2CLHA

Tryptophan synthase in complex with (naphthalene-2'-sulfonyl)-2-amino- 1-ethylphosphate (f19)
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
267
structure length
258
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Synthesis and characterization of allosteric probes of substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 102
structure length 258
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2clhA00
3G1AA 4MYAA 2X30A 3DI0A 1O95A 1SW7A 3W73A 4O0KA 1OX6A 4LT9A 5D04C 3P67A 2JKPA 4CCCA 1KM5A 2VELA 1H7RA 3WK0A 4JX6A 3JS3A 3GLCA 1LORA 4O17A 3MWAA 1VH7A 1KV8A 4M19A 1MXSA 2UV8G 3GAYA 2I9EA 3F1QA 1FXQA 3EX2A 4WOZA 1LBMA 2NXHA 5D02A 2BWGA 1KFLA 4UIOA 3FYPA 3NPVA 1YLVA 1QO2A 3DHDA 4UR7A 4E0CA 2PRMA 1Q6LA 4EOUA 1XDLA 4FB7A 1B4KA 5HULA 3TW7A 1RQHA 5HUOA 1TPB1 3KX6A 1ZHAA 3U8GA 4CQ9A 3T40A 1VCVA 3QZEA 1FQ0A 4HNUA 2HS8A 1WA3A 3S1VA 1FY6A 3NZRA 2Y70A 3HOJA 3TNOA 4JNMA 1LLWA 2W6RA 3HJZA 3OEXA 3FYOA 2GVLA 1FXPA 4PH6A 1R2SA 3SGZA 1JCYA 4MFEA 4HPJA 1FWTA 3IVUA 3LOTA 2GOUA 3N73A 3P74A 4U4MA 1AG1O 1KBIA 2JGQA 3MBFA 3THAA 4GUHA 4O0ZA 1K8XA 3C52A 4ZQNA 4MLJA 1OF8A 1XBXA 3WJYA 1OX4A 2OCZA 2WOQA 4AVFA 1DKWA 2A21A 3LI0A 5CPNA 4NX5A 1NVMA 3HGJA 1OFDA 2RH9A 3M5ZA 1O4UA 4XQ6A 4IX2A 2DP3A 1TPUA 3HBLA 3C2EA 1XCFA 1VS1A 4UTKA 3GIYA 4Y90A 3UPWA 1YXCA 4JTLA 1ZY9A 3PBWA 1PVNA 5DELA 4UFIA 4NUWA 5F2LA 3W83A 5K9XA 3PS7A 4JTFA 1FCUA 1IIHA 3W22A 3PG8A 1PL9A 2QAPA 1GPWA 2DZPA 2YCEA 3S9YA 5KMYA 4UNLA 2HTMA 4H3DA 4POCA 1XFBA 3Q94A 3SY5A 1X8FA 3JRKA 4HNTA 5BNKA 5D33A 2C18A 4DPPA 1P4CA 3MHUA 1VPXA 1RVGA 1I2OA 3R5EA 3PSVA 5AHMA 1EUAA 3IGSA 3LGEA 3W7QA 4OT7A 3QSTA 5F4WA 1MEIA 2QR6A 1PCKA 1EWEA 2WPBA 1TSIA 4O18A 1PHWA 4TMCA 5AHNA 3TROA 2X2GA 3EXSA 5CZJA 4PC8A 1DORA 5D2WA 5AC7A 3EWXA 1SZNA 3WK1A 2CZEA 2V9DA 5E1QA 4NX0A 1WQ5A 5I3JA 3RNDA 3NDOA 2H6RA 2FJKA 4AHOA 1LRNA 3DKJA 3FLUA 4AB4A 1YDOA 4JTGA 4C1LA 4XBKA 4UR8A 1JCXA 1SFJA 1ME9A 2V5LA 3IIXA 5GVJA 4UTMA 1KFEA 2PC4A 