2CU0A

Crystal structure of inosine-5'-monophosphate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
478
structure length
358
Chain Sequence
KFVEKLEKAIKGYTFDDVLLIPQATEVEPKDVDVSTRITPNVKLNIPILSAAMDTVTEWEMAVAMAREGGLGVIHRNMGIEEQVEQVKRVKRAEKYKNAVRDENGELLVAAAVSPFDIKRAIELDKAGVDVIVVDTAHAHNLKAIKSMKEMRQKVDADFIVGNIANPKAVDDLTFADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQITAVAMVADRAQEYGLYVIADGGIRYSGDIVKAIAAGADAVMLGNLLAGTKEAPGKEVIINGRKYKQYRGMGSLGAMMKYMKTRKFVPEGVEGVVPYRGTVSEVLYQLVGGLKAGMGYVGARNIRELKEKGEFVIITHAGIKESHPHDIIITNEAPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of inosine-5'-monophosphate dehydrogenase from Pyrococcus horikoshii OT3
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 113
structure length 358
sequence length 478
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2005-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cu0A00
1F5ZA 3C8FA 2Q3RA 4UFLA 2GQ8A 2GJNA 2NV2A 3W71A 1DORA 5EYWA 3W3OA 4C1KA 4A2SA 1VR6A 4K6AA 1B57A 3BG3A 3A21A 1VRDA 1NF0A 2QJIA 3GXTA 4O4WA 4DPPA 2B0MA 4A3UA 5D02A 1K8ZA 3V1PA 4AB4A 1FUYA 3SJ3A 4GJ1A 3MP3A 3NQFA 3H53A 2Y61A 3A9IA 2OT1A 1FBAA 5CPMA 1VYPX 2B7NA 3CC1A 1P0KA 1B4KA 1AW2A 4J9JA 1VCFA 1JQXA 4O53A 2VELA 1LLZA 2JGYA 2CLEA 2OJPA 1EWDA 5EL1A 1S3HA 3TCEA 1H7WA 1AW5A 3STCA 5LNUA 3S6DA 2NX3A 1OJXA 1F05A 1UB3A 4ZQPA 2ATMA 4E38A 1ME7A 4O1AA 4NXKA 3B0VC 4CNOA 1KM2A 5DCBA 2QAPA 3HQ1A 4WX2A 4LUJA 1XBXA 4NT0A 3B06A 5AYYA 1GOXA 1EWEA 1SZEA 3QSRA 4XTDA 2QCFA 3OEXA 3MWAA 3G1HA 1K3UA 2QCEA 1SSDA 3EX6A 3USBA 3NPXA 2AGKA 1FWNA 4RXGA 3YPIA 2JKPA 4S2BA 1PS9A 3W2MA 3JS3A 5HWNA 1F7BA 2YPIA 5AHMA 4AWSA 3PR2A 4ADTA 5DBUA 4N9EA 4YCOA 4HPXA 2GJLA 1K7XA 3GB6A 2G5WA 3P60A 1T8XA 4LU0A 2RKXA 2CLKA 2WSRA 1VZWA 1QPQA 3TMLA 1FCVA 4G1KA 3TSDA 3UWZA 1K8XA 1UCWA 3NQGA 3UWYA 2Y6ZA 2YFNA 2WOQA 4RZ4A 4Z1CA 4FB7A 2JGQA 2ISVA 4MYAA 4GUFA 3GXPA 