2DJL | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	312
structure length	312
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCCTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with succinate rcsb
molecule keywords	dihydroorotate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	107
structure length	312
sequence length	312
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2006-04-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	2djlA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2djlA01

3GXPA 4Z1DA 4HNUA 2QCEA 3QYQA 1SZNA 2CLEA 3WFAA 1TTQA 3NZ1A 4KFPA 4BI6A 1PCKA 1L6YA 3FYPA 4GUGA 1OFPA 3W2LA 3K30A 1SZFA 4X22A 4A21A 4HNVA 2A85A 5K2ZA 5AB3A 3CLMA 3ATZA 3W73A 4JICA 4MJZA 1I2QA 3W7RA 1QDSA 3QH2A 3LI1A 3NL5A 3LCGA 3UXDA 3SR7A 3HIJA 5HWJA 2NZLA 3B0VC 3DAQA 1J4EA 3M9YA 2DZWA 5MHBA 3FYOA 4PTNA 2B7QA 3CQ0A 1D3HA 3MBDA 1QNVA 1NFBA 3G1VA 3NQ6A 5DY3A 4MLJA 1FUYA 3IIOA 2WNNA 5EBUA 4UMAA 4K6AA 5C54A 3I65A 5F4SA 3LCHA 1RZMA 4UMBA 4A29A 1P5BA 4O11A 4O50A 4O10A 1W0MA 2A21A 3V1PA 1B57A 2B4GA 3GZ3A 1XKYA 5E93A 1I2OA 4GC4A 3AO0A 2DZPA 4TR9A 4JDYA 2QJHA 4MFEA 3O07A 1ONRA 3ZFHA 1W3IA 3FLUA 1F2JA 1KBJA 1W8SA 1ZENA 3WJSA 4UC5A 1A50A 3NQ7A 1SO6A 3MHFA 1XL9A 5DBUA 4DBEA 1NVMA 4JTLA 2ZZ2A 5CZTA 3KVJA 1O5XA 2DORA 1UUOA 3WJZA 2YFOA 4RK8A 3BO9A 3GIYA 3M5ZA 4HSNA 1GYNA 2ZZ4A 1NF7A 5F4WA 3IGSA 4JYEA 1F6KA 2H8ZA 4DEFA 2PC4A 3HPSA 4RCXA 2ABAA 3L9CA 3KAOA 1JULA 4WY0B 1T0OA 2AQWA 2BLEA 3G1DA 1TRDA 1H1ZA 4GJ1A 1SSGA 1TSIA 3G8EA 3QQ0A 2RDWA 1GZGA 1EP1A 3DFPA 2WSYA 4RJEA 1H1YA 4BR1A 4UR7A 3GXNA 3G24A 1I2PA 4XTDA 4DO5A 3LXCA 1H7RA 1J2WA 3GNDA 5HQEA 1KA9F 1AK5A 3GNNA 5KTLA 4MFDA 3WK2A 3GLCA 4AHOA 2YW3A 3W2JA 3G3DA 1G7VA 3G1HA 4GFSA 4UFIA 5CPOA 4EIVA 1OF8A 3L68A 3LLFA 1QR7A 3EX2A 3B05A 3V75A 5GVJA 1I45A 3B03A 3R89A 1LYXA 2E6DA 2YXGA 3S6DA 1PCWA 3QPYA 1GTEA 1M5WA 4Q33A 3UQNA 1IIGA 3HQ1A 4WXYA 5L6UA 1OYAA 2FDSA 1I4NA 4DXVA 2QAPA 1OHLA 3W7IA 3PWAA 2VEPA 1GQNA 2WSQA 1GWJA 3MI2A 