2CETA

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with phenethyl- substituted glucoimidazole
Total Genus 176

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
443
structure length
435
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASERAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLE
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
total genus 176
structure length 435
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cetA00
1R7AA 3AIEA 3O9NA 1EH9A 1J11A 2OWWA 4XB3A 5EBAA 4D1JA 2IUZA 1A3HA 2GFTA 3CGTA 3N18A 4V27A 3ZR6A 1QBBA 3WQ8A 1HT6A 3BLKA 3OGRA 2UY5A 1VFOA 1W3LA 4E2OA 1J0IA 1CGXA 4F9JA 1ITXA 1JZ2A 5ABFA 2DT3A 3KL5A 1VEOA 1ESWA 1GVIA 1CPUA 5A1AA 3PHAA 4V28A 3AISA 4U33A 4CD7A 3WDPP 2BY0A 5D9PA 2XGIA 5A8NA 2JEPA 2FHCA 4NRRA 4JZ5A 4QAWA 4AZCA 4CU7A 4UQBA 1W9VA 1H1NA 3MV01 2CNCA 3ZT7A 4S3JA 5D8WA 3F4VA 1UHVA 3S2CA 1WP6A 2FDMA 2PB1A 1SMAA 5EB8A 4PSPA 1WZMA 5A8PA 2VQUA 3FHQA 2CBJA 3WQWA 4WKHA 3FAXA 1E6XM 5HDRA 1SYTA 5IDIA 1QPKA 3RM8A 5FL0A 2J7EA 4FLOA 3MUAA 3SCOA 3WUGA 1WNOA 4P7OA 2V3DA 4OZOA 3VNZA 2PF0A 1W1YA 3SUUA 4AD2A 1JNDA 1V3MA 3BC9A 1EGZA 5I0DA 1C8YA 1GOIA 4UCFA 3AMDA 2EEXA 2PI6A 3KEHA 1PPIA 2YA0A 5CGTA 3CPUA 3AROA 2J4GA 1UZ1A 1OGSA 4X0NA 2XVKA 5CSUA 5E0CA 2V3EA 2ZUTA 4P7LA 1N82A 3CTTA 4M80A 1KWGA 1OINA 3I3DA 1JYNA 1US3A 3WH8A 4W5UA 5A2CA 3BAJA 5BXTA 4IUGA 1WPCA 4UQEA 3WD2A 4ATWA 1XYFA 3F5LA 2E3ZA 2XPKA 4JFUA 3U5YA 4F8XA 1H2JA 3VGDA 2VVSA 2W63A 3N12A 1PEZA 1ITCA 3MMWA 4JL1A 3CH9A 3WBAA 2X1IA 4LGXA 2ZXBA 5CXPA 1QOXA 4W7WA 3WY1A 4U3CA 3K4AA 5AYBA 3GNRA 4JCLA 2WHKA 3MSGA 1OM0A 3K4DA 5A95A 4JFVA 7A3HA 3A3HA 4Q7NA 1JDCA 4ATLA 3B8SA 3DECA 4GI9A 5AC5A 1XH1A 1ZJBA 1QW8A 5I3DA 3AHZA 4D1IA 1JYXA 5EFDA 1JXJA 5HOSA 3W4RA 3WNNA 4KWUA 5DT5A 3AJ7A 1TR1A 4UZUA 4DM1A 