2UV8G 4OV9A 5C5YA 2Y85A 1L2UA 1XCFA 3FEMA 3EKLA 2X30A 1L6YA 3TW6A 3O8AA 2YFOA 1WQ5A 1BEUA 1G6CA 3GAKA 3SW6A 3VE9A 4RJEA 1AL7A 2QCGA 1WBHA 4AMAA 2Y88A 3W6YA 5I3HA 3LI1A 3M1ZA 1DBTA 1W5PA 3TJLA 4Y9AA 3W74A 3W1TA 3BGGA 4I7VA 2E6FA 3LTSA 3DFSA 2A0NA 5AC8A 3GKAA 4NJHA 4JICA 1H1ZA 1XUUA 3O63A 3R13A 3W1UA 3OBKA 1DV7A 3CT7A 3W9ZA 3I68A 3UWVA 1GVOA 2W0UA 4Z0JA 1ZAJA 1P0NA 3G0UA 2CLFA 1YPIA 4O52A 1HG3A 1TV7A 2V9DA 3GKFA 1JCNA 2FB3A 5F2IA 4MZ8A 1Q6RA 5K7JA 5K9CA 4UNLA 5DXXA 4S1FA 1G69A 1K7FA 3M5YA 1I2NA 2C13A 4FNSA 3S1XA 4FO4A 1SU5A 2R14A 2FJKA 1W37A 5LHEA 2QR6A 1KM4A 4OBTA 1G67A 2R94A 2C0AA 3S9YA 4RK8A 2ISSA 1J2WA 2NUXA 3O6YX 3TU9A 1GQNA 1KFEA 3W88A 3DHDA 4HNNA 1DJQA 3PUEA 4Z1BA 2A7PA 2WNNA 1R30A 3NQMA 1VYRA 1SO3A 1PIIA 1XI3A 3PBVA 4WZHA 5K4XA 3NEVA 3ABSA 4ZQNA 2B7QA 3BK0A 5LKYA 3EX1A 4KFOA 3BO9A 4TX9A 1FX6A 4YL2A 3DH7A 3DKJA 5FI8A 4QISA 2E1DA 4AHPA 6ALDA 5CKSA 2NXGA 4K39A 3MO7A 4MJZA 2YZRA 5D30A 3CEPA 4UTWC 1ZAHA 5LNVA 4UUIA 3A23A 5DXYA 3Q94A 1FWRA 1X1OA 4N6EA 3RFAA 3L66A 3W23A 3S1UA 4LV4A 1MXSA 4WUIA 3LLFA 3W73A 4OWGA 1KFKA 1THFD 4O17A 5AN7A 2GOUA 2WNQA 3ZFHA 2AQWA 2NZLA 1IGSA 1SW0A 3PUDA 4UTTC 4O0ZA 3WJWA 1M6JA 2QCHA 4FX6M 1TCDA 4JTLA 3TV8A 4NNBA 2CW6A 4UR8A 1GVRA 3NL2A 3GX9A 2E6DA 3QZEA 4HIBA 1KM1A 1JCXA 3QMRA 3RK8A 1GT8A 1X7FA 2P10A 3C2EA 1PVNA 1X1ZA 5CG7A 1G4SA 2OX1A 1ALDA 3PB2A 4O28A 3P62A 3BPWA 4O12A 3N9SA 2A5HA 5D04C 4ORMA 4MY8A 2VFFA 1OF8A 3I7SA 5G2WA 1AG1O 3PC0A 1W5QA 2EAWA 4MY1A 3W7KA 1K02A 1W56A 3NQ2A 4JTJA 1RQHA 5FESA 2YW3A 3HG3A 3NVTA 2E5BA 2DJXA 3MYOA 2HSAA 4UTWA 3V75A 1QPRA 1XL9A 4PFMA 5AHLA 4Q4KA 3LLDA 4K8EA 1FWWA 5HWJA 2YX0A 1GYNA 4RZ6A 3P74A 3HGJA 3LHWA 1I2PA 1KM3A 4X22A 1SFJA 4IUOA 4O11A 3H54A 1VPXA 3PBYA 1TB3A 1W3NA 1OFDA 3MW7A 4LS2A 2Z2UA 3VCRA 1IXNA 2CFFA 1QDSA 1JJKA 3C4UA 4UTTA 3LV5A 4LRSA 3GYEA 3NGJA 1RZMA 2QUUA 3R8RA 5H91A 4LOCA 2WSYA 3HG4A 5BRBA 5LZLA 