2CBUA

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with castanospermine
Total Genus 182

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
444
structure length
440
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEKDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPDAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Dissection of Conformationally Restricted Inhibitors Binding to a Beta-Glucosidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
total genus 182
structure length 440
sequence length 444
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cbuA00
4W93A 3SCWA 1SMAA 3UCQA 1YHTA 2WNWA 4Z2GA 3A4XA 2YA0A 3AMGA 3AHTA 2WZHA 1HJVA 1CDGA 4B3KA 4AISA 2CCRA 2JF7A 1VFOA 2EPOA 3M6DA 1WCGA 3AQUA 4JFWA 3WF1A 1HKKA 4PRWA 4W7UA 5A69A 4Z2IA 1JYXA 2OLHA 3RM4A 3SCVA 3AS0A 1WZKA 2WK2A 3VD9A 2BHYA 5AYIA 1E1EA 1ZJBA 5CLWA 3ARVA 3GXMA 1E70M 1E73M 4KRTA 4NSBA 1MW1A 1V6VA 1B3WA 5HNNA 2OSXA 3WD3A 1KBBA 1B0IA 3IJ8A 5D9NA 4Z2JA 5JIWA 2X8RA 2AOSA 1Q6CA 3WMSA 5C8BB 1MW3A 1RH9A 2ZX7A 4PMNA 3L4XA 3T2OA 3W53A 7CGTA 4F79A 4HOXA 3LPFA 1TVPA 3GXFA 4D6IA 2QF8A 2OWCA 2WCGA 3WH9A 3PZGA 4J3TA 1HX0A 4JFVA 1WDRA 1UZ1A 2QPUA 5I3DA 5CXPA 1C7SA 2XIBA 4ZE4A 3T0BA 4MNLA 4UR9A 1CGWA 1HJUA 1ITXA 1GONA 2FGLA 1ZBKA 1WAWA 1H49A 1XYZA 5JBEA 2PI6A 5CJ5A 1BYAA 1DWGM 4PMUA 3OZPA 4C7GA 4TXEA 3AZSA 3JUGA 3WD0A 4XZWA 1EOMA 1L8NA 4ACZA 4GQRA 4F9JA 1TG7A 3SCSA 4Z2LA 1BGAA 2OYLA 4GXPA 1UR4A 5ABHA 3VO0A 2VJXA 4FLQA 3QGVA 4UZUA 2PWDA 1KBKA 3F4VA 2CHOA 5HDRA 1FP9A 2VT0A 1NM9A 3F5JA 3CZKA 3T2PA 2W67A 4JKKA 4XUYA 2WCSA 1HKJA 2DDXA 1C92A 1IZJA 1GJWA 1UKSA 5E09A 2RGMA 1HP4A 4P8UA 4W86A 2XWDA 3N18A 4MB4A 3RIKA 3D3AA 1GORA 3CZJA 1WNOA 2WKGA 2J7FA 2PWEA 4XZBA 4BQ3A 3RJYA 4UQEA 2FDMA 1ITCA 3B9AA 3BAXA 4A3HA 4CN1A 4AIUA 4BF7A 4UCFA 1EDGA 1WZMA 2YBTA 