2CERA

Beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus in complex with phenethyl-substituted glucoimidazole
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 195
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cerA00
2YL9A 1MW3A 1G5AA 3AS3A 3RIKA 1YQ2A 3WMBA 5KZ6A 4C7FA 2WBGA 2ZUNA 3I3BA 1R8LA 2W61A 3EDDA 2V3DA 2VR5A 3T2QA 1GHSA 1FP9A 3MO4A 1JZ5A 4MNKA 1RP9A 3CUFA 1XD1A 4CVWA 3RM9A 4D6JA 3AJ7A 4HZ8A 1XC6A 2WVVA 3BSGA 2BHUA 4FF5A 4W5ZA 2BY1A 1GHRA 3E1F1 2CCRA 1JG9A 3ARXA 1V3IA 4AD3A 1C91A 1FOBA 5CLTA 3AZSA 2E0PA 1VJSA 2XUCA 1X1NA 1I1WA 3WQ8A 3OZOA 3ARSA 1QW9A 2A3BA 5A2BA 2HISA 3T08A 1KGWA 1ECEA 3ZJ8A 4AD2A 3WDQA 1Q6CA 4F79A 4KGLA 2WPGA 7CGTA 3VIFA 2ZWYA 5A2CA 2D20A 1UZ1A 3TONA 4TX8A 1HNYA 1CXKA 1E1EA 1B3YA 1QI0A 2J7HA 3A6OA 3VOCA 3CHDA 1PIGA 4OBSA 4HPGA 2JEPA 4ZXLA 3WF3A 4W8LA 1PZ3A 3ARWA 2QV4A 3WNPA 1G9HA 1J10A 2XWDA 3W26A 3S6TA 1B2YA 4URIA 2X05A 4BF7A 1HJVA 4QLLA 3THDA 3K8MA 1CGUA 3PZTA 4U33A 3WENA 3MANA 3OIHA 1KWGA 4QAWA 5M03A 4NSBA 3ZJ7A 4QP0A 1MW0A 4P7RA 2VNCA 3EBVA 5A6AA 1KFWA 4MJ4A 4MB5A 4DM2A 1WDPA 2VMFA 1W9BM 3EMZA 1OBAA 1E0VA 3D3AA 2E9LA 2YLLA 1UWQA 2G41A 4KGJA 1BHGA 1V0MA 1ZS2A 4FLOA 1VFFA 4K68A 3SCNA 2VR4A 5A94A 2YLAA 2WHKA 2OSWA 2E40A 4D6GA 2WC3A 4E8DA 2VZSA 2BY0A 3VD3A 1FFRA 2WC7A 3D5HA 5A8OA 5E70A 2Y8KA 3A3HA 5D8WA 4EKJA 3WSUA 3WD1A 3U5YA 2VX6A 3POCA 3FAWA 1Y7VA 2WVUA 2ZICA 2E3ZA 3OGRA 2J47A 3GXFA 3K1DA 4AZ5A 5JUVA 5A6SA 1TA3B 2XGIA 5D8ZA 3W53A 3NIYA 5HOSA 2YA0A 4J7RA 1H41A 2DSVA 4W86A 4CU6A 4TTGA 2AAAA 2J62A 3M07A 9CGTA 3W37A 1E56A 1V02A 5A6LA 4CD8A 4ZE5A 1NOWA 1L8NA 2EPLX 5DT5A 1B3WA 3AXHA 1LJYA 4IPNB 2DEPA 1BVNP 1W2PA 5A1AA 1AQMA 1TVPA 4JKLA 4D1IA 1UHVA 3N04A 4UOZA 1E6ZA 2PB1A 1H49A 3NSXA 1J11A 3VUPA 3MMDA 3RM8A 1R7OA 4JFVA 5FKYA 1KWKA 1UZ4A 2X1IA 7TAAA 4AIUA 4W8AA 2W4XA 5TD4A 1LG1A 3WH5A 2CITA 1J18A 1XCWA 4PUDA 3AICA 2J7GA 1VB9A 1UYQA 3N15A 5ABGA 5D9NA 1QNRA 1GUVA 2YA1A 2GJRA 1NARA 3NJ3A 5GNYA 2HVMA 2WCSA 2DQXA 2DSKA 