3LI0A 2PRHA 5LGXA 2E68A 1EEPA 2VKZG 4NXSA 2FQIA 4LY8A 2CWNA 4O13A 4KWVA 4U4MA 3L0NA 4JX4A 5EPDA 1K03A 1QCWA 4FNUA 4ORIA 2RDTA 3W1XA 3LCHA 1L9WA 3CM4A 4IMCA 3BW2A 4AXKA 3NG3A 3EX3A 4JTHA 3RLVA 3IGUA 5IBXC 3A22A 3BLEA 3LRLA 1W5NA 4XKYB 3KRZA 3LXBA 3LHTA 3P82A 2H90A 1LM1A 2YDAA 1P5BA 1LRQA 1YADA 1TJPA 2A1YA 3W85A 3P8JA 1MSSA 1P4CA 5G4WA 1EX5A 4MY9A 4AVFA 5AOUA 4UFMA 2Y70A 1XXXA 3EX2A 3DENA 1ZJIA 2Z6JA 3LCGA 2E6YA 3M6YA 3VI2A 1O95A 3S5ZA 1AK5A 1VCGA 2R8WA 4LS0A 5K9DA 3W7EA 3EWZA 2V2CA 4Z08A 4NZFA 4WD0A 2FB2A 1H7PA 3HGSA 3PG8A 3AO0A 2EPHA 1OFPA 1P1XA 1ZNNA 3LXCA 4MFDA 4AWTA 3EWUA 4NQ1A 4DF2A 3VKJA 5DN1A 3CIWA 2VFGA 3EEGA 4OV4A 4DELA 5KSWA 2ISWA 1JQVA 3KFTA 1SZNA 4IPIA 1J4EA 3TXVA 1D3HA 5H2ZA 5F1VA 2QJHA 1XDMA 3TXZA 3T7VA 2RHGA 1FDJA 1YTEA 3L9CA 1D9EA 3GNDA 5IBXA 2RDUA 2CZDA 1KA9F 3NOEA 1LROA 1EIXA 3DFQA 3IEBA 4TMBA 3LXAA 4FF7A 2ZA3A 1ZHAA 3GK0A 4A21A 4BWLC 2X16A 1YLVA 3HBLA 1F6PA 4NNCA 3KVKA 3W1RA 3G1FA 3P61A 2G96A 1OX5A 2D73A 3NYZA 3EWXA 1BWLA 3OG3A 5D32A 2DJLA 4HNTA 3NPVA 7TIMA 1JUKA 1OK6A 1W5OA 3W83A 1W1ZA 1KM6A 3W76A 4P2VA 1TPFA 3UWQA 3QMSA 5F4WA 1OFEA 3Q58A 4JY9A 2QUTA 5HUOA 1QWGA 4A22A 4BI5A 5I3FA 2C19A 3HGRA 2OZ0A 3SZ8A 3N3MA 1IIGA 1TTQA 3C2RA 3LGEA 5DLCA 8TIMA 3M5ZA 4BF9A 3QSTA 2A7RA 4JR5A 4LV9A 2ZZ7A 1L6SA 1EUAA 2ALDA 3U2OA 2C18A 3G1AA 4XWUA 2CZEA 3N2MA 3BG9A 3B04A 3RU6A 1YTDA 4N6FA 5DELA 5F4SA 4DO5A 1UASA 3BARA 3KHJA 4AWUA 3TKFA 1RPXA 5FF0A 1G7UA 1KW1A 4JGDA 1TREA 3G1XA 1WAUA 3W1MA 1LTDA 1JULA 4BK9A 4DO6A 2VENA 4TR9A 3G1YA 2X1RA 4UMAA 1GG1A 1LZOA 5HUPA 1NSJA 2YYTA 5DY2A 1WDWA 2C14A 4LVAA 3T78A 3NL6A 4NJKA 3WK0A 3D0CA 4MIMA 4BWLA 4GUHA 2ZZ2A 4HHPA 1WA3A 1H1YA 3INPA 3BG5A 3Q37A 4XBSA 3ATYA 1G4PA 3E96A 4UC5A 5BMXA 1IXOA 3O16A 4JTSA 1KV5A 3L5LA 5F4XA 3SY5A 2WJZA 2ZZ4A 1VLWA 1G7VA 1O5XA 4M6PA 1TTPA 4H6KA 3W7QA 1S5VA 3EWBX 4ONVA 5HNRA 1LBFA 4RV8A 1JUEA 2X1UA 5HJLA 4X2RA 1YDOA 