2CLEA

Tryptophan synthase in complex with n-(4'-trifluoromethoxybenzoyl)-2- amino-1-ethylphosphate (f6) - lowf6 complex
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
266
structure length
251
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Synthesis and Characterization of Allosteric Probes of Substrate Channeling in the Tryptophan Synthase Bienzyme Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 95
structure length 251
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cleA00
4RXGA 2DZPA 3TCEA 3FYOA 5G1TA 2QEZA 3NL3A 3HG4A 2ZBTA 3M47A 3M5ZA 3KVMA 2X1UA 5AB3A 1KA9F 5LNVA 1OX4A 4ADSA 3UZ5A 2QDHA 1H62A 3HPZA 4IWWA 3ABQA 1C9DA 1I2QA 1H7RA 1Z44A 4BWLC 1GYLA 3CU2A 3EWBX 5KITA 2YW4A 1KLZA 6TIMA 4JTIA 4FNSA 2WNNA 2B7OA 1XC4A 5FF4A 5D32A 2TPSA 1XL9A 2QAFA 1SW3A 3NR0A 1R30A 2QKFA 1KV8A 2QUVA 4NT0A 1W8SA 3G1DA 3IVTA 2QJGA 5LNWA 3P5YA 1EX5A 1IIGA 4TIMA 3HO8A 3ELFA 3S1WA 1SQ7A 5HWJA 3W1PA 3HGJA 4IMGA 3I65A 1VCFA 2ZRYA 2H3BA 1H5YA 1OX4B 4O11A 1IIHA 3MI2A 4ZL1A 3NPUA 5LGXA 5HWNA 4ZQMA 5AHFA 3TNOA 2RFGA 3IGSA 3W7DA 1R47A 1XDLA 2JGYA 5C2XA 5DN1A 5LKYA 2TMDA 3CWOX 3TUUA 1KTCA 4I9AA 2PC4A 4L4LA 1EP1A 3LGEA 3CM4A 3PBVA 1F05A 3EX3A 2TSYA 2Z1BA 3PUOA 4ADUA 3HB9A 3PSWA 1YDOA 4JEQA 3STCA 3KXQA 5FF3A 1PE1A 1KBJA 1A53A 1F73A 3L0GA 2P10A 5LHEA 2A6LA 3QRHA 3TQKA 2ZRZA 3S1VA 4GUJA 4UTKA 1SFLA 1OVDA 4O28A 4OHQA 1KFCA 1KFBA 3B8DA 1KM3A 3OA3A 4JTLA 1V5XA 3WK1A 2DU2A 4UTUA 4NQ1A 1KM0A 2FFCA 4Y90A 3FJLA 3NG3A 5EYWA 4PTNA 1EA0A 1KFKA 4O13A 4NXSA 3TMQA 1VS1A 2ZQ0A 2V2DA 2V2HA 3W7RA 4JNMA 3W1LA 1TV8A 4K37A 3P74A 3FOKA 4IMEA 4CNOA 1KM2A 4M5PA 3LXAA 2ZZ6A 1K03A 1RQBA 2DP3A 3L0NA 2QDGA 3A21A 4Z0JA 1XKYA 4MOZA 3KOFA 3L68A 3GK0A 3E96A 4PEKA 2CZDA 2RDTA 4LRTA 4N9EA 1YADA 2VC6A 1O94A 1SZGA 2QJHA 1JULA 1LCOA 3LCXA 3TE9A 4JDYA 4NJIA 2FB3A 4E38A 4DQWA 3TK7A 1DQXA 4KFOA 1FXPA 3N2MA 4HKPA 3GLCA 1R2RA 4PH6A 1VCVA 2NV2A 1NFBA 1RV8A 2PCQA 3OG3A 4BI6A 4DF1A 3W72A 1I2PA 4HNUA 5AN7A 4D2JA 4NJJA 