3NUKA 2E8YA 3WNNA 1LL6A 1K9FA 5F7UA 5GNXA 5CGTA 1UH4A 1XCXA 2EEXA 3SIMA 3SEPA 4D1JA 2ZWZA 1H4PA 2WSPA 4P7QA 3WKZA 5M5DA 1K9EA 1NWTA 4FK9A 2WMIA 4HP5A 1LL7A 1GQJA 2EPMX 3W4RA 1XH1A 1GVYA 1ODZA 2XVLA 3W38A 2XJ7A 2BNJA 2WAGA 2O92A 3ZR6A 2JIWA 1HP5A 4M1RA 1ZBKA 3A4WA 3OLDA 2ZOXA 1CBGA 3WD2A 2XFYA 4AZ7A 4WKAA 4AZHA 3JUGA 4UQAA 4QFUA 2CPUA 4N0RA 5ABFA 4D6DA 1JYWA 1MW2A 4NF7A 4U2YA 1E6PA 2VI0A 2WYSA 2V5CA 3U5UA 1E40A 1WDSA 1W3KA 1XH0A 2G8ZA 3WUFA 1B30A 5AYIA 1BYDA 3NCOA 1D3CA 1U33A 2VVSA 1EHNA 2WKGA 2OYMA 5FIPA 4PMXA 2PC8A 2ZUWA 1XH2A 3IAPA 1HKMA 4J27A 3M6DA 1JDCA 4PMYA 1QBBA 4V27A 3VTRA 2GK1B 4W88A 1W3LA 4UZSA 2J7BA 2OSYA 1TFVA 3O2LA 1MXGA 1GW1A 2J4GA 5BXPA 3VMOA 4CD7A 1V02E 4P8WA 4AD4A 2WWCA 1QHPA 5I23A 1QBAA 1FFQA 3W29A 1W9VA 1JNEA 2WXDM 2XPKA 4DUVA 2E9MA 6CGTA 1XGZA 3AMDA 1TVNA 4YPJA 2Y4SA 1LL4A 3GXIA 2FH6A 2WLZA 5HNNA 2YL5A 2OLHA 3KWXA 4V2XA 5DEZA 2VQUA 2PWHA 2WBKA 4F9DA 4W93A 3PZ9A 1UR8A 1HIZA 2VURA 2WLYA 1XRVA 4HA4A 3L2LA 3ZJKA 2BY2A 4S3JA 2Q8XA 2X0HA 1RD6A 3SCWA 3VGGA 2DIEA 4HMCA 2PBGA 3S2CA 3VILA 4U2ZA 1M7XA 1OD8A 3GNOA 3KEHA 4HMEA 3CIVA 3WMSA 3ZSSA 3AIVA 4ACZB 3EDJA 3VIOA 2BHYA 1ISZA 1PAMA 3K4AA 3OZPA 3ARRA 8CGTA 4W87A 3MU7A 2GDUA 2UWFA 1KCKA 1N82A 2VCCA 3O6AA 2VRJA 1SMDA 1UD8A 1IZKA 2XVNA 3BMWA 4ZXOA 2YL6A 4TTUA 4CD6A 1EO5A 2QPUA 4XZBA 5CSYA 2XYLA 1UA7A 3AIQA 3POHA 1EH9A 2EBNA 3WFLA 1H5VA 1ZJBA 1K9TA 3SUWA 1NP2A 1QPKA 1WCGA 4X0NA 1EO7A 3PBGA 1HL8A 1EGZA 2WHLA 4UQDA 1CXHA 1M03A 3FNDA 1OIFA 4MB3A 2ZX5A 3VD4A 2NW0A 2BFGA 4CD5A 1VIWA 1HKKA 1R86A 1NOFA 4HPHA 1NWUA 2VZTA 3VNZA 4JCMA 2W91A 3AIBA 2C7FA 2FDMA 2VRKA 4BCEA 4CCCA 1ZBWA 2FGZA 1DWAM 1ZBCA 2OWCA 3DHUA 1EDTA 3NSMA 4WKHA 4UCFA 4UQEA 4TUFA 1MQPA 2NT1A 2G3JA 2XFRA 3CUHA 2QMKA 4M24A 3SCQA 3VINA 1UR9A 3CO4A 4H8HA 4WF7A 1EOKA 1A3HA 3WFZA 5C71A 1D7FA 1C92A 2ESCA 2RGLA 2DH3A 1HJSA 3QGVA 1OWQA 5LYRA 4Q22A 5AY7A 3THCA 4AW7A 1HT6A 3ALGA 1J0KA 3VIPA 5D9MA 2XG9A 4GKLA 3W82A 1CGTA 4S3KA 4TXEA 1MVYA 2UY4A 