2CWN | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	321
structure length	321
Chain Sequence	SGSALDQLKQFTTVVADTGDFNAIDEYKPQDATTNPSLILAAAQMPAYQELVEEAIAYGKKLGGPQEEQIKNAIDKLFVLFGAEILKKIPGRVSTEVDARLSFDKDAMVARARRLIELYKEAGVGKDRILIKLSSTWEGIQAGKELEEQHGIHCNMTLLFSFAQAVACAEAGVTLISPFVGRILDWHVANTDKKSYEPQGDPGVKSVTKIYNYYKKFGYKTIVMGASFRNTGEIKALAGCDFLTISPKLLGELLKDNSKLAPALSVKAAQTSDSEKIHLDEKAFRWLHNEDQMAVEKLSDGIRKFAADAIKLERMLTERMF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of mouse transaldolase rcsb
molecule keywords	Transaldolase
molecule tags	Transferase
source organism	Mus musculus
total genus	132
structure length	321
sequence length	321
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date	2005-06-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00923	TAL_FSA	Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2cwnA00

2ZZ3A 3EEGA 3MI2A 4KWVA 2HS6A 1IIHA 1FY6A 1DOSA 2BWGA 4MFEA 2J88A 2B4GA 3P62A 3UZ5A 3LGEA 2H8ZA 2GVGA 5DLCA 1HTIA 5HULA 3U2OA 4NNAA 1H7PA 1EB3A 4LVFA 3WJYA 1A53A 5T26A 2CLFA 5K9DA 3CB8A 4GBUA 4FXRA 1GVSA 2YPIA 5FESA 1SZFA 2CFFA 3USBA 3OIXA 1UUMA 4ZZ9A 5LNWA 4AWSA 4WX2A 5K4ZA 4X22A 3B0PA 4UTWC 5I3HA 3UQNA 2DZWA 3W1UA 1XBZA 3KVJA 3WJXA 1SO5A 1YADA 2H6RA 1AL7A 1JCXA 3TV8A 1KFKA 1W5NA 4UR8A 3NQ2A 1N55A 3FIGA 3N2XA 3NQDA 5CPOA 5KITA 3PULA 3O6CA 4BWLA 2ZDRA 4UTMA 3P8JA 4I7VA 4QAIA 1PHQA 1VGAA 2Y63A 3PBUA 1KTNA 2I14A 4O1CA 4JTHA 3EX1A 4DQWA 3LHWA 4CNPA 3R5EA 1EIXA 2PE4A 3U8GA 2ISSA 2NWSA 2I1OA 4UMCA 5G2HA 3MW7A 4AWUA 3W1QA 1EUNA 3P5YA 4K7VA 1D3HA 1BKSA 2WJZA 5DCBA 3M7WA 2W79A 1Z42A 4LY8A 3S1XA 4IX2A 4CNNA 4UUIA 3HG4A 4N9BA 5FI8A 5C5YA 3NEVA 5F1UA 4HNUA 3LHVA 3W7PA 3PC0A 1K8YA 3KVMA 3QZEA 2ZRXA 3JS3A 2C13A 4K8EA 3A5VA 4YWIA 3TAKA 2RH9A 4YL2A 3LCHA 4O53A 3DFNA 1O5XA 3JRKA 2YXGA 1AL8A 2HSAA 4GUIA 4JIPA 4O4VA 1W3IA 3GIYA 3MO7A 1E51A 2Y7FA 1P1XA 1YTKA 4YCPA 5LZLA 4XTIA 4WOQA 4Y96A 3R13A 3EWBX 4JY9A 3LM7A 4Z1BA 3TSDA 1GG1A 3DKLA 4PFMA 1VZWA 1JCYA 4DPPA 4FO4A 4WY0F 2AAMA 3W87A 1CW2A 3IV3A 1PE1A 4AMAA 1O4UA 1LBMA 3W7RA 3S1UA 3TXZA 2A5HA 