3A5FA 3QRHA 3LTSA 4M7TA 1TQJA 3IIZA 3F4WA 3DFQA 2A7RA 3FJLA 3LBCA 3P62A 2DZVA 1TYGA 4IOTA 3W71A 4B5NA 2EKCA 3IRDA 4YCOA 3MUXA 5HR7A 1AW5A 3DKLA 3M16A 4IGHA 1EP2A 1XBYA 4JX5A 4ZL1A 4ORIA 1NF7A 3G18A 2QF7A 4OV4A 2BSLA 3CIXA 5F2GA 2C3ZA 1QOQA 2E09A 2Y7FA 1TPH1 4IWWA 2QUUA 2E5DA 4O4VA 3NQAA 4Z0SA 3S42A 4YL2A 2KZHA 1W31A 1KFJA 3W2KA 1L6YA 3UWUA 4M6QA 3G22A 3QFEA 1Z48A 2DZUA 4DEFA 3NNTA 4AHPA 2RKXA 1RZMA 3PUEA 1YTKA 3M9YA 3G8EA 4AXKA 2FB2A 2G95A 4OU1A 3W7MA 1KM0A 3G1FA 5C54A 3BG3A 2FPTA 2J9XA 3NL6A 4TU1A 1ZFJA 3GKAA 3TJXA 5U4NA 1Z42A 1DOSA 4UFKA 3A23A 3ANYA 4N6FA 2PE4A 2GQ9A 1WYIA 2J27A 1TTPA 1CX9A 1W8SA 4MY1A 2ZFAA 4MYXA 4UC5A 4K36A 1LLZA 1TJRA 3L0GA 3NQGA 3SJ3A 3BLFA 1EWDA 4FX8A 2XN1A 3SZ8A 5U7SA 4FIRA 4WJEA 3QPYA 3HG3A 4LY8A 2FFCA 2EGZA 1TB3A 1TPEA 5TIMA 5BOOA 3PC0A 1WOAA 4JDYA 3W7JA 4LVAA 3P82A 4QJ1A 4E2BA 1GVSA 4NJGA 2OT1A 1FBAA 4MOZA 1GJPA 3NQ2A 3BVJA 1SFLA 3NOEA 4DO5A 5KSWA 1QNVA 4G1KA 4NXKA 3TSBA 3KVLA 3NEVA 3U2OA 1GYLA 1NF0A 4D2JA 3BW4A 1VGAA 1H5YA 2FB3A 1H60A 3ZWSA 2Y7DA 3P61A 5D32A 3HPXA 3D0CA 3GXNA 2DJLA 2CZ5A 2QCMA 4NNAA 1BWKA 3TE9A 3GDKA 3W3OA 4CCEA 1S5VA 4JICA 4PODA 2FTPA 1LOQA 4WXYA 3MI3A 2I14A 1U5JA 4O1AA 1W3IA 2DZWA 4JEQA 4MLRA 3A21A 3QMRA 3TQ0A 1M5WA 3EWYA 3TMQA 1ZENA 5FI8A 1KTCA 1W3TA 3LXAA 4P2VA 1XL9A 1F73A 4ADTA 2WNNA 3BW3A 3G3MA 4K8HA 3LB0A 1DHPA 2OMAA 2R94A 4KFPA 2H8ZA 4JS3A 5F2MA 3S5NA 3GX9A 2YX0A 5CG7A 1QAPA 3W2JA 2OZ0A 3PM6A 5AYXA 5G2IA 3BARA 1O5KA 2C13A 4O13A 2OX1A 5FEZA 1DV7A 1GVQA 4XKYA 4FXRA 4TO8A 5FEXA 4AF0A 3PUOA 5CZSA 2H90A 2JGYA 4L4LA 3GDMA 2Y88A 3S8HA 4FEZA 3QMTA 2AQWA 1SUXA 2W0UA 4JTTA 4MPQA 1DJNA 3NL3A 3M7WA 3OA3A 1WBJA 2PRHA 5T26A 5AC8A 1KM1A 1DQWA 2CLMA 4DF1A 1OFRA 4O1DA 3TAKA 4QNWA 1Q6RA 3CQ0A 3MJYA 1A5AA 2ZZ3A 2E6YA 2V81A 3PSWA 4NJIA 2HS6A 3A9IA 3ZS4A 1SPQA 2Z0IA 3CB8A 3LLFA 2H8XA 1IIGA 3CIWA 1FWNA 3NXFA 4RV8A 3TA6A 2Z6JA 3DFPA 5EYWA 4AWUA 3WJWA 2C14A 3T78A 2Y85A 1ZJIA 1RV8A 1YTEA 1H63A 4GFSA 4BWLA 1G7UA 5BMWA 