2DORA

Dihydroorotate dehydrogenase a from lactococcus lactis complexed with orotate
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure of Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A complexed with the enzyme reaction product throws light on its enzymatic function.
pubmed rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE A
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
total genus 112
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 1998-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2dorA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dorA01
3EXTA 2CLOA 3TC6A 1EUNA 1PE1A 2Q8LA 4JR5A 1MO0A 1LROA 3DFQA 4E2DA 1OFPA 3EXRA 3EEGA 3F1QA 3GAYA 4ZQCA 2ZQ0A 2DZUA 1CI1A 4Q33A 3NL5A 5CPNA 4PH6A 2VC6A 2KZHA 3LTSA 2EAWA 4JEQA 3FKRA 5G2WA 4DO5A 2WSYA 4O52A 4NJGA 4Q32A 1O5KA 1RR2A 2J24A 4UFMA 4S2BA 1JUKA 1SUXA 3AO0A 1CX9A 2ZTKA 5G1TA 1SSGA 4UNKA 4NJIA 3H55A 3P8IA 1OFBA 1DHPA 2A0NA 4LT9A 3LCHA 4H4IA 3T7VA 2H6RA 3C2VA 3PBVA 4N9CA 5DBTA 2A7RA 3M44A 3TU9A 1G7VA 3MP4A 3G0XA 1TIMA 2XN1A 3L2IA 3CEPA 2B4GA 4GUGA 2W79A 1OYBA 2WSRA 3C2RA 4JTLA 5EL1A 1D9EA 2NUYA 5D2VA 2D73A 1FXQA 1LZOA 1FY6A 3VE7A 1R2TA 2YW3A 3T78A 2ISSA 3RMJA 3O1NA 1LLWA 1H7PA 3PSWA 3FJ6A 5DCDA 5C6MA 1VCGA 2DZWA 4KFPA 1EWEA 3IRDA 3NM1A 4IX0A 1G4SA 4JN6A 1V7YA 5D33A 4IGHA 4FNRA 2C15A 3WJSA 2P1FA 3C4UA 4CCDA 3DENA 3C56A 3MYOA 5A5WA 5I3GA 3NAVA 3ZWSA 1SW7A 2NXIA 1DBTA 3GZ3A 1AL8A 1H51A 4O10A 3CC1A 3LI0A 3LV6A 2CZEA 5D2WA 1HFBA 4O12A 2C1HA 3LLFA 3QJAA 4O0KA 1GQNA 4R53A 3B04A 3SY5A 5BOOA 4N9DA 4N9EA 3B0VC 2Y7EA 1K8XA 4NZFA 3G1AA 1SW3A 4ADTA 4E2BA 1SZGA 1YTEA 3DFSA 2Q8ZA 3LGEA 4FX8A 2E77A 1ZFJA 4MYAA 5IM51 2P0OA 3ELFA 5FF3A 5CSSA 2VKZG 5IBXC 5I3IA 1AG1O 3E12A 3N14A 1JUBA 4DBEA 4MYXA 3L68A 1Y0EA 2VFGA 3C3NA 3WFAA 4O13A 4JTEA 1JULA 1TO3A 