2DOR | Genus

Total Genus 112

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	112
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The crystal structure of Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A complexed with the enzyme reaction product throws light on its enzymatic function. pubmed rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	112
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	1998-05-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	2dorA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2dorA01

3NQ6A 3P67A 3GXNA 1LBLA 4GC4A 3SR7A 1W37A 3W7HA 1OK4A 1SO4A 3NQGA 2EF9A 5G1YA 4LV4A 2GQ9A 3IIXA 4OHQA 4IXXA 3B0PA 3LI0A 1TTPA 2C18A 2ISWA 1YLVA 4R7JA 4ZQRA 2G96A 2QEZA 2Y70A 3QM3A 5HWJA 4KWWA 3R2GA 1CW2A 1TPDA 2Y7FA 2YGYA 4EF8A 3DGRA 3I7RA 1FUYA 4WXZA 5CKSA 1DL3A 2TMDA 3LHYA 2A7RA 3UWWA 4HIBA 3EKLA 4Z0JA 2BXVA 3QW3A 1VYRA 3OHIA 4HSOA 3KX6A 4FXRA 5D2WA 5G2HA 3L0GA 4MOZA 3UPWA 2V0TA 3QF0A 2RDWA 3NVTA 3WK2A 3CLMA 3NPVA 5KTLA 3FA5A 3W7MA 2C13A 3L5MA 3RF9A 3NQMA 5CZTA 5EY5A 4A29A 1LBMA 4LU0A 3N9RA 4IJBA 2YX0A 1O60A 2CLOA 1U5JA 1DQXA 4OT7A 2E5CA 2A6LA 2ZDRA 1S3HA 2VFGA 3SECA 4JTHA 2J9ZA 4GUJA 3L0KA 1YPFA 1N7KA 1ME7A 1W31A 1VRDA 4I7WA 3ZS4A 5E1QA 5LNRA 3G1HA 1ME9A 1B4EA 3R8RA 4NJKA 1ZNNA 1EB3A 3UZJA 3F03K 4FNPA 3MHFA 3HG2A 3BW2A 3CPRA 3L21A 1LOSA 4TIMA 4AAJA 3L68A 1R30A 2J9XA 2WKJA 2UV8G 4UFJA 3P61A 4PC8A 1SO5A 4MUZA 1GEQA 4O14A 1ICPA 3GDLA 4NUWA 5TQLA 3W7PA 3CB8A 2DORA 1OJXA 3PC0A 5U4NA 4LVAA 5D05A 1VR6A 3N34A 1J5TA 5CPMA 3W7LA 2E1DA 3W7NA 2EKCA 5AHLA 3G1DA 4O1BA 3IGSA 4JN6A 3C0JA 2R14A 5LGZA 2ZRXA 2Q3OA 3B05A 5DY2A 3MP4A 1G4TA 4NNCA 3VFLA 1WDWA 1LOQA 2FPYA 5BMXA 3DFQA 1MO0A 2DZSA 4Y90A 4AF0B 4AHQA 4ZMGA 3L65A 2PRLA 4EIVA 2D73A 3W83A 3B04A 3OVPA 2ZA3A 2ZYFA 3LX9A 3S5NA 1OVDA 1F5ZA 2C19A 3A5FA 3OVRA 2VEMA 3GB6A 1XL9A 4UTIA 3O15A 3IVTA 5AHFA 1P5BA 3IEBA 4UUIA 2JKEA 3B03A 1YDOA 3MBFA 2V2DA 5F2LA 2W79A 2X30A 3OG3A 1X1OA 4UTLA 3CHVA 2WNQA 3TMQA 