2CKRA

X-ray crystal structure of the catalytic domain of thermobifida fusca endoglucanase cel5a (e5) e355q in complex with cellotetraose
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
GTPVERYGKVQVCGTQLCDEHGNPVQLRGMSTHGIQWFDHCLTDSSLDALAYDWKADIIRLSMYIQEDGYETNPRGFTDRMHQLIDMATARGLYVIVDWHILTPGDPHYNLDRAKTFFAEIAQRHASKTNVLYEIANEPNGVSWASIKSYAEEVIPVIRQRDPDSVIIVGTRGWSSLGVSEGSGPAEIAANPVNASNIMYAFHFYAASHRDNYLNALREASELFPVFVTQFGTETYTGDGANDFQMADRYIDLMAERKIGWTKWNYSDDFRSGAVFQPGTCASGGPWSGSSLKASGQWVRSKLQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Thermobifida fusca
publication title The Crystal Structure of the Catalytic Domain of Thermobifida Fusca Endoglucanase Cel5A in Complex with Cellotetraose
rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE E-5
total genus 134
structure length 305
sequence length 305
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2006-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ckrA00
4KRUA 1HJUA 3QOMA 4RE4A 5A8OA 2ZXQA 1E0WA 1R7OA 4PMRA 1V3IA 1OWQA 5A3HA 3CUIA 1MXGA 5A6JA 5A69A 2DSWA 5TD4A 1D2KA 1C7TA 3K1DA 1HT6A 1J0KA 5A8QA 2W62A 4XZWA 3VO0A 4E8DA 1V03A 1MFVA 1E72M 1UYQA 2J75A 1QBBA 2J7FA 4AD2A 2A3EA 4S3JA 3BCDA 2WHJA 4CU6A 2FDMA 1ITCA 3N1AA 2FH6A 4YPJA 1CXKA 1H0IA 4W84A 2V38A 1HL9A 4LYQA 5GPRA 1XSIA 2CPUA 4FF5A 4UOJA 3WDRA 3WQ8A 3D3AA 4AEFA 5I23A 2V3FA 3WEMA 5HPOA 3UG3A 2UWFA 2CHNA 3EMZA 2EPMX 2DQXA 2YJQA 3VU2A 2DH2A 2VZOA 1UWIA 1PX8A 3PZOA 2WCSA 1DWHM 4JL1A 3IAPA 4KGJA 1HJSA 1CXHA 3BH4A 4LX4A 1UWSA 1IT0A 5FCZA 4UQDA 3IAQA 2DSVA 3VIPA 2PI6A 3PZGA 1V6XA 4XX6A 5I77A 2W63A 3MV01 3NSNA 1J10A 1CXLA 3ARQA 4D71A 3WUEA 1PJ9A 2Z1SA 1NWSA 1FFQA 1V6WA 2F2HA 5A6MA 3W6LA 5I79A 1AQ0A 2J7DA 4U2ZA 1NH6A 1QVBA 1XC6A 4AD3A 4OUEA 4H2CA 2E9BA 4U31A 4E8CA 1H09A 3WUFA 4MNLA 5DF0A 2YOCA 1W32A 5HXMA 2D0HA 3ZSTA 4LQ1A 3UESA 1JNDA 3T2QA 5A6LA 2WM0A 4PBGA 1VIWA 4BQ2A 