3NQMA 3EX2A 4WY0F 5AC8A 4QITA 4UR8A 5U4NA 4FB7A 1XM3A 3TSDA 1RQHA 1S3HA 2E5CA 4TR9A 2E09A 3I6RA 3NPXA 2NUYA 4IXHA 1G67A 1UUMA 1EP3A 1TPWA 3O63A 4OGZA 1SZNA 2E68A 4RR4A 4EF8A 1AL7A 1JCXA 2VOMA 3FIGA 3E02A 1SFJA 4JY8A 4LUIA 3TU9A 3W74A 5H91A 3P8IA 2QJIA 5C54A 4NU7A 3TC6A 4RX0A 1W37A 3RLUA 2OX1A 4JTJA 4PCFA 3W83A 4LNYA 1G6CA 5D2TA 4MFDA 5ABTA 2YCEA 4ZVJA 2ISVA 1P0KA 3BG3A 3BG9A 1JRBA 3S9YA 2YFNA 1KM6A 3N19B 4NNAA 2YXGA 5L6UA 2J88A 1SO3A 1DJQA 3ZR4A 1S5TA 2HTMA 3UPWA 3OVPA 5I3FA 4JYDA 5G4WA 3TXZA 1EPXA 2Q8ZA 3IVUA 5G5IA 4UNLA 2GJNA 1TTIA 5T26A 1O60A 2WSQA 4A2SA 2ZA2A 2ISSA 4RXFA 1JVNA 4C1KA 4FXSA 1RVGA 3L65A 3A23A 3LRLA 2C1HA 3VE9A 4Y6GA 2V0TA 3BGJA 3M43A 3UWQA 3UXAA 4MJZA 3M41A 3CC1A 3W86A 1KW1A 4PL2A 3W2LA 2P1FA 3G1HA 2CLHA 1ZAHA 1PCKA 4JIQA 2V9DA 4LS2A 1KTBA 1H1ZA 4AB4A 1GVOA 4UTHA 4JR5A 1VLWA 3S1UA 5H2ZA 4MZ8A 1OF8A 3S5ZA 3LX9A 5DELA 3W2KA 3LHYA 4N2YA 2G96A 4FF7A 4X3ZA 4JN6A 5IM51 3LCLA 4XZ9A 1FWRA 4M7TA 3U8GA 4OU1A 2R94A 2WO5A 4XTDA 1B4EA 1HL2A 5E93A 3SSJA 4OE7A 3QW3A 2CFFA 3RU6A 2NV1A 3I7SA 1TJRA 1PIIA 4JTFA 2J9YA 3LRKA 1IXNA 1TTQA 1FDJA 1KLYA 1WDWA 3LHVA 4ZQOA 2Y7EA 2ZTKA 4JY9A 5AYXA 3PC0A 3M7WA 2BLEA 3S42A 1M7PA 1FWTA 1RD5A 5LNRA 1OK4A 3B0UX 4O10A 1GTHA 4JICA 3M5VA 1EWEA 3HJZA 3KVLA 3G1FA 1MEIA 3CT7A 3LCFA 2RKXA 2Y89A 4IMCA 3SGUA 4Z1AA 3ZWTA 4AWTA 3QQ0A 3S5OA 2HSAA 4L4MA 3G8EA 3BW4A 5DLCA 2C18A 3F4WA 1LP6A 1F76A 3EKLA 1P5BA 3F03K 5CZSA 3IIXA 5HWMA 1NSJA 1BWLA 3IIPA 1T8XA 1QPRA 2ZZ4A 4Z08A 1EEPA 3ANYA 5EMUA 3W2UA 3MBFA 4O8RA 4IX2A 2PURA 5LNSA 3IIVA 3E9AA 3GB6A 4I7VA 4AHQA 3BARA 1OHLA 3BW2A 3DU0A 4AWSA 1GJPA 3GXPA 4R34A 1W5OA 5SWUA 1VGAA 5D03A 3C0JA 3B05A 3V75A 1TREA 2GVLA 3L66A 5J5DA 5HNRA 4O4VA 4RKAA 3QEZA 3W1RA 3DXIA 3P5ZA 1W5MA 3S5YA 4TU1A 3L5AA 3NXFA 4DF2A 4UTTC 4GWEA 1SZFA 4BK9A 3H54A 3P82A 4EVZA 1OFRA 2C15A 3R8RA 5CPNA 3WJYA 2VKZG 3NQAA 4LV9A 3MP3A 2EF9A 2ZZ7A 4YCPA 1IGSA 1OYAA 1WX0A 2XN0A 4WD0A 1DOSA 3FYPA 3OEXA 4UTIA 3B06A 3FKRA 1AMKA 1H7WA 1YLVA 4HNNA 