3BLPX 5AC5A 4CN4A 1RD6A 5C71A 2XHYA 4QCFA 3GNRA 4JL2A 4FMVA 5D4YA 5I0DA 1VAHA 3OGRA 8A3HA 1WPCA 1BLIA 1E73M 4W5UA 2ZUWA 1BGGA 1QI5A 3CBWA 4JIEA 3CPUA 3CUGA 2CXGA 2VNCA 3WMBA 3A4XA 1ISYA 3ZIZA 1XYFA 2XVPA 4J27A 1TVPA 2YLAA 1VENA 4ACYA 1E1EA 2XTKA 1H5VA 5AC4A 5FL0A 3ZMRA 5I79A 4GZJA 2BVYA 3KL5A 4DM1A 3CMJA 5A3HA 4A3HA 2J79A 5F7UA 1AMYA 3MMDA 1PAMA 1X1NA 1JNEA 2XVLA 4U31A 4UQEA 3SCOA 2PWDA 1VEMA 1F4AA 3IANA 4GZIA 2WMJA 5HNNA 3W25A 5BXTA 5A6BA 3WENA 3EMQA 3T0AA 4PN2A 1KR1A 4L4OA 1XH2A 2BY1A 2WMHA 1V0LA 1H1NA 2HVMA 3ZO9A 4W84A 3HU7A 3IAPA 2WZEA 4JKLA 1OD8A 4W87A 3M6DA 5JBEA 3BCFA 1HT6A 3PTKA 1QVBA 1JIBA 1EO7A 1HF6A 5ABEA 1GOQA 3VDCA 1YQ2A 2JFEX 4AISA 1CXEA 4CD7A 5I78A 1OGBA 4OBSA 1GCYA 3CHDA 5DFAA 1JXKA 1MQPA 3WDPP 5FCZA 5ABGA 4FLRA 3GXFA 3POCA 3ARQA 1QHOA 2JF6A 1PX8A 3OBAA 4V27A 2AAAA 1K6AA 3WUEA 2WVSA 3VIOA 1E4IA 1MXGA 3WFZA 4UQBA 1NP0A 1J11A 6CGTA 3BAXA 3ARPA 1HJVA 2ZUNA 2CESA 5M17A 5BRPA 1JI2A 1H4PA 3U5YA 4AD5A 2O9OA 5GNYA 2WMIA 2CHNA 4ZEPA 1V02E 1WDPA 4FLQA 4W7UA 1V3LA 2E9LA 5BXRA 1E9LA 1OT1A 4JFUA 4KH2A 2ZUUA 4AIEA 4GIAA 2ZOXA 1FA2A 4BS0A 4CU6A 1E0XA 3II1A 1EQPA 1XSIA 2D23A 4PMQA 1LG1A 3BAWA 1ZJBA 2V5DA 3OG2A 1IZJA 4P7QA 4PMYA 3WF1A 4WF7A 1DEDA 1JZ3A 5A8QA 1X6LA 4GO9A 4ZXOA 1B3ZA 3VKKA 1WB0A 2GDVA 2J47A 4M29A 2E40A 1KR0A 3RM9A 1JGIA 1CGVA 1XH0A 1UZ4A 1MW1A 1E40A 3HMCA 4PTMA 3T2OA 4MB5A 2WSPA 1US2A 1HX0A 4YPJA 1PEZA 1GOKA 3VD7A 3CTTA 5A8MA 1H11A 2PB1A 3WUFA 3K8MA 3PZIA 3QGVA 1ZBKA 1HVXA 3CLWA 4M24A 2VUYA 4GPNA 3WY1A 1NOWA 4CD5A 4H2CA 5FKYA 5EB8A 3L4WA 4A4AA 1WE5A 1UWIA 1UD5A 2WHLA 4ZENA 1JI1A 3EDFA 3ZT7A 3NYDA 3PZNA 2YBTA 2W61A 1JAEA 3PZUA 1LG2A 5I77A 3W38A 1C7SA 3L2MA 4J3XA 2Y5EA 5HDRA 4D6HA 1C92A 5IXEA 