2CBVA

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with calystegine b2
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
444
structure length
443
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEKEDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPDAPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Dissection of Conformationally Restricted Inhibitors Binding to a Beta-Glucosidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
total genus 181
structure length 443
sequence length 444
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cbvA00
1UA7A 2D20A 1SMDA 5BXRA 3CZLA 2O9OA 3WD2A 2ZIDA 3MSDA 3W53A 1GZJA 2Y4SA 4HPGA 3WF4A 4JAWA 2AOSA 3RDKA 2DH3A 4MB3A 3K8MA 1MWOA 1UR4A 4WSJA 3VD3A 4OOUA 2E4TA 1TE1A 4QFUA 1ISVA 3FN9A 2XWEA 4GKLA 2VMFA 1JDCA 1JYNA 4W86A 3ZR6A 3E1F1 2CXGA 1KBKA 1M7XA 1JFXA 4UQ9A 5IDIA 5I78A 1GOIA 2XSAA 5A2BA 1HL8A 4JKKA 4GIAA 1J10A 1EO7A 3GXMA 3BSGA 5E70A 3L4VA 3WH9A 2D23A 4XZWA 2FH6A 1KGXA 4W89A 2VNCA 1ZJBA 2FHCA 1XH0A 2JF6A 2ZX9A 3ZSSA 1C90A 1MFVA 3GXFA 4B3LA 4Z2LA 4JKMA 2OYLA 4CN4A 2GK1B 4DWSA 4TOQA 4QDMA 2XM1A 2GJPA 4Z2GA 4JFTA 5I24A 4IM4A 2DEPA 1P6WA 3WNOA 3PZTA 1E9LA 1UR1A 3OB8A 3SEPA 3MUY1 4EKJA 4PMUA 2Y8VA 1XSJA 4U33A 3KL0A 1E1EA 2WYSA 4WLCA 1ITXA 1WO2A 2CITA 4J3XA 2ZXAA 3WSUA 2DT0A 1J18A 1JAEA 3ECQA 2E8ZA 3AHTA 4AEFA 1UYQA 1E71M 2VRQA 2E8YA 3EDEA 2YDSA 3BMVA 4P7OA 4UQEA 4PMOA 2ZUSA 3W6LA 3WL0A 6CGTA 1LWHA 3EMCA 5D4YA 5EFFA 8A3HA 2WZEA 2WW5A 2J8FA 5CLWA 3RJXA 1CXHA 4TVDA 3WQ6A 1Q6CA 1LWJA 3ARUA 2CCRA 2BNJA 2JEQA 3GTNA 1PX3A 2W67A 3HJEA 3ZIZA 5CGMA 2CBJA 4PTMA 3N13A 1GPFA 4B9ZA 3LPGA 4GI8A 5A8MA 1E4LA 5BRPA 2OYMA 4B9YA 3A4AA 4GQRA 4X0VA 5FL1A 2UWFA 4AD1A 2ZUMA 2WK2A 4W84A 3CLWA 5DT7A 3VGHA 2WMJA 4F9JA 1E6QM 3NDYA 1UD5A 3PZIA 1VFFA 3CZ8A 5D9NA 2GUYA 1KWGA 1OIMA 