1FP8A 1G9HA 5A8NA 3T0DA 2C7FA 4M81A 2V3EA 3VTRA 5D9MA 1LQ0A 2UY2A 1CEOA 1H0GA 1QNRA 2D0HA 4MAZA 1VJZA 2PBOA 3ZOAA 2W61A 4AIEA 3MUZ1 1E4LA 2DPEA 1E5NA 2FHBA 3ZQ9A 1HJQA 1E72M 1JNEA 2ZX5A 4UOZA 1FA2A 1UWIA 4BQ4A 3K46A 1ODZA 1H5VA 3MUIA 3PZNA 1BYDA 2CXGA 3W4RA 4DWSC 5JUVA 1E6PA 2E9LA 4IUGA 1QHZA 4NZCA 3WH7A 4DUXA 4PSRA 4R5EA 4CD4A 2XSBA 1C90A 1E0WA 1H11A 1BF2A 1EGZA 4AC1X 4H8HA 3W27A 5AC4A 3WDPP 3K4DA 4CD8A 3N12A 4AZBA 4PUEA 2WMIA 1MW2A 1R85A 1JYWA 4DWSB 4AZCA 1LLOA 4HZ6A 4D1IA 3FY1A 1VB9A 4M56A 3S6TA 2GJPA 3NDYA 2VO5A 2YL6A 1JD9A 4PTWA 5BWFA 3VNZA 1W2VA 1W9XA 4QCFA 1CZ1A 1HJSA 2WBGA 2FHFA 4B15A 1L0PA 1J01A 2W4XA 3AMDA 4U3CA 2YL9A 1WP6A 1HL9A 2ZOXA 2DT3A 4B9YA 3CUJA 2ZUSA 4FLSA 3ARTA 4ZFMA 2VI0A 4OKDA 1F4HA 4FLRA 2O9RA 5CSYA 3ARPA 1XSKA 1JZ7A 4QLKA 2VX4A 3W37A 3W6MA 5A3HA 1ISZA 1GW1A 5E70A 2GJRA 1NP0A 4CU6A 1XSJA 4QFUA 3SURA 1MYRA 1E71M 4KH2A 3W28A 1GPFA 1HP5A 3ZJKA 1CGTA 3CLWA 3L4WA 4AD5A 4OZOA 1E6QM 1G1YA 1C93A 4OBRA 5FL0A 4KGJA 5DEZA 4PSPA 1TMQA 5LA2A 3WF0A 1JXKA 1WB0A 1XYFA 1RP9A 4CCEA 4EE9A 1CPUA 3KL3A 3GNPA 4WJXA 4BQ5A 5BROA 2XJ7A 2W92A 3GM8A 3PTKA 1AQHA 3VGBA 4V27A 1UD2A 4PMQA 3SCNA 1ECEA 1QOXA 4X9YA 1E6XM 1A3HA 3NSMA 3MV11 3NSXA 2OSYA 1JAEA 1B3XA 3WDHA 3T0AA 1TUXA 4J3UA 3HN3A 4IISA 1EOKA 4D6JA 1RPKA 3VDAA 1J0KA 2WMGA 1HT6A 1I75A 3U5UA 3ARZA 4MADA 3CZEA 3VIOA 1H1NA 1V0NA 5KZ6A 3VDHA 3BAWA 4E4PA 3VGEA 4J3VA 2WC7A 4HOZA 2WKLA 4Q7NA 2BVDA 4WLCA 1OT2A 1WDSA 1UQYA 1E3ZA 2WSPA 4TTGA 2WAGA 2J78A 3UG4A 4P8WA 5M3WA 3WQ6A 1JNDA 5A8MA 5LA0A 4UFIA 2VQTA 1PZ3A 2JF6A 1J9YA 3GDBA 2VCAA 2VR5A 3BSGA 3DC0A 2YKKA 5BCAA 2NT0A 2WC4A 3WELA 1GHRA 3EMCA 3L4VA 2D3LA 3KEHA 1C8XA 1W1YA 3OLGA 1TR1A 3F5KA 3OGSA 1VJSA 3FNDA 1M7XA 2J8GA 5FKYA 1TA3B 4P8VA 4C7DA 3HMCA 4LPCA 5ECUA 4TVUA 1QI4A 1WDPA 1HIZA 2X2YA 4N0RA 4JHOA 1VAHA 3WUEA 1VFUA 4M80A 