1KBJA 5F4SA 1TPFA 2GVJA 1X6UA 2NUYA 5DLCA 3SECA 3TX9A 1H7OA 1FX6A 4EIVA 4K38A 2R91A 2GPTA 2ISVA 3GDRA 3UPBA 3HMJG 4Q4KA 3P84A 3NM1A 2X1SA 5AHEA 4JYFA 3O6DA 1BEUA 5LHEA 3QMSA 4IMDA 3LHWA 1HG3A 1M7PA 2QCEA 2YXGA 2LLEA 3E02A 2E6FA 1KTBA 4LS1A 2NX3A 1HL2A 3GVGA 4XUGA 1KV5A 2ISWA 5K4ZA 3W1MA 3S1UA 1QO5A 3P81A 1KM6A 4GRSA 1FWRA 4MFDA 5FF7A 3LXBA 1SZFA 4N6EA 1KFCA 5DBTA 2ZRUA 4FNSA 1B4EA 4Y8FA 1H1ZA 3PY2A 5G1YA 5KINA 1LOSA 4C1KA 4O1CA 5LNVA 1O5XA 1T96A 3MYOA 4ZQOA 1H1YA 5H91A 1A5SA 1G67A 3Q37A 3W1LA 1I4NA 1WOBA 4DQWA 3PB0A 2V2HA 4JIQA 1OG0A 2DZXA 1P0NA 1SO6A 2A4AA 2V82A 4ADUA 2ZZ6A 4JXCA 3HG2A 1JRBA 1XM3A 5MHBA 4Q33A 1ADOA 3MP4A 4ZMGA 4YMZA 5FF3A 1NEYA 1JRCA 3KHJA 2QCCA 4GNJA 3STGA 5DXYA 2VENA 2ZZ7A 4MVAA 5DBUA 1GG1A 1D9EA 1Z44A 2OJPA 2TSYA 3HB9A 1BWLA 1JUBA 1E51A 5EKYA 3LDVA 3A22A 3S6DA 2ZRVA 2D73A 1SR9A 2FPYA 3QM3A 3OVRA 4NVTA 3HQ1A 4N02A 1NSJA 5HWJA 2CLLA 3IV3A 2GQ8A 2C16A 3C8FA 1GEQA 1JJKA 2YFNA 4GE8A 1L9WA 2QUTA 3USBA 4UFMA 1ZAHA 2BLEA 3DHFA 4PCFA 3QEZA 3P60A 3A5VA 2F7FA 3PULA 1GG0A 4UTJA 2YZRA 3C2VA 1LCOA 3TQKA 1J2WA 1F2JA 1KA9F 3WK2A 5K9DA 2EPHA 1G69A 1EP1A 3KRSA 1GWJA 1W0MA 3R12A 3OBKA 3UWYA 2Y7EA 3W2LA 1J4EA 4I7VA 4O8RA 2JKEA 1W5PA 2CZDA 2ALDA 1LROA 2DORA 1KM4A 4UTTC 1VZWA 3W7RA 1X1OA 3B06A 4BI5A 1JCNA 3KFTA 1QPOA 4RXFA 4W9TA 1LRQA 3KXQA 1OF6A 2GVGA 2XFWA 1PIIA 5G5IA 3S5OA 2YDAA 3UZJA 1TPC1 5A5WA 5DCBA 3I7SA 2WV8A 1DJQA 4E2DA 1XC4A 3VCRA 4MZ1A 1I8JA 1K02A 4CLMA 3PB2A 2AGKA 5AOUA 4H6KA 3W1PA 5CPLA 3CTLA 4OBTA 4BI7A 7TIMA 4JR5A 4UTHA 2J9ZA 3AJXA 5D09A 4OQVA 2J24A 4GUGA 1TTJA 3QC3A 1OABA 4FNPA 4NJKA 1AL8A 3HG4A 3IIVA 3INPA 1OFEA 3HGRA 4TX9A 3L5MA 1UB3A 4MZYA 3W1NA 1L2UA 1TPWA 5LSMA 1TV5A 3N19B 5TBOA 4EVZA 3LCFA 5G4EA 1I2RA 2CW6A 4ALDA 5HQEA 2A7PA 3B0VC 3TJLA 4AHQA 5I3FA 1JUKA 3W1QA 2NWSA 1CI1A 4ONVA 4PA8A 4UXDA 2ZA3A 3LXCA 2W79A 2GJNA 1FWWA 3MW7A 4PL2A 1R47A 1SZEA 5AHFA 4OE7A 1MEWA 2ZQ0A 3C4UA 2B7NA 2CLFA 1MO0A 1OFOA 2CLKA 3G1DA 4Z0JA 1EB3A 