2W61A 1WCGA 1PIFA 3VU2A 1UZ4A 3AIWA 3AZTA 4J3SA 2CKRA 1CPUA 1JG9A 2ZWYA 4UFIA 2DT1A 4FMVA 1HIZA 4L4OA 1U33A 3BXWA 3RJYA 2V5DA 1C91A 2A3BA 4WSKA 1J0KA 5I2UA 4MJ2A 3GXIA 1GOWA 4RL3A 4QLJA 5CLTA 4HZ6A 4PMZA 3VNYA 4MTVA 4HOZA 4N0RA 3CH9A 1GNXA 3NSMA 1XGZA 2C7FA 2CHOA 3VGFA 2PC8A 3PZUA 3VDHA 3UERA 1C8XA 1G1YA 2OWWA 1PPIA 1PX4A 4IPNB 1NARA 1KWKA 2GFTA 1OSEA 3PN8A 2J77A 3VNZA 1WNOA 1V3HA 1G9HA 1KXHA 3W82A 1FH7A 2F2HA 3PTMA 3T09A 1UHVA 1CXIA 3AZSA 2J7EA 4UTFA 4PMVA 1HKKA 2CBUA 4OZOA 4HMEA 3ZJ7A 1XRVA 3SCVA 1CGYA 4CN1A 1UD6A 2QF8A 2A3EA 3POHA 1E6SM 2PWHA 2YDQA 3ARRA 4PRWA 2YIHA 2WPGA 4P8UA 3MU7A 4EK7A 2CYGA 2WZHA 1W3HA 2ZXBA 4XX6A 4LQ1A 3U5UA 2XVNA 3N11A 7TAAA 4MAVA 2BHUA 2WC4A 1GOQA 3MANA 1SMAA 3NJ3A 1US3A 3NIYA 2NSXA 1D3CA 4S3JA 4JCMA 1QVBA 3TOPA 2D0FA 1B31A 3T08A 3WFLA 3WH5A 3T0BA 1VRXA 1Q6GA 1GORA 4JFSA 1UZ1A 2CNCA 1GOOA 2E3ZA 1BLIA 2DQXA 2XFRA 2DIJA 2D2OA 3ZT5A 1V02E 4NF7A 4PMNA 1MXGA 5A6MA 2HISA 2WC7A 1TR1A 5M03A 3IJ8A 4JCLA 1HVXA 2O9PA 1OINA 4MDOA 3WELA 1CECA 3VKKA 4AEEA 3EDDA 3WL1A 1JXKA 1KGUA 1JYWA 5ABEA 1UR0A 4W7UA 1BVZA 2VI0A 1EA9C 1QHOA 1UWIA 4W8LA 3UR7A 1GHRA 1QW9A 1CXFA 5I6SA 4F9DA 4DWSC 1ZL1A 3AS3A 1JI1A 4KGLA 2Q8XA 3PHAA 1EXPA 3VD4A 3FXYA 2BVDA 1J11A 1OIFA 3II1A 1TA3A 1DTUA 3N04A 2JE8A 2CBVA 1LL6A 1CDGA 1L0PA 4LX4A 4E8CA 5A8NA 4BQ2A 4MAZA 5E6YA 3BGAA 5GNYA 4C7GA 2EBNA 1X6LA 1E6RA 1PZ2A 3SURA 4XUYA 2GJXA 1Z32X 3I3DA 3GM8A 1OD0A 5FL0A 3QHNA 2BFGA 3ZQ9A 3ARYA 4UQCA 1E70M 3VUPA 2WNWA 1I75A 2XTKA 2YLAA 2PWFA 4MB4A 1OBAA 1K9EA 3SCSA 1EQCA 1KCLA 2WVVB 2XGIA 3ZO9A 2CBIA 1E5NA 2EQDA 3U57A 4D6HA 4OKDA 5IHSA 3MMUA 3MUAA 4QLLA 2WANA 5CPQA 1CLXA 4U2ZA 1CGTA 1QI5A 1G01A 1W1YA 2XJ7A 4AD4A 1HJVA 3TTYA 5C8BB 1NP0A 3W6MA 1BSIA 2W66A 4AZIA 4RE4A 5M3WA 3UG4A 1BQCA 1QBBA 2E9LA 2J4GA 4NRRA 1H5VA 1CWYA 2XGBA 2XPKA 3AS0A 1W9UA 