3QHNA 2WMHA 1E71M 2W5FA 5BWFA 2WKLA 1NM9A 4PMXA 1D2KA 3LPPA 5E6ZA 1ZB5A 4Z2JA 3HJEA 1E56A 4WKFA 4J3VA 4ZEPA 4J3SA 4DWSB 3EDDA 3WQ5A 3EMCA 5CLTA 2DIEA 4LPCA 1WDQA 1V0LA 3AI0A 3WMBA 3L2MA 1E73M 5I78A 3PZGA 1R87A 5M3WA 1HP5A 3WFLA 3VIHA 1B31A 3BLPX 3N13A 4MNMA 2VVNA 3OLDA 1KGWA 4MNLA 2FH8A 4J28A 2PWDA 1GOQA 5A8OA 5A6AA 1EQPA 4AMCA 1EDQA 2FGZA 4PMYA 4W8AA 1W32A 3NJ3A 2EPLX 1Y7VA 2OSWA 2QPSA 1K6AA 2XVLA 4CGTA 3DC0A 3NDZA 3GBEA 4GZEA 1BVNP 4TUFA 1JD9A 3AS1A 3QHOA 1UR9A 5AYIA 2BHUA 2DH2A 4NF7A 5CQ1A 3NSXA 4D6JA 4NI3A 4GO8A 4MNJA 4PCSA 4TVUA 1QHPA 2JE8A 4JHOA 1SMDA 4W85A 2ZUMA 1PX4A 1UH4A 2ZXDA 5DMYA 1VF8A 4Z2LA 5JBDA 3SIMA 3CZJA 3RCNA 4U5KA 1S46A 3VMOA 3K8KA 2W91A 4W7VA 2VOTA 1E0XA 2WCGA 4UQDA 2GJXB 3APGA 4PMRA 4CD8A 1V3JA 2A3EA 2BXYA 3T08A 1CZ1A 2ZUWA 1C7TA 2XFRA 3AIQA 4JFSA 2EXOA 4PMVA 2V5CA 2VX5A 1W3HA 3WDQA 3A4XA 1EQCA 3WH6A 3L4YA 3SEPA 3CBWA 1O6IA 5I5RA 5A69A 2WVTA 3T0BA 3CIVA 2VNCA 3ALGA 2DSWA 3M6DA 4KRUA 1W9UA 4UZSA 3EDFA 4UR9A 3BCDA 3AS3A 2EQDA 5E9AA 1U30A 2DIJA 3GDBA 1VBRA 5BXSA 1V3KA 4AZBA 4CN6A 3N11A 3T0DA 3K8LA 1OGBA 3BAIA 4CCDA 1FFQA 3BSHA 2ZUVA 1J0HA 4AYSA 3DYOA 1E5JA 2XM2A 3WIJA 3ZJ6A 1W1PA 4UTFA 5JIPA 3MMDA 4A3YA 4CKQA 2A3CA 2BXZA 1FP9A 4M24A 1NP0A 2GDUA 3AS2A 5E6YA 5DT7A 5A6KA 3G6MA 1HP4A 2YA2A 1XGZA 4L4PA 1AQHA 4PMDA 1C90A 2VJXA 4CD4A 4AZHA 1M04A 1QNQA 1BHGA 3VD5A 1KR1A 2XWEA 3G6LA 2DSZA 1CXEA 4HZ8A 1UWUA 3QGVA 3IJ7A 3W24A 1CXLA 1IZKA 3I3BA 5E70A 1CLXA 3WF1A 2WVVA 4Z2HA 3D5HA 1E70M 3AMCA 5JBFA 5A6JA 3SURA 1JD7A 1BGGA 4MTVA 5I6SA 2WHMA 4J7RA 5ABFB 3VMPA 3ZMRA 2EBNA 3PZQA 1U2YA 4YN5A 1MFUA 1UA3A 1JFXA 2CBUA 3A4AA 6CGTA 2Y4SA 3VIMA 4EAMA 3CZGA 1V08A 1ZL1A 2OLHA 3W6LA 3PBGA 5HXMA 4AZCB 3RJYA 1NP2A 1QI5A 4XZBA 2NSXA 3I3EA 3MSDA 1KQZA 2FH6A 4MB1A 5A2AA 1GVYA 2J47A 3N9KA 1W9PA 2CESA 2WZHA 