2VC9A 4TVDA 4PTXA 1J0IA 3EDEA 1EIBA 1H0GA 1B90A 1JIBA 3CMGA 3VX0A 4CN1A 3PZIA 3VM7A 2EQDA 5JIPA 3TA9A 3CHFA 4Y7EA 4GXPA 4JFUA 1ZJAA 3AMCA 4UFHA 1MXDA 4GIAA 1G01A 3PZGA 4XZWA 3VDAA 4BQ5A 1QVBA 1FHDA 3RO8A 3KL0A 4W7VA 4JFTA 1V0KA 1ISYA 3VGDA 5A8PA 2ZIDA 1V6XA 1BQCA 4ATLA 1AVAA 5I0DA 3VIJA 4ATWA 3AHXA 3DHPA 2O9RA 4JZ5A 2J74A 6A3HA 2ZX9A 3PZQA 5A8MA 4MPKA 2WKLA 4UQBA 1V3LA 4JAWA 2XWEA 4J28A 1HJQA 1JD7A 3WMCA 5LA1A 4PMDA 3PTQA 1HL9A 2X0YA 3W0KA 5C70A 4QDMA 5BRQA 1KR0A 1HXJA 1DWJM 1C90A 3BXWA 2BS9A 4UFMA 3WQ6A 3AHTA 4BQ2A 3WIJA 2DH2A 1CECA 1JAKA 4TVUA 2OWXA 3EMQA 1UKPA 3ALFA 2PWDA 1VAHA 1E73M 2WZHA 5EFDA 4CD4A 3TP4A 1CXIA 1CTNA 2ZUSA 3BMVA 3VMPA 5CSUA 1EOMA 1DWFM 1VRXA 2J79A 2O9PA 1H11A 1VF8A 1DWHM 3GNRA 5A95A 2ZUTA 2WMHA 2BY3A 4H04A 1GNXA 3ZSTA 2YL8A 1MFUA 2V3EA 3VD5A 3PTKA 1TMQA 3L4XA 2Z1KA 1TCMA 4KH2A 4W7WA 3AHZA 1B3ZA 2D2OA 3OGVA 1CXLA 7A3HA 4FLQA 3VIHA 1J0YA 4J3XA 3MV01 5AYBA 1UA3A 2ZXAA 4MDOA 2DSWA 3GTNA 3BCFA 1HJXA 2OYKA 1KQZA 4J3VA 1GVIA 5D9PA 2ZXQA 3MSGA 2CHOA 2WMJA 3L2MA 3VPLA 4BZYA 2CERA 5A6MA 2WW5A 5CG0A 3T2OA 2PF0A 3FHQA 1VBRA 5A6BA 2XM1A 4Q7NA 1MYRA 3BAIA 3CZJA 5BRPA 1VFOA 2WVSA 2JF7A 1US3A 5E09A 1C3FA 2FHFA 1EDQA 3M7SA 4LQ1A 1MW1A 1Q6DA 4PYSA 1JYNA 1E70M 2E4TA 3EMCA 1K9DA 5HPCA 1H1NA 3OB8A 2ZX7A 3CBWA 2J7CA 4BQ3A 1H2JA 4D6FA 1TA3A 1EQCA 4P8VA 1NWSA 1GOQA 3GYCA 4C7GA 4HTYA 3WQVA 4DWSC 3HN3A 3K46A 3L4ZA 3QOKA 1CLVA 3DC0A 5CXPA 4P7OA 3IK2A 2NT0A 4OOUA 4J3WA 1E0WA 1V3JA 3FAXA 1XSIA 4M8UA 2YIHA 5I79A 2WVTA 1WPCA 3AMKA 3CZGA 1KBKA 3W6LA 1PPIA 1W9XA 4TOQA 1QNPA 3VO0A 2G3MA 2BVTA 5CJ5A 3WF2A 3T0DA 4UZUA 4A3YA 4HA3A 1B3XA 1V6UA 3WBEA 2X8RA 4F66A 2YBTA 2DIJA 2VTFA 3KZSA 3AZRA 4J3SA 1BPLB 2D3LA 1GCYA 2PWEA 1FH9A 3VVGA 4AC1X 1PJ9A 4L4OA 4XX6A 3ARYA 1E6SM 1CLXA 3WD0A 1GOKA 1KR1A 1GQLA 1LF1A 3RMEA 3ZMRA 4UOJA 2YDSA 3U7VA 3ZT5A 4HZ6A 3WH9A 2CYGA 3EDFA 3L4YA 4MAVA 4JCLA 3DYMA 4XV0A 3OGSA 4AD0A 4LYPA 3ZT7A 4GINA 2XSBA 1AQHA 3KL5A 3QHNA 3VIGA 4RE2A 4U5IA 3WUBA 