2FGLA 2E40A 3SCQA 1ZS2A 2VCBA 3WNPA 4D6IA 4ZXOA 3GZAA 3ALFA 1BG4A 1JNEA 3CHDA 1KQZA 1E15A 3CO4A 1Q4NX 3CUJA 3K46A 3VINA 3ZR5A 2FDMA 2BXZA 1LL4A 4JL1A 4CCCA 4AMCA 1PX8A 3WD4A 1GJWA 3HU7A 3AXHA 1EHAA 2QMJA 2YL5A 4DM2A 1JDAA 1PAMA 3VIIA 3AS1A 2ESCA 3SCTA 1CNVA 3BAJA 3IAPA 1QI3A 1NM9A 1OGBA 1BGGA 2CETA 1ZBCA 2WCGA 3PBGA 3UR8A 1JF6A 2VX4A 1TA3B 1GVIA 4OUEA 1C3FA 4XB3A 1V3IA 6A3HA 3N18A 1CBGA 1QHPA 1TVPA 3AIEA 4EE9A 4HPHA 1KXTA 3F5LA 1FH9A 1OCQA 5A1AA 2D3LA 4M56A 1ODUA 4W5ZA 3WNMA 4V28A 2ZUNA 3CHEA 1VENA 1GUVA 3TTOA 3AIUA 2W4XA 2YLLA 3AI0A 3AMCA 3W24A 3MV11 3AQUA 4MNMA 3A6OA 4TUFA 2ZUUA 5LYRA 5A6KA 1HP4A 2EJ1A 2VURA 3AS2A 4AYSA 4MNJA 5A8QA 4DM1A 3DECA 4TXEA 5JUVA 3ZJ8A 5CPSA 4GO9A 1W91A 1XH2A 3WQVA 2G41A 3K1DA 4HA4A 3K8KA 4PBGA 4YHEA 2F61A 4AD0A 1B9ZA 2WMKA 1V02A 1EOMA 1UD2A 3WUGA 1GONA 2DGAA 3S6TA 5EB8A 4UQAA 2EPOA 3GDBA 2D3NA 1Q6DA 3THCA 1UQYA 3IJ9A 3OZOA 1AVAA 4WJXA 4UCFA 1G5AA 3O6AA 3NYDA 3OLEA 4WF7A 1MQPA 1LF1A 3W81A 3VMNA 4OBSA 3KZSA 4BQ4A 1J01A 1GCYA 2G3IA 2ZICA 1B3XA 3MSGA 3FHAA 1JZ3A 5CSYA 5ABFA 4U5KA 2DIEA 3WF1A 2D0GA 3ARXA 1V0LA 2VQTA 1UH2A 3DYOA 2OSXA 2X05A 1B3ZA 4UOZA 3WFZA 2MANA 5M5DA 5A8PA 4KMQA 1AQMA 4U5IA 1NOUA 1VEPA 3DC0A 3MV01 3OGVA 3BAXA 2WWDA 1JYXA 3ZT6A 5LA2A 3VD9A 2G8ZA 1VF8A 4JFWA 4CD7A 1JZ8A 1CZ1A 3G6MA 1ODZA 3SCUA 4HA1A 4IPLA 4S3KA 5ABGA 2JEPA 4H8HA 4M29A 2V38A 3WH8A 1V3LA 2RGLA 1IT0A 3FAWA 4A4AA 1RPKA 1E3ZA 1EDGA 4BA0A 5C70A 2X2YA 2JIEA 3OGSA 3AMDA 5BWFA 4TX8A 1JYVA 3N15A 2J79A 2J74A 5D8WA 5A6BD 4ACZA 5IFPA 5JIPA 4XV0A 3VD5A 1FHLA 4URIA 1JZ6A 1JF5A 1B3YA 5HPOA 4H8UA 2YOCA 1UKPA 2BXYA 3K8LA 2FHFA 4BZYA 3KE0A 3WQ5A 3OLGA 3PZVA 4WKFA 3GNRA 4AIOA 1BYCA 1VEMA 2WMIB 1GOKA 2G4FA 2UY5A 4JKLA 3SUVA 5ABHA 2WBGA 1E4NA 4AIEA 3VIMA 2AAAA 3CUHA 3RILA 1OT1A 1QOXA 1V0MA 4LPCA 4AXNA 5A8OA 4M1RA 3AYSA 4FLQA 8CGTA 