2CU0A

Crystal structure of inosine-5'-monophosphate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
478
structure length
358
Chain Sequence
KFVEKLEKAIKGYTFDDVLLIPQATEVEPKDVDVSTRITPNVKLNIPILSAAMDTVTEWEMAVAMAREGGLGVIHRNMGIEEQVEQVKRVKRAEKYKNAVRDENGELLVAAAVSPFDIKRAIELDKAGVDVIVVDTAHAHNLKAIKSMKEMRQKVDADFIVGNIANPKAVDDLTFADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQITAVAMVADRAQEYGLYVIADGGIRYSGDIVKAIAAGADAVMLGNLLAGTKEAPGKEVIINGRKYKQYRGMGSLGAMMKYMKTRKFVPEGVEGVVPYRGTVSEVLYQLVGGLKAGMGYVGARNIRELKEKGEFVIITHAGIKESHPHDIIITNEAPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of inosine-5'-monophosphate dehydrogenase from Pyrococcus horikoshii OT3
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 113
structure length 358
sequence length 478
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2005-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cu0A00
5CZSA 1SR9A 2Q3RA 2J27A 3E49A 3IVSA 1KFEA 1HO1A 5FEPA 4UXDA 4O52A 1BWLA 4R7JA 4BWLC 1R46A 5D03A 2QJGA 3LI1A 1MZHA 1XXXA 3LBCA 3BVJA 5KITA 1MEHA 3E9AA 3O63A 3LB0A 4LVDA 4R33A 4AWUA 3LCXA 1H1ZA 1JRCA 5K7JA 3UXDA 4POCA 4N9CA 3SZ8A 1EX5A 1QDSA 3TSBA 3HG4A 1RVGA 3ABOA 2PRLA 4M7SA 3V1PA 4FHAA 4QQ3A 4AHPA 3LX9A 4D2JA 4FXSA 4CQ8A 1KA9F 2G97A 3HPZA 3L0NA 1OYCA 4JY8A 1TRIA 3TR2A 1XBYA 1G4EA 1JJKA 2Y62A 3IIXA 4JIPA 2QAFA 1SQ7A 2QF7A 3C4UA 1HL2A 3IV3A 2A6LA 3S8HA 2C6QA 1K8XA 3LHUA 1Z48A 4UCGA 3NQAA 3PG9A 3TQ0A 3S1VA 3QQ0A 2FJKA 4H4IA 5AHEA 2XN0A 3EKZA 2H3DA 1VLIA 4S2CA 3IEBA 1SUXA 4UMCA 2VFDA 3IIZA 5G4EA 4YMZA 3CPRA 4IMGA 3T44A 3P82A 3HMJG 2I9EA 1OK4A 4HNNA 1EA0A 1A53A 3EX2A 3ZS4A 1KV8A 4K36A 5DCEA 2RHGA 4WY0B 3KRUA 3LCWA 1SO3A 3JS3A 4GXMA 3CIXA 4LNYA 4XBSA 4UFKA 4Y96A 5CGQA 3GXTA 4GFSA 4K37A 2V82A 2YYTA 2E6AA 3H54A 3W72A 1SO5A 3DKLA 1A50A 2YW4A 3WK3A 3NPVA 4UTIA 4XKYB 4BF9A 3N14A 3P81A 2J88A 1SU5A 3K30A 4IX0A 3NQGA 