2DOR | Genus

Total Genus 112

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	112
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The crystal structure of Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A complexed with the enzyme reaction product throws light on its enzymatic function. pubmed rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	112
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	1998-05-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	2dorA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2dorA01

4YWIA 3WK0A 2ZZ6A 3W1RA 4AHPA 2RDWA 4YCOA 4GRSA 3ABRA 5G1YA 3PBVA 4UR7A 3FA5A 3PUDA 4ONVA 2C0AA 4CNNA 3LCIA 1XBXA 2A2IA 2A21A 3NAVA 2PE4A 1BTMA 4UTMA 3LOTA 4MPQA 3W73A 1QFEA 3TSMA 2A5HA 1ZENA 4IMCA 5G2WA 4A2RA 1OFRA 4NVTA 1FUYA 1TPC1 1ICQA 3IIPA 1GTEA 3FFSA 4GUHA 3SECA 3OA3A 1OFBA 3GDRA 3G0XA 1L2UA 1OFDA 5I3IA 3I65A 1F76A 1TB3A 1T8XA 3TXZA 3W2KA 3DHFA 3EWZA 1VHCA 3G0SA 5DBUA 5C55A 4IWWA 2ZQ0A 2ZRXA 5IBXA 3MHGA 4CNPA 2ZCGA 2JKPA 1VC4A 3LHYA 3MHUA 1X8FA 3W7NA 4RK8A 1R2TA 3W7QA 1LBMA 3ELFA 3O6YX 3G1SA 3LTPA 3UNDA 3NQ8A 2CFFA 3LERA 4DO6A 5GVJA 3TFCA 3GDLA 1ME9A 3N34A 6ALDA 1Z44A 2NWRA 2VKZG 3C8FA 3OVQA 4N9DA 4O50A 3UWVA 4N9BA 4QIUA 3W85A 3A9IA 5CZ0A 2ZA2A 2FPTA 1M7OA 1KM4A 4AMAA 5DN1A 1E51A 2C6QA 3NEVA 3NQCA 3FYPA 4UMBA 4BI7A 3P5YA 3FKRA 1IXOA 2R14A 3IIZA 1TRDA 4NJHA 3ZFHA 3M5VA 1FCUA 4N9EA 1MO0A 1XBVA 2W79A 3TDFA 1ZJIA 4CCCA 3LRKA 1Z41A 2JBMA 5EYWA 2ZRUA 4Q33A 3LCLA 1TV7A 3GR8A 4N9CA 4XQ6A 4AWSA 1EP1A 1FWSA 3L5MA 1KFJA 4LC8A 3L9CA 4WXYA 2WKJA 4LT9A 5CZSA 4JTUA 5TQLA 3BW2A 4R53A 4DEFA 1K3UA 2VEPA 4I7VA 2IQTA 4O15A 3B0VC 3NG3A 1TTIA 4PEKA 1ZY9A 3NDOA 3LXAA 3P67A 1G4EA 3QMRA 2C13A 3KRSA 2Q8ZA 1LOLA 3HPZA 5IBXC 1EUAA 3B06A 1FDYA 3FYOA 2C19A 1BKSA 2E5DA 4ZQRA 3LHWA 4PCFA 