2CLIA

Tryptophan synthase in complex with n-(4'- trifluoromethoxybenzenesulfonyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f9)
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
268
structure length
258
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Synthesis and Characterization of Allosteric Probes of Substrate Channeling in the Tryptophan Synthase Bienzyme Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 101
structure length 258
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cliA00
2WSRA 3I65A 4R33A 4O28A 2A7RA 2DJXA 3C61A 3EKZA 3ANYA 3TQVA 4ZQRA 4O50A 4IXXA 1H7RA 5TIMA 3M9YA 1JCMP 3NQVA 3TJXA 2ZZ6A 1K8XA 5T26A 3Q37A 3S5OA 2E09A 1NEYA 3S1VA 4U4MA 2ABAA 2Y7GA 5TQLA 3W1NA 3Q94A 1JULA 4GUFA 3DI1A 3S1XA 1JCJA 5F2MA 1KBJA 4LTSA 3O6YX 4A2RA 2A7NA 2QCEA 4YLWA 3MBDA 4CCEA 1GTEA 1R2RA 2R94A 3BARA 5D2VA 1RZMA 1XUZA 1AL7A 3SGZA 1F74A 4A22A 4LT9A 6ALDA 1AG1O 5HWNA 5F2LA 3TC6A 2ZRWA 1YXYA 2BXVA 4GJ1A 1TIMA 3L5LA 3S5ZA 2O7SA 2QJGA 3TW6A 1ADOA 4DF1A 2V8ZA 2OT1A 4IXHA 1TQJA 4WJEA 1SFLA 4ZQMA 4BI7A 4JIPA 1WAUA 3GDRA 1NAL1 1LBMA 3YPIA 2GVLA 3HO8A 4JY9A 3NQFA 5LZLA 1IXPA 3UXAA 1KFLA 3E02A 1N8FA 3LM7A 4Z0JA 1A5BA 4IOTA 3DGRA 5CG7A 2KZHA 2DJLA 5EMUA 4NXKA 1HFBA 4NX0A 2WJZA 4JN6A 1ZJIA 3K30A 4XTDA 2CLHA 4RZ6A 4CCDA 1XUUA 3NL5A 1LCOA 2ATMA 1L9WA 2B7PA 1MEIA 4TU1A 1WXJA 2RDUA 5G2IA 2I1OA 4IUOA 3G1FA 4UUIA 1TPVA 2QDHA 1DHPA 2V5LA 5AHIA 2HTMA 3C4UA 2Z6IA 1W3IA 1K7EA 3UWYA 3FLUA 3NAVA 3HBLA 3R12A 1NF0A 3U8GA 4A3UA 3B03A 2OCZA 3LDVA 3EX3A 4XTIA 2P10A 2CFFA 3TKFA 4OV4A 2VOMA 2C18A 4ML9A 4ADTA 4O1DA 4POCA 3S5YA 1KLZA 3AJXA 3GR7A 1PV8A 3A5FA 4E38A 3TA6A 4ZL1A 1QOPA 4JYEA 1SSGA 2YGYA 3M41A 5D2XA 1VCGA 3B06A 3W2NA 3RFAA 3TDFA 4JTSA 3B05A 3PB2A 2J27A 4UIOA 3LTSA 3C2FA 2H90A 4KFOA 3N14A 1DKWA 4QM1A 5D2TA 3EKLA 4LOCA 3G24A 3VNDA 5L9FA 5LNSA 4MY1A 1ICSA 5F4SA 4AWSA 1FBAA 2E5DA 3NPWA 2TYSA 2JK2A 5EBUA 1O94A 2FPTA 2OMAA 2VC6A 4MVAA 3C8FA 2CLFA 1VHNA 4O1CA 3LTYA 2NWSA 4DPPA 