3GK0A 2ZDRA 3SJ3A 4JXCA 1S3HA 5DLCA 2FPTA 4MZYA 3LCWA 3BGJA 4Q32A 1O5KA 4BI5A 3LHYA 3LHVA 1O4UA 2CWNA 5J5DA 5AYXA 1H62A 3I7SA 2CLKA 2FPYA 2QCLA 1TCDA 4I9AA 2RDTA 3O05A 2ZA1A 5CPNA 5CPLA 2Y70A 3INPA 2EKCA 1QMLA 3W1NA 1L6WA 4WUIA 3W7EA 3S42A 1ICSA 2C1HA 3I7RA 5LGXA 3BVJA 3OEXA 1YADA 3G0UA 2R8WA 2Z2UA 2BTMA 2FIQA 1AW2A 3SZ8A 1KTNA 4Y96A 1DJQA 3LHWA 2QKFA 4AB4A 4LU0A 1XXXA 4IMGA 5F2MA 4UTUA 4XBSA 2JGYA 4R53A 1PVNA 1F74A 1K7FA 4LVBA 1TTPA 4K7VA 2X1TA 3CTLA 4DO6A 5HMSA 1TQJA 2A7RA 1ZJIA 1WAUA 1HO4A 4EWND 5E1QA 3GAYA 3TXVA 3NQVA 2QAFA 1MXSA 1TPFA 4ZQMA 3U6WA 4B5NA 3IRDA 2RH9A 1QWGA 3WK1A 4DO4A 3BG9A 1NAL1 3D0CA 3NO5A 3W1RA 4LS2A 4LS1A 1L2UA 2H3DA 4ZQPA 1JUKA 2I14A 4HPJA 3HJZA 1IXQA 1XC4A 4MUZA 4MZ8A 2CW6A 3G22A 4N4PA 3G1XA 3TJLA 4GBUA 2IQTA 3LGEA 1WOBA 3L5LA 3RF9A 3W6YA 3BLEA 4JX6A 3PS7A 3EX3A 3NR0A 5AC8A 5HR7A 3P81A 1VQTA 1EUAA 3NL2A 2YW4A 2CLOA 1ME7A 2FTPA 4DF0A 3NOEA 4I7WA 2O7QA 4IMDA 4UCGA 4BWLA 4MKNA 3TU9A 3W7GA 2ZCGA 3IIVA 2EAWA 2VXNA 4AHPA 3TW7A 3HGRA 2E6FA 1OFOA 1WDWA 5TQLA 1R2SA 2NX9A 1XBVA 3BG3A 2CZEA 3BW4A 4MVAA 3S0CA 1OX4A 4LC8A 4EF8A 2QCHA 3UWZA 4UTWC 1IXOA 4UR8A 4UTTA 3I6RA 2YZRA 3L0GA 3UWQA 4KFNA 3HOJA 4LRTA 2TRSA 4RXFA 4JY9A 4RX0A 3LCXA 4O1AA 4O4VA 2C18A 4X3ZA 4Z0SA 1G4TA 1ICPA 4XQ6A 3DFQA 1MEIA 3DKJA 3LCIA 5D32A 3NA8A 4FNQA 4JY8A 3JS3A 3T7VA 4AXKA 1KV8A 5KINA 4UFKA 5DCEA 4ZQNA 3NZRA 4GWEA 3ANYA 1W3TA 1GEQA 5KITA 2BX7A 1W56A 4N02A 2DP3A 1GOXA 2CLFA 2GVGA 1W5MA 4K39A 2A2IA 3W1AA 2ZQ0A 1GVFA 3LTSA 4HPXA 4HSOA 3G3MA 2XN2A 4G1KA 4PL2A 1OFEA 1ZCOA 2WQPA 2WJZA 4IMEA 3NDOA 3M16A 1OK4A 1TPDA 2E09A 3GAKA 4RZ4A 4P2VA 3VE9A 1GVRA 1YYAA 1SFJA 4NVTA 3P5YA 1OFDA 4NJKA 1UJPA 1MEWA 3P60A 2QJIA 3L5AA 3LB0A 2NUYA 1O94A 2J9YA 4ZQOA 3EWZA 3UWYA 3M5XA 1VYRA 1P1XA 2H3BA 4C1LA 1C9DA 3C2OA 5FF7A 3PC0A 5KMYA 3C2RA 3BV4A 3PBVA 1Q6LA 1XI3A 4ORIA 4Z1AA 3OG3A 1QPOA 2ZA2A 4FHAA 3EXTA 2GPTA 4YMZA 2GUUA 5FEPA 3LRKA 4M6VA 4JTTA 5K3VA 1KBIA 4BI7A 3CM4A 4QIUA 1OVDA 4HNTA 4AH7A 3R5EA 3T4CA 4CCCA 