4UMAA 2GPTA 3N3MA 4CQ9A 3DKLA 3NZRA 3GXNA 5AHNA 1I45A 4X9SA 2A7RA 2ISWA 2XN1A 3IEBA 2BXVA 3CQ0A 4ZZ9A 4QISA 4LC8A 5LNUA 3GDLA 2B7QA 2G5WA 2DJXA 1A5BA 3GDKA 2E1DA 3HGSA 2ZFAA 1QPNA 3H53A 1OK6A 4FXRA 1WBJA 1X6UA 4Q33A 1ZJIA 3DHDA 1PV8A 2I9EA 1EUAA 1GVSA 4AXKA 3VNDA 1H60A 5U7SA 2QCHA 5FF2A 4WJEA 3W7LA 5DY2A 4LVAA 3QMTA 3W7QA 5AHLA 2YW3A 5D05A 3GNNA 3LLFA 1MEWA 3I7RA 1TIMA 4O0KA 3A24A 4K8EA 5E0KA 3NM3A 3UYCA 2W6RA 3VE7A 1FCQA 4O12A 2NXIA 4UTWA 5FEWA 1H7PA 1PHQA 3EEGA 1WXJA 1KV5A 4HT3A 3HQ1A 1D3HA 4J9JA 1W5QA 1FDYA 1JQXA 2QCLA 4O18A 4WQ6A 3P84A 5EL1A 4NNBA 1GQNA 1S5WA 4BWLA 3WJWA 3C3NA 1ZAJA 4JD4A 3W3OA 4GUFA 2NWRA 1PL9A 1Q6OA 3C2OA 3G1AA 4Q32A 1TPH1 4AWUA 2Y63A 4JTKA 2WSRA 3WJXA 3SI9A 1J5TA 3S8HA 1S5VA 5MHBA 1LZOA 1VRDA 1MSSA 4OBTA 4AAJA 3RLVA 3EXRA 3IV3A 3CIXA 5BMXA 4YL2A 4GNJA 3DAQA 4MYXA 4FNUA 2H8ZA 4RZ5A 5AC6A 5DCBA 3NO5A 4Y9AA 1HO1A 3QYQA 2YSWA 1T96A 3W9ZA 3GYEA 1A5CA 2E77A 1XCFA 3GR8A 1VHNA 4MPQA 3W1UA 3MP4A 3I7QA 5DBTA 1H1YA 1OFQA 1VYSX 3O6YX 3B0VC 5I3GA 5D33A 3KFTA 4JTGA 2NX3A 4S1FA 4QM1A 1VCGA 2QCNA 1QDSA 2Z6IA 3UY7A 2OJPA 1O95A 4UFKA 4O54A 2O7SA 5D30A 2Y6ZA 2JKPA 3DI1A 4JTHA 4TMCA 3N9RA 4LVGA 2VFGA 2CLMA 2WNZA 2VFEA 2EPHA 1SO5A 3CTLA 2DJLA 1YTDA 3RNDA 3DZ1A 5F2LA 2VXNA 3TC7A 2GVJA 4NUWA 5BNKA 3KRSA 2BZNA 3BPWA 1KTNA 2ZZ2A 2V5LA 1WOAA 1YTEA 1W3IA 4IUOA 2Y70A 1RZMA 2A2IA 1TPEA 2GJLA 5CZTA 1ADOA 3UZJA 5G2WA 1K7EA 2R14A 2B7NA 3KVJA 3GDMA 3NL5A 1L6SA 1XFBA 3MMTA 4S2CA 1LDCA 1W0MA 1F74A 2Y7GA 1LTDA 2FPTA 2OT1A 4JS3A 4C1LA 4YXGA 3AJXA 3W7EA 4P61A 2RDWA 3P61A 3TV8A 4QNWA 2QCDA 2V2CA 4M6VA 3V1PA 3IGXA 4O53A 2B7PA 3L5LA 3N9SA 1MZHA 3ZFHA 2NZLA 4CCDA 1G4SA 1VYRA 5K2ZA 3PBWA 3IIZA 2X1SA 1TQJA 3M0ZA 2NXHA 3DFPA 2WNQA 2I1OA 3EWYA 3TX9A 3QW4B 5K4ZA 2ALDA 3W7HA 5K4XA 4NJKA 3N14A 3O1NA 3O6CA 5AFDA 3NZ1A 2AGKA 1ZNNA 2PRMA 3TFXA 4NVTA 5F2MA 1H63A 1OF6A 1YTKA 1JJKA 2QCDB 1GG1A 4MLRA 1VPXA 1TO3A 3NGJA 3PBYA 5G2IA 3T7VA 1ZENA 4O1CA 5D2YA 4BF9A 4XBKA 3OHIA 3GAKA 3W2NA 1OG0A 4GUGA 