1LQ0A 1KQZA 5A6BD 1XCXA 1H09A 3ALGA 3G6LA 1W1PA 3TTOA 4MAZA 3VGFA 5HOSA 2YA1A 1WZKA 4PMZA 3VTRA 3FHAA 1H2JA 2JIEA 4N42A 2W67A 1CEOA 5IFPA 3AIUA 3BC9A 4M56A 4BQ5A 1JYWA 4TX6A 3DC0A 2DIEA 3N04A 1MW0A 1UH4A 5D9NA 1UD6A 3PN8A 3N18A 3HN3A 3U5UA 3WD3A 3VGBA 1A3HA 1BYCA 2F2HA 5ABFA 1DTUA 3BGAA 4J3UA 1B0IA 3T09A 5IFTA 1FFRA 1NWUA 1CGXA 4CUCA 4JHOA 1HKKA 3FXYA 3W29A 3AMKA 1WCGA 1UKPA 4HMDA 4X9YA 4DUXA 1FOBA 3WBEA 3VDAA 1K9EA 3VD9A 2OSYA 1Q6CA 2WXDM 5HPCA 1GUVA 1MQQA 3APGA 2TAAA 1JZ7A 1ZS2A 4FLSA 3CUJA 5JBFA 3GZAA 1W2VA 1JD9A 2EEXA 3RM8A 3WH7A 1Q4NX 1UWUA 4AD4A 4W89A 4OOZA 1UH3A 2CERA 4J7RA 3WUBA 4D6DA 4UR9A 2GJXB 2VZUA 1CPUA 2CEQA 2WMKA 3VDBA 3AIRA 1FH9A 2WC4A 5JIPA 1PZ3A 3WDIA 1E6XM 3MO4A 5E6ZA 3GXIA 1QI0A 3TP4A 2UY2A 1CWYA 2PC8A 4BF7A 1R8LA 1FHDA 1UKTA 3DHPA 4TXEA 4Z2LA 3U57A 1CGTA 4MDPA 3WF2A 3PBGA 4AZGA 2OLHA 1V6WA 3THCA 3AHXA 1VB9A 1H0GA 1BGAA 1V0NA 1BYBA 2UY4A 1W1TA 4Z2HA 2NT0A 5A6SA 1ODZA 3LPFA 4E8CA 3VDHA 2A3EA 1J9YA 1PZ2A 4OBRA 1KBBA 2G3MA 3KZSA 4P7LA 4CCEA 2FDMA 1AQ0A 1EGZA 1V3JA 2BV9A 2RGMA 2OWWA 1HJQA 2IXVA 5A6KA 4HA4A 1DWIM 2XYLA 5JBDA 1KWKA 4WKFA 4CD8A 1CXIA 1E3ZA 1WZAA 5CLWA 3OA5A 4EK7A 2HISA 3OLGA 3AHVA 2VX4A 1HJWA 1UR1A 1HL9A 3BCDA 1CGYA 3B8SA 1GW1A 3CZGA 4HPGA 2VRJA 2VOTA 2CPUA 4P8UA 2WC3A 1W9BM 3GM8A 3OLEA 1ZBWA 4H8HA 1NM9A 2DIJA 4UNIA 1PPIA 1E3XA 4HU0A 3S2CA 4CN1A 2YA0A 1UR0A 1V02A 4NZCA 4UFMA 5CPQA 2VURA 5HBFA 3NSMA 1IV8A 5D9PA 3W82A 1ZB5A 3BSHA 4TTUA 5IDIA 3W6MA 4GXPA 3VIGA 3ZJKA 3SCPA 2E3ZA 1OIMA 4W88A 2DSVA 1QNOA 2VRKA 4E4PA 2CYGA 2JEQA 1TVNA 3AMGA 2D0HA 3GNPA 1NQ6A 2EBNA 2Y4SA 4ZXLA 5LA2A 3ZJ7A 1UQYA 4OOUA 2O92A 2VMFA 1DWFM 3A4WA 3PZGA 2XGBA 1UH2A 4MDOA 5A1AA 2QHAA 2VZOA 4JFTA 2E0PA 3ZJ8A 