1TPH1 1VCGA 3M7WA 5ABTA 3W7QA 3A5VA 5D37A 5DY2A 4Y9AA 3MI6A 1K7XA 1F73A 3W23A 4L4MA 4O18A 4OT7A 3SGZA 3P7YA 3O6DA 2QDGA 1EWDA 2G96A 3PBUA 3MO7A 3WK3A 5HWMA 5IBXA 1K3UA 3NQGA 1H7PA 2Z6JA 2Y7DA 5KZMA 4ICNA 5LKYA 2QCCA 1DJNA 2C14A 2ATMA 1PE1A 1OYBA 3EKLA 1W37A 2DZSA 2VEKA 5AFDA 2ZRXA 3T78A 2A6LA 2C6QA 1EA0A 3E96A 2RKXA 1TREA 1JUEA 1EUNA 2ZTKA 2P10A 4MPQA 1UUMA 4R34A 4FF7A 3DI1A 1DQWA 3W7CA 1DKWA 3VFLA 1MZHA 5J5RA 4XUGA 1K7EA 1VLWA 3O1NA 2Z0IA 3LCFA 4K8EA 3LM7A 2C15A 2WNQA 1W54A 1GTHA 5AHIA 3NG3A 1PHQA 4O15A 3LBMA 3T55A 2V2DA 2G5WA 4A2SA 2VEMA 2XN0A 4XZ9A 3GDTA 4FNTA 3IGUA 3O6YX 2CZ5A 1SSDA 1G69A 1P0NA 3N73A 1OFBA 1SO5A 3F1QA 2CZDA 1VS1A 1LOQA 3M5YA 4JTKA 1GPWA 3F03K 2R94A 3TFXA 3N2XA 3STGA 1GVOA 3BW2A 4DPPA 3W84A 1K8ZA 3NQEA 4RR4A 4NNCA 4FIRA 1UCWA 1NF0A 1RPXA 2Q3OA 1O95A 3P61A 3RLVA 1W31A 4AWUA 4RZ5A 3EKZA 1AW5A 4O54A 3M44A 3HG5A 2NXHA 4RKAA 4O53A 3NXFA 3R2GA 4LNYA 1SW7A 3TUUA 3GKAA 2F84A 2OT1A 1PHWA 2NX1A 1VH7A 4IOTA 1LLZA 4DBDA 3CB8A 4JTFA 3RNDA 1F05A 1FWTA 1F7BA 2A0NA 4GUIA 4R7JA 3B04A 1X1ZA 1D9EA 5AC7A 4NJJA 3TROA 3STCA 2JBMA 3C2VA 1H5YA 3P84A 4W9TA 3QSRA 4MY9A 3TMLA 5G4WA 2E77A 1QO5A 3BK0A 2VFHA 1F6PA 5D03A 3PSWA 3GX9A 4JNMA 1N8FA 3MP5A 5G5IA 3WJYA 3LV5A 1DOSA 2ZYFA 3KXQA 5HWNA 3HF3A 3ZWTA 4JDBA 5CZSA 5D2YA 3E02A 1YTKA 1BWKA 1W5PA 2V30A 3HBLA 4ML9A 3SI9A 1W1ZA 3F4NA 3DFTA 3S1VA 1XM3A 2EGZA 2NX3A 2J88A 4JYFA 5G2WA 5BRBA 1ZALA 2YPIA 4MOZA 1ALDA 1MEHA 3PUDA 4PA8A 1YDOA 3NPXA 3QQ1A 2E5DA 3W1LA 1JCXA 2X2GA 3W7NA 3O8AA 1GT8A 3TMQA 4DF1A 2E68A 3MWAA 3QFEA 2PRLA 4A22A 4OBTA 1FBAA 1KM0A 2FB2A 1KTBA 1DORA 3WJWA 2ZTJA 3DFNA 4FXSA 1U83A 4K37A 7TIMA 3ABQA 4WOZA 1IXPA 2Y89A 1DBTA 2QUVA 2HMCA 4UFLA 3G0XA 5CSRA 3LRMA 1KFLA 3W72A 3QPZA 4AAJA 5AHLA 2RFGA 3S5OA 1PIIA 2OJPA 4YCPA 2VC6A 3KRZA 2FQIA 4E2DA 3TSBA 1WBHA 2CZFA 4WD0A 3EEGA 3HG3A 5EKYA 2FFCA 3TE9A 4NQ1A 3GVGA 2P0OA 3TAOA 1EEPA 4YWIA 5LNSA 3EX4A 1G67A 3Q58A 1VGAA 3EWYA 2V5BA 2J24A 2NWRA 4YLWA 3MMTA 4X9SA 3C4UA 2CLLA 2H6RA 3GR7A 3H53A 