1NF7A 1JCLA 3P5ZA 5C55A 1W5MA 4EVZA 3LBCA 1F74A 4AXKA 3RF9A 4WY0B 3PM6A 3HG2A 4U28A 1VHNA 4EWND 2CW6A 3HB9A 2VELA 3EX4A 3DHDA 4NZJA 5FF2A 3TCEA 2E6FA 4M5PA 1W31A 3TQKA 4E0CA 1QOQA 5F4WA 1SZEA 2ZZ4A 4X2RA 3EWXA 3N3MA 1EPXA 4ZQCA 1VYSX 3KRSA 1QO5A 3WK2A 1GPWA 1ME9A 2TSYA 5FEZA 2O7QA 3NA8A 2NZLA 1W54A 2ZZ6A 3L2IA 4MIMA 4O19A 4AHPA 2E6DA 4MYXA 1FWWA 2JGYA 1LBLA 3DFTA 4I9AA 3UXDA 1P0NA 3B4UA 1X6UA 4MYAA 3W74A 1V7YA 1Q6QA 2OT0A 7TIMA 3G1SA 2CWNA 3QW4B 1WYIA 1SFJA 3TR2A 3SFKA 3W86A 4PH6A 2OX1A 1GZGA 1KM4A 1P4CA 3QC3A 3TSBA 4QM1A 3WFAA 4JX6A 3R8RA 4AAJA 4FNQA 3KHJA 2FIQA 4LRSA 3W1PA 5LSMA 4E38A 2OCZA 4NNCA 1JQVA 4LC6A 5FEPA 3SZ8A 2GQ9A 1A5CA 4S2BA 3F1QA 2V5BA 4YLWA 1F73A 1Q45A 2QCFA 4FNPA 1TREA 1TV5A 3HOJA 1TV8A 2FQIA 4M6VA 4H6KA 1VCFA 3DI1A 3B03A 1TQJA 4LW7A 1GWJA 3M16A 3W1XA 3GXPA 3DBPA 3T78A 5EMUA 3R12A 4LOCA 3ZWTA 3TUUA 3CEUA 3DHFA 1EWEA 4I7WA 5C54A 3A21A 2Z1BA 3MP3A 3FFSA 4JTUA 4QQ3A 5FEWA 4NU7A 3TH6A 4CQ9A 1G7UA 4K37A 3KX6A 4XQ6A 3T4CA 1PS9A 1AK5A 3NYZA 3P7YA 3M6YA 1DKWA 2FTPA 5LKYA 1TJRA 5HMSA 3WJZA 1DL3A 1OX4B 2R94A 3DAQA 3LV6A 2PCQA 2QCLA 3W9ZA 3W7CA 1K7XA 1TTJA 3NNTA 1XL9A 4X9SA 5BMWA 3SR7A 3DU0A 3HF3A 1F6PA 1KA9F 2QUTA 5I3JA 3E02A 1TTPA 3PUOA 3GK0A 1RV8A 4UFIA 2QCNA 1LP6A 1I2RA 2YW3A 3C2FA 5AOUA 1KV8A 4WOZA 4RV8A 4JICA 1N7KA 4PTNA 1XC4A 3SI9A 3UD6A 2ZZ2A 2XN1A 3B0VC 5AHFA 3DENA 1XDMA 4ZQRA 3L5AA 1VHCA 2B0MA 2V0TA 4XBKA 3NR0A 3PBWA 1KW1A 3LCFA 1PCKA 1GT8A 2ZZ1A 3ATYA 1PCWA 5LGZA 4OBTA 2YYUA 1QCWA 4C1LA 5G5IA 1QDSA 2V2DA 4BI6A 1ZALA 2X2GA 3NM3A 3S5YA 3DGRA 3TC7A 3INPA 4NJKA 3SSJA 3O05A 3C3NA 1OFBA 4LVDA 3L65A 2ALDA 4S1FA 5CZSA 1JR1A 4UTHA 1T96A 1NAL1 4LUJA 3E9AA 5EPDA 3TSMA 2ZTJA 1SPQA 1WOAA 3KFTA 3T7VA 1JUKA 4LV9A 2EHHA 1RVGA 1KTCA 2BXVA 5BMXA 5CPLA 3IRDA 4TMCA 1T0OA 2DORA 1VCVA 5HNRA 4HNNA 3NZRA 1W37A 1IXQA 2O7SA 3LBMA 3N14A 3MI3A 3UPWA 4Y9AA 4K8HA 5CZTA 4IWWA 5EYWA 3MBFA 1C9DA 5IBXC 1TB3A 1BEUA 1I8JA 4UFLA 5G1YA 5F4SA 4M7TA 1MEHA 3RLUA 1TTQA 4FIRA 4A2SA 5CPNA 3E12A 3TNOA 4DEFA 1VLWA 8TIMA 5AC7A 4DBEA 1TV7A 4ADTA 3N34A 3CT7A 3KAOA 4IXHA 3MP4A 