1C7TA 1DHKA 5ABFB 2DSVA 3LPPA 4NRSA 1GHSA 1J0HA 4WIWA 1H0IA 2WB5A 3VIKA 4HOWA 3A4WA 1OGSA 1N82A 3WKZA 4PTWA 3BLPX 3VMPA 4AIUA 3WF2A 4FLSA 2XM2A 4AZGA 2XVKA 4K68A 1LLOA 1UH4A 3RO8A 3GYCA 4OJYA 1C7SA 3WDHA 1R8LA 2JFEX 3NCOA 3GNPA 4CVUA 3VX1A 1HJSA 3GH7A 1BF2A 5C71A 4NI3A 5FOOA 1LL7A 2BS9A 1BYAA 2VZVA 3BAKA 4H41A 3CGTA 3L2LA 3NSNA 4CD5A 2WHKA 5A3HA 3L4ZA 1H49A 4D6GA 4AZHA 5LA1A 1E6PA 3TTSA 1L8NA 3FNDA 4FF5A 4X0NA 3VGDA 3BCDA 1K9TA 4DWSB 3VDBA 1RD6A 1GQIA 1CGVA 3VX0A 2JIWA 1BVNP 1WPCA 1I1WA 1PJ9A 3RM4A 1JZ5A 3DHPA 4EAMA 3DHUA 3AMKA 4ACZB 1NOWA 1UR2A 1V0NA 2TAAA 5FCZA 5HPCA 3SCPA 4QCFA 4V2XA 4TVUA 1DEDA 4KRTA 2OSYA 1E6NA 2YA1A 4PMRA 3FAXA 4M82A 3ARQA 3ARSA 1LG2A 3ARZA 2XSBA 1QI4A 1VEOA 5HOSA 4YPJA 4HA3A 2WKLA 2W5FA 2GJRA 1JNDA 4W87A 3CUFA 4QLKA 1F4HA 2FHBA 4PUEA 3WNKA 3WD1A 1YQ2A 3WENA 3KL5A 2EEXA 3VMOA 4H8VA 3VDAA 2WCSA 3QR3A 5I0DA 3WY1A 2OWXA 4FLOA 4D1IA 3W26A 4AC1X 1MW0A 2HVMA 2IXVA 3BH4A 3CHCA 2WSPA 1XD1A 1WKYA 1V6UA 1QHZA 4ATWA 2OWCA 3UG5A 4ATLA 3T0AA 2J47A 3I3BA 1RP9A 1JZ4A 1E56A 1OD8A 4UZUA 3MS8A 4HP5A 3WD0A 1CYGA 3EMZA 3AXIA 4KGJA 3AOFA 3W38A 2WC3A 5JBFA 1DWIM 2CESA 1C93A 4GZEA 1GQLA 2ZXDA 2J8GA 3WDRA 3GH4A 2WVSA 4ZE4A 1NWTA 1XHGA 2X1IA 5GQBA 2EPKX 4PTVA 3SCRA 1GOMA 2ZWZA 3OA5A 1KCKA 4D6JA 1E4IA 3WH7A 1V3KA 1JIBA 2XIBA 2AMGA 3QHOA 3D3AA 3VIHA 1VJZA 1MVYA 3AHYA 5E9AA 1JL8A 4M24A 4MNLA 3BC9A 2WBKA 3WQ8A 5DT5A 1GQKA 2CPUA 3AHZA 1BGAA 3B9EA 3W27A 4JHOA 5DO8A 3RIKA 4J27A 1M01A 1JZ2A 4ML4A 4W7WA 2VX6A 5A6SA 2PWDA 2OSWA 4Q7NA 1W9XA 2J7CA 2DSWA 2RGMA 3KWXA 4U31A 3U7BA 1K9DA 4AZCA 4W85A 2CIPA 1HJXA 2CHNA 4P8XA 1UOKA 5JBDA 2VUYA 2BY3A 2BVTA 5A2CA 2YJQA 1CGWA 3VVGA 4P7NA 4GQQA 4OOZA 4Z2KA 2QV4A 2C0HA 4CU7A 3D5HA 5F7UA 3K4AA 4BQ3A 2IUZA 3VIFA 4TTGA 1J0JA 1BYBA 1EHNA 5ECUA 3WEOA 4PMYA 5BRQA 1E0WA 3WUEA 5E09A 3WUFA 1H0GA 