4H4IA 3W1XA 2X1RA 4K7VA 3OVQA 1WYIA 4MY9A 2VFHA 1QWGA 2B0MA 5FF7A 3H55A 2A4AA 4NJGA 4DXVA 2O7QA 2WQPA 3B03A 3PAJA 3G1VA 4XBSA 5HMSA 5KMYA 3TAOA 2C19A 2Y7DA 2E6DA 3O06A 1V7YA 4TX9A 2CLEA 5FI8A 2LLEA 5KSWA 3LRMA 1QO5A 4N9CA 1Q45A 3CHVA 3LCHA 3SGZA 4NZJA 1A50A 4MY1A 3C2EA 2RHGA 5FEPA 3GZ3A 5TBOA 4HPJA 4NX0A 2YYTA 3JS3A 4RV8A 4A3UA 1L9WA 1WQ5A 3MO7A 3NOEA 4ZQNA 4GUIA 1E51A 1Y0EA 1SUXA 3C61A 3QQ1A 1CX9A 2GQAA 4M19A 3SZ8A 2EGZA 4UFJA 4Q4KA 5A5WA 3NPWA 4OV4A 1TSIA 1ZY9A 2DZXA 3LI0A 1MO0A 1N8FA 1P0NA 3W7GA 1D3GA 4JDBA 3W1TA 4NJHA 4YMZA 4ML9A 3LLDA 5EA9A 2XN2A 4JTEA 4JYFA 2NXGA 4ADTA 5FEZA 1L6WA 5CSRA 3C4UA 3M1ZA 1KM5A 3W70A 4QNEA 3QSRA 5D2VA 2AAMA 5CGQA 5KZDA 4H3DA 1EP2A 4BFAA 1B57A 1L6YA 4N4QA 4LOCA 5J5RA 3Q58A 5I3HA 1Q6QA 3PUDA 3WFAA 2FTPA 3S0CA 2FPVA 3QH2A 1OFOA 4A29A 5AHMA 3EXTA 1K8XA 4K6AA 5CSSA 4DEFA 1YDVA 2VENA 1KBIA 3LTYA 2QUUA 3NVTA 1PVNA 4LVFA 4O4WA 1WBHA 3CIWA 1PHWA 4IOTA 4BR1A 1R2TA 4MZYA 4DF0A 4FIRA 5A8GA 1NVMA 3UPBA 1X7FA 2V8ZA 3KAOA 3L9CA 1DL3A 3TQ0A 5I3IA 3MUXA 2WV8A 2Y85A 5D09A 4MIMA 4LS1A 1XBZA 3CWNA 2G95A 2J6XA 2QCEA 1LOQA 3W7PA 4E2BA 3LHWA 4WOQA 1AG1O 3IGUA 3QF0A 4N9BA 4FO4A 5BMWA 2Q8LA 4HHPA 2X1TA 5K9CA 1EB3A 5KZEA 1SW0A 4JX4A 1A5SA 5AOUA 1LRTA 4ZQPA 3U6WA 1HFBA 1H50A 1GPWA 5BRBA 1XUZA 4FNQA 5K9DA 3LCIA 3QJAA 2J27A 3EWXA 2CZFA 1UBSA 4QSHA 5F4WA 1VQTA 1D9EA 1Q6LA 3W7MA 4AVFA 2Z6JA 2WOQA 4UTTA 2ZZ3A 3TIMA 4JGDA 4FHAA 3W76A 1W3NA 3DI0A 4RJEA 3W7OA 1HTIA 2G97A 4A22A 1QOPA 4HPXA 2CLIA 1UCWA 3W85A 3G0UA 4U4MA 3CEPA 2ZZ1A 3R2GA 1VR6A 3N2XA 1QCWA 3W22A 4Z1DA 2ZTJA 1L2UA 1Z48A 3BGGA 3UWUA 3P81A 3BK0A 4AEOA 3B4UA 1JCMP 2YPIA 3DKJA 1OFEA 1W5NA 4H6KA 3OBKA 2NX9A 1OX6A 2YX0A 4KWVA 3HG5A 1BEUA 2RDUA 3G3DA 2DZVA 5TIMA 3QPYA 1LYXA 1Q3NA 4A21A 5BW6A 3UWVA 5LZLA 1JCYA 1TV5A 3EKZA 2H90A 2YGYA 3ABSA 3EWWA 2ZRUA 3N34A 4JTSA 1QPQA 2DZWA 4EF9A 1THFD 1TPFA 2QCGA 4IMFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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