5D2WA 2B7OA 3NL3A 3O63A 2C15A 1OFAA 1EP2A 4GUJA 1B4KA 3M5ZA 2ZRWA 4XZ9A 1LTDA 1VCGA 1U5JA 4CNOA 2NX3A 1HO1A 3C61A 5DXXA 5AC6A 1LYXA 3ZWSA 1FWTA 4ZQPA 3NAVA 1MO0A 1TPB1 2HMCA 4FNUA 4ICNA 3BVJA 2RDUA 4NQ1A 3FLUA 1IXNA 2Y6ZA 5KZDA 3HGSA 5AN7A 4JGDA 3TJXA 1WQ5A 2G96A 4WZHA 1KLYA 5HR7A 4JTLA 3FA5A 2ABAA 3DKJA 1LOSA 3NPWA 5FF7A 3TW6A 4ORIA 1GYNA 2P0OA 3UPBA 1G7VA 2QEZA 3FS2A 2Y70A 2ZA2A 1QFEA 3L66A 3W7NA 2QCEA 1PHWA 1J4EA 4JDBA 4MLJA 4GRSA 4LTSA 1DJNA 4Y90A 2WSQA 1D3GA 3W7QA 3L21A 1LBFA 5FF0A 2CLMA 2NXGA 3LXAA 3EWYA 2Y61A 1KM2A 5AHMA 4AB4A 3C52A 3FJLA 2GJNA 3W1MA 2ZBTA 4JN6A 3Q94A 3BW2A 2WSRA 3B0UX 1JRBA 4MY1A 1SZNA 2PRLA 4JDYA 3L5MA 4RK8A 1HL2A 1GQNA 3W71A 2A6NA 1M6JA 3EWWA 2VFGA 5AB3A 3QMTA 4O57A 4OHQA 2QF7A 1NSJA 4PODA 1SFLA 3UWUA 4IMEA 4J9JA 2AGKA 5D02A 3PR2A 4O1DA 4QITA 2VEMA 2QAFA 3QYQA 3TU9A 5HWMA 2Q8LA 2E09A 3GYEA 1VC4A 1F7BA 2DZTA 5I3FA 4ZMGA 1XUUA 2VXNA 1TPWA 2A7RA 4N6FA 4JX4A 3W2UA 1UASA 3NQEA 4ZQOA 4POCA 5F1VA 2DZSA 1OFOA 3EWUA 2DJXA 1H63A 1J5TA 1CI1A 3C2RA 2WNNA 2ZTKA 5K7JA 1FUYA 3Q37A 1HG3A 1OF8A 3IIOA 1H7WA 1VLIA 4BI7A 3W76A 4BK9A 2G95A 3M0ZA 4KWWA 1LM1A 2TYSA 1TYGA 3HBLA 2YDAA 2WQPA 2H90A 1Q6LA 3TE9A 1SW3A 3SJ3A 3ABRA 2G5WA 2Y89A 3PBVA 3A22A 3HMJG 1Q6RA 4HSOA 5CG7A 1GG0A 3O15A 3GX9A 3DI0A 4TR9A 4RZ6A 3W2LA 4RLIA 4ZL1A 4FIQA 3VI2A 1ZENA 3PB2A 3QM3A 4N6EA 4MY8A 4MZ8A 5FF4A 1SW0A 1TMHA 3LI1A 4H4IA 2R14A 2OJPA 4AH7A 1VRDA 4NJHA 3EXSA 3HQ1A 4O50A 4O8RA 4JYDA 1K7EA 5U4NA 2NXHA 1ZCOA 3W22A 2WOQA 3TA6A 4IJBA 3I7RA 2CLIA 4Q32A 2H3DA 1A5BA 1S3HA 4L4MA 4RR4A 4UFKA 3G1AA 3IGXA 2J27A 3GDKA 3WK3A 2W6RA 1NEYA 3EX6A 2E6YA 5F2LA 4JD4A 1RQEA 4MUZA 2F84A 3ANYA 4K39A 3FOKA 1MSSA 1XBXA 5EA9A 5A8GA 2TRSA 1BTMA 1OFQA 4TMBA 1UCWA 1PIIA 5KZMA 4UFJA 3CIXA 2FDSA 3ZFHA 5HUOA 3MYOA 5IM51 1K03A 1K7FA 1KFCA 1MEWA 2VFHA 2EGZA 1YPIA 2B7NA 2YGYA 4PC8A 1GJPA 1LOQA 2CLOA 2EF9A 3LRKA 3NPXA 1DJQA 4GC4A 4NVTA 3TJLA 3UWQA 4O15A 3P80A 3BGGA 5J5DA 1O95A 3G18A 5BW6A 3MYPA 4RZ4A 1QPNA 3QMRA 1G69A 3I6RA 4QISA 4IUOA 4DO6A 2ZFAA 1UJPA 4JEQA 4JTKA 1OF6A 4AHQA 1Z41A 3LDVA 1P0KA 4P61A 