4QM1A 2H3BA 2PCQA 1EP3A 2QJGA 1T99A 3WJSA 2FPTA 3NZRA 3P84A 2E6AA 4YMZA 1YTKA 2R91A 4IMFA 3W75A 3C0JA 1OX6A 3M41A 1XFBA 1HUVA 1NF7A 2GQAA 3LHZA 5LSMA 5KZEA 2J88A 4LVGA 3NDOA 5KMYA 2CLIA 1GZGA 1IXPA 1O5KA 1PV8A 3LOTA 4UTMA 1A5AA 1TYGA 1PHWA 4ZMGA 1F74A 1MEIA 1W3TA 2C15A 1ZFJA 1FCQA 3TA6A 3UZ5A 5D2XA 3LTYA 3LHYA 3P5YA 4CQ8A 4RR4A 1I2OA 2PE4A 4YWIA 3P5ZA 4JTTA 1LRNA 1A5SA 2CLHA 3LM7A 5E93A 2H3DA 2B7PA 1RVGA 2TYSA 2DU2A 3P81A 1WXJA 2ZRVA 2A21A 1J5TA 3SR7A 1EP1A 4QAIA 2C1HA 3CWNA 2NUWA 4LUIA 3WJYA 5F2GA 4IXHA 3NNTA 4N02A 1M7PA 2JBMA 3FA5A 3N19B 1SO4A 1TIMA 2RFGA 3I65A 3NR0A 4R7JA 2FPYA 4JTIA 3I7QA 1O4UA 1XC4A 2DZXA 4KFPA 5DCDA 4FEZA 3CB8A 4GBUA 1NEYA 2DZTA 2VFDA 2A2IA 1A53A 1TMHA 4DXVA 1LORA 1NFBA 4MFEA 1QPOA 3SGZA 4DF1A 2Q3OA 3OVQA 1AW1A 1OX4B 2Y89A 3NM1A 5FF3A 2NUYA 3C2VA 2Y63A 3PS7A 4AEOA 4NJGA 3PVFA 3IIZA 1ICSA 3W2KA 2F7FA 3NO5A 5D2WA 3QJAA 3HPXA 1EP2A 4LC6A 3FJ6A 3G1DA 3ZWSA 3B4UA 5EBUA 1GVFA 1EPXA 4MOZA 2TSYA 1Z42A 3E0IA 1FDZA 3E9AA 1DOSA 4GWEA 5FEXA 1KBJA 3NQ8A 1YXDA 4C1LA 3LHVA 1TPUA 5CZJA 4WXYA 1XM3A 2QDHA 1JCYA 2ZZ1A 3G18A 2YYUA 4N4PA 4RX0A 1KFJA 5D2VA 1OYBA 1SPQA 3G3MA 3MHUA 3MI2A 2ZZ3A 3QW4B 1RR2A 2B4GA 3C2OA 3EKZA 4POCA 4UFJA 3LX9A 4UIOA 1QOPA 1Q6OA 4K7YA 5C2XA 3W7IA 1ZY9A 5K9XA 3DFTA 1KV8A 4O50A 4NJIA 2YGYA 2NXHA 4UCGA 4AHQA 2WO5A 1JRBA 4M6QA 3T4CA 1SUXA 2ZRYA 3PBUA 3DBPA 3P7YA 3P8IA 4O54A 2DZSA 2Y7GA 4R33A 5TQLA 4FXSA 2Z0IA 3CEUA 3W7HA 1VLIA 4FNPA 3VE7A 3W1AA 3M9YA 4PEKA 5HULA 2Z1BA 4XKYA 3W86A 1WX0A 1FWSA 1DQWA 2DP3A 5D37A 3M43A 5HMSA 4Z0SA 2FDSA 3TH6A 5A5WA 2DORA 4FXRA 4OT7A 3OIXA 4FNQA 3LTPA 4NX5A 4QSHA 3IV3A 3SI9A 4OHQA 4UNKA 3BV4A 2NXIA 1TV5A 4UTKA 3K30A 1N55A 2VEMA 1A50A 2YR1A 3FKRA 2E5CA 3FLUA 3FIGA 1H63A 4O8RA 3NQ7A 4UMCA 5G4EA 2ZRXA 3QYQA 1O94A 3IIXA 4M7SA 3ANYA 4GRSA 1KFCA 1ML1A 3IVUA 4GFSA 4RKAA 4Y6GA 4JN6A 3R5EA 2CLLA 1T0OA 3L0KA 3PM6A 3THQA 4JD4A 