1XL9A 1LLZA 3EWBX 3MJYA 2FB3A 1SW3A 2ABBA 4IMCA 2VFFA 3O8AA 4JTHA 3W1RA 1RV8A 4GC4A 3IVSA 1E51A 1Q6OA 3JRKA 1TJRA 4NZFA 4RXGA 1SZNA 2GVGA 1F05A 4L4MA 4N4PA 1DORA 4S2BA 1DQXA 1J5TA 2QCDA 1TTJA 1YADA 3PBVA 5HINA 3KAOA 3UWZA 2E6YA 1R30A 5HMSA 2O7QA 4RV8A 1LM1A 2ISVA 4M6VA 5I3JA 3OVPA 5KZDA 3I7SA 3CQ0A 3OEXA 4MYXA 4UFHA 3W75A 1S5WA 2QUUA 1GTHA 3NVTA 4RCXA 1GVQA 3LHUA 5DLCA 3GR8A 4OT7A 4ZVJA 5K9XA 2DZSA 3PR2A 5I3IA 3G8EA 3PULA 4O52A 5AN7A 2WNQA 2CZ5A 3QMRA 1GZGA 3DBPA 1VR6A 3GKAA 4R7JA 2R91A 2YW3A 4QJ1A 3NGJA 1OG0A 2GQAA 1WQ5A 2W79A 1AMKA 2A5HA 3QW3A 4JTUA 4Y6GA 5F2IA 3WK3A 3CWNA 3OIXA 2DZPA 4OV9A 3SR7A 3W7LA 1KM2A 1UBSA 4JD4A 3NO5A 1DBTA 5A5WA 4WD0A 3DH7A 3LXBA 3W6YA 3D0CA 3SIZA 4FF7A 1N7KA 3S8HA 2QCLA 2Y61A 2YDAA 4JTFA 4YL2A 3EXTA 4K6AA 3W1TA 4GFSA 3TXZA 4Q32A 5LKYA 3CIWA 1KA9F 2C15A 4GUIA 2RHGA 1LRTA 3NG3A 3W7CA 1F5ZA 2QJIA 1OFEA 4MFEA 4UTKA 3P74A 2F7FA 3L5MA 4UTIA 2NUXA 3EWUA 3S42A 6TIMA 4X2RA 4PL2A 1LBLA 3GDMA 2CZDA 5G2HA 4LRTA 4K7YA 1XBVA 4FX8A 3W7HA 1FX6A 4MFDA 3PG9A 3TAKA 2PC4A 1KBIA 1OABA 1KM3A 4IMDA 4TR9A 1SPQA 4AXKA 4O16A 1KFCA 5CGQA 3ZWSA 5AC7A 3L9CA 1G4SA 2NX9A 1P0NA 1IXOA 1HL2A 3W22A 1TJPA 4EF8A 1GJPA 3G0UA 3NQ2A 3EWZA 5G1YA 1PE1A 3UY7A 3HGRA 3PS7A 3L2IA 4K8HA 1I2NA 2NXIA 5DCBA 2C14A 3P67A 4Y8FA 1QFEA 5K4ZA 2FPYA 1ZAJA 3MP5A 4AH7A 3DU0A 1XDMA 4AWTA 1W1ZA 4L4LA 1JJKA 3LCLA 5CKSA 2QAPA 3DFOA 4H4IA 1X1ZA 4IQLA 4UFIA 1LOSA 2A0NA 1W3TA 3S9YA 3QYQA 4BK9A 2XN2A 4DQWA 1FWTA 5AHEA 1TPUA 3CHVA 1X8FA 4CNNA 3W7QA 3FS2A 4O0KA 1S5VA 1K7FA 1MZHA 1SR9A 4AHQA 3LHZA 3M6YA 5IBXA 1W56A 4UNKA 3GDTA 4Z1DA 1VLWA 3S6DA 3W7OA 5L6UA 4BI6A 2V81A 3P80A 3RLVA 1OFPA 3QSRA 1KTNA 3PF3A 3TV8A 1YXCA 1IXNA 3LCHA 3PUOA 5J5RA 2JBMA 3A9IA 4E2BA 3P62A 4GUHA 3LB0A 4MLJA 2BSLA 4H6KA 1OHLA 4O1AA 3QF0A 2YCEA 1FCVA 4NXSA 3KHJA 3O6CA 3W2LA 2FTPA 4QISA 5DBTA 4AF0A 1TQXA 3BLIA 3UWWA 1ME9A 4GBUA 3RMJA 3SECA 5KMYA 3TAOA 4DF0A 4WX2A 4JS3A 1W0MA 1QCWA 4KFPA 3LCGA 3W85A 3WJYA 3TMLA 1RQEA 3QMTA 1Q6QA 3JR2A 