1FCQA 3CQ0A 3O07A 4O0KA 1B4EA 2QCMA 4N9DA 3GB6A 4TO8A 2JKPA 5DN1A 5HWNA 4IPJA 4ALDA 2D73A 1M7PA 3NO5A 1F6KA 1I2OA 3M43A 2HS8A 4DF0A 3C6CA 3KVLA 2NX9A 2YFOA 3NL2A 4LV4A 5C2XA 1SO6A 4OE7A 4M6PA 2YYTA 2P1FA 4LT9A 4H3DA 4UNKA 1MZHA 1TTIA 5KZEA 5D30A 3W88A 3V75A 1OX6A 2NV2A 1TIMA 3W7IA 4AVFA 1RZMA 5IBXA 3DFSA 2WV8A 3UXAA 4A3UA 2TMDA 3W2KA 1QMLA 2CLKA 3BG3A 2X30A 4YMZA 3GAYA 3IGUA 1J2WA 4O54A 2RDWA 3CHVA 2DU2A 1F5ZA 3IIVA 3UWYA 1AMKA 4NJJA 1GVQA 1AW1A 4IMDA 3SGUA 2CLHA 1GOXA 3ZR4A 2FPTA 1KFJA 3G1HA 3LI0A 4ZQNA 3C4UA 1ZY9A 2BLEA 1A5AA 3W7DA 3NL6A 3MHFA 3B04A 3SY5A 1QPQA 2X1RA 3IVTA 1VQTA 1LZOA 3W7MA 3ABSA 3G1XA 2AQWA 2GQ8A 3G0XA 4MJMA 3W1AA 3STCA 4CLMA 1W1ZA 4NXKA 4JTIA 3KRZA 4NJGA 3LHZA 2CU0A 4HSNA 5K4XA 3CWOX 3OVRA 1OJXA 5D04C 3QJAA 4LRTA 2JBMA 2H8XA 1FWSA 3E49A 3A9IA 2B7QA 2QKFA 1GYLA 3LERA 4UCGA 3QRHA 3RMJA 3W2MA 3LHTA 2PRMA 5U7SA 1ML1A 3W3OA 2QJHA 3VNDA 4WQ6A 4JTTA 1SU5A 2PC4A 4FX6M 3PY2A 5D2VA 4N2YA 3W6YA 5G2WA 3QPYA 1OFEA 4GUFA 4LVAA 1SQ7A 3C0JA 3G0UA 5DCEA 3WJWA 1H1ZA 3NZ1A 2C3ZA 3PAJA 3GKAA 3MHGA 3MP5A 3A23A 3P81A 4A21A 3OBKA 2ZCGA 4LS1A 3L67A 5FEXA 2DP3A 3A5FA 4HKPA 3F03K 4UTLA 4BFAA 4MLRA 1IXOA 4LVGA 5BNKA 3RFAA 2FFCA 4JTEA 3B05A 3PUEA 6ALDA 2DJLA 1GVOA 2EKCA 4GXMA 3LXCA 1BWLA 3GDLA 3NM1A 3GR8A 2QDGA 2ZRZA 4K6AA 3NQ6A 5K3VA 1VPXA 3M5XA 3LTSA 3IVSA 1KFBA 4MZYA 1H7NA 2JGQA 3LB0A 3U6WA 1OK4A 2OZ0A 5AHEA 2FB2A 4QNEA 4N02A 1HO4A 2Y7DA 3I65A 4N9EA 3EB2A 3O6YX 2QCDB 3NQGA 4BWLC 4IMGA 1T99A 3STFA 2NUYA 4R7JA 4UR7A 4WJEA 1X1ZA 3SECA 2X1UA 1WX0A 5D2TA 4JTSA 2I9EA 5DY2A 2J9YA 4NT0A 5AYZA 3G1DA 5D09A 3FEMA 3O1NA 3AO0A 1H7RA 4O16A 4N9CA 3O06A 1TPH1 1R2SA 3ELFA 4HIBA 1W56A 1FDJA 3G3DA 2Z6JA 4IOTA 3UY8A 1R2TA 4KFOA 1OVDA 5H91A 5BOOA 3VE7A 1OFRA 4X3ZA 3RU6A 1W5OA 1Z48A 4WY0A 4E2BA 3PSVA 4MKNA 3ATZA 5HUPA 3SIZA 1H1YA 5G1TA 1ME7A 3TFCA 2GJLA 3EXTA 3NXFA 2E5DA 5D33A 4O17A 4TX9A 4JIQA 1XBYA 4UXDA 1K3UA 4FNSA 3KXQA 3BGJA 3I68A 4DPQA 3RLVA 1KM6A 5E93A 1JUBA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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