3PG8A 4HNVA 4Y8FA 1FCUA 3N9SA 1D3HA 1KFLA 2P10A 3P60A 4FIQA 1TYGA 3O16A 1UUMA 1EB3A 4IWWA 1JUKA 1YTKA 5K9XA 5I3JA 4JTGA 3RNDA 5FI8A 1XCFA 2VXNA 4PFMA 3HG5A 2VFIA 5HWJA 4MIMA 1FXPA 3V75A 1F2JA 3OBKA 3A9IA 2ZDRA 4KWWA 3QMTA 1S5WA 3TW7A 3LCFA 1Q6RA 4YL2A 3EEGA 4IOTA 3KAOA 1U83A 4L4MA 4K7VA 5LZLA 1JRBA 3TW6A 1PE1A 2QKFA 1FDYA 2ZFAA 1O4UA 5L6UA 4X22A 1ML1A 1ME8A 3CT7A 1H5YA 2YCEA 3P5ZA 3DFTA 4FNTA 2QCGA 4NT0A 4RR4A 1S3HA 4EIVA 2QAPA 3BO9A 3WK0A 3HQ1A 3P80A 2JKPA 5FF0A 3TDFA 1I2NA 4DXVA 3BPWA 3NQ2A 4HIBA 1W56A 2RKXA 4JTTA 5DCDA 5HULA 5K2ZA 4E2BA 4OE7A 3A5VA 1I4NA 1YXDA 4ZL1A 2B7NA 3DGRA 3KVJA 3G1XA 1YDOA 1QR7A 1TJPA 3LXBA 3I7SA 3EXTA 3G0SA 1VR6A 4IUOA 3UWVA 5CKSA 1THFD 3W7IA 1XC4A 3C56A 3SSJA 2QCLA 4BFAA 1GVOA 4IPJA 1C8VA 3LTYA 3GDLA 2ZZ3A 2ZRVA 3W7JA 3I65A 3Q2DA 4LV4A 3QH2A 3DFNA 2TYSA 4O0ZA 4N9DA 3YPIA 1HG3A 4WXZA 3C3NA 3T7VA 1L2UA 1IXQA 2PE4A 1FDJA 1KM4A 4IXHA 1QCWA 2VFHA 4YWIA 2ZBTA 1JR1A 3HB9A 2I14A 4M7TA 4MPQA 1CX9A 4S2BA 1W0MA 3L5AA 3GZ3A 3QQ1A 4EOUA 1W5NA 4IXXA 2NWRA 5C54A 3C61A 2CZDA 3UWZA 3PUOA 5BMWA 3NPUA 1WOBA 1GTEA 4O14A 3VNDA 5LNUA 4O53A 4TIMA 3A21A 3NL6A 1O60A 4H3DA 3QYQA 4CNNA 3D0CA 2A6NA 3L0KA 3GK0A 1L6YA 3EWWA 2V2CA 3UPBA 4NU7A 3S5NA 3EWXA 4PL1A 1T8XA 1QOQA 1LRNA 2DZVA 4TO8A 3BW4A 4QJ1A 3G3MA 1W31A 3B03A 2BSLA 4ICNA 3HBLA 4MLJA 1EP3A 3TXZA 3W1UA 3WJXA 3NQVA 3GDTA 1H51A 3GIYA 3LOTA 4AF0B 6ALDA 3HG2A 2E6DA 1GVSA 4O12A 4FB7A 2FDSA 3FJ6A 4N4PA 1KBJA 3NR0A 3B0UX 4AXKA 4JEQA 3W1RA 1FCBA 1TPVA 4PC8A 2J9ZA 2FPVA 3M5YA 3PBVA 1J4EA 1Z42A 2EPHA 3T4CA 3KHJA 2JGQA 1N7KA 1S5TA 5FEZA 4RCXA 2PRMA 3LCIA 1W5OA 3R89A 4HNTA 1YYAA 5DBTA 5EKYA 1KFBA 2O7SA 1JCJA 4JTLA 1ZY9A 1GT8A 1JUBA 1FDZA 4Y90A 3P62A 1KM0A 2CLMA 1LDCA 1XBXA 4ZQOA 1Q45A 3L9CA 2GVLA 4NX0A 3BV4A 4N9EA 3NGJA 4Y6GA 1SZGA 5HNRA 4R34A 3ELFA 3DFSA 1TJRA 2YYUA 3ATYA 3MMTA 2C14A 3LBMA 1QPNA 2Z1BA 4JN6A 1XKYA 