5JBDA 4E4PA 3MUZ1 3LPFA 4PMOA 4Z2GA 5A69A 4GO9A 3TTOA 1M53A 2XHYA 4DUWA 4OBRA 1W9PA 3ARZA 4HU0A 1HJUA 2CEQA 4CN6A 3QR3A 3UETA 5FOOA 5I24A 3AIUA 1W1TA 5HXMA 2PWGA 1UG6A 2NSXA 2VX7A 5BXSA 5IHRA 4AMCA 2DPEA 1JYXA 3UCQA 2GK1A 1UQYA 3WEZA 4IPLA 4P7LA 2XSAA 3LPPA 1V0LA 4AEEA 5FD0A 3BGAA 3K8LA 1GJUA 1UOKA 5CPSA 2BVYA 2CKRA 4J3UA 5E6ZA 1HN1A 2J7FA 3WQWA 4WKFA 1JFHA 5CQ1A 2G3NA 3AHYA 1GOIA 1J12A 1OD0A 1EXPA 2XVGA 3WF0A 3WQ5A 4JIEA 3VM5A 5EB8A 1BLIA 5DMYA 1RPKA 4M29A 3WY1A 1WAWA 4RL3A 2O9TA 2J78A 4AZIA 1E9LA 2WM0A 1SFSA 1MQRA 4M82A 3NYDA 1UD5A 3UG4A 4M56A 3T0BA 4CU8A 1JFXA 1E5NA 3WELA 2ZXDA 4JL1A 2YOCA 3UESA 3G6LA 4PSPA 3TOPA 3AMGA 1UR0A 3VU2A 4MNMA 5FCZA 2WSKA 1BYAA 1UD6A 1V3HA 5AC5A 3WNMA 2CIPA 4P8XA 2EPNA 4QCFA 1CWYA 2VRQA 2W67A 4OKDA 4HMDA 1UKTA 5CPTA 1LG2A 4ACZA 3WNLA 3IJ7A 2A3AA 2JFEX 3AOFA 1C93A 1OB0A 3T09A 2BV9A 1YHTA 1LWJA 2V3GA 3MV11 1U30A 1JYVA 4PCSA 4AD1A 5FL0A 1QHOA 4CN4A 1XHGA 5DFAA 3L4UA 2J77A 4TX6A 4F9JA 2W92A 5AC4A 4TVCA 3VNYA 3OLIA 3WL1A 3BLKA 2JF6A 2A3HA 1QHZA 4XUYA 3AXXA 1JZ6A 1O6IA 3AROA 4UQ9A 1PX4A 4B9YA 3GDBA 1FHLA 3WL0A 3SCSA 2W66A 4AZCB 2YA2A 4J3TA 4PCTA 1M01A 3SCUA 3N17A 3N12A 1UKQA 1WDQA 3AYSA 1A47A 2EJ1A 5A6JA 4RE4A 4OIFA 2WNWA 1PX3A 4JKKA 5HBFA 1V08A 4KMQA 3HJEA 3PHAA 3BAJA 1CENA 1BGGA 3J7HA 3QOMA 4X0VA 3WH6A 4GI9A 3GH5A 1JF5A 2GDVA 1CGXA 1KCLA 4CVUA 1UKSA 3PTMA 1E4MM 3F4VA 1OGGA 1ZB5A 5CZKA 3WDHA 2YJQA 1ISXA 3N11A 1KXQA 1HKIA 3F5KA 2DDXA 1J0JA 5E0FA 1V03A 1JDAA 1UR2A 1DWGM 1FP8A 2Y8VA 1CDGA 3OLGA 2VUYA 4P7NA 1WNOA 4HU8A 3CTTA 3PN8A 3KL3A 2VT0A 4PMUA 1OGSA 3AIEA 3SCVA 1DTUA 2O9OA 5I5RA 1H3GA 5DF0A 1E72M 1XD0A 2EXOA 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2BXZA 2UY2A 4H41A 3NDZA 5EBAA 1C8XA 2OYLA 1E4IA 1CXEA 1OIMA 2D22A 2W62A 1CNVA 4LXFA 2RGMA 1E3ZA 1VJZA 1TZ7A 1UWRA 4Z2LA 3MKKA 2DSZA 1UH2A 2GFTA 2J25A 1R87A 1C7SA 3N18A 3CZLA 4B16A 1DHKA 3SCTA 4DWSA 1QNOA 3GH4A 3AMLA 2V5DA 1QNSA 3ARVA 2CESA 1BG4A 3NSNA 4U3CA 1WZMA 3CPUA 