4NNAA 3W9ZA 3DFNA 3W7EA 4LY8A 3TCEA 2HSAA 5CZJA 2NLIA 5BRBA 1D3HA 3DHDA 2ZRZA 1TSIA 4DO5A 5HUOA 4WJEA 3P5ZA 1GTEA 2BX7A 5D2YA 3VI2A 2H8XA 4UFIA 3GKAA 3M5ZA 2V2CA 4LT9A 2AQWA 4WZHA 2QDHA 1KM2A 1NEYA 4Z1AA 3Q2DA 3O63A 3EX6A 1SO3A 2WPBA 5IBXC 3LDVA 2QCMA 1JQVA 4ZQCA 4RKAA 3WFAA 5G2IA 3LXAA 7TIMA 5KZEA 4MZ8A 1OFPA 4KFPA 3LCLA 1JCMP 3UWQA 4MPQA 1G4SA 1W3IA 4JD4A 3G1AA 1EUAA 4KFOA 1ZJIA 3C8FA 2FPTA 3KVKA 4RX0A 3W1NA 3UZ5A 2QCLA 3H55A 4MJZA 5HQEA 3TE9A 2CZEA 2ZTKA 4O50A 3BG3A 4K6AA 3BLIA 3PWAA 3W7OA 3LXBA 1VYSX 3W7KA 3G22A 4P2VA 5A5WA 4RJEA 2QCNA 3BGGA 4GXMA 3W72A 4M6PA 5AHNA 4TMCA 3T78A 2YYUA 2OZ0A 5G2WA 3VCRA 3B8DA 2J88A 4IOTA 1GYLA 1KFBA 5E0KA 4O0ZA 1OYAA 4ML9A 1OHLA 1EP1A 2AAMA 2C0AA 4MLJA 4FNTA 1MEHA 1XBZA 3E12A 3NNTA 4NT0A 5HULA 4DEFA 3TQVA 4ZVJA 4MY9A 5DLCA 1I2PA 1PVNA 4AWUA 2B7QA 3W2MA 3W1AA 3FLUA 3Q37A 1GVFA 3S5ZA 1PIIA 1TPB1 2V5BA 3N9SA 5KSWA 1OK6A 5CPOA 1GG1A 1XC4A 4CNNA 2G5WA 3LM7A 3MBDA 3MWAA 3QSTA 3NQVA 5HUPA 5TBOA 4DPQA 1LBFA 5G4WA 3TFXA 3GX9A 3SGZA 3UWVA 1NF0A 4UTHA 3W2KA 4U28A 1LRTA 4LV9A 1ZAJA 1Z48A 3PBYA 3MJYA 4PL1A 3GR8A 4UTMA 1IXQA 3G0XA 1GVOA 4X3ZA 4O16A 4MVAA 3O6CA 2E5DA 4GBUA 1Q6LA 4GE8A 5D04C 3S8HA 3K30A 5HJLA 5CSSA 3HF3A 1BTMA 1OFQA 3W73A 3MI3A 4HHPA 3DFTA 4ORMA 5AFDA 4NJHA 1A5SA 3G1VA 4JDBA 3FS2A 1DQWA 3CT7A 2ZCGA 2WSYA 1KM3A 1ALDA 3NM1A 3P81A 4LC8A 3N3MA 4BI5A 2FQIA 3QZEA 2OT0A 1KM5A 3IIOA 3V75A 1SSDA 1QAPA 3NL3A 2CLKA 3N2XA 5I3HA 2G95A 2IQTA 4HPXA 5K9DA 3LI1A 4DELA 3DU0A 2CU0A 3TU9A 5FEZA 1K03A 5KZMA 3O6YX 3CWOX 4LVDA 4A22A 4MFDA 3MYOA 2NX3A 3NQFA 3DZ1A 1G7UA 5FF4A 2P10A 3THQA 1YPIA 2CZDA 1P0KA 3KAOA 3C4UA 1FXQA 1VC4A 2JGQA 2ATSA 3DFOA 1NAL1 3W7RA 2VELA 4O53A 4W9TA 1JUEA 5FEXA 2Q8ZA 1OFOA 1H61A 3SY5A 1CX9A 2X1SA 2XFWA 3W23A 4POCA 3W1PA 3MHUA 3W7IA 1VS1A 1FBAA 3HO8A 2Y7GA 3RNDA 3IIZA 1HL2A 3BGJA 4U4MA 4RR4A 1Z44A 2HS6A 4TX9A 5DY3A 2J24A 2J9YA 1PV8A 1XI3A 2PCQA 4IQLA 1PL9A 3EXRA 2HMCA 2FJKA 3O05A 3ZWSA 1L2UA 1UUOA 3PB0A 5C54A 4Z0SA 3LTSA 1WV2A 5FEPA 3DFPA 