1WX0A 3MP3A 5TIMA 4UUIA 1GOXA 3B04A 5AC7A 1P0NA 1KLYA 2X16A 3NZRA 2WPBA 4Q32A 4HNTA 3M41A 3GDKA 3FJLA 2BWGA 1PE1A 4FIQA 1ONRA 1B9BA 2NUYA 3A5FA 3S5ZA 4J9JA 2DP3A 5D33A 1K8ZA 1TIMA 3PG8A 3S42A 3M0ZA 4TR9A 1JJKA 1OFEA 1SSGA 5BW6A 4EF9A 3QRHA 1W37A 1VHNA 1F6PA 3UZJA 1Q6RA 4ORIA 1MSSA 3MUXA 1G7VA 3I7RA 4IX2A 5AC6A 4DXVA 3W75A 2H3DA 3BK0A 4JIPA 4POCA 2DORA 2CW6A 4PODA 3EX1A 1EA0A 1JCLA 1H62A 5FF4A 1TTJA 5KSWA 2H8ZA 3DBPA 2VXNA 3RNDA 5D2WA 4MJZA 1W31A 3HIJA 3KRZA 3Q2DA 4JICA 2QEZA 1XC4A 2OZ0A 2D73A 5F2LA 4FX6M 1X7FA 1KM6A 3W88A 1H61A 4GUFA 3G0UA 3UQNA 4IGHA 4O17A 3EEGA 1GVSA 1FXPA 2VEKA 3UPBA 1H5YA 2WSQA 4LY8A 2V5BA 4GE8A 4XBSA 3C56A 4MY8A 4O52A 1G4TA 3PUEA 4E2DA 2QDGA 2ZRVA 2B7PA 2FJKA 1I2PA 3O8AA 4OV9A 3SGUA 4LVDA 3NM3A 4JNMA 5K4XA 1YXDA 1XCFA 4UFJA 5D30A 2ALDA 5LGZA 1W5OA 2ISWA 3TNOA 2C1HA 3R8RA 3ZS4A 1ME7A 3FLUA 3FOKA 4DBEA 3PC0A 3RLUA 3G3MA 4R33A 2PURA 2O7SA 4UTIA 2ZRWA 2Y7FA 1WOBA 1JQXA 4ML9A 3QQ0A 5EBUA 3C3NA 4JTJA 1VLWA 3S5OA 1MXSA 2Y85A 4OBTA 3TJXA 3C0JA 3LI0A 2H90A 3C52A 1OFPA 4S1FA 2RH9A 1KM3A 4JTHA 3G18A 2ZZ7A 1SFLA 3GX9A 4AHOA 1L9WA 4DELA 2QDHA 5FF2A 3W1TA 3IV3A 3GNNA 1NSJA 3OBKA 4Z1CA 3IEBA 4RZ4A 5AFDA 4YXGA 5T26A 3SGZA 1G4PA 2GPTA 2ZA3A 4NXKA 5LSMA 1ZALA 2CLMA 3W87A 5CPOA 1ZAJA 1G67A 1VPXA 1SR9A 5J5RA 2ZBTA 4RCXA 3BLFA 1W5PA 3C2RA 1SO6A 1AL8A 5KMYA 3NPUA 3L67A 3W1PA 5KTLA 5G1TA 5KITA 3VCRA 4LVAA 2JGQA 3WK2A 4C1KA 1JR1A 2ZZ5A 4AAJA 3ZR4A 3NGJA 3TFXA 2RFGA 1Q3NA 3HG5A 5LGXA 2A6NA 2E6YA 2C18A 3USBA 4RLIA 3O05A 4Y9AA 3KHJA 2NUWA 1S5WA 2QCDA 1DBTA 4UXDA 3BPWA 3O06A 4N6EA 3LXBA 1PHQA 4IX0A 4UFHA 5AHFA 4HT3A 1XUUA 4K6AA 1QDSA 1KV5A 4L4LA 3LM7A 1T0OA 1TO3A 1LOSA 1DQWA 3B0PA 2Y61A 3BLEA 5E93A 2WQPA 4O28A 1JCYA 4QNWA 2CZEA 1S5TA 3LLFA 1V7YA 4I9AA 1K7FA 3CLMA 3TA6A 3NQVA 3E12A 3L66A 3TR2A 3RFAA 1W3IA 3PBWA 