3HJEA 4PTWA 1CECA 1VRXA 1K9TA 1BPLB 2WMFA 3CZKA 1ZBVA 2G3IA 2O9OA 3ZMRA 3UERA 1OCQA 1VEPA 2CETA 1E15A 3VGBA 2DDXA 2AOSA 1GQIA 1JFHA 2WCAA 3PZUA 4IISA 1EHAA 3EMCA 2E4TA 4Z2JA 1JNEA 1V6YA 3I3DA 1QHZA 4X0NA 3GXIA 5DO8A 5I78A 3WH7A 1UUQA 2GJRA 4AZCA 1PPIA 2VTFA 4UFIA 1E73M 1CPUA 5HDRA 1JFXA 3CPUA 1BGAA 5A6SA 4CKQA 4MNKA 4TXEA 1VEMA 3WD0A 1EOMA 3ZQ9A 1KBBA 3L4YA 4W8BA 2CCRA 1Q6DA 2X0YA 1LF1A 2XTKA 1PIFA 2Y24A 3WY1A 2XGBA 4GI8A 3OA5A 1G5AA 4ZE4A 1KGUA 1SMAA 4EAMA 1HKJA 2J7GA 3OZPA 3L4UA 1UH2A 3MUAA 5BWFA 2VRJA 4Z2GA 5CZKA 1D7FA 5FD0A 2PF0A 3WL1A 4YN5A 2WMJA 2XM1A 2FHBA 4J3TA 4BF7A 2YDQA 2C0HA 5CGTA 3M46A 1WDSA 3NSXA 4B9YA 1NP0A 3U5YA 2PB1A 2W91A 2WK2A 4L4OA 3CO4A 1OD0A 5D8WA 4XV0A 1H5VA 1UD5A 4FLQA 4AIEA 4R27A 2ZUVA 3II1A 2YBUA 3PZIA 1QI4A 1DWJM 3LPOA 1ZBWA 4OOUA 5ABFA 5A2AA 1E55A 3M7SA 1UR1A 3BSGA 2WC7A 2WAGA 1JAKA 2D22A 2WVVB 4MPKA 2FGLA 3SIMA 1GW1A 4NRRA 1MYRA 2WWCA 3GXDA 3MV11 1GQKA 3GNPA 3U5UA 2DIEA 1LWHA 3NDZA 1VB9A 2A3HA 4AZIA 1EQPA 3KL5A 2G3NA 3B9AA 1E5NA 1V6VA 2VR5A 2WW5A 1HNYA 1UD4A 1TCMA 1BVZA 1GOMA 1WPCA 3AYRA 1KGXA 2W66A 4GINA 2E9LA 3M6DA 2ZX9A 4JCLA 2WVSA 3RDKA 1XYZA 5AC4A 1GVIA 3W6MA 5BRQA 3EMQA 4AY1A 3WD3A 4AW7A 3ARSA 4MJ2A 4AISA 3GTNA 2V3EA 1ZS2A 3WMBA 4PMNA 2V3DA 1E56A 3AIWA 4LGXA 5A1AA 2V5CA 3GZAA 1JD7A 3L2MA 3OZOA 4JFWA 4WSJA 1CTNA 1E6ZA 1JYXA 1HVQA 1DWGM 3RM4A 3BSHA 2XVKA 3NYDA 2BVTA 1V3JA 3N17A 2YDRA 3QHMA 2JEQA 5EFDA 2J7BA 1W1PA 3AMKA 4DWSC 3WF0A 5BXPA 3AZSA 1CDGA 1W3JA 5ECUA 3CZEA 1M04A 3VIIA 4Q7NA 3A47A 3VMOA 4EANA 1UD3A 2WMIA 2J79A 1ZBKA 5A8MA 3BXWA 3WMCA 1H3GA 1HJXA 1J01A 4M29A 4XUYA 2DT2A 1WZMA 1EXPA 2VZVA 1LL7A 2A3AA 4J28A 2CEQA 3BMWA 4ATLA 2XVLA 4HOZA 2O9PA 4ACYA 1PZ3A 1JZ6A 2YDSA 4CD6A 2WBKA 4HMEA 2OLHA 4A3YA 5CPSA 3SCWA 3WKZA 4P7OA 1UWQA 5FL1A 4ML4A 3CUGA 2YKKA 1JXKA 2CITA 3ARZA 1VEOA 1E70M 3SUWA 3SEPA 4KMQA 1TA3B 1OB0A 2ZIDA 1RH9A 4ACZB 5CGMA 2VUYA 3CMJA 