1F6PA 3U6WA 5CZ0A 2FQIA 4DBEA 1Y0EA 1K7XA 5K9CA 4IMEA 3GKFA 5KITA 2TMDA 1YADA 2VEKA 3DXIA 1KLYA 1JULA 3UWZA 3L9CA 4GUIA 2NV1A 5F1VA 3NQMA 1SO5A 1P1XA 1WXJA 3DI1A 3M5XA 2G5WA 4BF9A 1LP6A 4HSOA 4KWVA 1R46A 3UZ5A 3MO7A 1GQNA 4WUIA 3W7EA 2QEZA 4DELA 2ABBA 1O94A 1OFBA 2ZBTA 3UD6A 3GDTA 2Q8ZA 1H61A 1KFKA 2YW4A 3NVTA 2JK2A 4N4QA 3RK8A 1GTHA 2RDTA 3NQFA 4JTKA 3EX6A 1VR6A 1P5BA 2ZZ4A 3M41A 2HSAA 3NQDA 4X2RA 2I1OA 1VLIA 2DJXA 3QQ0A 3LI1A 1QOPA 2ZTJA 2NUXA 4NZJA 4BR1A 4WY0B 4Z1CA 2Q8LA 5FEWA 1TPDA 2V5BA 1VQTA 2VKZG 3NZ1A 4CCDA 4Z1BA 3LERA 4UMAA 4YXGA 3DAQA 5DN1A 2QCDB 3RMJA 1TRDA 3NA8A 3W7IA 3NQ6A 4UUIA 1FDZA 5I3HA 3EKLA 3SI9A 5K3VA 4LRSA 4A29A 1A5CA 5D2TA 1VYPX 2RDUA 4BFAA 4XWUA 4DXVA 4A21A 3FJ6A 2Y6ZA 3L0KA 1TREA 1IXNA 1AMKA 1W5NA 4KFNA 3V75A 3PVFA 3TC7A 1M6JA 3I7RA 3GR7A 1EX5A 3VFLA 4BI6A 5EA9A 1EIXA 1TQXA 2O7SA 4ZQRA 3STEA 3MYPA 5AC6A 5AFDA 3LCHA 3W9ZA 3GXTA 3EWUA 2VOMA 2R14A 1UUOA 3C6CA 3QW3A 5D37A 5DXXA 1FCQA 4N2YA 3B4UA 3O63A 4JIPA 4O10A 4CQ8A 4MIMA 1T99A 5HR6A 2BZNA 4FX7A 2A85A 3H53A 1GVOA 4KFOA 5AHLA 3E12A 1ICPA 1ONRA 4XTDA 1B3OA 1WBHA 2V2DA 4HIBA 5LNSA 1THFD 5HNRA 3LRKA 1HO1A 5HINA 2VFDA 2C19A 3P5YA 5I3KA 3C0JA 1W5OA 3CEPA 4UTWA 5C5YA 3PBYA 3L67A 1Z41A 4O28A 1VYRA 3DFTA 4NZFA 1GVFA 2VC6A 4EWND 4NJHA 1TO3A 1QCWA 3DFNA 4IJBA 4JTEA 1HFBA 3EX3A 2XN0A 2NZLA 3OVQA 4GUJA 2BXVA 3W1UA 3NG3A 3UYCA 3NL5A 4K7YA 4JTJA 4CNNA 3W70A 5L6UA 4KWWA 2NX1A 3N14A 1GTEA 1C29A 4AWSA 1W1ZA 5FESA 3CPRA 3H54A 2NLIA 4CQAA 3P5ZA 2WNQA 3O16A 2Z2UA 5D2VA 3EXTA 2ZZ5A 5F4XA 5H2ZA 4K6AA 5FF4A 4DBDA 3UXDA 3QJAA 4O52A 1G4PA 4N9EA 1OYCA 3ABRA 3WJZA 2E68A 5D05A 1A5BA 4QISA 3BGJA 2YSWA 2ZZ1A 4A3UA 4LV4A 2WKJA 3PBVA 4UFHA 2ATSA 3VI2A 4GWEA 4LRTA 3W2MA 3R89A 5LHFA 4Y9AA 1G4SA 3TUUA 3P8IA 4UMBA 3W1RA 3ELFA 1SW0A 4FO4A 4M6PA 3IEBA 3M47A 1ME7A 1UBSA 2C6QA 3DFSA 5G2HA 1ZAJA 3W7OA 5J5RA 3MBDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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