1EP2A 3G0UA 1DQXA 1LLWA 5CZTA 2V5LA 2OJPA 4MJZA 3M5XA 3S6DA 3TMLA 4A22A 3TFXA 1TQXA 2TPSA 2J24A 1GYLA 1TTIA 2QCHA 4RXFA 3W7OA 4UMBA 3E12A 1TTJA 2A7PA 3U2OA 3QEZA 1H50A 3KX6A 4GWEA 1NVMA 1X7FA 3LHVA 1MEIA 2BLEA 3NQMA 4UMAA 3W2JA 4IQLA 1YXCA 3W2MA 4ORMA 5AHLA 3G1AA 3PUDA 1VLWA 3IVUA 3N73A 3LHWA 4JR5A 3W1TA 1JULA 1JQXA 3QFEA 4BR1A 3ABRA 1F5ZA 2RDTA 3TV8A 3W6YA 4GUHA 4E0CA 1VHNA 1OFDA 3BARA 2J9XA 3NG3A 1UCWA 3LHZA 3BGJA 3UD6A 1WQ5A 3ZWTA 2ATMA 2E1DA 3WJSA 4ADSA 1TTQA 4NQ1A 5D04C 5C6MA 4O4WA 2DZSA 1VGAA 3DI0A 3W3OA 2CU0A 3L68A 4A21A 1K8YA 2E5CA 3VCRA 5H2ZA 4CCEA 3O1NA 1X1OA 1GVQA 2CFFA 2CZ5A 3NEVA 2OZ0A 3BLEA 2VKZG 1ME7A 4A29A 2Y70A 4O13A 4EF9A 2EHHA 1KW1A 3P8JA 1A5AA 2J9YA 4OWGA 1LLZA 1KBIA 4RV8A 1W8SA 1YDVA 4QITA 3WJZA 4YCOA 5C55A 3CU2A 1LYXA 4UTHA 4K8EA 3HF3A 4I7WA 3GKFA 3PF3A 3W7HA 1EPXA 2AQWA 3W75A 1ZAHA 1RQHA 3L65A 4K39A 3FKKA 3NAVA 5AYZA 1A5BA 1GWJA 5TBOA 4O19A 2ZRWA 4UR7A 2V30A 4M6VA 2V0TA 1XDMA 1NFBA 1V5XA 4N6FA 2CW6A 3TU9A 1MXSA 1OHLA 4UFMA 1VRDA 1TB3A 2GUUA 2YFNA 1TPC1 5TQLA 3NL5A 5F4XA 2CZEA 4FO4A 3E02A 1ZFJA 3CLMA 1AW1A 3M41A 2ZRXA 3TSDA 3LCLA 4JX4A 3C8FA 2ZTKA 4O16A 1GTHA 3BG5A 4S1FA 1GOXA 3TH6A 4AVFA 1DJQA 5D2XA 1JCNA 3NPWA 4DPPA 3ATZA 2QR6A 3HGSA 4UTWA 1FUYA 1W3NA 2GJLA 1F74A 1OF6A 3Q58A 2FTPA 1NAL1 4TR9A 4C1LA 1H63A 3NVTA 3U8GA 1VC4A 3NNTA 4HPXA 2GQ9A 1JUEA 3TQKA 2PRHA 2ISVA 1I2QA 3KVLA 3MO7A 4DBEA 1OX5A 3HG3A 3EWUA 3LDVA 3M0ZA 2QUVA 5LNRA 1LBMA 2CZFA 3N34A 4EVZA 1B3OA 2H90A 2OCZA 2ZCGA 4LW7A 1W3IA 3EX6A 3VFLA 4M6PA 3PSVA 3ZWSA 3RFAA 2FB3A 1RQEA 3N2MA 3RU6A 3RLUA 4KKXA 1KM2A 1R2TA 3GAKA 4UIOA 2XFWA 3NQCA 4HSOA 3PAJA 4E2DA 3HGJA 1Z44A 3TMQA 2RDUA 4IJBA 4RZ4A 4FNPA 3EB2A 3P67A 4CQAA 3B8DA 6TIMA 5F2IA 1OVDA 2ZZ7A 3FOKA 3DFPA 5CG7A 1FCVA 1OX4A 4JIQA 2EAWA 1YTDA 2QCDA 2H8ZA 2OMAA 1B4KA 5GVJA 1VYPX 5U7SA 4Z0SA 2JKEA 2FPYA 1K02A 4JYDA 2V9DA 3HJZA 5G1YA 2E6FA 