2VCBA 2WC3A 1IT0A 2ZIDA 4PMVA 1BHGA 2CPUA 5EFDA 4CN4A 2DH3A 1JDAA 3I3DA 3HJEA 1KQYA 4HTYA 4UOJA 4HA3A 1LWHA 5DMYA 3ZJ8A 5D8WA 5F7UA 1US2A 1W1TA 2D24A 1AMYA 3WUFA 3WNKA 1BPLB 5A6KA 3POHA 4HA4A 4HZ8A 2Z1SA 1VEMA 3MSGA 3RPMA 2WMJA 4RE2A 4AIOA 4N42A 2ZXBA 3N15A 1J0HA 4F8XA 1XH0A 3MUAA 2VZTA 4E8CA 4CVWA 1I1XA 4KMQA 3WH8A 1ZS2A 1UKTA 3VM7A 3BLPX 1ODUA 3ZJ6A 3W24A 4HU8A 5A6MA 1XH1A 3WY1A 1QW8A 1JZ6A 2IXUA 1UHVA 1S46A 3KL0A 1K6AA 6CGTA 2VNCA 3BXWA 3AMKA 2ZUMA 1GVIA 3AZTA 1JI1A 1CGYA 1E9LA 2Q8XA 3VU2A 4PEEA 2O9OA 2BFGA 5D9PA 1E3XA 2NSXA 3CIVA 4AZIA 1IV8A 2YDSA 4UFHA 4KGLA 1C8QA 5I24A 4GO9A 5ABFB 3BH4A 2VQUA 1JDDA 1ISVA 5E6YA 4H7VA 4DWSA 1EXPA 3AIVA 1KGWA 2PWGA 4QCEA 4WKHA 1F4AA 3FAXA 4AXNA 2CEQA 3APGA 1HVXA 3A47A 3K8MA 4D6GA 3ARXA 2FGZA 2X05A 3CZLA 2D0GA 3M7SA 3CHFA 2ZUTA 1CLXA 2DSVA 3W0KA 2EO7A 4W5UA 4HMCA 1V0LA 2VURA 3SUTA 2DQXA 4P7QA 2WMHA 4M8UA 1KXVA 3TONA 2Y5EA 1WKYA 2VRQA 3GTNA 4UTFA 1CXLA 3WF2A 2J7EA 2Y8VA 3FHQA 4W7WA 1GQLA 3G6LA 3BCFA 4AD2A 3NCOA 4D1JA 1E1FA 1W1VA 1QI0A 5A6AA 1NWSA 1OT1A 1E4MM 1U33A 1CXKA 2VVSA 2BHUA 3T08A 1UWRA 4GZEA 4HPGA 2E8ZA 1CIUA 4TOQA 1NOWA 3CHCA 4LYQA 1NQ6A 1KFWA 3WL1A 2GJXB 2WYSA 5FD0A 1OBAA 1PX3A 2E9MA 4EKJA 2J7GA 2W63A 3QOKA 4H8UA 2J7DA 1C7TA 4YN5A 1UQZA 2OWWA 1BVZA 1D3CA 4PBGA 1CYGA 2VCCA 1OCQA 3TTYA 4HU0A 3SCOA 5EBAA 1E55A 2EXOA 1JZ5A 3MO4A 2EPLX 4W88A 3VMNA 3UR7A 1DWIM 2DSUA 2VVNA 2WHMA 1BAGA 2BVYA 1GOQA 3CUGA 2ZICA 1UKPA 3VUPA 5I79A 1CECA 2JE8A 3IK2A 3SCQA 4RE4A 2O92A 4DUVA 2X1IA 4AD4A 1XV8A 2DT0A 3CZ8A 3VD7A 4J27A 3POCA 1JZ3A 1UD4A 4WSKA 7A3HA 2Y8KA 5HPCA 1UH4A 2WMFA 3EDKA 1XCWA 6TAAA 3OA5A 1CBGA 1W3KA 3THCA 1DWFM 3VIIA 4D6EA 1R7AA 5JIPA 4JIEA 5BXRA 2JEPA 5IHSA 3AIQA 3PZOA 1JZ2A 5BYWA 1GVYA 5KEZA 2DEPA 5A6JA 3DECA 3ECQA 1M01A 3ZSTA 3BAIA 9CGTA 3ALGA 4GQQA 1R86A 1EQCA 5AC5A 4F66A 2VRKA 