4TVCA 1XCWA 4OOZA 5EB8A 2A3BA 1RD6A 1CGUA 3WQ6A 3VVGA 2EPKX 4PMXA 3WN6A 3GBDA 4M80A 1QOXA 3PZVA 2NW0A 3GYCA 2CESA 3AIVA 4MB5A 5GNYA 3G6LA 5CPQA 3WEOA 1QHPA 2YA0A 3I3EA 4HMCA 4M81A 2ZICA 3A4WA 4HTYA 3WNLA 1J0YA 2X1IA 4JFVA 3WDPP 1BG4A 2OWCA 1MQQA 4AXNA 2XVPA 3O6AA 4UFHA 1CLVA 4JCMA 3DYOA 2DIJA 3FW6A 2J4GA 4PMDA 3ZJ8A 3OGSA 2Y5EA 1W1YA 5DEZA 2RGMA 1XGZA 1S46A 3MANA 3AS2A 2WMHA 4QAWA 2XFYA 3AS0A 3GH4A 5E09A 3AROA 4EK7A 1X6NA 3T0BA 2EBNA 3WQVA 4M8UA 3GXFA 2DSUA 5EMYA 4AZCB 5IHRA 1CXIA 3GDBA 4WF7A 1C3FA 1W91A 3AIUA 3POCA 4JZ5A 1GJWA 1C90A 3VDCA 1WZAA 3PTKA 4NSBA 1P6WA 4UOZA 3K8KA 2Y8KA 3SCPA 3TA9A 4CGTA 2ZUMA 1KBKA 3PHAA 1EDQA 4HOWA 1GZJA 3VINA 5CSYA 3WFZA 4HU0A 1WDRA 3PTMA 2VI0A 4PUEA 3PZ9A 5CLTA 1V6UA 4ZENA 3AIQA 1EH9A 2WHMA 3FHQA 4H8HA 3OGRA 2G8ZA 3WF1A 1WNOA 3SURA 3LPFA 4LYPA 4TOQA 1UD2A 1QNOA 3CH9A 3EDJA 2DT0A 3AISA 1LLOA 1R7AA 2VCAA 1EO5A 3WNPA 1C8QA 2PWEA 8CGTA 1H41A 4W5UA 3VGHA 2BY3A 1W3LA 3VNZA 3MUIA 5D4YA 4YHGA 4M24A 1GCYA 3ARRA 1JZ5A 3AOFA 2BXZA 2WC3A 1ZJAA 5CG0A 1EIBA 5BROA 1ODZA 5DT5A 1N82A 5I0DA 2VO5A 7A3HA 2YLLA 3E1F1 3G6MA 4P7NA 1CGVA 1JYVA 3MMWA 3WD1A 1UH3A 3VX0A 4CD4A 1E3XA 3F5LA 2HVMA 3ZJ7A 2ZX7A 3WD2A 1QPKA 2E40A 3EDFA 3MUZ1 3DYPA 5E9AA 3CZ8A 3VD7A 3OG2A 1EDTA 4UCFA 5D9PA 1JF5A 6TAAA 4CD5A 3AIEA 4D6JA 2WMGA 2ZE0A 1JZ7A 3WUGA 2OYMA 4HZ7A 2ZUSA 1KFWA 3KL3A 2XG9A 3SCOA 2JF7A 1V3KA 1VJZA 4B9ZA 2OSXA 3VX1A 3GH7A 1FA2A 1OSEA 2VZTA 4CCCA 3BCFA 4KGLA 4AZBA 3VIHA 4W8LA 4EE9A 4N42A 5FL0A 1OGSA 2ZUWA 3AHTA 3CGTA 1E4IA 3UEQA 4JKLA 1CYGA 3WIJA 4L4PA 3MSGA 4UZUA 1AVAA 4ZXOA 2HISA 1MQPA 3MU7A 3VIKA 4AWEA 1ZBCA 2JF6A 3A4XA 4W93A 2D3LA 1BG9A 1NWRA 2J8FA 4TX8A 1UKSA 1BFNA 2GSJA 4AZGA 3EYPA 1XH0A 2GDUA 1KQYA 2CXGA 1M03A 3M07A 2NT1A 4UZSA 2VQTA 1NWTA 1JZ4A 1CXFA 4PSRA 3RJYA 4DWSB 2X2YA 4GO8A 1EQCA 1CNVA 2J25A 3NIYA 1CLXA 4WIWA 1GOIA 1JXJA 3SCSA 2YLAA 1UQZA 3OIHA 3L4ZA 4W7WA 2WMIB 3D5HA 4AZ7A 