2FLIA 1ZHAA 2X1TA 5G2IA 1KM1A 3EXRA 3TCEA 1MEWA 4QNEA 2GVGA 3GB6A 4N4QA 2I1OA 2DJLA 1LORA 3LRKA 3W74A 3EX1A 3MP3A 4MVAA 4OQVA 4LC8A 1KLZA 1WX0A 5C2XA 1J2WA 4NJIA 1AG1O 1L6SA 4WUIA 5SWUA 1OYAA 5AHFA 1HUVA 5AHMA 3GR7A 1LCOA 5C5YA 1XL9A 5DY3A 3H55A 3A24A 3O06A 4ZVJA 5G5IA 3GDKA 1PS9A 4UR8A 4M5PA 2NUYA 2YPIA 3QC3A 3I7QA 1P4CA 3P61A 2QCCA 3QSTA 2E6YA 1SPQA 3EWYA 4O11A 1JCXA 4I7UA 2GOUA 1VH7A 3MP5A 3W7GA 5F4WA 3ABQA 5KINA 5J5RA 3C0JA 5IBXA 1H7PA 1PCKA 4Z0JA 1NSJA 1D3GA 2DORA 5F2LA 1K7EA 4XQ6A 1RQBA 4FNSA 4CNPA 3CWOX 5AYYA 3SECA 3THQA 3O05A 1ZNNA 2XN2A 3IIVA 3G22A 3M5VA 4LUIA 4ZQNA 3TK7A 1SZFA 2E5DA 3OIXA 3USBA 3R12A 1OFAA 4PEKA 1VPXA 4LRSA 2TSYA 1W37A 4DO5A 1KV5A 4XUGA 3W1LA 3KOFA 1ADOA 1TMHA 1W1ZA 1GYNA 2J6XA 1WDWA 2WSYA 1EWDA 1EP1A 4WD0A 1F7BA 3MHUA 3MI6A 1RR2A 4MZ8A 2QCNA 4WQ6A 1KTCA 3PBYA 1OFEA 4NJJA 3QPZA 2O7QA 1YTEA 3TROA 4AF0A 5AFDA 2NV2A 4TX9A 4YXGA 3PSWA 4UTKA 3PUEA 2R91A 1WV2A 5LKYA 2OT0A 1QFEA 2NWSA 3F4NA 3QJAA 3MP4A 1VZWA 1XUZA 4UTJA 4MKNA 2XN1A 4Q4KA 1FWTA 2DZTA 3F4WA 1GPWA 4IX2A 4DQWA 3B06A 3BG9A 2GQ8A 1QPQA 5G4WA 3N3MA 4MFEA 1H7XA 4BI7A 2QDGA 4HNUA 3SGZA 2A0NA 4GUJA 4LV9A 3W2NA 1Y0EA 1ME9A 1Q3NA 2C16A 3S9YA 4UFJA 4OHQA 3JR2A 1I2OA 3PS7A 4JTJA 5KZEA 1RV8A 3RF9A 1K7FA 4RLIA 1VYSX 2Q3OA 3QMRA 4UTWC 1WYIA 3RK8A 3SJ3A 3DBPA 3C6CA 1ZALA 2PC4A 4LWWA 5D2VA 3THAA 2AGKA 5HUOA 2FFCA 4PH6A 1RZMA 3NYZA 1QPOA 3I6RA 1FWRA 3LLFA 4K38A 3G1DA 3SFKA 4OV9A 3BLFA 3W87A 1D9EA 2C18A 1L9WA 1LROA 4XWUA 1T96A 3PBWA 4HPJA 2HS8A 4FEZA 2TRSA 3GVGA 3QZEA 4JD4A 4O4VA 3G1SA 3W88A 3W7DA 1G7VA 2EKCA 3HGOA 3STEA 1PCWA 4AHQA 4ONVA 5FESA 1QAPA 3F03K 5LHFA 3B05A 4Q32A 2X1SA 3GX9A 5D02A 1WOAA 4NX5A 4O57A 5D2TA 5D09A 3C2FA 3W1QA 2OT1A 4GC4A 5BOOA 3W1PA 4QM1A 3C2EA 3UWWA 3O8AA 1N55A 3M6YA 1TREA 3L0GA 2G95A 3MBFA 4NNCA 1FY6A 4K6AA 3JRKA 1E51A 4CLMA 3LRLA 1LBLA 1UASA 2GQAA 3LGEA 4RJEA 3STCA 3UWYA 