3LPGA 1QW9A 1FFRA 5A8QA 4XV0A 4PYSA 1A47A 1TA3A 1OB0A 2VUYA 3PN8A 2QHAA 3U7BA 4NI3A 3WDRA 1LG1A 1H0IA 3WQ8A 1UYQA 2E40A 1V3HA 4M29A 4EANA 3E1F1 3TTSA 2XWEA 5A8PA 2E8YA 4LYPA 1X1NA 3AIEA 3ZSSA 4UQDA 4FLOA 3G6MA 2C8NA 3GYCA 2WZEA 4Z2KA 1RP8A 1C91A 1BTCA 4UFMA 2DSZA 4AZ7A 3OGVA 3PZQA 5CPSA 1KCKA 2CETA 4A3YA 2JEQA 1ZBVA 2CHNA 2G3IA 3ARRA 2CKRA 2GFTA 1VBRA 5EFFA 5D9OA 2WSKA 3MU7A 3AXIA 3WNNA 3B8SA 4JKLA 1MVYA 1HKMA 2D20A 1E6NA 3NYDA 3ZT5A 2ZWZA 4B3LA 1E0VA 3BLKA 1WE5A 1VENA 4JL1A 5I2UA 4CN6A 1AQ0A 4BQ2A 2OYKA 4ACYA 3W81A 4D72A 2EPMX 3PBGA 2GK1B 1P6WA 3VGFA 2O9PA 2VR4A 3GNRA 3O9NA 4R27A 3BAJA 4QLLA 3WMCA 1VIWA 4WF7A 1UWTA 2WPGA 2EPNA 1KWGA 3M46A 4UQCA 3PZUA 1W9DM 1PBGA 1XCXA 5DF0A 4HOWA 1V0KA 2PF0A 1XD0A 2B31A 1RD6A 2NT1A 1W2PA 1KCLA 1W9BM 4UQ9A 4U5KA 4C7FA 3OZOA 1GOWA 5M17A 5FIPA 1U30A 1UR1A 1EIBA 2XPKA 3S2CA 3WD1A 5ABFA 5M03A 3NJ3A 1HNYA 1PX4A 3VVGA 3WEZA 1WO2A 3CZGA 8CGTA 3ZR6A 3VIGA 5CSUA 2VZSA 3II1A 3PZVA 1GZJA 1Q6EA 1VEPA 1E43A 1J0IA 1KXTA 3CH9A 3KZSA 4F9DA 3N11A 4H2CA 2YIHA 4XX6A 1CXIA 3NDZA 1ZU8A 2UWFA 1CNVA 3VDCA 1PIFA 3AIUA 1LL7A 2ZXDA 2BHZA 2ZUVA 1B31A 4JHZA 4LQ1A 4V2XA 3CGTA 4AEEA 2D0FA 2VC9A 3O2LA 2WVSA 2XVKA 1KR1A 1ZBWA 2WZIA 4ATWA 2J79A 1BG9A 4UFKA 1EA9C 2BY3A 2BNJA 3AIBA 3RO8A 1LF1A 4QLJA 2ESCA 1UZ4A 3HU7A 2PWFA 4TX6A 2XSAA 1GQIA 1KWKA 3CMJA 1DWHM 4JZ5A 3KE0A 2X0YA 2QLYA 3UG5A 5GNXA 3N1AA 3VD5A 4AD1A 3UR8A 1X6NA 1ZJAA 2V3GA 3VPLA 2GJXA 1R87A 2D2OA 3PZMA 5CPTA 5DT7A 1NWRA 2MANA 2J4GA 3J7HA 3QR3A 2OWXA 3WNPA 2J77A 1JFXA 1FHLA 1PAMA 1ISYA 1GOIA 1FOBA 3WF4A 4AZGA 1GJUA 1OD0A 5BRPA 4GZJA 5BXPA 5BRQA 3RCNA 1E15A 4P8XA 3IJ9A 2J7HA 1ZB5A 1Q6FA 1TZ7A 1XGZA 1FH8A 4NRRA 2GVYA 1JF6A 1V3IA 1ESWA 4CD7A 1BYBA 1H3GA 3VIKA 3AS2A 4AD0A 2EBNA 5CLTA 2FH8A 4U3AA 1CGVA 2J7BA 1NP2A 2XTKA 1N82A 3TOPA 4M82A 4PTMA 2JIEA 4UZSA 3IJ7A 