2Y8KA 2X2YA 2VX4A 2F61A 1GZJA 3F5JA 3PTKA 3O6AA 2YDSA 3CUGA 1BAGA 2XSAA 3VGGA 3AMLA 3ARSA 1KBBA 2PWHA 3SCRA 5CSYA 3WNLA 2WMGA 3E1F1 1H41A 4UQCA 1Q6DA 1UWIA 1VEPA 5DFAA 4X0VA 1H0GA 4HZ6A 2D1ZA 3ARUA 1JYVA 3PZNA 3SCNA 2GJXA 1M7XA 1NQ6A 4GINA 1C92A 3ECQA 1FHLA 1W3JA 1JZ6A 1E3XA 2YL8A 3VD7A 5I77A 4P7RA 2YLLA 1BTCA 3T2QA 3U7VA 2NW0A 3IJ8A 4M82A 5A3HA 2ZIDA 4TX8A 4AD1A 4QP0A 1FFRA 2VUYA 3AQUA 4TTGA 4NSBA 2DQXA 3JUGA 3WL1A 1VFFA 1EO5A 2BFGA 4PMZA 3CMGA 1DWAM 4WJXA 2CXGA 1JXKA 4FLQA 3ZJ8A 4J3XA 4DUWA 3IAPA 2XHYA 3MV11 2J8FA 4HOXA 3VINA 2VZSA 3UG4A 1HJVA 2J78A 1VAHA 1BF2A 3DYPA 1UZ4A 1LL6A 1FH7A 4ATDA 3W25A 5CPQA 2G41A 5A6MA 2MANA 3BXWA 4OIFA 3EDJA 1HJXA 5ABGA 4BF7A 1B3XA 1CGVA 2WBGA 3CZ8A 3AHYA 1K9FA 4K68A 1FOBA 2BHYA 3WD0A 2JALA 3IK2A 1UQYA 3M46A 3MUY1 4M29A 4M56A 1G9HA 2BV9A 2O9TA 1VEMA 3L2LA 1W1TA 1F4AA 4LX4A 3L4XA 3WKZA 2E0PA 3WH9A 3A4WA 1R86A 1CNVA 4KMQA 4BQ3A 1OB0A 1UKQA 1PJ9A 4TX6A 2DT1A 1NWTA 3RPMA 4H7VA 2XIIA 3N04A 4AISA 4Z2GA 1OWQA 5A6LA 2VZVA 4MB4A 3UCQA 1WCGA 1HKJA 2J75A 5DEZA 5M03A 2WVUA 1EA9C 1HKMA 3W28A 3NUKA 5GNXA 3MKKA 4C7DA 2CITA 2WKGA 3AZTA 2O9RA 4OKDA 4WSKA 1MQRA 1KB3A 4W89A 1AVAA 4YPJA 3L4WA 5IFTA 4GO9A 4OOUA 1Q4NX 1QNRA 1M01A 1W91A 4H8HA 1LL4A 2VR4A 3GXDA 1NARA 1UD4A 1E4LA 3HN3A 3D3AA 1CENA 4PRWA 2W4XA 4D6CA 1ODZA 3FAWA 2XWDA 2JIEA 1OGGA 1JZ8A 4PBGA 4JCMA 3BH4A 2BS9A 4B9ZA 1UKOA 1B1YA 4MJ2A 4IISA 3PZTA 1G01A 3VIFA 1B0IA 2J74A 3VIOA 2PBGA 1LQ0A 4PTVA 4AWEA 2DSVA 1JI2A 1E4NA 2GSJA 3NSMA 3ZO9A 3CUIA 1ISYA 1J12A 4D72A 1UQZA 1QHZA 3BAXA 3UESA 1KWKA 5I24A 1US2A 4OUEA 4NRSA 2NT0A 3L4VA 4MAZA 1XHGA 3CUFA 1TZ7A 4URIA 2YDQA 4H8VA 1SFSA 2CBIA 4D6EA 3PZUA 4JFTA 1DWFM 4Q22A 5HNNA 5D8ZA 4AD4A 1VB9A 1R7OA 2WSKA 4W8BA 3TONA 4UFIA 1HIZA 4E8CA 3GNPA 4P8XA 3W38A 1WZLA 1B3WA 1OIFA 3OLGA 1V3HA 