3RF9A 1OK4A 4TX9A 3BVJA 1LP6A 4NJKA 1VQTA 3P74A 4YL2A 1RD5A 4WOQA 2DZSA 3VKJA 1DJQA 3L2IA 3LCFA 1X1ZA 1OX5A 4LRSA 2V82A 1OF6A 3HO8A 1KBIA 3EXSA 3VE9A 4UTJA 4WJEA 3NQDA 2Y62A 4CLMA 1LRQA 1F7BA 4QNEA 3E9AA 5AYXA 2PCQA 4EVZA 3ATYA 3ANYA 3CEUA 3M5YA 1B57A 2AQWA 4O14A 4XZ9A 1LBFA 1EB3A 2WSRA 4GWEA 4OQVA 2YGYA 3W84A 2QCLA 2FIQA 1C29A 1VYSX 1AW2A 1PCWA 2NXGA 2ISVA 3QM3A 1JCJA 3WJWA 1KBJA 4AWUA 1JUEA 2UV8G 2B7OA 3DZ1A 2NWSA 2GVLA 2ZRZA 1GWJA 1L6WA 1NFBA 2EHHA 2ZA1A 3STFA 5I3HA 4IXHA 5C54A 3S1XA 5EA9A 5LZLA 3HJZA 1GVQA 3GAYA 2QJHA 1LYXA 5U4NA 3TXVA 4JN6A 3GXPA 1RPXA 4MZ1A 2ZZ4A 1IXQA 1OYCA 3O63A 1SW0A 1KLZA 4X22A 2ZFAA 3KX6A 3NQ2A 5AHLA 3QSRA 1GT8A 1GYLA 5AHIA 3THQA 1NF7A 2EAWA 2WNQA 3M9YA 1OHLA 4MY9A 2DZVA 4I7UA 3H54A 5CGQA 1A5SA 3JRKA 5KZMA 3P61A 2QUVA 2VFDA 4BK9A 5F4SA 1YPIA 5AYZA 3HMJG 1V5XA 4OWGA 4FNUA 4O0KA 2QCEA 3PR2A 3GKFA 3S5NA 4MOZA 4O19A 3OVPA 3PM6A 3P7YA 5D32A 4OHQA 1K02A 4IXXA 4RJEA 3QQ1A 4HPJA 2A1YA 1YADA 3IVUA 2ZYFA 3W2JA 1PV8A 4N4PA 3RLVA 4XTIA 2ZZ2A 3KVLA 2EKCA 4Y6GA 1K8XA 3HB9A 1LBLA 4CQ8A 4K7YA 2XFWA 3BW4A 4MYAA 1HL2A 1F5ZA 5FF7A 3UWZA 1DV7A 1LM1A 1LLWA 1XBYA 3FS2A 1ME8A 4LTSA 1KTCA 1WYIA 4Z1AA 1T96A 1EP2A 3DFSA 3G1FA 3CM4A 2NX3A 5D02A 3WFAA 4MZ8A 2X1SA 1W3TA 3FEMA 3LX9A 4UFIA 4O11A 3G1XA 3GLCA 1SZEA 3CQ0A 3KFTA 4U4MA 3MP5A 4W9TA 5HWJA 4O12A 2WOQA 2QAPA 2RDTA 1FWNA 5CSRA 4Y8FA 1W5QA 1WA3A 1N8FA 4XTDA 4AH7A 4EF8A 4WQ6A 5FF3A 3W7CA 1LROA 2V9DA 3PSWA 3PSVA 3CEPA 3W2MA 3DFTA 3NNTA 4LV9A 3LRLA 2Y89A 3IGSA 4MZYA 1UBSA 3KRUA 3GXNA 3TQVA 4ICNA 3LB0A 3HPSA 3T44A 3HG4A 3HPXA 3M6YA 4FNSA 2J9YA 1Q6LA 1TTQA 1JULA 2DZUA 2R91A 1QPRA 4IPJA 4TMCA 1WBJA 4H6KA 4GC4A 1TPVA 3HG3A 4O54A 1UASA 4XKYA 4JY8A 1I2NA 4EWND 4E0CA 1FBAA 3PWAA 3EWUA 4JTTA 2Q3RA 4K8HA 3BV4A 3QPZA 2TRSA 3DFOA 4M19A 3TMQA 3THAA 4ZMGA 1QCWA 3C2VA 3W71A 