4P2VA 4JDYA 4JTJA 5GVJA 1OYCA 3P8JA 5I3HA 4E2DA 1KM6A 4FX6M 3Q2DA 3UXDA 3KVMA 2CLEA 1P1XA 1D3HA 1RR2A 1L6YA 4JTIA 2NXGA 2QCFA 4NU7A 3P8IA 5CPLA 1XFBA 4ZQOA 3O15A 4UFMA 3QRHA 3TXVA 4HSOA 4TX9A 2TPSA 1FDZA 1ME8A 3HOJA 4FNSA 3FJLA 2YYUA 2QCDB 2ZTJA 3KOFA 5E93A 1IXQA 2ISSA 1R46A 3JS3A 5K9CA 3A22A 3GX9A 1P5BA 3S0CA 2J6XA 2IQTA 3P81A 4JTEA 3STCA 5HUPA 4HSNA 4Z0SA 3U6WA 4KWVA 1RQBA 3PVFA 3N2XA 3PBUA 4CNOA 4WXYA 4XWUA 5HNRA 1WV2A 2ZZ3A 4LS1A 3QJAA 1JVNA 4O18A 4O15A 2CLMA 3LXCA 4UMBA 1OK6A 4DPQA 3MWAA 3F03K 3IGXA 2EGZA 2FPVA 4EWND 4LC6A 3NM1A 4GXMA 3QQ0A 1WOBA 1W37A 1UJPA 3NQ7A 3MYOA 3USBA 5KINA 4XQ6A 1TPC1 5D09A 4OGZA 1IIGA 1H7PA 4TMBA 3A24A 1THFD 5H91A 3GK0A 3LOTA 2AGKA 4HNUA 2V30A 1W5QA 2DORA 1EWEA 3ZR4A 3NQGA 5AYXA 3GAYA 1YTKA 3LLFA 3LRMA 4LVDA 3GXTA 4OE7A 3GDLA 4EIVA 1G67A 1K7XA 1JCLA 4LVGA 2ZQ0A 3DZ1A 3HG3A 3T78A 3MHFA 4ZQNA 3ZWTA 3VCRA 4AAJA 2H3BA 4FIRA 2J9ZA 1OK4A 4M5PA 3WJSA 1XCFA 5D37A 2VFHA 1XDLA 5G5IA 1XC4A 3CIXA 5HR7A 1HO4A 5BMXA 2A21A 2BX7A 1G6CA 3MYPA 1I4NA 3KVLA 2YSWA 4Z1BA 5AHNA 3L66A 1G7UA 2G97A 2CZEA 3TW7A 1F76A 3A5VA 4QNWA 1GQNA 3WFAA 3E49A 3W88A 1PVNA 3BW4A 2E1DA 2DZXA 5CSSA 1MO0A 1DQWA 3W7KA 4M7SA 2OJPA 2GPTA 5U7SA 3IIPA 4JTTA 1ALDA 2E6DA 2ZTKA 1QPOA 4GUGA 3EWYA 3W74A 3AO0A 1GT8A 2Y63A 2HS8A 2Y7FA 2DZTA 4A29A 3ABRA 4C1LA 4MZYA 3ABQA 3PM6A 3OVRA 1WBHA 1QO2A 3BG5A 1H7OA 1WX0A 3M44A 1NVMA 4OU1A 4GRSA 4NVTA 2YW4A 1ME7A 3O16A 1TB3A 1VZWA 3NZ1A 1QDSA 2B7NA 3TROA 4DF2A 5EL1A 2Q8LA 4QAIA 1EIXA 3HQ1A 3G3MA 1W3NA 1H50A 4NNAA 3W3OA 2HMCA 2WSQA 3O1NA 3PBWA 3BLEA 3IGSA 3PWAA 4X22A 3VE9A 3W7PA 4JDBA 5LHEA 3G0XA 2CU0A 2PRLA 2ZFAA 2ZZ1A 3PSWA 1YXDA 4A2SA 2BZNA 1TV7A 5HWJA 1I2PA 3Q58A 3TIMA 3RF9A 5BOOA 1H5YA 3LCXA 1Q6LA 2PCQA 3W7NA 3LX9A 4FX7A 4O0ZA 3W86A 4I7VA 2YXGA 4HN4A 4GUJA 3G0SA 1EWDA 5CPMA 4LWWA 3KRUA 5IBXC 3PUEA 4FNRA 1K8YA 1R2TA 3MW7A 4MLRA 3LHWA 2PURA 3ZS4A 3N9RA 1EP2A 2R14A 3BW3A 1TO3A 1F73A 5HR6A 3EX2A 4LS0A 1DJQA 2X2GA 3QMSA 1H62A 1TTPA 2FQIA 3G3DA 4DEFA 3G8RA 