3TTYA 1GW1A 1UR8A 1XYZA 1E72M 1HVQA 1GPFA 2WBKA 3VD9A 1ZBCA 1JAEA 3LPGA 3KWXA 3NIYA 1AMYA 4W87A 1V0MA 3FHAA 3W81A 5A6BD 1O7AA 1UUQA 4P7QA 4CD6A 1J01A 2J7GA 3LMYA 1CXHA 2WLYA 1TVPA 4LYPA 3RDKA 2CPUA 3WENA 5M5DA 4YHGA 3WBEA 1YQ2A 4E8DA 1B90A 3AZRA 1E3ZA 1KR0A 2YL9A 1ZBWA 5HBFA 4H04A 4HA1A 4RE4A 1B3ZA 1KCKA 1Q6FA 1D7FA 5KZ6A 4J3WA 1H49A 1BYDA 4WSJA 3PZVA 3VNYA 1XH0A 3L4TA 5CPSA 5CZKA 2CKSA 1J0KA 1JGIA 2PC8A 3AHXA 5JUVA 2VMFA 1BPLB 1JIBA 5D9OA 4FLRA 3SCWA 4UFMA 3K46A 1BQCA 1HJUA 2YDRA 1J0YA 1NH6A 1L0PA 3CUHA 3WNPA 4GQRA 1OT2A 2WVVB 1M03A 1E5NA 3HMCA 1I1XA 4RE3A 3EBVA 1BLIA 1MXDA 1UKTA 3A47A 4BZYA 3NYDA 1WE5A 2ZE0A 1BYBA 3GXFA 5DF0A 1W2VA 2WZIA 4CU6A 6A3HA 3AHTA 5E0FA 2WNWA 2Y2WA 2V3FA 2D2OA 4JKLA 1EOMA 3IJ9A 4UFLA 2CERA 1WKYA 2AOSA 2J8GA 1XCXA 1GQLA 2D0GA 4UFKA 2O92A 1E40A 2ZXQA 4KGJA 3WDHA 3VDCA 1KGXA 3B9DA 4HOZA 3T2PA 1RD6A 4B3KA 2OWXA 4HP5A 1QNSA 2XTKA 1OCQA 4TVDA 3ARWA 1MW2A 1QI2A 2YBUA 3CUJA 1HXJA 2E9BA 5IXEA 4U2ZA 3BAYA 4UQ9A 3W29A 3CHDA 3WNKA 1R85A 1XD1A 2V5DA 3OIHA 3PZMA 2WK2A 3BAKA 1BVZA 1NOWA 2ZX6A 3OZPA 1E4IA 2PWFA 4PEEA 1UH3A 1PBGA 4BS0A 2OYKA 1I1WA 1NWUA 1XD0A 3WUFA 4IPNB 2G3NA 8A3HA 4CCEA 5JBEA 4AEEA 2DSKA 2CKRA 2UY2A 2DT2A 4Y7EA 4CVWA 3L4ZA 2BHZA 5FKYA 3UETA 5HPCA 1V6VA 4WKAA 1DWGM 1Z32X 1K9TA 1EOKA 3VOCA 3AMGA 1BFNA 3KZSA 1MQQA 2VZUA 5FIPA 3HU7A 4B9YA 2E9LA 1J0JA 5A6BA 1FHDA 1BYAA 1V6XA 3WQ4A 1ISZA 3WH7A 3THDA 4AIEA 5GPRA 1X1NA 4XX6A 2D0HA 2VT0A 1E6RA 1KQYA 1PIGA 2ZXAA 4P8WA 3POCA 2B31A 4PCTA 2HVMA 1VIWA 2V3GA 2WC7A 4Z2IA 1JZ3A 8CGTA 4BCEA 3WUEA 2WXDM 4EANA 2D3LA 5TD4A 1PIFA 5CJ5A 2WC3A 4HZ7A 1UD6A 1SR0A 3SUWA 1G0CA 3WD4A 4W93A 1H0IA 4P7NA 1JZ5A 3WF0A 4U3AA 1LJYA 1X6LA 2V38A 5FL1A 3UG5A 1CXFA 1VENA 4FLSA 4LQ1A 2ZX9A 5JIWA 1OBAA 4UFJA 2J62A 1EHAA 2PWGA 3J7HA 1CXIA 2VTFA 3GBDA 3K1DA 