4O28A 2FIQA 4M7SA 3IVSA 1FDZA 2VFIA 1TPVA 2JKPA 2XN1A 3L9CA 1XBYA 3GDTA 5IBXA 2ATMA 1GJPA 4E2BA 3GIYA 5LNUA 3O6DA 4XTIA 5C2XA 3TH6A 3G0SA 1NFBA 3IRDA 3S9YA 4PODA 2BTMA 1MEIA 4A21A 5F4WA 2ZQ0A 4WOZA 1B57A 5AOUA 4Q4KA 3HQ1A 3MW7A 4LVGA 4A2SA 1GWJA 1B3OA 3O1NA 4JGDA 1UB3A 1MXSA 4LRSA 1W3NA 5AC6A 3G1FA 4OE7A 4FXSA 2FPVA 1FCBA 3P8JA 4CQ8A 3NQ7A 1GOXA 2V81A 5CZ0A 8TIMA 2A1YA 3PUOA 5L6UA 3DXIA 3LRLA 5LKYA 4HSNA 2WNNA 2I9EA 3NPUA 1W0MA 5D33A 1JCLA 2EAWA 4PFMA 3C6CA 3NZ1A 1SSGA 3M7WA 3S42A 1LM1A 3TJXA 5HR7A 2A6NA 1YDNA 3HPSA 3W2UA 4IXHA 5AN7A 3BLFA 1TV8A 4LC6A 5KZDA 4K38A 3UY7A 5KITA 4LS0A 3HPXA 3LCWA 1VQTA 3LRKA 3QSRA 3BW4A 3HIJA 4UIOA 1KLYA 4UXDA 5FF3A 3EWBX 4RZ4A 4MJMA 4NQ1A 1FCUA 3LGEA 5C5YA 3GYEA 3R13A 3R12A 2GQAA 3USBA 5D38A 4RLIA 2ZZ3A 3LV5A 1TPFA 2OX1A 3S0CA 4UTJA 4GWEA 4Y8FA 1KFLA 1LCOA 1VZWA 1JUBA 2QJHA 3OEXA 5G1TA 1OG0A 4UC5A 4MZYA 2Y63A 1SU5A 3B0UX 4LWWA 1JCNA 5CGQA 3BG9A 4O13A 2FTPA 5D37A 3GAYA 3CTLA 5FF7A 4PL2A 4MYXA 4ADSA 3L5LA 5L9FA 5DELA 3EXTA 1QPNA 5D32A 2J27A 3TSBA 1IXPA 1VCGA 2A7NA 4O4WA 3QQ1A 1K3UA 1UCWA 4QNEA 1ZHAA 3SI9A 1X6UA 3Q94A 3LTYA 4IMCA 2NWSA 2Z1BA 3E49A 1TRIA 2X16A 3T7VA 1OFEA 1RR2A 1ZCOA 4K7YA 5I3GA 3CWNA 3SSJA 1OX4A 4Q32A 4BK9A 5KMYA 2JKAA 1JUKA 1F6KA 4JY9A 2V2HA 4XZ9A 1KTBA 1WAUA 4H4IA 3NQ2A 4KWVA 1TREA 2PURA 4FIRA 3LCGA 1LYXA 1H51A 4LW7A 1JRBA 4WY0B 1VPXA 5CPNA 1WOBA 4ZQOA 2CLEA 1R47A 4JR5A 1GVRA 3M5YA 5F4SA 3CIXA 3F4NA 2Y6ZA 3QMSA 1XDLA 3LHZA 4UTWC 2X1RA 2NZLA 1J4EA 2QCCA 1P1XA 2CZFA 2HS8A 2VXNA 3MMTA 3N19B 4GRSA 1W3TA 1ZENA 4CCCA 2G97A 3W3OA 4FNSA 1OYBA 3BW3A 3LCHA 1XDMA 4K36A 3G3DA 4HPJA 1ZFJA 5K3VA 4RZ6A 3UYCA 3LLFA 4MFEA 4ZQPA 4MKNA 3M0ZA 4FX7A 2NX9A 2CZ5A 1N55A 2A85A 3WJXA 2QCDB 4DBEA 1SZNA 4TO8A 1ICQA 3STEA 1R46A 1W5PA 4LOCA 5D03A 1ZALA 3ZFHA 1LRNA 1HFBA 3G8RA 1FCQA 3QMTA 1H7NA 2C15A 3SIZA 3MP5A 4AXKA 2E5BA 3HG4A 2GOUA 4K8HA 4XKYB 3M16A 4YLWA 2TSYA 2QCEA 1PCKA 4O1CA 4HNVA 2DZVA 4HN4A 1EUNA 5FEWA 4JX6A 4O4VA 5FF2A 3I7SA 4BFAA 4FB7A 3PAJA 