3O07A 4DBDA 3JS3A 3HGOA 4HPJA 3W73A 3HMJG 3PS7A 4LNYA 1LBLA 1ICQA 2YCEA 1HUVA 4OHQA 2V81A 5G2HA 3QSTA 5ABTA 1GVFA 1X1ZA 3LOTA 3L0KA 3LHZA 3NEVA 1ZNNA 3GXPA 2AGKA 4UTTA 1UCWA 1VYPX 3BGJA 3LXBA 5EA9A 4RJEA 3W1MA 4XBKA 2X2GA 5I3FA 1EP3A 5U7SA 4NX5A 1DORA 4GE8A 5LHFA 3TQ0A 2H90A 2A7PA 1M5WA 3RNDA 3JR2A 2NV2A 1TREA 3P8JA 1ICPA 2B7QA 3L5AA 1YLVA 2ZRZA 2PURA 5C55A 1LRNA 4EVZA 2J9XA 4QAIA 4CQAA 2TMDA 4DELA 1KM4A 1KTBA 4NNAA 2Y7GA 1N7KA 2ZRUA 4QITA 2WKJA 1LBFA 3W7CA 1W5NA 4MY9A 3DFNA 2V9DA 4BWLA 2NX9A 1TSIA 1GVOA 3EX6A 5AYZA 5HULA 4JNMA 3GNNA 1OYAA 1SQ7A 4Y90A 1KM0A 5D38A 3MHGA 4LS0A 3KXQA 2H8ZA 1LOQA 4FX7A 4IX2A 1GVQA 1VR6A 4JTGA 1R30A 4HSNA 2EKCA 2ZZ6A 4YCOA 4JTKA 1P0KA 2GOUA 1GG1A 3P5ZA 1Z41A 4EOUA 4ZQNA 1BTMA 3G1VA 4HPXA 3VNDA 3C2OA 5KZDA 4MIMA 1TPH1 1OX6A 3TXZA 3EWXA 3W1QA 4CQ9A 2DZSA 1VC4A 4O53A 4Z1CA 3SW6A 3I7RA 2Z0IA 3HJZA 4GBUA 2ZA2A 1CW2A 2CLFA 1F2JA 1M7OA 2VFDA 4O1AA 4OBTA 1RQHA 1GTEA 5AHEA 3VFLA 3SIZA 4DF2A 2CFFA 1DL3A 3BG5A 2A7NA 2VFIA 4JICA 1VCFA 1FDJA 2PC4A 3KX6A 4GUHA 5AC6A 3TSBA 1JCNA 4EF8A 4A21A 1N55A 3KVJA 2QDHA 5CPLA 3V1PA 1FWRA 2Z6JA 4WD0A 2P10A 3UZ5A 3NGJA 2A85A 1NF7A 2ZZ3A 4K39A 5CG7A 4NJHA 4AMAA 3T40A 1QOPA 3PVFA 4LY8A 4DF0A 3U8GA 3MO7A 2JKPA 3NZRA 4ORIA 3P62A 1AL7A 2HMCA 4H6KA 4MFEA 4O18A 1OX4A 1QPNA 4LRSA 3UZJA 4TR9A 5LGXA 1JRBA 2YDAA 3IIZA 1W3IA 2JGQA 3W1PA 2QJHA 2E6FA 3USBA 3DXIA 3LX9A 4E38A 2YYTA 3BW2A 3W1XA 5HR7A 1MEHA 3CIXA 3T44A 1HL2A 5G4WA 3UWYA 2YGYA 3R2GA 1KFLA 3BG9A 4JTSA 1W8SA 4O14A 5EYWA 4U4MA 1VHNA 2QCHA 3CQ0A 5DXXA 4NT0A 2QJIA 1GZGA 2NUWA 3MI6A 4O54A 1WYIA 4E0CA 3M5YA 1SZFA 5F2IA 5D2XA 2GQ8A 2BLEA 3VE9A 3QF0A 4O1CA 4C1KA 2J27A 1VZWA 3UD6A 2OMAA 2DZXA 3S5YA 4WY0A 5F2GA 4AVFA 1T0OA 3W3OA 1H60A 2E1DA 1O4UA 4R7JA 4DXVA 3WJYA 1KW1A 4UTMA 1XDLA 1LLZA 3I7SA 1YXCA 4WOZA 3W87A 2ZRWA 1QAPA 1LDCA 