3L68A 1EWEA 3INPA 2HTMA 1OYAA 3P60A 1AG1O 3NL3A 3TH6A 3CPRA 2R94A 1PL9A 3LHUA 4MY1A 1D9EA 3NZ1A 4IUOA 4LUJA 2I9EA 2VFIA 3TV8A 1VZWA 4JY9A 2ZTJA 3DFNA 4OT7A 1FWWA 1SZGA 2EGZA 4RZ5A 3T40A 1QOPA 2A7PA 1HUVA 5FF0A 5C6MA 1YDNA 5KINA 5K9DA 5D05A 3WJZA 1IIGA 3W9ZA 3RU6A 1DOSA 4K7VA 3G3DA 1EPXA 1KFBA 2TYSA 2E68A 2DU2A 4LUIA 3TC6A 4WXZA 4IPIA 3A23A 4MJMA 4PC8A 5EPDA 3DENA 4MUZA 1ZAHA 4L4MA 4FX8A 4UFKA 3C2OA 3T78A 3B05A 4WD0A 3UPWA 4LS1A 4AB4A 3W7IA 1FCVA 4UIOA 2QR6A 5I3FA 3DU0A 3LXCA 2E1DA 1B4EA 5HUOA 3IGXA 4ADTA 3UD6A 4YLWA 2QCCA 3TAOA 2CZDA 2DJLA 1BWLA 2PRLA 3O6CA 2QCMA 2VENA 3W22A 1RR2A 1VH7A 4P2VA 1OX4B 1VYRA 2FLIA 3SFKA 3SJ3A 5HWNA 4AF0A 3MHFA 1W1ZA 1SQ7A 3WJSA 4UTLA 1W0MA 1X1OA 1RVGA 2G5WA 3W7JA 5EY5A 2ATMA 1TPWA 1QNVA 2AGKA 5EKYA 4UTTC 3RK8A 2OMAA 1TJRA 3VNDA 4CCDA 2YXGA 3U8GA 1G4SA 2GJLA 3MJYA 1U83A 3N19B 5DXYA 4QAIA 3TX9A 4QSHA 1I2OA 1KFCA 3L5LA 1Z42A 1FWRA 1W3NA 1VCGA 4UNLA 3PB2A 3MI6A 2CLEA 4K37A 3GYEA 2A6LA 4BR1A 3DXIA 3NA8A 3PBYA 3G22A 5A8GA 3NQGA 3HGRA 5FEZA 1CI1A 1O5KA 1GJPA 3L0KA 1AMKA 3W7LA 1OG0A 2YW4A 2VEMA 4FIRA 4NXSA 3SR7A 4JYEA 5I3GA 1EWDA 4RV8A 2Y88A 3EX3A 5L9FA 3MO7A 3LBMA 4O4VA 2BLEA 3NQFA 2QCNA 1HTIA 1FX6A 4NT0A 2ZRYA 3I68A 3LLDA 4WOZA 1J5TA 5FESA 1C8VA 1JRCA 1R2SA 2WV8A 1LTDA 1F73A 2DZTA 2C3ZA 2E6AA 1A50A 4K38A 2RHGA 1M7PA 2NX9A 4PTNA 2EPHA 3MI2A 1CX9A 2HS6A 2YR1A 3UWUA 1OJXA 2QKFA 4ADSA 1RZMA 3EX6A 4LNYA 3W1XA 2BX7A 3LBCA 3TKFA 1D3GA 3L65A 5DLCA 1OYBA 2E5CA 3N73A 3JS3A 3STEA 4WY0A 5K4ZA 3LGEA 5LNUA 2B7QA 3SIZA 4XWUA 4AWTA 1JUBA 1OK6A 1KW1A 3EXRA 2QCHA 4M7SA 3L5AA 1UB3A 1XDLA 3G1AA 1YTKA 4S2CA 3EKLA 1WV2A 3HBLA 4CNOA 4UTUA 1P1XA 2ZDRA 4KFOA 3LTYA 3LDVA 3M44A 1GTHA 1YDOA 4X2RA 4FEZA 4ALDA 3HG2A 1WBHA 4JTKA 3BG9A 5HNRA 2DJXA 1EEPA 1H63A 3HOJA 1HFBA 1TV5A 1M5WA 3Q58A 1HG3A 3TCEA 3QF0A 3PY2A 