3UNDA 3N2MA 3FYOA 3SW6A 5TIMA 1H7OA 3EB2A 3NM3A 4M19A 3U2OA 2RH9A 4LUJA 4UNKA 4YWIA 4M7TA 2PRHA 1FWTA 3WK0A 3NR0A 2Y62A 4XKYA 5J5RA 2TPSA 3P5YA 3TKFA 1F05A 3D0CA 1F2JA 2B4GA 3RU6A 3U6WA 3W85A 4QITA 4BI6A 2O7SA 1DKWA 3YPIA 3C3NA 1KLZA 1X1ZA 4H3DA 3PY2A 2E68A 3S6DA 2DU2A 3W1XA 2WO5A 3C2OA 2KZHA 4O19A 3TV8A 1OYCA 5U7SA 1ZAIA 2Z6JA 4CCEA 3P80A 1Z42A 5HMSA 2Z2UA 1QPRA 1YXYA 3EWXA 4EVZA 4AF0A 1M5WA 3G1XA 3LHWA 3QMRA 3P74A 1HTIA 4JTSA 4NU7A 2QAPA 3LOTA 2YR1A 1WXJA 2YYTA 4JYEA 1JQXA 3TW6A 2VC6A 1SZFA 3GXTA 4FNRA 3W1UA 1EEPA 1PCWA 4MIMA 3PM6A 4DF0A 1WX0A 1YDVA 4ADTA 1I2QA 3W71A 4XUGA 4Z1DA 2FLIA 2PC4A 3BK0A 5AC8A 2QR6A 3BARA 2R94A 4UMCA 4Y96A 4X9SA 4GUIA 1E51A 3LHVA 6ALDA 3IIPA 3C2RA 4UTTA 1TMHA 3M6YA 3OBKA 4CLMA 4IUOA 1H62A 2VFEA 2YW4A 3TXZA 1OFBA 5K4ZA 4O15A 1RV8A 1TQJA 1W54A 2CLMA 1UBSA 4UTUA 1TIMA 1TCDA 4LUIA 3HPZA 2RKXA 4HNTA 1TV7A 1XBVA 5DCBA 2TYSA 3A9IA 1AW1A 1S5VA 1OF6A 4JTGA 2YPIA 3CM4A 3TAKA 4XBSA 1AW2A 1VLWA 1SW7A 3MI6A 5DCEA 3E96A 4LTSA 4PCFA 3TMLA 3UXDA 5I3IA 4UTWA 1PE1A 3M5XA 3RLVA 5J5DA 3N14A 2CW6A 2GPTA 3TK7A 3UWUA 3QFEA 3P8IA 1UJPA 3W7DA 3TFCA 2E6YA 1AK5A 3W7QA 1TPWA 2Z0IA 3GAKA 1GPWA 4N6FA 5DBTA 4KKXA 4E0CA 5K9CA 1LRQA 4I9AA 4N2YA 5I3JA 1EP2A 1A53A 2QJIA 1Q6RA 3TUUA 1FCVA 2E6DA 2QF7A 2Y88A 5BW6A 3V1PA 1JJKA 4IMEA 4S1FA 1R2RA 4NJIA 1OFDA 1DORA 3PB2A 1K7EA 4LVBA 3PG9A 5LGXA 4ONVA 1QO5A 3TSMA 1TV5A 1Q3NA 5H2ZA 3GDRA 1MEWA 1RQHA 2GQ8A 4XTDA 4IMDA 3TX9A 3KVMA 3HG5A 2NUWA 3HGSA 1HUVA 4JIQA 4QNWA 3B0VC 4WQ6A 1VYPX 3ABOA 1EWDA 3CEUA 1HO1A 4AHOA 1TPC1 2EHHA 1G69A 4QQ3A 3MUXA 3NQ8A 5BMWA 3BLEA 3EWZA 5FESA 1RZMA 3BG5A 1RQEA 1H5YA 2B7PA 5IM51 1MSSA 2C16A 2JBMA 3G24A 3P60A 1PHQA 1H7RA 3Q58A 1N8FA 3BVJA 2GVGA 4FO4A 2P1FA 4LS1A 1DJQA 5DXXA 2V8ZA 3NG3A 4N4PA 2QAFA 2YFNA 3T40A 4A2RA 4BR1A 1AG1O 5D09A 3LCIA 3S1VA 3O07A 5F2IA 3A24A 3TROA 4JX4A 2NX1A 1MZHA 3M41A 1W1ZA 4XBKA 3RMJA 3NAVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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