3G24A 1XBXA 1GTHA 5D37A 4DO4A 3LHVA 3MYPA 3HPZA 5G5IA 4WZHA 1IIHA 1ZAHA 1C9DA 2Y70A 3BO9A 1KLZA 1OFEA 4IQLA 3S42A 1GYLA 1OF8A 3TQVA 2GQAA 1Q6QA 4AWSA 4UFLA 1FX6A 1FWTA 5BMXA 1XBYA 2NWRA 3F4NA 3OHIA 1M7PA 1R46A 4HNNA 5CZ0A 1I2OA 5D2YA 1AMKA 5F1VA 4DF1A 2BXVA 3FLUA 3A24A 3B4UA 4JTUA 3LBCA 3TH6A 3WJWA 1ZHAA 1LYXA 3M9YA 3HPXA 4O16A 4JIQA 3W7HA 4N4PA 4DPPA 2XN0A 3OVPA 3TXVA 3P82A 2Y61A 3N19B 3LV5A 2VXNA 2YR1A 3UWZA 2WNNA 4BK9A 1AK5A 3O6CA 3PB2A 3C8FA 5LNSA 2CLIA 1LBMA 3S1VA 1SSDA 3A21A 3LRKA 4QIUA 2A1YA 1UUMA 3N73A 4WXYA 3NQ2A 4Z0JA 1LP6A 3LCWA 2PRLA 1FDYA 4LC6A 3N2MA 3OVRA 1W31A 3EXSA 4BF9A 4NX0A 3UY7A 5AB3A 2WV8A 1OYCA 1ZY9A 3QQ1A 4NNBA 2ABBA 5D2TA 1TPFA 4O19A 3TA6A 1KM5A 2ISWA 3KVKA 3TJXA 1ZAJA 3MBFA 4XWUA 4ZQRA 5BNKA 1G4EA 3W2JA 1P4CA 3C0JA 5T26A 3BARA 3W6YA 4OT7A 4MZYA 1ZENA 3R5EA 4S1FA 5EBUA 1WV2A 4Z1AA 3NQVA 1VQTA 3U6WA 4NQ1A 1WDWA 1KTCA 4K38A 1JVNA 4O1DA 1TJPA 3GXTA 2GVJA 1UASA 2H8XA 4O57A 3HG5A 3BG3A 3TAOA 4IWWA 2QCNA 5CZJA 1FXPA 2PE4A 4FNUA 3PBUA 1KM1A 5EY5A 2Q3OA 3NPUA 3GYEA 3Q94A 3M5VA 3QW4B 3DAQA 3DZ1A 4ONVA 3G1XA 4JXCA 3UNDA 2BX7A 2V0TA 1GG0A 2A6NA 5DY3A 5HWMA 4Y6GA 3CM4A 2WSQA 4N9BA 5LKYA 5LZLA 4PC8A 4N02A 2VENA 3NPWA 3LHWA 4BI5A 1BKSA 2CZFA 4Z1DA 3W7PA 4FB7A 1OX4B 3TV8A 3P5YA 3S1WA 4AWUA 1W5OA 1MEWA 5AHMA 3UWVA 3TKFA 5K4ZA 3P7YA 3L21A 5KSWA 2ZA1A 3DI1A 4UTWA 5D32A 3VKJA 3GLCA 2HS6A 3M47A 1IIGA 2R91A 3MBDA 2QCCA 3KAOA 3L65A 1MXSA 2FPYA 3NOEA 3R13A 4ZQPA 3EWUA 4Z08A 4MFDA 1QPRA 5KINA 1YDVA 3LXCA 2FPTA 2GVLA 3ABRA 4OV4A 3TUUA 4FNQA 3DHFA 1DKWA 3GIYA 4LS2A 1WOAA 5TQLA 3HG4A 4CNPA 2QCGA 3IVTA 3E96A 1PIIA 3WK2A 5SWUA 4LWWA 3W7LA 4FXRA 3PB0A 3LLDA 1DJNA 3PY2A 1OFAA 1F74A 1GYNA 3F03K 2OCZA 5D09A 5KZEA 3W1UA 3ZR4A 1JCMP 1NEYA 3GVGA 4ZMGA 3OIXA 4JD4A 3W1RA 3IGSA 3SZ8A 3W9ZA 3UWUA 2CLMA 4WY0B 3CHVA 1TRDA 1K7XA 3W7QA 