2GQ8A 2BTMA 2QUTA 3IIVA 1QAPA 4NNCA 3O07A 5K3VA 3I7QA 1LLZA 1TREA 4LVFA 1EX5A 1I8JA 3TK7A 4LVGA 1JQVA 3TAKA 8TIMA 1GVRA 4A21A 1R2RA 3UYCA 3W1NA 1FDJA 5D38A 1Z48A 4R7JA 3QMSA 4NJGA 4OV4A 2VC6A 1TQJA 4O4WA 4HNNA 3LCXA 1ALDA 1LZOA 2NZLA 3ZWTA 3UXDA 5TBOA 4UFLA 4WUIA 3M5XA 1YXCA 4TO8A 3PS7A 4X9SA 3BLIA 3W1UA 3LV6A 2P1FA 5AC8A 4PL2A 5E1QA 3CHVA 2FPYA 3CT7A 4GUGA 1AW1A 4IMGA 4RZ6A 3HGSA 2Y7GA 1SO3A 3OEXA 5DBTA 2X2GA 1QO5A 2YFOA 3NL2A 1H50A 3B0UX 3TJLA 2NXHA 4JX5A 1ZFJA 4ZQMA 3UWWA 1W8SA 5DCEA 1VR6A 1OFOA 1PCKA 1GQNA 5HINA 3QW3A 4CQAA 3WK1A 5HR7A 4FNRA 4WZHA 3DAQA 3SY5A 1DQXA 4JIQA 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2ABBA 2E6FA 1KM1A 4BI5A 2XN0A 1SPQA 3IVTA 1H60A 2V2DA 1TRIA 1W5NA 1SZFA 2WNNA 4XBKA 3QEZA 4UNKA 2FQIA 2BSLA 1LRTA 3M5ZA 1K03A 5BNKA 4M6VA 2OT0A 4HSNA 4B5NA 2QCDB 1UJPA 4O0ZA 4PH6A 3B03A 1GEQA 1OFQA 3IVSA 4UTWC 1PHWA 4LS0A 1TPB1 2DZPA 1LRNA 1I2RA 1YPFA 3Q94A 3OVRA 3NQEA 1A5BA 1UUOA 3ABQA 4LOCA 3S1UA 5K2ZA 3EX2A 4HN4A 1DJNA 3MYOA 3UXAA 5L6UA 3W7MA 1SSDA 4IOTA 4TIMA 3MW7A 2CWNA 3T55A 1SO4A 3AO0A 3GK0A 3BW3A 2X1UA 3GAKA 2FFCA 3F4NA 3B4UA 4DBDA 2I1OA 3JR2A 5LHFA 5D03A 5KZDA 3UY8A 4JYFA 1KTNA 3HF3A 2GVGA 2ZZ3A 2GUUA 3NM1A 4Z0SA 1TMHA 4A22A 3W1LA 4NX0A 3W1AA 1JCNA 4BWLC 1QO2A 2CLOA 2P10A 2YZRA 3HGOA 3R12A 1K7EA 3H53A 4M5PA 4QQ3A 1GVOA 4N2YA 4CQ9A 3P8IA 3T7VA 2Z6IA 1R30A 1I2QA 3EWBX 3N9SA 4E38A 4I7WA 1T99A 3TROA 1H1ZA 3NL6A 4JXCA 3O16A 2HSAA 3LCHA 5CPMA 3S9YA 1N7KA 2C15A 5D2VA 4O1AA 1DL3A 1GG0A 3CB8A 5AYYA 4BFAA 3BG5A 2CU0A 4IMDA 3KAOA 2TSYA 3GXTA 4N02A 1U5JA 3MP4A 2E6DA 1W5MA 3P8JA 5DXXA 3BG3A 3M7WA 3PVFA 4UTTA 4FO4A 3E49A 3TUUA 1H1YA 5F2IA 3W7RA 3S6DA 1PVNA 2GOUA 2ZZ1A 3V1PA 3TSBA 4HNVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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