4X9SA 4NUWA 3HG4A 1Q3NA 1LOLA 3HG2A 4ZMGA 3C3NA 3NQAA 3OA3A 4RLIA 4UTHA 3KVJA 1MSSA 1SFJA 4AF0B 2Y7EA 2LLEA 1O4UA 1H7NA 3SFKA 1YYAA 4I7UA 3NPVA 3OHIA 1M7PA 1SO5A 2C3ZA 1C9DA 1VRDA 3TU9A 1KFBA 3P60A 3T44A 1TTIA 5TBOA 1WA3A 3QEZA 5IM51 4PC8A 2QJHA 2QR6A 2NXHA 3MHUA 3VE7A 2Z6JA 2ZZ4A 4ORIA 3LHYA 1KFEA 4LV4A 4UTWC 3L67A 2GOUA 1X7FA 1VHCA 1B9BA 1OX6A 1G7VA 1TPH1 1TTQA 3P84A 2YFNA 1EP1A 4Z08A 4H3DA 4UR7A 3FJ6A 3SJ3A 4XBSA 4FNTA 2H8XA 2PE4A 1SO4A 3TUUA 1M7OA 4M7TA 4GNJA 3TX9A 3GDKA 1T99A 3IEBA 3ABSA 3CC1A 1O5KA 3GYEA 4RJEA 5K7JA 1OFAA 4K39A 1HG3A 4JXCA 3LCIA 2V2DA 1O5XA 1YDOA 3NQ8A 1CI1A 5LSMA 2WNNA 4IX0A 1OVDA 1DV7A 5DBUA 5F2GA 1TPB1 3NQEA 1I2RA 2G95A 1FXQA 1CX9A 1VS1A 1GVSA 1ZALA 4NJHA 1X6UA 2EHHA 1A53A 3CB8A 1Z48A 2ZA2A 3NDOA 4WUIA 1K8ZA 4RZ4A 3WJXA 2FB2A 3L0KA 1MXSA 1GPWA 4K7VA 1FXPA 4O17A 3VFLA 2PRHA 4YCOA 4N4QA 2TRSA 3BG9A 4YMZA 5AB3A 2DZWA 2Z0IA 4O54A 3IGUA 1Z41A 3QFEA 3QH2A 4LUJA 4OBTA 3FA5A 1OFOA 3L21A 4N6FA 3W1XA 2QCHA 4N6EA 1LP6A 3N73A 2V2HA 3BLFA 1UCWA 4BI5A 2FDSA 3W1UA 4NJJA 1W5NA 4UTLA 4UFJA 2VKZG 1KFKA 5FF7A 3UNDA 4PA8A 3H53A 4IGHA 3GLCA 3H54A 2YPIA 3MO7A 4DBDA 1VGAA 3BK0A 4XZ9A 3SY5A 2B0MA 2C19A 1KTBA 3N3MA 3MHGA 1A50A 1F7BA 2CLKA 3CT7A 3I7RA 2FFCA 2FIQA 1YPFA 4LW7A 3DKJA 4NJKA 3EX4A 4Y9AA 3L5AA 3U2OA 2JKEA 1O95A 2VFIA 3C6CA 5D38A 2QKFA 2J24A 2ZRXA 4LNYA 1L6WA 3NL3A 1OF6A 2CWNA 2DZUA 1X1OA 3I68A 1I2QA 2V0TA 3FFSA 3BG3A 3BGJA 4MJZA 1S5TA 3CLMA 4UCGA 4HNVA 1G4PA 4NNBA 4Z1AA 2X16A 3NL2A 5AFDA 3P61A 3FKRA 4CCCA 3DAQA 3HMJG 4JR5A 3RNDA 3IIZA 4EVZA 3F4NA 3G1HA 5G1TA 4MKNA 5F4XA 1OX4A 4WXZA 2BTMA 5AYYA 3W9ZA 1Z42A 2ZRUA 3W7IA 3LXAA 2JGQA 3GNNA 3GIYA 3LRLA 3UY8A 1EUAA 3STFA 1JR1A 1FWRA 2DU2A 5KZMA 4CQ8A 5K4XA 3BVJA 1H1ZA 3HGOA 1JRBA 3QZEA 1JCNA 4FO4A 1ZCOA 1M6JA 1ML1A 2WPBA 5C54A 3PB0A 1K3UA 4LV9A 3O6DA 2VEPA 5FF2A 5FESA 2XFWA 3W84A 4JX4A 4ZZ9A 5FEWA 1B4EA 2HS6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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