1BWKA 1ZJIA 4YWIA 3CT7A 1KV5A 1TPEA 1KLYA 1RPXA 3GDLA 3QPZA 1B4EA 1GPWA 1RZMA 3HGRA 4AXKA 3TFCA 3NA8A 3M7WA 3E02A 1QO2A 1PVNA 4POCA 3TROA 1G6CA 2QAPA 3WJXA 4TIMA 4XZ9A 3SJ3A 4DQWA 4S2CA 4JDYA 1SO4A 1Z44A 2FDSA 4O8RA 3EWYA 1RVGA 4NJJA 4AHQA 3QRHA 5CPMA 4NUWA 4Y9AA 3LBMA 2Z6IA 3LI1A 1EB3A 2BSLA 1THFD 3IIXA 1ZAIA 3QYQA 5DY2A 3MWAA 1YPIA 1JJKA 1TB3A 2JKEA 1FWSA 1XL9A 4AB4A 2A6LA 1ME9A 1T96A 4IUOA 1EA0A 1TQJA 1VYRA 3SECA 1E51A 1BEUA 4UTLA 3HQ1A 2ZZ7A 1O95A 1SO5A 4X9SA 3KVMA 3C2FA 2J6XA 4P61A 1JCLA 2ZZ5A 2QUUA 4A2SA 1XI3A 3NQ8A 3QFEA 3C2EA 1H7XA 2QF7A 3IVUA 3QH2A 3W1NA 5G1YA 4LV9A 3R12A 2DORA 2QAFA 3U2OA 4I7VA 3EWZA 3STCA 1EP2A 1TPDA 4UMBA 3P81A 3W7NA 2YFOA 4WJEA 3FA5A 4K7YA 3THQA 1UB3A 5F4WA 1GOXA 3KVLA 4AH7A 2ZRXA 1PHQA 1F6PA 3DFPA 2ZZ1A 1AW2A 2J88A 1GWJA 3RFAA 2R14A 3S8HA 3DI0A 5FF7A 3LCLA 1L6YA 1TV8A 5J5DA 1H1ZA 3H54A 1ME7A 1RQBA 2R8WA 1KM3A 5D05A 3O05A 1Q45A 3GR8A 5K7JA 4PCFA 4UFIA 1FCQA 1NSJA 3ZS4A 3V75A 3W86A 2B7PA 3N9RA 5HJLA 3BLEA 1W37A 3W75A 4ZQOA 1PL9A 5C54A 4LVAA 3MW7A 1JQXA 1GJPA 1TRIA 3A22A 3TC7A 1A50A 3HB9A 2V30A 3O15A 2GJNA 5CKSA 5L6UA 2E5CA 3T55A 3SI9A 1FUYA 1NFBA 2BZNA 3FIGA 3DBPA 3W72A 2ZRYA 4UR7A 2CWNA 3YPIA 1JCYA 3IIVA 2NXGA 1JR1A 1I4NA 1U83A 4UFKA 4NXKA 1EIXA 3B0PA 5HUOA 4X22A 4JTHA 5I3HA 4LVGA 1RV8A 4UTTC 2H3BA 1QNVA 2E5DA 4PA8A 3TCEA 3IIPA 3FKKA 5CSRA 4MJMA 3M43A 4RK8A 2X1UA 4Q4KA 3UWQA 3M16A 3QMSA 4Y8FA 3INPA 3G1HA 5H91A 2DU2A 4RLIA 1VYSX 1FCVA 4ICNA 3LB0A 1G67A 2HS8A 1SPQA 1LOSA 1OK6A 3GK0A 3TDFA 4YLWA 1R47A 5BRBA 3N9SA 1F6KA 1NAL1 3PM6A 2OT0A 3F4WA 1LM1A 1SFLA 4QM1A 2PCQA 1SZNA 4MY1A 2V2HA 4MLJA 5CGQA 1VLIA 2JBMA 4O50A 3NQ7A 5HWJA 3NYZA 1OFOA 3L0GA 3EWBX 3THAA 5AYXA 4BWLC 2OJPA 3P60A 1FWWA 2VOMA 3EKLA 1AW1A 3SFKA 4X3ZA 1RD5A 3KRSA 4FF7A 4JYDA 1EWDA 3KRUA 2V82A 3NQCA 5DBUA 5G4EA 1I8JA 3M1ZA 