4CNOA 1QWGA 1XFBA 3GXNA 2QUTA 2ATSA 3TC6A 2X1UA 4P2VA 1WBHA 3PC0A 3P5YA 3S5YA 5AHIA 4UNKA 4IPIA 3UNDA 4UC5A 2G96A 2JK2A 5U4NA 1KLYA 4O1BA 4UTUA 2YSWA 4JY9A 3EWZA 4DF2A 1BWKA 1XDLA 2WQPA 4Z1DA 4O15A 1GZGA 1L6WA 4JGDA 3RLVA 1IGSA 1H61A 2C13A 4ZQMA 2B4GA 2B7PA 2A2IA 3FYPA 4CCDA 4FXRA 3SY5A 3M16A 2X2GA 2HTMA 4QIUA 2ZRYA 1JCMP 5G2HA 2C1HA 4C1KA 2CLIA 3NM1A 4O8RA 5HJLA 3NA8A 4ALDA 1R2RA 2RH9A 3W73A 4LY8A 4KFPA 4Q33A 2NX1A 3NQ7A 3P74A 4HKPA 1W5PA 1OFQA 3G1HA 3W7NA 5IBXC 4EF8A 3LLDA 3B4UA 3S42A 5F2MA 3DU0A 2FB2A 4N9BA 3PWAA 4ADTA 3T78A 5EYWA 3G8EA 2B7QA 3C2RA 3M9YA 4LS2A 1W5MA 1FXQA 2QCMA 2YXGA 5LGZA 1LZOA 2Z6JA 4YLWA 3ZFHA 4ORIA 3NQDA 3W84A 1X6UA 3DAQA 4UUIA 3STFA 4JYFA 5I3HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4B5S A;  3H2A A;  4NZ3 A;  2CLP A;  1OY0 A;  3E2Q A;  4R7J A;  4BWL C;  3RX4 A;  3PFR A;  3WEM A;  3LI1 A;  3BVJ A;  1MEH A;  1PUD A;  1UYQ A;  3I3B A;  2XVL A;  1WDP A;  1TR9 A;  1IQ8 A;  4AWU A;  3TYB A;  1JRC A;  3MQT A;  3SZ8 A;  4I9J A;  4D6G A;  5LIW X;  1DWJ M;  1GEH A;  3K4A A;  4ZGY A;  3UCQ A;  2G97 A;  3HPZ A;  4GZJ A;  4GCX A;  2PDN A;  2UY3 A;  2ODO A;  3BMV A;  3VIH A;  4J27 A;  1M1B A;  1PO9 A;  2PD5 A;  1G4E A;  2Y62 A;  1XIF A;  4JIP A;  1E9Z B;  2DSW A;  1HL2 A;  3W4R A;  3S8H A;  3BUV A;  4UCG A;  3QY7 A;  4J28 A;  4H4I A;  3AUJ A;  2XN0 A;  3WEO A;  4S2C A;  3N2T A;  2VX5 A;  4LBR A;  3IEB A;  4W89 A;  4UMC A;  3HQN A;  4GJI A;  5ECV A;  2GDV A;  3USZ A;  2QGY A;  1OK4 A;  1A5L C;  3EX2 A;  2UY5 A;  3NDZ A;  2RHG A;  3N04 A;  1I6N A;  3F7J A;  3TP4 A;  3JS3 A;  2AGT A;  4UFK A;  4Y96 A;  5CGQ A;  3GXT A;  3PTM A;  4NYU A;  3WUF A;  3QC0 A;  2YYT A;  2X2Y A;  2I57 A;  1RAL A;  1UOK A;  4P7R A;  1MDL A;  1JD9 A;  1Q7Q A;  4QG8 A;  2GGJ A;  1BGA A;  1X6L A;  2G3N A;  1A50 A; 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