4W8BA 5E0CA 5FIPA 4P8VA 1W2PA 2XHYA 1EIBA 2ZUVA 5D9PA 3AXXA 4LGXA 1UKQA 1E73M 1I1XA 1V08A 7A3HA 1UWTA 3OGRA 2Y2WA 1JGIA 3BSHA 2ZX5A 3NUKA 1UG6A 1NWRA 2ZOXA 4MB5A 5IXEA 3APGA 2Y24A 4R5EA 4F79A 2VL4A 5IFTA 1TUXA 2ZX6A 3KEHA 3U5YA 1XD0A 1E40A 1B3WA 4IISA 4ZFMA 2YL9A 3N12A 1U30A 1UQZA 4U3AA 1UUQA 3UETA 2J7BA 3ZM8A 4AZ7A 4MDPA 5CZKA 3F5KA 3RM8A 1JXJA 3FHQA 4OIFA 1US2A 3CBWA 3WEMA 2VR5A 3ARVA 2DSZA 1HJUA 1KFWA 1VB9A 3SCNA 1W2VA 4D6FA 2VCAA 2E0PA 4V27A 5I79A 1H2JA 2DT3A 1NOFA 4YHGA 4TTUA 1HX0A 1QNSA 2GVYA 1UD3A 5DMYA 1MW3A 4AZCB 1J0ZA 3G6LA 4PUDA 1JD7A 5D8ZA 3OLIA 3PZQA 4J7RA 3O9NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UA7 A;  2D20 A;  1SMD A;  5BXR A;  3CZL A;  2O9O A;  3WD2 A;  2ZID A;  3MSD A;  3W53 A;  1GZJ A;  2Y4S A;  4HPG A;  3WF4 A;  4JAW A;  2AOS A;  3RDK A;  2DH3 A;  4MB3 A;  3K8M A;  1MWO A;  1UR4 A;  4WSJ A;  3VD3 A;  4OOU A;  2E4T A;  1TE1 A;  4QFU A;  1ISV A;  3FN9 A;  2XWE A;  4GKL A;  2VMF A;  1JDC A;  1JYN A;  4W86 A;  3ZR6 A;  3E1F 1;  2CXG A;  1KBK A;  1M7X A;  1JFX A;  4UQ9 A;  5IDI A;  5I78 A;  1GOI A;  2XSA A;  5A2B A;  1HL8 A;  4JKK A;  4GIA A;  1J10 A;  1EO7 A;  3GXM A;  3BSG A;  5E70 A;  3L4V A;  3WH9 A;  2D23 A;  4XZW A;  2FH6 A;  1KGX A;  4W89 A;  2VNC A;  1ZJB A;  2FHC A;  1XH0 A;  2JF6 A;  2ZX9 A;  3ZSS A;  1C90 A;  1MFV A;  3GXF A;  4B3L A;  4Z2L A;  4JKM A;  2OYL A;  4CN4 A;  2GK1 B;  4DWS A;  4TOQ A;  4QDM A;  2XM1 A;  2GJP A;  4Z2G A;  4JFT A;  5I24 A;  4IM4 A;  2DEP A;  1P6W A;  3WNO A;  3PZT A;  1E9L A;  1UR1 A;  3OB8 A;  3SEP A;  3MUY 1;  4EKJ A;  4PMU A;  2Y8V A;  1XSJ A;  4U33 A;  3KL0 A;  1E1E A;  2WYS A;  4WLC A;  1ITX A;  1WO2 A;  2CIT A;  4J3X A;  2ZXA A;  3WSU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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