1UR4A 1K9FA 1BHGA 3W37A 1UA7A 3EDEA 1FHLA 3VIOA 2VT0A 3DECA 2Q8XA 4AIUA 5FIPA 4CCEA 3LPPA 1GQLA 3W27A 2WSKA 4Z2IA 1UA3A 4QFUA 1B3ZA 3W29A 1QBAA 2OYKA 4P8WA 3OLGA 1EHNA 1I75A 5KZ6A 5JIWA 4HOXA 1HVXA 1C8YA 1NOFA 3F4VA 4AD4A 4UR9A 2OWWA 3WSUA 1E0XA 5A6AA 4AZ6A 3AXXA 5HNNA 2YL8A 5E0CA 4H04A 2WANA 4HMDA 3J7HA 3ARUA 3GBEA 1Q6EA 4W8AA 3U7VA 4GZJA 1C92A 4C7DA 4BZYA 2WZEA 1GHSA 1GHRA 2BHZA 1PAMA 4PMYA 1DHKA 2WNWA 3W25A 4V28A 4ATDA 5CPTA 1BYDA 4D6GA 3ZR6A 1V02E 1UR8A 4MAVA 3UG4A 5DFAA 4DM1A 5AYIA 1JI1A 3UCQA 2VRKA 3SUTA 1Q6FA 1E6RA 1UWRA 2MANA 4PN2A 2XWEA 4PTVA 5EBAA 3SCTA 1CENA 3AS1A 1UWTA 1UR0A 1GORA 3HMCA 4D6DA 2ZX6A 4JHOA 3WDHA 3VD3A 5GQBA 3K46A 5ABHA 4ZEPA 2ZUNA 3B9EA 1TVPA 1RP9A 3A3HA 1J11A 3L2LA 1HXJA 4MB3A 1CGXA 3K8MA 2Z1KA 4UNIA 2XFFA 2O9RA 1NQ6A 4OBRA 4JIEA 2YA1A 1E6SM 2W4XA 3QOKA 1FOBA 1CGWA 3PZNA 1OD8A 1HN1A 2RGLA 1H49A 2GFTA 2VZUA 3L4WA 4J27A 1XSJA 4WKAA 2C7FA 3OLEA 2VX4A 2XJ7A 4MDPA 5A94A 2DPEA 1W2PA 2JE8A 1J0IA 1WDQA 2CNCA 4TTGA 3HU7A 1B3VA 3VDBA 3ZIZA 4DWSD 5A6BD 2J62A 4PMUA 4OJYA 3MO4A 3QHOA 6A3HA 1R85A 4MB4A 5A2BA 2E8ZA 3NCOA 2EPOA 2CBUA 1AQMA 2WLYA 1U33A 2QMKA 3VTRA 2DSZA 1KB3A 3RO8A 4AZHA 1UWUA 5CQ1A 3VGEA 3CZLA 4W7UA 1CWYA 3MKKA 1H2JA 3PZTA 1CZ1A 4MDOA 1E4LA 2GJPA 4D1JA 2WKGA 1OM0A 2YL9A 5D9OA 3FXYA 3RM9A 1W3HA 4NI3A 4M56A 4HPHA 1V0NA 3NJ3A 4FMVA 3CLWA 3L4TA 4X0VA 1TZ7A 4HP5A 1EDGA 4TUFA 1E3ZA 2DH3A 3WUBA 4LPCA 4A3HA 1XH1A 3AFBA 3L4XA 1VBUA 3W24A 1EGZA 3WH8A 2J78A 4CVWA 1A3HA 1AMYA 1MXDA 2CBJA 3OLDA 1H4PA 3WDJA 4D1IA 4WLCA 3UG5A 3BAJA 4GQQA 1Q6GA 2WCGA 3WD4A 1C91A 2TAAA 5BRPA 3BAIA 4YHEA 3AZRA 3FAWA 5JIPA 4GI6A 1GOWA 1C93A 3PTQA 4JL2A 3N11A 3THDA 3FHAA 1LL6A 3VKKA 2OWXA 4URIA 1UH4A 2XGIA 3BLKA 5I2UA 1SFSA 2PBOA 2X09A 1ZL1A 4V2XA 1MW1A 3BAWA 4AD0A 2XPKA 2EXOA 2DGAA 3GH5A 9CGTA 1G9HA 4AZ5A 1Q6CA 1VFMA 3AJ7A 1KXTA 4ZE5A 1KCLA 1BGGA 3PBGA 2G3JA 4QCEA 4V27A 1GOKA 4MADA 3AHXA 