4YCPA 3R89A 1WBJA 1MZHA 3F4WA 5CGQA 1MEWA 1G4EA 1QAPA 3THAA 4O0KA 4H4IA 5G1YA 3TW7A 5SWUA 4UXDA 5DBTA 2J24A 2O7SA 4KKXA 3UY7A 4QNEA 1N7KA 4DQWA 3S0CA 4O57A 1LBLA 4A29A 5IM51 3NL5A 4AAJA 2V2HA 4NNAA 4MZYA 4JY8A 4M19A 1F2JA 3HG5A 4LC8A 3IVSA 4QQ3A 2VEIA 1JCMP 1Z41A 1KBIA 2PURA 5TBOA 3S8HA 3KVLA 2P1FA 2P0OA 5C55A 3Q2DA 1DHPA 1WOBA 2QDGA 2I14A 2NX1A 3W7NA 2JK2A 4TU1A 3GVGA 4MUZA 3PG9A 4Y96A 4K36A 2ZRZA 1EUNA 4IGHA 1PCKA 1X6UA 3S1VA 5LGZA 1AMKA 4AF0A 1JCJA 1SFLA 1H50A 4FNRA 2QCNA 1YPFA 2V82A 5EA9A 4N2YA 3O1NA 4LVFA 4JYEA 3TAOA 2ZRUA 4PL2A 2BLEA 1I4NA 5D2YA 1OFBA 3QQ0A 4I9AA 4O14A 3DI0A 3PF3A 1R2TA 2CLMA 1F76A 3STGA 4UMBA 1O60A 3MUXA 4CQ9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CEX C;  4QFU A;  3UNT A;  1DOR A;  4Q22 A;  1BRL A;  4NAF B;  3KS6 A;  3OOQ A;  3U3H A;  1EDG A;  1VR6 A;  3T42 A;  3GTH A;  3PTK A;  4D6H A;  4GZ7 A;  1W3J A;  2EG8 A;  4YVP A;  2QS8 A;  4A3U A;  1JF6 A;  5D02 A;  4D6F A;  1DPM A;  4ZE5 A;  4GJ1 A;  3SJ3 A;  3NQF A;  2IKJ A;  1VEP A;  2Y61 A;  3WN6 A;  1B31 A;  5TF0 A;  3WLQ A;  2Y24 A;  1FBA A;  2B7N A;  4NAE A;  3L4T A;  4BS0 A;  3LEP A;  1QUM A;  3UR5 A;  1JQX A;  2OG9 A;  4OIF A;  4O53 A;  4XAY A;  2VEL A;  2PF0 A;  2JGY A;  4W5U A;  1TR1 A;  3CPG A;  3CO8 A;  4WCJ A;  1H7W A;  3T0T A;  3WKZ A;  1AW5 A;  2WNW A;  3AIB A;  1UB3 A;  5CC5 A;  3W6M A;  2WJD A;  1ESW A;  1QU4 A;  1UR4 A;  4REQ B;  3EDF A;  5DCB A;  4PUL A;  2IQD A;  5M5D A;  3AS1 A;  5AYY A;  3O2L A;  3TQP A;  1SZE A;  3QSR A;  4J3U A;  3VC5 A;  3WBE A;  2QT3 A;  1DWA M;  1EO7 A;  1PYF A;  4G9P A;  2CC0 A;  3AIQ A;  2AGK A;  2DW7 A;  3B8V A;  6CGT A;  2WXD M;  3B40 A;  2TOD A;  1IZK A;  1PS9 A;  2HQA A;  1F7B A;  3PR2 A;  3W24 A;  4Z2L A;  4ROP A;  5DBU A;  2BGS A;  3TR9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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