4LX4A 1Q6DA 3UEQA 1VJSA 4MJ4A 1GOMA 3AROA 2V3GA 4GINA 2PWEA 2DH3A 3WUGA 3BLKA 4C7GA 4HOWA 1C8XA 2VJXA 4KGJA 3WIJA 1OIFA 5D9MA 2GK1B 4UQAA 4CD6A 3ZR6A 1I1XA 1E6ZA 5AYBA 4IPNB 3VINA 2DQXA 4CCCA 4J3SA 3WQ5A 1LLOA 4AD0A 1E15A 4AY1A 1UR8A 1BSIA 3ZR5A 2CBIA 4Y7EA 4HPHA 4W7WA 4OJYA 4OIFA 3WQVA 4MNKA 3CHCA 2FH6A 3E1F1 1JD7A 2BY0A 4PSPA 1KXQA 3QHMA 5ECUA 2WVVA 2EQDA 3QHNA 2VX7A 5CJ5A 3FY1A 4P7RA 3WD4A 3RCNA 4H7VA 5FOOA 2PI6A 3WNNA 3EDEA 1W9PA 3UG4A 2FGZA 3THDA 1J0JA 3GH4A 1PIFA 1LWJA 3EDJA 4JFWA 4TOQA 5CGMA 2QF8A 2PWHA 5C70A 4L4PA 1CIUA 3QHOA 3SUWA 1VBUA 1V0MA 4AIUA 4MPKA 1E4LA 3W6LA 1C3FA 3KWXA 1L0PA 1JYVA 3RMEA 1MYRA 2QPUA 2YDSA 1HP4A 4TVCA 3ZJ6A 5BXSA 2QMJA 1ECEA 3AS2A 1TUXA 4ZE4A 1M7XA 3FAXA 1JZ5A 3U7BA 2E9BA 4Q22A 4JAWA 1BFNA 4U33A 3F5JA 4TX8A 1Y7VA 2QMKA 3RDKA 1JF5A 1B30A 2EO7A 5GNXA 3AIEA 3BAKA 1HIZA 1UWTA 2J7EA 3ZSSA 2XSAA 1M04A 1JDDA 2ZXBA 2VT0A 2VQUA 4UOJA 5ABHA 1E6QM 1E71M 4B3LA 1KFWA 2YLLA 3AZSA 3EDDA 5DO8A 4PRWA 1B3WA 1W2PA 5GNZA 4F9JA 2GJRA 3IJ9A 2UY3A 1DP0A 1CXFA 4ZE5A 2J8GA 2WKGA 2CNCA 6A3HA 1FH7A 4QLLA 1HL8A 3RJYA 1M53A 1WNOA 2MANA 2XIIA 1NWRA 1E6NA 4UFHA 3CO4A 3WMCA 2E8YA 1FH8A 1VIWA 5E0FA 1V0KA 2EJ1A 3WDQA 1VJZA 4OKDA 1UG6A 3T08A 4NF7A 1GQLA 2D0FA 4C7FA 2J78A 3VGGA 3GXMA 1HKMA 4R5EA 5A8NA 3PTQA 4LQ1A 2YL5A 2PBGA 3OGSA 1W1VA 2VRQA 2GJXA 4BQ4A 3ZSTA 3ALFA 3PZTA 3ZT6A 1ZBCA 3W4RA 3TOPA 1EHAA 5A6LA 3QR3A 1B3VA 2WHMA 5IHRA 1CXHA 1I75A 1UUQA 2CCRA 1R85A 2Y2WA 1CTNA 1QHZA 3T0BA 4D72A 1QPKA 4LYRA 4R27A 1XYZA 2D1ZA 3CMGA 2WLYA 5AYIA 1CECA 2J4GA 4S3JA 3VM5A 3O2LA 2YJQA 3WNMA 2W5FA 3AXIA 4QFUA 3GBDA 4HZ6A 1H3GA 3POHA 3ARUA 1KGXA 3ARSA 4GI6A 3OLIA 3F5KA 2BFGA 2XFYA 2VZSA 4CVUA 2ZUMA 2X0HA 4JKMA 4M1RA 