1KFCA 3P8JA 3QSTA 4NT0A 3MP3A 2V9DA 2VKZG 5AN7A 5FF3A 3QJAA 2V8ZA 2VFFA 3UY8A 5HR6A 1VLIA 5G2IA 1JQVA 2E6YA 5D05A 4NX0A 5EY5A 4JD4A 3UD6A 3W7PA 1TPWA 3DENA 3TCEA 2ZZ1A 1TPB1 3DZ1A 3FKKA 5D04C 1A5AA 3TW6A 2Q8LA 1OG0A 3P74A 5K4XA 5BMXA 1G4SA 1JCMP 3QF0A 3RLUA 4CCEA 4O1DA 2YFNA 1NEYA 3RK8A 1EPXA 3LXAA 3KFTA 4UTKA 3DFSA 3C3NA 3O6CA 2EPHA 5DBTA 1SU5A 1TV5A 3JRKA 3LCLA 3SECA 4IJBA 4YL2A 1Q6OA 1HO1A 4UUIA 3HG2A 4KFOA 2QCGA 3N19B 4TX9A 3UXAA 4IXHA 1H61A 1TPVA 1W5NA 4EF9A 1LROA 5LHEA 3W87A 4FX8A 3CHVA 1FXPA 1SUXA 1OABA 4Z1BA 3NM1A 1Q45A 4CNOA 2A5HA 3L67A 5HJLA 2NUXA 1L9WA 3W7KA 3UY7A 2NUWA 1XBYA 3FIGA 1I2RA 1TIMA 4FNPA 3NVTA 1H7NA 2YSWA 3ELFA 4FX7A 3PBWA 5LHFA 2QCDA 3A9IA 3G18A 1TV7A 3E0IA 1SW3A 1H51A 4N2YA 1YXDA 1WQ5A 5I3FA 2CLIA 1KM3A 1KM1A 3BLFA 3W88A 1VJIA 4OV4A 1SO3A 3EXSA 3W2UA 1L6SA 3H54A 1ML1A 4M19A 3BARA 3OVQA 3QW3A 1DV7A 3LTPA 2CU0A 1DHPA 4ORMA 2EHHA 1DVJA 1SR9A 2XFWA 4XBKA 3SIZA 3FA5A 3G1FA 2Y7GA 4ONVA 1X6UA 2VENA 3S1XA 3A23A 4POCA 5CGQA 5TIMA 2ZZ7A 1VYPX 4O0KA 3P8IA 1XFBA 3L0KA 3M47A 3EWBX 4S2CA 1G4PA 3W75A 1G6CA 3DH7A 4I7VA 3B0UX 1XUZA 1LZOA 3OIXA 1W5QA 3S5ZA 2TPSA 3T44A 1VRDA 4KKXA 3EWXA 3O63A 5A8GA 4IWWA 3GKFA 1VC4A 3LHTA 4JTIA 1CX9A 3LI0A 1S5VA 3R12A 3TQ0A 5AHMA 4UFJA 3G0SA 1LM1A 3TDFA 3R13A 3PUEA 1YDNA 3CWOX 4WZHA 4IPIA 2E6AA 4Y6GA 1LRNA 5SWUA 1EP2A 2TMDA 6ALDA 3W9ZA 1GVQA 1WBJA 4UNKA 1EWEA 1LLWA 3STEA 3CWNA 4CQAA 3EXRA 2A7NA 3SSJA 4N9EA 4Z1CA 3C52A 1YPIA 3M5VA 5CG7A 4EOUA 5T26A 4S2BA 1AW1A 5LGZA 1VZWA 4LVFA 2QCFA 5LSMA 4Y8FA 4IXXA 3IVUA 3MBFA 3HPXA 1SPQA 3IIZA 1B4KA 3CIXA 1Q3NA 4X2RA 1X8FA 3PBYA 3O06A 3ABOA 1QFEA 3W7JA 1TPC1 3GDKA 4NZFA 5F2IA 1CW2A 3NPWA 4O8RA 4LVDA 3GR8A 3VKJA 3C8FA 2GOUA 4LV9A 4MZ1A 3TNOA 1JUBA 5I3HA 1K02A 4ADUA 1T96A 3S9YA 3A21A 2VFGA 1B3OA 2OT0A 5K9CA 2PE4A 4S1FA 3OVPA 4N6EA 4UNLA 4M7SA 4QQ3A 4QISA 1FDYA 2V82A 3W1UA 3G1AA 1H50A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2DJLA

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