1PV8A 1QPOA 2TRSA 1G4TA 4RKAA 3VCRA 1Q6RA 1W56A 1LCOA 4AF0A 4GC4A 2DJXA 3GDKA 1S5TA 3KHJA 4M5PA 4Z0SA 3HO8A 4CNNA 3HG2A 1F73A 1EX5A 3SGUA 3R89A 5EMUA 4RXFA 4RR4A 1LRTA 1L9WA 4WX2A 1XBVA 1FQ0A 4EF9A 3QZEA 3HGJA 2GUUA 1S3HA 1SO6A 4K36A 3KRZA 3W2UA 1U5JA 4L4LA 2XN2A 4M7SA 1W1ZA 2VFHA 3W1AA 4UXDA 1JRCA 2VEIA 5FI8A 5DCEA 5HQEA 3BGGA 3PSVA 4O15A 2ZBTA 3HF3A 3TSDA 1O60A 2A5HA 4FNSA 5FEPA 4O4WA 2G97A 4UMCA 4H3DA 2Q3RA 5EKYA 3W83A 1H61A 5FEWA 1OFQA 1QR7A 3Q2DA 4CCCA 3BVJA 2WNQA 4PFMA 1H50A 3OEXA 3NZ1A 5C5YA 4BR1A 2Y7FA 3W7RA 1C29A 1LORA 3B05A 2C14A 1TPC1 2Y89A 1WBJA 4AAJA 2W6RA 5FEZA 3P80A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A3X A;  3CUI A;  3TNB A;  3LYE A;  1VEO A;  5FD0 A;  2G3M A;  2Q8L A;  2D20 A;  2PDH A;  4MDO A;  4TQT A;  2HE8 A;  4G8T A;  1LRO A;  3DFQ A;  4HCH A;  1CBG A;  2C1I A;  3TYZ A;  1E9Y B;  5E6Y A;  2VX5 A;  4X0N A;  4KER A;  3K8L A;  3ME3 A;  2WKL A;  1M68 A;  4JEQ A;  5G2W A;  3NTY A;  4CN4 A;  3HV9 A;  2MNR A;  1A0E A;  2A3A A;  3QYS A;  3ANV A;  1CX9 A;  2Y1H A;  2ZTK A;  5G1T A;  2DT1 A;  1OFB A;  3LCH A;  4H4I A;  4C6I A;  2CET A;  1RJP A;  1GVI A;  2A7R A;  4AZC A;  3E0W A;  4AXN A;  2DFA A;  3G0X A;  3WX7 A;  1LJY A;  3L2I A;  4GUG A;  1OYB A;  2WSR A;  2QJJ A;  3AIE A;  5AVH A;  5D2V A;  4XV0 A;  1FY6 A;  4D6I A;  3AU6 A;  3TN4 A;  3VE7 A;  3T78 A;  5FJJ A;  1XH2 A;  1GQJ A;  1TIW A;  1H7P A;  4ATL A;  4F48 A;  4GQQ A;  3GG0 A;  4KFP A;  4H9Y A;  5A6J A;  3A4X A;  5I3G A;  3GUW A;  1BXN A;  4MWA D;  1AQH A;  4DIA A;  4J2P A;  4S3D A;  3IAR A;  1DWI M;  1SW7 A;  1AL8 A;  2UY5 A;  1HFB A;  1UD4 A;  3B9D A;  4O0K A;  1GQN A;  3VGF A;  1TE1 A;  3B04 A;  4R53 A;  1OAD A;  1ZP4 A;  4DLF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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