2WHJA 1A47A 4LYQA 3QOMA 1C8QA 4IUGA 4WSKA 4P7OA 1R86A 3W24A 1E5NA 8CGTA 4H8VA 3QOKA 1UYQA 1V3MA 3J7HA 1UD2A 3PHAA 3SCWA 1FFQA 2ZICA 1TMQA 1GOIA 2CHOA 2ZWZA 4MB3A 3K8KA 1UD4A 2VR4A 3PZQA 1EA9C 1CNVA 1ISWA 1UD8A 2PWFA 1J10A 4AZCB 4AZ6A 1B9ZA 1TFVA 2YA2A 1ISVA 1ITCA 2F8QA 4P8VA 5A2AA 1V3HA 3EYPA 2XVKA 4HOXA 3WD2A 1U2YA 4NSBA 1XD0A 2WVVB 3MV01 1ZJAA 1VFMA 3L4VA 4U5IA 4HMCA 1XV8A 4MJ2A 1E6SM 3L4YA 4GO8A 2J7HA 4TVDA 4X0NA 1GHSA 1WO2A 5A8OA 1J12A 3ARYA 1FP8A 2WZHA 4P7NA 1CZ1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QI4 A;  1GJW A;  3ZOA A;  1MW3 A;  2JIW A;  1E5J A;  7A3H A;  3BMV A;  2D20 A;  5C8B B;  3UG3 A;  4QAW A;  4HOZ A;  2BHY A;  2J7D A;  2XM1 A;  1WZL A;  1TG7 A;  1JFH A;  4CKQ A;  1YHT A;  4D6I A;  4WKH A;  1XSK A;  1QOX A;  3VPL A;  4D6G A;  1PX4 A;  2VO5 A;  4HTY A;  3WQ8 A;  1E56 A;  3NDY A;  3MS8 A;  3ARZ A;  3K4A A;  2BY3 A;  1BF2 A;  2W66 A;  1CLV A;  1ISX A;  4XV0 A;  2WMI B;  3VIM A;  1E6P A;  4Q7N A;  1GON A;  4OZO A;  1HKI A;  3WNO A;  4MB1 A;  1DWA M;  5CXP A;  5A6M A;  5DMY A;  4MAD A;  3SEP A;  4D1J A;  2WSK A;  1GQI A;  3FND A;  2XJ7 A;  4NI3 A;  3W37 A;  3WH5 A;  2C8N A;  4CD4 A;  1KB3 A;  2W91 A;  1V6U A;  1TA3 A;  2Z1K A;  4QLK A;  4BCE A;  2A3A A;  2ZX7 A;  4U2Y A;  1WKY A;  2WMF A;  1Q6F A;  2NSX A;  4BZY A;  1WDS A;  2CBV A;  4H8U A;  1HKJ A;  1QNS A;  1W3H A;  2BNJ A;  1CXK A;  5I23 A;  3A4A A;  3I3E A;  3OGV A;  3L2L A;  1V08 A;  1EQC A;  3NSN A;  4PMN A;  4UZU A;  4S3K A;  1LL6 A;  1CLX A;  3CHF A;  3CUH A;  3UET A;  4AEE A;  3MAN A;  2WBG A;  1EH9 A;  3WF4 A;  5EFD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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