4PMZA 3CUGA 1J01A 4JKMA 1W3HA 4OZOA 3T0AA 4ZENA 3OG2A 4UFJA 2JALA 2CBIA 1V3KA 2CHNA 1GORA 2GJXB 5IFPA 5IDIA 2Z1SA 5I3DA 3B9AA 2WMKA 2J8FA 4FLSA 3VMNA 3VX1A 2J75A 4BA0A 1JI2A 2W63A 1JZ8A 1NP0A 1GOMA 1W3JA 2VZUA 3WF4A 1KGUA 4Z2JA 4YN5A 3VGHA 4ZFMA 1TR1A 1E43A 2JEQA 2PWFA 3BC9A 4H7VA 4PMNA 2WANA 3LMYA 4H8VA 1PX8A 3FN9A 4JHZA 3CMJA 2F61A 8A3HA 3UERA 2WVVB 1JZ3A 5LA2A 4DWSB 1BF2A 4KWUA 5I77A 3UG5A 1CPUA 3KE0A 4PTVA 3SCOA 2WZEA 3T2PA 3APGA 4GO8A 2JIEA 1HKJA 3IAQA 4B15A 3W81A 2CNCA 3RCNA 4JFWA 3N13A 1UWIA 1RH9A 1ITXA 3AYRA 1BYCA 1E5JA 3A4XA 1DP0A 1E6QM 1W91A 1XSJA 4C7DA 2FH8A 2WMFA 2MANA 4EANA 4AISA 1OCQA 4PN2A 2Y2WA 1GONA 2W5FA 4Z2HA 4AZGA 5FL1A 1W1YA 3TTQA 3PZNA 1O7AA 1BGAA 1RP8A 1UD3A 1E4LA 1WB0A 1UR4A 1ZU8A 2CBUA 2VOTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YL9 A;  1MW3 A;  1G5A A;  3AS3 A;  3RIK A;  1YQ2 A;  3WMB A;  5KZ6 A;  4C7F A;  2WBG A;  2ZUN A;  3I3B A;  1R8L A;  2W61 A;  3EDD A;  2V3D A;  2VR5 A;  3T2Q A;  1GHS A;  1FP9 A;  3MO4 A;  1JZ5 A;  4MNK A;  1RP9 A;  3CUF A;  1XD1 A;  4CVW A;  3RM9 A;  4D6J A;  3AJ7 A;  4HZ8 A;  1XC6 A;  2WVV A;  3BSG A;  2BHU A;  4FF5 A;  4W5Z A;  2BY1 A;  1GHR A;  3E1F 1;  2CCR A;  1JG9 A;  3ARX A;  1V3I A;  4AD3 A;  1C91 A;  1FOB A;  5CLT A;  3AZS A;  2E0P A;  1VJS A;  2XUC A;  1X1N A;  1I1W A;  3WQ8 A;  3OZO A;  3ARS A;  1QW9 A;  2A3B A;  5A2B A;  2HIS A;  3T08 A;  1KGW A;  1ECE A;  3ZJ8 A;  4AD2 A;  3WDQ A;  1Q6C A;  4F79 A;  4KGL A;  2WPG A;  7CGT A;  3VIF A;  2ZWY A;  5A2C A;  2D20 A;  1UZ1 A;  3TON A;  4TX8 A;  1HNY A;  1CXK A;  1E1E A;  1B3Y A;  1QI0 A;  2J7H A;  3A6O A;  3VOC A;  3CHD A;  1PIG A;  4OBS A;  4HPG A;  2JEP A;  4ZXL A;  3WF3 A;  4W8L A;  1PZ3 A;  3ARW A;  2QV4 A;  3WNP A;  1G9H A;  1J10 A;  2XWD A;  3W26 A;  3S6T A;  1B2Y A;  4URI A;  2X05 A;  4BF7 A;  1HJV A;  4QLL A;  3THD A;  3K8M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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