1UKSA 3WD1A 1V3IA 2J7HA 3OLEA 4DUVA 1D3CA 3L4UA 2VL4A 1CGUA 1GOKA 3U5UA 1Q6CA 2X0HA 1EDGA 1KXQA 5ABHA 2BY3A 5E09A 4FMVA 4BQ2A 2J77A 4J3TA 2J7FA 2W61A 3LPFA 3MUZ1 5D9MA 3O2LA 1GOMA 1G5AA 1OIMA 4AXNA 1QI4A 3QHMA 2J7DA 4WIWA 1V6UA 2VCAA 4RL3A 1W3KA 3KL3A 1B3YA 3SCQA 3VPLA 4AD5A 2F2HA 3SCTA 1E43A 5CGMA 2G8ZA 4E4PA 2J79A 3T0AA 3BGAA 3RM9A 2G3MA 2XG9A 2WHJA 4A3HA 3AICA 5I23A 4N42A 1JFHA 2D3NA 3AXXA 4OJYA 2BNJA 1NOUA 3B9AA 1DP0A 1HJWA 2J7BA 2WMIA 1A47A 1GNXA 1W1VA 2IXVA 3RO8A 3T2OA 2NT1A 4DWSC 4HTYA 1ISVA 3K8MA 3CHCA 1J10A 4PSRA 3TTOA 4LYQA 4DUXA 3AXIA 3EMZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1R7A A;  3AIE A;  3O9N A;  1EH9 A;  1J11 A;  2OWW A;  4XB3 A;  5EBA A;  4D1J A;  2IUZ A;  1A3H A;  2GFT A;  3CGT A;  3N18 A;  4V27 A;  3ZR6 A;  1QBB A;  3WQ8 A;  1HT6 A;  3BLK A;  3OGR A;  2UY5 A;  1VFO A;  1W3L A;  4E2O A;  1J0I A;  1CGX A;  4F9J A;  1ITX A;  1JZ2 A;  5ABF A;  2DT3 A;  3KL5 A;  1VEO A;  1ESW A;  1GVI A;  1CPU A;  5A1A A;  3PHA A;  4V28 A;  3AIS A;  4U33 A;  4CD7 A;  3WDP P;  2BY0 A;  5D9P A;  2XGI A;  5A8N A;  2JEP A;  2FHC A;  4NRR A;  4JZ5 A;  4QAW A;  4AZC A;  4CU7 A;  4UQB A;  1W9V A;  1H1N A;  3MV0 1;  2CNC A;  3ZT7 A;  4S3J A;  5D8W A;  3F4V A;  1UHV A;  3S2C A;  1WP6 A;  2FDM A;  2PB1 A;  1SMA A;  5EB8 A;  4PSP A;  1WZM A;  5A8P A;  2VQU A;  3FHQ A;  2CBJ A;  3WQW A;  4WKH A;  3FAX A;  1E6X M;  5HDR A;  1SYT A;  5IDI A;  1QPK A;  3RM8 A;  5FL0 A;  2J7E A;  4FLO A;  3MUA A;  3SCO A;  3WUG A;  1WNO A;  4P7O A;  2V3D A;  4OZO A;  3VNZ A;  2PF0 A;  1W1Y A;  3SUU A;  4AD2 A;  1JND A;  1V3M A;  3BC9 A;  1EGZ A;  5I0D A;  1C8Y A;  1GOI A;  4UCF A;  3AMD A;  2EEX A;  2PI6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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