3DHUA 1L0PA 1HJWA 1EA9C 3ARWA 3ECQA 4DUVA 3TOPA 2XVGA 5IHSA 3AMDA 4AEEA 2W92A 4Z2HA 2CKRA 2EPLX 3ZOAA 3BMVA 4DUWA 1IZJA 1M53A 3HN3A 1ZU8A 3NSMA 6CGTA 3LMYA 4MAZA 3RILA 4NF7A 1PBGA 1WAWA 2CBIA 3LPGA 4MNMA 3THCA 1OT2A 5C70A 3AI0A 1NP2A 4P7RA 1PIGA 1I1XA 1CEOA 1KWGA 3UETA 4GZEA 4FK9A 1W9DM 3T0AA 4JKMA 4CD8A 3RMEA 3ALFA 2WHLA 4BS0A 4CCDA 3MUY1 1WDPA 3A4AA 3CHEA 4UQEA 1E9LA 3VD5A 4BCEA 2YL6A 4KWUA 3CBWA 1A47A 3ZT6A 1XRVA 4B3LA 3CIVA 1BTCA 2Y4SA 1GONA 3IANA 5M17A 1FFRA 4N0RA 1J12A 2W61A 2D24A 4TTUA 1E6NA 3W81A 1WZLA 4U3CA 3VIJA 4AMCA 2QPSA 1TMQA 2EQDA 3ZM8A 1QNSA 1UZ4A 1M7XA 3MSDA 2CIPA 1CIUA 1JYNA 5LA1A 1HKKA 2V5DA 3VM5A 1XSKA 5ABEA 1E6PA 3VILA 3QHNA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KRU A;  1HJU A;  3QOM A;  4RE4 A;  5A8O A;  2ZXQ A;  1E0W A;  1R7O A;  4PMR A;  1V3I A;  1OWQ A;  5A3H A;  3CUI A;  1MXG A;  5A6J A;  5A69 A;  2DSW A;  5TD4 A;  1D2K A;  1C7T A;  3K1D A;  1HT6 A;  1J0K A;  5A8Q A;  2W62 A;  4XZW A;  3VO0 A;  4E8D A;  1V03 A;  1MFV A;  1E72 M;  1UYQ A;  2J75 A;  1QBB A;  2J7F A;  4AD2 A;  2A3E A;  4S3J A;  3BCD A;  2WHJ A;  4CU6 A;  2FDM A;  1ITC A;  3N1A A;  2FH6 A;  4YPJ A;  1CXK A;  1H0I A;  4W84 A;  2V38 A;  1HL9 A;  4LYQ A;  5GPR A;  1XSI A;  2CPU A;  4FF5 A;  4UOJ A;  3WDR A;  3WQ8 A;  3D3A A;  4AEF A;  5I23 A;  2V3F A;  3WEM A;  5HPO A;  3UG3 A;  2UWF A;  2CHN A;  3EMZ A;  2EPM X;  2DQX A;  2YJQ A;  3VU2 A;  2DH2 A;  2VZO A;  1UWI A;  1PX8 A;  3PZO A;  2WCS A;  1DWH M;  4JL1 A;  3IAP A;  4KGJ A;  1HJS A;  1CXH A;  3BH4 A;  4LX4 A;  1UWS A;  1IT0 A;  5FCZ A;  4UQD A;  3IAQ A;  2DSV A;  3VIP A;  2PI6 A;  3PZG A;  1V6X A;  4XX6 A;  5I77 A;  2W63 A;  3MV0 1;  3NSN A;  1J10 A;  1CXL A;  3ARQ A;  4D71 A;  3WUE A;  1PJ9 A;  2Z1S A;  1NWS A;  1FFQ A;  1V6W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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