1OGBA 1DP0A 2WANA 4PTVA 1WZAA 2GDVA 2VX6A 2V5CA 2DSWA 3TTQA 3GH7A 3L4UA 2DIJA 3WN6A 3ZMRA 2XFFA 2OSWA 5AY7A 5ABGA 3VMOA 1YQ2A 4MPKA 5I5RA 2QV4A 3DYPA 1BLIA 3ARUA 1W9UA 1D2KA 4W84A 1GNXA 1HXJA 2PBGA 1VRXA 2CKSA 3FAWA 4P7LA 3B9DA 3AICA 2BVTA 5E6ZA 1K9FA 4GKLA 3K8LA 5A6SA 2HISA 4RL3A 1MW0A 1GQJA 1LL6A 1BQCA 5GNYA 1WDQA 4HPHA 1SR0A 2WM0A 5IDIA 5A94A 1UR0A 4IPLA 1Z32X 4MJ4A 4GI6A 3M07A 1TVNA 1G5AA 1O7AA 2E3ZA 3AZRA 1H2JA 5HOSA 4PTXA 5ABEA 1B9ZA 2YDQA 4OOUA 8A3HA 1OSEA 1JL8A 1UWSA 5IHRA 1IZKA 2YA2A 4MNKA 4LGXA 5A6BD 2BS9A 2VX5A 2W5FA 1UG6A 3PZIA 5I78A 1GCYA 3OLDA 2DT2A 3FHAA 3I3EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4W93 A;  3SCW A;  1SMA A;  3UCQ A;  1YHT A;  2WNW A;  4Z2G A;  3A4X A;  2YA0 A;  3AMG A;  3AHT A;  2WZH A;  1HJV A;  1CDG A;  4B3K A;  4AIS A;  2CCR A;  2JF7 A;  1VFO A;  2EPO A;  3M6D A;  1WCG A;  3AQU A;  4JFW A;  3WF1 A;  1HKK A;  4PRW A;  4W7U A;  5A69 A;  4Z2I A;  1JYX A;  2OLH A;  3RM4 A;  3SCV A;  3AS0 A;  1WZK A;  2WK2 A;  3VD9 A;  2BHY A;  5AYI A;  1E1E A;  1ZJB A;  5CLW A;  3ARV A;  3GXM A;  1E70 M;  1E73 M;  4KRT A;  4NSB A;  1MW1 A;  1V6V A;  1B3W A;  5HNN A;  2OSX A;  3WD3 A;  1KBB A;  1B0I A;  3IJ8 A;  5D9N A;  4Z2J A;  5JIW A;  2X8R A;  2AOS A;  1Q6C A;  3WMS A;  5C8B B;  1MW3 A;  1RH9 A;  2ZX7 A;  4PMN A;  3L4X A;  3T2O A;  3W53 A;  7CGT A;  4F79 A;  4HOX A;  3LPF A;  1TVP A;  3GXF A;  4D6I A;  2QF8 A;  2OWC A;  2WCG A;  3WH9 A;  3PZG A;  4J3T A;  1HX0 A;  4JFV A;  1WDR A;  1UZ1 A;  2QPU A;  5I3D A;  5CXP A;  1C7S A;  2XIB A;  4ZE4 A;  3T0B A;  4MNL A;  4UR9 A;  1CGW A;  1HJU A;  1ITX A;  1GON A;  2FGL A;  1ZBK A;  1WAW A;  1H49 A;  1XYZ A;  5JBE A;  2PI6 A;  5CJ5 A;  1BYA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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